Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2015-05-19T16:34:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Carolina da Rocha Simões.pdf: 2694652 bytes, checksum: 6446d4fa347e53fe42ce7e769f745124 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-19T16:34:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Carolina da Rocha Simões.pdf: 2694652 bytes, checksum: 6446d4fa347e53fe42ce7e769f745124 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / CAPES / O aumento da informação proveniente do sequenciamento de alta performance (NGS), e de projetos como o 1000 genomas e HapMap, permitiram a descoberta de milhões de variações. Entretanto, o maior desafio é a identificação da relação entre o genótipo e o fenótipo, proporcionando informações que possam ajudar a definir os polimorfismos que podem ou não causar doenças. Ferramentas computacionais tem auxiliado na predição das modificações estruturais geradas pelos polimorfismos, e as consequentes alterações funcionais sofridas pelas proteínas. Os receptores Toll Like (TLR) são proteínas do sistema imunológico que estão envolvidas na regulação da inflamação e em alguns casos no desenvolvimento do câncer. O objetivo deste projeto foi analisar, através de ferramentas in silico, os polimorfismos de base única nos genes das TLRs, buscando por polimorfismos que possam estar relacionados com a predisposição ao câncer e com alterações da via de sinalização das TLRs. Foram encontrados 37 genes que estão envolvidos na via de sinalização e podem ser utilizados como marcadores genéticos (biomarcadores) para o diagnóstico e predição das alterações na expressão dos genes relacionados à esta via. Estes genes, se regulados, podem ser utilizados como inibidores. Em relação aos polimorfismos foram coletados no banco de dados dbSNP/NCBI 5.839 SNPs entre os 10 genes das TLRs. Destes, 1.017 variações foram classificadas como missense e analisadas para avaliar as consequências estruturais pela troca dos aminoácidos. Para isso quatro ferramentas preditoras (SIFT, Polyphen, MutationAssessor e SDM) foram utilizadas gerando informações sobre as modificações e associando-as com possíveis danos nas proteínas. Dos polimorfismos analisados 223 foram classificados como danosos baseados na troca de aminoácido e podem causar uma desregulação funcional na proteína. Entre eles está o rs5743708 (TLR2), rs3775291, (TLR3) e rs11466653 (TLR10) que já foi estudado in vitro e tiveram associação com câncer colorectal (TLR2 e 3) e carcinoma da tireóide (TLR10). A predição prévia, in silico, das alterações funcionais pode auxiliar na interpretação das variações gênicas, neste caso associadas com o câncer, e também na caracterização precisa dos fatores que levam a estas alterações, contribuindo no diagnóstico, na prevenção e em melhores respostas aos tratamentos oferecidos.

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2015-05-21T18:13:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação - Matheus Filgueira Bezerra.pdf: 1273109 bytes, checksum: 6d941505fbd1fa66ae0aee92822b04dd (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-21T18:13:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação - Matheus Filgueira Bezerra.pdf: 1273109 bytes, checksum: 6d941505fbd1fa66ae0aee92822b04dd (MD5) Previous issue date: 2014-11-19 / Capes / Leucemia mielóide aguda (LMA) é uma doença de caráter multifatorial e heterogênea. Alterações somáticas no código genético recorrentes na LMA são causadas principalmente por agentes químicos e físicos nocivos ao DNA, associados a falhas nos sistemas de reparo. Pesquisas realizadas na última década sugerem que metilação aberrante e polimorfismos genéticos em genes supressores tumorais e genes do metabolismo de radicais livres podem estar envolvidos na leucemogênese. O presente estudo teve como objetivo investigar a associação entre polimorfismos nos genes TP53 codon 72, GSTT1, GSTM1 e hipermetilação da região promotora do gene BRCA1 com a leucemia mielóide aguda. Duzentos e vinte e três pacientes adultos diagnosticados com LMA e 202 indivíduos adultos são (controles) foram genotipados para polimorfismos no TP53, GSTT1 e GSTM1 e 55 pacientes com AML de novo foram avaliados para metilação no BRCA1. As frequências observadas para o TP53 foram: 33,6% ARG/ARG, 44,4% ARG/PRO e 22% PRO/PRO nos pacientes e 38,3% ARG/ARG, 48,5 ARG/PRO e 12,8% PRO/PRO nos controles. O alelo PRO foi associado à susceptibilidade ao desenvolvimento de LMA no modelo genético recessivo (p=0.0198), no co-dominante (p=0.0291) e no alélico (p=0.0438). O polimorfismo do GSTT1 foi observado em 23% dos pacientes e em 27% dos controles (p=0,297). O polimorfismo do GSTM1 foi observado em 45% dos pacientes e em 43% dos controles (p=0,573) e a co-ocorrência dos dois polimorfismos foi observada em 12% dos casos e 8,5% dos controles (p=0.286). Nenhuma associação foi encontrada entre os polimorfismos nos genes GSTs e LMA. O gene BRCA1 não foi encontrado hipermetilado em nenhum dos 55 pacientes analisados. Os resultados do presente estudo apontam que o polimorfismo do TP53 parece favorecer a leucemogênese. Em contrapartida, os polimorfismos no GSTT1, GSTM1 e metilação do BRCA1 parecem não ter relevância na leucemia mielóide aguda.

