Considerando-se a importância de Gracilaria birdiae e G. caudata como as principais agarófitas coletadas no nordeste brasileiro, e o conhecimento prévio sobre a diversidade fisiológica de suas populações, foram avaliadas as características fenológicas, a diversidade genética e os parâmetros relacionados à fotossíntese de populações selecionadas ao longo da costa brasileira. Durante a realização desse trabalho, foram amostradas quatro populações de Gracilaria birdiae de diferentes estados (RN, CE, PE e BA) e sete populações de G. caudata (RN, CE, PE, PB, BA, ES e SP). Tetrasporófitos foram encontrados em maior número em todas as populações amostradas. Em G. caudata, uma maior proporção de tetrasporófitos foi observada para as populações da região Nordeste, quando comparada às populações da região Sudeste. A ausência de plantas inférteis na maioria das populações amostradas, ou a baixa frequência (G. birdiae, RN, 4%; e G. caudata, RN e PE, 0,95% e SP, 8,57%), indicam a elevada fertilidade das espécies. A presença de gametófitos epífitas em tetrasporófitos foi observada em ambas espécies, entretanto, eles foram predominantes em G. caudata. Os parâmetros da fotossíntese foram avaliados a partir de dados coletados na natureza, com o uso da técnica de fluorescência in vivo da clorofila α. Nos locais onde ambas espécies ocorriam, observou-se que G. caudata apresentou valores elevados de Ik e inferiores de αETR, quando comparada a G. birdiae, sugerindo que essa espécie apresente maior sensibilidade a altos níveis de irradiância. Essas respostas estão de acordo com a posição em que ocupam em relação ao nível de maré: G caudata, sempre numa posição superior em relação à G. birdiae. Tetrasporófitos e gametófitos femininos de ambas espécies do CE apresentaram valores elevados de αETR, sugerindo que estes estão adaptados a irradiâncias elevadas e apresentam mecanismos capazes de evitar danos ao aparato fotossintetizante. A população de G. birdiae do RN apresentou uma diminuição das taxas fotossintetizantes em elevadas irradiâncias (até 500 µmol.fótons.m-2.s-1) atribuída a sua posição inferior no costão, quando comparada às populações da BA e PE, o que poderia indicar uma maior sensibilidade à irradiância em relação às demais. Não foram observadas diferenças nos valores de ETRmax entre as populações do RN e CE para ambas espécies, o que pode ser justificado pela proximidade geográfica. Tetrasporófitos de G. birdiae de coloração esverdeada do CE apresentaram maiores valores de ETRmax, quando comparados aos de coloração vermelha (selvagem), sugerindo uma maior habilidade de indivíduos de coloração esverdeada em utilizar elevadas irradiâncias para a manutenção de seu metabolismo. Essa característica deve representar uma vantagem adaptativa para G. birdiae, uma vez que a ocorrência de espécimes com capacidades fotossintetizantes distintas pode aumentar os espectros de aclimatação da espécie. A diversidade genética foi acessada por meio de marcadores plastidiais (rbcL), mitocondriais (Cox1 e cox2-3), nucleares (SSU) e microssatélites. Um total de 129 sequências de G. birdiae e G. caudata foram amplificadas para os marcadores Cox1, Cox2-3, rbcL e SSU. Sequências de Cox1 (633 pares de base (bp)) foram obtidas para 42 amostras de G. birdiae, e para apenas três amostras de G. caudata, devido a dificuldades de amplificação; uma divergência de 64 bp (10,25%) foi observada entre as espécies. Sequências de rbcL (1571 bp) e de SSU (1769 bp) foram obtidas para: i, uma amostra de G. birdiae da população do RN; e ii, duas amostras de G. caudata, uma do RN e outra da população do ES. Divergências de 61 bp (3,88%) e 4 bp (0,2%) foram observadas entre as espécies para as sequências de rbcL e SSU, respectivamente. Sequências de Cox2-3 (363 bp) foram obtidas para 33 amostras de G. birdiae, e para 48 amostras de G. caudata; uma divergência de 35 bp (8,97%) foi observada entre as espécies. Três haplótipos foram reconhecidos em G. birdiae para as sequências de Cox1 de 0-1 bp (0,15%), enquanto que 5 haplótipos para as sequências de Cox2-3, de 0-3 bp (0,82%), foram identificados em G. caudata. Uma média de sete marcadores tipo microssatélites foram desenvolvidos para G. birdiae e 12 para G. caudata, a partir das diferentes populações amostradas. Cinco loci de microssatélites amplificaram em ambas espécies, no