White mold (Sclerotinia sclerotiorum Lib. de Bary) is one of the most important diseases of common bean in the U.S. with seed yield losses up to 100%. White mold resistance is hard to incorporate into breeding materials because of low heritability, cumbersome screening methods, and few sources of resistance. A Multi-parent Advanced Generation Inter-Crosses population was created to develop resistant germplasm and map the genetics factors controlling the resistance. A seedling straw test method was used to identify resistant lines. Twenty genotypes were found to be resistant based on its response when inoculated with isolate 1980 of white mold. GWAS using quantitative, polynomial and binomial phenotypic distribution data, identified 30 genomic regions associated with resistance on Pv01, Pv02, Pv04, Pv05, Pv07, Pv08, Pv10 and Pv11. Cumulative R2 values were 57% for binomial distribution using 13 genomic intervals, 41% for polynomial using 8 intervals, and 40% for quantitative using 11 intervals.

O fungo Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco, encontra-se disseminado em todo o país e afeta mais de 400 espécies de plantas, dentre elas a cultura da soja, causando danos consideráveis no rendimento. A transmissão do patógeno ocorre por meio de sementes contendo micélio dormente ou pela presença de escleródios no lote, os quais podem permanecer viáveis por um longo período, dificultando o manejo da doença. Este trabalho teve como objetivos verificar a viabilidade do patógeno em sementes durante o armazenamento e seu efeito sobre o poder germinativo; comparar tamanhos de amostras de sementes visando à detecção do fungo; e avaliar a sensibilidade in vitro de S. sclerotiorum a fungicidas. Para avaliação da sobrevivência do patógeno, sementes de soja foram inoculadas, artificialmente, com três isolados de S. sclerotiorum, e armazenadas em duas condições, câmara fria e seca (20 ºC e 45% UR) e ambiente não controlado, durante oito meses. A cada dois meses foram realizados testes de sanidade pelo meio de cultura ágar-bromofenol (Neon), utilizando-se 4 repetições de 100 sementes, e testes de germinação, com 4 repetições de 50 sementes, pelo método do rolo de papel. No experimento de amostragem foram avaliadas dez amostras de sementes de soja pelo método do meio Neon, comparando-se quatro tamanhos de amostra: 400, 800, 1600 e 2400 sementes. Para avaliação da sensibilidade in vitro de S. sclerotiorum a fungicidas, foram utilizados 13 ingredientes ativos, em 7 doses e 5 repetições. Os valores da concentração inibitória de 50% (CI50) e 100% (CI100) foram estimados com base na percentagem de inibição do crescimento micelial. Além disso, realizaram-se a quantificação e pesagem dos escleródios formados após 15 dias de incubação. A presença do patógeno S. sclerotiorum, afetou negativamente a germinação das sementes, com redução média de 32% em relação à testemunha. Verificou-se diferença entre os isolados com relação à agressividade. O patógeno sobreviveu nas sementes em ambos os ambientes de armazenamento, porém, em ambiente controlado a redução na geminação das sementes foi de 14% e na incidência do fungo de 16%, enquanto que, em laboratório, esta redução foi de 23% na germinação e de 62% na incidência. Não houve diferença estatística com relação à quantidade de sementes amostradas na detecção de S. sclerotiorum, entretanto, constatou-se maior frequência de ocorrência do patógeno à medida que o número de sementes amostrado foi maior. Todos os fungicidas foram capazes de reduzir o crescimento micelial de S. sclerotiorum, bem como a produção de escleródios, sendo que os ingredientes ativos piraclostrobina, carbendazim, tiabendazol e tiofanato metílico, além de apresentarem CI50 inferior a 1 mg L-1, também inibiram totalmente a formação de escleródios em concentrações inferiores a 5 mg L-1. / The fungus Sclerotinia sclerotiorum, the causal agent of white mold is spread throughout the country and affects more than 400 species of plants, including soybean, causing considerable decrease in yield. The pathogen transmission occurs through seeds with dormant mycelium or by the presence of sclerotia in the lot, which can remain viable for a longer period, making hard the disease management. This study aimed to verify the viability of the pathogen in seeds during the storage period and its effect on germinative power; compare sizes of seed samples to determine the presence of the fungus; and to evaluate the in vitro sensibility of S. sclerotiorum to fungicides. To determine the pathogen survival, soybean seeds were inoculated artificially with three isolates of S. sclerotiorum, and stored into two conditions, cold and dry chamber (20 °C and 45% RU) and in uncontrolled environment, for eight months. Every