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2015-05-21T18:40:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação - Matheus Filgueira Bezerra.pdf: 1273109 bytes, checksum: 6d941505fbd1fa66ae0aee92822b04dd (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-21T18:40:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação - Matheus Filgueira Bezerra.pdf: 1273109 bytes, checksum: 6d941505fbd1fa66ae0aee92822b04dd (MD5) Previous issue date: 2014-11-19 / CAPES / Leucemia mielóide aguda (LMA) é uma doença de caráter multifatorial e heterogênea. Alterações somáticas no código genético recorrentes na LMA são causadas principalmente por agentes químicos e físicos nocivos ao DNA, associados a falhas nos sistemas de reparo. Pesquisas realizadas na última década sugerem que metilação aberrante e polimorfismos genéticos em genes supressores tumorais e genes do metabolismo de radicais livres podem estar envolvidos na leucemogênese. O presente estudo teve como objetivo investigar a associação entre polimorfismos nos genes TP53 codon 72, GSTT1, GSTM1 e hipermetilação da região promotora do gene BRCA1 com a leucemia mielóide aguda. Duzentos e vinte e três pacientes adultos diagnosticados com LMA e 202 indivíduos adultos são (controles) foram genotipados para polimorfismos no TP53, GSTT1 e GSTM1 e 55 pacientes com AML de novo foram avaliados para metilação no BRCA1. As frequências observadas para o TP53 foram: 33,6% ARG/ARG, 44,4% ARG/PRO e 22% PRO/PRO nos pacientes e 38,3% ARG/ARG, 48,5 ARG/PRO e 12,8% PRO/PRO nos controles. O alelo PRO foi associado à susceptibilidade ao desenvolvimento de LMA no modelo genético recessivo (p=0.0198), no co-dominante (p=0.0291) e no alélico (p=0.0438). O polimorfismo do GSTT1 foi observado em 23% dos pacientes e em 27% dos controles (p=0,297). O polimorfismo do GSTM1 foi observado em 45% dos pacientes e em 43% dos controles (p=0,573) e a co-ocorrência dos dois polimorfismos foi observada em 12% dos casos e 8,5% dos controles (p=0.286). Nenhuma associação foi encontrada entre os polimorfismos nos genes GSTs e LMA. O gene BRCA1 não foi encontrado hipermetilado em nenhum dos 55 pacientes analisados. Os resultados do presente estudo apontam que o polimorfismo do TP53 parece favorecer a leucemogênese. Em contrapartida, os polimorfismos no GSTT1, GSTM1 e metilação do BRCA1 parecem não ter relevância na leucemia mielóide aguda.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-05-13T17:24:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE - CAROLLINE DE ARAÚJO MARIZ- PPGMEDTROP - versão digital.pdf: 13913765 bytes, checksum: 807dfe50740ff1ef8b1debe42632853e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-13T17:24:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE - CAROLLINE DE ARAÚJO MARIZ- PPGMEDTROP - versão digital.pdf: 13913765 bytes, checksum: 807dfe50740ff1ef8b1debe42632853e (MD5) Previous issue date: 2015-03-27 / Pessoas vivendo com HIV/Aids (PVHA), diagnosticadas com tuberculose (TB) ativa, apresentam uma maior probabilidade em desenvolver reações adversas devido à reconhecida toxicidade hepática tanto dos antirretrovirais quanto dos tuberculostáticos. Esta tese resultou em três artigos originais e teve como principal objetivo estimar a incidência e identificar fatores associados ao desenvolvimento de hepatotoxicidade, verificar a ocorrência dos marcadores sorológicos dos vírus das hepatites B e C e fatores associados, além de verificar a associação entre polimorfismos e haplótipos do gene NAT2 e a ocorrência de hepatotoxicidade após o início do tratamento da TB em PVHA. Uma coorte de 173 indivíduos com infecção pelo HIV foi monitorada no Hospital Correia Picanço, durante o período de outubro de 2007 a agosto de 2012. Todos os pacientes tiveram as enzimas aminotransferases dosadas antes do início do tratamento para TB e 30 e 60 dias depois. Realizou-se análise de regressão logística bivariada e multivariada, e a magnitude das associações foi expressa pelo Odds Ratio (OR) como uma estimativa do risco relativo com intervalo de confiança de 95%. A incidência de hepatotoxicidade durante o tratamento para TB em PVHA foi 30,6% e foi demonstrada no primeiro artigo. O uso de fluconazol, a desnutrição e ser classificado fenotipicamente como acetilador lento para o gene NAT2 foram fatores associados de forma independente à hepatotoxicidade. No segundo artigo, entre os 173 pacientes avaliados antes do início do tratamento para TB, 166 (95,9%) foram investigados quanto à presença de marcadores sorológicos HBV e HCV, cuja prevalência na população foi de, respectivamente, 36,7% e 6,6%. Os homens com 40 anos ou mais apresentaram um risco maior de infecção pelo HBV. O terceiro artigo evidencia a associação da presença do alelo variante nos loci polimórficos C282T e G590A do gene NAT2 à hepatotoxicidade após o início de drogas antituberculose em PVHA. Indivíduos portadores de haplótipos GT/GT e GT/AC apresentam um risco de até 4,4 vezes, para desenvolver hepatotoxicidade (p < 0,005). Acredita-se que pesquisas sobre este tema possam contribuir para tornar o tratamento da TB individualizado principalmente em PVHA, por meio da adaptação das drogas e suas dosagens, de acordo com o perfil genético baseado em haplótipos funcionais do Gene NAT2. Recomenda-se que o uso de fluconazol deve ser evitado em PVHA durante o tratamento da tuberculose. / People living with HIV/AIDS (PLWHA), diagnosed