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Estudo genÃtico de caracterÃsticas de importÃncia econÃmica em uma populaÃÃo multirracial de ovinos de corte: uma abordagem quantitativa e molecular / Genetic study for economic traits in a multiracial population of meat sheep: a quantitative and molecular approachAna Maria Bezerra Oliveira LÃbo 15 February 2008 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Atualmente, existe uma grande possibilidade de associaÃÃo entre as Ãreas de genÃtica quantitativa e de genÃtica molecular. Isto pode causar importante impacto na seleÃÃo
de ovinos, com o estabelecimento de eficientes critÃrios de seleÃÃo para produÃÃo de carne. Com isso, os objetivos deste trabalho foram: verificar polimorfismos nos genes GDF9,
Calpastatina e Aromatase (CYP19); verificar a freqÃÃncia de variantes alÃlicas do tipo SNP nestes genes; verificar os efeitos destas variantes sobre caracterÃsticas produtivas e
reprodutivas de ovinos de uma populaÃÃo multirracial; estimar os parÃmetros genÃticos e os valores genÃticos destas caracterÃsticas, nesta populaÃÃo; verificar o efeito da inclusÃo do genÃtipo para estes genes nos modelos para estimativas de parÃmetros genÃticos e verificar o efeito do genÃtipo para estes genes sobre os valores genÃticos estimados. O gene GDF9 à um gene candidato relacionado com o fenÃtipo de alta prolificidade. O gene da Calpastatina possui importÃncia na produÃÃo de animais de corte, por està relacionado ao crescimento e a qualidade da carne. O gene da aromatase à um candidato afetando o desempenho produtivo e reprodutivo, pelo seu importante papel no metabolismo dos hormÃnios esterÃides. O polimorfismo do tipo (SNP) do gene CYP19 foi investigado pela tÃcnica PCR-RFLP em uma amostra de 133 animais de diversos grupos genÃticos de ovinos de corte. Foram estimadas as freqÃÃncias alÃlicas e genotÃpicas de polimorfismos deste gene e investigado o efeito destas variantes sobre caracterÃsticas de crescimento, reprodutivas e de habilidade materna, utilizando o procedimento GLM do software SAS. As caracterÃsticas estudadas foram peso ao nascer (PN), peso ao desmame (PD), peso ao abate (PA), peso a um ano de idade (P1), ganho de peso mÃdio diÃrio do nascimento ao desmame (Gn_d), ganho de peso mÃdio diÃrio do desmame ao abate (Gdes_abat), ganho de peso mÃdio diÃrio do desmame a um ano de idade (Gdes_ano), idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos (IP), perÃodo de gestaÃÃo (PG), dias para o parto (DP), peso total de crias nascidas por matriz por parto (PTCN) e peso total de crias desmamadas por matriz por parto (PTCD). ParÃmetros genÃticos e valores genÃticos foram estimados utilizando o mÃtodo da MÃxima VerossimilhanÃa Restrita Livre de Derivadas (DFREML). Foi avaliado o efeito da inclusÃo do genÃtipo para o gene da aromatase nos modelos para estimativas de parÃmetros genÃticos. Foi verificado o efeito do genÃtipo sobre os valores genÃticos estimados. NÃo foi possÃvel genotipar os animais para os genes GDF9 e Calpastatina, devido a dificuldades de padronizar as reaÃÃes. Assim, os animais foram genotipados apenas para o gene da aromatase. Na amostra estudada para o gene da aromatase, nÃo foram observados indivÃduos com genÃtipo AA. As freqÃÃncias para os genÃtipos AB e BB foram 0,65 e 0,35, respectivamente. A freqÃÃncia alÃlica diferiu entre os grupos genÃticos estudados. O gene da aromatase apresentou influÃncia sobre a maioria das caracterÃsticas estudadas, havendo diferenÃas no padrÃo desta influÃncia, de acordo com o grupo genÃtico considerado. As herdabilidades diretas estimadas foram 0,21, 0,25, 0,52, 0,39, 0,24, 0,20, 0,21, respectivamente, para PN, PD, PA, P1, Gn_d, Gdes_abat e Gdes_ano, e 0,01, 0,06, 0,14, 0,06, 0,20 e 0,11, respectivamente, para IPP, IP, PG, DP, PTCN e PTCD. CorrelaÃÃes genÃticas positivas foram estimadas entre os pesos corporais. A correlaÃÃo genÃtica entre Gn_d e Gdes_abat foi de 0,37 e entre Gn_d e Gdes_ano foi de 0,55. CorrelaÃÃes genÃticas negativas foram estimadas entre IPP com IP e PG. PTCN apresentou correlaÃÃo genÃtica de 0,52 com PTCD. O uso da informaÃÃo do genÃtipo dos animais para o gene da aromatase melhorou o