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[en] PREDICTING THE ACQUISITION OF RESISTANT PATHOGENS IN ICUS USING MACHINE LEARNING TECHNIQUES / [pt] PREVENDO A AQUISIÇÃO DE PATÓGENOS RESISTENTES EM UTIS UTILIZANDO TÉCNICAS DE APRENDIZADO DE MÁQUINALEILA FIGUEIREDO DANTAS 01 February 2021 (has links)
[pt] As infecções por bactérias Gram-negativas Resistentes aos Carbapenêmicos (CR-GNB) estão entre as maiores preocupações atuais da área da, especialmente em Unidades de Terapia Intensiva (UTI), e podem estar associadas ao aumento do tempo de hospitalização, morbidade, custos e mortalidade. Esta tese tem como objetivo desenvolver uma abordagem abrangente e sistemática aplicando técnicas de aprendizado de máquina para construir modelos para prever a aquisição de CR-GNB em UTIs de hospitais brasileiros. Propusemos modelos de triagem para detectar pacientes que não precisam ser testados e um modelo de risco que estima a probabilidade de pacientes de UTI adquirirem CR-GNB. Aplicamos métodos de seleção de características, técnicas de aprendizado de máquina e estratégias de balanceamento para construir e comparar os modelos. Os critérios de desempenho escolhidos para avaliação foram Negative Predictive Value (NPV) and Matthews Correlation Coefficient (MCC) para o modelo de triagem e Brier score e curvas de calibração para o modelo de risco de aquisição de CR-GNB. A estatística de Friedman e os testes post hoc de Nemenyi foram usados para testar a significância das diferenças entre as técnicas. O método de ganho de informações e a mineração de regras de associação avaliam a importância e a força entre os recursos. Nosso banco de dados reúne dados de pacientes, antibióticos e microbiologia de cinco hospitais brasileiros de 8 de maio de 2017 a 31 de agosto de 2019, envolvendo pacientes hospitalizados em 24 UTIs adultas. As informações do laboratório foram usadas para identificar todos os pacientes com teste positivo ou negativo para CR-GNB, A. baumannii, P. aeruginosa ou Enterobacteriaceae. Há um total de 539 testes positivos e 7.462 negativos, resultando em 3.604 pacientes com pelo menos um exame após 48 horas de hospitalização. Dois modelos de triagem foram propostos ao tomador de decisão do hospital. O modelo da floresta aleatória reduz aproximadamente 39 por cento dos testes desnecessários e prevê corretamente 92 por cento dos positivos. A rede neural evita testes desnecessários em 64 por cento dos casos, mas 24 por cento dos testes positivos são classificados incorretamente. Os resultados mostram que as estratégias de amostragem tradicional, SMOTEBagging e UnderBagging obtiveram melhores resultados. As técnicas lineares como Regressão Logística com regularização apresentam bom desempenho e são mais interpretáveis; elas não são significativamente diferentes dos classificadores mais complexos. Para o modelo de risco de aquisição, o Centroides Encolhidos Mais Próximos é o melhor modelo com um Brier score de 0,152 e um cinto de calibração aceitável. Desenvolvemos uma validação externa a partir de 624 pacientes de dois outros hospitais da mesma rede, encontrando bons valores de Brier score (0,128 and 0,079) em ambos. O uso de antibióticos e procedimentos invasivos, principalmente ventilação mecânica, são os atributos mais importantes e significativos para a colonização ou infecção de CR-GNB. Os modelos preditivos podem ajudar a evitar testes de rastreamento e tratamento inadequado em pacientes de baixo risco. Políticas de controle de infecção podem ser estabelecidas para controlar a propagação dessas bactérias. A identificação de pacientes que não precisam ser testados diminui os custos hospitalares e o tempo de espera do laboratório. Concluímos que nossos modelos apresentam bom desempenho e parecem suficientemente confiáveis para prever um paciente com esses patógenos. Esses modelos preditivos podem ser incluídos no sistema hospitalar. A metodologia proposta pode ser replicada em diferentes ambientes de saúde. / [en] Infections by Carbapenem-Resistant Gram-negative bacteria (CR-GNB) are among the most significant contemporary health concerns, especially in intensive care units (ICUs), and may be associated with increased hospitalization time, morbidity, costs, and mortality. This thesis aims to develop a comprehensive and systematic approach applying machine-learning techniques to build models to predict the CR-GNB acquisition in ICUs from Brazilian hospitals. We proposed screening models to detect ICU patients who do not need to be tested and a risk model that estimates ICU patients probability of acquiring CR-GNB. We applied feature selection methods, machine-learning techniques, and balancing strategies to build and compare the models. The performance criteria chosen to evaluate the models were Negative Predictive