Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The cardini group is part of the genus Drosophila and has its geographical distribution in the Neotropics. Some previous studies revealed the high variability in species of this group of flies. Transposable elements are recognized as capable of high potential for generation of genetic variability in the genomes of the organisms where they are present. Considering such assumptions, the present study has the objective to contribute with the molecular, ecological e evolutionary studies of the transposable elements in the cardini group of Drosophila and in the Drosophilidae family, to such, identifying the presence/absence and the patterns of distribution of the retroelements micropia and gypsy in sixteen natural populations of: Drosophila cardinoides (02), D. neocardini (05) and D. polymorpha (09) in the Brazilian States of Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Aiming to identify the presence of the retroelement micropia in the genome of these populations, a fragment isolated from the genome of D. hydei was used as probe. We verified that all populations here studied of the cardini group of Drosophila present strong signal of hybridization, indicating that possibly they have sequences very similar to the probe used in their genomes. The analysis of a part of the micropia s reverse transcriptase sequence by the PCR technique shows that almost all the populations have sequences highly similar to the primers used, showing the expected fragment of 812pb. Although the populations of D. polymorpha presented a fragment slightly smaller than those from D. neocardini and D. cardinoides showing differences at the nucleotide level between the sequences. In the analyze of the presence of gypsy element isolated from D. melanogaster s genome, it was observed that all studied populations have DNA sequence homologies with the probe used. Drosophila cardinoides presented six to seven hybridization bands visible in the blots, D. neocardini presented four to five bands and D. polymorpha presented only one or two bands. When the probe used was a part of the env gene of the element gypsy isolated of D. polymorpha, the populations of D. polymorpha present a sole band in the blots, the populations of D. neocardini present three bands, and the populations of D. cardinoides only present very weak bands, but under exposition by a higher time, three to four bands appeared. From all populations of D. neocardini it was obtained bands with very faint signals. When hybridized with this second probe, indicating high nucleotide divergence between the probe isolated from D. polymorpha and the sequences present in the genome of D. neocardini. For all three probes used in this study: gypsy isolated from D. melanogaster, part of the gene env isolated of the element gypsy from D. polymorpha, and the element micropia isolated from D. hydei, we verified the existence of variability in the banding patterns revealed by Southern Blot between the species. For micropia, this variability was verified among the different populations of the same species. / O grupo cardini faz parte do gênero Drosophila e tem sua distribuição descrita para a região dos Neotrópicos. Alguns estudos foram realizados com espécies deste grupo evidenciando a alta variabilidade encontrada nestas moscas. Por sua vez, os elementos de transposição possuem grande potencial para geração de variabilidade genética nos organismos em que estão presentes. Considerando estas afirmativas, este trabalho tem o objetivo de contribuir com os estudos moleculares, ecológicos e evolutivos dos elementos de transposição no grupo cardini e na família Drosophilidae; portanto, identificando a presença/ausência e analisando o padrão de distribuição dos retroelementos micropia e gypsy em dezesseis populações naturais de: Drosophila cardinoides (02), D. neocardini (05) e D. polymorpha (09) distribuídas nos Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Visando a busca por seqüências similares ao retroelemento micropia no genoma das populações, foi utilizado como sonda o elemento isolado de D. hydei. Verificou-se que o DNA de todas as populações analisadas apresentam forte sinal de hibridação, indicando que possivelmente as populações possuem seqüências muito similares à seqüência utilizada como sonda. A análise de parte da seqüência da transcriptase reversa do elemento micropia, através da técnica de PCR, nos indicou que todas as populações apresentam seqüências altamente similares ao par de primers utilizados, entretanto as populações de D. polymorpha aparentemente possuem seqüências ligeiramente inferiores ao tamanho esperado de 812pb, indicando que existem diferenças ao nível nucleotídico entre as seqüências presentes nas três espécies. Na análise de presença de seqüências similares ao elemento gypsy isolado de D. melanogaster foi verificado que todas as populações apresentam seqüências que hibridaram com a sonda utilizada. Drosophila cardinoides apresentou de seis a sete bandas visíveis nos blots, D. neocardini apresentou de quatro a cinco bandas e D. polymorpha apresentou de uma a duas bandas. Quando foi utilizada a sonda referente à parte do gene env do elemento gypsy isolado de D. polymorpha, as populações de D. polymorpha apresentaram uma única banda nos blots, as populações de D. neocardini apresentaram três bandas e as populações de D. cardinoides apresentaram bandas muito fracas, mas utilizando maior tempo de exposição dos blots, as populações desta espécie mostraram ter de três a quatro bandas. De todas as populações de D. neocardini, foram obtidas bandas com sinais muito fracos quando hibridados com esta segunda sonda, o que indica um alto grau de divergência nucleotídica entre a sonda isolada de D. polymorpha e as seqüências existentes em D. neocardini. Para as três sondas utilizadas neste trabalho: gypsy isolado de D. melanogaster, parte do gene env isolado do elemento gypsy de D. polymorpha e o elemento micropia isolado de D. hydei, verificamos a existência de variabilidade no padrão de bandas apresentado pelas diferentes populações. Para o elemento micropia verificamos também a existência de variabilidade no padrão de bandas entre as diferentes populações de mesma espécie.