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Análise multivariada no estudo de características de carcaça e pernil em suínos para produção de presunto maturado / Multivariate analysis to study carcass and ham traits in a pig population for production of dry cured hamVentura, Henrique Torres 22 February 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-02-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study aimed to evaluate genetic groups using multivariate analysis, and to study the association between carcass and ham traits using canonical correlation analysis in a pig population for the production of dry cured ham. The genetics groups were: DULL= Duroc x (Landrace x Large White), DULA= Duroc x Landrace, DUWI= Duroc x Large white, WIWI= Large White, DUDU= Duroc. Carcass traits were obtained: hot carcass weight (HCW), backfat thickness (BT) and loin depth (LD), and ham traits were obtained: gross ham weight (GHW), trimmed ham weight (THW), ham inner layer fat thickness (HIFT), ham outer layer fat thickness (HOFT), pH (PH), and color (COL), with animals slaughtered at 130 kg and at 160 kg weights. In the genetic lines evaluation study, the first and the second canonical variables explained 97.51 %, 93.55% and 88.81% of the total variation of the carcass traits at 130 kg and 160 kg, and ham traits at 130 kg, respectively. In the dispersion graph concerning the canonical means, it was observed significant distance between the genetic groups DUDU and WIWI relative to the carcass traits at 130 kg and 160 kg, and ham traits at 130 kg. Pigs with 50% Duroc were little dispersed relative to the carcass traits at 130 kg and 160 kg and were not divergent to the genetic group DUDU relative to the ham traits 130 kg. In the clustering analysis using the single linkage method DULL, DULA and DUWI were grouped with a high similarity level, relative to the carcass traits with at 130 kg and 160 kg, and ham traits with at 130 kg. In the Tocher optimization method, pigs with 50% Duroc and 100% Duroc were grouped relative to the ham traits at 130 kg, suggesting that 50% Duroc pig s ham traits are similar to the 100% Duroc one. In this context, the utilization of the genetic groups Duroc x Large White, Duroc x Landrace and Duroc x (Landrace x Large White) production of dry cured ham should be recommended. In the study of association between carcass and ham traits it was observed that they were not independent. The canonical correlations (r) between the carcass and ham traits with slaughter weight at 130 kg were 0.77; 0.24; and 0.20 for the first, second and third canonical pair, respectively and all were significant using Wilks test (P<0.01). The canonical correlation between the three canonical variate pairs for the carcass and ham traits with slaughter weight at 160 kg was 0.88; 0.42; 0.14, respectively. All the canonical correlations were significant, except the third, that correspond to third canonical variate pair using Wilks test (P>0.05). The hot carcass weight (HCW) was the higher correlation with the first canonical variate pair relative to carcass traits with slaughter weight at 130 kg and 160 kg. The ham traits gross ham weight (GHW) and trimmed ham weight (THW) were the higher canonical correlation values for slaughter weights 130 kg and 160 kg, relative to the first canonical variate pair. The carcass traits backfat thickness (BT) and loin depth (LD), the last one with negative values,were the higher canonical correlation, for slaughter weights at 130 kg and at 160 kg, relative to the second canonical variate pair. In the ham traits group, ham outer layer fat thickness (HOFT) was the higher canonical correlation values for slaughter weights at 130 kg and 160 kg, relative to the second canonical variate pair. The correlations between the traits and the canonical variates showed an association among hot carcass weight (HCW), gross ham weight (GHW) and trimmed ham weight (THW), as well an association between backfat thickness (BT) and ham outer layer fat thickness (HOFT). These results allows to conclude that the carcass traits group should be used to cull pigs that are not suitable to the dry cured ham production. / O objetivo desse estudo foi avaliar grupos genéticos utilizando-se técnicas de análise multivariada, e estudar a associação entre características de carcaça e de pernil com utilização da análise de correlações canônicas, em uma população de suínos para produção de presuntos maturados. Os seguintes grupos genéticos foram utilizados: DULL= Duroc x (Landrace x Large White), DULA=Duroc x Landrace, DUWI= Duroc x Large White, WIWI= Large White, DUDU= Duroc. Foram obtidas as seguintes medidas de carcaça: peso da carcaça quente (PCQ), espessura do toucinho (ET) e profundidade do músculo Longissimus (PM); e as seguintes medidas de pernil: peso bruto do pernil (PB), peso refilado do pernil (PR), espessura de gordura da borda interna do pernil (EIN), espessura de gordura da borda externa do pernil (EEX), pH do músculo Semimembranosus (pH) e cor superficial do músculo Semimembranosus (COR). Na avaliação de grupos genéticos, observou-se no diagrama de dispersão em relação às médias canônicas uma considerável distância entre os grupos genéticos DUDU e WIWI referente às características de carcaça, com abate aos 130 kg e aos 160 kg, e de pernil, com abate aos 130 kg. Os animais com 50% Duroc situaram-se próximos nas características de carcaça com abate aos 130 kg e 160 kg e foram pouco divergentes em relação ao grupo DUDU nas características de pernil com abate aos 130 kg. Na análise de agrupamento pelo método do vizinho mais próximo os animais DULL, DULA e DUWI foram agrupados com um nível de similaridade alto, em relação às características de carcaça, com abate aos 130 kg e aos 160 kg, e às características de pernil com abate aos 130 kg. No método de otimização de Tocher, os animais 50 % Duroc foram agrupados com os animais puros Duroc, nas análises relativas às características de Pernil, com abate aos 130 kg, o que indica que os animais 50 % Duroc são próximos dos animais puros Duroc com relação às características de pernil. Com base nos resultados obtidos pode-se recomendar a utilização de animais produtos de cruzamento Duroc x Large White, Duroc