Value (NPV) and Matthews Correlation Coefficient (MCC) for the screening model and Brier score and calibration curves for the CR-GNB acquisition risk model. Friedman s statistic and Nemenyi post hoc tests are used to test the significance of differences among techniques. Information gain method and association rules mining assess the importance and strength among features. Our database gathers the patients, antibiotic, and microbiology data from five Brazilian hospitals from May 8th, 2017 to August 31st, 2019, involving hospitalized patients in 24 adult ICUs. Information from the laboratory was used to identify all patients with a positive or negative test for carbapenem-resistant GNB, A. baumannii, P. aeruginosa, or Enterobacteriaceae. We have a total of 539 positive and 7,462 negative tests, resulting in 3,604 patients with at least one exam after 48 hours hospitalized. We proposed to the hospital s decision-maker two screening models. The random forest s model would reduce approximately 39 percent of the
unnecessary tests and correctly predict 92 percent of positives. The Neural Network model avoids unnecessary tests in 64 percent of the cases, but 24 percent of positive tests are misclassified as negatives. Our results show that the sampling, SMOTEBagging, and UnderBagging approaches obtain better results. The linear techniques such as Logistic Regression with regularization give a relatively good performance and are more interpretable; they are not significantly different from the more complex classifiers. For the acquisition risk model, the Nearest Shrunken Centroids is the best model with a Brier score of 0.152 and a calibration belt acceptable. We developed an external validation of 624 patients from two other hospitals in the same network, finding good Brier score (0.128 and 0.079) values in both. The antibiotic and invasive procedures used, especially mechanical ventilation, are the most important attributes for the colonization or infection of CR-GNB. The predictive models can help avoid screening tests and inappropriate treatment in patients at low risk. Infection control policies can be established to control these bacteria s spread. Identifying patients who do not need to be tested decreases hospital costs and laboratory waiting times. We concluded that our models present good performance and seem sufficiently reliable to predict a patient with these pathogens. These predictive models can be included in the hospital system. The proposed methodology can be replicated in different healthcare settings.
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[pt] O USO RETÓRICO DAS ALEGORIAS DE GL 4,1–5,1 NO DEBATE PAULINO SOBRE A ESCRAVIDÃO E A LIBERDADE, A PARTIR DAS REGRAS DE HILLEL / [en] THE RHETORICAL USE OF THE ALEGORIES OF GL 4,1– 5,1 IN THE PAULINE DEBATE ON SLAVERY AND FREEDOM, BASED ON HILLEL S RULESANTONIO MARCOS DOS SANTOS 05 March 2024 (has links)
[pt] Esta Tese Doutoral debruça-se sobre o uso retórico das alegorias de Gl 4,1–5,1
como forma de se compreender o debate paulino sobre a escravidão e a liberdade, a partir
das regras de Hillel. Partindo da investigação das ferramentas semânticas e linguísticas
que moldaram a interpretação da Escritura em contexto judaico do primeiro século,
percebe-se como Paulo utiliza-se de tais técnicas e ensinamentos oriundos de escolas
rabínicas em sua elaboração de Gl 4,1–5,1. Deste modo, a pesquisa visa estudar o texto
bíblico seguindo os critérios acadêmicos reconhecidos para análises deste caráter, para
compreender os elementos que norteiam o sentido teológico do uso paulino das distintas
figuras paradigmáticas, centradas na ideia de filiação, como parte integrante de um grande
argumento retórico, como estratégia de diálogo, defesa e resgate da comunidade da
Galácia, ameaçada por indivíduos que buscavam contradizer a pregação do apóstolo / [en] This Doctoral Thesis focuses on the rhetorical use of the allegories of Gl 4,1–5,1 as away of understanding the Pauline debate on slavery and freedom, based on Hillel s rules. Starting from the investigation of the semantic and linguistic tools that shaped the interpretation of Scripture in the Jewish context of the first century, it is clear how Paul uses such techniques and teachings from rabbinical schools in his elaboration of Gl 4,1–5,1. In this way, the research aimsto study the biblical text following the academic criteria recognized for analyzes of this character, to understand the elements that guide the theological meaning of Paul s use of diferente paradigmatic figures, centered on the idea of filiation, as an integral part of a great argument rhetorical, as a strategy of dialogue, defense and rescue of the Galatian community, threatened byindividuals who sought to contradict the apostle s preaching.