ajuste dos modelos de anÃlises genÃtica sob metodologia BLUP. Os indivÃduos com genÃtipo AB apresentaram superioridade genÃtica em relaÃÃo Ãqueles de genÃtipo BB para a maioria das caracterÃsticas estudadas. Pode se concluir que o uso da seleÃÃo assistida por marcadores permitirà o aumento da eficiÃncia da seleÃÃo atualmente em prÃtica com o uso das metodologias tradicionais de genÃtica quantitativa / Nowadays, there is great possibility of association between quantitative and molecular genetics. An important impact would be expected in the sheep selection, with the establishment of efficient criteria for meat production selection. The aims of this work were to verify polymorphisms in GDF9, Calpastatine and Aromatase (CYP19) genes; to verify the frequencies of SNP allelic variants in these genes; to verify the effects of these variants on
productive and reproductive traits in a multiracial sheep population; to estimate genetic parameters and breeding values of these traits in this population; to verify the effect of genotype of these genes on models to estimate the genetic parameters and to verify the effect of genotype for these genes on estimated breeding values. GDF9 gene is a candidate related to phenotype of high prolificacy. The calpastatine gene has importance on production of meat animals, as it is related to growth and meat quality. Aromatase gene is a candidate affecting the productive and reproductive performance, by its important role in the steroid hormone metabolism. SNP polymorphism of CYP19 gene was investigated by PCR-RFLP technique in a sample of 133 animals from several breed groups of meat sheep. Allelic and genotypic frequencies were estimated for this polymorphism and the effect of these variants on growth,reproductive and maternal traits were investigated, using GLM procedure of SAS software. The studied traits were birth weight (PN), weaning weight (PD), slaughter weight (PA), yearling weight (P1), weight gain from birth to weaning (Gn_d), weight gain from weaning to slaughter (Gdes_abat), weight gain from weaning to yearling (Gdes_ano), age at first lambing (IPP), lambing interval (IP), gestation length (PG), lambing date (DP), total weight of lambs born for female for lambing (PTCN) and total weight of weaned lambs for female for lambing (PTCD). Genetic parameters and breeding values were estimated by Derivative Free Restricted Maximum Likelihood (DFREML) method. The effect of genotype inclusion in analysis models for estimation of genetic parameters was evaluated. The effect of genotype on estimated breeding value was verified. It was not possible to verify the genotype of the animals for GDF9 and Calpastatine genes due the difficulties on the reactions standardizations. So the animals were genotyped only for aromatase gene. In studied sample, it is not observed animals with AA genotype. The frequencies for AB and BB were 0.65 and 0.35,respectively. The allelic frequency did differ among studied breed groups. The aromatase gene presented influence on most studied traits, with difference in this influence according to breed group. The direct heritabilities were 0.21, 0.25, 0.52, 0.39, 0.24, 0.20, 0.21, respectively, for PN, PD, PA, P1, Gn_d, Gdes_abat and Gdes_ano, and 0.01, 0.06, 0.14, 0.06, 0.20 and 0.11, respectively, for IPP, IP, PG, DP, PTCN and PTCD. Positive genetic correlations were estimated among corporal weights. Genetic correlation between Gn_d and Gdes_abat was 0.37 and between Gn_d and Gdes_ano was 0.55. Negative genetic correlations were estimated between IPP with IP and PG. PTCN presented genetic correlation of 0.52 with PTCD. The use of information of genotype of aromatase gene increased the efficiency of models for genetic analyses by BLUP methodology. The animals with AB genotype presented
genetic superiority for most studied traits in relation to those with BB genotype. It is possible conclude that the use of marked assisted selection will permit increase the efficiency of selection today in practice with the use of traditional quantitative genetic methodologies
