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Suspended micro- and nanotools for cell biology

Durán Ibáñez, Sara 12 December 2014 (has links)
Esta tesis presenta el diseño, desarrollo tecnológico, caracterización y aplicaciones tanto químicas como biológicas de micro- y nanodispositivos destinados a ser herramientas funcionales en biología celular. Esta línea de investigación es posible gracias a los avances obtenidos en el campo de las Micro- y Nanotecnologías, donde la aplicación de técnicas de miniaturización en la fabricación de sus dispositivos a escala celular es ya una realidad. Estas herramientas son lo suficientemente pequeñas como para etiquetar y permitir el seguimiento de embriones vivos o incluso actuar como sensores permitiendo el estudio de células vivas únicas de forma intra- y extracelular. Además, una de las características más relevantes de las micro- y nanoherramientas presentadas en esta tesis es su capacidad de suspensión, es decir, que estos dispositivos pueden ser liberados de la oblea en la que están fabricados y directamente actuar con las células en su mismo medio y en su misma escala. Estas herramientas presentan diferentes formas, tamaños, materiales y funcionalidades específicas, ya que la combinación de todas estas características o incluso la incorporación de partes nanoestructuradas en un solo dispositivo nos permite la obtención de herramientas multi-funcionales. Por todo ello, las micro- y nanoherramientas presentadas en esta tesis implican un gran número de aplicaciones como sensores y actuadores en biología celular. O incluso en el futuro estos dispositivos podrán ser aplicados en el campo de la nanomedicina como sistemas de diagnosis y drug delivery. / This thesis presents the design, technological development, characterization and chemical and biological applications of micro- and nanodevices which are focused on being functional tools for cell biology. This research is possible thanks to the recent advances in Micro- and Nanotechnologies, where the application of miniaturization techniques at cell scale is already a reality. These tools are small enough to label and track living embryos or even sense and operate in single living cells in an extra- and intracellular way. Furthermore, one of the most relevant new features of the micro- and nanotools presented in this thesis is the capability of being suspended, meaning that these devices can be released from the wafer and directly interact with cells in their same medium and at cell scale. These micro- and nanotools present different shapes, sizes, materials and specific functionalities, as the combination of these features or even the incorporation of nanostructured parts in a single device can let us obtain multi-tasking devices. Summarizing, the extensive capabilities of the presented micro- and nanotools imply a broad number of applications as sensors and actuators in cell biology. Or even in the near future, these devices can be applied in the nanomedicine field as diagnosis and drug delivery systems.
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Necesidades de personas que han finalizado tratamientos oncológicos en España

Arrighi, Emilia 17 June 2014 (has links)
Objetivo: El objetivo principal fue el de conocer cuáles son las necesidades físicas, psicológicas y sociales que presentan las personas que han finalizado tratamientos oncológicos; además de identificar la necesidad de implementar un plan de seguimiento estandarizado para supervivientes de cáncer. Metodología: Esta es una investigación de tipo descriptiva, trasversal y mixta donde que utilizaron métodos de recogida de la información de tipo cualitativos y cuantitativos, según las distintas fases de realización del estudio. La fase 1 sirvió para la revisión de la literatura científica, durante la fase 2 se desarrolló un estudio cualitativo para conocer la calidad de vida y las necesidades no cubiertas de los supervivientes de cáncer en España. Durante la fase 3, se desarrolló el Cuestionario Español para Medir Necesidades no Cubiertas de Supervivientes de Cáncer (CESC) y en la fase 4 se aplicó este cuestionario a una población de más de 2067 supervivientes. En la fase 5, se desarrolló un estudio cualitativo para conocer las necesidades relativas al plan de seguimiento de los supervivientes de esta enfermedad. Resultados: La fase 2 se centró en la calidad de vida y las necesidades no cubiertas de esta población. Se utilizó metodología cualitativa que incluyó la realización de 9 entrevistas semi-estructuradas con expertos y la realización de 4 grupos focales con la participación de afectados y familiares. Entre los resultados principales, se describe una situación de desorientación en relación al itinerario médico a seguir y sensación de abandono. Advirtieron la permanencia de distintos síntomas físicos, además de necesidades a nivel psicológico, relacionadas con el miedo a una posible recaída, angustia y preocupación por el futuro. La fase 3 tuvo por objetivo construir y evaluar el Cuestionario Español para Medir Necesidades no Cubiertas de Supervivientes de Cáncer (CESC). Se elaboró una versión preliminar con la colaboración de expertos y luego fue sometido a una prueba piloto a una muestra de 109 participantes, a fin de analizar sus propiedades psicométricas. En la fase 4, se aplicó el cuestionario CESC a una muestra de 2067 supervivientes de cáncer que participaron en una encuesta online auto-administrada. Entre los resultados principales se observó que más de la mitad de los participantes reportaron más de una necesidad no cubierta en al menos dos dominios. Las tres necesidades no cubiertas más prevalentes fueron: pérdida de energía y cansancio casi todo el día (64 %), el miedo a la recaída (61 %); además de la angustia, la ansiedad y la preocupación por el futuro (53 %). Los participantes consideraron necesario recibir seguimiento en unidades específicas (p < 0,001), tener una copia del Plan de seguimiento del Superviviente, de fácil comprensión (p < 0,007), además de un contacto telefónico disponible para hacer consultas (p < 0,001). Se constató además, que los participantes con niveles bajos de educación presentaron un mayor riesgo de tener necesidades no cubiertas en los tres dominios (psicológico, social y físico), resultando estadísticamente significativo. En la fase 5 se desarrolló un estudio cualitativo para conocer la información que debería incluir un plan de seguimiento y se organizaron 3 grupos focales: uno con profesionales sanitarios, uno con supervivientes de cáncer y otro con familiares. Entre las conclusiones principales de esta fase se constata la importancia de poder recibir un documento escrito que, además de incluir un resumen de los eventos clínicos, incorpore una valoración de la situación psicosocial del afectado. Conclusiones: Es necesario organizar unidades de atención multidisciplinar que garanticen un seguimiento de aspectos clínicos y psicosociales a través de la implementación de un plan de seguimiento estandarizado. / Aim: To understand the physical, emotional and psychosocial needs of cancer survivors and the need or a follow up plan. Methods: This is a descriptive, transversal and mix method (qualitative and quantitative) research developed in different phases. In phase 1, the scientific literature was reviewed, in phase 2, in order to understand needs and quality of life of cancer survivors a qualitative study was undertaken with the organization of 9 semi-strcutures interview to experts and the organization of 4 focus groups with cancer survivors and caregivers. During phase 3, the aim of the study was the construct and evaluation of the Spanish Questionnaire to Assess Unmet Needs of Cancer Survivors (CESC) which was administrated to a sample of 109 cancer survivors. During phase 4, CESC questionnaire was undertaken to a sample of 2067 cancer survivors who participated in an online self-report survey. Finally, in phase 5 a qualitative study was made in order to understand the characteristic of a survivorship follow up plan. To achieved this, 3 focus groups were organized with the participation of professionals, cancer survivors and caregivers. Results: In phase 2 a qualitative study was conducted in order to understand main needs and quality of life of cancer survivors. Methodology included 9 semi-structured interviews with the participation of experts and the organization of 4 focus groups with cancer survivors and caregivers. Among the main results of this phase, participants described feeling disoriented with regard to the medical process and sense of abandonment. They noted physical symptoms that remained after finishing treatments, along with a variety of psychological needs such as, fear of recurrence, anxiety and concern about the future. The aim of phase 3 was to construct and evaluate the Spanish Questionnaire to Assess Unmet Needs of Cancer Survivors (CESC), that after been was successively evaluated by a panel of experts, was tested by a total of 109 cancer survivors. Its implementation could be useful for referring patients to specific care services. The results, although preliminary, are very encouraging and show good psychometric properties. In phase 4, CESC was undertaken to a sample of 2067 cancer survivors who participated in an online self-report survey. Results showed that more than half of participants had reported more than one unmet need in at least two domains. The three most prevalent unmet needs were: energy loss and tiredness most of the day (64%); fear of recurrence (61%); and grief, anxiety and concern regarding the future (53%). Participants considered it necessary to receive follow up care in specific units (p < 0.001), to have an easily understandable copy of the Survivorship Plan (p < 0.007) and a phone contact available to answer their questions (p < 0.001). Findings suggest a need to enhance follow ups and the provision of supportive care services for survivorship along a continuum of care. In order to understand the type of document patients and professionals needs to follow up care, a qualitative study was conducted in Phase 5. To achieve this, 3 focus groups were organized, one with health professionals; one with cancer survivors and the third, with families and caregivers. Among the key findings, there exist consensus among participants regarding the importance of receiving a written document which include a summary of the most important clinical events. Moreover, to incorporate the systematic assessment of psychological and social needs. Personalized recommendations for nutrition and physical exercise must be included in such document. Conclusions: Survivorship units must be organized, with the participation of multidisciplinary team that ensures clinical and psychosocial follow up through the implementation of a survivorship cancer follow up plan.