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Programas de transferência condicionada de renda e acesso aos serviços de saúde: um estudo da experiência do Programa Bolsa Família em Manguinhos, RJ / Programs of conditional cash transfer and access to health services: a study of the experience of the Bolsa Familia in Manguinhos, RJFerreira, Milena Nogueira January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / O Programa Bolsa Família (PBF) foi criado em outubro de 2003, a partir da unificação de quatro programas federais de transferência de renda (Bolsa Escola, Bolsa Alimentação, Cartão Alimentação e Vale Gás), sendo destinado a famílias pobres e extremamente pobres, no qual o critério de inclusão é a renda per capita. O Programa articula a transferência de renda a condicionalidades da saúde e educação, que são responsabilidades que toda família deve cumprir para se manter no Programa. A exigência dessas contrapartidas tem provocado um intenso debate no campo das políticas públicas. De um lado, pesquisadores e gestores compreendem a estratégia como oportunidade de melhorar o acesso aos serviços públicos. Por outro lado, há a abordagem de que os direitos sociais, incluindo o acesso aos serviços de saúde, são incondicionais. O presente trabalho analisa o processo de implementação do Programa Bolsa Família na região de Manguinhos, no que se refere ao acompanhamento das ações de saúde previstas para a população beneficiária, identificando os limites e as potencialidades no cumprimento das chamadas condicionalidades , em um contexto local marcado por precária infra-estrutura urbana e dificuldades no acesso aos equipamentos públicos. O período desta pesquisa foi de março de 2007 a dezembro de 2008 e a metodologia utilizada foi o estudo de caso, com a análise de documentos oficiais do PBF, entrevistas com gestores e profissionais que atuam nas diversas secretarias (saúde, educação e assistência social) e grupos focais com famílias beneficiárias. Essa experiência revelou fragilidades institucionais como: pouca qualificação dos profissionais, ausência de incentivos, falta de recursos humanos, ênfase na questão burocrática e oferta insuficiente de ações e serviços de saúde. Contudo, um aspecto positivo observado foi a busca de maior integração dos beneficiários às demais ações e iniciativas sociais locais. / The Bolsa Família Program (BFP) was created in October 2003, from the unification of four federal cash transfer programs (Bolsa Escola, Bolsa Alimentação, Cartão Alimentação e Vale Gás), destined to poor and extremely poor families, in which the inclusion criterion is the per capita income. The Program articulates the income transfer with conditionalities of health and education, which are responsibilities that all families must accomplish to continue in the Program. The exigency of these counterparties has been causing an intense debate in the public politics area. On the one hand, researchers and managers understand the strategic as an opportunity to improve the public services access. On the other hand, there’s the approach that the social rights, including the health services access, are unconditional. The present paper analyses the implementation process of the Bolsa Família Program in the Manguinhos region, concerned to the attendance of the health actions, destined to the beneficiaries, by identifying the limits and the potentials in the accomplishment of what is called “conditionalities”, in a local context marked from a precarious urban infrastructure and difficulties in the public equipments access. The period of this search was from March 2007 to December 2008 and the methodology was the case study, with the analysis of BFP official documents, interviews with managers and professionals that work in the different secretariats (health, education and social assistance) and focal groups with beneficiaries. This experience showed institutional fragilities, like: not much qualification of professionals, absence of incentives and of human resources, emphasis in the bureaucratic question and insufficient offer of actions and health services. Nevertheless, a positive aspect observed was the search of higher integration between beneficiaries and the other actions and local social initiatives.
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A bioética da proteção e a população transexual feminina / The bioethics of protection and the population female transsexualGuimarães Júnior, Anibal Ribeiro January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / Esta dissertação analisa a população transexual feminina e as demandas específicas de cuidado com a sua saúde no sistema público de saúde, face às políticas públicas que, lançadas a partir de 2004, afirmam contemplá-las. A análise se orienta pela perspectivada vertente latino-americana de bioética chamada Bioética da Proteção - e da proposta de acolhimento sem exceção dos vulnerados. O método utilizado foi a análise teórico conceitual crítica, enfocada, sucessivamente, nas categorias de vulnerabilidade, suscetibilidade, vulneração. / This dissertation analyses the female transsexual population in its specific issues relating to healthcare, throughout the Brazilian public health system, in concert with the federal government’s public policies, introduced since 2004, intended to be inclusive. This analysis is based upon the current Latin-American Bioethics approach – also known as “Bioethics of Protection” – and by the proposal of welcoming, “with no exception” all of those considered vulnerable actors. The method employed here is that of the critical conceptual and theoretical analysis, successively focused on the categories of “vulnerability”, “susceptibility” and “injury”.