with active tuberculosis (TB), are more likely to develop adverse reactions due to liver toxicity both of the antiretroviral as of tuberculosis treatment. This thesis resulted in three original articles that aimed to estimate the incidence and risk factors associated with the development of hepatotoxicity, to verify the occurrence of serological markers of hepatitis B and C and related factors, and the association between polymorphisms and haplotypes the NAT2 gene and the occurrence of hepatotoxicity after initiation of treatment for TB in PLWHA. A cohort of 173 individuals with HIV infection was followed up in Correia Picanço Hospital, during the period from October 2007 to August 2012. All patients had aminotransferase enzymes dosed prior to the start of treatment for TB and 30 and 60 days after. We conducted a bivariate and multivariate logistic regression analysis and the magnitude of the associations was expressed by odds ratio (OR) as an estimate of relative risk with 95% confidence interval. The first article showed the incidence of hepatotoxicity in PLWHA during treatment for TB, that was 30.6%. The use of fluconazole, malnutrition and be classified phenotypically as slow acetylator for NAT2 gene have been the independent factors associated of hepatotoxicity. In the second article, among the 173 patients evaluated before the initiation of treatment for TB, 166 (95.9%) were investigated for the presence of serological markers HBV and HCV, whose prevalence in the population was, respectively, 36.7% and 6.6%. Men aged 40 years and older had a higher risk of HBV infection. The third article highlights the association between the presence of the variant allele in the polymorphic loci C282T and G590A of NAT2 gene and the occurrence of hepatotoxicity after initiation of antituberculosis drugs for PLWHA. Individuals with haplotypes GT/GT and GT/AC present a risk of up to 4.4 times for developing hepatotoxicity (p <0.005). We believe that research on this topic, can contribute to make individualized treatment of tuberculosis, mainly in PLWHA, through the adaptation of drugs and their dosages, according to the genetic profile based on functional gene NAT2 haplotypes. We recommend that the use of fluconazole should be avoided in PLWHA during tuberculosis treatment.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-09T18:09:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação biblioteca CD - corrigida.pdf: 1306281 bytes, checksum: f6269bdbfa9eb44850607213a01cdaa0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-09T18:09:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação biblioteca CD - corrigida.pdf: 1306281 bytes, checksum: f6269bdbfa9eb44850607213a01cdaa0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-12 / FACEPE / Cromossomos B foram descritos para a subespécie de gafanhoto Xyleus discoideus angulatus e embora alguns estudos tenham proposto a possível origem do cromossomo B na subespécie, pouco se conhece a respeito da sua composição molecular. Neste trabalho, uma análise citogenética foi realizada nos cromossomos supernumerários do gafanhoto X. d. angulatus em distintas populações do nordeste do Brasil, para obter um melhor conhecimento acerca das características destes cromossomos e de sua dinâmica evolutiva em diferentes populações. Para isso, um levantamento populacional de cromossomos B em X. d. angulatus foi realizado, assim como a medição cromossômica destes elementos e o mapeamento físico do DNA C0t-1, de sequências teloméricas e de cromossomos B no cariótipo de indivíduos com B. Os resultados mostraram que houve uma alta prevalência (44,44%) de cromossomos B em uma população de Juazeiro do Norte – CE, além de mostrar que alguns cromossomos B eram menores em algumas populações. A técnica de FISH apresentou padrões semelhantes para sondas de C0t-1 em todos os indivíduos, além disso, as sondas teloméricas e de cromossomos B obtidas por microdissecção mostraram variações na sua distribuição. É provável que tenham ocorrido mecanismos de mutação e acumulação dos elementos supernumerários, que deram origem à sua alta prevalência. A presença de quatro morfotipos de cromossomos B em X. d. angulatus evidencia uma variação da composição molecular destes elementos ao longo da evolução. / B chromosomes was described for the grasshopper subspecie Xyleus discoideus angulatus and, although some studies have suggested the possible origin of the B chromosomoes in this subspecies, little is known about its molecular composition. In this study, cytogenetic analysis was performed in supernumerary chromosomes of grasshopper X. d. angulatus in distinct populations of northeastern Brazil, in order to get a better understanding of the characteristics of these chromosomes and their evolutionary dynamics in different populations. For this purpose, a populational survey of B chromosomes in X. d. angulatus was performed, as well as chromosomal measurement of these elements and the physical mapping of DNA C0t-1, telomeric and B chromosomes sequences in the karyotype of individuals with B. Results showed a high prevalence (44,44%) of B chromosomes in a population of Juazeiro do Norte - CE, and also that some B chromosomes were smaller in some populations. The FISH approach showed similar patterns for C0t-1 probes in all subjects, in addition, telomeric and B chromosome probes obtained by chromosome microdissection showed variations in their distribution. It is likely to have occurred mutation mechanisms and accumulation of supernumerary elements, giving rise to its high prevalence. The presence of four B chromosomes morphotypes in X. d. angulatus shows a variation of the molecular composition of these elements throughout evolution.