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Inequality, Opportunity and Redistribution Three Essays on Institutions and Development in Latin America

Oviedo León, Mónica Juliana 03 December 2015 (has links)
Esta tesis consta de tres ensayos empíricos que abordan algunas dinámicas institucionales y sociales relacionadas con la persistencia de altos niveles de desigualdad y pobreza en América Latina. En el primer ensayo exploro el papel de la expansión de la educación superior en la mejora de la igualdad de oportunidades y la movilidad social. La pregunta central es si la expansión de la oferta contribuye a reducir el impacto de los antecedentes familiares en la probabilidad individual de asistir y completar la educación superior. Uso una metodología cuasi-experimental para analizar la extraordinaria expansión de la oferta de educación superior en Colombia durante los años noventa como caso de estudio. La principal conclusión es que la expansión de la oferta tuvo un efecto positivo en la igualdad de oportunidades en este nivel educativo, ya que aumentó las probabilidades de matricularse y graduarse para individuos de orígenes menos favorecidos. Sin embargo, este efecto positivo estuvo limitado de dos maneras. En primer lugar, el efecto positivo para los estudiantes procedentes de entornos menos acomodados fue impulsado principalmente por la oferta no universitaria, lo que sugiere que fueron desviados a oportunidades educativas consideradas de más bajo estatus por la sociedad colombiana. En segundo lugar, la oferta de las instituciones públicas benefició sobre todo a los estudiantes de orígenes más aventajados y el efecto positivo de los nuevos programas ofrecidos por instituciones públicas tendió a ser proporcional al nivel educativo de los padres, lo que indica la existencia de un trade-off entre eficiencia y equidad en el sistema de educación público. En el segundo ensayo estudio el efecto de las percepciones individuales de corrupción sobre las actitudes hacia la redistribución. La corrupción percibida incide en este tipo de actitudes en tres maneras diferentes. Por un lado, quebranta la confianza en el gobierno, lo que a su vez puede reducir el apoyo popular a la redistribución. Por otra parte, dado que la corrupción socava la igualdad de oportunidades, tanto el deseo oportunista de capturar rentas de la intervención del gobierno, como la demanda por equidad puede aumentar el apoyo a las políticas redistributivas. Con datos de encuestas en 18 países de América Latina, uso un modelo de ecuaciones simultáneas para estimar el efecto de la percepción de corrupción en la probabilidad de apoyar la intervención del Estado para reducir la desigualdad económica y explorar estas tres vías. Los resultados sugieren que percibir un alto nivel de corrupción aumenta el apoyo a las políticas redistributivas. Es decir, los efectos de la búsqueda de rentas y la preocupación por la equidad parecen ser mayores que el efecto negativo sobre la confianza en las instituciones gubernamentales provocados por la corrupción generalizada. Proporciono evidencia preliminar sobre la importancia de cada uno de estos tres canales. Por último, en el tercer ensayo, en coautoría con Roxana Gutiérrez-Romero, analizamos el impacto del tráfico de drogas y la violencia relacionada con las drogas en el desarrollo socioeconómico, usando datos de México a nivel municipal. Construimos una base de datos única para identificar las áreas en las que los cárteles han estado activos con y sin homicidios a través de la recopilación de datos de múltiples fuentes. Utilizando el método de kernel matching en conjunto con diferencias-en-diferencias, encontramos que, por una parte, la desigualdad se redujo en gran medida en las zonas donde los cárteles estaban activos y sin homicidios relacionados con las drogas. Por otro lado, la pobreza aumentó en zonas que tenían tanto las más bajas como las más altas tasas de homicidios relacionados con las drogas. Este aumento de la pobreza podría estar relacionado con el hecho de que, en las zonas más violentas, el número de empleadores y las remuneraciones disminuyeron en industrias clave, tales como las manufacturas. En las zonas menos violentas, la pobreza aumentó posiblemente debido a la emigración de los lugares más violentos. / This dissertation consists of three empirical essays tackling some institutional and social dynamics related with the persistently high levels of inequality and poverty in Latin America. In the first essay, I explore the role of the expansion of higher education in improving equality of opportunity and social mobility. The central question is whether expanding supply contributes to reduce the impact of family background on individuals’ probability of attending and completing higher education. I use a quasi-experimental methodology to analyse the extraordinary expansion of higher education supply in Colombia during the Nineties as case study. The main finding is that expansion of supply had a positive effect on equality of opportunity in higher educational attainment, as it increased the probabilities of enrolling and graduating for individuals of less well-off backgrounds. However, this positive effect was limited in two different ways. First, the positive effect for students from less well-off backgrounds was mainly driven by non-university supply, which suggests they were diverted to educational opportunities considered of lower status by Colombian society. Second, the supply of public institutions mostly benefited individuals from the most advantaged backgrounds and the positive effect of new public degrees tended to be proportional to the parents’ educational level, which signals a trade-off between efficiency and equity in the public education system. In the second essay, I study the effect of individual perceptions of corruption on public attitudes towards redistribution. Perceived corruption shapes such attitudes in three different manners. On the one hand, it undermines trust in government, which in turn may reduce people’s support for redistribution. On the other hand, given that corruption subverts equality of opportunity, both an opportunistic desire to capture rents from government intervention and a demand for fairness may increase people’s support for redistribution. Using survey data for 18 countries in Latin America, I use a simultaneous equation model to estimate the effect of perceptions of corruption on the probability of agreeing with state’s intervention to reduce economic inequality, and explore these three pathways. Results suggest that perceived a high level of corruption enhances support for redistributive policies. That is, rent seeking motives and fairness concerns seem to outweigh the effect of undermined trust in government and political institutions brought about by widespread corruption. I provide preliminary evidence about the importance of each of these three channels in explaining the positive relationship between perceived corruption and support for redistribution. Finally, in the third essay, co-authored with Roxana Gutiérrez-Romero, we analyse the impact of drug trafficking and drug-related violence on socio-economic development, using municipal level data from Mexico. A unique dataset was built to identify the areas where cartels have been active with and without related homicides by gathering data from multiple sources. Using the difference-in-difference kernel matching method, we find that, on the one hand, inequality declined to a large extent in areas where cartels were active without incidents of drug related homicides. On the other, poverty increased in areas that had both the lowest and the highest rates of drug related homicides. This increase in poverty might be related to the fact that in the most violent areas the number of employers and remunerations declined in key industries, such as manufacturing. In the least violent areas poverty increased possibly due to people migrating from the more violent places.