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ArthurAM.pdf: 2987872 bytes, checksum: eabe4d351ac5cc34dc00a074b5ff8d39 (MD5) Previous issue date: 2007-12-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Sea urchins are common benthic organisms on coastal ecosystems of tropical and temperate shallow waters. The impact of sea urchins populations in shore communities is density-dependent, and therefore, knowledge of the life history of these animals is important to understand these interactions. Between 2000 and 2005 a population boom of Tripneustes ventricosus was observed in the Fernando de Noronha Archipelago. In 2004 a research program was started to monitor the population dynamics of T. ventricosus in the archipelago, when it noted a lack of basic information on the biology and reproduction of this species, despite its broad geographic distribution and economic importance in parts of its occurrence. In this context, this work focuses on the reproductive biology of T. ventricosus with emphasis on the description of the gametogenic stages. Between December 2006 and July 2007, ten urchins were collected by snorkeling in two sites of the archipelago, totaling 120 individuals. Gametogenic stages were described for both sexes through microscopic analysis, and were defined as: Recovery, Growing, Premature, Mature and Spawning. Results showed increasing in Gonad index throughout of months of sampling and suggest that the reproductive cycle of the species in the archipelago is annual / Os ouri?os-do-mar s?o conhecidos organismos bent?nicos dos ecossistemas costeiros de ?guas rasas das regi?es tropicais e temperadas. O impacto das popula??es de ouri?os em algumas comunidades ? dependente da sua densidade e o conhecimento da hist?ria de vida destes animais ? importante para compreender a ecologia destas intera??es. Entre 2000 a 2005 ocorreu uma expans?o em algumas popula??es de Tripneustes ventricosus no Arquip?lago de Fernando de Noronha. Em 2004 foi iniciado um programa de monitoramento da din?mica populacional da esp?cie no local, quando foi constatada a escassez de informa??es b?sicas sobre a biologia e a reprodu??o da mesma, apesar de sua ampla distribui??o geogr?fica e import?ncia econ?mica em partes de sua ?rea de ocorr?ncia. Nesse contexto, o presente trabalho enfoca a biologia reprodutiva de T. ventricosus, com ?nfase na descri??o dos est?gios gametog?nicos. Entre os meses de dezembro de 2006 e julho de 2007 foram coletados 10 ouri?os atrav?s de mergulho em apn?ia em duas localidades do arquip?lago, totalizando 120 indiv?duos. Os est?gios gametog?nicos para ambos os sexos foram determinados atrav?s de an?lises microsc?picas e definidos como: Reserva, Prolifera??o, Em Matura??o, Matura??o M?xima e Emiss?o de Gametas. Os resultados mostraram um crescimento no ?ndice gonadal ao longo dos meses de coletas e sugerem que o ciclo reprodutivo da esp?cie no local seja anual

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:18:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ThayseAS.pdf: 421769 bytes, checksum: da81d1c89c2fb11516509aaaad4a2595 (MD5) Previous issue date: 2008-04-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Despite advances in vaccine development and therapy, bacterial meningitis (BM) remains a major cause of death and long-term neurological disabilities. As part of the host inflammatory response to the invading pathogen, factors such as reactive oxygen species are generated, which may damage DNA and trigger the overactivation of DNA repair mechanisms. It is conceivable that the individual susceptibility and outcome of BM may be in part determined by non synonymous polymorphisms that may alter the function of crucial BER DNA repair enzymes as PARP-1, OGG-1 and APE-1. These enzymes, in addition to their important DNA repair function, also perform role of inflammatory regulators. In this work was investigated the non synonymous SNPs APE-1 Asn148Glu, OGG-1 Ser326Cys,PARP-1 Val762Ala, PARP-1 Pro882Leu and PARP-1 Cys908Tyr in patients with bacterial meningitis (BM), chronic meningitis (CM), aseptic meningitis (AM) and not infected (controls). As results we found increased frequency of variant alleles of PARP-1 Val762Ala (P = 0.005) and APE-1 Asn148Glu (P=0.018) in BM patients, APE-1 Asn148Glu in AM patients (P = 0.012) and decrease in the frequency of the variant allele OGG-1 Ser326Cys in patients with CM (P = 0.013), regarding the allelic frequencies in the controls. A major incidence of individuals heterozygous and/ or polymorphic homozygous in BM for PARP-1 Val762Ala (P= 0.0399, OD 4.2, 95% IC 1.213 -14.545) and PARP-1 Val762Ala/ APE-1 Asn148Glu (P = 0.0238, OD 11.111, 95% IC 1.274 - 96.914) was observed related to what was expected in a not infected population. It was also observed a major incidence of combined SNPs in the BM patients compared with the control group (P=0.0281), giving evidences that SNPs can cause some susceptibility to the disease. This combined effect of SNPs seems to regulate the principal cytokines and other factors related to BM inflammatory response and point the importance of DNA repair not only to repair activity when DNA is damaged, but to others essential functions to human organism balance. / Apesar dos avan?os no desenvolvimento de vacinas e terapias, a meningite bacteriana (MB) continua sendo uma das principais causas de morte e seq?elas neurol?gicas causadas por uma doen?a infecciosa. Como parte da resposta inflamat?ria ao pat?geno invasor, fatores como esp?cies reativas de oxig?nio (ROS) s?o geradas, podendo causar danos no DNA e ativar seus mecanismos de repara??o. ? poss?vel que a susceptibilidade individual do hospedeiro ? MB possa ser em parte determinada por polimorfismos n?o-sin?nimos (SNPs) que possivelmente