Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Gerson Silva de Lima.pdf: 864257 bytes, checksum: ca49b40df55461f84d34f8a4d94fd512 (MD5) Previous issue date: 2008-10-03 / Leptospirosis is considered a global health problem in human and veterinary medicine. It is a zoonotic disease caused by bacteria of the genus Leptospira, prevalent on every continent. The development of an effective macroscopic serum agglutination test against leptospirosis is justified, since the available ones are expensive, cumbersome and restricted to specialized laboratories. In Brazil, leptospirosis in pigs has been a major cause of reproductive failure in several states, mainly in the south and southeast regions of the country. Among the animals used in production of rural ecosystems, pigs have the most frequent clinical manifestations in the reproductive sphere with abortions, usually in the final third of pregnancy. Infertility, sterility or birth of debilitated or dead pigs which dies in the first days of life are signs of the presence of the bacteria in the breeding matrix. In the present study, six suspensions formulations of antigenic serovars pomona, icterohaemorrhagiae and copenhageni were used in single suspension form or in two serovars combinations. These were tested against pig serum with no clinical suspicion of leptospirosis compared with the microscopic agglutination test that is accepted as the gold standard by the World Health Organization (WHO). Among the six proposed suspensions the combination of serovars pomona + icterohaemorrhagiae showed the best result. The results demonstrates a percentage of 89% sensitivity and specificity of 89% for the suspension with the serovars combination of pomona + icterohaemorrhagiae and 87% for positive predictive value and 90% negative predictive value for the same combination, demonstrated by the statistics methods such as Chi-square, Kappa and Linear Logistic Model. Given the importance of leptospirosis in pigs and economic impact that it causes worldwide, in addition to the lack of current information, this study aimed to develop a screening rapid test for the diagnosis of pigs kept in variable dimension farms from rural regions of the Rio de Janeiro state. / A leptospirose ? considerada um problema global de sa?de na ?rea humana e veterin?ria. ? uma zoonose causada por bact?rias do g?nero Leptospira, prevalente em todos os continentes. O desenvolvimento de um teste de soro aglutina??o macrosc?pica eficaz contra a leptospirose se justifica, j? que os existentes s?o caros, trabalhosos e restritos a laborat?rios especializados. No Brasil, a leptospirose em su?nos tem sido uma das principais causas de falhas reprodutivas em v?rios estados, principalmente nas regi?es sul e sudeste do pa?s. Dentre os animais de produ??o explorados em ecossistemas rurais os su?nos apresentam as manifesta??es cl?nicas mais freq?entes na esfera reprodutiva com abortamentos, usualmente no ter?o final da gesta??o. A infertilidade, a esterilidade o nascimento de leit?es debilitados que morrem nos primeiros dias de vida s?o sinais da presen?a da bact?ria nas matrizes reprodutoras. No presente estudo, utilizou-se seis formula??es de suspens?es antig?nicas dos sorovares pomona, icterohaemorrhagiae e copenhageni em forma de suspens?o ?nica ou em combina??es de dois sorovares. Foram testadas frente a soros de su?nos sem suspeita cl?nica de leptospirose comparando com a soroaglutina??o microsc?pica que ? o teste aceito como padr?o ouro pela Organiza??o Mundial de Sa?de (OMS). Dentre as seis suspens?es propostas a combina??o dos sorovares pomona + icterohaemorrhagiae apresentou o melhor resultado. Os resultados obtidos demonstraram um percentual de 89% de sensibilidade e 89% de especificidade para a suspens?o com a combina??o dos sorovares pomona + icterohaemorrhagiae e de 87% de valor preditivo positivo e 90% de valor preditivo negativo para a mesma combina??o, comprovado pelos m?todos estat?sticos Qui-quadrado, Kappa e Modelo Linear Log?stico. Dada ? import?ncia da leptospirose em su?nos e o impacto econ?mico que causa mundialmente, al?m da car?ncia de informa??es atuais, este trabalho teve por objetivo desenvolver um teste r?pido de triagem para diagn?stico em su?nos mantidos em cria??es rurais de diferentes regi?es e tamanhos no Estado do Rio de Janeiro.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Pablo Waldeck Goncalves de Souza.pdf: 2011389 bytes, checksum: 2d903c70e0f497dfa879d5f386e128c6 (MD5) Previous issue date: 2008-03-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The objective of this paper was determined the presence of Cryptococcus neoformans in cockroach (Periplaneta americana) collected in public places. The motivation for this research was based on the fact that this species of cockroach is synanthropic and vehicle of several pathogenic agents for man and animals. The insect were collected already dead and also collected alive using different traps, at all, were 150 samples. The research of the presence of the agents in the insects was made in Laboratory of Pathogenic and Environmental Yeasts, Department of Microbiology and Immunology Veterinary, Institute of Veterinary, UFRRJ, by the process