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-04T22:01:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fabrício Andrade Martins Esteves.pdf: 2070591 bytes, checksum: cd3f61e4b208e5062bd0ee88b718cf5f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-04T22:01:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fabrício Andrade Martins Esteves.pdf: 2070591 bytes, checksum: cd3f61e4b208e5062bd0ee88b718cf5f (MD5) Previous issue date: 2015-09-09 / A Doença Celíaca (DC) trata-se de uma enteropatia imuno-mediada causada pela intolerância ao glúten. Através da ativação de linfócitos T presentes na lâmina própria da mucosa intestinal em indivíduos geneticamente susceptíveis, são desencadeados mecanismos inflamatórios regulados pelo balanço entre citocinas de perfil Th1, como o interferon gama (IFNg), o fator de necrose tumoral alfa (TNF-α), a interleucina 6 (IL-6), a interleucina 15 (IL-15) e interleucina-18 (IL-18) e outras reguladoras tais como TGFβ e interleucina-10 (IL-10). Em consequência ao mecanismo inflamatório desencadeado, a doença celíaca cursa com mal- absorção e diarréia secundária à diminuição da superfície de absorção da mucosa do intestino delgado. Uma vez que o grau e o tipo de alterações que sofre a mucosa intestinal depende do padrão de citocinas e de suas concentrações locais, o presente estudo avaliou a possível relação entre os polimorfismos nas regiões promotoras dos genes das IL-10, IL-6 e TNF-α na imunopatogênese da Doença celíaca em uma população de pacientes italianos. Participaram do estudo 204 indivíduos italianos portadores de doença celíaca (subdivididos em 96 indivíduos HLA-DQ2+ e 96 indivíduos HLADQ8+) e 96 indivíduos saudáveis (grupo controle). Foram realizadas genotipagens para as regiões promotoras dos genes da IL-10 (posições -1082G>A, -819C>T e - 592C>A), IL-6 (posição -174G>C) e TNF- alfa (posição -308G>A). Foram estabelecidas as frequencias alélicas, genotípicas e haplotípicas dos grupos. Com intervalo de confiança de 95%, após a aplicação do teste de Qui-Quadrado, diferenças de frequencias que apresentaram valores de p < 5% foram consideradas estatisticamente significativas para estabelecimento da Odds Ratio (O.R.). Diferenças significativas foram observadas para o polimorfismo do TNF-α (-308 G>A) quando foram comparados os seguintes grupos celíacos DQ2-positive com controles (OR = 0.45, p = 0.0002), celíacos DQ8-positivos com controles (OR = 3.55, p< 0.0001) e celíacos DQ2-positivos com celíacos DQ8-positive (OR = 0.12, p < 0.0001). Não foram observadas diferenças de frequências estatisticamente significativas para o polimorfismo da IL-6 (-174 G>C) entre celíacos e indivíduos saudáveis (p > 0.05). Também não foram observadas diferenças significativas entre as frequências dos polimorfismos da região promotora do gene da IL-10 (posições - 1082G>A, -819C>T e -592C>A). A análise de haplótipos da região promotora do gene desta citocina demonstrou que, na população estudada, não houve associação que pudesse sugerir uma participação imunomoduladora da IL-10 na Doença celíaca. Contudo, por ter um caráter anti-inflamatório, a IL-10 poderia eventualmente desempenhar algum papel no tipo de forma clínica da Doença celíaca. Ou seja, indivíduos com haplótipos de baixa produção de IL-10 estariam mais susceptíveis a apresentar as formas mais graves dessa enteropatia imunomediada. Sugerimos que o polimorfismo da região promotora do gene do TNF-alfa (posição -308G>A) possa estar envolvido na imunopatogênese do mecanismo inflamatório desencadeado pela exposição alimentar ao glúten em portadores da Doença celíaca. / Celiac disease (CD) it is an immune-mediated enteropathy caused by intolerance to gluten, a family of proteins in wheat and various grains. Through the activation of T lymphocytes present in the lamina propria of the gut mucosa in genetically susceptible individuals are triggered inflammatory mechanisms regulated by the balance between Th1 cytokines such as interferon gamma (IFNg), Tumor necrosis factor (TNF-α), interleukin-6 (IL-6) interleukin 15 (IL-15) and interleukin-18 (IL-18) and other regulatory and TGFb such as interleukin-10 (IL-10). As a result of the inflammatory mechanism triggered, celiac disease progresses with malabsorption and diarrhea secondary to decreased mucosal absorptive surface of the small intestine. Since the degree and type of changes that suffers the intestinal mucosa depends on the pattern of cytokines and their local concentrations, the present study evaluated the possible relationship between polymorphisms in the promoter regions of the genes of interleukins IL-10, IL -6 and TNF-α in the immunopathogenesis of celiac disease in a population of Italian patients. Methods: A total of 204 individuals Italian patients with celiac disease (subdivided into 96 HLA-DQ2 + individuals and 96 individuals HLA-DQ8 +) and 96 healthy subjects (control group). Genotyping was performed in the promoter regions of the genes of IL-10 (positions -1082G> A, - 819C> T and -592C> A), IL-6 (-174G position> C) and TNF-alpha (position -308G> A). The