x Landrace e Duroc x (Landrace x Large White) para a produção de presunto maturado. No estudo da associação entre as características de carcaça e de pernil foi observado que as características de carcaça e de pernil não são independentes. As correlações canônicas (r) entre os conjuntos de características de carcaça e de pernil com abate aos 130 kg foram 0,77; 0,24 e 0,20 para o primeiro, segundo e terceiro par canônico respectivamente, sendo todas consideradas significativas pelo teste de Wilks (P<0,01). Para os grupos de características de carcaça e pernil com abate aos 160 kg, as correlações canônicas (r) entre os três pares canônicos foram 0,88; 0,42; 0,14, respectivamente, sendo a última, correspondente ao terceiro par, a única não significativa pelo teste de Wilks (P >0,05). Ao examinar o primeiro par canônico, observou-se que a variável PCQ obteve maior correlação com as variáveis canônicas dentro do grupo de características de carcaça com abate aos 130 kg e aos 160 kg. Nas características de pernil, com relação ao primeiro par canônico, as características PB e PR obtiveram as maiores correlações com as variáveis canônicas nos dois pesos de abate, 130 kg e 160 kg. Com relação ao segundo par canônico, as variáveis com maiores valores de correlação com as variáveis canônicas foram ET e PM, sendo o último com valores negativos, para as características de carcaça com abate aos 130 kg e 160 kg. Dentro do conjunto de características de pernil, com abate aos 130 kg e 160 kg, em relação ao segundo par canônico, a característica com maior valor de correlação foi a espessura de gordura da borda externa do pernil (EEX). As correlações entre as características e as variáveis canônicas possibilitaram observar que existe associação entre o peso da carcaça quente (PCQ), o peso bruto do pernil (PB) e o peso refilado do pernil (PR), bem como entre a espessura de toucinho (ET) e a espessura de gordura da borda externa do pernil (EEX). Deste modo, é possível concluir que o grupo de características de carcaça pode ser usado para descarte prévio de animais que não se enquadrem nos padrões estabelecidos para produção de presunto maturado.
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Genomic selection for boar taint and carcass traits in a commercial pig line / Seleção genômica para características relacionadas ao odor da carne e características de carcaça em uma linhagem comercial de suínosCampos, Carolina Filardi de 23 July 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-07-23 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / From the beginning of the century, advances in genotyping enabled the development of new classes of markers, among which stand out single nucleotide polymorphisms (SNPs). Due to the availability of these markers it has been proposed genomic selection, consisting of simultaneous analysis of large number of markers distributed throughout the genome; its success depends on the method used for prediction of genomic breeding values. The objective of this study was to compare the methods RR-BLUP and Bayesian LASSO to calculate estimated genomic breeding values (GEBVs) and also to determine which method provides more accurate results for genomic selection in pigs. A total of 622 boarswere genotyped for 2,500 SNPs, and phenotyped for the following traits: concentration of androstenone, concentration of skatole, backfat thickness and loin depth. The R software packages rrBLUP and BLR were used respectively for the implementation of the RR-BLUP method and Bayesian LASSO method. Genetic correlations between the traits were calculated by the correlation between the vectors of GEBVs. The Bayesian LASSO method reached higher accuracy values in three traits: concentration of androstenone (0.65), concentration of skatole (0.58) and loin depth (0.33), and RR-BLUP was more accurate (0.61) for backfat thickness. Genetic correlations calculated, show that exists a small genetic correlation (0.03) between backfat thickness and loin depth. Between the concentrations of androstenone and skatole also exists a genetic correlation (0.24)that is consistent with results from other studies. Thus, concerning to the estimates of effects of markers, for all traits the found peaks were in regions where are reported QTLs inPIGQTLdatabase and other studies. / A partir do início do século XXI, avanços na genotipagem permitiram o desenvolvimento de novas classes de marcadores, entre os quais se destacam os polimorfismos de nucleotídeos simples (SNPs). Devido à disponibilidade desses marcadores, foi proposta a Seleção Genômica, que consiste em uma análise simultânea de um grande número de marcadores distribuídos ao longo do genoma, cujo sucesso depende do método utilizado de predição de valores genéticos genômicos. O objetivo deste estudo foi comparar os métodos RR-BLUP e LASSO Bayesiano para cálculo dos valores genéticos genômicos estimados (GEBVs) e determinar qual método apresenta resultados mais acurados para a seleção genômica em suínos. Foram genotipados 622 suínos machos não castrados para 2.500 SNPs, e fenotipados para as seguintes características: concentração de androstenona, concentração de skatol, espessura de gordura subcutânea e profundidade de lombo. Os pacotes rrBLUP e BLR do software R foram utilizados respectivamente para a implementação do método RR-BLUP e LASSO Bayesiano. As correlações genéticas entre as característicasforam calculadas por meio da correlação entre os vetores de GEBVs. O método LASSO Bayesiano apresentou valores mais elevados de acurácia em três características: concentração de androstenona (0,65), concentração deskatol (0,58), e profundidade de lombo (0,33), e o RR-BLUP foi mais acurado para espessura de gordura subcutânea (0,61). As correlações genéticas calculadas, mostram que existe uma pequena correlação genética entre espessura de gordura subcutânea e profundidade de lombo (0,03). Entre as concentrações de androstenona e skatol também existe correlação genética (0,24) que é consistente com os resultados de outros estudos. Assim, com relação às estimativas de efeitos de marcadores, para todas as características os picos encontrados estão em regiões onde se encontram QTLs relatados no PIGQTLdatabase e em outros estudos.
