Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T11:58:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroepidemiologiaCaracterizacaoMolecular.pdf: 950016 bytes, checksum: 0dab8c38100d1541aefa71f47bdae8a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-01T13:25:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaCaracterizacaoMolecular.pdf: 950016 bytes, checksum: 0dab8c38100d1541aefa71f47bdae8a0 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-01T13:25:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaCaracterizacaoMolecular.pdf: 950016 bytes, checksum: 0dab8c38100d1541aefa71f47bdae8a0 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A infecção pelo HTLV-1/2 já foi investigada em diversas populações, mostrando prevalência variável conforme a área geográfica, grupos étnicos e subpopulações analisadas. Em estudos brasileiros foi observada uma maior prevalência nos Estados da Bahia e do Pará. O presente estudo teve como objetivo avaliar a prevalência do HTLV em mulheres grávidas na cidade de Belém, Pará, por meio de técnicas sorológicas e moleculares. Foram coletadas 1.027 amostras de sangue e alíquotas de plasmas foram testadas para a presença de anticorpos anti-HTLV-1/2, utilizando o método imunoenzimático do tipo ELISA. A confirmação da infecção e diferenciação dos tipos e subtipos virais foi realizada por meio da Reação em Cadeia mediada pela Polimerase em duas etapas (Nested PCR) através da amplificação gênica das regiões pX, env e 5’LTR seguido da análise de RFLP e seqüenciamento. Foram detectados seis (0,58%) casos de sororreatividade para o HTLV que posteriormente foram confirmados pela amplificação de um fragmento de 159 pb da região pX. A análise de RFLP com a enzima TaqI mostrou que quatro (66,7%) amostras eram positivas para HTLV-1 e duas (33,3%) para HTLV-2. Uma das amostras HTLV-2 teve o fragmento de 630 pb do gene env amplificado. A análise com a endonuclease XhoI mostrou a presença de um perfil de RFLP característico dos subtipos HTLV-2a/2c. Duas amostras HTLV-1 e uma HTLV-2 tiveram a região 5’LTR amplificada e seqüenciada. Por meio da análise filogenética foi possível classificar as amostras HTLV-1 como Cosmopolita Transcontinental e a HTLV-2 como pertencente ao subtipo HTLV-2c. Esse estudo mostra a relevância de se introduzir o teste para HTLV na triagem pré-natal, a fim de reduzir transmissão vertical e horizontal em nosso estado. / HTLV-1/2 infection was already investigated in several populations, showing variable prevalence according to the geographical area, ethnic groups and analyzed subpopulations. In Brazilian studies a larger prevalence was observed in the States of Bahia and Pará. The present study aimed to evaluate the prevalence of HTLV in pregnant women in the Belém city, Pará, through sorologics and molecular assays. One thousand and twnty-seven (1.027) blood samples were collected and plasma aliquots were tested for the presence of antibodies anti-HTLV-1/2, using enzyme immunoassay ELISA (Ortho Diagnostic Systems Inc., USA). The confirmation of the infection and types and subtypes differentiation was determined by a Nested Polimerase Chain Reaction (Nested PCR) targeting the pX, env and 5'LTR regions followed by RFLP analysis and sequencing of the products amplified. It were detected six (0,59%) cases of serorreactivity for anti-HTLV that were confirmed by the amplification of a 159 pb fragment from the pX region. The RFLP analysis with the enzyme TaqI showed that four (66,7%) samples were positive for HTLV-1 and two (33,3%) for HTLV-2. One out of the HTLV-2 samples had a fragment of 630 pb of the env gene amplified. The analysis with the endonuclease XhoI showed the presence of a profile characteristic of the HTLV-2a/2c subtypes. Two samples HTLV-1 and one HTLV-2 had the 5'LTR region amplified and sequenced. The phylogenetic analysis classified the samples HTLV-1 as Cosmopolitan subtype, subgroup Transcontinental and HTLV-2 as belonging to the HTLV-2c subtype. That study shows the relevance of introducing the test for HTLV in the prenatal selection, in order to reduce vertical and horizontal transmission in our State.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T12:37:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroprevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1302818 bytes, checksum: de787f10ea1d81e3ce4054f5c39d04d1 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-01T14:10:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1302818 bytes, checksum: de787f10ea1d81e3ce4054f5c39d04d1 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-01T14:10:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1302818 bytes, checksum: de787f10ea1d81e3ce4054f5c39d04d1 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2008 / Segundo a Organização Mundial de Saúde (OMS), existem no mundo, aproximadamente, 350 milhões de pessoas infectadas cronicamente pelo VHB e outras 170 milhões com infecção crônica pelo VHC. Assim, o presente trabalho teve como objetivo verificar a incidência da infecção pelos VHB e VHC e analisar possíveis fatores de risco