of the exoskeleton and the internal content of then, sowing in cultivation medium containing dopamine. The confirmations of isolation were made by macromorfology and micromorfology test, realization of auxanographic method and complementally proofs. Was not obtained isolation of Cryptococcus neoformans of exoskeleton. Were obtained 5 isolated (3%), starting by the content of the insects that, after the serogrouping in CGB medium, show them self as belonging to AD serum group. Test show that 80% of the stumps are big producing of phospholipase and 100% big producing of protease. We considerate that the cockroaches of the species Periplaneta americana are,potentially, a vector for the studied yeast. / O objetivo deste trabalho foi determinar a presen?a de Cryptococcus neoformans em baratas (Periplaneta americana) recolhidas de ambientes p?blicos. A motiva??o para esta pesquisa deve-se ao fato desta esp?cie de barata ser sinantr?pica e veiculadora de v?rios agentes patog?nicos para o homem e animais. Os insetos foram recolhidos mortos e tamb?m capturados vivos por meio de duas diferentes armadilhas, totalizando 150 amostras. A pesquisa da presen?a do agente nos insetos foi feita no Laborat?rio de Leveduras Patog?nicas e Ambientais, Depto de Microbiologia e Imunologia Veterin?ria, Instituto de Veterin?ria, UFRRJ, por processamento do exoesqueleto e do conte?do interno dos mesmos, com semeadura em meio de cultivo contendo dopamina. As confirma??es de isolamento foram realizadas por meio de testes de macromorfologia, micromorfologia, realiza??o de auxanograma e provas complementares. N?o foi obtido isolamento de Cryptococcus neoformans de exoesqueleto. Foram obtidos 5 isolamentos (3%) a partir do conte?do interno dos insetos que, ap?s sorogrupagem em meio CGB revelaram-se como pertencentes ao sorogrupo AD. Testes evidenciaram que 80% das cepas s?o forte produtoras de fosfolipase e 100% forte produtoras de protease. Consideramos que as baratas da esp?cie Periplaneta americana s?o um potencial vetor para a levedura estudada.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Alexander Santos.pdf: 2028526 bytes, checksum: 5876d3f1d1f305df3af598f0bef1531d (MD5) Previous issue date: 2008-04-15 / This work was developed in the Department of Microbiology and Immunology of the Institute of Veterinary Rural Federal University of Rio de Janeiro in Serop?dica-RJ. We evaluated the antifungal activity plant Cymbopogon citratus (lemon-grass), Peumus boldus (boldo) and Shinus terebinthifolia (aroeira), inhibition of growth of species of the genus Aspergillus (A. flavus, A. niger, A. ochraceus, A. Parasiticus and A. carbonarius. Using the method of minimum inhibitory concentration in agar, with the technique of dilution plate (Pour-Plate), were held dilutions of different extracts, resulting in the final concentrations of 5%, 2.5% and 1.25%. Testing of commercial sensitivity to antifungal - ketoconazole were made in a final concentration of 1933.18 ? g /mL, as recommended by the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). The results obtained in the experiments have shown that aqueous extracts of C. citratus and S. terebinthifolia, after 24 hours of incubation, were able to inhibit the growth of A. flavus and A. carbonarius, respectively. The other extracts being studied and tested in the concentrations were not able to inhibit the growth of mycelial species of the genus Aspergillus. / Este trabalho foi desenvolvido no Departamento de Microbiologia e Imunologia do Instituto de Veterin?ria da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, em Serop?dica-RJ. Foram avaliadas a atividade antif?ngica das plantas Cymbopogon citratus (capim-lim?o), Peumus boldus (boldo) e Shinus terebinthifolia (aroeira), na inibi??o do crescimento de esp?cies do g?nero Aspergillus (A. flavus, A. niger, A. ochraceus, A. parasiticus e A. carbonarius). Utilizando o m?todo da concentra??o inibit?ria m?nima em ?gar, com a t?cnica de dilui??o em placa (Pour-Plate), foram realizadas dilui??es dos diferentes extratos, obtendo-se as concentra??es finais de 5%, 2,5% e 1,25%. Testes de sensibilidade ao antif?ngico comercial - cetoconazol foram realizados numa concentra??o final de 1933,18 ?g/mL, conforme recomendada pelo National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). Os resultados obtidos nos experimentos demonstraram que os extratos aquosos de C. citratus e S. terebinthifolia, ap?s 24 horas de incuba??o, foram capazes de inibir o crescimento de A. flavus e A. carbonarius, respectivamente. Os demais extratos em estudo e nas concentra??es testadas, n?o foram capazes de inibir o crescimento micelial das esp?cies do g?nero Aspergillus.