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Não realização de mamografia e consumo de serviços de saúde em uma população de idosos de Juiz de Fora, Minas Gerais / Non-performance of mammography and consumption of health services in an elderly population from Juiz de Fora, Minas GeraisNovaes, Cristiane de Oliveira January 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010 / Os objetivos dessa tese foram: Descrever os determinantes de acesso aserviços de saúde por idosos em uma perspectiva de gênero; Determinar a prevalência e os fatores associados à não utilização de mamografia pela população feminina; Identificar os motivos para nunca ter realizado exame mamográfico e os fatores predisponentes, habilitadores e reforçadores associados com cada categoria de motivo, identificando o papel das características contextuais nesse processo. Foram elegíveis para estudo indivíduos com 60 ou mais anos de idade, residentes no município de Juiz de Fora que compareceram a um posto de vacinação do município no período da Campanha Nacional de Vacinação Contra Gripe de 2006. Os principais resultados mostraram perfil social e de saúde similar ao descrito para a população brasileira, Pior auto-avaliação da saúde, maior proporção de morbidade, mais uso de medicação e maior proporção e freqüência deconsultas médicas entre as mulheres. Foi observada prevalência de não utilização de mamografia de 27,9 por cento nessa população, associada à idade avançada, à baixa escolaridade, à ausência de relação conjugal e à não realização de consultas com ginecologista e de exame de Papanicolaou. As principais razões apontadas pelas mulheres para nunca terem se submetido ao exame mamográfico foram Não acha necessário fazer mamografia; Não ter recebido recomendação médica para fazer mamografia e Afetos negativos. / The objectives of this study were: To describe the determinants of access to health services for older people in a gender perspective; to determine the prevalence and the factors associated with non-use of mammography by women; to identify the reasons for never having been submitted to mammography and the predisposing, enablers and reinforcing factors associated to each category of reasons, and to identify the role of contextual characteristics in this process. Subjects with 60 or more years old, living in Juiz de For a and who attended a vaccination station in the city during the National Immunization Campaign Against Influenza of 2006 were eligible for study. The main results showed social and health profiles similar to that described for the Brazilian population. Women had poorer self-rated health, higher proportion of
morbidity and use of medication and a higher proportion and frequency of medical visits compared to men. The prevalence of non-use of mammography in this population was 27,9%, and advanced age, poor education, lack of marital
relationship, lack of Pap smear and no consultations with gynecologists were associated to a higher risk of non-use. The main reasons why women have never undergone mammography were "Having no need of a mammogram", "Not having received medical advice to have a mammogram" and “Having negative affects in relation to mammograms”.
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Pcatool-Brasil versão profissionais: avaliação do atributo acesso de primeiro contato na atenção primária à saúde em municípios do interior do Rio Grande do Sul / Pcatool-Brasil professional version: assessment of the attribute access of first contact in the primary health care in municipalities of the interior of Rio Grande do SulSilva, Kauana Flores da 20 February 2017 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In Brazil, Primary Health Care is the gateway of users into the health system, based on individual and collective actions, presenting as one of the fundamental principles the universal and equitable access of the population to these actions. In order for this level of attention to be strengthened, guaranteeing access, evaluation is essential, as it allows to leverage available resources according to local demands. Thus, considering the importance of Primary Health Care as a health care provider, with access as an indispensable attribute and evaluation as a tool to change realities, the present study to evaluate the access in APS services of the municipalities that are part of the 4th Regional Health Coordination from the perspective of health professionals. It is a study with a quantitative, transversal approach, carried out in the Primary Health Care services of the 4th Regional Health Coordination of Rio Grande do Sul, composed of the Entre Rios and Verdes Campos Health Regions. Data collection took place between February and July 2015, using computerized Epi Info® 7.0 software, using tablets, with application of the Primary Care Assessment Tool-Brazil professional version. The sample comprised 207 higher-level health professionals. Statistical Analysis System (SAS) version 9.0 was used to analyze the data. The score was dichotomized at low score, if <6.6 or high score, if ≥6.6. The normality of the variables was evaluated by the Shapiro Wilk test. Pearsson's Correlation was used to verify the degree of relationship between First Contact Access items and the score, and Poisson Regression to identify the dependence between the score and its socio-spatial context. The ethical precepts respected Resolution 466/2012. The article 1, a descriptive study in which the attribute First Contact Access obtained a low score (4.68), being the issues related to the time and day of operation of the health unit, the ones that most influenced this result. Article 2, a multilevel study, with contextual and individual variables found low First Contact Access score in most of the municipalities surveyed (83.6%), presenting a level of significance only in the variable population size, in which municipalities with up to five thousand inhabitants Higher prevalence of the attribute. Article 3, a study of trends about access of the elderly in Primary Health Care, shows that access does not prevail as an object of research, related to quality of life and integral care of the elderly, as well as organizational and bureaucratic barriers. Article 4, integrative review on the access of the elderly in this level of attention, showed the Family Health as a facilitator of access, work processes and infrastructure as real barriers to elderly access. In this way, it can be seen