alterem a fun??o de enzimas de reparo de DNA da via BER como PARP-1, OGG-1 e APE-1. Estas enzimas, al?m da importante fun??o na corre??o de danos no DNA, tamb?m desempenham papel de reguladores inflamat?rios. Neste trabalho foram investigados os SNPs n?o-sin?nimos APE-1 Asn148Glu, OGG-1 Ser326Cys, PARP-1 Val762Ala, PARP-1 Pro882Leu e PARP-1 Cys908Tyr em pacientes com meningite bacteriana (MB), meningite cr?nica (MC), meningite ass?ptica (MA) e n?o infectados (controles). Como resultado, foi encontrado um aumento na freq??ncia dos alelos variantes de PARP-1 Val762Ala (P = 0.005) e APE-1 Asn148Glu (P=0.018) em pacientes com MB, de APE-1 Asn148Glu em pacientes com MA (P = 0.012) e diminui??o da freq??ncia do alelo variante OGG1 Ser326Cys (P = 0.013) em pacientes com MC em rela??o ?s freq??ncias al?licas observada nos controles para estes polimorfismos. Foi observado um maior n?mero de indiv?duos heterozigotos e/ou homozigotos polim?rficos para os gen?tipos polim?rficos PARP-1 Val762Ala (P= 0.0399, OD 4.2, 95% IC 1.213 -14.545) e PARP-1 Val762Ala/ APE-1 Asn148Glu (P = 0.0238, OD 11.111, 95% IC 1.274 - 96.914) no grupo MB em rela??o ao que se era esperado dentro de uma popula??o n?o-infectada. Observou-se tamb?m uma maior incid?ncia de SNPs combinados em pacientes com MB quando comparado ao grupo controle. Estas rela??es trazem evid?ncias de que os SNPs analisados causam alguma susceptibilidade ? doen?a. O efeito combinado destes SNPs parece influenciar a regula??o das principais citocinas e de outros fatores relacionados com a resposta inflamat?ria a MB, mostrando a import?ncia da ativa??o de enzimas de reparo de DNA n?o somente quando o DNA ? danificado, mas para outras fun??es essenciais ao equil?brio do organismo humano.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:36:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LuciaMA.pdf: 2203138 bytes, checksum: 48fa4ac1bb0ac072b45eeaff0535e06e (MD5) Previous issue date: 2008-02-15 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The knowledge of Anastrepha zenildae behavioral aspects combined with the biology of Tephritidae may contribute to monitoring and control programs of this fruit fly that is considered as economically important to the Rio Grande do Norte state. In order to characterize the daily activity profile of this species, we studied the behaviors of resting, locomotion, feeding, cleaning, courtship, copulation and oviposition of animals submitted to an artificial 12:12h light-dark cycle (750:1lux) with controlled temperature (26?2 ?C). The observations were made with groups of 16 males and 16 females during 3 consecutive days each generation from parental to F5. Resting, locomotion, feeding and cleaning data were recorded as frequency and time of occurrence by scanning technique in 15 minutes windows per hour, with a record each minute. Courtship, copulation and oviposition were recorded as frequency, time of occurrence and duration by al occurrences technique. Resting was the most frequent behavior with males resting more than females. Locomotion was more evident in the first half of the ligh phase with higher values in females. Cleaning and feeding behaviors were more frequent in the second half of the light phase for both sexes with females eating more frequently than males. During the courtship, males were grouped in lek formations showing wings vibration and pheromone liberation. Courtship occurred more frequently 4 to 7 h after lights on (81,9%) with copulations being more frequent 6 h after lights on with a mean duration of 58,1?40,4 min. Copulation attempts were observed in males inside and outside the lek with aggressive behavior being observed only between males in the lek. Oviposition behavior was similar to that described for other species of the genus with a peak of this activity 2-3 h after the lights on, mean duration of 43, 7?34, 8 sec and 2 to 5 eggs by event. According to the results, sexual behavior of A. zenildae is temporally different of other sympatric species of the genus, being favorable to the reproductive isolation as well as the use of resources as oviposition substrate. / O estudo dos aspectos comportamentais de Anastrepha zenildae associados aos aspectos da biologia geral dos tefrit?deos, pode favorecer os programas de monitoramento e controle dessa mosca-da-fruta de import?ncia econ?mica e bastante presente no estado do Rio Grande do Norte. Para caracterizar o perfil da atividade di?ria de A. zenildae foram estudados os comportamentos de descanso, locomo??o, alimenta??o, limpeza, corte, c?pula e oviposi??o de animais mantidos em ciclo claro/escuro 12:12h (750:<1 lux), com temperatura controlada (26?2 ?C). As observa??es foram feitas em grupos de 16 machos e 16 f?meas por gera??o (parental a F5) durante tr?s dias consecutivos para cada gera??o, sendo registrado freq??ncia e hor?rio de ocorr?ncia utilizando t?cnica varredura, em janelas de 15 minutos a cada hora com registro a cada minuto. Os comportamentos de corte, c?pula e oviposi??o foram observados pela t?cnica de todas as ocorr?ncias , registrando-se freq??ncia, hor?rio e dura??o. O descanso foi mais freq?ente e os machos descansaram mais que as f?meas. A locomo??o foi mais evidente na primeira metade da fase de claro e as f?meas se locomoveram mais que os machos. Os comportamentos de limpeza e alimenta??o foram mais freq?entes na segunda metade da fase de claro em ambos os sexos, com as f?meas alimentando-se mais que os machos. Os machos agruparam-se em leks com comportamento de corte caracterizado pela vibra??o de asa e libera??o de ferom?nio. A corte ocorreu com maior freq??ncia 4 a 7 horas ap?s o acender das luzes (81,9%) e a c?pula 6 horas ap?s acender das luzes. O tempo m?dio de c?pula foi de 58,1?40,4 min, com tentativas de c?pula dentro e fora do lek e comportamento agressivo entre os machos no lek. O comportamento de oviposi??o foi similar ao descrito para outras esp?cies do g?nero, com pico entre 2 e 3 horas ap?s o acender das luzes e dura??o m?dia de 43,7?34,8 segundos e tamanho da postura variando de 2 a 5 ovos. De acordo com resultados, o comportamento sexual em A. zenildae difere temporalmente de outras esp?cies simp?tricas do g?nero, favorecendo o isolamento reprodutivo, bem como a utiliza??o de recursos como substrato para oviposi??o.