two months health tests were performed by culture media bromophenol agar (Neon), using 4 repetition of 100 seeds, and germination tests, with 4 repetition of 50 seeds, by the method of the paper roll. During the experiment of sampling, ten samples of soybean seeds were evaluated by the method of media Neon, comparing four sample sizes: 400, 800, 1600 and 2400 seeds. To evaluate the in vitro sensibility of S. Sclerotinia to fungicides were used 13 active ingredients, in 7 doses and 5 repetitions. The values of the 50% inhibitory concentration (IC50) and 100% (IC100) were estimated based on the percentage inhibition of the mycelial growth. In addition, it was performed the quantification and weighing of sclerotia formed after 15 days of incubation. The pathogen S. sclerotiorum in soybean seeds affected negatively the germination of seeds, with an average reduction of 32% compared to the control. There was difference between the isolates in relation to aggressiveness. The pathogen survived in seeds in both storage environments, however, under controlled environment, the decrease in the germination of the seeds was 14% and in its incidence was 16%, while in laboratory this reduction was 23% in the germination and 62% in the incidence. There was no statistical difference in the quantity of seeds sampled in the detection of S. sclerotiorum, however, a higher frequency of pathogen occurrence was verified as the number of sampled seeds was enlarged. All fungicides were able to reduce the mycelial growth of S. sclerotiorum and sclerotia production, and the active ingredients pyraclostrobin, carbendazim, thiabendazole and thiophanate methyl, besides having IC50 of less than 1 mg L-1 also completely inhibited the formation of sclerotia in concentrations less than 5 mg L-1.

The White mold or Sclerotinia stem rot, caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum, has become a serious problem in soybean production areas. The objectives of this work were to evaluate whether in different agricultural regions of Brazil, the fungus S.sclerotiorum, has a behavioral similarity at the level of symptoms on certain soybean genotypes, to evaluate which genotypes can be used for each region and which materials can be used for plant breeding. The experiment was conducted at the University of Santa Maria, in a growth chamber with controlled temperature and humidity, between November 2016 and February 2017, with three isolated of S.sclerotiorum, collected in the cities of Itaara and Passo Fundo in Rio Grande do sul and Jataí in Goias, in the season of 2015/2016, on a total number of 56 soybean genotypes. The inoculation of the isolates was performed by the straw test method when the plants were in the growth stages V3/V4. For all genotypes, it was evaluated average lesion size, in centimeters, five days after inoculation. Each treatment was consisted of seven replications, each replication being one plant. Analyzes resulted in the formation of four symptom levels, being susceptible, intermediate, moderately resistant and resistant. Analyzes demonstraded that for the three isolates, different resistant reaction levels were obtained for the tested genotypes. It was verified that the isolate of Passo Fundo - RS, showed resistant pattern the genotype CD 2655 and as susceptible patterns, five genotypes. For the reaction to the Itaara - RS isolate, there were no resistant reactions and nine genotypes were susceptible. For the isolate from Jatai - GO, six genotypes were resistant and one susceptible, NS4823. The use of the UPGMA grouping method, created for each isolate, showed no correlation emphasizing that the isolates have genetic diversity. / O mofo branco ou podridão branca da haste, causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, tem se tornado um problema grave nas áreas de produção de soja. Os objetivos deste trabalho foram avaliar se em diferentes regiões agrícolas do Brasil, o fungo presente S. sclerotiorum, tem similaridade de comportamento ao nível de sintomas sobre determinados genótipos de soja, avaliar quais genótipos podem ser usados para cada região, bem como quais materiais podem ser utilizados pelo melhoramento genético. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, em câmara de crescimento com temperatura e umidade do ar controladas, entre os meses de novembro de 2016 a fevereiro de 2017, com um número de 3 isolados de S. sclerotiorum, coletados nas cidades de Itaara e Passo Fundo no Rio Grande do Sul e Jataí em Goiás, na safra agrícola 2015/2016, sobre um número total de 56 genótipos de soja. A inoculação dos isolados foi realizada pelo método straw test quando as plantas estavam em estádio fenológico de V3/V4. Avaliou-se o tamanho médio da lesão, em centímetros, cinco dias após a inoculação, para todos os genótipos. Cada tratamento foi constituído de sete repetições, sendo cada repetição uma planta. As análises resultaram na formação de quatro níveis de sintomas, sendo suscetível, intermediário, moderadamente resistente e resistente. As análises demonstraram que para os 3 isolados se obteve níveis de reação a resistência distintos para os genótipos testados. Foi verificado que o isolado de Passo Fundo – RS apresentou como padrão resistência o genótipo CD 2655 e como padrões suscetíveis 5 genótipos. Para a reação ao isolado Itaara - RS não houve reações de resistência e 9 genótipos foram suscetíveis. Para o isolado de Jataí - GO 6 genótipos foram resistentes e um suscetível, NS4823. A utilização do método de agrupamento UPGMA criado para cada isolado mostrou-se não possuir correlações, ressaltando de que os isolados têm diversidade genética.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 235692 bytes, checksum: ee18b34c6def906f1cea8ca756673794 (MD5) Previous issue date: 2011-07-27 / Sclerotinia sclerotiorum causes white mold, stem rot, watery rot and white rot disease in many important crops such as bean, soybean, cotton, tomato, and pea. The pathogen produces sclerotia that can survive in the field for several years, which hinders white mold control. In the perspective of assessing biocontrol in the management of the disease, we tested the efficiency of Clonostachys rosea in parasitizing sclerotia of the pathogen and reducing their viability. Thus, we studied in vitro the survival of sclerotia either dormant or conditioned to myceliogenic germination in soil samples that were untreated, pasteurized, or autoclaved, at different levels of both moisture and temperature, and infested with varying conidia concentrations of C. rosea. Temperature, moisture, stages of sclerotia, and conidia concentration did not affect the germination of sclerotia. Clonostachys rosea inhibited germination of sclerotia only in the autoclaved soil. Moisture, temperature, and conidia concentration had no effect in the recovery of C. rosea from soil. Although C. rosea have not affected the viability of sclerotia of S. sclerotiorum in untreated and pasteurized soils, it markedly reduced sclerotia viability in the autoclaved soil. The low competitiveness of C. rosea, and consequently its low efficiency in parasitism, is credited to the absence of external nutrient sources to support its establishment in both untreated and pasteurized soils. New studies to evaluate the effectiveness of these sources, particularly in soils under natural conditions, are suggested. / Sclerotinia sclerotiorum causa o mofo branco, podridão da haste, podridão aquosa ou podridão branca, doença importante em várias culturas como feijão, soja, algodão, tomate e ervilha. O patógeno produz escleródios que podem sobreviver no campo por vários anos, o que dificulta seu controle. Na perspectiva de avaliar o biocontrole no manejo do mofo branco, testou-se a eficiência de Clonostachys rosea, em parasitar escleródios do patógeno e reduzir a viabilidade dos mesmos. Estudou-sein vitro a sobrevivência de escleródios dormentes e condicionados para germinação miceliogênica, em solo natural, pasteurizado e autoclavado, em diferentes níveis de umidade e temperatura, e infestados com concentrações variadas de conídios de C. rosea. A temperatura, umidade, estádios do escleródio e concentração de conídios do antagonista não interferiram na germinação dos escleródios. Clonostachys rosea inibiu a germinação dos escleródios apenas no solo autoclavado, independentemente do fator estudado. Não se detectou interferência da umidade, temperatura do solo e concentração de conídios em recuperar o antagonista do solo. Apesar de C. rosea não haver afetado a viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum em solos natural e pasteurizado, reduziu marcantemente a viabilidade em solo autoclavado. Credita-se abaixa competitividade do antagonista, e consequentemente baixa eficiência no parasitismo, à inexistência de fonte externa de nutrientes para auxiliar seu estabelecimento nos solos natural e pasteurizado. Sugerem-se novos trabalhos, para se avaliar a eficácia dessas fontes, principalmente em solos em condições naturais.