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D’Israel (1929) a Antígona (1939) l’apropiació espriuana de mites bíblics i clàssics, entre la llum i el neguit

Juanmartí i Generès, Eduard 04 December 2015 (has links)
L’apropiació de mites bíblics i clàssics en les primeres obres de Salvador Espriu, des d’Israel (1929) fins a Antígona (1939), respon a les inquietuds fonamentals de l’autor en aquells anys i evoluciona en funció d’aquests interessos. A més, les nocions contraposades de llum i neguit són punts de referència que ajuden a explicar el treball de reelaboració mitològica i, en general, les obres estudiades i l’evolució que hi ha entre elles. Així ho mostra l’anàlisi dels textos següents: Israel (en particular, la “Portada” introductòria i els capítols dedicats als personatges bíblics de Jael, Rut, Elí, Abigail, Abisag, Salomó i Jezabel); Aspectes (en particular, la prosa preliminar i els relats “Auca tràgica i mort del Plem”, “Novembre. Diada de difunts”, “Orestes” i “Neguit”, en els quals es reelaboren, respectivament, els mites de Judit, Hefest, Orestes i Nausica/Ulisses); Ariadna al laberint grotesc (en particular, la prosa preliminar sobre Ariadna, i els relats “Psyche”, “Nabucodonossor” i “Mirra”); l’obra teatral Fedra, versió al català de l’obra castellana homònima de Llorenç Villalonga; la “nouvelle” Fedra, que reelabora l’anterior, i Antígona (la versió de 1939, publicada el 1955). En l’anàlisi es té en compte la tradició literària clàssica, moderna i contemporània associada a cada mite, així com les contaminacions que hi opera l’autor amb obres de la literatura modernista catalana (especialment Joaquim Ruyra, Víctor Català i Joan Maragall) o de la literatura universal (especialment Edgar Allan Poe, però també Gabriele D’Annunzio o Ivan Turguénev). L’eina metodològica a què es recorre és la teoria de la transtextualitat formulada per Gérard Genette en Palimpsestes (1982), on el crític estableix una tipologia de les modificacions que un autor pot operar respecte als textos de referència precedents, la qual és útil per interpretar l’abast i el sentit de les represes espriuanes. Complementàriament, es fa un estudi de les obsessions temàtiques de l’autor, sobretot en dos moments crítics en la construcció de la seva obra. D’una banda, la “nouvelle” Fedra es pot llegir com una síntesi dels temes de la prosa espriuana dels anys trenta: la decadència universal, l’amor com a dominació i com a miratge, l’ànim que es persegueix ell mateix, la síntesi de contraris, el motiu solar i la supervivència en companyia de l’art. D’altra banda, la tragèdia Antígona reprèn alguns d’aquests temes però també en desenvolupa de nous, que seran molt rellevants en el desenvolupament ulterior de l’obra d’Espriu: la guerra fratricida, la pietat, el poder absolut i l’amor a la ciutat. / The appropriation of biblical and classical myths in the first works of Salvador Espriu, from Israel (1929) to Antígona (1939), responds to the author’s basic worries on those years and it evolves according to those concerns. Besides, the opposite ideas of light and restlessness are references to explain the work of mythological remaking and, in general, the studied works and the evolution existing among them. So it is shown in the analysis of these texts: Israel (particularly, the introductory “Portada” and the chapters dedicated to biblical characters of Jael, Ruth, Eli, Abigail, Abisag, Solomon and Jezabel); Aspectes (particularly, the preliminary prose and the stories “Auca tràgica i mort del Plem”, “Novembre. Diada de difunts”, “Orestes” and “Neguit”, in which the myths of Judith, Hephaestus, Orestes and Nausicaa/Ulysses are remade); Ariadna al laberint grotesc (particularly, the preliminary prose about Ariadne, and the stories “Psyche”, “Nabucodonossor” and “Mirra”); the play Fedra, a version to Catalan from the homonymous Spanish work of Llorenç Villalonga; the “nouvelle” Fedra, which is a re-elaboration of the previously refered work, and Antígona (the version of 1939, published in 1955). The analysis considers the classical, modern and contemporany literary tradition associated to each myth, as well as the contaminations applied by the author with works of the Catalan modernists (especially Joaquim Ruyra, Víctor Català and Joan Maragall) or from the universal literature (especially Edgar Allan Poe, but also Gabriele D’Annunzio or Ivan Turguénev). The methodology of this analysis is the theory of transtextuality established by Gérard Genette in Palimpsestes (1982), in which this critic sets up a typology of the modifications that an author can make on the previous texts of reference. This typology is useful to understand the extent and the orientation of the re-elaborations of Espriu. In addition, a study is made on the autor’s thematic obsessions, especially in two critic moments in the construction of his works. On the one hand, the “nouvelle” Fedra can be read as a synthesis of the themes of the Espriu’s prose of the thirties: the universal decadence, the love as a domination and as a mirage, the aim that persecutes itself, the shynthesis of opposites, the image of the Sun and the survival in the company of art. On the other hand, in the tragedy of Antígona, some of these subjects are revisited but some new ones are also developed, which will be very relevant in the farther development of the works of Espriu: the fratricidal war, the compassion, the absolute power and the love to the city.