frequencies were established allelic, genotypic and haplotype of the above groups. With 95% confidence interval, after applying the chi-square test, differences in frequencies with values of p <5% were considered statistically significant for establishment of Odds Ratio (OR). Significant differences were observed for the polymorphism of TNF-α (-308 G> A) when the celiac groups DQ2-positive with controls were compared (OR = 0:45, p = 0.0002), DQ8- positive celiac with controls (OR = 3.55, p <0.0001) and celiac DQ2-positive with celiac DQ8-positive (OR = 0:12, p <0.0001). Statistically significant differences in frequencies were observed for IL-6 polymorphism (-174 G> C) from celiac and healthy individuals (p> 0.05). Also there was no difference between the frequencies of polymorphisms of the promoter region of the IL-10 gene (positions -1082G> A, -819C> T and -592C> A). The haplotype analysis of the promoter region of the gene of this cytokine showed that in the population studied, there was no association that would suggest an immunomodulatory participation of IL-10 in celiac disease. However, being an anti-inflammatory protein, IL-10 could eventually play a role in the type of clinical presentation of celiac disease. Thus, patients with IL-10 low production haplotypes could present more likely the severe forms of this immune-mediated enteropathy. We suggest that the polymorphism of TNF-alpha promoter region of the gene (position - 308 G>A) may be involved in the immunopathogenesis of nflammatory mechanism triggered by dietary exposure to gluten in patients with celiac disease.

PEREIRA, Gisnayle Ana da Silva, também é conhecida em citações bibliográficas por: SILVA, Gisnayle Ana da / Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-14T22:46:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Gisnayle Ana da Silva Pereira.pdf: 3581049 bytes, checksum: 0e1c269d58eb70f1e94adebbfd3193ea (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-16T18:35:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Gisnayle Ana da Silva Pereira.pdf: 3581049 bytes, checksum: 0e1c269d58eb70f1e94adebbfd3193ea (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-16T18:35:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Gisnayle Ana da Silva Pereira.pdf: 3581049 bytes, checksum: 0e1c269d58eb70f1e94adebbfd3193ea (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CAPES / O câncer do colo do útero é um dos principais tipos de câncer no mundo, e seu desenvolvimento está associado principalmente à infecção pelo Papilomavirus humano (HPV). Embora esse tipo de infecção esteja intimamente associado à atividade sexual, a alta incidência das lesões cervicais pode estar relacionada a uma deficiência na resposta imune. Receptores Toll-like (TLRs) tem um importante papel na imunidade inata, atuando no reconhecimento de antígenos e gerando sinais para produção das citocinas pró-inflamatórias. O TLR9, atua no reconhecimento do DNA bacteriano e viral conduzindo ao recrutamento de células imunológicas para os sítios da infecção. Polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) em TLR9 podem influenciar no aumento da susceptibilidade a diversas doenças, como, por exemplo, o câncer cervical. O presente estudo teve por objetivo identificar polimorfismos não sinônimos com potencial correlação com a infecção por HPV, assim como avaliar efeitos estruturais e funcionais ocasionados por essas mutações em TLR9 através de ferramentas in silico. Análises para 5 nsSNPs da TLR9 foram realizadas por PCR-RFLP em amostras cervicais de 57 pacientes atendidas nas Unidades de Saúde da Família (SUS, Olinda – PE). Adicionalmente, para determinar como SNPs não sinônimos (nsSNPs) podem afetar a estrutura molecular e a função de TLR9, uma análise de nsSNPs existentes para TLR9 foi realizada e apenas nsSNPs que possuíam variação no grau de hidrofobicidade maior ou igual a 50% foram utilizados para análise preditiva do efeito estrutural e funcional através de 16 algoritmos. A metodologia para PCR-RFLP para os polimorfismos 7021T>G (Met85Arg), 7191G>A (Glu115Gln), 7351C>T (Ala168Val), 7986G>T (Asp380Tyr), 8159G>T (Met347Ile) foi desenhada através de bioinformática. A análise molecular demonstrou que para TR9 8159G>T, o alelo T pode estar associado com lesões cervicais (p=0.0005). Em relação à predição computacional, 18 nsSNPs foram encontrados com alto impacto funcional/estrutural para a TLR9, sendo 12 nsSNPs localizados na região de reconhecimento do patógeno. Através do nosso estudo, descobrimos polimorfismos que podem ter alta correlação com doenças causadas por agentes patogênicos, de acordo com a previsão dos impactos estruturais e funcionais através de polimorfismo deletério não sinônimo na molécula de TLR9. / Cervical cancer is among the main types of cancer of higher incidence in the world. It is associated mainly with human papillomavirus (HPV) infection. Although this type of infection is closely associated with sexual activity, the high incidence of cervical lesions may be also related to a deficiency in the immune response. Toll-like Receptors (TLRs) play an important role in innate immunity, acting in the recognition of antigens and the generation of signals that produce proinflammatory cytokines. TLR9 operates in the recognition of bacterial and viral DNA leading the recruitment of immune cells to the infection