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Análise de polimorfismos em tumores gliais humanos / Polymorphisms Analysis in Human Glial TumorsAline Cadurin Custódio 31 March 2011 (has links)
Os tumores do sistema nervoso central representam aproximadamente 2% de todos os tipos de cânceres. Embora a incidência dos tumores do SNC seja pequena, comparada com outras neoplasias, estes tumores estão entre as mais graves malignidades humanas, pois afetam o órgão responsável pela coordenação e integração de todas as atividades orgânicas. Os gliomas são os tumores mais comuns do SNC. Apesar do progresso marcante na caracterização da patogênese molecular dos gliomas, esses tumores permanecem incuráveis e, na maioria dos casos, refratários aos tratamentos, devido à sua heterogeneidade molecular. O aparecimento desses tumores ocorrem a partir do acúmulo de alterações genéticas nas células. Para entender o mecanismo molecular de formação e progressão tumoral é indispensável identificar os genes que acumulam essas alterações. Um polimorfismo de base única (SNP Single Nucleotide Polymorphism) é geralmente definido como uma substituição estável de apenas uma base na molécula de DNA com frequência maior que 1%, em pelo menos uma população Os SNPs são reconhecidos como importantes ferramentas na genética humana e médica e têm sido amplamente utilizados nos estudos de associação genética de várias doenças complexas, como por exemplo: distúrbios cardiovasculares, psiquiátricos e autoimunes, obesidade, osteoporose, diabetes e câncer Sendo assim, este trabalho teve como objetivo analisar polimorfismos entre populações caso e controle na intenção de identificar associações destes genótipos na suscetibilidade aos tumores. A técnica utilizada para a análise de polimorfismos foi de PCR-RFLP onde observamos diferenças nas distribuições genotípicas entre pacientes e controles nos SNPs EGF+61, GSTP-1Ile 105 Val, XRCC1 Arg 194 Trp, Pro 206 Pro, Arg 280 His, Arg 399 Gln, Gln 632 Gln, XRCC2 Arg 188 His, XRCC3 Thr 241 Met e XRCC4 G1394T, onde as variantes EGF G61, Trp194, Val105, Pro206, His280, Gln632, His188, Met241 e XRCC4 T1394 foram observados com maior freqüência entre os portadores de gliomas. Dessa forma, estas variantes podem ser fatores de susceptibilidade para o desenvolvimento dos tumores. / The Central nervous system tumors represent about 2% of all cancers. Although the incidence of CNS tumors is small compared with other cancers, these tumors are among the most serious human malignancies, because they affect the body responsible for coordination and integration of all organic activities. Gliomas are the most common tumors of the CNS. Despite remarkable progress in characterizing the molecular pathogenesis of gliomas, these tumors remain incurable and, in most cases, refractory to treatment, due to its molecular heterogeneity. The appearance of these tumors occurs from the accumulation of genetic changes in cells. To understand the molecular mechanism of tumor formation and progression is essential to identify genes that accumulate these changes. A single base polymorphism (SNP Single Nucleotide Polymorphism) is generally defined as a stable replacement of only one base in the DNA molecule often greater than 1% in at least one population SNPs are recognized as important tools in human genetics and medical and have been widely used in genetic association studies of various complex diseases, such as: cardiovascular, psychiatric and autoimmune diseases, obesity, osteoporosis, diabetes and cancer. Thereby, the objective of this study was to analyze the polymorphisms between cases and control the intention to identify associations of these genotypes in susceptibility to tumors. The technique used for the analysis of polymorphisms were PCR-RFLP where we observe differences in genotype between patients and controls in the EGF +61, GSTP-1 Ile105Val, XRCC1 Arg 194 Trp, Pro 206 Pro, Arg 280 His, Arg 399 Gln, Gln 632 Gln, XRCC2 Arg 188 His, XRCC3 Thr 241 Met and XRCC4 G1394T, where the variants EGF G61, Trp194, val105, Pro206, His280, Gln632, His188, Met241 and XRCC4 T1394 were observed more frequently among patients with gliomas. Thus, these variants can be important factors of susceptibility to the tumor development.
