As-p18 es una de las proteínas más abundantes del fluido que baña a la larva infectiva, L3, dentro de los huevos, particularmente resistentes, del parásito Ascaris suum. Es una proteína que une lípidos, perteneciente al grupo de las FABPs, aunque por presentar características únicas, exclusivas para nematodos, se las asocia a un nuevo subcluster, las nemFABPs. Dentro de las peculiaridades de las nemFABPs se destacan: poseer señal de secreción, estar bajo una estricta regulación de síntesis y poseer una estructura con ciertas características no presentes en otros miembros de la superfamilia. Tomando como base estas diferencias, se ha propuesto que las nemFABPs presentarían funciones específicas, de relevancia en la supervivencia de estos organismos, tal vez involucrando la captación, la distribución y/o el almacenamiento de lípidos. Con la finalidad de contribuir al entendimiento de la estructura y función de este singular grupo de proteínas, se abordaron estudios estructurales y de dinámica, empleando la técnica de Resonancia Magnética Nuclear (RMN). Por otra parte, se determinaron las propiedades de unión a lípidos, haciendo uso de variadas técnicas biofísicas y bioquímicas. Por último se analizó la capacidad de As-p18 para transferir ácidos grasos a membranas modelo y se realizaron ensayos preliminares para caracterizar la interacción con las mismas. El plegamiento tridimensional determinado en solución, mostró que As-p18 presenta componentes estructurales que caracterizan a la familia de FABPs. Dentro de los mismos se encuentran: el barril β, formado por 10 hebras β antiparalelas cubierto por el motivo hélice-vuelta-hélice; la hendidura o gap entre las hebras βD y βE; una cavidad interna que incluye al sitio de unión al ligando y que involucra residuos de aminoácidos polares e hidrofóbicos; y una región portal postulada como lugar de entrada del ligando, delimitada por los loops entre βC-βD y βE-βF, y la α-hélice II. Sin embargo, a pesar de presentar un plegamiento FABP canónico, As-p18 mostró características que la diferencian de cualquier estructura de FABP descrita hasta el presente. Los loops entre las hebras βB y βC, y βG y βH, son notablemente más largos que los presentes en cualquier otra FABP, llegando al doble de longitud para el primer caso. En cuanto a los residuos que estabilizan la unión del ligando, se comprobó la participación de la Arginina 43, que dada su ubicación relativa en la proteína, representa un elemento atípico respecto a lo observado para otras FABPs. Aminoácidos hidrofóbicos protruyentes, que flanquean la región portal, estarían potencialmente involucrados en interacciones proteína-proteína o proteína-membrana. Los estudios de unión a lípidos mediante TLC y cromatografía gaseosa mostraron que la proteína recombinante une de manera exclusiva ácidos grasos (AGs) dentro de un entorno lipídico celular como el provisto por E. coli. Entre los AGs seleccionados del medio por la proteína, se comprobó un enriquecimiento relativo de ácido oleico (18:1). La particular afinidad por este lípido se corroboró mediante experimentos de fluorescencia involucrando el desplazamiento competitivo de una sonda fluorescente. Asimismo, estudios por Calorimetría de Titulación Isotérmica (ITC) y RMN, permitieron establecer un único sitio de unión, de alta afinidad, donde la contribución entálpica fue preponderante. En cuanto a la habilidad de As-p18 para ceder AGs a vesículas o membranas modelo, se ha propuesto que la transferencia de ligandos ocurre mediante interacciones proteína-membrana. En este sentido, se analizaron de forma preliminar qué factores modulan dicha interacción. En resumen, los resultados obtenidos en este trabajo de Tesis contribuirían a la comprensión del rol de As-p18 en los huevos infectivos de A. suum. De manera más general, constituyen el paso inicial para el mejor entendimiento del nuevo subcluster, nemFABP, dentro de la familia de las FABPs.

In 1931, Mungomery stated "whitegrubs have been for years past, and still are, the worst insect problem confronting the sugar industry". This statement remains true to this day, with canegrubs costing the Australian sugar industry A$7.22 million in lost production and in use of insecticides. The development of a sugarcane cultivar with resistance to canegrub attack would be a valuable addition to the recently implemented canegrub management program. This thesis examined the possibility that natural inhibitors derived from canegrubs could be incorporated in sugarcane to reduce or prevent its destruction by canegrubs. The research described here demonstrated that canegrub haemolymph contains inhibitors with activity against commercially purified enzymes and serine proteases found in crude midgut extracts. A cDNA encoding a potential canegrub protease inhibitor (DA10 12) belonging to the Ascaris family was cloned, but it did not have activity against the major canegrub midgut proteases. This protein does, however, still have potential for modification into a serine protease inhibitor suitable for use as a novel insect resistance transgene. The possibility of using haemolymph derived inhibitors as novel antimetabolites in a canegrub management strategy based on transgenic plants was also explored. The findings suggest that proteins with properties similar to those of DA10 12 will require the presence of a signal peptide and/or codon optimisation for successful expression in sugarcane. The research outlined in this thesis is the first investigation of protease inhibitors in the haemolymph of scarab larvae, and is the first report of an Ascaris family inhibitor that does not inhibit a serine protease.