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Regressão aleatória na avaliação da produção de leite de búfalas Murrah utilizando inferência bayesiana / Random regression analysis to model test-day milk yield in Murrah buffaloes using bayesian inferenceBrito, Lais Costa 19 March 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-03-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Considering the importance of raising buffaloes to the national dairy farming, the objective of this study was to model variations in test-day milk yield (TDMY) during the first lactation of Murrah buffaloes by random regression models (RRM), using orthogonal Legendre polynomials (POL) and linear B-splines (BSP). A total of 15,161 test-day records from 1,158 first lactations of Murrah buffaloes breed from herds belonging to São Paulo state, Brazil, with calving recorded from 1988 to 2005, were analyzed. For TDMY, 38 weekly classes of lactation days were considered and analyzed using a single-trait RRM, including the additive genetic, permanent environmental and residual random effects. In addition, contemporary group, linear and quadratic effects of the covariate age of the buffalo at birth, number of milkings and mean lactation curve of the population, modeled using a fourth-order orthogonal Legendre polynomials, were included as fixed effects. Covariance functions of additive genetic and permanent environmental regression coefficients were equally modeled by POL (3th to 6th order) or linear BPL (4 to 6 knots). Residual variances were modeled considering 9 classes uniformly spaced. The (co)variance components of parameters were estimated by Bayesian inference, using the GIBBS3F90 software. The convergence of Gibbs chains was verified by graphic inspection and using BOA package from the R program. The post-gibbs analyses were performed using the POSTGIBBS1F90 software. The selection of the models was based on deviance information criterion (DIC). The average TDMY was 6.31±2.13 kg. The sixth order POL and six-knot BSP (knots at 8, 29, 57, 120, 239 and 267 days), with highest degree of complexity (51 parameters) were considered as the most suitable to describe the TDMY variation. The genetic parameters presented similar tendencies for both models, excepted for genetic variances and heritability, which showed low estimates at first lactation weeks for model BSP6. It was possible realize that, despite the low correlation between the predicted breeding value for 270-day milk yield and lactation persistency, the best models classified the bulls similarly. The results indicate that linear B-spline function with six knots was the most appropriate RRM to genetic evaluation of TDMY of Murrah buffaloes, given that parcimonious models with higher computational advantages to model variations of TDMY are most sought, and given the better control of heritability estimates of the edges of the lactation curve. / Ao considerar a crescente importância da bubalinocultura na pecuária leiteira nacional, objetivou-se com o presente estudo modelar as variações da produção de leite no dia de controle (PLDC) de búfalas da raça Murrah por meio de modelos de regressão aleatória (polinômios ortogonais de Legendre POL e B-splines BSP lineares). Para tanto, foram analisados 15161 registros semanais de PLDC provenientes da primeira lactação de 1158 búfalas da raça Murrah, com partos registrados entre os anos de 1988 a 2005 e pertencentes a rebanhos do estado de São Paulo, Brasil. As PLDC foram divididas em 38 classes semanais e analisadas considerando modelo animal de regressão aleatória - que incluiu efeitos aleatórios genético-aditivo, de ambiente permanente e residual. Adicionalmente, incluíram-se efeitos fixos de grupo de contemporâneo, a covariável idade da búfala ao parto (efeito linear e quadrático), número de ordenhas e as médias dos coeficientes da curva de lactação representativa da população (sendo esta ajustada por meio de POL de 4ª ordem). As funções de covariâncias relativas aos coeficientes de regressão aleatória dos efeitos genético-aditivo e de ambiente permanente foram igualmente modeladas por meio de POL (3ª à 6ª ordem) ou BSP lineares (4 a 6 nós). A estrutura residual foi considerada heterogênea, contendo nove classes de variâncias. Os componentes de (co)variância dos parâmetros foram estimados via inferência bayesiana, utilizando o programa GIBBS3F90. A convergência das cadeias de Gibbs foi verificada por meio de inspeção gráfica e o pacote BOA, do programa R. As análises pós-gibbs foram feitas utilizando o POSTGIBBS1F90. A seleção dos melhores modelos se deu pela utilização do critério de informação da deviance (DIC). A média de PLDC foi igual a 6,31±2,13 kg. Os modelos POL de sexta ordem POL6, e BSP com seis nós BSP6 (8, 29, 57, 120, 239, 267 dias), com maior número de parâmetros (51) foram considerados os melhores para descrever a variação da PLDC ao longo da lactação. De modo geral, os parâmetros genéticos apresentaram tendências semelhantes para estes modelos, à exceção das estimativas de variância genética aditiva e herdabilidade, menores nas primeiras semanas de lactação para o modelo BSP6. Verificou-se que, apesar de pouco correlacionados, os valores genéticos preditos para produção de leite aos 270 dias e persistência da lactação para os melhores modelos classificam os reprodutores de forma similar. O MRA mais recomendável para avaliação genética da PLDC de búfalos da raça Murrah é uma função B-spline (com seis nós), haja vista a procura por modelos mais parcimoniosos e com maiores vantagens computacionais para modelar variações da PLDC de búfalas da raça Murrah; e dado maior controle das estimativas de herdabilidade referentes aos extremos na curva de lactação.