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Detecção de mutações em pacientes deficientes do fator VIIRodrigues, Dalva Nery 27 August 2002 (has links)
Orientador: Joyce Maria Annichino-Bizzacchi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-02T08:19:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2002 / Resumo: O fator VII humano é uma glicoproteína dependente da vitamina K que tem a função de iniciar a coagulação sanguínea, ao formar um complexo com o fator tissular. O gene do fator VII está localizado no cromossomo 13q34, é composto por 9 exons e 8 introns, e possui 12,8 kb. A deficiência do fator VII é transmitida por herança autossômica recessiva, e os aspectos clfnicos são muito variáveis, nem sempre havendo uma correlação entre a atividade do fator VII e a tendência hemorrágica. Apenas um estudo, em 705 doadores de sangue de origem inglesa, determinou que a prevalência da deficiência de fator VII foi de 2,1%. A origem étnica da população brasileira é muito diferente, sendo altamente heterogênea e composta de imigrantes da Europa, África, Ásia e indígenas. Neste estudo a prevalência da deficiência de fator VII em 267 pacientes brasileiros acompanhados no Ambulatório de Hemostasia do Hemocentro-Unicamp, por alteração laboratorial do tempo de protrombina, ou quadro clínico hemorrágico foi de 3,7%.
A análise das mutações no gene do F7 em seis pacientes não relacionados, permitiram a identificação de um defeito genético em todos os pacientes, incluindo uma nova mutação de ponto. O rastreamento das alterações moleculares foi realizado pelos métodos de SSCP e CSGE, que se mostraram complementares. O método de SSCP evidenciou um padrão anormal em dois pacientes não relacionados, referente a mutação G10828A no exon 8, levando a substituição R304Q. O CSGE revelou quatro padrões anormais referentes a três mutações no exon 8 (G10846T que corresponde a C310F; G10828A que corresponde a R304Q; e G10909A que corresponde a G331D) e uma mutação no exon 6 (G8926T que corresponde a 11405), esta a única ainda não descrita anteriormente. A atividade plasmática do fator VII varia significativamente inter e intraindividualmente. Essas variações podem ser decorrentes de fatores adquiridos e genéticos. Assim determinamos cinco polimorfismos no gene do fator VII (5'F7, IV57, R353Q, -401GIT e --402G/A), mas apesar do
pequeno número de pacientes analisados, não se detectou nenhuma relação entre os genõtipos e a atividade do fator VII / Abstract: Factor VII is a vitamin K-dependent glycoprotein with a pivotal role in the initiation of the blood coagulation, following interaction with tissue factor. The Factor VII gene is located on chromosome 13q34 and is consist of nine exons and eight introns spanning 12,8Kb. Factor VII deficiency is transmitted as an autossomal recessive trait, the
incidence of the disorder in the general population being 1 in 500.000. The clinical manifestations of Factor VII deficiency are variable, and there is no correlation between coagulation activity and tendency to bleed. A prevalency of 2,1% was reported for Factor VII deficiency in a series of 705 English blood donors. In the present study, the prevalence of. Factor VII deficiency based on na altered prothrombin time or hemorrhagic state 267 brazilian patients attended at the Hemostasis Ambulatory of Hemocentre at UNICAMP was 3,7%. Analysis of the Factor VII gene in six unrelated patients revealed a genetic defect in ali cases, including a new point mutation. The screening for molecular alterations was done using SSCP and CSGE, which gave complementary result.s. SSCP gave an abnormal pattern in two unrelated patients in which the mutation G10828A in the exon 8,resulted in the substituation R304Q. CSGE identified four abnormal patterns resulting from three mutations in exon 8 (G10846T corresponding to C310F; G10828A corresponding to R304Q; and G10909A corresponding to G331D) one mutation in exon 6 (G8926T corresponding to 1140S), the only one of these mutations not already described. Plasma Factor VII activity showed considerable inter-and intra-individual variation which may have resulted from acquired or genetic factors. Five polymophisms in the Factor VII gene, which can contribute to Factor VII levei variation were described (5'F7, IVS7, R353Q, -401GIT and -402G/A). However, the study of these patients with FVII deficiency demonstrated no relationship between the genotypes and Factor VII activity / Mestrado / Mestre em Farmacologia
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Investigação da fertilidade diferencial das heterozigotas como um eventual mecanismo homeostatico de manutenção do polimorfismo da hemoglobina S e da talassemia betaMazzi, Michelle Marcondes 12 February 2002 (has links)