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Frederic Mompou: música i pensament. La fluïdesa de l’ésser i la creativitat musical (1893-1987)

Pla i Garrigós, Adolf 04 December 2015 (has links)
La música de Frederic Mompou (1893-1987) ha viscut en una paradoxa: d'una banda la seva estètica ha estat difícil de situar al segle XX, ha tingut poca visibilitat en els repertoris del concertisme internacional i en els àmbits acadèmics de formació pianística. Alhora, ha estat el compositor, o un dels dos o tres compositors, que ha generat més bibliografia de tota la història de la música espanyola, interès que ha anat creixent en els darrers anys del segle XX i principis de segle XXI. El contingut de la tesi neix de la hipòtesi que aquesta circumstància ve donada per un dèficit d'anàlisi i d'informació del pensament del compositor en relació a la seva creativitat musical. Per aquesta raó, la tesi analitza el vincle d'aquests dos àmbits a través del qual podem obtenir respostes a aquesta circumstància paradoxal i obtenir conclusions que amplien la visió interpretativa de la naturalesa creativa i de l'estil compositiu del compositor. La tesi demostra el vincles estrets entre la música i el pensament de Mompou, analitza els aspectes en els quals es manifesta i concreta els elements morfològics musicals on queden constatats. El contingut de la recerca posa en relació tres àmbits diferenciats: les vivències, el pensament i la música. El redactat de la tesi s'estructura en tres capítols titulats Impressions, Reflexions i Expressions. El primer capítol, Impressions, és el més breu, i de manera introductòria, analitza les vivències que van influir en la manera de pensar del compositor, el segon capítol, Reflexions, analitza i posa al descobert el pensament filosòfic, estètic i el pensament sobre la interpretació al piano, i el tercer capítol, Expressions, analitza fragments de les seves partitures per a piano, en els quals trobem reflectit l’essència del pensament del compositor. Un dels aspectes rellevants de la tesi és l'aportació de documentació manuscrita original, no publicada i poc coneguda, que constata l'interès de Frederic Mompou pels conceptes filosòfics existencials que es remunten a la seva joventut. També aporta documentació original manuscrita desconeguda sobre la seva faceta poètica i manuscrits que combina petites composicions musicals amb textos poètics breus. De la documentació original utilitzada també cal destacar l'epistolari personal i el de la seva família i amics, al qual hem pogut tenir accés. Les anàlisis musicals obtinguts en relació al pensament de Frederic Mompou, demostren que la seva estètica i el seu estil compositiu ve determinat pel que podem anomenar "un estat de fluïdesa conscient", que va trobar en l'acció de fluir, una semiòtica musical coherent d'acord a la seva personalitat, la seva naturalesa artística i el seu pensament. Aquest fet el situa en una posició d'outsider en el context de la música d'Occident del segle XX i ens convida a fer una ampliació de com hem d'interpretar la seva obra i la seva ubicació estètica en el present. / The music of Frederic Mompou (1893-1987) has existed in a paradox: on one hand it’s aesthetics has been difficult to locate within the 20th century, having little visibility in the international concert repertory and in the academic training of pianists, and on the other hand he has been the composer, or at least one of the two or three, who has generated the most bibliography in the history of music in Spain. The interest in this composer has been growing in the last years of the twentieth and first years of the twenty-first centuries. The content of the thesis begins from the hypothesis that there is a deficit in both analysis and information about the composer’s thinking in relation to his musical creativity. For this reason the thesis analyzes the connection of these two aspects through which we can obtain answers to this paradoxical circumstance and arrive at conclusions that enhance the interpretive vision of the creative nature and compositional style of the composer. The thesis demonstrates the close ties between Mompou’s music and thought, analyses the aspects in the ways they manifest, and defines the musical morphological elements that remain constant. The content of the research relates three different aspects: life experience, thinking, and music. The thesis is structured in three chapters titled Impressions, Reflections, and Expressions. The first chapter, Impressions, is the shortest, and serves as an introduction, analyzing the life experience that has influenced the composer’s way of thinking. The second chapter, Reflections, analyses and exposes the philosophical thought, aesthetic, and piano interpretation. The third chapter, Expressions, analyses excerpts of his piano scores in which we find reflected the essence of the composer’s thought. One of the relevant aspects of the thesis is the contribution of little known, previously unpublished original manuscript documentation that proves Frederic Mompou’s interest in philosophical concepts that date back to his youth. It also brings to light his poetic interest and manuscripts where he combines short musical compositions with brief poetic texts. From the original documentation used it is important to highlight his personal correspondence, as well as that of his family and friends, to which we have had access. The musical analysis obtained in relation to Mompou’s thought show that his aesthetic and his compositional style are determined by what we could call “a state of conscious fluidity,” which has found its way to a musical semiotic that corresponds to his personality, to his artistic nature, and to his thought. This fact puts him in a position of the “outsider” in the context of Western music of the twentieth century and invites us to expand how we should interpret his music and further define his aesthetic placement in the present.
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Functional and structural analyses of the terminal organelle of Mycoplasma genitalium

González González, Luis 04 December 2015 (has links)
Mycoplamsa genitalium es un patógeno humano causante de uretritis no gonocócica y no causada por clamidias en hombres y de enfermedad pélvica inflamatoria y cervicitis. Los micoplasmas, además de ser muy interesantes para el estudio como células mínimas (dado el pequeño tamaño de su genoma), también presentan características únicas sólo presentes en este género. En particular, se ha detectado la presencia de mecanismos de adhesión y de motilidad, que además de estar implicados en el mecanismo de infección, sólo se encuentran en este género. En especial, el mecanismo de motilidad de M. genitalium consta de una estructura polar que contiene un característico citoesqueleto. Se conoce que este citoesqueleto está formado por varias proteínas implicadas en el proceso de adhesión y motilidad. En los tres primeros capítulos de esta tesis se ha determinado el papel de tres de estas proteínas: MG219, MG318 (también llamada P32) y MG386. El estudio se ha realizado gracias a la obtención de mutantes defectivos de estas proteínas. La proteína MG219 se ha hallado que es necesaria para el correcto funcionamiento de la maquinaria de motilidad de este organismo. Mediante fusión a proteínas fluorescentes se ha determinado la localización subcelular de esta proteína, que resulta localizar en la parte más cercana de la organela terminal respecto al cuerpo celular. Las células en ausencia de MG219 se mueven a una velocidad inferior a la mitad (y la mitad de frecuentemente) que las células de la cepa salvaje. Esta reducción de la velocidad es concomitante con la aparición de un mayor número de células en división y con múltiples organelas terminales. De una manera similar, las células de la cepa que carece la proteína P32 se