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Comparação de diferentes cenários de métodos de seleção, tipos de acasalamento e razões sexuais em características de codornas de corte usando simulação / Proportion of different scenarios of selection methods, mating types and sexual reasons in characteristics quail cutting using simulationLehner, Helmut Gonçalves 08 August 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-08-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study aimed to compare different scenarios including methods of selection, mating and sexual reasons economic interest characteristics of quails in the long term. Were simulated for each trait (slaughter weight, carcass yield and mortality) different genomes similar to the European quail through the computer program GENESYS. From each genome was originally obtained from a population base of 1200 patients (600 males and 600 females) heterozygotes with no relationship to one another. Subsequently, the initial population was formed by random sampling and mating of 204 males and 204 females obtaining an initial population of 2040 individuals corresponding to an average number of offspring per female 10. Formed after the initial populations began the formation of the selected populations, a total of 24 for each characteristic, corresponding to scenarios formed by two selection methods (SI= Single and BP= BLUP), four sex ratios (D1= 204 males: 204 females; D2= 102 males: 204 females; D3= 68 males: 204 females, and D4= 51 males: 204 females) and three mating systems (RAA= Players randomly mated; EIC= Deleting Brothers Completion; EICMI= Deleting Brothers Full and Half-Brothers) over 20 generations with 10 repetitions. Populations under selection were compared using the parameters: phenotypic value, the average coefficient of inbreeding, fixation of favorable and unfavorable alleles and selection limit. It was observed that the method of selection, the phenotypic values were generally higher for the BLUP, especially in the characteristic slaughter weight. However, individuals undergoing BLUP resulted in higher increase in inbreeding coefficient, the greater percentage of fixation favorable and unfavorable alleles and greater reduction in threshold selection. The increase in sex ratios mainly influenced coefficients of inbreeding within the population. Mating systems that excluded the crossing among relatives (EIC and EICMI) were instrumental in reducing inbreeding, besides providing an increased fixation of favorable alleles and reduction in unfavorable allele fixation and selection limit. / Objetivou-se comparar diferentes cenários incluindo métodos de seleção, tipos de acasalamento e razões sexuais em características de interesse econômico de codornas de corte a longo prazo. Foram simulados para cada característica (peso ao abate, rendimento de carcaça e mortalidade) diferentes genomas similares ao da codorna européia por meio do programa computacional GENESYS. A partir de cada genoma foi obtido inicialmente uma população base de 1200 indivíduos (600 machos e 600 fêmeas) heterozigotos sem nenhum parentesco entre si. Posteriormente, foi formada a população inicial através da amostragem e acasalamento aleatório de 204 machos e 204 fêmeas obtendo uma população inicial de 2040 indivíduos correspondentes a um número médio de 10 descendentes por fêmea. Depois de formadas a populações iniciais, teve início à formação das populações de seleção, num total de 24 para cada característica, correspondendo aos cenários formados por dois métodos de seleção (SI= Individual e BP= BLUP), quatro razões sexuais (D1= 204 machos: 204 fêmeas; D2= 102 machos: 204 fêmeas; D3= 68 machos: 204 fêmeas; e D4= 51 machos: 204 fêmeas) e três sistemas de acasalamento (RAA= Reprodutores Acasalados Aleatoriamente; EIC= Exclusão de Irmãos Completos; EICMI= Exclusão de Irmãos Completos e Meio-Irmãos) ao longo de 20 gerações com 10 repetições. As populações sob seleção foram comparadas através dos parâmetros: valor fenotípico, coeficiente médio de endogamia, fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que quanto ao método de seleção, os valores fenotípicos médios em geral foram superiores para o BLUP, principalmente na característica peso ao abate. Entretanto, os indivíduos submetidos ao BLUP resultaram em maior incremento do coeficiente de endogamia, maior percentagem de fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e a maior redução no limite de seleção. O aumento das razões sexuais influenciou principalmente os coeficientes de endogamia dentro da população. Os sistemas de acasalamento que excluíram o cruzamento entre aparentados (EIC e EICMI) foram determinantes na redução da endogamia, além de proporcionarem um aumento da fixação de alelos favoráveis e redução na fixação de alelos desfavoráveis e no limite da seleção.
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Estudo da endogamia e da estrutura de populações de codornas de corte sob seleção / Study of inbreeding and population structure of meat quail population under selectionCrispim, Aline Camporez 29 July 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this study was to analyse the structure of population, genetic tendency and evaluate the effect of inbreeding ongrowth and production traits of meat type quail selected by weigth. Strains UFV1 and UFV2, from Universidade Federal de Viçosa, was used to calculate inbreeding coefficient (F) and effective population size (Ne), totalizing 12.965 animals and 11generations from UFV1 and 18.273 animals and 17 generations from UFV2. The software Endog was used to calculate the genetic structure of population. The software Wombat was used to predict breeding values for growth and production traits using a bicharacteristicmodel. Traits were birth weight (P1), body weight at 28 days (P28), average egg weight up to 112 days of age (POM112), number of eggs up to 112 days (NO112) and egg mass up to 112 days (MO112).Also, general linear models (GLM) were used to analyze effects of generation on genetic value and the effects of inbreeding on genetic value traits. All regressions was tested for significance (P < 0.05) using the software SAS. The UFV1 strain showed an average F of 0,79% and Ne 330,18. UFV2 strain showed an average F of 1,85% and Ne 194,58. The effect of generations on inbreeding and effect of generations on average of genetic value was quadratic, for both strains. The inbreeding presented a quadratic effect on genetic value, for all traits and strains. The genetic gain with body weight selection was