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Marcelo Santos de Oliva.pdf: 3554572 bytes, checksum: 0fae31785d5eaf0f107b4791b1e03628 (MD5) Previous issue date: 2008-11-13 / Mussels are bivalve mollusks that developed a filtrating system enabling them to uptake nutrients from water. This is a not selective mechanism, so mussels microbiological analysis shows up the aquatic environment quality. Therefore, the present work aimed to isolate and identify bacterial microbiota from bivalve mollusks incrustated into the rocky coast of Arquip?lago de Santana, Maca?, RJ. The antimicrobial resistance pattern of prevalent microorganisms isolated was also analyzed. The surrounding water microbiological quality was also evaluated in order to detect contamination source from fishing and subaquatic activities in the studied region. From the bacteriological analysis it was obtained a total of 51 isolates of Vibrio spp., being V. damsela (n=15) the prevalent specie, followed by V. harveyi (n=13) and V. alginolyticus (n=07). It was also obtained a total of 20 isolates of Enterobacteriaceae species, being Escherichia coli (n=06) the prevalent one, followed by Proteus vulgaris (n=04). Vibrio spp. isolates presented 100% of sensitivity to tested antimicrobials, except for ampicillin with no detected sensitivity corroborating to literature. For enterobacteria, it was detected a high percentile of sensitivity to all testes antimicrobials. In the six samples of ocean water analyzed it was not possible to detect total or fecal coliforms. The low percentile of isolated microorganisms from mussels at Arquip?lago de Santana can be justified for its location at the open sea, far away from the coast and influenced by sea currents, in a environment not yet altered by human action. / Os mexilh?es s?o moluscos bivalves filtradores que se alimentam de microrganismos captados pela corrente de ?gua e n?o apresentam capacidade seletiva de filtra??o do seu alimento, consequentemente, a an?lise dos mexilh?es reflete a qualidade microbiol?gica do habitat aqu?tico. Desse modo, o presente trabalho objetivou executar o isolamento e identifica??o da microbiota bacteriana a partir de moluscos bivalves incrustados em cost?es rochosos no Arquip?lago de Santana, Maca?- RJ, bem como analisar o perfil de resist?ncia dos microrganismos prevalentes. Tamb?m se buscou avaliar a qualidade da ?gua de modo a detectar poss?veis contamina??es decorrentes das atividades pesqueiras e subaqu?ticas nesta regi?o. A partir das an?lises bacteriol?gicas foi obtido um total de 51 col?nias de Vibrio spp. com preval?ncia da esp?cie V. damsela (n=15), seguida de V. harveyi (n=13) e V. alginolyticus (n=07) e um total de 20 col?nias de enterobact?rias com preval?ncia de Escherichia coli (n=06) seguida de Proteus vulgaris (n=04). Os isolados de Vibrio spp. apresentaram 100% de sensibilidade aos antimicrobianos testados, com exce??o da ampicilina, para a qual n?o foi detectada qualquer sensibilidade a semelhan?a de outros relatos na literatura. Nos isolados de enterobact?rias avaliados, foram detectados elevados percentuais de sensibilidade aos antimicrobianos testados. No total de seis amostras de ?gua do mar analisadas, n?o foi detectada a presen?a de coliformes totais e termotolerantes. O baixo percentual de microrganismos isolados de mexilh?es no Arquip?lago de Santana pode ser justificado por ser um local de mar aberto, afastado da costa e sobre a influ?ncia de correntes mar?timas, e ainda pouco impactado pela a??o humana.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-09-29T15:27:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoFenotipicaIsolados.pdf: 1039438 bytes, checksum: 3c6c87cbf938c2196c47c8af4a7fe355 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-10-02T16:49:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoFenotipicaIsolados.pdf: 1039438 bytes, checksum: 3c6c87cbf938c2196c47c8af4a7fe355 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-02T16:49:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoFenotipicaIsolados.pdf: 1039438 bytes, checksum: 3c6c87cbf938c2196c47c8af4a7fe355 (MD5) Previous issue date: 2005-02-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cryptococcus neoformans foi descrito como patógeno humano em 1894. Desde então, estudos abrangendo aspectos da biologia, taxonomia, ecologia e epidemiologia do fungo , vêm se desenvolvendo com significante importância para a medicina e para o meio ambiente. O fungo foi recentemente classificado em duas espécies distintas, C. neoformans (sorotipo A, D e AD) e C. gattii (sorotipos B e C), cada uma com características morfológicas e genéticas bem definidas, assim como seus aspectos ecológicos e epidemiológicos. C. neoformans acomete principalmente indivíduos imunocomprometidos, especialmente aqueles infectados pelo HIV, enquanto C. gattii infecta principalmente indivíduos imunocompetentes, atingindo todas as faixas etárias. Os fatores principais que determinam a patogênese da criptococose são relacionados com a situação de defesa do hospedeiro, o tamanho do inóculo e a virulência da cepa, sendo este último determinado por quatro características principais: a cápsula polissacarídica, a produção de melanina, a diferença de tipos sexuados (MAT e MATa) e a termotolerância. O fungo possui ciclo de vida transitório entre formas leveduriformes haplóides e formas filamentosas dicarióticas. A reprodução sexuada envolve mistura de material genético de parentais que formam progênies contendo características genéticas de ambos. A forma sexuada pode ocorrer através de um processo conhecido como frutificação haplóide. As espécies são heterotálicas, com dois tipos sexuados MAT e MATa. Estudos de caracterização fenotípica, incluindo