entanto, foram observadas diferenças no tamanho e número de alelos de acordo com a espécie. Para a análise de microssatélites, foi avaliado um total de 248 amostras de G. birdiae (RN, 71; CE, 58; BA, 52; e PE, 67) e 424 de G. caudata (RN, 52; CE, 75; PB, 83; PE, 53; BA, 56; ES, 54; e SP, 51). Em G. birdiae, genótipos multilocus repetidos foram encontrados em três das quatro populações avaliadas (BA, CE e PE). Em G. caudata, essa repetição foi encontrada apenas para as populações da BA e SP, sendo que as demais apresentaram somente genótipos multilocus únicos (CE, RN, PB, PE e ES). As estimativas de diferenciação genética (Fst) em combinação com o Teste de Mantel indicaram a existência de uma correlação entre as distâncias genética e geográfica, tanto para G. birdiae como para G. caudata; entretanto, essa correlação mostrou-se linear apenas para G. caudata. A análise Bayesiana (programa Structure) demonstrou e existência de uma estruturação semelhante para as populações de G. birdiae e G. caudata. Os dois agrupamentos encontrados para ambas espécies têm como limite as populações dos Estados da Bahia e Pernambuco, indicando a existência de uma possível barreira genética não específica. Em síntese, análises moleculares corroboram dados de fotossíntese e indicam a maior variabilidade genética em G. caudata, quando comparada à G. birdiae. Essas análises corroboram ainda a hipótese da existência de uma variação genética relacionada a adaptações ambientais que resultam em alterações moleculares, fisiológicas e fenológicas / Considering the importance of Gracilaria birdiae and G. caudata as the main agarophytes collected in northeastern Brazil, and previous knowledge on the physiological diversity of their populations, phenological characteristics, parameters related to photosynthesis, and genetic diversity were evaluated in populations selected along the Brazilian coast. During this work, were sampled four populations of Gracilaria birdiae (RN, CE, PE, and BA) and seven of G. caudata (RN, CE, PE, PB, BA, ES, and SP). Tetrasporophytes were found in greater numbers in all sampled populations. In G. caudata, a higher proportion of tetrasporophytes was observed for the Northeast populations, compared to the Southeast populations. The absence of infertile plants in most of the sampled populations, or their low frequency (G. birdiae, RN, 4%, and G. caudata, RN and PE, 0.95%, and SP, 8.57%), indicate the high fertility of the species. The presence of epiphytic gametophytes of tetrasporophytes was observed in both species; however, they were prevalent in G. caudata. The photosynthetic parameters were evaluated from data collected in nature, using the in vivo chlorophyll α fluorescence technique. Where both species occurred, G. caudata presented high levels of Ik and lower α ETR, compared to G. birdiae, suggesting that this species may show greater sensitivity to high levels of irradiance. These responses are consistent with the position that they occupy relative to the shore: G caudata, always in a higher position, compared to G. birdiae. Tetrasporophytes and female gametophytes from the CE population of both species showed high levels of ?ETR, suggesting that these are adapted to high irradiance and have mechanisms to prevent damage to the photosynthetic apparatus. The RN population of G. birdiae presented a decrease in photosynthetic rates at high light intensities (up to 500 ?mol.fótons.m-2.s-1) attributed to its lower position on the shore, compared to the BA and PE populations, which could indicate a greater sensitivity to irradiance in relation to others. No differences were observed in ETRmax values between the RN and CE populations for both species, which can be explained by their geographical proximity. The greenish tetrasporophytes of G. birdiae from CE had higher ETRmax values, when compared to the wild-type (red), suggesting a greater ability of the greenish individuals to use high irradiance for maintaining their metabolism. This feature should be considered an adaptive advantage for G. birdiae, since the occurrence of specimens with different photosynthetic capacity may increase the acclimation spectra of the species. Genetic diversity was accessed through plastid markers (rbcL), mitochondrial (cox1 and cox2-3), nuclear (SSU) and microsatellites. A total of 129 sequences of G. birdiae