superior to losses by inbreeding depression. Animals with inbreeding over than 13% have suffered the effects of inbreeding depression for P1, P28 and POM112. / Objetivou-se, com este trabalho, fazer um estudo da estrutura da população, bem como uma análise da tendência genética e avaliação do efeito da endogamia sobre características de crescimento e produção de ovos de duas linhagens de codornas de corte submetidas a seleção por peso. Foi utilizado um banco de dados das linhagens,UFV1 e UFV2, provenientes do programa de melhoramento genético de codornas de corte da Universidade Federal de Viçosa. Para cálculo da endogamia e estrutura de população através do programa Endog, foram utilizadas 11 gerações da UFV1, totalizando 12.965 animais, e 17 gerações da UFV2, totalizando 18.373 animais. Os valores genéticospara as características de crescimento e produção foram preditos através do programa WOMBAT, usando um modelo bicaracterística. As características foram peso ao nascimento (P1), peso aos 28 dias (P28), peso médio do ovo até 112 dias(POM112), número de ovos até 112 dias (NO112) e massa de ovos até 112 dias (MO112).Para estudo de tendência genética foi testada regressão linear e quadrática do valor genético em função das gerações avaliadas. Para estudo do efeito da endogamia sobre as características, foram testadas regressões linear e quadrática do valor genético das características avaliadas em função da taxa de endogamia (F%). A significância das regressões obtidas, utilizando o programa SAS, foi avaliada ao nível de 5% de probabilidade. Para a linhagem UFV1, a taxa de endogamia média foi 0,79% e tamanho efetivo de população 330,18.Para a linhagem UFV2, o coeficiente de endogamia médio foi 1,85% e o tamanho efetivo 194,58. A endogamia média em função das gerações apresentou efeito quadrático para as duas linhagens. O valor genético em função das gerações apresentou efeito quadrático para todas as características e linhagens. O valor genético em função da taxa de endogamia apresentou efeito quadrático para todas as características e linhagens. O ganho genético obtido com a seleção foi superior às perdas por depressão endogâmica. Animais com endogamia superior a 13% sofreram efeitos da depressão endogâmica para P1, P28 e POM112.
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Análise de características reprodutivas, tratadas como variáveis categóricas, em bovinos da raça Nelore / Analysis of reproductive traits, treated as categorical variables, in Nellore cattleKluska, Sabrina 15 February 2017 (has links)
CAPES / O presente trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos, em uma população de bovinos da raça Nelore, para as características probabilidade de parto até os 39 meses de idade (PC39), probabilidade de permanência no rebanho (stayability), considerando três partos até 5,2 (STAY5,2) e três partos até 6,2 anos (STAY6,2), e os quatro primeiros intervalos entre partos (IEP1, IEP2, IEP3 e IEP4), tratando- as como variáveis categóricas, e para os perímetros escrotais à desmama (PED) e ao sobreano (PES), tratando-as como variáveis contínuas. Foram usados procedimentos bayesianos, em análises unicaracterística e bicaracterística, por meio dos programas THRGIBBS1F90 e GIBBS2F90. Os dados utilizados pertencem ao programa de melhoramento genético Geneplus - Embrapa. As herdabilidades para PC39, STAY5,2, STAY6,2 , PED e PES em análise unicaracterística foram 0,15, 0,20, 0,23, 0,28 e 0,36, respectivamente. Para o intervalo entre partos as estimativas de herdabilidade, obtidas em análise unicaracterística, para IEP1, IEP2, IEP3 e IEP4 foram 0,13 0,13, 0,12 e 0,17, respectivamente. Estes valores indicam que os ganhos por seleção direta em quaisquer um dos intervalos seriam pequenos.Na análise bicaracterística as herdabilidades para PC39 e PES foram 0,14 e 0,38,respectivamente. As estimativas obtidas foram de baixa magnitude, indicando que os ganhos por seleção direta em qualquer uma das características mensuradas nas fêmeas seriam baixos. Já o PED e PES apresentaram maiores valores de herdabilidades. A correlação entre PES e PC39 foi positiva e de baixa magnitude (0,25), sugerindo que a seleção para o aumento do PES de touros possivelmente levaria a pequenas mudanças na PC39. De modo geral as estimativas de herdabilidade para as características medidas nas fêmeas apresentaram baixos valores, enquanto que para as características medidas nos machos se apresentaram de moderada a baixa, de maneira semelhante à maioria dos estudos com estas características. Entretanto, o modelo de limiar foi capaz de detectar variância genética aditiva para as características em estudo, permitindo promover ganhos, embora pequenos, por seleção direta. / In the present study were obtained, in a population of Nellore cattle, estimates of genetic parameters for the characteristics probability of calving up to 39 months at age (PC39), stayability, considering three calving until 5.2 (STAY5,2) and trhee calving until 6.2 years old (STAY6,2), and the first four calving interval (CI1, CI2, CI3 and CI4), treated as categorical traits, and scrotal perimeter at weaning (EPD) and at 18 months of age (EPS), treated as continuos trait. Were used Baeysian procedures, in single and two trait analysis, by using THRGIBBS1F90 and GIBBS2F90 programs. Information from Nellore animals belonging to the Geneplus-Embrapa program was used. The heritabilities for PC39, STAY3,1, STAY3,2, EPD and EPS in single trait analysis were 0.14, 0.20, 0.23, 0.28 and 0.36, respectively. For the calving interval estimates heritabilities for CI1, CI2, CI3 and CI4 were 0.13, 0.13, 0.12 and 0.017, respectively. These values indicate that genetic gains by direct selection in any of the intervals would be very small. In the two trait analysis the heritabilities for PC39 and EPS were 0.15 and 0.38, respectively. The low values of estimates showed that small gains would be obtained by direct selection in any of traits measured in females. EPD and EPS had higher heritabilities. The correlation between EPS and PC39 was positive with low magnitude (0.25), suggesting that the selection for the increase of EPS of sires could possibly lead to small changes in the PC39. In general, estimates of heritability for traits measured in dams were low and for traits measured in males were moderate to low. This result is likely those reported in most studies with the same traits. However, the threshold model was able to detect additive genetic variance for the traits under study and can permit to promote gains, albeit small, by direct selection.