entre 365 mulheres profissionais do sexo no Estado do Pará, sendo 32 participantes em Augusto Corrêa, 99 em Barcarena, 175 em Belém e 59 em Bragança. Destas participantes foram colhidas amostras de sangue , sendo os plasmas analisados por meio de um ensaio imunoenzimático e características epidemiológicas foram coletadas por meio de um questionário epidemiológico. Os resultados revelaram uma prevalência da infecção pelo VHB de 63,6%, sendo que para o HBsAg foi de 1,1% e para o anti-HBc de 61,9%. A soroprevalência do anti-VHC foi de 7,7% e, no que se refere à sororreatividade ao VHB e VHC simultaneamente foi de 4,4%. Entre as participantes, a imunização ao VHB foi observada em apenas 4,7% e 29,0% demonstraram suscetibilidade à infecção pelo VHB e VHC. Houve uma correlação significativa entre a soropositividade para os marcadores virais do VHB com a baixa renda familiar, o desconhecimento de doença hepática sob forma de hepatite e o uso ocasional do preservativo nas relações sexuais. Entretanto, não houve essa correlação entre as variáveis epidemiológicas com a sororreatividade para o marcador do VHC. Assim, as prevalências de infecção pelo VHB e o VHC na população de mulheres profissionais do sexo do Estado do Pará revelam padrão de intensa circulação desses vírus nessa população. / According to the World Health Organization (WHO), there are approximately 350 million people worldwide who are chronically infected with HBV and another 170 million with chronic infection by the HCV. The present this paper had the objective to estimate the incidence of the infection by the HBV and the HCV and to analyze possible risk factors among 365 female sex workers in the State of Pará: 32 participants in Augusto Corrêa, 99 in Barcarena, 175 in Belém and 59 in Bragança. Blood samples were collected and the plasmas were analyzed by means of an immunoenzymatic assay and the epidemiological characteristics were collected by the application of a epidemiological questionnaire. The results showed a prevalence of infection by the HBV of 63,6%, the HBsAg was 1,1% and the anti-HBc was 61,9%. The seroprevalence of the anti-VHC was of 7,7% and the seropositivity to HBV and HCV simultaneously was of 4,4%. Among the participants, the immunization to HBV was observed in just 4,7% and 29,0% demonstrated susceptibility for infection by HBV and HCV. There was a significant correlation among seropositivity to the viral markers of HBV with the income family, history of previous hepatitis and the use of condoms in the sexual relations. However, this difference was not observed among the epidemiological factors with the seropositivity HCV viral marker. Thus, the prevalences of infection by the HBV and the HCV in the population of female sex workers of the State of Pará indicate a pattern of intense viruses circulation in that population.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T12:45:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-01T14:44:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-01T14:44:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroprevalenciaVhcAvaliacao.pdf: 482746 bytes, checksum: 49ea7ec7bf01358dda30b57849744b20 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / A hepatite C é um dos principais problemas de saúde pública no Brasil e no mundo, tendo alta prevalência em algumas populações específicas, inclusive em pacientes com insuficiência renal crônica, submetidos à hemodiálise. A disseminação do Vírus da Hepatite C (VHC) neste ambiente pode estar relacionada a diversos fatores, como transfusões sanguíneas freqüentes, tempo de duração do tratamento, compartilhamento de máquinas, cateteres e linhas de diálise, e à dificuldade do diagnóstico da infecção, sobretudo nas fases iniciais, quando ainda não ocorreu a soroconversão de anticorpos (anti-VHC). O objetivo deste trabalho foi descrever a soroprevalência de anti-VHC em pacientes renais crônicos submetidos à hemodiálise no Estado do Amapá, e correlacioná-los com os fatores de risco. Para este fim, foram avaliados 103 prontuários de pacientes do serviço de hemodiálise da unidade de nefrologia do Hospital de Clínicas Dr. Alberto Lima, em Macapá, Amapá, em dezembro de 2007. Os resultados das sorologias para o anti-HCV foram relacionados com os fatores de risco. Os resultados mostraram baixa prevalência de anti-VHC (4,8%), concluindo-se, estarem relacionados à baixa freqüência de transfusões sanguíneas, ao diagnóstico precoce da soroconversão, à não reutilização de máquinas e insumos, à adoção de “boas práticas” nos procedimentos e ao não compartilhamento de frações de injetáveis. / Hepatitis C is one of the most serious public health problems in Brazil and the world, and there is high prevalence in some specific populations, including in patients with chronic renal failure, in hemodialysis. The spread of hepatitis C virus (HCV) in this environment may be related to several factors, such as frequent blood transfusions, the duration of the treatment, sharing machines, catheters and lines of dialysis, and to difficulty of diagnosis of the infection, especially in early