a identificação da espécie, sorotipo e tipo sexuado tem grande relevância para a condução de estudos mais aprofundados devido ao estreito relacionamento entre seus aspectos ecológicos variáveis e seu ciclo de desenvolvimento e multiplicação, especialmente para o Norte e Nordeste do Brasil, onde o sorotipo B destaca-se como principal agente de meningite fúngica em hospedeiros normais. Este trabalho utilizou a técnica do CGB para a análise metabólica (identificação da espécie), onde 28 cepas apresentaram resultado positivo, caracterizando C. gattii e duas apresentaram resultado negativo, caracterizando C. neoformans . Os resultados de sorotipagem, realizados através de teste de aglutinação revelaram 28 cepas do sorotipo B e duas do sorotipo A. A determinação do tipo sexuado foi realizada através de técnica de PCR e todas as amostras eram MAT. / Cryptococcus neoformans was described as human pathogen in 1894. Since then, studies about fungal aspects as biology, taxonomy, ecology and epidemiology have been developed with great importance to medicine and the environment. The fungus was recently classified in two separated species, C. neoformans (serotypes A, D and AD) and C. gattii (serotypes B and C) each one with well defined genetic and morphological features as well as ecology and epidemiology aspects. C. neoformans occurs mainly in immunocompromised hosts, especially those infected by HIV. In the other hand, C. gattii infects mainly immunocompetents individuals to all lifetimes. The main factors determining the cryptococcosys pathogenesis have relations with the host defenses state, the size of particle and strain virulence, this last for four main features: the polyssacharide capsule, the melanin production, the mating types (MAT and MATa) and thermotolerance. The fungus has a transitory life cycle between haploid yeast form and dykariotic filamentous forms. The sexual cycles includes a mixture of genetic parental genes that form progenies containing the genetic characteristics of both. The asexual cycle occurs through a process know as haploid fruiting. The species are heterothallic with two mating types MAT and MATa. Phenotypic characterization studies, including the species identification, serotype and mating type have a great importance for conductions of profound studies because of the close relation between the ecological variants features and its development cycle and multiplication, especially in Brazilian regions North and Northeast where serotype B is the most prevalent cause of meningitis in ordinary hosts. This work used the CGB techniques for methabolic analysis (species identification), where 28 strains were positive, characterizing C. gattii and two were negative, characterizing C. neoformans. The serotyping results, make among agglutination test reveals 28 strains of serotype B and two of serotype A. The mating type was realized by PCR technique and all strains were MAT.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-08-13T12:44:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilSuscetibilidadeAntifungica.pdf: 1455209 bytes, checksum: c51a6ecbb5ce359e2b342d34bb8e5879 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2014-08-22T16:53:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilSuscetibilidadeAntifungica.pdf: 1455209 bytes, checksum: c51a6ecbb5ce359e2b342d34bb8e5879 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-22T16:53:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_PerfilSuscetibilidadeAntifungica.pdf: 1455209 bytes, checksum: c51a6ecbb5ce359e2b342d34bb8e5879 (MD5) Previous issue date: 2014 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Introdução: Onicomicoses são infecções ungueais causadas por fungos, podendo ser causadas por dermatófitos, leveduras e fungos filamentosos não dermatófitos. O diagnóstico de leveduras como agente de onicomicose tem aumentado significativamente, tal evidência tem sido atribuída ao crescente número de indivíduos imunocomprometidos e transplantados, ao aumento do uso de drogas antibacterianas de amplo espectro, à fatores genéticos, tendências atópicas e ao aumento da vida média da população. O objetivo principal do trabalho foi determinar o perfil de suscetibilidade antifúngica e alguns dos fatores de virulência de leveduras causadoras de onicomicoses. Métodos e Resultados: Foram estudadas 100 amostras de raspado ungueal semeadas em Agar Sabouraud com cloranfenicol e em Agar Mycosel. A identificação e o teste de suscetibilidade antifúngica (fluconazol, anfotericina B, fluocitocina e voriconazol) foram realizados através do método automatizado Vitek 2 e visando a pesquisa dos fatores de virulência para detecção de fosfolipase e proteinase foram utilizados os meios com emulsão de ovo a 50% e o ágar BSA (Bovine Serum Albumin), respectivamente. Das 100 amostras coletadas, 57 (57%) foram positivas no exame micológico direto e 42 (42%) na cultura. Dos isolados, 29 (69%) eram Candida parapsilosis, 8 (19%) C. albicans, 3 (7,2%) C. haemulonii, 1 (2,38%) C. lusitanea e 1 (2,38%) C.tropicalis. Todas as espécies de C. albicans, C. lusitanea e C. tropicalis foram sensíveis aos antifúngicos. As espécies de C. parapsilosis apresentaram resistência em 6 (20,7%) cepas ao fluconazol, e em 3 (10,34%) ao voriconazol. C. haemulonii apresentou resistência em 1 (33,33%) cepa ao fluconazol, 1 (33,33%) a flucitosina, 1 (33,33%) ao voriconazol e 3 (100%) à anfotericina B. Os Fatores de resistência, fosfolipase e proteinase, estiveram presentes somente nas espécies de C. albicans com positividade de 87,5% e 50% respectivamente. Conclusão: A espécie C. parapsilosis é um agente emergente de onicomicose, apresentando cepas resistentes aos antifúngicos. C. haemulonii apresentou perfil multirresistente. C. albicans, ainda que sensível a todos os fármacos testados foi a única espécie que apresentou os fatores de virulência estudados.