Lic.-avh. Uppsala : Sveriges lantbruksuniv. / Härtill 3 uppsatser.

p. 1-91 / Submitted by Antonio Geraldo Couto Barreto (ppgms@ufba.br) on 2013-10-02T18:18:39Z No. of bitstreams: 1 TESE FINAL TOTAL 19-09.pdf: 5006094 bytes, checksum: b3c2eaab92221a19848b3eaf975c9789 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barroso(pbarroso@ufba.br) on 2013-10-08T17:04:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE FINAL TOTAL 19-09.pdf: 5006094 bytes, checksum: b3c2eaab92221a19848b3eaf975c9789 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-08T17:04:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE FINAL TOTAL 19-09.pdf: 5006094 bytes, checksum: b3c2eaab92221a19848b3eaf975c9789 (MD5) Previous issue date: 2013 / OBJETIVO: Estudar a associação entre asma e ascaridíase e sua distribuição espacial em crianças de 2 a 10 anos de idade, no bairro do Pedregal – Campina Grande - PB METODOLOGIA: Estudo transversal, no período de Janeiro e Novembro de 2007. Foram aplicados 1004 questionários padrão International Study of Asthma And Allergy in Childhood (ISAAC), e entregue o recipiente para coleta de material fecal. No exame parasitológico de fezes foi utilizado o método de Ritchie, para o cálculo da carga parasitária foi utilizado o método de Kato-Katz. A posição geográfica das residências foi registrada com um aparelho de GPS GARMIN. Foram utilizados o teste t e teste qui-quadrado (2) de Pearson e de Tendência Linear e Regressão Logística, com Odds Ratio (OR) e Intervalo de Confiança (IC). Para analise espacial o banco de dados e as coordenadas geográficas foram organizados no programa ArcGis 9.3, foi definida uma largura de banda de 50 metros e grade regular composta de 5 x 5 células. RESULTADOS: Associações das cargas parasitárias leve e pesada foram significativas para todos os sintomas da asma (p<0,05). Associações significativas também foram encontradas entre infectados com gênero, escolaridade materna e media de idade; e entre infectados e asmáticos com a faixa etária, renda familiar, média de idade e portadores da co infecção A. lumbricoides e T. trichiura (p<0,05). A análise de Kernel da associação da infecção por A. lumbricoides com a asma, mostrou que não existe homogeneidade na distribuição dos casos, e os clusters tendem a se concentrar nas áreas mais altas do bairro, relativamente distantes da vala de esgoto a céu aberto que atravessa o bairro. A utilização da regressão logística permitiu identificar as variáveis preditoras da asma. CONCLUSÃO: A carga parasitária leve da infecção por A. lumbricoides se apresentou como fator de proteção para a asma e mascara seus sintomas enquanto a carga parasitária alta, caracterizada como fator de risco, evidencia seus sintomas. As análises de Kernel (densidade e razão de risco) indicaram os locais de maior risco da contaminação por A. lumbricoides, e a regressão logística identificou as variáveis independentes estatisticamente significantes para os riscos de asma. / Salvador

Made available in DSpace on 2011-05-04T12:42:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010 / Ascaris lumbricoides e Trichuris trichiura são os helmintos intestinais de maior prevalência na população mundial e também no material arqueológico. Porém, na América do Sul pré-colombiana, o encontro de ovos de A. lumbricoides é raro. Recentemente um estudo de diagnóstico paleoparasitológico molecular apontou para um sub-diagnóstico de Ascaris sp. na América do Sul. No registro arqueológico de parasitos intestinais predominam achados de ovos de Trichuris sp. ao invés de Ascaris sp. Isto parece contraditório, em virtude do número de ovos eliminados por cada parasito. Os objetivos desta pesquisa foram: avaliar marcadores moleculares para o diagnóstico de Ascaris sp. e Trichuris sp. em material moderno pela caracterização molecular destes parasitos; caracterizar geneticamente isolados de sítios arqueológicos sul americanos para verificar a real paleodistribuição destes parasitos em uma perspectiva paleoepidemiológica e compará-la com a epidemiologia moderna destas infecções; avaliar os fatores envolvidos na paleodistribuição encontrada. As amostras foram submetidas ao diagnóstico por microscopia óptica, seguida da extração do DNA, PCR e sequenciamento nucleotídico. Na avaliação dos marcadores moleculares, a região ITS1 de Ascaris sp. apresentou variação intra-indivíduo, o que descartou seu uso com fins taxonômicos e diagnósticos. A