and G. caudata were amplified for the markers cox1, cox2-3, rbcL and SSU. Cox1 sequences (633 base pairs (bp)) were amplified for 42 samples of G. birdiae, and only three samples of G. caudata, due to difficulties in amplification; a difference of 64 bp (10.25%) was observed between species. RbcL sequence (1571 bp) and SSU (1769 bp) were obtained for: i, a sample of G. birdiae from RN; and ii, two samples of G. caudata, one from RN and another from ES. Differences of 61 bp (3.88%) and 4 bp (0.2%) were observed among species for rbcL and SSU sequences, respectively. Cox2-3 sequences (363 bp) were obtained for 33 samples of G. birdiae and 48 samples of G. caudata; a difference of 35 bp (8.97%) was observed between species. Three haplotypes were found in G. birdiae for cox1 sequences, 0-1 bp (0.15%), while 5 haplotypes for were found for cox2-3 sequence of 0-3 bp (0.82%) in G. caudata. An average of seven microsatellites markers were developed for G. birdiae and 12 for G. caudata, from the different sampled populations. Five microsatellite loci amplified on both species; however, there were differences in the size and number of alleles according to species. For the microsatellite analysis, we evaluated a total of 248 samples of G. birdiae (RN, 71, CE, 58; BA, 52; and PE, 67), and 424 of G. caudata (RN, 52, CE, 75; PB, 83; PE, 53; BA, 56; ES, 54, and SP, 51). In G. birdiae, repeated multilocus genotypes were found in three of the four populations evaluated (BA, CE, and PE). In G. caudata, this repetition was found only for the BA and SP populations, the others presented only unique multilocus genotypes (CE, RN, PB, PE, and ES). Estimates of genetic differentiation (Fst) in combination with the Mantel Test indicated that there is a correlation between the genetic and geographic distances, for both G. birdiae and G. caudata; however, this correlation was shown to be linear only for G. caudata. The Bayesian analysis (Structure program) and demonstrated the existence of a similar structure to the populations of G. birdiae and G. caudata. The two groups found for both species have as limit the populations of BA and PE, indicating the existence of a possible non-specific genetic barrier. In summary, molecular analyses corroborate photosynthesis data and indicate a higher genetic variability in G. caudata, compared to G. birdiae. These analyzes confirm yet the hypothesis of a genetic variation related to environmental adaptations that result in molecular, physiological and phenological changes

Gracilaria caudata J. Agardh is one of the naturally occurring species in Brazil that produce good quality agar. In Rio do Fogo (RN), Brazil, a green variant was discovered in a G. caudata population of predominantly red (wild phenotype) tetrasporophytes. Epiphytes gametophytes on tetrasporophytes have been observed for both strains. Considering the wild and green variant strains in laboratory control conditions, this study: (i) assessed the impacts of epiphyte gametophytes on tetrasporophytes by evaluating the growth rates, the pigment content, and the photosynthetic potential of the tetrasporophytes; (ii) evaluated the amount of time required for the differentiation of cystocarps in free-living gametophytes and epiphyte gametophytes on tetrasporophytes; (iii) evaluated the number of epiphyte gametophytes produced by tetrasporophyte; and (iv) analyzed anatomical aspects of the intersection between the tetrasporophytes and the tetraspores that germinated on the tetrasporophytes. Samples were cultivated for 12 weeks on laboratory conditions. Control samples had epiphyte gametophytes growing on them, while treatment samples had their epiphyte gametophytes removed weekly. Physiological analyses compared control and treatment samples, while anatomical analysis used the control samples only. Considering the tetrasporophyte growth rates before fertility (2nd week), wild strain showed higher values than green variant; however, after 12 weeks, no differences were found between strains or between samples without epiphyte gametophytes. The wild strain produced tetraspores more frequently than the green variant and showed deficiency in phycoerythrin and allophycocyanin. Green variant treatment samples had higher content of allophycocyanin, phycocyanin and phycoerythrin than the control samples. Chlorophyll