stages, when there was not yet a seroconversion of antibodies (anti-HCV). The objective of this study was to describe the seroprevalence of anti-HCV in chronic renal patients submitted to hemodialysis in the state of Amapá, and correlate them with the risk factors. For that, 103 charts were evaluated of patients of the service of hemodialysis, nephrology unit of the Hospital de Clínicas Dr. Alberto Lima in Macapá, Amapá, in December 2007. The results of serology for anti-HCV were related to the risk factors. The results showed low prevalence of anti-HCV (4,8%), related to the low frequency of blood transfusion, to the early diagnosis of seroconversion, not reuse of machinery and inputs, to the adoption of “good practices” in procedures and not sharing of injecting fractions.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T15:42:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPolyomavirus.pdf: 1509201 bytes, checksum: 381279beb5e167a9e8416af619b8e028 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-03T15:04:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPolyomavirus.pdf: 1509201 bytes, checksum: 381279beb5e167a9e8416af619b8e028 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-03T15:04:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoPolyomavirus.pdf: 1509201 bytes, checksum: 381279beb5e167a9e8416af619b8e028 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2009 / O presente estudo teve como objetivo realizar a investigação molecular da infecção pelos Poliomavírus JC e BK em pacientes com Doença Renal Crônica (DRC) terminal, transplantados e em indivíduos sem DRC. Foram testadas 295 amostras de urina, que após a extração de DNA, foram submetidas à amplificação de um fragmento de 173 pb do gene do antígeno-T de Polyomavirus por meio da PCR seguida pela análise de RFLP, utilizando a endonuclease de restrição BamHI, na qual foi detectado 17,6% (52/295) de infecção por Polyomavirus, sendo 3,9% (4/102) nos pacientes com DRC, 30,5% (18/59) nos pacientes transplantados e 22,4% (30/134) nos assintomáticos. A prevalência da infecção pelo BKV foi de 88,9% (16/18) nos transplantados e de 10,0% (3/30) nos assintomáticos, não sendo detectada a infecção pelo BKV em pacientes com DRC. A prevalência de infecção pelo JCV foi de 3,9% (4/102) nos pacientes com DRC, de 11,1% (2/16) no transplantados e de 90,0% (27/30) nos assintomáticos. O risco de infecção por BKV foi determinada ser 72 vezes maior em pacientes transplantados do que em assintomáticos. A baixa frequência de infecção encontrada entre os pacientes com DRC pode estar relacionada ao fato de que esses pacientes apresentam uma elevada taxa de excreção de uréia na urina, assim como, baixo volume e densidade urinária, podem ser outros dois fatores contribuintes para a ausência de amplificação por estarem associados à baixa carga viral presente. De acordo com estes resultados, sugere-se que a investigação da infecção por Polyomavirus deve ser realizada, rotineiramente, nos pacientes pré e póstransplante, assim como nos doadores de órgãos, uma vez que a infecção por BKV tem sido associada com rejeição de enxerto em transplante de rins. / This study aimed to perform molecular studies of infection by Polyomavirus JC and BK among patients with chronic renal disease (CRD), kidney transplanted recipients and asymptomatic subjects. We tested a total of 295 urine samples. After DNA extraction from urine, samples were subjected to PCR to amplify a fragment of 173 bp of the antigen-T gene of the Polyomavirus followed by RFLP analysis using the restriction endonuclease BamHI. Infection by Polyomavirus was detected in 17.6% (52/295) of the subjects, being 3.9% (4/102) in the DRC, 30.5% (18/59) among renal transplanted recipients and 22.4% (30/134) among asymptomatic subjects. The prevalence of BKV infection was 88.9% (16/18) among renal transplant recipients and 10.0% (3/30) among asymptomatic, but it was not detected BKV infection among CRD. The prevalence of JCV infection was 3.9% (4/102) among chronic renal patients, 11.1% (2/16) among transplanted and 90.0% (27/30) in the asymptomatic individuals. The risk of BKV infection was 72 times higher in renal transplanted patients than in asymptomatic subjects. The low frequency of infection found among patients with chronic renal disease may be related to the fact that these patients have a high rate of urea excretion in the urine. Furthermore, the low urine volume and low presence of cells from urine may be two factors contributing to the absence of amplification and consequently associated with a low viral load. According to these results, it is suggested that the investigation of Polyomavirus infection should be performed routinely in patients before and after transplantation, as well as in organ donors, since the BKV infection has been associated with graft rejection in kidney transplant.