mueven a velocidades inferiores (y con la mitad de frecuencia) que las células de la cepa salvaje. Además, se ha determinado que el N-terminal de P32 juega un papel importante en la estabilidad de las proteínas P110 y P140, las más importantes adhesinas de M. genitalium. También se ha establecido que la proteína P32 es crítica para la morfología de la parte más distal de la organela terminal. El último mutante generado en este trabajo, el defectivo para la proteína MG386, presenta importantes variaciones tanto a nivel de morfología celular como de motilidad. Las células de esta cepa presentan motilidad la mitad de frecuentemente que la cepa salvaje pero se mueven a una velocidad 1.7 veces superior. Sorprendentemente, esta cepa presenta un gran número de organelas terminales desancladas del cuerpo celular, sugiriendo un importantísimo papel de la proteína MG386 en el anclaje de la organela terminal al cuerpo celular. Se ha observado que la membrana alrededor del citoesqueleto se encuentra completamente recubierta por el complejo de adhesión o ‘nap’. Mediante estudios de microscopia electrónica se ha determinado la estructura a 3.5 nm por ctomografia crioelectrónica y a 1.9 nm por tinción negativa. Además, la tomografía crioelectrónica también ha desvelado la estructura a baja resolución del botón terminal del citoesqueleto, revelando que las placas que forman la mayor parte del citoesquelto son, en realidad, anillos de unos 20 nm de diámetro. Además, se han analizado por tomografía crioelectrónica 14 mutantes que carecen de diferentes proteínas (o dominios de éstas) relacionadas con motilidad y/o adhesión. El conjunto de todos estos datos aporta una visión global al conocimiento previo (y al generado en este trabajo) sobre el papel de las proteínas implicadas motilidad y formación del citoesqueleto de M. geniatlium. / Mycoplamsa genitalium is a human pathogen and the causative agent of non-gonococcal non-chlamydial urethritis in men and pelvic inflammatory disease and cervicitis. Mycoplasmas, besides being interesting as minimal cells (given the small size of its genome), also have unique features only present in its genus. In particular, the presence of mechanisms of adhesion and motility has been detected, and in addition of being involved in addition of being involved in the infection mechanism, are only found in this genus. In particular, the mechanism of motility of M. genitalium involves a polar structure containing characteristic cytoskeleton. It is known that the cytoskeleton is composed of several proteins involved in the adhesion and motility processes. In the first three chapters of this thesis dissertation the role of three of this proteins—MG219, MG318 (also called P32) and MG386—has been stablished. The study was conducted by obtaining null mutants strains of these proteins. The MG219 protein has been found to be necessary for the proper functionality of the motility machinery. By fusion to fluorescent proteins it has been determined the subcellular localization of this MG219, which located at the nearest part of the terminal organelle relative to the cell body. Cells in the absence of MG219 move slower than half speedy (and half frequently) the cells of the wild type strain. This speed reduction is concomitant with the appearance of a greater number of dividing cells and cell with multiple terminal organelles. In a similar manner, cells of the strain lacking P32 move at lower speeds (and with half also half frequently) than cells of the wild type strain. Furthermore, it has been determined that the N-terminal P32 plays an important role in protein stability P110 and P140, the major adhesins of M. genitalium. It has also been established that the P32 protein is critical to the morphology of the most distal part of the terminal organelle relative to the cell body. The last mutant generated in this work, the null mutant for MG386, presents significant alterations in both cell morphology and motility. The cells of this strain show motility half frequently than the wild type strain but move to a velocities as greater as1.7 times than the reference strain. Surprisingly, this strain has a high number of terminal organelles detached from the cell body, suggesting an important role of protein MG386 anchoring the organelle to the cell body. It has been observed that the membrane around the cytoskeleton is completely covered by the adhesion complex or "nap". By electron microscopy studies it has determined the structure by cryo-electron tomography at 3.5 nm and at 1.9 nm single particle by negative staining TEM of the purified P110 and P140 complex. Additionally, cryo-electron tomography also allowed to determine at low resolution the structure of the terminal button of the cytoskeleton, revealing that the plates forming most of the cytoskeleton are actually rings about 20 nm in diameter. In addition, 14 mutants lacking different proteins (or domains thereof) related to motility and / or adhesion have been analysed by cryo-electron tomography. All these data taken together provides an overview of the prior knowledge—in addition to the data generated in this work—of the role of the proteins involved motility and cytoskeleton formation in M. geniatlium.
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Estratificación de riesgo de pacientes ambulatorios con insuficiencia cardíaca

Ribas Pizá, Nuria 18 June 2014 (has links)
Hipótesis: La estimación del riesgo de muerte puede optimizar el manejo de los pacientes ambulatorios con insuficiencia cardíaca (IC). Objetivos: Analizar el patrón cronobiológico de muerte de estos pacientes, y desarrollar un modelo predictivo de mortalidad que mejore la estimación del riesgo. Métodos: Se han recogido, de manera prospectiva, variables demográficas, clínicas, bioquímicas y ecocardiográficas de dos cohortes diferentes de pacientes ambulatorios con IC. La “cohorte UIC- Sant Pau”, está formada por 1233 pacientes controlados en la Unidad de Insuficiencia Cardíaca del Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, entre los años 2003 y 2008. Y, la “cohorte REDINSCOR”, está constituida por 1293 pacientes del registro REDINSCOR (Red Nacional de Insuficiencia Cardíaca en España). Estudio observacional prospectivo realizado con pacientes de 18 hospitales españoles diferentes, incluidos entre los años 2007 y 2011. A partir de la “cohorte UIC- Sant Pau”, en primer lugar, se realiza un análisis retrospectivo para describir la distribución de muerte de los pacientes según el patrón circadiano, día de la semana, mensual y estacional (cronobiología). Posteriormente, con 653 pacientes de esta misma cohorte (se excluyen los pacientes incluidos simultáneamente en la “cohorte REDINSCOR”), se define la “cohorte UIC Sant Pau reducida” como cohorte de derivación para desarrollar modelos predictivos de muerte a 1 y 4 años. Aplicamos métodos estadísticos tradicionales (regresión de Cox) y métodos basados en la utilización de árboles de clasificación y regresión (Classification and regression tree analysis – CART) como técnica alternativa a los métodos estadísticos tradicionales. Comparamos el rendimiento predictivo de los modelos obtenidos por regresión de Cox y por análisis de CART. Finalmente realizamos dos tipos de validación de los modelos predictivos obtenidos. Una interna, por validación cruzada. Y una validación externa, aplicando los modelos obtenidos a la muestra de validación (“cohorte REDINSCOR”). Resultados: En la cohorte UIC- Sant Pau los pacientes no presentaron picos de mortalidad circadianos ni dependientes del día de la semana. Se observa un marcado pico de mortalidad en invierno. Los modelos predictivos obtenidos por regresión de Cox y análisis de CART muestran una capacidad discriminatoria muy similar. El modelo CART de predicción de muerte a 1 año utiliza sólo tres variables (NT-proBNP, edad y score clínico) para