caracterização molecular dos genes mitocondriais cox1 e nad1 de Ascaris sp. mostrou infecção cruzada de genótipos entre as espécies humana e suína, o que denota a necessidade de monitoramento das populações avaliadas assim como de outras regiões brasileiras para que a infecção não venha a se tornar uma zoonose em potencial no Brasil. Foi possível o diagnóstico molecular de Trichuris sp. pelo gene ribossomal 18S DNA. A análise paleogenética mostrou que há subdiagnóstico para ambas as infecções na América do Sul pré-colombiana. Este é o primeiro diagnóstico paleoparasitológico molecular de T. trichiura em material sul americano. Estes são também os primeiros registros de recuperação de DNA de parasitos intestinais em material de sítio arqueológico do tipo “sambaqui” e também do período colonial brasileiro. Comparando-se a paleoepidemiologia molecular de Ascaris sp. com a epidemiologia molecular moderna foi possível notar que há haplótipos antigos que ainda estão presentes hoje, no entanto a maioria dos haplótipos é característica ao material arqueológico. Observou-se que há haplótipos comuns ao Velho e Novo Mundo, contudo, há também especificidades regionais. Os resultados da análise genética claramente apontam para uma pobre preservação dos ovos no material arqueológico, principalmente de Ascaris sp. Os fatores principais envolvidos nessa paleodistribuição, seriam fatores tafonômicos que proporcionaram a quebra maior de ovos de Ascaris sp. do que de Trichuris sp., e evidências de consumo de plantas vermífugas pelos povos pré-históricos, as quais teriam maior ação sobre Ascaris sp. do que Trichuris sp. / Ascaris lumbricoides and Trichuris trichiura are the intestinal helminths with higher prevalence in the world today as it was in the past. However, in pre-Columbian South America the findings of A. lumbricoides eggs are rare. Recently a study of paleoparasitological molecular diagnosis showed a sub-diagnosis of Ascaris sp. in South America. In the archeological material, eggs of Trichuris sp. are more common compared with Ascaris sp. eggs. This is contradictory taking into account the number of eggs eliminated by each parasite. The aims of this research was: to evaluate molecular markers for Ascaris sp. and Trichuris sp. diagnosis in modern material; genetic characterization of the samples South American archeological sites aiming the paleodistribution of these parasites in a paleoepidemiological perspective; compare results with the modern epidemiology of these infections; evaluate the factors involved in paleodistribution. Extraction of DNA, PCR and nucleotide sequencing were performed after microscopy. In the evaluation of the molecular markers Ascaris sp. ITS1 region showed intra-individual variation. Therefore, this region to taxonomical and diagnoses studies was discarded. With the molecular characterization of Ascaris sp. cox1 and nad1 mitochondrial genes it was possible to identify cross infection of genotypes between human and pig hosts. Results showed that surveillance field works in modern populations are necessary to verify the zoonotic potential of this infection in Brazil. The molecular diagnosis of Trichuris sp. by ribossomal 18S DNA gene was possible. The paleogenetic analysis showed that there is subdiagnosis for both infections in pre-Columbian South America. This is the first paleoparasitological molecular record of T. trichiura in South American samples. These are also the first recovery of DNA of intestinal parasites in "sambaqui" archeological site, and also of the Brazilian colonial period. Molecular paleoepidemiology of Ascaris sp. infection compared with modern molecular epidemiology showed that there are ancient haplotypes still present today. However, most of the haplotypes are characteristic of the archaeological material. It was observed that there are common haplotypes both to the Old World and to the New World, but showing regional specificities. The results of the genetic analysis clearly pointed to a poor preservation of eggs in archeological material, mainly of Ascaris sp. Taphonomy may be the main factor involved in paleodistribution, breaking more eggs of Ascaris sp. than Trichuris sp. Evidences of consumption of vermifuge plants by prehistoric groups should also have influence, as some plants should have more efficacy eliminating Ascaris sp. than Trichuris sp.