Orientadores : Antonio Sergio Ramalho, Luis Alberto Magna / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-02T20:18:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2002 / Resumo: Os mecanismos homeostáticos de manutenção do polimorfismo da hemoglobina S e da talassemia beta ainda não estão totalmente esclarecidos, admitindo-se a existência de mecanismos complementares ou alternativos, em relação à hipótese de seleção favorável dos heterozigotos pela malária. O aumento de fertilidade das heterozigotas é um dos processos sugeridos, embora só tenha sido testado até o momento em estudos indiretos e/ou realizados em áreas malarígenas, onde é difícil afastar a influência dessa parasitemia sobre o comportamento reprodutivo das heterozigotas. No presente trabalho, a fertilidade de portadoras do traço falciforme (heterozigotas AS) e do traço talassêmico beta (heterozigotas AT) foi comparada de forma direta à de suas irmãs com hemoglobina normal (homozigotas AA), em região não malarígena (Araras, SP). Foram estudadas 53 heterozigotas AS e 43 irmãs AA, casadas ou com parceria estável com maridos AA, bem como 68 heterozigotas AT e 45 irmãs AA, igualmente casadas com indivíduos com hemoglobina normal. As heterozigotas e as suas irmãs-controle foram comparadas quanto à idade, pelo teste de Mann-Whitney, sem diferença significativa. O número médio de filhos das heterozigotas AS e AT (3,0755 e 2,7647, respectivamente) não diferiu significativamente do observado nas amostras-controle (3,0000 e 2,3778, respectivamente). Além disso, não foi observada diferença significativa entre heterozigotas e controles, no que diz respeito à proporção de mulheres casadas sem filhos, quando comparadas pelo teste exato de Fisher. Tais resultados não favoreceram, portanto, a hipótese de o aumento de fertilidade das heterozigotas ser um mecanismo homeostático de manutenção do polimorfismo da hemoglobina S e da talassemia beta / Abstract: Homeostatic mechanisms that maintain hemoglobin S and beta thalasemia are not completely clear so far, being considered the presence of mechanisms either complimentary or alternative concerning the hypothesis of favorable selection of heterozygous by malaria. Increased fertility of heterozygous women is one of the suggested processes, though it has only been tested so far in indirect surveys and/or ones that have been carried out in areas with endemic malaria, which makes it difficult to split apart the influence of this disease over the reproductive behavior of heterozygous women. In the present work, the fertility of sickle-cell trait women (heterozygous AS) and thalasemic trait (heterozygous AT) was directly compared to the fertility of their sisters carrying normal hemoglobin (homozygous AA). The samples were obtained in a non-endemic malaria area (Araras, SP). It has been studied 53 AS women and their 43 AA sisters, both either married or sharing a stable relationship with their husband AA, as well as 68 AT women and their 45 AA sisters, also married with normal hemoglobin husbands. The average number of children per heterozygous AS and AT women (3.0755 and 2.7647 respectively) did not differ significantly from those observed among their control sisters (3.0000 and 2.3778 respectively). In addition, it was not observed a significant difference between the proportion of married women without children between the heterozygous women and their control sisters. The results herein presented hence does not support the hypothesis of increased fertility of heterozygous women as being a homeostatic mechanism able to maintain the polymorphism of either hemoglobin S and beta thalasemia / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas
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Analise citogenetica e do DNA mitocondrial de populações de Hyla semiguttata (Anura, Hylidae) e especies relacionadasAnanias, Fernando 27 September 2002 (has links)
Orientador : Shirlei Maria Recco-Pimentel / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-02T18:19:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2002 / Resumo: Populações polimórficas de Hyla semiguttata e espécies relacionadas, pertencentes ao grupo de Hyla pulchella, foram analisadas citogeneticamente e através das seqüências de segmentos do gene citocromo b e da região controle do DNA mitocondrial. Todas as populações do táxon H semiguttata apresentam polimorfismo no padrão de coloração, tamanho corpóreo e diferenças na vocalização de anúncio. A análise cito genética mostrou cariótipos com 2n = 24 cromossomos com morfologia muito conservada em todas as espécies e o mesmo padrão de banda C. A região organizadora do nuc1éolo (NOR) foi detectada no braço longo do par 10 em H marginata e no braço curto do par 1 nas populações de H semiguttata de São Francisco de Paula e Cambará do Sul, RS e de Piraquara, PR, H marginata e Hyla