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T15:54:01Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1005605 bytes, checksum: 8b971a1eeb5490e131265031a676d0b2 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-03T16:46:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1005605 bytes, checksum: 8b971a1eeb5490e131265031a676d0b2 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-03T16:46:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PrevalenciaInfeccaoVirus.pdf: 1005605 bytes, checksum: 8b971a1eeb5490e131265031a676d0b2 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / A Organização Mundial de Saúde (OMS) calcula que existam mais de 350 milhões de pessoas no mundo infectadas de forma crônica pelo Vírus da hepatite B (VHB) e cerca de 180 milhões de pessoas com o Vírus da hepatite C (VHC), além de, aproximadamente, 40 milhões de pessoas vivendo com o HIV-1. Estima-se que entre dois e quatro milhões são co-infectados pelo VHB e que entre quatro e cinco milhões são co-infectados pelo VHC. A partir dessas informações, o presente estudo teve como objetivo avaliar a soroprevalência da co-infecção pelo VHB e pelo VHC em pessoas portadoras do HIV-1 e/ou com SIDA/AIDS da cidade de Belém, entre os usuários da URE-DIPE. As amostras foram testadas para a presença de marcadores da infecção pelo VHB (HBsAg, HBeAg, anti-HBs, anti-HBc, anti-HBc/IgM e anti-HBe) e VHC (anti-VHC) por meio de ensaios imunoenzimáticos. O grupo estudado foi composto por 170 homens (56,7%) e 130 mulheres (43,3%), sendo que 30% não chegaram a cursar o primeiro grau completo e apresentam renda familiar de até 3 salários mínimos. A co-infecção HIV-1/VHB foi detectada em 91 (30,3%), cinco (1,7%) apresentaram co-infecção HIV-1/VHC, e seis (2%) mostraram-se infectados pelo VHB e VHC. Em sete (2,7%), foi possível mostrar evidência de vacinação prévia ao VHB. Não foi possível mostrar diferença estatística entre os valores de carga viral e de contagem de linfócitos T CD4+ e linfócitos T CD8+ com a presença de anticorpos na duplo (HIV-1/VHC) e na triplo infecção (HIV-1/VHB/VHC), porém foi mostrado significância estatística entre os valores de carga viral e contagem de linfócitos T CD8+ entre os co-infectados HIV-1/VHB. / The World Health Organization (WHO) estimates that 350 million persons are currently infected with Hepatitis B virus, 180 millions carry Hepatitis C virus and that approximately 40 millions are persistently infected with Human immunodeficiency virus 1. It is thought that two to four million of the HIV-1 infected persons are co-infected with HBV and that four to five millions carry also HCV. The present study aimed to estimate the seroprevalence of HBV and HCV co-infections among persons who are HIV-1 infected and/or presenting AIDS, residing in Belem, among those attended in a Reference Unit (URE-DIPE) of the State Health Department. Serum samples were tested for the presence of HBV (HBsAg, HBeAg, anti-HBs, anti-HBc, anti-HBc/IgM and anti-HBe) and HCV (antibodies to HCV) infections using enzyme immuno assays. The population group involved 170 males (56.7%) and 130 females (43.3%), 30% of them without the first grade of education and a familial income of no more than three minimum wages. HIV-1/HBV co-infection was detected in 91 individuals (30.3%), five (1.7%) were HIV-1/HCV co-infected and six (2%) showed evidences for previous infections with the three agents. Vaccination with HBV was detected in seven individuals (2.7%). There was no statistical significance between the association of values of viral load and T CD4+ and CD8+ lymphocyte counts with antibodies to either HIV-1/HCV or HIV-1/HBV/HCV infected individuals. Statistical significance was shown to occur between T CD8+ lymphocyte counts and the presence of HIV-1/HBV co-infection.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T16:15:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-14T14:16:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-14T14:16:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os flebovírus (família Bunyaviridae; gênero Phlebovirus), possuem importância considerável em saúde publica, pois podem causar uma variedade de síndromes clínicas. Na região amazônica brasileira até o momento já foram isolados 23 flebovírus sendo que quatro se destacam por terem sido isolados de humanos: Virus Alenquer, Virus Candiru, Virus Morumbi e Virus Serra Norte. Estes mais o Virus Itaituba, isolado de Didelphis marsupialis, fazem parte do Complexo Candiru (grupo Candiru) e foram utilizados para estudos de caracterização genética e de infecção experimental em hamsters dourados (Mesocricetus auratus). Os Hamsters mostraram-se suscetíveis a infecção por esses flebovírus, apesar de não terem apresentado sinais de doença. A análise histopatológica demonstrou aspectos lesionais no fígado, nos rins, no baço, nos pulmões e no sistema nervoso central, sendo as lesões mais intensas no fígado comprovadas pela presença dos antígenos virais empregando a técnica de imunohistoquímica. A análise das seqüências nucleotídicas parciais dos segmentos PRNA e MRNA obtidas para os cinco flebovírus estudados mostraram maior similaridade genética entre si do que com outros membros do gênero Phlebovirus. Sendo as mesmas geneticamente mais relacionadas ao Virus Punta Toro. Filogeneticamente, independentemente