that there are still barriers in access, mainly referring to the structure of primary health care services. This study is expected to help in the expansion and quality of the population's access to this level of care. / No Brasil, a Atenção Primária à Saúde é a porta de entrada dos usuários no sistema de saúde, fundamentando-se na realização de ações individuais e coletivas, apresentando como um dos princípios fundamentais o acesso universal e equânime da população a essas ações. Para que esse nível de atenção se fortaleça, garantindo o acesso, a avaliação é essencial, pois permite potencializar os recursos disponíveis conforme as demandas locais. Assim, considerando a importância da Atenção Primária à Saúde como ordenadora do sistema de saúde, tendo o acesso como um indispensável atributo e a avaliação como uma ferramenta para mudar as realidades, o presente estudo tem como objetivo avaliar o acesso em serviços de APS dos municípios integrantes da 4ª Coordenadoria Regional de Saúde na perspectiva dos profissionais de saúde. Trata-se de estudo com abordagem quantitativa, transversal, realizado nos serviços de Atenção Primária à Saúde da 4ᵃ Coordenadoria Regional de Saúde do Rio Grande do Sul, composta pelas Regiões de Saúde Entre Rios e Verdes Campos. A coleta dos dados ocorreu entre os meses de fevereiro e julho de 2015, de maneira informatizada por meio do software Epi Info® 7.0, utilizando tabletes, com aplicação do instrumento Primary Care Assessment Tool-Brasil versão profissionais. Compuseram a amostra 207 profissionais de saúde de nível superior. Para a análise dos dados foi utilizado o Statistical Analisys System (SAS) versão 9.0. O escore foi dicotomizado em baixo escore, se <6,6 ou alto escore, se ≥6,6. A normalidade das variáveis foi avaliada pelo Teste de Shapiro Wilk. Utilizou-se a Correlação de Pearsson para verificar o grau de relacionamento entre os itens do Acesso de Primeiro Contato e o escore, e a Regressão de Poisson para identificar a dependência entre o escore e o seu contexto sócio-espacial. Os preceitos éticos respeitaram a Resolução 466/2012. O artigo 1, estudo descritivo em que o atributo Acesso de Primeiro Contato obteve-se um baixo escore (4,68), sendo as questões relativas ao horário e dia de funcionamento da unidade de saúde, as que mais contribuíram para esse resultado. O artigo 2, estudo multinível, com variáveis contextuais e individuais encontrou baixo escore Acesso de Primeiro Contato na maioria dos municípios pesquisados (83,6%), apresentando nível de significância apenas na variável porte populacional, em que os municípios com até cinco mil habitantes obtiveram maior prevalência do atributo. O artigo 3, estudo de tendências acerca do acesso do idoso na Atenção Primária à Saúde, mostra que o acesso não prevalece como objeto de pesquisa, vindo relacionado à qualidade de vida e integralidade da atenção dos idosos, além de barreiras organizacionais e burocráticas. O artigo 4, revisão integrativa sobre o acesso do idoso nesse nível de atenção, evidenciou a Saúde da Família como facilitadora do acesso, e os processos de trabalho e a infraestrutura como barreiras reais ao acesso do idoso. Dessa forma percebe-se que ainda há barreiras no acesso, principalmente referentes à estrutura dos serviços de Atenção Primária à Saúde. Espera-se que este estudo possa auxiliar na ampliação e qualidade do acesso da população esse nível de atenção.
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Dinâmica de construção de relações sociais: estudo dos valores sociais no contexto da saúde suplementar no Brasil / Dynamic construction of social relations: a study of social values in the context of health care in BrazilVilarinho, Paulo Ferreira January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / O presente estudo tem por objetivo analisar a evolução dos fatores históricos que ensejaram a formação do atual desenho do setor de saúde suplementar no Brasil, tendo por principal base teórica a teoria da estruturação de Anthony Giddens. A pesquisa utiliza o método da análise de documentos e entrevistas semi-estruturadas, envolvendo a análise qualitativa dos dados coletados com vistas à compreensão dos fenômenos estudados, segundo a perspectiva dos atores. Neste sentido, a pesquisa identifica os principais atores que compõem a estrutura do setor e suas relações recíprocas, inferindo sobre os recursos de poder utilizados, procurando mostrar, por meio de uma descrição histórica linear, com cortes em fatos determinantes, a evolução da constituição do setor. Ao final, o estudo mostra que o setor da saúde suplementar se formou a partir de inúmeras ações do Estado, principalmente após a década de setenta, como fruto de uma estratégia alternativa de disseminação de serviços de saúde à população brasileira. O estudo avalia que os fenômenos da crescente longevidade da população brasileira e aconseqüente redução nos postos de trabalho e na renda familiar poderão acarretar uma elitização do setor da saúde suplementar representando um grave problema para o final da próxima década para este sensível segmento da política social do governo brasileiro. / The aim of the present study is to analyze the evolution of the historical and institutional elements that generate the current design of the private health market in Brazil. Its main theoretical basis is the Theory of Structuration, by Anthony Giddens. The research’ data were collected through documents and semi structured interviews involving the qualitative analyze due to understand the field’s phenomena under an
actors’ perspective. The research identifies the several players that integrate the market,
and their reciprocal relationship besides of the powers’ resources used to reach them. Thus, it tries to show, through a historic linear description, and emphasis in the determinant facts, the evolution of the market’s constitution. The study demonstrates that the field had formed from several Estate’ actions, basically after the past seventy’ decade, as result of a alternative Government’ strategy towards a Brazilian population’s dissemination plan of health’ services that enforced the institutionalization of social structures, with a strong internal interaction. In the end, the study estimates that the crescent longevity’ Brazilian’s population and the consequent work’s dismiss may cause a private health’ elitism conforming a future problem in this sensible segment of the social politics of the Brazilian government.