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-03-20T12:36:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoSuscetibilidadeInVitro.pdf: 1683274 bytes, checksum: 9513eec5b0e41bedde9a08f37813a32c (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-03-24T11:41:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoSuscetibilidadeInVitro.pdf: 1683274 bytes, checksum: 9513eec5b0e41bedde9a08f37813a32c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T11:41:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoSuscetibilidadeInVitro.pdf: 1683274 bytes, checksum: 9513eec5b0e41bedde9a08f37813a32c (MD5) Previous issue date: 2015-06-18 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / FADESP - Fundação de Amparo e Desenvolvimento da Pesquisa / Cromoblastomicose (CBM) é uma micose por implantação fúngica na pele, de evolução crônica, causada pela inoculação traumática de fungos dematiáceos. O Estado do Pará é uma das principais áreas endêmicas, sendo F. pedrosoi o principal agente etiológico. A baixa taxa de cura é reflexo da falta de um esquema terapêutico padronizado e da escassez de dados relacionados a suscetibilidade de fungos negros aos fármacos disponíveis para o tratamento. O principal objetivo deste trabalho foi avaliar a suscetibilidade in vitro de isolados clínicos de Fonsecaea spp. frente a nove antifúngicos, correlacionando as Concentrações Inibitórias Mínimas (CIM) do itraconazol (ITZ) com a evolução clínica e os tipos de lesões, além de quantificar os níveis plasmáticos de ITZ e Hidroxi-ITZ (ITZOH) em pacientes atendidos na Unidade de Referência Especializada em Dermatologia Sanitária do Estado do Pará Dr. Marcello Candia. Os 38 isolados clínicos de Fonsecaea foram avaliados em relação ao ITZ, cetoconazol (CTZ), posaconazol (PCZ), voriconazol (VCZ), fluconazol (FCZ), anfotericina B (ANF B), caspofungina (CAS), terbinafina (TBF) e 5-fluorocitosina (5-FLU), de acordo com as recomendações do Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, documento M38-A2). A CIM para cada fármaco utilizado foi obtida após 5 dias de incubação a 30°C, e dentre os fármacos testados, o PCZ foi o mais efetivo (CIM 0.28 μg/ml, CFM 4.35 μg/ml) podendo ser uma alternativa terapêutica em isolados não sensíveis ao ITZ. Os resultados da correlação entre a CIM do ITZ e a evolução clínica demonstraram que os pacientes com piora tiveram um valor médio ± erro padrão da média (0.90 ± 0.10 μg/ml) superior aos sem melhora (0.45 ± 0.05 μg/ml) com melhora (0.59 ± 0.05 μg/ml) e cura (0.45 ± 0.05 μg/ml), com diferença significativa (p < 0.05) entre os grupos. Não houve correlação entre o CIM do ITZ e os tipos de lesões dos pacientes. Observamos uma grande variabilidade interindividual entre os níveis plasmáticos de ITZ e ITZOH, sendo importante destacar que o ITZOH estava até 3 vezes mais elevado no plasma dos pacientes (p < 0.001), o que pode contribuir para atividade antifúngica do tratamento e sugere uma importante contribuição deste metabólito na terapia. Por fim, avaliamos três pacientes que foram submetidos a altas doses de ITZ, 600 mg/dia, com aumento significativo dos níveis plasmáticos de ITZOH (p=0.0148) e uma concentração >1000 ng/ml na somatória ITZ+ITZOH, considerada satisfatória para a maioria das infecções fúngicas, além de apresentarem melhora do quadro clínico. Em resumo, nossos dados 1) confirmam F. pedrosoi como o principal agente etiológico da CBM no Pará; 2) não evidenciam correlação entre as lesões, as espécies e a sensibilidade ao ITZ; 3) demonstram que ITZ, VCZ e PCZ foram os fármacos com menor CIM, sendo que o PCZ apresentou a menor CFM; 4) correlacionam o metabólito ITZOH com a evolução clínica dos pacientes e; 5) indicam que o uso de altas doses de até 600 mg/dia de ITZ podem ser usadas em pacientes que não respondem a doses terapêuticas menores. / Chromoblastomycosis (CBM) is a fungal infection by implantation in the skin, with a chronic evolution, caused by traumatic inoculation of dematiaceous fungi. Pará state is one of the most important endemic areas in Brazil, and F. pedrosoi is the most prevalent agent. The low cure rate is consequence of the lack of a standardized treatment regimen and there are a few works related to susceptibility of black fungi to the drugs available for treatment. The main objective of this study was to evaluate in vitro susceptibility of clinical isolates of Fonsecaea spp. against nine antifungals, correlating itraconazole (ITZ) minimal inhibitory concentrations (MIC) and minimal fungicidal concentrations (MFC) with clinical outcome and the types of lesions. Furthermore, plasma levels of ITZ and ITZOH were measured in patients treated in Dr Marcello Candia Reference Unit in Sanitary Dermatology (UREMC, Pará State). Thirty-eight clinical isolates of Fonsecaea spp. were evaluated against ITZ, ketoconazole (CTZ), posaconazole (PCZ), voriconazole (VCZ), fluconazole (FCZ), amphotericin B (ANF B), caspofungin (CAS), terbinafine (TBF) and 5-fluorocytosine (5-FLU), according to the protocol of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, M38-A2 document). After 5 days of incubation at 30°C, MICs were determined visually evaluating fungal growth in different drug concentrations, in comparison to the drug-free control wells. PCZ was the most effective (MIC 0.28 μg/ml, MFC 4.35 μg/ml) drug. The correlation between the MIC to ITZ and clinical outcome results demonstrate that patients with worsening had a media value ± SEM (0.90 ± 0.10 μg/ml) superior to no improvement (0.45 ± 0.05 μg/ml) or improvement (0.59 ± 0.05 μg/ml) and cure (0.45 ± 0.05 μg/ml), with a significant difference (p < 0.05) among the groups. There was no correlation between ITZ CIM and types of lesions. We observed a large inter-individual variability of ITZ and ITZOH plasma levels. ITZOH was up to 3 times higher in the plasma of patients (p < 0.001), which can contribute to the antifungal treatment and suggests an important participation of this metabolite in therapy. Lastly, we evaluated three patients who underwent high dose 600 mg/day ITZ with a significant increase of ITZOH (p= 0.0148) plasma levels. In summary, our data 1) confirmed F. pedrosoi as the main agent of CBM in Pará; 2) did not show correlation between the lesions, species and ITZ sensitivity; 3) Showed that ITZ, VCZ and PCZ are the drugs with lower CIM, wherein PCZ had the lowest MFC; 4) correlated the metabolite ITZOH with the clinical evolution of patients and; 5) indicated that the use of high doses of up to 600 mg/day ITZ can be used in patients who do not respond to lower therapeutic doses.

Submitted by Nathalya Silva (nathyjf033@gmail.com) on 2017-04-07T17:30:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_BiodiversidadeBacterianasFermentação.pdf: 6853574 bytes, checksum: 5de6a4fbf13df35b52431b1ad2a200f7 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-04-10T12:02:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_BiodiversidadeBacterianasFermentação.pdf: 6853574 bytes, checksum: 5de6a4fbf13df35b52431b1ad2a200f7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T12:02:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_BiodiversidadeBacterianasFermentação.pdf: 6853574 bytes, checksum: 5de6a4fbf13df35b52431b1ad2a200f7 (MD5) Previous issue date: 2015-06-22 / Frutos de açai (Euterpe oleracea) (FA) e uma gama de produtos derivados desse fruto são um exemplo de sucesso comercial de um produto regional genuinamente brasileiro no mercado global. Os FA sofrem fermentação espontânea durante o pós-colheita devido, principalmente, sua elevada carga microbiana e aos fatores intrínsecos e extrínsecos favoráveis. A biodiversidade da comunidade microbiana em FA e sua evolução em três origens geográficas e duas condições de fermentação foram estudadas. Métodos independente de cultivo baseados no gene 16S rRNA de quinze amostras revelaram que os filos Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes e Acidobacteria foram os mais abundantes. Ao nível do gênero, foram identificados a Massilia (taxon com mais de 50% das sequências e constante durante as 30h de fermentação), Pantoea (taxon com o maior aumento durante a fermentação), Naxibacter, Enterobacter, Klebsiella e Raoultella, formando a microbiota bacteriana dos FA. Atributos relacionados à promoção de crescimento vegetal (sideróforos) e outros compostos como, por exemplo, o poli-3-hidroxibutirato (PHB) e a violaceína podem promover a preponderância de Massilia em resposta a condições de estresse do fruto. Análises de beta diversidade demonstraram que os parâmetros de qualidade dos FA (pH, sólidos solúveis, acidez titulável e lípidos) e de análise elementar (C, N, H e razão C/N) não foram capazes de correlacionar padrões de grupos taxonômicos em FA. Este trabalho oferece novos conhecimentos e perspectivas sobre a composição da comunidade bacteriana nativa nos FA em função de sua fermentação espontânea durante o período do pós-colheita. / Açai (Euterpe oleracea) fruits (AF) and a wide variety of products derived from this fruit are an example of success of a local and typically Brazilian product on the global market. The AF suffer spontaneous fermentation during postharvest due mainly to its high microbial load and the favourable intrinsic and extrinsic parameters. The biodiversity of microbial community in AF and their evolution between three geographical origins and two fermentation conditions were examined. Culture-independent methods based on 16S rRNA from fifteen samples revealed that Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes and Acidobacteria were the most abundant phyla. At genus level, were identified Massilia (taxon with more than 50 % of sequences remaining constant during the 30 h of fermentation), Pantoea (taxon with the highest increase during fermentation), Naxibacter, Enterobacter, Raoultella and Klebsiella, forming the carposphere bacterial microbiota of AF. Attributes related to plant growth promotion (siderophores) and others compounds e.g. poly-3-hydroxybutyrate (PHB) and violacein in response to stress conditions could improve the Massilia preponderance. Beta diversity showed that quality parameters of AF (pH, soluble solids, titratable acididy and lipids) and elemental analysis (C, N, H and C/N ratio) were unable to establish microbial patterns in AF. This research offers new insights and perspectives of the indigenous bacterial community composition on AF as a function of spontaneous fermentation during postharvest.