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:13:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EdnaMAS_TESE.pdf: 813256 bytes, checksum: 6c2788ba74c72a29680a0f392ee49282 (MD5) Previous issue date: 2013-08-20 / Universidade Federal do Rio Grande do Norte / Este trabalho objetivou estudar a imunoglobulina E total e espec?fica para A. lumbricoides e eosin?filos em crian?as de ?rea end?mica, a fim de avaliar a resposta imune do tipo Th2 e relacionar os dados obtidos com a idade, sexo e intensidade da infec??o numa popula??o formada por 205 crian?as com faixa et?ria de 1 a 10 anos, de ambos os sexos e baixo n?vel socioecon?mico. Foram analisadas amostras fecais das crian?as, pelos m?todos de Blagg e Cols. e Kato-katz, determinadas as dosagens s?ricas de IgE total, IgE espec?fica para A. lumbricoides, pelo m?todo ImmunoCAP e realizada a contagem relativa de eosin?filos no sangue perif?rico. Os resultados revelaram uma ocorr?ncia de 182 (88,8 %) para enteroparasitas, 168 (81,9%) para helmintos intestinais e 140 (68,3%) para A. lumbricoides. A mediana dos n?veis s?ricos de IgE total e espec?fica e o n?mero de eosin?filos se apresentaram acima dos valores de refer?ncia padr?o (mediana 480 kU/L, 0,74 kU/L e 8 %). Ocorreu uma diferen?a significante nos n?veis de IgE total, IgE espec?fica e no n?mero de eosin?filos entre as crian?as parasitadas por A. lumbricoides e as n?o parasitadas (p = 0,02; <0,01; < 0,03), no entanto, estes, n?o apresentaram diferen?a significativa com a idade e sexos das crian?as e intensidade da infec??o.Houve uma correla??o positiva entre os n?veis de IgE total e IgE espec?fica (r = 0,55). Conclu?mos, portanto, que a infec??o por enteroparasitas, em especial para o A. lumbricoides, induziu uma resposta imune do tipo Th2 com produ??o de IgE total e espec?fica e eosin?filos nas crian?as infectadas

Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-06T17:10:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-dissertação-WhevertonRicardoCorreiaNascimento.pdf: 4035736 bytes, checksum: f33cf235cb56b67d16c3e819dbebb2a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T17:10:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-dissertação-WhevertonRicardoCorreiaNascimento.pdf: 4035736 bytes, checksum: f33cf235cb56b67d16c3e819dbebb2a1 (MD5) Previous issue date: 2012-03-02 / O extrato de vermes adultos de Ascaris suum (Asc) possui atividade imunossupressora em modelos vacinais, de asma alérgica e doenças auto-imunes. Neste estudo, foi verificado o efeito da administração do Asc, profilática ou terapêutica, no modelo de hepatite induzida por Com A (HAI). Para isto, camundongos BALB/c, receberam ConA, i.v., (20mg/kg corpóreo) e três grupos de animais foram formados (n=6). 1)HAI: recebeu apenas ConA; 2)Protocolo profilático HAI+Asc: tratados com Asc (1mg/mL), i.p., 30 minutos antes da indução da HAI; 3)protocolo terapêutico HAI+Asc: tratados com Asc 2 horas após indução da HAI. Como grupo controle animais receberam apenas PBS. Foram dosados transaminases e imunoglobulinas totais séricas, 8, 24 horas e 7 dias após tratamento. Cultivou-se esplenócitos estimulados com Asc e ConA. Níveis de IL-4, IL-10, IL-13 e IFN-γ dos sobrenadantes foram dosados por ELISA. Os fígados foram pesados e analisados histologicamente (hematoxilina-eosina e Tricômico de Masson). No grupo HAI, ocorreu aumento no peso do fígado, dos níveis de transaminases e Imunoglobulinas totais. Estes parâmetros foram reduzidos nas 8, 24 horas e 7º dia no grupo profilático, enquanto no terapêutico apenas no 7º dia.Em ambos os tratamento houve aumento de IL-4, IL-10 e IL-13. No grupo profilático, houve redução do infiltrado celular e aumento da fibrose hepática. A administração profilática do Asc preveniu, e a terapêutica reduziu o dano hepatocelular da lesão. Ambas estimularam a fibrose hepática a longo prazo, pela possível ação da IL-13. Desta forma, o Asc teria eficiência mais acentuada na fase inicial da doença hepática. / The extract of adult Ascaris suum worms (Asc) has immunosuppressive activity in vaccine models, allergic asthma and autoimmune diseases. This study evaluated the prophylactic or therapeutic effect of administration of the Asc in a mouse model of Concanavalin A (Con A)-induced hepatitis. For this, BALB/c mice received ConA, i.v., (20mg/kg) and three groups of animals were formed (n=6). 