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Resistência de genótipos de amendoim (Arachis hypogaea L.) de hábitos de crescimento ereto e rasteiro a Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818 (Lepidoptera: Noctuidae) /Pitta, Rafael Major. January 2008 (has links)
Orientador: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Francisco Jorge Cividanes / Banca: José Djair Vendramim / Resumo: Objetivou-se com este trabalho avaliar possíveis fontes de resistência de genótipos de amendoinzeiro a Anticarsia gemmatalis Hübner, 1818 dos tipos não-preferência para alimentação, oviposição e antibiose, em avaliações de parâmetros biológicos das fases jovem e adulta do inseto, tendo como objetivo secundário demonstrar a viabilidade do emprego de análises multivariadas para interpretação de dados em testes de antibiose. Os experimentos foram realizados sob condições controladas (temperatura: 26 ± 2ºC, U.R. 60 ± 10% e fotofase de 12 horas) no Laboratório de Resistência de Plantas a Insetos, pertencente ao Departamento de Fitossanidade da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Campus de Jaboticabal/SP. Os genótipos utilizados foram: IAC 5; IAC 8112; IAC 22 e IAC Tatu st de hábito de crescimento ereto, e IAC 147; IAC 125; IAC Caiapó e IAC Runner 886 de hábito crescimento rasteiro. Os testes de não-preferência para alimentação foram realizados com e sem chance de escolha, utilizando lagartas de 3º ínstar. As avaliações foram realizadas aos 3; 5; 10; 15; 30; 60; 120; 360 e 480 minutos após a liberação, contando o número de indivíduos se alimentando por genótipo, e quantificando ao término do experimento a área foliar consumida por genótipo. Para os testes de não-preferência para oviposição, avaliou-se o número de ovos por cm2 de folha. Os genótipos IAC Caiapó, IAC Runner 886, IAC 125, IAC 5 e IAC 147 apresentaram características de resistência por serem menos preferidos para alimentação de A. gemmatalis, sendo IAC 147 menos preferido nos testes de não-preferência para alimentação com e sem chance de escolha, e não-preferência para oviposição sem chance de escolha. No teste de antibiose além dos genótipos de amendoim, utilizouse o genótipo de soja BR 16, como padrão de suscetibilidade...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This work aimed to evaluate possible resistance sources of peanuts genotypes for no feeding preference, no oviposition preference and antibiosis tests, in evaluations of biological parameters of adult and larvae phases of Anticarsia gemmatalis, and as secondary objective to confirm the importance of multivariate statistical for interpretation of data in antibiosis tests. Experiments were realized under controlled conditions (temperature: 26 ± 2ºC, R.H. 60 ± 10% and photophase of 12 hours) in the Laboratory of Plant Resistance to Insects, pertaining to Department of Fitossanidade - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Campus de Jaboticabal/SP. The genotypes used were: IAC 5; IAC 8112; IAC 22 and IAC Tatu st of upright growth habit, and IAC 147; IAC 125; IAC Caiapó and IAC Runner 886 of runner growth habit. In the no-preference feeding tests, larvae's of 3º ínstar were utilized, being the evaluations done to: 3; 5; 10; 15; 30; 60; 120; 360 and 480 minutes after liberation, counting the numbers of individuals feeding per genotype and quantifying in experiment finish the leaf area consumed per genotype. For the no-preference oviposition tests, the number of eggs per cm2 of leaf were evaluated. The genotypes IAC Caiapó, IAC Runner 886, IAC 125, IAC 5 e IAC 147 demonstrated resistance characteristics, presenting low preference to feeding of A. gemmatalis, especially IAC 147 that presented low preference in choice and no choice feeding tests, and no choice oviposition test. For the antibiosis test, beyond the peanuts genotypes the soybean genotype BR 16 was included as susceptibility parameter, being evaluated the biological parameters: leaf consumption, weight of larvae in 4º instar and pupa with 24h, larval and pupal period and adult's longevity. After, were done leaves analysis iv nutritional of genotypes, and verified that quality nutrition not influenced the selection ...(Complete abstract, click electronic access below) / Mestre
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Adequando consultas por similaridade para reduzir a descontinuidade semântica na recuperação de imagens por conteúdo / Reducing the semantic gap content-based image retrieval with similarity queriesRazente, Humberto Luiz 31 August 2009 (has links)