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:37:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaKML_DISSERT.pdf: 1298335 bytes, checksum: bc9f128ee5227ddc8396096c88563b9d (MD5) Previous issue date: 2010-09-30 / In most primates, the mother is primarily responsible for care in early life of the infants, since, as in other mammals, infants depend on their mother to nutritional conditions. However, unlike most of them, in some species, infants are also dependent on other individuals with respect to transportation, supervision, and food sharing. To understand the distribution of care to offspring is essential to understand the social dynamics of the group. Several studies conducted in the natural environment, during the infant have been studied mainly through the careful transport of the infants. Our study approached the different forms of care to infants (transport, supervision and food sharing) and the development of behavioral repertoire throughout all phases of infant and juvenile seeking to better understand how to establish the development and survival of offspring of Callithrix jacchus, in natural environment. The seasonality in the caatinga was striking in this study and the collection had two distinct seasons for each of the sets observed, one dry and one rainy. These environmental changes seem to have influenced the distribution of activities in animal development. Yet the greater availability of resources in the rainy season seems to have been the main factor influencing the pattern of activities. Results will be presented in two manuscripts / Na maioria dos primatas, a m?e ? o principal respons?vel pelo cuidado no princ?pio de vida dos filhotes, uma vez que, como nos demais mam?feros, os infantes dependem da sua m?e para o provimento nutricional. Por?m, ao contr?rio de grande parte deles, em algumas esp?cies, os infantes tamb?m s?o dependentes de outros indiv?duos com rela??o ao transporte, supervis?o e partilha de alimento. Para se compreender a distribui??o do cuidado ? prole ? fundamental conhecer a din?mica social do grupo. V?rios trabalhos realizados no ambiente natural, na fase de infante t?m estudado, principalmente, o cuidado atrav?s do transporte dos filhotes. No nosso estudo foram abordadas as diferentes formas de cuidado aos infantes (transporte, supervis?o e partilha de alimento) e o desenvolvimento do repert?rio comportamental ao longo das fases infantil e juvenil buscando compreender melhor como se estabelece o desenvolvimento e a sobreviv?ncia dos filhotes de Callithrix jacchus, em ambiente natural. A sazonalidade na caatinga foi marcante nesse estudo e as coletas tiveram duas esta??es distintas para cada uma das proles observadas, uma seca e outra chuvosa. Essas varia??es ambientais parecem ter influenciado a distribui??o de atividades dos animais em desenvolvimento. Mesmo assim a maior disponibilidade de recursos na esta??o chuvosa n?o parece ter sido o fator de maior influencia no padr?o de atividades. Os Resultados s?o apresentados em 2 manuscritos

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:37:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JenifferCM_DISSERT.pdf: 926553 bytes, checksum: 802fba8946218d778ebe9345c0c66294 (MD5) Previous issue date: 2012-03-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / In order to characterize the seasonal and daily rhythm of Dinoponera quadriceps foraging activity in natural environment, four colonies of D. quadriceps were observed in an area of secondary Atlantic forest in northeastern Brazil. Data collection was performed during 72 hours every three months during an annual cycle. Colonies of D. quadriceps exhibited seasonal variation in foraging activity, peaking in the early dry season, followed by a sudden decline at the end of this season and increasing again at the late rainy season. The seasonal rhythm of foraging was positively related to the duration of the daylight and luminosity, and negatively to the time of sunrise and rainfall. Regarding the daily rhythm, foraging activity was predominantly diurnal independent of season. At the early dry season, the colonies had two activity peaks, one in the morning and another in the afternoon, with a decrease in foraging at midday, while in the rest of the year foraging activity was distributed more evenly throughout the daylight. The daily rhythm of foraging activity had a stronger and positive relation with light intensity. The second most important factor determining the daily rhythm of foraging was temperature that was also positively related for most of the year. Relative humidity showed a weak and negative relation with the daily rhythm of foraging in just one month of observation / A fim de caracterizar o ritmo sazonal e di?rio da atividade de forrageio de Dinoponera quadriceps em ambiente natural, foram observadas quatro col?nias de D. quadriceps em ?rea de mata atl?ntica secund?ria no nordeste do Brasil. A coleta de dados foi realizada durante 72 horas ininterruptas a cada tr?s meses, durante um ciclo anual. As col?nias de D. quadriceps exibiram varia??o sazonal da atividade de forrageio, com pico no in?cio da esta??o seca, seguido por uma queda brusca no final dessa esta??o e tendendo a aumentar novamente no final da esta??o chuvosa. O ritmo sazonal de forrageio foi relacionado positivamente ? dura??o da fase clara e ? luminosidade, e negativamente ao hor?rio de nascer do sol e ? pluviosidade. Em rela??o ao ritmo di?rio, a atividade de forrageio foi predominantemente diurna independente da esta??o do ano. No in?cio da esta??o seca, as col?nias tiveram dois picos de atividade, um pela manh? e outro ? tarde, com diminui??o do forrageio no meio do dia, enquanto que no resto do ano a atividade de forrageio foi distribu?da de forma mais uniforme ao longo da fase clara. O ritmo di?rio da atividade de forrageio foi relacionado mais fortemente e de forma positiva ? luminosidade. O segundo fator mais importante na determina??o do ritmo di?rio de forrageio foi a temperatura, tamb?m relacionada positivamente durante a maior parte do ano. Por ?ltimo, a umidade apresentou uma rela??o fraca e negativa com o ritmo di?rio de forrageio em apenas um m?s de observa??o