a was higher in the wild strain, and treatment samples had lower values in comparison to control samples. Epiphyte gametophytes possibly promoted reduction in pigment content of the tetrasporophytes on both strains. Wild strain samples without epiphyte gametophytes had higher photosynthetic efficiency. Epiphyte gametophytes produced cystocarps one week before free-living gametophytes. The amount of epiphyte gametophytes on tetrasporophytes is not different between strains. Epiphyte gametophytes were visible one week before on the wild strain than in the green variant strain. It was found that tetraspores give rise to epiphyte gametophytes through two distinct germination methods: outside or inside the thallus of the tetrasporophyte. Germination outside the tetrasporophyte thallus was more common, produced visible holdfasts and promoted cortex thickening in the cortical region of the tetrasporophyte. Germination inside the tetrasporophyte thallus did not show evidences of holdfasts nor cortex thickening on the tetrasporophytes. Epiphyte gametophytes holdfasts had adjacent cells to the cortex of the tetrasporophytes when they germinate outside the thallus; however, when germination occurred inside the thallus, the connection interface was closer to the medulla of the tetrasporophyte. Epiphyte gametophytes might represent a new life strategy that promotes sexual variability in a population mostly composed of tetrasporophytes. For cultivation purposes, wild tetrasporophytes with epiphyte gametophytes yielded more mass than the variant tetrasporophytes, being the best option for production. However, the green variant without epiphyte gametophytes produced more phycobiliproteins, making it a better option to harvest those substances / Gracilaria caudata J. Agardh é uma das espécies encontradas na costa brasileira que produzem ágar de boa qualidade. Em Rio do Fogo (RN), Brasil, uma linhagem variante verde de G. caudata foi descoberta em uma população composta principalmente por indivíduos de coloração vermelha (fenótipo selvagem). Gametófitos epífitos em tetrasporófitos foram observados para as duas linhagens. Considerando-se as linhagens selvagem e verde em condições controladas de laboratório, este estudo analisou: (i) os impactos dos gametófitos epífitos nos tetrasporófitos por meio de taxas de crescimento, conteúdo pigmentar e potencial fotossintetizante dos tetrasporófitos; (ii) o tempo necessário para a diferenciação de cistocarpos em gametófitos de vida livre e gametófitos epífitos; (iii) o número de gametófitos epífitos produzidos por tetrasporófito; e (iv) aspectos anatômicos da interseção entre tetrasporófitos e gametófitos epífitos. O experimento teve duração de 12 semanas. Amostras controle foram mantidas com seus gametófitos epífitos durante o experimento, enquanto as amostras tratamento tiveram seus gametófitos epífitos removidos semanalmente. Análises fisiológicas compararam amostras controle e tratamento, enquanto que para os estudos anatômicos utilizou-se apenas as amostras controle. A linhagem selvagem apresentou maiores taxas de crescimento que a linhagem verde nas duas primeiras semanas do experimento, quando ainda não estavam férteis; entretanto, após as doze semanas de cultivo, não foram observadas diferenças entre as linhagens tetrasporofíticas. A linhagem vermelha produziu tetrásporos com mais frequência do que a linhagem verde e apresentou deficiência em ficoeritrina e aloficocianina. As amostras tratamento da linhagem verde apresentaram valores maiores de aloficocianina e ficoeritrina do que às do controle. A linhagem selvagem apresentou menores teores de ficoeritrina e aloficocianina quando comparada à linhagem verde. As amostras tratamento da linhagem verde apresentaram maiores valores de aloficocianina, ficocianina e ficoeritrina que as amostras controle da mesma linhagem. A quantidade de clorofila a foi maior na linhagem selvagem, e as amostras tratamento desta linhagem apresentaram valores maiores que às do controle. A presença de gametófitos epífitos promoveu a redução no conteúdo pigmentar nas duas linhagens. Amostras tratamento da linhagem selvagem apresentaram potencial fotossintetizante maior do que amostras controle. A quantidade de gametófitos epífitos não foi diferente entre as linhagens. Gametófitos epífitos produziram cistocarpos uma semana