sp. (aff semiguttata) de Misiones, Argentina. Este foi o único caráter que as diferenciaram do ponto de vista citogenético, contrariando a sugestão de alguns autores de sinonimização de H semiguttata e H joaquini à H marginata. A análise filo genética baseada em 361 pb do gene citocromo b e 744 pb da região controle mostraram que a população de H semiguttata de São Francisco de Paula é muito próxima de H joaquini, contrariando a hipótese filo genética baseada em caracteres morfológicos e biológicos, que indicam uma proximidade maior com a população de Cambará do Sul. As populações de H semiguttata de Palmeira e Piraquara são muito próximas entre si e distantes das demais. Apesar de H marginata apresentar diferenças morfológicas e biológicas em relação às espécies Hyla sp. (aff polytaenia), H bishoffi e H guentheri, geneticamente parece ser muito próxima. A presença de Hyla sp. (aff polytaenia) (grupo de H polytaenia) neste mesmo c1ado indica que o grupo de H pulchella pode ser parafilético. Hibridação natural entre H bischoffi e Hyla sp. n. sugere que eventos cladogênicos possam estar ocorrendo entre estes taxa em simpatria e que o padrão de canto semelhante facilitou este processo. Como já sugerido por outros autores, muitos eventos cladogênicos estariam relacionados com a especiação de hilídeos neotropicais o que dificulta um estudo envolvendo populações polimórficas, principalmente quando o polimorfismo está relacionado com o padrão de coloração / Abstract: Polymorphic populations of Hyla semiguttata and related species in the Hyla pulchella group were analyzed cytogenetically and by comparing the sequences of the cytochrome b gene and the control region of mitochondrial DNA. All H semiguttata populations showed polymorphism in color pattern, body size and acoustics. The cytogenetic analysis showed a karyotype with 2n = 24 chromosomes and a very conserved chromosomal morphology in all of the species. H semiguttata from São Francisco de Paula and Cambará do Sul, RS and Piraquara, PR, H marginata, and Hyla sp. (aff. semiguttata) from Misiones, Argentina had the same C-banding pattern. The nucleolar organizer region (NOR) located in the long arm of pair 10 in H marginata and in the short arm of pair 1 in the other specie the on1y character that differentiated these species cytogenetically. These results do not support the suggestion of some authors for the synonymization of H semiguttata and H joaquini with H marginata. The phylogenetic analysis based on 361 bp of the cytochromo b gene and 744 bp of the control region of mitochonsdrial DNA showed that the H semiguttata population at São Francisco de Paula was very close to H joaquini, in contrast to the phylogenetic conclusions based on morphological and biological characters, which indicated a greater proximity with the population at Cambará do Sul. The populations of H semiguttata at Palmeira and Piraquara were very close to each other and distant form the other populations. Although H marginata differs morphologically and biologically from Hyla aff. polytaenia, H bishoffi and H guentheri, our analysis showed them to be very closely related. The presence of Hyla sp. (aff. polytaenia) (H polytaenia group) in this clado indicates that the H pulchella group may be paraphyletic. Natural hybridization between H bischoffi and Hyla sp. n. demonstrates that cladogenic events may occurr between sympatric taxa and that the similar vocalization patterns of the two species facilitates this process. As already suggested by other many cladogenic events have been involved in the speciation of neotropical hylids, which makes it difficult a study polymorphic populations, especially when the polymorphism is related to the pattern of coloration / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Polimorfismos de inversões cromossomicas em drosophila mediopunctataAnanina, Galina 03 August 2018 (has links)
Orientador: Louis Bernard Klaczko / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T16:43:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2003 / Doutorado
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Influencia de polimorfismos geneticos sobre a perda precoce de implantes dentais endoosseosCampos, Maria Isabela Guimarães 03 August 2018 (has links)
Orientador: Sergio Roberto Peres Line / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T18:55:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2003 / Mestrado
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Determinação do Polimorfismo de Seis STRs do Cromossomo X humano na população do Estado Pernambuco, BrasilCavalcante da Silva, Vanessa January 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007 / As Seqüências Repetidas em Tandem (STRs) presentes nos
cromossomos sexuais são ferramentas importantes na genética forense.