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-11-10T16:56:23Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Hugo Henrique Pádua de Oliveira- 2012.pdf: 1742065 bytes, checksum: 7bac69420ca8a041766ecff769ec955c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-11-10T20:01:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Hugo Henrique Pádua de Oliveira- 2012.pdf: 1742065 bytes, checksum: 7bac69420ca8a041766ecff769ec955c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-10T20:01:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Hugo Henrique Pádua de Oliveira- 2012.pdf: 1742065 bytes, checksum: 7bac69420ca8a041766ecff769ec955c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-06-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The anurans are a group of vertebrates with wide geographical distribution that obtained highly evolutionary success, being part of a lineage descendant of early tetrapods, the first vertebrates to conquer the terrestrial environment. Anurans are divided into two suborders: Archaeobatrachia and Neobatrachia. Within the suborder Neobatrachia there is Bufonoidea superfamily, which includes the three families of higher abundance in the neotropical region: Leptodactylidae, Bufonidae and Hylidae. The aim of this study was to analyze cytogenetically species of the family Hylidae of areas of the Cerrado of Goiás, by the technique of conventional cytogenetics and by silver nitrate staining. The metaphases were obtained directly from cell suspensions of spleen, liver and bone marrow. The slides were stained with Giemsa at 8%, to determine the diploid number and chromosome morphology. The species Hypsiboas multifasciatu and Hypsiboas raniceps presented the diploid number 2n=24 and fundamental number FN=48 with positive marks for NORs in chromosomes 8 and 10 respectively. The species Hypsiboas lundii presented diploid number 2n=24 and fundamental number FN=46 due to the presence of acrocentric chromosome in pair 6. The RONs for this species were identified in pericentromeric regions of short arms of chromosome 5 and in telomeric regions of short arms of chromosome 8. Within the genus Hypsiboas, only the species Hypsiboas albopunctatus presented diploid number 2n=22 and fundamental number FN = 44, and by silver staining technique we identified the presence of NORs on the short arms of the telomeric regions of chromosome pair 8. The species Pseudis bolbodactyla presented diploid number 2n=24 and FN=46 evidenced by the acrocentric pair 4. The species Scinax similis and Scinax constrictus showed different karyotypic notations. The species Scinax similis presented karyotype 2n=24 and FN=48 with methacentric and submethacentric chromosomes. We found for the species Scinax constrictus the karyotype notation 2n=22 and FN=44. Differences in the morphology of chromosomes with respect to literature data can be explained by the different criteria used for classification of the chromosomes. The morphology of some of the chromosomes found in this study differs from their representatives described in the literature, and such differences may be explained by adopting different criteria for the classification of chromosomes. / Os anuros são um grupo de vertebrados de ampla distribuição geográfica que obtiveram um grande sucesso evolutivo, fazendo parte de uma linhagem descendente dos primeiros tetrápodes, os primeiros vertebrados a conquistarem o ambiente terrestre. Os anuros encontram-se divididos em duas subordens: Archaeobatrachia e Neobatrachia. Dentro da subordem Neobatrachia há a superfamília Bufonoidea, que inclui as três famílias de maior abundância na região neotropical: Leptodactylidae, Bufonidae e Hylidae. O objetivo desse estudo foi analisar citogeneticamente espécies da família Hylidae de áreas do cerrado goiano, pela técnica de citogenética convencional e pela coloração por nitrato de prata. As metáfases foram obtidas diretamente a partir de suspensões celulares de baço, fígado e medula óssea. As lâminas foram coradas com Giemsa a 8%, para determinação do número diplóide e morfologia cromossômica. As espécies Hypsiboas multifasciatus e Hypsiboas raniceps apresentaram o número diplóide 2n=24 e número fundamental NF=48 com marcações positivas para as RONs nos pares cromossômicos 8 e 10 respectivamente. Já a espécie Hypsiboas lundii apresentou número diplóide 2n=24 e número fundamental NF=46 devido a presença do cromossomo acrocêntrico no par 6. As RONs para esta espécie foram identificadas em regiões pericentroméricas dos braços curtos do cromossomo 5 e em regiões teloméricas dos braços curtos do cromossomo 8. Dentro do gênero Hypsiboas, apenas a espécie Hypsiboas albopunctatus apresentou número diplóide 2n=22 e o número fundamental NF = 44, sendo que a técnica de coloração por prata identificou a presença de RONs nos braços curtos das regiões teloméricas do par cromossômico 8. A espécie Pseudis bolbodactyla apresentou número diplóide 2n=24 e NF=46 evidenciado pelo par acrocêntrico 4. As espécies do gênero Scinax apresentaram diferentes notações cariotípicas. Scinax similis apresentou cariótipo 2n=24 e NF=48 com os cromossomos metacêntricos e submetacêntricos, enquanto que Scinax constrictus apresentou notação cariotípica 2n=22 e NF=44. A morfologia de alguns dos cromossomos encontrados no presente estudo difere de seus representantes descritos na literatura. As diferenças observadas podem ser explicadas através da adoção de diferentes critérios utilizados para a classificação dos cromossomos.