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Análise de características reprodutivas, tratadas como variáveis categóricas, em bovinos da raça Nelore / Analysis of reproductive traits, treated as categorical variables, in Nellore cattleKluska, Sabrina 15 February 2017 (has links)
CAPES / O presente trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos, em uma população de bovinos da raça Nelore, para as características probabilidade de parto até os 39 meses de idade (PC39), probabilidade de permanência no rebanho (stayability), considerando três partos até 5,2 (STAY5,2) e três partos até 6,2 anos (STAY6,2), e os quatro primeiros intervalos entre partos (IEP1, IEP2, IEP3 e IEP4), tratando- as como variáveis categóricas, e para os perímetros escrotais à desmama (PED) e ao sobreano (PES), tratando-as como variáveis contínuas. Foram usados procedimentos bayesianos, em análises unicaracterística e bicaracterística, por meio dos programas THRGIBBS1F90 e GIBBS2F90. Os dados utilizados pertencem ao programa de melhoramento genético Geneplus - Embrapa. As herdabilidades para PC39, STAY5,2, STAY6,2 , PED e PES em análise unicaracterística foram 0,15, 0,20, 0,23, 0,28 e 0,36, respectivamente. Para o intervalo entre partos as estimativas de herdabilidade, obtidas em análise unicaracterística, para IEP1, IEP2, IEP3 e IEP4 foram 0,13 0,13, 0,12 e 0,17, respectivamente. Estes valores indicam que os ganhos por seleção direta em quaisquer um dos intervalos seriam pequenos.Na análise bicaracterística as herdabilidades para PC39 e PES foram 0,14 e 0,38,respectivamente. As estimativas obtidas foram de baixa magnitude, indicando que os ganhos por seleção direta em qualquer uma das características mensuradas nas fêmeas seriam baixos. Já o PED e PES apresentaram maiores valores de herdabilidades. A correlação entre PES e PC39 foi positiva e de baixa magnitude (0,25), sugerindo que a seleção para o aumento do PES de touros possivelmente levaria a pequenas mudanças na PC39. De modo geral as estimativas de herdabilidade para as características medidas nas fêmeas apresentaram baixos valores, enquanto que para as características medidas nos machos se apresentaram de moderada a baixa, de maneira semelhante à maioria dos estudos com estas características. Entretanto, o modelo de limiar foi capaz de detectar variância genética aditiva para as características em estudo, permitindo promover ganhos, embora pequenos, por seleção direta. / In the present study were obtained, in a population of Nellore cattle, estimates of genetic parameters for the characteristics probability of calving up to 39 months at age (PC39), stayability, considering three calving until 5.2 (STAY5,2) and trhee calving until 6.2 years old (STAY6,2), and the first four calving interval (CI1, CI2, CI3 and CI4), treated as categorical traits, and scrotal perimeter at weaning (EPD) and at 18 months of age (EPS), treated as continuos trait. Were used Baeysian procedures, in single and two trait analysis, by using THRGIBBS1F90 and GIBBS2F90 programs. Information from Nellore animals belonging to the Geneplus-Embrapa program was used. The heritabilities for PC39, STAY3,1, STAY3,2, EPD and EPS in single trait analysis were 0.14, 0.20, 0.23, 0.28 and 0.36, respectively. For the calving interval estimates heritabilities for CI1, CI2, CI3 and CI4 were 0.13, 0.13, 0.12 and 0.017, respectively. These values indicate that genetic gains by direct selection in any of the intervals would be very small. In the two trait analysis the heritabilities for PC39 and EPS were 0.15 and 0.38, respectively. The low values of estimates showed that small gains would be obtained by direct selection in any of traits measured in females. EPD and EPS had higher heritabilities. The correlation between EPS and PC39 was positive with low magnitude (0.25), suggesting that the selection for the increase of EPS of sires could possibly lead to small changes in the PC39. In general, estimates of heritability for traits measured in dams were low and for traits measured in males were moderate to low. This result is likely those reported in most studies with the same traits. However, the threshold model was able to detect additive genetic variance for the traits under study and can permit to promote gains, albeit small, by direct selection.