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-06-09T11:35:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CianotoxinasOstrasAguas.pdf: 1711540 bytes, checksum: eb11c36e72609b2319a594f916b74184 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-06-12T14:32:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CianotoxinasOstrasAguas.pdf: 1711540 bytes, checksum: eb11c36e72609b2319a594f916b74184 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T14:32:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CianotoxinasOstrasAguas.pdf: 1711540 bytes, checksum: eb11c36e72609b2319a594f916b74184 (MD5) Previous issue date: 2016-08-31 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / Cianobactérias são organismos procarióticos fotossintetizantes e em condições favoráveis ao seu crescimento podem formar florações. Também são capazes de produzir cianotoxinas, metabólitos secundários que possuem efeito tóxico para organismos eucarióticos inclusive o homem. Como parte do fitoplâncton as cianobactérias participam das cadeias alimentares, sendo assim a ingestão de moluscos que tenham se alimentado continuamente de cianobactérias tóxicas e acumulado as toxinas em seus tecidos gera a possibilidade de transferência para o homem através de seu consumo trazendo sérios riscos à sua saúde. Ainda são escassos estudos sobre a contaminação (por cianotoxinas) de moluscos destinados ao consumo humano. Logo, este estudo consistiu em verificar a ocorrência de cianotoxinas em águas de cultivo e no tecido de ostras destinadas ao consumo humano. As coletas de água e de ostras foram realizadas em cultivos de dois municípios localizados no nordeste do Pará. A pesquisa por cianotoxinas foi realizada através de Cromatografia Líquida de Alta Eficiência, HPLC. As cianobactérias presentes na água, as isoladas e as cultivadas a partir das conchas das ostras foram identificadas. Não foram detectadas microcistinas e saxitoxinas nas amostras de água e nos extratos de ostras de ambos locais de cultivo. Contudo, foram identificados três gêneros de cianobactérias – Aphanizomenon, Oscillatoria e Phormidium, em Curuçá e três gêneros de cianobactérias em São Caetano de Odivelas – Aphanothece, Oscillatoria e Phormidium, todos conhecidos por conter espécies tóxicas. Foi detectada a presença de saxitoxinas em extratos de culturas de cianobactérias a partir das conchas das ostras de ambos os locais de cultivo, indicando a presença de espécies tóxicas apesar da ausência de floração. Neste estudo, verificou-se que os locais de cultivo de ostras encontram-se adequadas para o consumo, livres de contaminação por microcistinas e saxitoxinas, no entanto, se faz necessária a implantação de uma legislação específica e o monitoramento desses cultivos a fim de assegurar a saúde dos consumidores. / Cyanobacteria are photosynthetic prokaryotic organisms and under conditions favorable to their growth can form blooms. They are also capable of producing cyanotoxins, secondary metabolites that have a toxic effect on eukaryotic organisms including man. As part of phytoplankton the cyanobacteria participate in the food chains, thus the ingestion of shellfish, that have been continuously fed toxic cyanobacteria and accumulated the toxins in their tissues generates the possibility of transfer to the man through their consumption bringing serious risks to their health. There is still very little research on the contamination (by cyanotoxins) of shellfish intended for human consumption. Therefore, this study was to verify the occurrence of cyanotoxins in culture waters and in the tissue of oysters destined for human consumption. The water and oyster samples were collected from two municipalities located in the northeast of Pará. The cyanotoxins research was performed using High Performance Liquid Chromatography (HPLC). The cyanobacteria present in the water, isolated and cultured from oyster shells were identified. No microcystins and saxitoxins were detected in water samples and oyster extracts from both growing sites. However, three genera of cyanobacteria - Aphanizomenon, Oscillatoria and Phormidium were identified in Curuçá and three genera of cyanobacteria in São Caetano de Odivelas - Aphanothece, Oscillatoria and Phormidium, all known to contain toxic species. The presence of saxitoxins in extracts from cyanobacterial cultures was detected from the oyster shells of both growing sites, indicating the presence of toxic species despite the absence of bloom. In this study, it was verified that the cultivation of oyster sites are suitable for consumption, free of contamination by microcystins and saxitoxins, however, it is necessary to implement specific legislation and the monitoring of these crops in order to ensure consumer health.