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-05-19T11:06:39Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Santos Marques - 2014.pdf: 4633133 bytes, checksum: 8058e7f850a7ea713f7c77b0ad35cc32 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-05-19T11:08:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Santos Marques - 2014.pdf: 4633133 bytes, checksum: 8058e7f850a7ea713f7c77b0ad35cc32 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-19T11:08:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Santos Marques - 2014.pdf: 4633133 bytes, checksum: 8058e7f850a7ea713f7c77b0ad35cc32 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-09-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The extracts and essential oils from plants are bioactive molecules of interest to resistance induction in plants and the control of plant pathogens. The aim this study was to evaluate the effect of the ethanol extract and essential oil from leaves of Eugenia uniflora and two commercial flavonoid fractions, quercetin and rutin, as bioactive compounds for the control of white mold, caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The compounds were tested against pathogen through the mycelial growth, cell viability, sclerotia formation, cell morphology and biochemical aspects. And on the pathossystem Phaseolus vulgaris-Sclerotinia sclerotiorum was evaluated biochemical and molecular aspects (RT-qPCR) involved in the mechanism of plant defense, into a kinetic treatment and infection (12, 24 e 48 hours). The data show that the tested compounds were significantly relevant (P<0.01) to growth inhibition pathogen’s mycelium and cell viability in vitro and in the formation of sclerotia of the pathogen a positive correlation between percent inhibition and the concentration of active compounds applied was observed. The minimum inhibitory concentration (MIC) for S. sclerotiorum was 0.6% (v/v) ethanol extract of leaves from E. uniflora and the 100 ppm of the essential oil. In Bioassays in plants, the treatment with ethanol extract or essential oil from Eugenia uniflora and rutin inhibited the formation of necrotic area in common bean leaves 48 hours after inoculation. Biochemical analysis showed that the compounds induced 12 hours after treatment the activation of key proteins related to plant defense, chitinases, β-1,3- glucanase, phenylalanine ammonia lyase, peroxidases and polyphenoloxidases. Molecular analysis showed that treatment with ethanolic extract, quercetin and rutin in healthy plants activated pathogenesis-related genes (PRs) at different times into the kinetic treatment, and that these genes are highly expressed in plants infected compared to the pretreated and infected plants. The results of this research suggest that the effects of the ethanol extract, flavonoids and oil from Eugenia uniflora are potential bioactive molecules to reduce the severity of disease white mold in bean leaves. / Os extratos e óleos essenciais de plantas são moléculas bioativas de grande interesse para a indução de resistência em plantas e no controle de fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do extrato etanólico e óleo essencial de folhas de E. uniflora e duas frações flavonoides comerciais, quercetina e rutina como compostos bioativos para o controle de mofo branco, causado pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Os compostos foram testados sobre patógeno através do crescimento micelial, viabilidade celular, esclerogênese, morfologia celular e aspectos bioquímicos. E sobre o patossistema Phaseolus vulgaris-Sclerotinia sclerotiorum foi avaliado aspectos bioquímicos e moleculares (RT-qPCR) envolvidos no mecanismo de defesa da planta, dentro de uma cinética de tratamento e infecção (12, 24 e 48 horas). Os dados mostram que os compostos testados foram significantemente (P<0.01) relevantes na inibição do desenvolvimento e viabilidade celular in vitro do micélio e na formação de escleródios do patógeno, sendo observada uma correlação positiva entre percentual de inibição e as concentrações dos compostos avaliadas. A concentração inibitória mínima (MIC) para o S. sclerotiorum foi de 0.6% (v/v) do extrato etanólico de folhas de E. uniflora e de 100 ppm do óleo essencial. Nos bioensaios em plantas, o tratamento com extrato etanólico ou óleo essencial de folhas de Eugenia uniflora e rutina inibiram a formação de necrose em folhas de feijoeiro comum com 48 horas ápos inoculação. A análise bioquímica mostrou que os compostos induzem com 12 horas após tratamento a ativação das principais proteínas relacionadas à defesa da planta, quitinases, β-1,3- glucanase, fenilalanina amônia-liase, peroxidases, e polifenoloxidases. A análise molecular mostrou que o tratamento com extrato etanólico, quercetina e rutina em plantas sadias ativaram genes relacionados à patogênese (PRs) em diferentes tempos dentro da cinética de tratamento, e que tais genes são altamente expressos em plantas infectadas em comparação as plantas pré tratadas e infectadas. Os resultados obtidos neste trabalho indicam que o extrato etanólico, flavonoides e o óleo essencial de folhas de Eugenia uniflora são moléculas bioativas potenciais para reduzir a severidade da doença mofo branco em plantas de feijoeiro comum.