do segmento genômico analisado, os cinco flebovírus constituem um grupo monofilético, sendo que a análise pelo método de máxima verossimilhança demonstrou diferentes origens evolutivas para os segmentos de RNA o que sugere a ocorrência de rearranjo genético em natureza entre estes cinco flebovírus amazônicos. / The phleboviruses (family Bunyaviridae, genus Phlebovirus) are of considerable public health importance, due to their association with human diseases causing different clinical syndromes. In the Brazilian Amazon region, 23 phlebovirus were presently isolated, four of them have been isolated from humans: Alenquer virus, Candiru virus, Morumbi virus, and Serra Norte virus. These and Itaituba virus, isolated from Didelphis marsupialis belong to the Candiru Complex (Candiru group) and were used for studies on genetic characterization and experimental infection using gold hamsters (Mesocricetus auratus) as animal model. Hamsters showed to be susceptible to infection by these viruses; however signs of disease were not observed. The histophatological analysis demonstrated damages in the liver, kidneys, lung, and central nervous system. More intense lesions were observed in the liver which were characterized by the presence of viral antigens detected by immunohistochemistry assay. The analysis of the partial SRNA and MRNA nucleotide sequences obtained for the five studied phleboviruses showed more similarity among them than with other members of the genus Phlebovirus.More over, is was demonstrated that these phleboviruses were more genetically related to Punta Toro virus. Phylogenetically, regardless of the genome segment analyzed, the five phleboviruses constitute a monophyletic group. In addition the analysis by maximum likelihood method demonstrated different evolutionary origins for the RNA segments, suggesting the occurrence of natural genetic reassortment among the five Amazonian phleboviruses.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T12:43:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilEpidemiologicoDemografico.pdf: 797086 bytes, checksum: 6371b7060d39911bf8d74c591d4c2938 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-14T16:41:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilEpidemiologicoDemografico.pdf: 797086 bytes, checksum: 6371b7060d39911bf8d74c591d4c2938 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-14T16:41:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilEpidemiologicoDemografico.pdf: 797086 bytes, checksum: 6371b7060d39911bf8d74c591d4c2938 (MD5) Previous issue date: 2006 / O Vírus da imunodeficiência humana 1 (HIV-1), agente etiológico responsável pela pandemia de Sida/Aids, apresenta ampla distribuição geográfica. No Brasil, segundo país em número de notificações nas Américas, o número de indivíduos registrados com a doença alcançou 371.827 casos desde o início da epidemia até 2005. O presente trabalho teve como objetivo principal realizar a caracterização epidemiológica – demográfica (sexo e faixa etária), clínica (estágio clínico, tratamento e rogas utilizadas) e laboratorial (contagens de linfócitos T CD4+/CD8+ e carga viral plasmática no primeiro atendimento) – de portadores do HIV-1 e/ou pacientes com Sida/Aids na população de Belém do Pará. Foram selecionados 1.266 pacientes provenientes da Unidade de Referência Especializada em Doenças Infecciosas e Parasitárias Especiais (URE-DIPE), cujas amostras foram encaminhadas ao Laboratório de Virologia da Universidade Federal do Pará para realização dos testes laboratoriais referidos acima. Os principais resultados revelaram uma prevalência de infecção pelo HIV-1 na faixa etária mais jovem da população (13-30 anos e 30-49 anos), o uso preferencial de triploterapia (três drogas combinadas) e duploterapia (duas drogas combinadas) para o tratamento, bem como a resposta imunológica dos indivíduos portadores do HIV-1 e/ou com Sida/Aids da população de Belém entre os anos de 1998 e 2002. / The Virus of human imunodeficiency 1 (HIV-1), responsible etiological agent for the pandemic of Sida/Aids, presents wide geographical distribution. In Brazil, according to country in number of notifications in America, the number of individuals registered with the disease reached 371.827 cases since the beginning of the epidemic up to 2005. The present work had as main objective to accomplish the epidemic characterization - demographic (sex and age group), clinic (clinical apprenticeship, treatment and used drugs) and laboratorial (countings of linphocytes T CD4+/CD8+ and load plasmatic viral in the first service) - of carriers of the HIV-1 and/or patients with Sida/Aids in the population of Belem of Para. 1.266 patients were selected coming of the Unit of Reference Specialized in Infectious and Parasitic Diseases Special (URE-DIPE), whose samples had been directed to the Laboratory of Virology of the Federal University of Para for accomplishment of the related laboratorial tests above. The main results revealed a prevalence of infection for the HIV-1 in the age group more youth of the population (13-30 years and 30-49 years), the preferential use of triploterapia (three combined drugs) and duploterapy (two combined drugs) for the treatment, as well as the immunological reply of the individuals bearers of the HIV-1 and/or with Sida/Aids of the population of Belem among the years of 1998 and 2002.