antes do que gametófitos de vida livre. A linhagem selvagem produziu gametófitos epífitas uma semana antes da linhagem verde. A germinação de tetrásporos em tetrasporófitos ocorreu de duas maneiras: antes e após a liberação de tetrásporos. A liberação de tetrásporos seguida da germinação sobre o tetrasporófito foi mais frequente, produziu apressórios e promoveu aumento do número de células no córtex do tetrasporófito. A germinação de tetrásporos dentro do talo do tetrasporófito não apresentou evidências de apressórios ou espessamento da região cortical do tetrasporófito. A porção basal de apressórios de gametófitos epífitos permaneceu adjacente ao córtex do tetrasporófito. Quando a germinação do tetrásporo ocorreu ainda dentro do talo, a interface de conexão das células foi mais próxima da medula do tetrasporófito. Gametófitos epífitos podem representar uma nova estratégia de vida para a espécie por possibilitar a variabilidade por reprodução sexual em uma população predominantemente composta por tetrasporófitos. Para um possível cultivo em larga escala, tetrasporófitos com gametófitos epífitos da linhagem selvagem seriam mais adequados por produzirem mais massa que os da variante verde. Entretanto, se o objetivo for a produção de ficobiliproteínas, a linhagem verde seria a mais indicadaphycoerythrin and allophycocyanin. Green variant treatment samples had higher content of allophycocyanin, phycocyanin and phycoerythrin than the control samples. Chlorophyll a was higher in the wild strain, and treatment samples had lower values in comparison to control samples. Epiphyte gametophytes possibly promoted reduction in pigment content of the tetrasporophytes on both strains. Wild strain samples without epiphyte gametophytes had higher photosynthetic efficiency. Epiphyte gametophytes produced cystocarps one week before free-living gametophytes. The amount of epiphyte gametophytes on tetrasporophytes is not different between strains. Epiphyte gametophytes were visible one week before on the wild strain than in the green variant strain. It was found that tetraspores give rise to epiphyte gametophytes through two distinct germination methods: outside or inside the thallus of the tetrasporophyte. Germination outside the tetrasporophyte thallus was more common, produced visible holdfasts and promoted cortex thickening in the cortical region of the tetrasporophyte. Germination inside the tetrasporophyte thallus did not show evidences of holdfasts nor cortex thickening on the tetrasporophytes. Epiphyte gametophytes holdfasts had adjacent cells to the cortex of the tetrasporophytes when they germinate outside the thallus; however, when germination occurred inside the thallus, the connection interface was closer to the medulla of the tetrasporophyte. Epiphyte gametophytes might represent a new life strategy that promotes sexual variability in a population mostly composed of tetrasporophytes. For cultivation purposes, wild tetrasporophytes with epiphyte gametophytes yielded more mass than the variant tetrasporophytes, being the best option for production. However, the green variant without epiphyte gametophytes produced more phycobiliproteins, making it a better option to harvest those substances

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:03:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LeandroSC.pdf: 650975 bytes, checksum: 6025a0ab11422614586386d571f936a6 (MD5) Previous issue date: 2008-12-23 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / In recent years, sulfated polysaccharides (SP) from marine algae have emerged as an important class of natural biopolymers with potential pharmacology applications. Among these, SP isolated from the cell walls of red algae have been study due to their anticoagulant,antithrombotic and anti-inflammatory activities. In the present study, three sulfated polysaccharides fractions denominated F1.5v, F2.0v and F3.0v were obtained from seaweed G. caudate by proteolysis followed to acetone fractionation. Gel electrophoresis using 0.05 M 1,3-diaminopropane-acetate buffer, pH 9,0, stained with 0.1% toluidine blue, showed the presence of SP in all fractions. The chemical analysis demonstrated that all the fractions are composed mainly of galactose. These compounds were evaluated in anticoagulant, antioxidant and antiproliferative activities. In