As X-STRs são especialmente úteis em casos complexos de testes de
paternidade e naqueles de identificação de sexo. Com o objetivo de
caracterizar a população pernambucana quanto ao polimorfismo de seis
X-STRs (DXS7132, DXS6789, DXS8377, DXS101, DXS10011 e ARA), foi
analisado um total de 300 homens e 300 mulheres não aparentados. O
teste para o desequilíbrio de ligação entre os locos na subamostra
feminina não revelou evidência consistente de associação entre os
marcadores (p>0,214) e a verificação da diversidade haplotípica, na
subamostra masculina, revelou que todos os haplótipos foram únicos. A
heterozigosidade variou de 0,743 (DXS7132) a 0,937 (DXS8377) e o
poder de discriminação (PD) de 0,906 (DXS7132) a 0,993 (DXS10011).
Com base no cálculo da distância genética a partir dos dados dos
marcadores DXS7132, DXS8377, DXS6789 e DXS101, concluiu-se que a
população pernambucana está geneticamente mais próxima da
portuguesa (0.022) e da espanhola (0.029) do que da afro-americana
(0.036). O presente trabalho demonstra que estes marcadores genéticos
são altamente discriminantes, e portanto, úteis em propósitos forenses e
estudos populacionais
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Distribuição de polimorfismos de base única (SNPS) nos genes da lectina ligadora de manose (MBL2) e da beta-defensina humana 1 (DEFB1) entre pacientes com tuberculoseLacerda Alves da Cruz, Heidi 31 January 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Fatores genéticos podem desempenhar um importante papel na susceptibilidade à tuberculose
(TB), uma das doenças com maior índice de mortalidade entre as enfermidades causadas por
um único agente etiológico. Esta doença infecto-contagiosa, causada pelo bacilo
Mycobacterium tuberculosis, tem sido responsável pela morte de milhões de pessoas
anualmente. Polimorfismos de base única (SNPs) em genes responsáveis pela imunidade inata
têm sido alvo de diversos estudos e mostraram-se de grande importância na susceptibilidade a
infecções. O presente trabalho teve como objetivo analisar a associação entre SNPs funcionais
nos genes MBL2 e DEFB1 e a susceptibilidade à infecção promovida pelo M. tuberculosis.
Foram selecionados 115 pacientes com TB e 180 adultos saudáveis provenientes da cidade do
Recife, Brasil. Os SNPs localizados no gene MBL2 foram genotipados através da PCR em
tempo real (qPCR), enquanto que os SNPs presentes no gene DEFB1 foram genotipados
através do sequenciamento de DNA. Para o gene MBL2, foram genotipadas as regiões
promotoras (H/L e X/Y), através de uma PCR alelo-específica, e o éxon 1 (A/O), através da
curva de dissociação. Para o gene DEFB1, foram genotipadas as posições -52, -44 e -20 da
região 5 UTR. Os SNPs foram agrupados segundo o alelo, as freqüências alélicas e
genotípicas encontradas foram calculadas e comparadas entre os grupos estudados. As
freqüências das variantes do MBL2 nos pacientes foram diferentes das freqüências
encontradas no grupo controle. Todas as populações encontraram-se em equilíbrio de Hardy-
Weinberg. Tanto o alelo L quanto o alelo O apresentaram efeito de risco para o grupo de
pacientes com TB em relação aos pacientes controles. Da mesma forma, as freqüências
genotípicas foram significativamente diferentes em pacientes com TB quando comparadas aos
pacientes controles, com os genótipos OO e LL presentes principalmente nos doentes em
relação aos indivíduos saudáveis. Para o promotor X/Y, foi observado um efeito protetor do
polimorfismo, com freqüência tanto do alelo X quanto do genótipo XX para a população
controle quando comparadas com o grupo de pacientes. A análise dos haplótipos revelou que
os genótipos combinados responsáveis pela alta produção de MBL apresentaram-se
significativamente mais freqüentes nos controles do que nos pacientes com TB. Os haplótipos
para produção deficiente apresentou-se com maior freqüência nos pacientes do que nos
controles. Em relação aos polimorfismos no gene DEFB1 não foram observadas diferenças
significativas entre os dois grupos estudados. Apesar disso, foi observada uma tendência para
que polimorfismos na posição -20 localizados na região 5 UTR estejam relacionadas com a
susceptibilidade à tuberculose, principalmente na forma extrapulmonar da doença. Em
conclusão, nossos resultados indicam que a presença de SNPs no gene MBL2, responsáveis