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-12T14:08:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilSoroepidemiologicoRubeola.pdf: 2078023 bytes, checksum: d32067e339d79b48139cb029df708447 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-16T16:57:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PerfilSoroepidemiologicoRubeola.pdf: 2078023 bytes, checksum: d32067e339d79b48139cb029df708447 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-16T16:57:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_PerfilSoroepidemiologicoRubeola.pdf: 2078023 bytes, checksum: d32067e339d79b48139cb029df708447 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2009 / A Rubéola é uma virose exantemática geralmente de evolução benigna, mas quando adquirida durante a gestação, pela teratogenicidade do vírus, pode provocar a Síndrome da Rubéola Congênita caracterizada por malformações fetais e aborto espontâneo. Com o objetivo de descrever o perfil soroepidemiológico da Rubéola de pacientes referenciados ao Instituto Evandro Chagas/SVS/MS nos períodos prévacinal(1989 a 1999) e pós-vacinal (2000 a 2005), foi realizado estudo retrospectivo do banco de dados de 34.221 amostras, cujos testes sorológicos foram analisados através da técnica de pesquisa de IgM e IgG por ELISA com kits do laboratório DADE BEHRING®. A taxa de infecção encontrada foi de 17,2% no período prévacinal e de 4,0% no pós-vacinal. Entre a sintomatologia apresentada no período pré-vacinal, a linfadenopatia teve maior taxa com 38,4% e no pós-vacinal a artralgia com 11,3%. Nas mulheres em idade fértil, a média da taxa de imunes foi de 78,3% e 84,4% no período pré e pós-vacinal, respectivamente. A taxa de infecção em gestantes no período pré-vacinal foi de 9,3% e no pós-vacinal 1,6%. Os recémnascidos infectados corresponderam a 2,1% no período pré e 1,0% no período pósvacinal nesses, houve predomínio de catarata e cardiopatia isoladas ou em associação. Foi concluído que houve diferença significante entre as frequências de todos os segmentos estudados, em relação aos períodos pré e pós-vacinal, confirmando a eficácia da vacina na prevenção da Rubéola e da SRC, tal fato realça a necessidade de se ampliar as coberturas vacinais para impedir a circulação do VR no país, cumprindo assim o acordo de eliminação até o ano 2010. / Rubella is a usually benign exanthematic virus infection. However, it can cause Congenital Rubella Syndrome characterized by fetal malformation and spontaneous abortion when acquired during pregnancy due to its teratogenicity. A restrospective study of a database of 34.221 samples was performed in order to describe the seroepidemiological profile of rubella in patients referred to the Evandro Chagas Institute/SVS/MS, during the vaccinal period (1989 -1999) and post-vaccinal (2000- 2005). The serological tests were analyzed through research of IgM and IgG by ELISA with DADE BEHRING® laboratory kits. The infection rates found were 17,2% and 4,0% during the pre- and post-vaccinal periods, respectively. Among the symptoms observed during the pre-vaccinal period, lymphadenopathy presented the highest rate (38,4%), whereas during the post-vaccinal period arthralgia was the most prevalent (11,3%). In women in reproductive age, the mean immunity rate was 78,3% and 84,4% during the pre- and post-vaccinal periods, respectively. The infection rate in pregnant women was 9,3% during the pre-vaccinal period and 1,6% during the post-vaccinal period. The total of infected newborns in the prevaccinal period was 2,1%, and 1,0% in the post-vaccinal period. Predominance of cataract and cardiopathy, isolated or in association, was observed among the newborns. It was concluded that there was a significant difference between the frequency of all studied segments regarding the pre- and post-vaccinal periods, which confirmed the effectiveness of the vaccine in the prevention of Rubella and Congenital Rubella Syndrome. These data highlight the need to increase the coverage of vaccination programs in order to reduce the circulation of the rubella virus in Brazil, thus accomplishing the commitment to eliminate rubella by 2010.