sites. Therefore, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in TLR9 could influence the increased susceptibility to many diseases, for example, cervical cancer. This study aimed to identify non-synonymous SNPs (nsSNPs) with potential correlation with HPV infection, also evaluating structural and functional effects caused by these mutations in TLR9 through computational analysis. Evaluation of 5 nsSNPs in TLR9 was performed by PCR-RFLP in cervical samples of 57 patients treated in the Family Health Units (SUS, Olinda - PE). To determine how nsSNPs may affect the molecular structure and function of TLR9, a computational analysis was performed, and only nsSNPs with of hydrophobicity variation degree equal or greater than 50% were used for predictive analysis of structural and functional effect through 16 algorithms. The PCR-RFLP test for 7021T> G (Met85Arg), 7191G> A (Glu115Gln), 7351C> T (Ala168Val), 7986G> T (Asp380Tyr), 8159G>T (Met347Ile) was determined through by bioinformatics approaches. Molecular analysis showed that T allele of TR9 8159G> T may be associated with cervical lesions (p=0.0005). Regarding the computational prediction, 18 nsSNPs were found with high functional/structural impact for TLR9, 12 nsSNPs located in pathogen recognition region. Through our study, we found polymorphisms that may have high correlation with diseases caused by pathogens, according to the prediction of structural and functional impacts through deleterious polymorphism not synonymous in TLR9 molecule.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-21T22:46:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Joana D’arc Rozendo dos Santos.pdf: 2832084 bytes, checksum: 98dea1008c46aecb8db1bf23fc46be2e (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-28T22:43:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Joana D’arc Rozendo dos Santos.pdf: 2832084 bytes, checksum: 98dea1008c46aecb8db1bf23fc46be2e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-28T22:43:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Joana D’arc Rozendo dos Santos.pdf: 2832084 bytes, checksum: 98dea1008c46aecb8db1bf23fc46be2e (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES / FACEPE / O câncer de colo do útero, o quarto tipo mais comum entre as mulheres brasileiras, é precedido por lesões epiteliais, classificadas como neoplasia intraepitelial cervical (CIN) de grau I, II, ou III, normalmente associadas com infecção genital pelo papilomavírus humano (HPV). Porém, os elementos envolvidos no prognóstico da infecção por HPV ainda estão pouco esclarecidos. O óxido nítrico (NO), um gás solúvel envolvido em processos de vasodilatação, neurotransmissão e imunidade, é produzido a partir da ação de 3 isoformas da enzima óxido nítrico sintase (NOS), sendo a endotelial (eNOS) uma das moléculas envolvidas com o câncer. No entanto, investigações sobre o efeito de mutação na eNOS no câncer ainda geram resultados conflitantes, com poucos estudos relacionando essas diferenças genéticas com CIN ou câncer cervical. No presente estudo, os polimorfismos 894G>T e VNTR 4b4/a forma investigados por PCR em amostras de mulheres atendidas em USFs de Olinda – PE. Os dados foram correlacionados com os aspectos de citologia oncótica, infecção por HPV, assim como genótipos de HPV de alto risco. Amostras de DNA de sangue de 94 pacientes atendidas em unidades de atenção primária foram avaliadas, e os dados analisados em relação ao tipo de lesão cervical para determinar o efeito do polimorfismo da eNOS na susceptibilidade à infecção por HPV. A distribuição dos polimorfismos de eNOS 894G>T e VNTR 4b/a apresentou maior frequência para os genótipos G/G (64,9%) e 4b/4b (67%), respectivamente. Apenas genótipo eNOS 894 T/T poderia estar associado à lesão cervical (p=0,0018), enquanto o genótipo VNTR 4a/4a não foi encontrado nesta população. Não houve associação entre os polimorfismos de eNOS com a infecção pelo HPV, HPV de alto risco ou vaginose bacteriana. No entanto, o haplótipo G/T+4a/4b apresentou OR de 5,3 para vaginose bacteriana (95% CI 0.76-37.1), enquanto T/T+4b/4a mostrou OR de 5,0 para infecção por HPV (95% CI 0.11-220) e para 1,8 lesões cervicais (95% CI 0.04-79.5). A combinação dos alelos T+4a apresentaram valores de OR para infecção por HPV de 3,0 (95% CI 0.07-115) e lesões cervicais 1,29 ( 95% CI 0.03-53.6). Os resultados indicam polimorfismos na eNOS podem influenciar na resposta imunológica do organismo contra o HPV e no surgimento das lesões cervicais. Estudos adicionais serão necessários para confirmar o papel polimorfismos da eNOS na evolução das lesões cervicais para o câncer. / The cervical cancer, the fourth most common type among Brazilian women is preceded by lesions in the epithelium cervical intraepithelial neoplasia (CIN), usually associated with genital human papillomavirus (HPV). However, the elements involved in HPV infection of prognosis are still poorly understood. Nitric oxide (NO) is a soluble gas processes involved in vasodilation, neurotransmission and immunity. NO is produced from 3 isoforms of the enzyme nitric oxide synthase (NOS) and endothelial (eNOS) of the molecules involved in cancer. However, investigations of the mutation effect on eNOS in cancer also generate conflicting results, with few studies linking these genetic differences with cervical cancer. In the present study, a panel involving molecules associated with eNOS and signaling