Com o crescente aumento no número de imagens geradas em mídias digitais surgiu a necessidade do desenvolvimento de novas técnicas de recuperação desses dados. Um critério de busca que pode ser utilizado na recuperação das imagens é o da dissimilaridade, no qual o usuário deseja recuperar as imagens semelhantes à uma imagem de consulta. Para a realização das consultas são empregados vetores de características extraídos das imagens e funções de distância para medir a dissimilaridade entre pares desses vetores. Infelizmente, a busca por conteúdo de imagens em consultas simples tende a gerar resultados que não correspondem ao interesse do usuário misturados aos resultados significativos encontrados, pois em geral há uma descontinuidade semântica entre as características extraídas automaticamente e a subjetividade da interpretação humana. Com o intuito de tratar esse problema, diversos métodos foram propostos para a diminuição da descontinuidade semântica. O foco principal desta tese é o desenvolvimento de métodos escaláveis para a redução da descontinuidade semântica em sistemas recuperação de imagens por conteúdo em tempo real. Nesta sentido, são apresentados: a formalização de consultas por similaridade que permitem a utilização de múltiplos centros de consulta em espaços métricos como base para métodos de realimentação de relevância; um método exato para otimização dessas consultas nesses espaços; e um modelo para tratamento da diversidade em consultas por similaridade e heurísticas para sua otimização / The increasing number of images captured in digital media fostered the developmet of new methods for the recovery of these images. Dissimilarity is a criteria that can be used for image retrieval, where the results are images that are similar to a given reference. The queries are based on feature vectors automatically extracted from the images and on distance functions to measure the dissimilarity between pair of vectors. Unfortunately, the search for images in simple queries may result in images that do not fulfill the user interest together with meaningful images, due to the semantic gap between the image features and to the subjectivity of the human interpretation. This problem leaded to the development of many methods to deal with the semantic gap. The focus of this thesis is the development of scalable methods aiming the semantic gap reduction in real time for content-based image retrieval systems. For this purpose, we present the formal definition of similarity queries based on multiple query centers in metric spaces to be used in relevance feedback methods, an exact method to optimize these queries and a model to deal with diversity in nearest neighbor queries including heuristics for its optimization
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Caracterização molecular da resistência aos carbapenêmicos em enterobactérias isoladas em hospitais brasileiros / Molecular characterization of carbapenem resistance in enterobacteria isolated in Brazilian hospitalsAguilar, Mónica Alejandra Pavez 27 August 2009 (has links)
Introdução: Após o surgimento e disseminação das β-lactamases (BL) de amplo espectro em membros da família Enterobacteriaceae, os antibióticos carbapenêmicos (imipenem, meropenem, ertapenem) têm sido considerados a terapia de escolha pela estabilidade apresentada contra estas enzimas. Infelizmente, em 2005, o primeiro caso de infecção fatal por um isolado de Klebsiella pneumoniae resistente aos carbapenêmicos foi relatado em nosso país. A partir deste, novos casos de infecção, inclusive por outros gêneros da família Enterobacteriaceae como Enterobacter, Providencia e Escherichia, começaram a surgir. Como mecanismo de resistência aos carbapenêmicos, a expressão de enzimas carbapenemases tem sido mundialmente relatada, enquanto que, a impermeabilidade associada à produção de enzimas do tipo AmpC ou ESBL tem sido esporádica. Com relação à mobilização dos determinantes genéticos de resistência, elementos móveis como integrons e plasmídios têm sido associados. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar os mecanismos de resistência aos carbapenêmicos, sua mobilização genética e disseminação clonal em amostras clínicas de enterobactérias isoladas em diversos hospitais brasileiros. Material e métodos: Foram estudadas 28 cepas recuperadas de oito centros hospitalares descritas como resistentes ao imipenem. A caracterização fenotípica foi realizada por: i) determinação da CIM na presença e ausência de inibidores de BL, ii) bioensaio para produção de BL e iii) SDS-PAGE para investigar a ausência de porinas. A confirmação genotípica da resistência mediada por β-lactamases foi realizada por PCR e seqüenciamento e a sua localização plasmidial foi estudada por transformação. Por último, a tipagem molecular foi realizada pela técnica de ERIC-PCR, sendo confirmada pela técnica de PFGE. Resultados: 25 cepas apresentaram resistência para carbapenêmicos (imipenem MIC 8-128 µg/mL), todas com perfil de multiresistência incluindo cefoxitina (CIM90 ≥32 µg/mL). Foram identificados três determinantes de resistência, entre eles, a produção de carbapenemases de tipo MBL (IMP-1) e a enzima KPC-2, recentemente descrita, sendo emergente no país. O mecanismo mais prevalente nas amostras estudadas foi a impermeabilidade de membrana