anticoagulant activity evaluated through aPTT and PT tests, no one fractions presented anticoagulant activity at tested concentrations (0.1 mg/mL; 1.0 mg/mL; 2.0 mg/mL).The antioxidant activities of the three fractions were evaluated by the following in vitro systems: Total antioxidant capacity, superoxide and hydroxyl radical scavenging, ferrous chelating activity and reducing power. The fractions were found to have different levels of antioxidant activity in the systems tested. F1.5v shows the highest activity, especially in the ferrous chelating system, with 70% of ferrous inhibiting at 1.0 mg.mL-1. Finally, all the fractions showed dose-dependent antiproliferative activity against HeLa cells. The fractions F1.5v and F2.0v presented the highest antiproliferative activity at 2.0 mg/mL with 42.7% and 37.0% of inhibition, respectively. Ours results suggests that the sulfated polysaccharides from seaweed G. caudata are promising compounds in antioxidant and/or antitumor therapy / Nos ?ltimos anos, os polissacar?deos sulfatados de algas marinhas t?m emergido como uma importante classe de biopol?meros naturais com potenciais aplica??es farmacol?gicas. Dentre estas, os polissacar?deos sulfatados de algas vermelhas tem sido extensivamente estudados, principalmente devido seu potencial anticoagulante, antitromb?tico e antiinflamat?rio. Neste estudo, tr?s fra??es de polissacar?deos sulfatados, denominadas F1,5v, F2,0v e F3,0v, foram extra?das da alga vermelha Gracilaria caudata, atrav?s de prote?lise, seguida de fracionamento com acetona. Eletroforese em gel de agarose em Tamp?o PDA mostrou a presen?a de polissacar?deos sulfatados em todas as fra??es. As an?lises qu?micas demonstraram que todas as fra??es s?o compostas principalmente de galactose. Esses compostos foram testados para as atividades anticoagulante, antioxidante e antiproliferativa. Na atividade anticoagulante avaliada atrav?s de kits comerciais de aPTT e PT, nenhuma das fra??es apresentou atividade nas concentra??es testadas (0,1; 0,5 e 1,0 mg/mL). A atividade antioxidante das fra??es polissacar?dicas foi avaliada atrav?s de diversos ensaios in vitro: Capacidade antioxidante total, seq?estro de radical super?xido e hidroxila, quela??o f?rrica e poder redutor. As fra??es apresentaram diferentes n?veis de atividade antioxidante nos sistemas testados. A fra??o F1,5v apresentou a maior atividade antioxidante, principalmente no ensaio de quela??o f?rrica, com cerca de 70,00% de inibi??o na concentra??o de 1,0 mg/mL. Finalmente, todas as fra??es apresentaram atividade antiproliferativa dose-dependente frente a linhagem celular tumoral HeLa. As fra??es F1,5v e F2,0v apresentaram as maiores atividades antiproliferativa na concentra??o de 2,0 mg/mL, com 42,70% e 37,00% de inibi??o da prolifera??o celular em rela??o ao controle. Nossos resultados sugerem que os polissacar?deos sulfatados de G. caudata s?o promissores f?rmacos na terapia antioxidante e/ou antiproliferativa

Screening efforts at the Gray Fossil Site, Washington County, Tennessee, have yielded a unique and diverse salamander fauna for the southern Appalachian Mio-Pliocene; including at least five taxa from three modern families (Ambystomatidae, Plethodontidae, and Salamandridae) supporting the woodland-pond interpretation of the site. All specimens represent the earliest record of their respective families in the Appalachian Mountains; with the Notophthalmus sp. vertebrae being the only Mio-Pliocene skeletal fossil known for the family Salamandridae in North America. Three types of plethodontid salamander are present, with one type representing the earliest known desmognathine. The desmognathine fossils lend credence to the 'Appalachian' origin of the clade in the Mio-Pliocene. The GFS salamander fauna is predominated by plethodontids; competition is inferred by the presence of several similarly large-sized taxa and is invoked to explain the presence of neotenic individuals in an otherwise amicable terrestrial environment.