O fungo Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco, encontra-se disseminado em todo o país e afeta mais de 400 espécies de plantas, dentre elas a cultura da soja, causando danos consideráveis no rendimento. A transmissão do patógeno ocorre por meio de sementes contendo micélio dormente ou pela presença de escleródios no lote, os quais podem permanecer viáveis por um longo período, dificultando o manejo da doença. Este trabalho teve como objetivos verificar a viabilidade do patógeno em sementes durante o armazenamento e seu efeito sobre o poder germinativo; comparar tamanhos de amostras de sementes visando à detecção do fungo; e avaliar a sensibilidade in vitro de S. sclerotiorum a fungicidas. Para avaliação da sobrevivência do patógeno, sementes de soja foram inoculadas, artificialmente, com três isolados de S. sclerotiorum, e armazenadas em duas condições, câmara fria e seca (20 ºC e 45% UR) e ambiente não controlado, durante oito meses. A cada dois meses foram realizados testes de sanidade pelo meio de cultura ágar-bromofenol (Neon), utilizando-se 4 repetições de 100 sementes, e testes de germinação, com 4 repetições de 50 sementes, pelo método do rolo de papel. No experimento de amostragem foram avaliadas dez amostras de sementes de soja pelo método do meio Neon, comparando-se quatro tamanhos de amostra: 400, 800, 1600 e 2400 sementes. Para avaliação da sensibilidade in vitro de S. sclerotiorum a fungicidas, foram utilizados 13 ingredientes ativos, em 7 doses e 5 repetições. Os valores da concentração inibitória de 50% (CI50) e 100% (CI100) foram estimados com base na percentagem de inibição do crescimento micelial. Além disso, realizaram-se a quantificação e pesagem dos escleródios formados após 15 dias de incubação. A presença do patógeno S. sclerotiorum, afetou negativamente a germinação das sementes, com redução média de 32% em relação à testemunha. Verificou-se diferença entre os isolados com relação à agressividade. O patógeno sobreviveu nas sementes em ambos os ambientes de armazenamento, porém, em ambiente controlado a redução na geminação das sementes foi de 14% e na incidência do fungo de 16%, enquanto que, em laboratório, esta redução foi de 23% na germinação e de 62% na incidência. Não houve diferença estatística com relação à quantidade de sementes amostradas na detecção de S. sclerotiorum, entretanto, constatou-se maior frequência de ocorrência do patógeno à medida que o número de sementes amostrado foi maior. Todos os fungicidas foram capazes de reduzir o crescimento micelial de S. sclerotiorum, bem como a produção de escleródios, sendo que os ingredientes ativos piraclostrobina, carbendazim, tiabendazol e tiofanato metílico, além de apresentarem CI50 inferior a 1 mg L-1, também inibiram totalmente a formação de escleródios em concentrações inferiores a 5 mg L-1. / The fungus Sclerotinia sclerotiorum, the causal agent of white mold is spread throughout the country and affects more than 400 species of plants, including soybean, causing considerable decrease in yield. The pathogen transmission occurs through seeds with dormant mycelium or by the presence of sclerotia in the lot, which can remain viable for a longer period, making hard the disease management. This study aimed to verify the viability of the pathogen in seeds during the storage period and its effect on germinative power; compare sizes of seed samples to determine the presence of the fungus; and to evaluate the in vitro sensibility of S. sclerotiorum to fungicides. To determine the pathogen survival, soybean seeds were inoculated artificially with three isolates of S. sclerotiorum, and stored into two conditions, cold and dry chamber (20 °C and 45% RU) and in uncontrolled environment, for eight months. Every two months health tests were performed by culture media bromophenol agar (Neon), using 4 repetition of 100 seeds, and germination tests, with 4 repetition of 50 seeds, by the method of the paper roll. During the experiment of sampling, ten samples of soybean seeds were evaluated by the method of media Neon, comparing four sample sizes: 400, 800, 1600 and 2400 seeds. To evaluate the in vitro sensibility of S. Sclerotinia to fungicides were used 13 active ingredients, in 7 doses and 5 repetitions. The values of the 50% inhibitory concentration (IC50) and 100% (IC100) were estimated based on the percentage inhibition of the mycelial growth. In addition, it was performed the quantification and weighing of sclerotia formed after 15 days of incubation. The pathogen S. sclerotiorum in soybean seeds affected negatively the germination of seeds, with an average reduction of 32% compared to the control. There was difference between the isolates in relation to aggressiveness. The pathogen survived in seeds in both storage environments, however, under controlled environment, the decrease in the germination of the seeds was 14% and in its incidence was 16%, while in laboratory this reduction was 23% in the germination and 62% in the incidence. There was no statistical difference in the quantity of seeds sampled in the detection of S. sclerotiorum, however, a higher frequency of pathogen occurrence was verified as the number of sampled seeds was enlarged. All fungicides were able to reduce the mycelial growth of S. sclerotiorum and sclerotia production, and the active ingredients pyraclostrobin, carbendazim, thiabendazole and thiophanate methyl, besides having IC50 of less than 1 mg L-1 also completely inhibited the formation of sclerotia in concentrations less than 5 mg L-1.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-10-08T18:44:27Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renata Silva Brandão - 2012.pdf: 881645 bytes, checksum: 6eb66647a421b6919caad44ecf9145fd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-09T11:25:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renata Silva Brandão - 2012.pdf: 881645 bytes, checksum: 6eb66647a421b6919caad44ecf9145fd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-09T11:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renata Silva Brandão - 2012.pdf: 881645 bytes, checksum: 6eb66647a421b6919caad44ecf9145fd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-09-10 / The fungus Trichoderma spp., is a microorganism naturally found in soil, which presents an important ecological function, as part of the decomposition and mineralization of plant residues, contributing to the availability of nutrients to plants. It is considered also a natural biofungicide, which reduces up to 100% the chances of achieving any fungus culture. The fungus Trichoderma is a fast growing, hence the advantage of use as a biocontrol agent in large scale, produces a variety of antifungal metabolites, including antibiotics and enzymes that degrade the cell wall of certain pathogens, is related to growth promotion in plants and the induction of resistance. The fungus Sclerotinia sclerotiorum is the etiological agent of the disease known as white mold in different cultures, such as soft rot, white mold, tipping pre-emergent and post-emergent plants. It is estimated that about 300 plant species are susceptible to S. sclerotiorum, such as the common bean (Phaseolus vulgaris) and soybean (Glycine max), both of great economic importance. Thus, this work needs to evaluate physiological, biochemical and molecular in common bean using the inductor Trichoderma harzianum against Sclerotinia sclerotiorum. Three isolates of T. harzianum and one isolate S. sclerotiorum were selected for inoculation in bean plants. In plants inoculated with isolates of T. harzianum 475/02 was possible to observe higher values related to the physiological aspects, as the plants inoculated with T. harzianum 479/01 had the highest enzyme activities in the R5 stage. Treatments with more pathogen T. harzianum showed the highest expression of the genes of interest, demonstrating greater efficiency when the two fungi act together. / O fungo Trichoderma spp., é um microrganismo naturalmente encontrado no solo, que apresenta uma importante função ecológica, pois participa da decomposição e mineralização dos resíduos vegetais, contribuindo com a disponibilização de nutrientes para as plantas. Ele é considerado, também, um biofungicida natural, que reduz em até 100% as chances de qualquer fungo atingir a cultura. O Trichoderma é um fungo de crescimento rápido, daí a grande vantagem de utilização como agente de biocontrole em larga escala, produz uma variedade de metabólitos antifúngicos, incluindo antibióticos e enzimas que degradam a parede celular de certos patógenos, está relacionado a