associada à expressão de enzimas do tipo AmpC (CMY-2 plasmidial para E. coli e AmpC cromossômica no caso de Enterobacter aerogenes), as quais mostraram uma contribuição significativa para a resistência aos carbapenêmicos. Dos 28 isolados, 18 apresentaram a perda da porina de 36 kDa, responsável pela entrada de antimicrobianos na bactéria, como os carbapenêmicos. Tanto os genes blaKPC-2 e blaCMY-2 foram transferidos com êxito para E. coli DH10B, confirmando sua localização plasmidial. A co-produção de carbapenemase ou enzimas do tipo AmpC com ESBL do tipo CTX-M foi confirmada em 68% dos isolados. A tipagem molecular mostrou uma disseminação clonal para os isolados carregando determinantes IMP-1 e as enzimas do tipo AmpC cromossômica e plasmidial. Ao contrário, isolados expressando KPC não foram clonalmente relacionadas. Conclusão: A caracterização de resistência apresentada neste trabalho demonstrou uma mudança no perfil de resistência da família Enterobactériaceae devido à sua versatilidade para a aquisição de novos mecanismos de resistência, como sua adaptação aos ambientes hostis. A perda da porina foi o mecanismo mais freqüente nesta família e a co-produção de BL foi um evento associado. Finalmente, os dados obtidos na tipagem molecular denotaram uma disseminação majoritariamente clonal na cidade de São Paulo, com exceção das cepas produtoras de KPC-2, cuja presença tem sido relatada em outras cidades do país, sugerindo a participação de uma transferência horizontal. / Introduction: After emergence, and dissemination of extended spectrum β-lactamases (ESBL) in members of the Enterobacteriaceae family, carbapenem antibiotics (imipenem, meropenem, ertapenem) have been the therapy of choice, since they are stable to ESBL hydrolysis. Unfortunately, in 2005, the first fatal case of infection by carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae was related in our country. From this episode, new infection cases, including by other genders of Enterobacteriaceae such as Enterobacter, Providencia and Escherichia, began to appear. Regarding carbapenem resistance mechanisms, expression of carbapenem hydrolyzing enzymes has been worldwide reported, whereas interplay between impermeability and AmpC or ESBL production has been sporadic. Furthermore, integrons and plasmids have been associated with mobilization of genetic determinants. The aim of this study was to characterize the mechanisms of resistance to carbapenems, their genetic mobilization and clonal dissemination in enterobacterial isolates recovered from clinical samples in Brazilian hospitals. Material and methods: 28 imipenem-resistant isolates recovered from 8 hospital centres were studied. Phenotypic profiles were characterized by: i) MIC of carbapenems in the presence/absence of β-lactamase inhibitors; ii) bioassay for β-lactamase production; iii) SDS-PAGE to investigate absence of outer membrane porins (OMPs). Molecular characterization of β-lactamase-mediated resistance was made by PCR and DNA sequencing and their plasmid localization was evaluated by transformation. Finally, epidemiological typing was performed by ERIC-PCR, being confirmed by PFGE. Results: 25 isolates were confirmed as being resistant to imipenem (MIC 8-128 µg/mL), exhibiting a multidrug-resistant profile, including to cefoxitin (MIC90 ≥32 µg/mL). Two main mechanism of resistance were identified: i) hydrolysis of carbapenem by class B (IMP-1-like MBL) and class A (KPC-2) enzymes, (the latter being recently reported in our country), and ii) outer membrane impermeability associated to AmpC enzyme production (plasmid-mediated CMY-2 for E. coli and chromosomal AmpC for E. aerogenes), which was the most prevalent mechanism found. Eighteen of 28 isolates lacked 36kDa OMP, which is responsible for uptake of carbapenem antibiotics. The blaKPC-2 and blaCMY-2 genes were successful transferred to E. coli DH10B, confirming the plasmid location of both genes. Co-production of carbapenemases or AmpC and CTXM enzymes was confirmed in 68% of isolates, and molecular typing showed clonal dissemination of IMP-1-, plasmid AmpC- and chromosomal AmpC-producing isolates. Otherwise, KPC-2-producing isolates were not clonally related. Conclusion: The characterization of resistance mechanisms to carbapenems, in this study, reveals a change in the resistance patterns among Enterobacteriaceae family members in Brazilian hospitals, due to versatility of isolates to acquire new resistance determinants, which it has favoured the adaptation to hostile environments. Lack of 36 kDa OMP was the most frequent resistance mechanism, being associated to co-production of β-lactamases. Finally, molecular typing denote a clonal dissemination of imipenem-resistant isolates in Sao Paulo city, with exception of KPC-2-producing isolates, which have been described in other Brazilian cities, suggesting a horizontal gene transfer.
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