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Dermatófitos em gatos sem dermatopatias na região metropolitana de Florianópolis - SCFraga, Cibele Floriano January 2017 (has links)
Dermatófitos são denominados os fungos filamentosos queratinofílicos e queratinolíticos responsáveis pela dermatofitose, uma importante zoonose de ocorrência mundial. Gatos são considerados hospedeiros naturais e potenciais carreadores de fungos dermatofíticos, especialmente Microsporum canis, principal agente da dermatofitose em pequenos animais e que frequentemente acomete humanos. A prevalência dos dermatófitos em gatos sem dermatopatias apresenta variações regionais atribuídas aos aspectos climáticos e às características associadas a cada população. Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi estimar a frequência de dermatófitos isolados de gatos que não apresentavam sinais clínicos de dermatopatias na região metropolitana de Florianópolis - SC, entre julho de 2015 e outubro de 2016. Características como sexo, idade, comprimento do pelame, sorologia para FIV e FeLV, acesso à rua e contato com outros gatos foram avaliadas em associação ao isolamento de dermatófitos. Amostras do pelame de 198 gatos foram obtidas através da técnica de MacKenzie que consiste na escovação vigorosa dos pelos, por todo corpo do animal, utilizando escova dental estéril. Cento e dez amostras (55,6%) foram colhidas em clínicas veterinárias e 88 (44,4%) em domicílios com numerosos gatos (11 em média). O cultivo micológico foi realizado em Sabouraud Agar Cloranfenicol-Ciclo-hexamida (SCC) e a incubação realizada a 25-27°C, durante 21-28 dias. O diagnóstico foi baseado nas características macro e micromorfológicas do dermatófito isolado. A frequência de dermatófitos correspondeu a 3,0% (6/198), onde apenas o gênero Microsporum foi observado com predomínio de M. canis (66,7%; 4/6), seguido de M. gypseum (33,3%; 2/6). Fungos saprotróficos foram observados em 94,4% das culturas e 5,6% das amostras não tiveram crescimento fúngico. A maior parte dos isolados ocorreu de gatos adultos (66,7%; 4/6), fêmeas (83,3%; 5/6) e de pelame longo (5,4%; 3/55), em comparação às amostras de pelame curto (2,1%; 3/143). Uma parcela dos gatos (30,0%; 59/198) havia sido testada para FIV/FeLV e destes, 27,0% (16/59) eram positivos: 22,0% para FeLV e 5,0% para FIV. Microsporum gypseum foi isolado de um gato FeLV positivo. Dermatófitos foram isolados de gatos em contato com outros gatos (5/165). No entanto, gatos provenientes de domicílios com alta densidade populacional não apresentaram cultura positiva para dermatófitos, fato atribuído à intensa contaminação por espécies saprotróficas. Na ausência de sinais clínicos, há o desafio de detectar fungos dermatofíticos nas criações, o que ressalta a necessidade de controle entre os felinos. O cultivo micológico é um método eficaz, econômico e deve ser indicado pelos médicos veterinários que atuam na clínica médica, tanto no âmbito doméstico, como em abrigos para prevenção e controle da infecção em animais e humanos. / Dermatophytes are the filamentous fungi keratinophilic and keratinolytic responsible for dermatophytosis, an important worldwide zoonosis. Cats are considered natural hosts and potential carriers of dermatophytes especially Microsporum canis, the main agent of dermatophytosis in small animals and frequently affects humans. The prevalence of dermatophytes in cats without dermatopathies presents regional variations attributed to the climatic aspects and the characteristics associated with each population. In this context, the aim of this study was to estimate the frequency of dermatophytes isolated from cats that had no clinical signs of dermatopathies in the Metropolitan Area of Florianópolis - SC between July 2015 and October 2016. Sex, age, length of hair, serology for FIV and FeLV, outdoors access and contact with other cats were evaluated in association with the isolation of dermatophytes. Hair samples of 198 cats were obtained through the MacKenzie brush technique consisting of vigorous brushing of the hairs, throughout the animal's body, using a sterile toothbrush. One hundred and ten samples (55.6%) were collected in veterinary clinics and 88 (44.4%) in multiple household cats (average 11). Mycological culture was performed onto Sabouraud Agar Chloramphenicol- Cyclohexamide (SCC), and incubated at 25-27°C for 21-28 days. The diagnosis was based on the macro and micromorphological characteristics of the isolated dermatophyte. The frequency of dermatophytes corresponded to 3.0% (6/198). Only the genus Microsporum was observed with predominance of M. canis (66.7%; 4/6), followed by M. gypseum (33.3%; 2/6). Saprotrophic fungi were observed in 94.4% of the cultures and 5.6% of the samples did not occurred fungal growth. Most of the isolates occurred in adult (66.7%; 4/6), female (83.3%; 5/6) and long hair cats (5.4%; 3/55) compared to the short hair (2.1%). Part of this cats (30.0%, 59/198) had been tested for FIV / FeLV and, among them, 27.0% were positive (22.0% FeLV and 5.0% FIV). Microsporum gypseum was isolated from one FeLV positive cat. Dermatophytes were isolated from cats in contact with other cats (5/165). However, multiple household cats had no positive cultures and this outcome can be associated to high contamination by saprotrophic fungi. In the absence of clinical signs, the challenge of detecting dermatophytic fungi in the creations, which highlights the needs of control among the felines. Mycological cultivation is an effective, economical method and should be indicated by veterinarians working in the medical clinic, both at home and in shelters for the prevention and control of animal and human infection.