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:46:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1174662 bytes, checksum: b8d279c4ce9aa576070293eaf8594b88 (MD5) Previous issue date: 2010-03-24 / Sewage sludge is the major residue produced in Sewage Treatment Stations (STS). One of its possible applications, agricultural use of biosolids - a term which characterizes sewage sludge submitted to hygienization process - presents productive and reduced cost advantages. However, there is a concern of environmental contamination and risk of disease transmission through pathogenic microorganisms. This work aimed to evaluate the decay of pathogenic organisms in hygienized sewage sludge by solarization and lime addition, at field scale, and to estimate the time of permanence of microorganisms in soils fertilized by biosolids in experiments in laboratory conditions. Sewage sludge from a UASB reactor was fortnightly disposed in drying beds and three different lots were monitored, out of which samples were collected for analysis of microbiological parameters every seven days until class B biosolid characteristics were reached, following CONAMA 375/2006 specifications. The parameters monitored were: total solids, pH, humidity, total coliforms, Escherichia coli, Salmonella sp. and helminth eggs. Mixtures in the proportion of 75, 50 and 25% of biosolid with soil were prepared in the laboratory experiments, besides a biosolid treatment. The treatments were placed in 2 kg vases, with 3 repetitions, and submitted to 100 mL irrigation, weekly. The results indicated that hygienization was faster when the lime addition process was applied. Besides, the laboratory experiments confirmed that the biosolid+limed soil mixtures presented a drastic reduction of the remaining pathogenic microorganisms, even after hygienization. The concentrations found at 90 days of treatment with 75% of biosolid were 1.85x102 NMP/g of S.T. (?) for total coliforms, absence of E. coli since the start of monitoring and 0.07 helminth eggs per g of S.T. (?) In the treatment with 75% of solarized biosolid, total coliform concentrations of 5.15x104 NMP/g of S.T. (?) were found at 90 days of experiment; absence of E. coli, at the end of the experiment and between 0.48 and 0.12 helminth eggs per g of S.T. The results obtained in this work indicate the efficiency of both hygienization processes and continuity in pathogen reduction even after their application in the soil, confirming their viability for agricultural use. / O lodo de esgoto é o principal resíduo produzido nas Estações de Tratamento de Esgotos (ETEs). Entre os destinos possíveis, o uso agrícola de biossólidos, nome este que caracteriza o lodo de esgoto submetido a processo de higienização, apresenta vantagens produtivas e de redução de custos; contudo, há preocupação com a possibilidade de contaminação ambiental e risco de transmissão de doenças por microrganismos patogênicos. Este trabalho teve como objetivos avaliar o decaimento de organismos patogênicos em lodo de esgoto higienizado por solarização e caleação, em escala real, e estimar o tempo de permanência dos microorganismos em solos adubados com biossólido em experimentos de bancada. O lodo de um reator UASB era descartado quinzenalmente em leitos de secagem. Foram acompanhados três lotes diferentes, dos quais amostras foram coletadas para análise de parâmetros microbiológicos, a cada sete dias, até alcançar características de biossólido classe B, conforme especificação da CONAMA 375/2006. Os parâmetros monitorados foram: sólidos totais, pH, umidade, coliformes totais, Escherichia coli, Salmonella sp. e ovos de helmintos. Nos experimentos de bancada, foram realizadas misturas na proporção de 75, 50 e 25% de biossólido com solo, além de um tratamento sem biossólido. Os tratamentos foram colocados em vasos com capacidade de 2 kg, com três repetições, e submetidos à irrigação semanal de 100 mL. Os resultados indicaram que a higienização foi mais rápida, quando foi aplicado o processo de caleação. Além disso, constatou-se, nos experimentos de bancada, que as misturas biossólido + solo caleado apresentaram drástica redução dos microrganismos patogênicos remanescentes, mesmo após o processo de higienização. As concentrações encontradas aos 90 dias do tratamento, com 75% de biossólido, foram de 1,85x102 NMP/g de S.T para coliformes totais; ausência de E. coli, desde o princípio do monitoramento; e 0,07 ovos de helmintos por g de S.T. No tratamento com 75% de biossólido solarizado, foram encontradas, aos 90 dias, concentrações de coliformes totais de 5,15x104 NMP/g de S.T.; ausência de E. coli no final do experimento; e ovos de helmintos entre 0,48 e 0,12 ovos por g S.T. Os resultados obtidos indicam que há eficiência em ambos os processos de higienização e continuidade na redução de patógenos, mesmo após a sua aplicação no solo, o que ratifica a sua viabilidade para o uso agrícola.