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T16:46:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-28T14:52:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-28T14:52:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2006 / As hepatites virais representam um importante problema de saúde pública no Brasil e no mundo. A hepatite B e a hepatite C são as de principal interesse para os profissionais da área de saúde em função do modo de transmissão e da possibilidade de aquisição ocupacional. O presente trabalho teve por principal objetivo verificar a soroprevalência da infecção pelo Vírus da Hepatite B (VHB) e pelo Vírus da Hepatite C (VHC) em cirurgiões-dentistas e relacioná-la com os fatores de risco. Participaram do estudo 97 cirurgiões-dentistas, sendo 39 do gênero masculino e 58 do gênero feminino, no período de junho a dezembro de 2005, que atuam no município de Belém, Pará, Brasil. Os dados epidemiológicos foram obtidos por meio de inquéritos e os sorológicos por um ensaio imunoenzimático para a pesquisa de antígeno e anticorpo tanto para o VHB quanto para o VHC. O teste de Tendência foi utilizado para a análise estatística dos resultados. A prevalência do VHB foi de 6,2%, enquanto do VHC foi de 3,1% entre a população estudada. Das amostras sororreativas para os marcadores da hepatite B, a prevalência foi de 1,03% (1/97) para o anti-HBc total, 5,16% (5/97) para a presença simultânea do anti-HBc total e anti-HBs e 54,61% (53/97) para o anti-HBs. Quando comparado ao encontrado na população de doadores de sangue no Estado do Pará a prevalência do VHC na população estudada foi significativamente maior, enquanto a do VHB foi semelhante. Além disso, 37,7% (36/97) relataram terem tido algum tipo de exposição ocupacional, estando o acidente com objetos pérfuro-cortante como o mais relatado (86,1%). A medida adotada após a exposição foi sempre a lavagem com água e sabão e apenas 2,8% (1/36) dos acidentados relataram à realização de testes sorológicos. O conhecimento das normas de biossegurança e a utilização de pelo menos uma barreira de proteção individual foram relatados por todos, sendo o uso de luvas e máscara a resposta mais mencionada (96,9%). Encontravam-se imunizados contra o VHB por meio de vacina 54,61% (53/97) dos cirurgiões-dentistas, enquanto que imunes por infecção natural 5,16% (5/97). O elevado percentual de ocorrência de acidentes ocupacionais, aliado a baixa soroconversão pós-exposição dentre os cirurgiões-dentistas participantes demonstra a necessidade de se conhecer a prevalência de infecções de risco ocupacional em profissionais da área de saúde para que se adotem medidas de prevenção e controle mais eficazes contra os agentes causadores. / Viral hepatitides represent an important problem of public health in Brazil and in the world. Hepatitis B and hepatitis C are the most interesting for health professionals due to the form of transmission and the possibility of occupational acquisition. The present work intended, as its main objective, to verify the seroprevalence of the infection by the Hepatitis B Virus (HBV) and by the Hepatitis C Virus (HCV) in surgeon-dentists, and to relate it to risk factors. 97 surgeon-dentists, 39 males and 58 females, who work in the city of Belém, Pará, Brazil, participated in the study, from June to December of 2005. Epidemiologic data have been obtained by inquiries and the serologic ones by an immunoenzymatic assay for research on antigen and antibody for both the HBV and the HCV. The trend test was used for statistical analysis of the results. The prevalence of the HBV was of 6,2%, and the HCV was of 3,1% among the studied population. Out of the seroreactive samples to the markers of hepatitis B, the prevalence was of 1,03% (1/97) for total anti-HBc, 5,16% (5/97) for the simultaneous presence of total anti-HBc and anti-HBs, and 54,61% (53/97) for anti-HBs. When compared to the data found in the population of blood donors in the State of Pará, the prevalence of the HCV in the studied population was significantly higher, while the prevalence of the HBV was similar. Moreover, 37,7% (36/97) reported having had some type of occupational exposition, and accidents with cutting and piercing objects was the major cause (86,1%). The procedure after the exposition was always washing the wound with water and soap, and only 2,8% (1/36) of the victims reported the accomplishment of serologic tests. Knowledge of biosafety norms and the usage of at least one barrier of individual protection were stated by all dentists. The usage of gloves and masks was the most reported reply (96,9%). 54,61% (53/97) of the surgeon-dentists were immunized by HBV vaccination; 5,16% (5/97) were immunized by natural infection. The high percentage of occupational accidents, allied with the low post-exposition seroconversion amongst the surgeon-dentists, demonstrates the need of knowing the prevalence of infections of occupational risk in health professionals so that more efficient and effective prevention and control measures against the causing agents can be adopted.