Piava juveniles (7-13 cm; 25-30 g) were exposed to different NH3 (mg L-1): 0.003 (control), 0.1, 0.3, 0.7, 1.4, and dissolved oxygen levels (mg L-1): 1.0, 2.0, 3.0, 4.0, and 6.0, for 4 days (96h). Na+, K+, Cl-, and NH4 + plasma levels were measured, as well as metabolics and enzyme activity in tissues (liver, kidney, gills, and muscle). The lethal concentration (LC50-96h) for piava was 0.27 (0.21 0.34) mg L-1 NH3, and Na+ and NH4 + plasma levels increased and K+ decreased with the increase of waterborne NH3 levels. Na+, K+ -ATPase activity increased in the gills and decreased in the kidney with the increase of waterborne NH3 levels. Glucose levels in the liver and muscle decreased as waterborne NH3 concentrations raised. NH4 + levels in the tissues presented a positive correlation with waterborne NH3 levels. Na+, Cl-, K+ and NH4 + plasma levels and Na+, K+ -ATPase activity in the gills increased with dissolved oxygen reduction in the water. Glucose levels in the liver and muscle and ammonia in all tissues also increased with the reduction of dissolved oxygen levels in the water, but glycogen levels decreased. Consequently, ammonia is a stressor agent for this species, leading to an accumulation of ammonia in plasma and other tissues. In piava, hypoxia led to physiological changes in both osmoregulatory and metabolic parameters. / Juvenis de piava (7-13 cm; 25-30 g) foram expostas a diferentes níveis de NH3 (em mg L-1): 0,003 ( controle); 0,1; 0,3; 0,7; 1,4, e oxigênio dissolvido: 1,0; 2,0; 3,0; 4,0 e 6,0 mg O2 L-1, por 4 dias (96h). Foram analisados os níveis plasmáticos de Na+,K+, Cl- e NH4 +, bem como metabólicos e enzimas nos tecidos (fígado, rim, brânquias e músculo esquelético). A CL50-96h para a piava foi de 0,27 (0,21 - 0,34) mg L-1 NH3, as concentrações plasmáticas de Na+ e NH4 + aumentaram com a crescente concentração de NH3 na água, já o K+ diminuiu e o Cl- manteve-se estável. A atividade da Na+, K+ -ATPase nas brânquias aumentou com a elevação da concentração de NH3 na água, enquanto que no rim houve redução da atividade. Os níveis de glicose no fígado e músculo reduziram proporcionalmente com o aumento da concentração de NH3. Os níveis de NH4 + nos tecidos tiveram correlação positiva em relação à concentração de NH3 na água. Em piavas expostas a diferentes níveis de oxigênio dissolvido, as concentrações plasmáticas de Na+, Cl-, K+ e NH4 + diminuíram e a atividade da Na+, K+ -ATPase nas brânquias aumentou com a redução do oxigênio na água. Os níveis de glicose no fígado, rim e músculo aumentaram de acordo com a redução do oxigênio dissolvido na água. Porém os níveis de glicogênio reduziram. A concentração de amônia aumentou em todos os tecidos de acordo com a redução do oxigênio dissolvido na água. Na piava, a hipóxia provocou mudanças fisiológicas, tanto na osmorregulação como nos parâmetros metabólicos, após a exposição a diferentes níveis de oxigênio dissolvido. Portanto, o experimento confirmou que a amônia é um agente estressor para o peixe, inclusive em baixas concentrações, causando acumulação de amônia no plasma e em outros tecidos.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-05-30T17:13:22Z No. of bitstreams: 1 DIS_BELISA_AVILA_RODRIGUES_PARCIAL.pdf: 420085 bytes, checksum: 77f9b7ddcd1250899386df6d319c1934 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-30T17:13:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_BELISA_AVILA_RODRIGUES_PARCIAL.pdf: 420085 bytes, checksum: 77f9b7ddcd1250899386df6d319c1934 (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (ACB) are opportunistic pathogens responsible for respiratory tract infections, wound infections, and bacteremia in intensive care units patients. These microorganisms became a problem in health care units due to their ability to acquire and accumulate resistance determinants. They are resistant to important antibiotics commonly used to treat infections caused by them. Thus, this study aimed to determine the antimicrobial susceptibility and detect resistance determinants in clinical ACB isolates. For this, 200 clinical ACB isolates, resistant to carbapenems, were collected from a hospital in Porto Alegre, Brazil. To determine susceptibility to antimicrobial agents, 16 antimicrobials were used in the disk diffusion technique and the minimum inhibitory concentration (MIC) for polymyxin B and meropenem was performed by broth microdilution. Additionally, MIC for polymyxin B in 17 isolates was determined using different methods in comparison with broth microdilution, adopted as reference method. The presence of blaOXA-23, blaOXA-51, blaIMP and blaNDM, as well as class 1 and 2 integrons, were detected by PCR. A total of 82.5% were extremely resistant (XDR) and 17.5% were multidrug resistant (MDR). Forty-six non-susceptibility patterns were found among the isolates, with polymyxins, tetracyclines, and aminoglycosides being the classes with higher rate of susceptibility. When different methods to determining MIC for polymyxin B were evaluated, very major errors and major errors were found in E-test and major errors in