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Terapia fonoaudiológica assistida por cães: estudo de casos clínicosDomingues, Camila Mantovani 12 February 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-02-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / INTRODUCTION: By sharing our routines with animals, they became part of our culture when start to occupy different roles, besides the company. Currently, due to the benefits not restricted to common sense, but also listed from scientific research, they are in clinics, hospitals, schools and many others institutions. These studies gave itself two ways to call procedures involving animals with the purpose of taking care of human health: animal-assisted activities (AAA) and animal-assisted therapy (AAT) (DELTA SOCIETY, 2006) OBJECTIVE:Investigating the possible effects of the interaction speech therapyst-patient-dog in the operation of patients language with disturbances of language. The event set in the possibility of the device animal, in speech therapy setting, enhance the therapeutic process. METHOD: Clinical-quality research, developed in study of clinical cases mode. The ethical standards for research with humans and animals were obey.Casuistry: Three subjects, from sample unintentional: Jonas, 12; 0 years, male, with difficulties in writing / reading language; Lucas, 8; 0 years, male with school´s complaints related to difficulties in the written / reading language, summed the dismotivation for learning; Pedro, 4; 0 years, male with phonological changes that lead to segments of unintelligible speech, as well as complaints related to aggressive behavior. The animal participant was a dog without defined race (SDR), seven years old, female, selected in accordance with the criteria proposed by Aiello (DOTTI, 2005). Procedure: The clinical material was recorded in writing regularly and the sessions were recorded on digital camera bimonthly. The interpretation of the data came from theoretical benchmarks of anthropology, speech therapy, psychoanalysis and AAT. RESULTS: The AAT favored the interaction between therapist / patient, intensified the activity dialogical (LaFRANCE et al, 2007) the motivation to write and to read, the reduction of the problems manifest in writing (replacements / omissions grafemics, junction / separation misuse of words); besides mobilize the affectivity of the patients.CONCLUSION: The introduction of AAT as a therapeutic device shown to be effective in clinical cases studied. It is suggested therefore that the Speech Therapy participate more actively in this field of study, since the results corroborate the findings of research that suggests the effectiveness of AAT in various therapeutic environments / INTRODUÇÃO: Ao compartilhar nossas rotinas com os animais, estes passaram a fazer parte de nossa cultura ao ocupar diferentes papéis, para além da companhia. Atualmente, devido aos benefícios não restritos ao senso comum, mas também elencados a partir de pesquisas científicas, eles habitam consultórios, hospitais, escolas e instituições diversa. Desses estudos originaram-se duas formas de denominar procedimentos que envolvem animais com o objetivo de cuidar da saúde humana: atividade assistida por animais (AAA) e terapia assistida por animais (TAA) (DELTA SOCIETY, 2006). OBJETIVO: Investigar os possíveis efeitos da interação fonoaudiólogo-paciente-cão no funcionamento da linguagem de pacientes com distúrbios de linguagem. A hipótese configurou-se na possibilidade do dispositivo animal, no setting fonoaudiológico, potencializar o processo terapêutico. MÉTODO: Pesquisa de natureza clínico-qualitativa, desenvolvida na modalidade estudo de casos clínicos. As normas éticas para pesquisa com seres humanos e animais foram obedecidas. Casuística: três sujeitos, a partir de amostra não intencional: Jonas, 12;0 anos, sexo masculino, com dificuldades na linguagem escrita/leitura. Lucas, 8;0 anos, sexo masculino com queixas escolares relacionadas a dificuldades na linguagem escrita/leitura, somadas a desmotivação para aprendizagem. Pedro, 4;0 anos, sexo masculino com alterações fonológicas que levam a segmentos ininteligíveis de fala, além de queixas relacionadas ao comportamento agressivo, O animal participante foi um cão sem raça definida (SDR), sete anos, fêmea, selecionado de acordo com os critérios propostos por Aiello (DOTTI, 2005). Procedimento: O material clínico foi registrado por escrito regularmente e as sessões foram gravadas em câmera digital bimestralmente. A interpretação dos dados ocorreu a partir de referenciais teóricos da antropologia, fonoaudiologia, psicanálise e TAA. RESULTADOS: A TAA favoreceu a interação terapeuta/paciente, intensificou a atividade dialógica (LaFRANCE et al, 2007) a motivação para escrever e ler, a diminuição dos problemas manifestos na escrita (substituições/omissões grafêmicas, junção/separação indevida de palavras); além de mobilizar a afetividade dos pacientes. CONCLUSÃO: A introdução da TAA como dispositivo terapêutico mostrou-se eficaz nos casos clínicos estudados. Sugere-se, portanto, que a Fonoaudiologia participe mais ativamente desse campo de estudos, já que os resultados obtidos corroboram os achados de pesquisas que apontam a eficácia da TAA em ambientes terapêuticos diversos
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Estudo comparativo das clostridioses diagnosticadas no Setor de Patologia Veterinária da Universidade Federal do Rio Grande do Sul / Comparative study of clostridial diagnosing in sector of veterinary pathology of the Federal University of Rio Grande do SulRaymundo, Djeison Lutier January 2010 (has links)
Descreve-se os achados epidemiológicos e clínico-patológicos das clostridioses diagnosticadas no Setor de Patologia Veterinaria da Universidade Federal do Rio Grande do Sul no período 1996-março/2010. Este estudo incluiu uma pesquisa retrospectiva nos arquivos do SPV e uma etapa prospectiva, a qual também teve o objetivo de desenvolver exames complementares específicos para cada clostridiose. As clostridioses mais prevalentes foram tétano (em equinos, bovinos, ovinos e caprinos), botulismo (em bovinos, suínos e aves) e enterotoxemia (em caprinos). Também houve casos de edema maligno em equinos, bem como de carbúnculo sintomático e hemoglobinúria em bovinos. Adicionalmente, foram coletadas amostras de soro sanguíneo de animais afetados por tétano, em diferentes estágios de evolução da doença, para subsequente inoculação em camundongos (testes de bioensaio) e comprovação da técnica no diagnóstico da enfermidade. / This study describes the epidemiological and clinicopathological findings of clostridial diseases diagnosed in the 1996-March, 2010 period in the Setor de Patologia Veterinária da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV_UFRGS). A retrospective survey in the files of SPV was complemented with a prospective phase, which also aimed developing complementary diagnostic tests of clostridiosis. The most prevalent clostridiosis were tetanus (in horses, cattle, sheep and goats), botulism (in cattle, pigs and birds), and enterotoxemia in goats. There also were cases of malignant edema in horses, blackleg and bacillary hemoglobinuria in cattle. In addition, blood serum samples from animals affected by tetanus on different stages of the disease evolution were applied in mice bioassay, as a complementary diagnosing test for the disease.
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