clasificar a los pacientes en grupos de alto, intermedio y bajo riesgo de mortalidad. Tiene una notable precisión predictiva (AUC: 0,72; IC(95%): 0,67-0,77), reproducida cuando el modelo se aplica a la cohorte de validación ( AUC: 0,67; IC(95%): 0,62-0,71) (p= 0,12). El árbol CART de predicción de muerte a 4 años, con las variables NT-proBNP, score clínico y sodio, discrimina a los pacientes en los tres grupos de riesgo. Su precisión predictiva es buena (AUC: 0,70; IC(95%): 0,66-0,74), y también se reproduce al aplicarla a la cohorte de validación (AUC: 0,66; IC(95%): 0,63-0,70) (p= 0,23). Conclusiones: La mortalidad de los pacientes ambulatorios con IC no sigue el patrón circadiano observado en la población general para eventos cardiovasculares. Sí se detecta un ritmo estacional con mayor mortalidad en invierno. Proponemos nuevos modelos pronósticos de muerte a 1 y 4 años, fáciles de implementar e interpretar, que quizás ayuden a progresar en el estudio, manejo y pronóstico de estos pacientes. / Hypothesis: Risk of death estimation can optimize the management of ambulatory patients with heart failure (HF). Objectives: To determine the chronobiology of death in these patients, and develop a mortality predictive model that improves the estimation of risk. Methods: Prospectively, demographic, clinical, biochemical and echocardiographic variables of two ambulatory HF patients cohorts were collected. The UIC-Sant Pau cohort consists of 1233 patients and they were controlled at the Hospital de la Santa Creu i Sant Pau HF unit from 2003 till 2008. The REDINSCOR cohort consists of 1293 patients from the REDINSCOR registry (National network of HF in Spain). Prospective observational study conducted with patients of 18 different Spanish hospitals that were included between 2007 and 2011. Firstly, we did a retrospective analysis to describe the distribution of patients death according to the circadian pattern, day of the week, monthly and seasonal (chronobiology) from the UIC - Sant Pau cohort. Subsequently, with 653 patients of the same cohort (excluding patients included simultaneously in the REDINSCOR cohort), we defined the UIC Sant Pau reduced cohort as a derivation cohort to develop predictive models of death at 1 and 4 years. We applied traditional statistical methods (Cox regression) and methods based on the use of Classification and regression tree analysis (CART) as an alternative to traditional statistical methods. We compared the predictive performance of the models obtained by Cox regression and CART analysis. Finally, we performed two types of validation of the obtained predictive models: an internal cross-validation and an external validation, by applying the models obtained to the sample of validation ("REDINSCOR cohort"). Results: In the UIC Sant Pau cohort patients did not show circadian or dependent on the day of the week mortality peaks. There is a marked mortality peak during the winter season. Predictive models obtained by Cox regression and analysis of CART showed a very similar discriminatory capacity. Prediction of death at 1 year CART’s model uses only three variables (NT-proBNP, age and clinical score) to classify patients into groups of high, intermediate and low risk of mortality. It has remarkable predictive accuracy (AUC: 0.72; 95% CI: 0,67-0,77), reproduced when the model is applied to the validation cohort (AUC: 0.67; 95% CI: 0,62-0,71) (p=0.12). CART's prediction model of death at 4 years, uses the NT-proBNP, clinical score and sodium variables, to discriminate patients in the three risk groups. Its predictive accuracy is good (AUC: 0.70; 95% CI: 0,66-0,74), and is also reproduced when applied to the validation cohort (AUC: 0.66; 95% CI: 0,63-0,70) (p=0.23). Conclusions: The mortality of ambulatory HF patients does not follow the circadian pattern observed in the general population for cardiovascular events, but a seasonal rhythm with higher mortality in winter is detected. We propose new predictive mortality models at 1 and 4 years, easy to implement and interpret. That may help to advance in the study, management, and prognosis of ambulatory patients with heart failure.
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Significado del trabajo y sentido de la profesión en la academia. Un estudio en el contexto colombian

Romero Caraballo, Martha Patricia 07 October 2015 (has links)
Introducció. La investigació va estar emmarcada en el context de les transformacions del treball, especialment del situat a l'acadèmia. El seu focus d'anàlisi va ser la configuració del significat del treball i del sentit de la professió en un col·lectiu de professorat universitari colombià. Es va desenvolupar en dues parts: un marc teòric i un estudi empíric. La primera va consistir en una aproximació general al constructe treball i en una descripció dels canvis en les seves condicions de realització, així com de la seva relació amb el benestar laboral. Sobre aquesta base, va ser analitzada la metamorfosi de la universitat -especialment la irrupció del capitalisme acadèmic-. I també les seves repercussions en el significat del treball i en el sentit de la professió del professorat docent-investigador, entès en termes de professionalisme acadèmic. Mètode. Per a l’estudi empíric, es va aplicar un disseny mixt que va permetre la combinació de diverses tècniques de recollida d'informació: Les dades quantitatives van ser col·lectades mitjançant un qüestionari d'avaluació de condicions de treball, càrrega de treball, benestar laboral, burnout i engagement. Aquest qüestionari va ser aplicat a grups de professors pertanyents a diverses universitats colombianes elegits amb criteris de representativitat teòrica. La informació qualitativa va ser obtinguda a través de dues vies: En primer lloc, mitjançant una sèrie de preguntes obertes incloses en el mateix qüestionari. Entre elles figura la que convida als participants a definir la seva experiència laboral mitjançant 5 paraules clau. Aquesta informació es va complementar amb l'obtinguda mitjançant una entrevista grupal semiestructurada. Per a l'estudi de les dades quantitatives van ser aplicats estadístics descriptius i anàlisi de correspondències. Per al tractament de la informació qualitativa van ser utilitzades tècniques d'anàlisi textual i d'anàlisi de contingut, així com mapes d'associació d'idees. Resultats. Els professionals enquestats van expressar numèricament una moderada satisfacció amb les seves condicions de treball a l'acadèmia. Aquesta visió es va corroborar i matisar amb la informació lèxica i textual. La informació obtinguda del professorat investigat evidencià certes tendències generals a la configuració del significat del treball acadèmic realitzat en condicions laborals flexibles. Entre els elements sortints d'aquesta configuració va destacar cert malestar associat a la percepció de sobrecàrrega de treball, de precarització de les condicions contractuals i de pèrdua de vincle identitari amb l'acadèmia. Això es va reflectir especialment a través de les anàlisis de correspondències i de l'anàlisi de contingut de mapes d'associació d'idees. D'altra banda, l'anàlisi de correspondències va descobrir components positius del sentit de la professió, entre els quals destaquen els relatius a entrega, dedicació i compromís amb les tasques acadèmiques i un notable sentit del professionalisme associat a la vocació docent. Conclusions. Les anàlisis de correspondències van mostrar una configuració del significat del treball i del sentit de la professió acadèmica incloent dues cares contraposades: benestar i malestar. El professorat universitari colombià investigat va pensar el seu treball i la seva professió per una banda en termes de realització personal i d'exercici responsable docent i investigador. I per un altre es va mostrar preocupat per la fragmentació del seu treball i per la pressió a