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AlexandraRSF.pdf: 554056 bytes, checksum: fdede8a12e56bfeb141534a40ac27701 (MD5) Previous issue date: 2007-12-03 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The integrated culture of seaweed and aquatic animals is an ancient practice in Asian countries. The expansion of this practice to western countries is consequence of the recognition of this system as a sustainable alternative that allows economical diversification and mitigation of environmental impacts generated by effluents of aquaculture. This study evaluated the growth of the seaweed Gracilaria caudata and of the shrimp Litopenaeus vannamei in monoculture (shrimps) and integrated culture (shrimps and algae) systems, and accessed the effect of the seaweed in the water quality. There were two treatments in the experiment: monoculture (shrimps) and integrated culture (shrimps/ algae). The organisms were cultured in 6 aquaria (10L) filled with seawater (35.0?0.0 PSU and 28.1?0.4?C) for 28 days. The nutrients of water (PO43-, NH4+, NO2-, NO3- and DIN), the biomass and the relative growth rate (RGR, % day-1) of seaweed and shrimps were measured weekly. The parameters pH, temperature, salinity and dissolved oxygen were measured daily. The concentration of NH4+ in integrated culture (62.8?25.2?M) was lower (Mann-Whitney p<0.001) than in monoculture (85.6?24.3?M). The mean of PO4- in monoculture (10.4?4.6?M) was markedly higher (Mann-Whitney; p=0.024) than that in integrated culture (8.7?4.1?M). The level of dissolved oxygen in integrated culture (6.0?0.6mg/L) was higher (t-Student; P=0.014) than that in shrimp monoculture (5.8?0.6mg/L). The mean values of the parameters pH, NO2-, NO3- and DIN were 7.5?0.2, 10.1?12.2?M, 24.5?3.2?M and 120.17?30.76?M in monoculture, and 7.5?0.2, 10.5?13.2?M, 27.4?3.5?M and 100.76?49.59?M in integrated culture. There were not differences in these parameters between treatments. The biomass and RGR of seaweed reached 15.0?1.9g and 7.4?2.8% day-1 at the end of the experiment. The performance of shrimp was favorable in monoculture (1.5?0.8g; 5.7?1.6% dia-1) and in integrated culture (1.5?0.7g; 5.2?1.2% dia-1), and the rate of survival was 100% in both treatments. The tolerance and favorable performance of Gracilaria caudata suggest that this seaweed might be integrated into shrimp (Litopenaeus vannamei) culture systems / O uso de macroalgas em cultivo integrado com animais ? uma pr?tica antiga em pa?ses asi?ticos. A expans?o desta pr?tica em pa?ses ocidentais ? conseq??ncia do reconhecimento desse sistema como uma alternativa que possibilita a diversifica??o econ?mica e a mitiga??o dos impactos gerados pelos efluentes da aq?icultura. Este estudo avaliou o crescimento da macroalga Gracilaria caudata e do camar?o Litopenaeus vannamei em monocultivo (camar?o) e em cultivo integrado, observando o efeito das algas na qualidade da ?gua. O experimento foi constitu?do por dois tratamentos (triplicata), realizados em aqu?rios de vidro contendo ?gua do mar (35,0?0,0 PSU e 28,1?0,4?C) durante 28 dias: monocultivo (camar?es) e cultivo integrado (camar?es/algas). Os nutrientes da ?gua, a biomassa e as taxas de crescimento relativo (TCR,%dia-1) das duas esp?cies foram determinadas semanalmente. Os par?metros f?sico-qu?micos da ?gua (pH, temperatura, salinidade e oxig?nio dissolvido) foram monitorados diariamente. Os n?veis do ?on am?nio foram significativamente menores (Mann-Whitney p<0,001) no cultivo integrado (62,8?25,2?M) do que no monocultivo (85,6?24,3?M). Este mesmo modelo foi observado para o ortofosfato, cujas m?dias foram 10,4?4,6?M no monocultivo e 8,7?4,1?M no cultivo integrado (Mann-Whitney; p=0,024). O oxig?nio dissolvido no cultivo integrado (6,0?0,6mg/L) foi maior (t-Student; P=0,014) que no monocultivo (5,8?0,6mg/L). Os par?metros pH, nitrito, nitrato e nitrog?nio inorg?nico dissolvido n?o apresentaram diferen?a entre os tratamentos, cujas m?dias foram 7,5?0,2, 10,1?12,2?M, 24,5?3,2?M e 120,17?30,76?M no monocultivo e 7,5?0,2, 10,5?13,2?M, 27,4?3,5?M e 100,76?49,59?M no integrado. A alga apresentou aumento significativo de biomassa (15,0?1,9g) e de TCR (7,4?2,8% dia-1). Os camar?es mostraram bom desempenho no monocultivo (1,5?0,8g; 5,7?1,6% dia-1) e no integrado (1,5?0,7g; 5,2?1,2% dia-1) e 100% de sobreviv?ncia, n?o havendo diferen?a entre ambos (t-student; p>0,05). A toler?ncia e o bom desempenho de Gracilaria caudata em ambientes eutr?ficos sugerem que essa alga pode ser integrada em sistemas de cultivo de camar?es (Litopenaeus vannamei)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6436.pdf: 1547654 bytes, checksum: 6f984d349332adbb8920bb20ab338180 (MD5) Previous