pathways related to eNOS was designed, highlighting 5 stimulatory molecules production eNOS, 4 and 38 signaling pathways related molecules eNOS. DNA from blood samples of 94 patients with and without cervical intraepithelial lesion were analyzed for the presence of two polymorphisms in the eNOS gene, G894T and intron 4VNTR (4a/b). The distribution of eNOS 894G>T and VNTR 4b/a polymorphisms showed higher frequency of G/G (64.9%) and 4b/4b (67%) genotypes. No VNTR 4a/4a genotype was found in this population. Only eNOS 894 T/T genotype may be associated with cervical lesions (p = 0.0018). There was no association between polymorphisms of eNOS with HPV infection, high risk HPV or bacterial vaginosis. However, the haplotype G/T + 4a/4b showed an OR of 5.3 for bacterial vaginosis (95% CI 0.76-37.1), while T/T + 4b/4a showed an OR of 5.0 to HPV infection (95 % CI 0.11-220) and 1.8 cervical lesions (95% CI 0.04-79.5). The combination of T + 4a alleles presented OR values for HPV infection of 3.0 (95% CI 0.07-115) and cervical lesions 1.29 (95% CI 0.03-53.6). The genotype 894 T/T associated with the genotype VNTR 4b/4a can be related to HPV infection. And more studies are needed to confirm the role of eNOS polymorphism in cervical lesions.

ARAUJO, Antônio Roberto Lucena de, também é conhecido em citações bibliográficas por: LUCENA ARAUJO, Antônio Roberto / Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-29T20:27:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jéssica Vitória Gadelha de Freitas Batista.pdf: 1325693 bytes, checksum: 4544a28b935d533b1a17b98ce4822801 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-10T19:36:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jéssica Vitória Gadelha de Freitas Batista.pdf: 1325693 bytes, checksum: 4544a28b935d533b1a17b98ce4822801 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-10T19:36:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jéssica Vitória Gadelha de Freitas Batista.pdf: 1325693 bytes, checksum: 4544a28b935d533b1a17b98ce4822801 (MD5) Previous issue date: 2017-02-14 / CNPq / A anemia falciforme (AF) é uma doença marcada por grande heterogeneidade clínica. Diante disso, muitos genes são investigados a fim de avaliar sua possível modulação no curso clínico da doença: dentre eles, o KLOTHO (KL), que está envolvido na biologia do óxido nítrico, estresse oxidativo e adesão vascular. Com o objetivo de avaliar o papel de polimorfismos em KL na clínica dos indivíduos com AF, investigamos os SNPs rs211239 (A>G) e rs685417 (G>A) e sua possível associação com algumas complicações clínicas da doença. Também investigamos os níveis de expressão de KL, para avaliar possíveis diferenças entre os genótipos dos SNPs estudados e entre as complicações clínicas analisadas. O estudo foi conduzido por comparação de grupos (casos e controles). Após análise de 703 pacientes, não foram encontradas associações do SNP rs211239 com nenhuma das complicações. Em contrapartida, os portadores dos genótipos GA e AA para o SNP rs685417 apresentaram maior frequência de crises vaso-oclusivas (p=0,006), de doença cerebrovascular (DCV) (p=0,017), maior número de complicações (p=0,029) e menor tempo para desenvolvimento de DCV (p=0,004) quando comparados aos indivíduos com genótipo selvagem (GG). No que concerne aos níveis de expressão, não foram encontradas diferenças entre os diferentes genótipos dos polimorfismos nem com as complicações. Por outro lado, houve diferença entre indivíduos com AF (HbSS) e sem AF (HbAA) (p=0,0001). Dessa forma, pôde-se perceber que os genótipos GA e AA do SNP rs685417 parecem indicar um pior prognóstico ao paciente, embora não tenham se mostrado como fator que altera os níveis de expressão. / Sickle cell anemia (SCA) is a disease characterized by high clinical heterogeneity. Therefore, many genes are investigated in order to evaluate their possible modulation in the clinical course of the disease: among them, KLOTHO (KL), which is involved in the biology of nitric oxide, oxidative stress and vascular adhesion. In order to evaluate the role of KL polymorphisms in the clinical setting of individuals with SCA, we investigated the SNPs rs211239 (A>G) and rs685417 (G>A) and their possible association with some clinical complications of the disease. We also investigated KL expression levels to evaluate possible differences between the genotypes of the studied SNPs and between the clinical complications analyzed. The study was conducted by performing a comparison of groups (cases and controls). The analysis of 703 patients showed no associations of the SNP rs211239 with any of the complications. On the other hand, patients with GA and AA genotypes for the rs685417 SNP had a higher frequency of vaso occlusive crises (p = 0.006), cerebrovascular disease (CVD) (p = 0.017), a greater number of complications (p = 0.029), and a shorter time to develop CVD (p = 0.004) when compared to individuals with wild genotype (GG). Regarding the levels of expression, no differences were found neither between the different genotypes of the polymorphisms nor with the complications. On the other hand, a notable difference was seen between subjects with SCA (HbSS) and without SCA (HbAA) (p = 0.0001). Thus, the genotypes GA and AA of the SNP rs685417 seem to indicate a worse prognosis for the patient, although they have not yet been shown as factors that change levels of expression.