competir, especialment en el camp de la investigació, per exigències de la nova gestió acadèmica. Aquesta tensió entre el sentit de la professió i els imperatius del nou ordre acadèmic va ser viscuda com a font d'estrès psicosocial afectant la pròpia qualitat de vida laboral i també la qualitat del treball realitzat. Aquestes observacions assenyalen uns problemes que cal prevenir i uns desafiaments que cal afrontar. / Introducción. La investigación estuvo enmarcada en el contexto de las transformaciones del trabajo, en especial del situado en la academia. Su foco de análisis fue la configuración del significado del trabajo y del sentido de la profesión en un colectivo de profesorado universitario colombiano. Se desarrolló en dos partes: un marco teórico y un estudio empírico. La primera consistió en una aproximación general al constructo trabajo y en una descripción de los cambios en sus condiciones de realización, así como de su relación con el bienestar laboral. Sobre esta base, fue analizada la metamorfosis de la universidad –en especial la irrupción del capitalismo académico-. Y también sus repercusiones en el significado del trabajo y en el sentido de la profesión del profesorado docente-investigador, entendido en términos de profesionalismo académico. Método. Para estudio empírico, se aplicó un diseño mixto que permitió la combinación de diversas técnicas de recogida de información: Los datos cuantitativos fueron colectados mediante un cuestionario de evaluación de condiciones de trabajo, carga de trabajo, bienestar laboral, burnout y engagement. Este cuestionario fue aplicado a grupos de profesores pertenecientes a diversas universidades colombianas elegidos con criterios de representatividad teórica. La información cualitativa fue obtenida a través de dos vías: En primer lugar, mediante una serie de preguntas abiertas incluidas en el mismo cuestionario. Entre ellas figura la que invita a los participantes a definir su experiencia laboral mediante 5 palabras clave. Esta información se complementó con la obtenida mediante una entrevista grupal semiestructurada. Para el estudio de los datos cuantitativos fueron aplicados estadísticos descriptivos y análisis de correspondencias. Para el tratamiento de la información cualitativa fueron utilizadas técnicas de análisis textual y de análisis de contenido, así como mapas de asociación de ideas. Resultados. Los profesionales encuestados expresaron numéricamente una moderada satisfacción con sus condiciones de trabajo en la academia. Esta visión se corroboró y matizó con la información léxica y textual. La información obtenida del profesorado investigado evidenció ciertas tendencias generales a la configuración del significado del trabajo académico realizado en condiciones laborales flexibles. Entre los elementos salientes de esta configuración destacó cierto malestar asociado a la percepción de sobrecarga de trabajo, de precarización de las condiciones contractuales y de pérdida de vínculo identitario con la academia. Ello se reflejó especialmente a través de los análisis de correspondencias y del análisis de contenido de mapas de asociación de ideas. Por otra parte, el análisis de correspondencias descubrió componentes positivos del sentido de la profesión, entre los que destacan los relativos a entrega, dedicación y compromiso con las tareas académicas y un notable sentido del profesionalismo asociado a la vocación docente. Conclusiones. Los análisis de correspondencias mostraron una configuración del significado del trabajo y del sentido de la profesión académica incluyendo dos caras contrapuestas: bienestar y malestar. El profesorado universitario colombiano investigado pensó su trabajo y su profesión por un lado en términos de realización personal y de ejercicio responsable docente e investigativo. Y por otro se mostró preocupado por la fragmentación de su trabajo y por la presión a competir, especialmente en el campo de la investigación, por exigencias de la nueva gestión académica. Esta tensión entre el sentido de la profesión y los imperativos del nuevo orden académico fue vivida como fuente de estrés psicosocial afectando la propia calidad de vida laboral y también la calidad del trabajo realizado. Estas observaciones señalan unos problemas que hay que prevenir y unos desafíos que cabe afrontar. / Introduction. The research was framed in the context of the transformation of work, especially the located in the academy. Their focus was the analysis of the configuration of the meaning of work and the sense of the profession in a group of Colombian university teachers. It was conducted in two parts: a theoretical framework and an empirical study. The first was to construct a general approach to work and a description of changes in their conditions of implementation, as well as their relationship with the labor wellbeing. On this basis, it was analyzed the metamorphosis of the university, especially the emergence of academic-capitalism, and also their impact on the meaning of work and the sense of the profession of teaching and research, understood in terms of academic professionalism. Method. Quantitative data were collected through a questionnaire assessing working conditions, workload, work wellbeing, burnout and engagement: for empirical study, a mixed design that allowed the combination of different data collection techniques applied. This questionnaire was administered to groups of teachers from various Colombian universities chosen by criterion of theoretical representativeness. Qualitative information was obtained through two ways: First, through a series of open questions in the same questionnaire. These include which invites participants to define their work experience with five keywords. These data were supplemented with information obtained through a semistructured group interview. To study the quantitative data were applied descriptive statistics and correlation analysis. For the treatment of qualitative information they were used techniques of textual analysis and content analysis, as well as maps of association of ideas. Results. The surveyed professionals expressed numerical moderate satisfaction with their working conditions at the academy. This view was corroborated and nuance to the lexical and textual information. The information obtained from teachers investigated showed some general trends to the configuration of the meaning of academic work in flexible working conditions. Among the salient elements of this configuration highlighted some discomfort associated with the perception of work overload, of precarious contractual conditions and loss of identity links with academia. This was especially reflected through correspondence analysis and content analysis of maps of association of ideas. Moreover, correlation analysis found positive components of sense of profession, most notably those relating to commitment, dedication and engagement to academic work and a remarkable sense of professionalism associated with the teaching vocation. Conclusions. The correspondence analysis showed a configuration of the meaning of work and the meaning of the academic profession which included two opposing sides: wellbeing and discomfort. The investigated Colombian university teachers thought their work and profession on the one hand in terms of personal fulfillment and responsible exercise in teaching and research. And on the other they were concerned by the fragmentation of their work and the pressure to compete, especially in the field of research, due to requirements of the new academic management. This tension between the sense of the profession and the imperatives of the new academic order was lived as a source of psychosocial stress affecting one's quality of working life and quality of work performed. These observations indicate a need to prevent problems and challenges which should be addressed.