pela diminuição dos níveis da proteína MBL, encontram-se associados a uma maior
susceptibilidade ao bacilo da TB, representando uma molécula fundamental durante os
primeiros estágios de infecção pelo M. tuberculosis. Nossos resultados mostraram que a
presença de SNPs tanto na região promotora quanto no éxon 1 do MBL2 aparece como um
fator de risco para a infecção, podendo ser utilizados no desenvolvimento de novos
tratamentos individualizados. No entanto, o mesmo não pôde ser afirmado para HBD-1,
apesar de ser uma proteína fundamental à imunidade inata, não foram encontradas associações
entre polimorfismos do gene DEFB1 e a tuberculose. Vale ressaltar que este é o primeiro
relato descrito na literatura que envolve um estudo de associação entre polimorfismos
funcionais do DEFB1 e o seu papel na infecção e desenvolvimento da tuberculose. O papel
das proteínas solúveis da imunidade inata na infecção pelo M. tuberculosis está longe de ser
compreendido e o conhecimento encontra-se restrito, necessitando-se de mais informações a
cerca da interação existente entre o Homem e as micobactérias como um caminho a ser
percorrido visando no futuro o controle da doença
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Reação hansênica e imunidade: polimorfismos do gene NRAMP1(SLC11A1) em indivíduos paucibacilares e multibacilares atendidos em dois centros de referência no Recife, nordeste do BrasilTEIXEIRA, Márcia Almeida Galvão 31 January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / A hanseníase é uma doença infecciosa que pode vir acompanhada das reações
hansênicas que são quadros frequentes e importantes no contexto da doença,
pois podem ser responsáveis pelo retratamento e pelas incapacidades. O
entendimento dos padrões reacionais é primordial para o seu manejo. Vários são
os fatores, dentre eles o genético, que podem influenciar no desenvolvimento das
formas clínicas da hanseníase e das reações. Este trabalho consta de dois
artigos. O primeiro cujo título é: Características epidemiológicas e clínicas das
reações hansênicas em indivíduos paucibacilares e multibacilares atendidos em
dois centros de referência para hanseníase na cidade de Recife-PE , teve a
finalidade de descrever as características epidemiológicas e clínicas de 201
pacientes com história de quadro reacional. Variáveis epidemiológicas e clínicas
como baciloscopia inicial, sexo, idade, fototipo, procedência, forma clínica,
retratamento e tipo de tratamento e de reação, índice baciloscópico final e período
de surgimento da reação em relação ao tratamento, foram avaliados. Para cálculo
dos fatores de risco para as formas multibacilares foram realizadas análises
univariada e multivariada. Sexo masculino, pele fototipo V, idade entre 30 - 44
anos e procedência do Recife caracterizaram a maioria da amostra. Em relação
às características clínicas, a forma clínica borderline, tratamento regular, reação
tipo I, neurite, presença de 10 a 20 nódulos e surgimento da reação hansênica
durante o tratamento foram os achados mais frequentes. Pela análise univariada,
os pacientes submetidos ao retratamento tiveram chance uma vez maior de
serem multibacilares. Ainda em relação à comparação do quadro reacional entre
indivíduos paucibacilares e multibacilares, pela análise multivariada, indivíduos do
sexo masculino tiveram chance uma vez maior de serem multibacilares. As
reações hansênicas se desenvolveram predominantemente durante o tratamento.
O segundo artigo, sob o título: Polimorfismos do gene NRAMP1 em indivíduos
com reações hansênicas atendidos em dois centros de referência no Recife,
Nordeste do Brasil abordou o aspecto genético da amostra estudada no primeiro
artigo, avaliando três polimorfismos do gene NRAMP1 por meio de um estudo
comparativo e observacional, que através do polimorfismo de fragmento de
restrição (RFLP), investigou a frequência de três polimorfismos gênicos da
proteína NRAMP1: 274C/T, D543N, 1729+55del4. O genótipo mutante 274 TT foi
associado positivamente ao eritema nodoso (p=0,04) e negativamente à reação
reversa (p=0,03). Esses resultados sugerem que o polimorfismo 274 C/T do gene
NRAMP1 pode auxiliar na determinação da susceptibilidade à reação tipo II em
indivíduos com hanseníase
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