issue date: 2014-10-20 / Universidade Federal de Sao Carlos / Habitat fragmentation is one of the main threats to biodiversity and one of the main challenges faced by conservation biology. This study assessed the habitat fragmentation effects on the genetic variability of Chiroxiphia caudata, which is an Atlantic Forest endemic bird species. Nine microsatellite loci were used for the analysis of individuals from five Atlantic Forest areas. We found departure from HWE is due to heterozygotes deficit and positive values for the inbreeding coefficient (Fis) for all populations. Private alleles were found in all areas. Fst, Dest, Bayesian and factorial correspondence analyses indicated that populations are genetically structured, but the distance could not explain the differentiation between areas. Apparently, this species did not suffered from a reduction in its variability because of the habitat fragmentation process. The fragmentation and its consequences as the reduction of gene flow may be acting in order to increase the differentiation between areas, including nearby areas that already show evidence of early differentiation.The choice of C. caudata for this study concerning the Atlantic Forest revealed the most fragmented areas played an important role for the specie by sheltering great genetic diversity within itself. Although not considered a very specialized specie as to their habits, the study model based on C. caudata showed that even more generalist species may be affected by fragmentation. When dealing with more specialized species, this scenario can become even worse. / A fragmentação de habitats é uma das principais ameaças à biodiversidade e um dos principais desafios enfrentados pela biologia da conservação. Este estudo avaliou os efeitos da fragmentação de habitat sobre a variabilidade genética de Chiroxiphia caudata, uma espécie endêmica da Mata Atlântica. Foram utilizados 9 loci de microssatélites para a análise de 78 indivíduos inseridos em cinco áreas de Mata Atlântica. Encontramos desvios no equilíbrio de Hardy-Weinberg para déficit de heterozigotos e valores positivos de FIS em todas as populações. Foram encontrados alelos privados em todas as áreas. Quanto a estruturação populacional, as análises de Fst, Dest, análise Bayesiana e análise de correspondência fatorial indicam que as populações são estruturadas geneticamente e que somente a distância não pode explicar a diferenciação entre as áreas. Aparentemente esta espécie não teve sua variabilidade reduzida a partir do processo de fragmentação. A fragmentação e suas consequências quanto a diminuição do fluxo gênico pode estar atuando de maneira a aumentar a diferenciação entre áreas, inclusive áreas próximas que já apresentam indícios de início de diferenciação. A utilização de C. caudata como modelo de estudo da Mata Atlântica mostra que áreas mais fragmentadas possuem um papel muito importante para espécie, abrigando grande diversidade genética. Mesmo não sendo considerada uma espécie muito especializada quanto aos seus hábitos, o modelo de estudo baseado em C. caudata mostrou que mesmo espécies mais generalistas podem ser afetadas pela fragmentação. Quando tratamos de espécies mais especializadas, este panorama pode se tornar ainda pior.

The objective of this study was to identify DNA markers for each of six added C-genome chromosomes in Triticum aestivum L. cv. 'Alceso'-Aegilops caudata L. addition lines using the randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) technique. DNA from Ae. caudata, T. aestivum, amphiploid of T. aestivum X Ae. caudata, and six disomic addition lines of wheat having a pair of Ae. caudata chromosomes was used as the template for the amplification of RAPD markers with a total of 58 random 10-mer oligonucleotide primers. Two primers, OPC-08 and OPJ-16, produced one intense band each from the amphiploid of T. aestivum X Ae. caudata and Ae. caudata, which was absent in all six addition lines. Each of these two primers produced a chromosome marker that could be tentatively located to the chromosome CA of Ae. caudata. OPJ-02, OPD-12, OPD-02, OPJ-12, OPD-20, and OPJ-14 produced a marker each for CB, CC, CD, CE, CF, and CG, respectively. OPJ-09 produced C-genome chromosome-specific RAPD markers. Also, OPC-05 and OPJ-19 produced RAPDs from both wheat and Ae. caudata genomes.