Orientador: Theo Guenter Kieckbusch / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-29T06:14:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luccas_Valdecir_D.pdf: 7706595 bytes, checksum: e01113efc25225947290ffb3cb1d8119 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Análises térmicas da gordura de cupuaçu natural (Theobroma grandiflorum Schumann) proveniente de Manaus, AM, realizadas com um Calorímetro Diferencia! de Varredura (DSC), indicaram um comportamento polimórfico semelhante ao da manteiga de cacau. Quando submetidas ao processo de temperagem tradicional utitizado para a manteiga de cacau, ambas as gorduras mostraram preferência de cristalização nas Formas N e V. As composições em ácidos graxos e trigficerfdeos, obtidas por cromatografia, assim como a curva de sólidos da gordura de cupuaçu, obtida em RMN, sugerem o uso de frações específicas da mesma, misturadas com frações do óleo de palma, para a obtenção de gorduras alternativas à manteiga de cacau (CBA's) com boas características de fusão, para uso na fabricação de chocolate e/ou produtos análogos. Gordura de cupuaçu natural foi neutralizada e submetida a um processo de fracionamento térmico a seco em um reator de cristalização, com capacidade para 3 litros. Aplicou-se um Planejamento Fatorial (31 x 21), com a temperatura de cristalização variando em três níveis (26, 28 e 30°C) e a velocidade de agitação variando em dois níveis (10 e 20 rpm), envolvendo seis tratamentos com repetição, totalizando 12 ensaios. A fração estearina com propriedades mais adequadas foi a E30/20, obtida na temperatura de cristalização de 30°C e com uma rotação do agitador de 20 rpm, com tempo total de fracionamento de 11 horas e 15 minutos. Misturas de E30/20 com uma fração média de palma desodorizada conduziram a três gorduras, classificáveis como Gorduras Equivalentes à Manteiga de Cacau (CBE's), segundo os critérios analfticos estabelecidos pela União Européia (UE). Foram desenvolvidas 18 formulações de chocolate (ao leite, amargo e branco), variando-se a composição da fase gordurosa através da substituição de 16% da manteiga de cacau pelas gorduras alternativas, e 6 formulações padrões de chocolate, utilizando-se manteiga de cacau pura. Os resultados das avaliações físicas, químicas e sensoriais dos chocolates demonstraram não haver diferenças entre os chocolates produzidos com e sem o uso das CBA's / Abstract: Thermal analyses of natural cupuaçu fat (Theobroma grandiflorum Schumann) acquired in Manaus, AM, were made by Differential Thermal Analyses with a DSC, and indicated similar polimorphic behavior to cocoa butter. When submitted to traditional tempering process used for cocoa butter, both fats crystallized preferenciaty in the Forms IV and V. The composition in fatty acids and in triglycerides, obtained by chromatography, as well as the cupuaçu solid fat content curve, obtained by RMN, suggest the use of specific cupuaçu fat fractions, in mixture with palm oil fractions, to obtain cocoa butter altematives (CBA's) with good melting characteristics for the manufacture of chocolates and/or simitar producs. Natural cupuaçu fat was neutralized and submitted to dry thermal fractionation in a 3 I crystallization vessel. A (31 X 21) factorial design was set up, with a 3-level variation of the crystallization temperature (26, 28 e 30°C) and 2-level variation of the stirrer speed (10 e 20 rpm), implying in six treatments with repetition, totalizing 12 tests. The stearin fraction showing the most adequate properties, denominated E30/20, was obtained at a crystallizing temperature of 30°C and at a rotation of the mixer of 20 rpm, with a total fractionation time of 11 hours and 15 minutes. Mixtures of E30/20 with deodorized palm mid fraction produced three fats that could be classified as Cocoa Butter Equivatents (CBE's), attending the analytic criteria established by the European Union (UE). Eighteen chocolate formulations (milk, dark and white) were developed, varying the composition of the fat phase by substituing 16% of the cocoa butter with the altematives butter, and six standard chocolate formulations, using on/y cocoa butter. Physical, chemical and sensorial evaluations of the chocolates showed no differences between the chocolate produced with and without the CBA' s / Doutorado / Engenharia de Processos / Doutor em Engenharia Química