Introdução: estudos com Enfuvirtida (ENF) mostraram que mutações na HR1 da gp41 levam à resistência primária de cepas em pacientes sem tratamento prévio com inibidores de fusão (Derdeyn et al., 2000; Rimsky et. al., 1998; Sista et. al., 2002). Outros, que o uso contínuo de HAART leva à falha virológica (Shafer et. al., 1998; Shafer & Vuitton, 1999). Para a melhor escolha terapêutica recomenda-se usar a Genotipagem do HIV1 (Ministério da Saúde, 2008b; Perez-Elias et. al., 2003; Shafer et. al., 2001). Objetivos: avaliar o perfil de resistência do HIV1 ao ENF pelo sequenciamento da HR1 da gp41 em pacientes sob HAART, sem uso de inibidor de fusão. Realizar fenotipagem virtual da pol do HIV1 em trinta e duas cepas com resistência aos NRTI, NtRTI , NNRTI e PI para verificar indicação do ENF. Métodos: investigamos 877 prontuários de pacientes do CRT-DST/AIDS entre 5/2002 a 7/2005 e verificamos que 92 que haviam realizado o Teste de Genotipagem do HIV1 em nosso laboratório, sem tratamento prévio com inibidores de entrada poderiam participar do nosso estudo. O primeiro grupo, com 60 pacientes apresentou cepas sensíveis à pelo menos um antirretroviral (ARV) e o segundo com 32 cujas cepas apresentaram resistência parcial e completa às drogas. A região HR1/HR2 da gp41 foi seqüenciada com o kit Big Dye Terminator vs. 3.1. Alinhamos as seqüências e as comparamos com HXB2 através do programa BioEdit vs.7.0.9.0. As mutações de resistência ao ENF foram determinadas pelo algoritmo Francês (ANRS) e pelo da Universidade de Stanford. Submetemos as sequências ao Virtual Phenotype Assay (Virco, Bélgica) para obtermos a Fenotipagem Virtual. Os subtipos da HR1/HR2 da gp41 e do pol foram determinados por análises filogenéticas e os recombinantes, pelo Simplot v 3.5.1. Resultados: 89(97%) amostras foram seqüenciadas, 2 (2%) não amplificaram e 1 (1%) não tinha material suficiente. Destas, 82 (92%) eram do subtipo B, 6(7%) do F1 e 1(1%), do BF na gp41. No pol, 80(87%) eram B, 4(4%) eram F e 7(8%), eram FB. Três (3%) apresentaram resistência primária ao ENF, determinada pela N42D (1%), N43H (1%) e L44M (1%). Dez amostras tinham os polimorfismos Q39R(10%), N42H(10%), N42R(10%), N42N/S(10%) e N42S(60%). Na HR2, as mutações N126N/K, N126K/Q/E, E137E/K, E137K e S138S/A estavam presentes em 26% das cepas. Apesar das cepas apresentarem resistência aos ARV pelo teste de genotipagem, a fenotipagem virtual mostrou que 10% dos ARV ainda atuavam sobre elas, enquanto que 75% delas apresentaram resistência parcial e 15%, completa às drogas. Conclusão: nosso estudo sugere a introdução do teste de genotipagem da HR1/HR2 da gp41 antes de indicar do ENF em pacientes com falha terapêutica e que a Fenotipagem Virtual pode ser usada para a escolha do melhor esquema antirretroviral que permita uma supressão viral sustentada. / Background: studies using Enfuvirtide (ENF) have showed that mutations in the HR1 (gp41) have been associated with primary resistance in strains of the patients without previous treatment with fusion inhibitors. (Rimsky et. al.,1998; Derdeyn et al.,2000, Sista et. al.,2002). The widespread use of HAART may achieve maximal suppression of the viral load, but the viral rebound may occur, leading to virologic failure (Shafer et. al.,1998; Shafer & Vuitton,1999). To optimize therapeutic choices it is recommended to use the HIV1 Genotypic Assay. Objective: to evaluate the resistance profile in the HR1 in patients submitted to HAART, but naïve entry inhibitors. To make the Virtual Phenotypic Assay in the pol of the HIV1 strains isolated of the 32 patients with resistance to the antiretroviral (ARV) and to verify the possibility of using the ENF. Methods: we investigated 877 handbook patients of the CRT-DST/AIDS from May/2002 to July/2005. We identified 92 naïve patients to entry inhibitors included in our cohort to do genotypic assay; they were included in our research. The first group was composed by 60 persons with sensible strains to only one ARV. The second, with 32 presented strains with resistance to all ARV. HR1/HR2 was sequenced (ABIPrism BigDye Terminator vs 3.1). Bioedit Software vs.7.0.9.0 was used to compare sequences with the HIVHXB2. The resistance mutations to ENF were analyzed using French ANRS and Stanford HIV Drug Resistance Algorithm. The results by Virtual Phenotype Assay of 32 patients that presented regimen failure by Genotypic Assay predicted HIV phenotypic resistance. Subtype analysis were did by Phylogeny and the recombinants strains results, confirmed by Simplot v.3.5.1. Results: 89(97%) out of 92 samples were sequenced. Two of them (2%) could not be amplified and one (1%) we did not have enough material to use. In the HR1/HR2 82(92%) of the samples were typed as B, 6(7%), as F and 1(1%) as FB. In the pol 80(87%) were classified as B, 4(4%), as F and 7(8%) as FB. According to algorithms used, 3(3%) out of 89 ENF naïve patients presented complete resistance to this drug. One virus harbored the N42D mutation (1%), another, the N43H(1%) and the other one the L44M(1%). In 10 samples we observed the polymorphisms Q39R(1%), N42H(1%), N42R(1%), N42N/S(1%) and N42S(7%). In the HR2 domain the substitutions N126N/K, N126K/Q/E, E137E/K, E137K and S138S/A were present in 26% of the samples. Although strains presented resistance to the ARV by Genotypic Assay, in the Virtual Phenotypic Assay we verified that 10% of the drugs had some effect upon them. 75% of the strains presented partial and 15% completed resistance to ARV. Conclusion: it is important to introduce the HR1/HR2 genotyping test to verify resistance mutations to ENF before indicating this drug to patients with virologic failure. The virtual phenotypic assay can be used to select the better combination therapy to obtain viral suppression sustained response.