1) IAH: received only ConA; 2) AIH+Asc prophylactic: treated with Asc (1mg/mL), i.p., 30 minutes before induction of the AIH; 3) AIH+Asc therapeutic: treated with Asc two hours after induction of AIH. The control group of animals received only PBS. Were measured transaminases and total immunoglobulins, in serum, 8, 24 hours and 7 days after treatment. Was cultivated splenocytes stimulated with ConA and Asc. IL-4, IL-10, IL-13 and IFN-γ were assayed in the supernatants by ELISA. The livers were weighed and examined histologically (hematoxylin-eosin and Masson’s trichrome). In the AIH group, there was an increase in liver weight, transaminase levels and total immunoglobulins. These parameters were reduced in 8, 24 hours and 7 days in the prophylactic group, while the therapeutic treatment only on day 7. In both treatments increased IL-4, IL-10 and IL-13. In the prophylactic group, decreased cellular infiltration and increased liver fibrosis. The prophylactic administration of Asc prevented, and treatment reduced the damage of hepatocellular injury. Both stimulated liver fibrosis in long term by IL-13 action. Thus, the efficiency of Asc would more pronounced in the initial stage of liver disease.

The isotope partitioning studies of the Ascaris suum NAD-malic enzyme reaction were examined with five transitory complexes including E:NAD, E:NAD:Mg, E:malate, E:Mg:malate, and E:NAD:malate. Three productive complexes, E:NAD, E:NAD:Mg, and E:Mg:malate, were obtained, suggesting a steady-state random mechanism. Data for trapping with E:14C-NAD indicate a rapid equilibrium addition of Mg2+ prior to the addition of malate. Trapping with 14C-malate could only be obtained from the E:Mg2+:14C-malate complex, while no trapping from E:14C-malate was obtained under feasible experimental conditions. Most likely, E:malate is non-productive, as has been suggested from the kinetic analysis. The experiment with E:NAD:malate could not be carried out due to the turnover of trace amounts of malate dehydrogenase in the pulse solution. The equations for the isotope partitioning studies varying two substrates in the chase solution in an ordered terreactant reaction were derived, allowing a determination of the relative rates of substrate dissociation to the catalytic reaction for each of the productive transitory complexes. NAD and malate are released from the central complex at an identical rate, equal to the catalytic rate.

Dissociation constants for alternate dirmcleotide substrates and competitive inhibitors suggest that the dinucleotide binding site of the Ascaris suum NAD-malic enzyme is hydrophobic in the vicinity of the nicotinamide ring. Changes in the divalent metal ion activator from Mg^2+ to Mn^2+ or Cd^2+ results in a decrease in the dinucleotide affinity and an increase in the affinity for malate. Primary deuterium and 13-C isotope effects obtained with the different metal ions suggest either a change in the transition state structure for the hydride transfer or decarboxylation steps or both. Deuterium isotope effects are finite whether reactants are maintained at saturating or limiting concentrations with all the metal ions and dinucleotide substrates used. With Cd^2+ as the divalent metal ion, inactivation of the enzyme occurs whether enzyme alone is present or is turning over. Upon inactivation only Cd^2+ ions are bound to the enzyme which becomes denatured. Modification of the enzyme to give an SCN-enzyme decreases the ability of Cd^2+ to cause inactivation. The modified enzyme generally exhibits increases in K_NAD and K_i_metai and decreases in V_max as the metal size increases from Mg^2+ to Mn^2+ or Cd^2+, indicative of crowding in the site. In all cases, affinity for malate greatly decreases, suggesting that malate does not bind optimally to the modified enzyme. For the native enzyme, primary deuterium isotope effects increase with a concomitant decrease in the 13-C effects when NAD is replaced by an alternate dinucleotide substrate different in redox potential. This suggests that when the alternate dinucleotides are used, a switch in the rate limitation of the chemical steps occurs with hydride transfer more rate limiting than decarboxylation. Deuteration of malate decreases the 13-C effect with NAD for the native enzyme, but an increase in 13-C effect is obtained with alternate dinucleotides. These suggest the presence of a secondary 13-C effect in the hydride transfer step. This phenomenon is also applicable to the modified enzyme with NAD as the substrate.

No description available.