promoção de crescimento em plantas e a indução de resistência. O fungo Sclerotinia sclerotiorum é o agente etiológico da doença conhecia como mofo branco em diferentes culturas, como podridão mole, mofo branco, tombamento pré-emergente e pós-emergente de plantas. Estima-se que cerca de 300 espécies vegetais são suscetíveis a S. sclerotiorum, a exemplo do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) e da soja (Glycine max), ambas de grande importância econômica. Sendo assim, este trabalho teve por objetivo avaliar aspectos fisiológicos, bioquímicos e moleculares em feijoeiro comum com o uso do indutor Trichoderma harzianum contra Sclerotinia sclerotiorum. Três isolados de T. harzianum e um isolado S. sclerotiorum foram selecionados para inoculação em plantas de feijão. Nas plantas inoculadas com os isolados de T. harzianum 475/02 foi possível observar maiores valores relacionados aos aspectos fisiológicos, já as plantas inoculadas com o T. harzianum 479/01 apresentaram as maiores atividades enzimáticas no estágio R5. Os tratamentos com patógeno mais o T. harzianum, apresentaram as maiores expressões dos genes de β1,3 glucanase, quitinase, peroxidade e lipoxigenase, demonstrando uma maior eficiência na produção quando os dois fungos atuam juntos.

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The cultivation of flowers is, in Brazil, very recent and little known species have a high ornamental potential, Cartamus is such a species and there are cultivars for the production of oil and as well as for ornamental pourposes. Being a recent crop in Brazil, little is known about its associated diseases, specially those that affect the seeds and the soil borne, such as white mold that causes great losses to several crops. Six experiments were conducted with the objectives of testing the reaction of the crop to isolates of Sclerotinia sclerotiorum, the biocontrol of S. sclerotiorum and of pathogens associated to the seeds, and the effect of the biocontrollers on cartamus plant growth. Isolates of the pathogen from chrisantemum, lettuce, soybean, and carrots, as well as isolates of Trichoderma sp. (ETSR 20 e TC 1.15) and comercial products of Trichoderma spp. (Agrotrich and Trichodel®) were used. In the reaction test, the cartamus crop was more severely attacked by the isolate obtained from lettuce, which when incorporated to commercial substrate did not promote the development of the disease in plant, but reduced plant growth. Trichodel® was the product that promoted the highest growth of plants when incorporated to the substrate, even in the absence of the pathogen. The product more efficient in controlling seed pathogens was Agrotrich. In the growth of seedlings, the isolates ETSR20 and TC1.15 were the best, when applied to the seeds and the latter promoted the best emergency of seeds in commercial substrate. Therefore, the Trichoderma based products can be used in the control of seed pathogens and growth promotion of cartamus plants as seed or substrate treatment. There are differences in disease severity on cartamus among isolates of S. sclerotiorum from different crops and its presence reduces the crop s growth, even in the absence of visible symptoms / A floricultura, no Brasil, é relativamente recente, existindo espécies pouco conhecidas com alto potencial ornamental. O cártamo é uma delas e possui cultivares tanto para a produção de óleo quanto para ornamentação. Por ser uma cultura recente no Brasil, pouco se conhece sobre as doenças associadas a ela, especialmente as que afetam as sementes e as veiculadas pelo solo, como o mofo branco, que causa grandes prejuízos a diversas culturas. Seis experimentos foram conduzidos com o objetivo de testar a reação da cultura a isolados de Sclerotinia sclerotiorum, o biocontrole de patógenos associados às sementes e de Sclerotinia sclerotiorum e o efeito dos biocontroladores no crescimento de plantas de cártamo. Foram utilizados isolados de Sclerotinia sclerotiorum das culturas do crisântemo, alface, soja e cenoura, e isolados de Trichoderma spp. (ETSR 20 e TC 1.15) e formulados comerciais à base de Trichoderma spp. (Agrotrich e Trichodel®). No teste de reação, a cultura do cártamo foi mais severamente atacada pelo isolado proveniente da alface, o qual, quando incorporado ao substrato