agar dilution, as compared with the reference method. The broth microdilution with polysorbate 80 showed a reduction of two or more dilutions in most isolates (82.3%). The blaOXA-23 and blaOXA-51 genes were found in 100% of the isolates, while 49% harbored blaIMP. The blaNDM gene was not found in any isolate. Class 1 and class 2 integrons were found in 68% and 88% of the isolates, respectively. The high percentage of XDR isolates, as well as the detection of important resistance determinants and the high rate of integrons found, reinforce the concern regarding ACB microorganisms and their spread in health care units. / Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (ACB) s?o pat?genos oportunistas respons?veis por infec??es do trato respirat?rio, infec??es de feridas e bacteremia em pacientes internados em unidades de terapia intensiva. Esses microrganismos tornaram-se um problema nas unidades de assist?ncia ? sa?de devido ? sua capacidade de adquirir e acumular determinantes de resist?ncia a antimicrobianos, sendo respons?veis por altas taxas de resist?ncia aos principais antimicrobianos utilizados terapeuticamente. Desta forma, esse estudo teve por objetivo determinar a suscetibilidade a antimicrobianos, assim como detectar determinantes de resist?ncia em isolados cl?nicos de ACB. Para isso, foram utilizados 200 isolados cl?nicos, resistentes aos carbapen?micos, pertencentes ao complexo ACB, coletados de um hospital em Porto Alegre, Brasil, no per?odo de janeiro de 2012 a maio de 2015. Para determinar a suscetibilidade a antimicrobianos, 16 f?rmacos foram utilizados na t?cnica de disco-difus?o, assim como foi determinada a concentra??o inibit?ria m?nima (CIM) para polimixina B e meropenem por meio da t?cnica de microdilui??o em caldo. Adicionalmente, a CIM para polimixina B foi determinada em 17 isolados, empregando diferentes m?todos em compara??o com a microdilui??o em caldo, adotada como refer?ncia. Os genes blaOXA-23, blaOXA-51, blaIMP e blaNDM, bem como os integrons de classe 1 e 2 foram detectados por PCR. Um total de 82,5% dos isolados foram extremely resistant (XDR) e 17,5% foram multidrug resistant (MDR). Quarenta e seis padr?es de n?o-suscetibilidade foram encontrados entre os isolados, sendo que polimixinas, tetraciclinas e aminoglicos?deos foram as classes com maior taxa de suscetibilidade. Na determina??o de CIM para polimixina B com diferentes m?todos, very major errors e major errors foram encontrados em E-test, e major errors em dilui??o em ?gar, quando comparados com o m?todo de refer?ncia. A microdilui??o em caldo suplementado com polissorbato 80 mostrou redu??o de duas ou mais dilui??es na maioria dos isolados (82,3%). Os genes blaOXA-23 e blaOXA-51 foram encontrados em 100% dos isolados, enquanto 49% apresentaram blaIMP. O gene blaNDM n?o foi encontrado nos isolados analisados. Integrons de classe 1 foram encontrados em 68% dos isolados e integrons de classe 2 em 88%. O elevado percentual de isolados XDR, assim como a detec??o de importantes determinantes de resist?ncia e a alta taxa de integrons encontrada, refor?am a preocupa??o com microrganismos do complexo ACB e sua dissemina??o nas unidades de assist?ncia ? sa?de.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-01T14:56:39Z No. of bitstreams: 1 DIS_MAILA_PACHECO_DIAS_COMPLETO.pdf: 1237790 bytes, checksum: 5f0ce43f31e6bb7c9d9d5d922daa8668 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T14:56:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_MAILA_PACHECO_DIAS_COMPLETO.pdf: 1237790 bytes, checksum: 5f0ce43f31e6bb7c9d9d5d922daa8668 (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / Solanum lycopersicum L., tomato, is an herbaceous plant belonging to the Solanaceae family. Its fruits are consumed worldwide, reaching the world production of 160 million tons per year. In Brazil, it is the second vegetable in economic importance. However, the tomato is attacked by numerous diseases that lead to loss of production and /or poor quality of the fruit, such as the hollow stem, the disease caused by Pectobacterium spp. Due to the large number of diseases caused by plant pathogens, the tomato is a culture in which a significant amount of agrochemicals is used. Therefore, this species is among the vegetables with the greatest amount of residual pesticides. Under these circumstances, it is essential to develop sustainable plant defense techniques in order to reduce the use of agrochemicals. Then, changes in plant metabolism related to defense must be understood so that new strategies and new products can be developed. Disease control using soil microorganisms has been considered as an alternative, since the rhizobacteria, in addition to promoting plant growth, may induce resistance as the result of activation of the natural plant defenses. These, calls plant growth promoting rhizobacteria (PGPR), has been explored for their biofertilizers, biopesticides and phyto-stimulating abilities. The aims of this study were to characterize biochemically the Streptomyces spp. isolates, to determine the antagonism against Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis (Pcb), to determine the ability of Streptomyces spp. on promoting growth of tomato plants and to evaluate the modulation of the defense-related metabolism of tomato plants when treated with Streptomyces spp. The possible influence of Streptomyces spp. on reducing soft rot disease in tomato plants was also evaluated. Biochemical characterization was evaluated through the ability of Streptomyces spp. on producing siderophores, solubilizing phosphate, and activity of amylase and lipase, as well as volatile organic compounds (VOC) production. Antagonism of Streptomyces spp. against Pcb was determined by dual-culture method and I-plate for VOC effect analysis. Plant growth promotion was evaluated through VOC emission and by direct interaction with Streptomyces spp. isolates (PM1, PM3, PM4, PM5, PM6 e PM9). Enzymes related to plant defense were colorimetric analyzed in plants treated with isolates of Streptomyces spp. Evaluation of soft rot disease was performed on plants treated with Streptomyces spp. and challenged with Pcb through the area under the disease progression curve (AUDPC) and plant mortality. Isolates of Streptomyces spp. displayed characteristics of PGPR and 32 volatile compounds were identified from the different isolates. PM3 was the isolate showing efficient antagonism against Pcb. Most of the isolates promoted increase of root and shoot length of tomato plants by VOC although PM5 was efficient on promoting growth by direct interaction with Streptomyces spp. Treatment with Streptomyces spp. modulated the activity of defense-related enzymes and decrease incidence of soft rot disease. / O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) ? uma planta herb?cea pertencente ? fam?lia Solanaceae. Seus frutos s?o consumidos mundialmente, chegando ? produ??o mundial de 160 milh?es de toneladas por ano. No Brasil, ? a segunda hortali?a em import?ncia econ?mica. Contudo, o tomateiro ? alvo de in?meras doen?as que levam ? perda de produ??o e/ou m? qualidade dos frutos, como por exemplo, a doen?a Talo oco causada por Pectobacterium spp. Devido ao elevado n?mero de doen?as causadas por fitopat?genos, o tomateiro ? uma cultura onde se utiliza uma quantidade expressiva de agroqu?micos, estando entre as hortali?as que apresentam maior quantidade de agrot?xicos residuais. Por isso, torna-se imprescind?vel o desenvolvimento de t?cnicas sustent?veis de defesa para o vegetal, a fim de reduzir o uso destes compostos. Para este fim, ? fundamental compreender as altera??es no metabolismo vegetal relacionado ? defesa, para que novas estrat?gias e novos produtos agr?colas possam ser desenvolvidos. O controle de doen?as utilizando microrganismos de solo tem sido considerado uma alternativa, uma vez que as rizobact?rias, al?m de promoverem o crescimento vegetal, podem induzir ? resist?ncia como consequ?ncia da ativa??o da defesa vegetal. Estas, chamadas rizobact?rias promotoras de crescimento vegetal (PGPR), v?m sendo exploradas quanto ? capacidade biofertilizante, fito-estimuladora e biopesticida. Os objetivos deste estudo foram caracterizar seis isolados de Streptomyces spp. como PGPR, determinar o antagonismo contra Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis (Pcb), determinar a capacidade de isolados de Streptomyces spp. na promo??o do crescimento de plantas de tomate e avaliar a modula??o do metabolismo relacionado ? defesa das plantas de tomate quando tratadas com Streptomyces spp. A poss?vel influ?ncia de Streptomyces spp. na redu??o da doen?a Talo oco em plantas de tomate tamb?m foi avaliada. A caracteriza??o bioqu?mica de isolados de Streptomyces spp. foi realizada por meio da capacidade de produzir sider?foros, solubilizar fosfato, e da atividade de amilase e lipase, bem como a produ??o de compostos org?nicos vol?teis. O antagonismo de Streptomyces spp. contra Pcb foi determinado pelo m?todo de dupla cultura e placa com barreira para an?lise do efeito de compostos org?nicos vol?teis (VOC). A promo??o do crescimento das plantas foi avaliada por meio de emiss?o de VOC e pela intera??o direta com os isolados de Streptomyces spp. (PM1, PM3, PM4, PM5, PM6 e PM9). Enzimas relacionadas ? resposta de defesa foram analisadas colorimetricamente em plantas tratadas com isolados de Streptomyces spp. A avalia??o da doen?a Talo oco foi realizada em plantas tratadas com Streptomyces spp. e desafiadas com Pcb atrav?s da ?rea sob a curva de progresso da doen?a e da mortalidade das plantas em 24 dias. Os isolados de Streptomyces spp. mostraram caracter?sticas de PGPR e 32 compostos vol?teis foram identificados como produtos dos diferentes isolados. PM3 foi o isolado mais eficiente quanto ao antagonismo contra Pcb. A maioria dos isolados promoveu o aumento do comprimento de raiz e da parte a?rea do tomateiro por VOC, embora PM5 tenha sido tamb?m eficiente na promo??o do crescimento atrav?s da intera??o direta com Streptomyces spp. O tratamento com Streptomyces spp. modulou a atividade de enzimas relacionadas ? defesa e diminuiu a incid?ncia da doen?a Talo oco.