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Genotipado de las especies de Leishmania y variabilidad intraespecífica de L. infantum. Aportaciones al diagnóstico molecular y a la epidemiología de las leishmaniosis

Tomás Pérez, Míriam 06 February 2015 (has links)
Los trabajos presentados en esta tesis doctoral se han basado en el uso, diseño y optimización de herramientas moleculares para facilitar el diagnóstico de las leishmaniosis humanas y de reservorios animales, así como para favorecer el conocimiento del agente causal a nivel interespecífico e intraespecífico. Para el tipado interespecífico de Leishmania spp se ha optimizado un método basado en la lectura del tamaño de fragmentos marcados con fluorescencia, metodología denominada PCR-FFL (PCR-Fluorescent Fragment Length analysis). No sólo se han buscado mejoras en la técnica analítica, sino también en la sensibilidad evaluando la capacidad discriminatoria de la PCR-FFL sobre dos dianas distintas, las secuencias ribosómicas ITS-1 y 7SL, obteniéndose mejores resultados en cuanto a sensibilidad sobre 7SL. La comparación con la metodología clásica de PCR-RFLP nos ha permitido observar que a nivel metodológico la PCR-FFL presenta ventajas importantes, como la simplicidad y exactitud en la lectura de los resultados, gracias a la automatización del análisis. El uso de la PCR-FFL con ambas dianas sobre biopsia de piel o bien utilizando papeles de filtro representa una buena metodología para el diagnóstico y tipado interespecífico por su especificidad, exactitud, objetividad, elevada sensibilidad y rapidez en la obtención de los resultados. La aplicación de metodologías moleculares en estudios epidemiológicos se ha dirigido a la detección de Leishmania en dos especies de erizos presentes en la zona de alta endemia de M’sila (Argelia): Atelerix algirus y Paraechinus aethiopicus, con el objetivo de determinar su papel como posibles nuevos reservorios del parásito. El estudio serológico ha revelado contacto pasado o reciente con el parásito. La posterior detección de ADN de Leishmania en estos animales mediante una qPCR de género de alta sensibilidad nos ha permitido confirmar la infección activa de los erizos en el momento del estudio. El genotipado de Leishmania sobre muestra se ha determinado mediante PCR-FFL, permitiendo identificar la especie L. major en una muestra de piel de los erizos estudiados. Para aumentar la sensibilidad del análisis, se ha realizado una doble amplificación mediante nested-PCR que ha permitido la identificación de L. major en todas las muestras restantes. Estos resultados han señalado por primera vez la existencia de L. major en erizos, y el papel de éstos como posibles reservorios de esta especie en el área estudiada. El tercer objetivo de nuestro estudio ha consistido en analizar la diversidad intraespecífica de Leishmania infantum en sucesivos aislados del parásito obtenidos de pacientes co-infectados con Leishmania/VIH que presentan recaídas clínicas después del tratamiento, mediante el análisis de 20 microsatélites considerados polimorfos para L. infantum. El análisis de 25 aislados ha permitido detectar 18 genotipos distintos, indicando una gran diversidad a pesar de proceder de 8 pacientes co-infectados del área metropolitana de Barcelona. El bajo número de genotipos repetidos detectado ha indicado una baja proporción de recaídas clínicas entre los pacientes, no siendo las reinfecciones la única hipótesis, sino considerando otras posibilidades sobre el comportamiento del parásito en el hombre y la posible selección en los cultivos de laboratorio. En algunos casos, el análisis filogenético ha señalado una distancia genética próxima entre los aislados de un mismo paciente, que puede ser relacionado con mutaciones del parásito. La posibilidad de la infección mediante el uso de jeringas contaminadas ha sido considerada otra posible fuente de transmisión. / The work presented in this thesis is based on the design, use and optimization of molecular tools to improve the diagnosis of human leishmaniasis and the reservoir hosts, as well as to promote knowledge of the causal agent at interspecific and intraspecific levels. The optimization of interspecific typing of Leishmania spp is based on a fluorescent fragment length analysis methodology called PCR-FFL. The sensitivity of the technique was evaluated on two different targets, the ITS-1 and 7SL sequences, with high sensitivity observed in both sequences, particularly 7SL. Compared with PCR-RFLP methodology, the automated PCR-FFL analysis proved simpler and allowed more accurate readings of the results. The use of PCR-FFL with both targets on skin biopsies or filter papers is a good methodology for interspecific typing of Leishmania. Molecular techniques are usually applied for epidemiological purposes to identify new reservoir hosts. Our study is based on the detection of Leishmania in two hedgehog species of the highly endemic area of M'sila (Algeria), in order to determine their role as potential new reservoir hosts of the parasite. A serological study revealed contact with the parasite, and detection of Leishmania DNA by qPCR allowed us to confirm active infection. Genotyping of Leishmania was determined by PCR-FFL, and the species L. major was identified in one skin sample. A nested-PCR allowed the identification of L. major in all remaining samples. These results have revealed, for the first time, the existence of L. major in hedgehogs, and their role as potential reservoirs of this species. Molecular techniques were also used for the intraspecific analysis of Leishmania infantum in 25 successive isolates from 8 co-infected Leishmania/HIV patients with clinical relapses after treatment. The analysis of 20 polymorphic microsatellites for L. infantum indicated high genotype diversity with 18 genotypes, only 3 of which were repeated. Clustering and phylogenetic analysis allowed the evolution of the infection to be studied, revealing cases of confirmed relapse, parasite evolution in the patients, mixed infections followed by differential selection by the parasite culture, and reinfection.
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Compostos de remi i tecneci pel desenvolupament de radiofàrmacs de segona generació

Lecina Vicente, Joan 20 December 2012 (has links)
Aquesta tesi doctoral es troba dividida en tres parts corresponents a les tres línees d’investigació que s’ha desenvolupat: (a) Complexos de reni i Ciprofloxacina; (b) Síntesi de radiofàrmacs de 2a generació d’elevada activitat específica; i (c) Estudi de la interacció de les metal·lotioneines de mamífer amb el fragment fac-{M(CO)3} (M =Re, Tc) (a) S’ha provat de descobrir el mecanisme d’actuació del radiofàrmac experimental 99mTc-Ciprofloxacina. L’anàlisi de l’activitat antibacteriana dels compost homòleg amb reni ha demostrat que les propietats antibiòtiques del complex estan lligades al caràcter làbil del seu enllaç. Amb conseqüència, s’ha proposat un mecanisme d’actuació del radiofàrmac que està d’acord amb les dades experimentals tant de la present tesi doctoral com les publicades fins el moment.(b) Els resultats obtinguts han demostrat que és possible l’aplicació de la metodologia proposada, basada en la reacció de transmetal·lació de complexos de zinc poc solubles en aigua. Els elevats valors de puresa radioquímica dels complexos de tecneci-99m sintetitzats, tenint en compte la baixa solubilitat de la biomolècula, demostren la viabilitat del mètode ja que s’aconsegueix disminuir un ordre de magnitud la relació entre biomolècula marcada i no marcada respecte dels mètodes actuals. (c) L’estudi de la interacció de les metal·lotioneïnes MTs amb els fragments carbonil, ha demostrat ser una bona alternativa als mètodes sintètics convencionals emprats avui dia en la preparació d’agents quelants de tecneci. L’obtenció per primer cop de l’estequiometria d’un compost Tc-MTs, obre la porta tant a la preparació de radiofàrmacs mitjançant la fusió de les MTs a altres proteïnes (Tc-MT-Biomolècula) com també a la possibilitat de marcatge i estudi in vivo d’aquestes. / This thesis is divided into three parts corresponding to the three lines of research that has been developed: (a) Ciprofloxacin and rhenium complexes; (b) 2nd Generation Synthesis of radiopharmaceuticals with high specific activity; and (c ) Study of the interaction of mammalian Metallothioneins with fragment fac-{M(CO)3} (M = Re, Tc) (a) It has tried to explore the action mechanism of experimental radiopharmaceutical 99mTc-Ciprofloxacina. Analysis of the antibacterial activity of the homologous rhenium compound has shown that the antibiotic properties of the complex are related to the labile nature of their bond. In consequence, it has been proposed a mechanism of action for the radiopharmaceutical that it is in agreement with the experimental data. (b) The results have shown that it is possible to apply the proposed methodology, based on transmetallation step reaction of zinc complexes poorly soluble in water. The high values of radiochemical purity of technetium-99m complexes synthesized, taking into account the low solubility of the biomolecules, it demonstrate the feasibility of the method, since the relation between labeled and unlabeled biomolecule decrease one order of magnitude compared with the currently methods. (c) The study of the interaction between Metallothioneins MTs and carbonyl fragments has proved a good alternative to the conventional synthetic methods, which are currently used in the preparation of technetium chelating agents. For the first time it has been obtained the stoichiometry of a compound Tc-MTs, opening the door for the preparation of radiopharmaceuticals through the fusion of MT to other proteins (Tc-MT-biomolecules), as well as the possibility of labeled MTs for in vivo studies

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