comercial, não promoveu o desenvolvimento da doença nas plantas, porém prejudicou seu crescimento. Trichodel® foi o produto que maior crescimento proporcionou às plantas quando incorporado ao substrato, mesmo sem a presença do patógeno. O produto mais eficiente no controle dos patógenos das sementes foi o formulado comercial Agrotrich. No crescimento de plântulas, os isolados ETSR 20 e TC 1.15 se sobressaíram quando aplicados às sementes e este obteve melhor resultado na emergência de plântulas em substrato. Assim, os produtos a base de Trichoderma são viáveis para controle de patógenos de sementes e crescimento de plantas tanto no tratamento de sementes como do substrato. Existem diferenças na severidade da doença em cártamo entre isolados de Sclerotinia sclerotiorum oriundos de diferentes culturas e sua presença reduz o crescimento da cultura, mesmo na ausência de sintomas visíveis

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 550307 bytes, checksum: 0df08c84d82f26ea26cca91aae2a1b91 (MD5) Previous issue date: 2011-07-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Knowledge about the genetic structure of the population of Sclerotinia sclerotiorum can help decide the most adequate white mold management strategies, especially the development and use of resistant cultivars. The objective of this work was to study the genetic structure of populations of S. sclerotiorum on bean crops in Minas Gerais. We quantified the genetic variability of 127 isolates from four beanproducing regions (subpopulations), based on eight microsatellite markers. There was high genetic variability, with most variation due to differences among individuals within subpopulations. We identified 59 alleles and 65 haplotypes, with 49 haplotypes represented by a single isolate. There was no evidence of random mating in the subpopulations. Highest clonal fraction was recorded for the Zona da Mata subpopulation. The total population is moderately structured. However, there was no genetic differentiation between subpopulations of Noroeste, Zona da Mata, and Triângulo. However, all three subpopulations differed from that of Sul. Six cluster of isolates were detected, with evidence of immigrants among them. Most of the isolates from Sul subpopulation constituted a single group. In other groups there was mixing of individuals from other subpopulations. The high genetic variability observed in the population of S. sclerotiorum warns for greater care in the selection of bean genotypes resistant to white mold. The selection process should be performed in different regions of Minas Gerais in order to minimize the risk of supplanting resistance. / O conhecimento sobre a estrutura genética da população de Sclerotinia sclerotiorum é importante para direcionar as estratégias de controle do mofo-branco do feijoeiro, principalmente o desenvolvimento e uso de cultivares resistentes ao patógeno. Objetivou-se estudar a estrutura genética das populações de S. sclerotiorum em lavouras de feijão em Minas Gerais. Analisaram-se 127 isolados provenientes de quatro regiões produtoras de feijão (subpopulações) em Minas Gerais quanto ao polimorfismo identificado por oito marcadores microssatélites. Houve alta diversidade genética, com maior parte da variação decorrente de diferenças entre indivíduos dentro das subpopulações. Identificaram-se 65 haplótipos, sendo 49 representados por um único isolado e 59 alelos. Não houve evidência de acasalamento aleatório nas subpopulações. Maior fração clonal foi registrada na subpopulação da Zona da Mata. A população está moderadamente estruturada. Contudo, não houve diferenciação genética entre as subpopulações do Noroeste, Zona da Mata e Triângulo Mineiro. Houve diferença da subpopulação Sul em relação às demais. Pela análise de agrupamento detectou-se a existência de seis grupos, com a presença de imigrantes entre eles. A maioria dos isolados da subpopulação Sul constituiu um único grupo. Nos outros grupos houve mistura de indivíduos das diferentes subpopulações. A alta variabilidade genética observada nas populações de S. sclerotiorum, implica em maiores cuidados na seleção de materiais resistentes ao mofo branco. O processo de seleção deve ser realizado em diferentes regiões de Minas Gerais a fim de minimizar os riscos de suplantação de resistência.