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Concentração de resveratrol e expressão de resveratrol sintase em espécies de Arichis

Carvalho, Paula Andréa Sampaio de Vasconcelos [UNESP] 26 April 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-26Bitstream added on 2014-08-13T18:00:49Z : No. of bitstreams: 1 000753267.pdf: 1148159 bytes, checksum: e46fd3be4a1e5a94f82f31452ef03554 (MD5) / O resveratrol é uma fitoalexina produzida em função de estresses bióticos e abióticos e foi encontrado em um número limitado de espécies de plantas, incluindo o amendoim (Arachis hypogaea) e seus parentes silvestres. Este tem também propriedades antioxidantes e em função disso é um promissor antitumoral, cardioprotetor e neuroprotetor. O amendoim é um alotetraploide de constituição genômica AB sendo A. ipaënsis e A. duranensis os doadores de seus genomas B e A, respectivamente. Estudos prévios demonstraram que algumas espécies silvestres do gênero Arachis produzem resveratrol e que ampla variabilidade genética para diferentes características existe entre acessos das espécies silvestres, incluindo ampla variação nos níveis de resistência a doenças fúngicas e nematoides. Portanto, a avaliação de um maior número do gênero e a investigação da variação da produção de resveratrol também entre acessos é fundamental para uma exploração mais adequada das espécies silvestres do gênero Arachis. O melhor entendimento das causas da variação na produção de resveratrol sem dúvida contribuirá para o uso das mesmas e o primeiro passo para esse entendimento sem duvida passa pela identificação do padrão de expressão da resveratrol sintase (RS). Este trabalho tem como objetivos avaliar a variação na produção de resveratrol entre espécies (A. hypogaea, A. stenosperma, A. valida, A. wiliamsii, A. duranensis, A. ipaënsis e um anfidiploide sintético proveniente do cruzamento artificial entre A. duranensis e A. ipaënsis) e entre acessos de duas espécies(A. hypogaea e A. stenosperma) por meio de HPLC e avaliar a expressão relativa da resveratrol sintase por meio de RT-qPCR em A. hypogaea, A. duranensis, A. ipaënsis e um anfidiploide sintético. Folhas foram coletadas de plantas cultivadas em casa de vegetação para os grupos teste e controle e três repetições biológicas ... / Resveratrol is a phytoalexin produced under biotic and abiotic stresses. It has been found in a restricted number of plant species including peanut (Arachis hypogaea) and its wild relatives. This phytochemical has antioxidant properties, being considered a promising antitumour, cardioprotective and neuroprotective agent. Peanut is an allotetraploid specie with an AABB genomic constitution. Arachis ipaënsis and A. duranensis are the donors of the B genome and the A genome, respectively. Previous studies have shown that wild species of the genus Arachis can produce resveratrol. Therefore, the evaluation of other species of thus genus and the analysis of the variation in the production of resveratrol between accessions is essential for better exploitation of wild species in the genus Arachis. It also important the understanding of the variation in resveratrol concentration between species and accessions and that could be reached through the better understating of the role resveratrol synthase.. . The aims of this work were to evaluate the variation in resveratrol production between species (A. hypogaea, A. stenosperma, A. valida, A. wiliamsii, A. duranensis, A. ipaënsis and in a synthetic amphidiploid derived from these two wild species A. duranensis and A. ipaënsis) and between accessions of the same specie (A. hypogaea and A. stenosperma) through HPLC, and to quantify the expression of resveratrol synthase by RT-qPCR in A. hypogaea, A. duranensis, A. ipaënsis and in a synthetic amphidiploid. Leaves for the test and control groups were collected from plants cultivated in a greenhouse and three biological replicates were evaluated for each specie. The synthesis of resveratrol in leaves was induced by treatment with UV for 2 hours and thirty minutes and then the difference in the concentration of resveratrol between species and between the accessions and cultivars of the same species was analyzed. We found new ...
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Caracterização citogenética e molecular das espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti e seu possível híbrido interespecífico coletados em ambientes naturais

Mourão, Andrea Abrigato de Freitas [UNESP] 22 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-08-13T18:00:39Z : No. of bitstreams: 1 000756870.pdf: 4401994 bytes, checksum: 3fa324e27d9b06c347fb1e60c3086526 (MD5) / Espécies invasoras são altamente eficientes na competição por recursos, tem alta capacidade reprodutiva e de dispersão, o gênero Cichla é exemplo dessas características. Os espécimes desse gênero são amplamente utilizados no controle de espécies exóticas com alta prolificidade, além de sua indiscutível importância na alimentação humana e na pesca esportiva. No presente trabalho foi estudada a diferenciação cromossômica e genética entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti e seus prováveis híbridos naturais. Foram utilizadas técnicas citogenéticas e moleculares de PCR multiplex e PCR-­‐RFLP com genes nucleares e mitocondriais e, posteriormente, tais marcadores foram aplicados em exemplares coletados em reservatórios dos rios Paraná e Tietê, SP. As técnicas citogenéticas foram realizadas para exemplares coletados no rio Tietê, município de Uru, enquanto que para o estabelecimento e aplicação dos marcadores moleculares foram utilizadas amostras de ambas localidades, rio Paraná (Uru) e rio Tietê (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). Os resultados citogenéticos indicam uma conservação cariotípica entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti, tais espécies apresentam numero diploide de 2n=48 cromossomos do tipo acrocêntrico, região organizadora de nucléolo localizado no par 2 e heterocromática constitutiva em regiões centroméricas. Além disso, os genes ribossomais estão localizados nos mesmos pares cromossômicos para ambas as espécies, sendo o 5S DNAr localizado no terceiro par cromossômico, em posição intersticial, e 18S DNAr corroborando com as marcações da NOR. Já nas análises moleculares, foram estabelecidas diferenças genômicas entre as espécies C. kelberi e C. piquiti, que permitiram o estabelecimento de marcadores de eficiente aplicabilidade para diferenciação das duas espécie, fato confirmado pela aplicação dos mesmos em exemplares de quatro localidades do ... / Some invasive species are highly efficient in resource competition, have high reproductive capacity and dispersal, the genus Cichla exemplifies these characteristics. The specimens of this genus are widely used to control exotic species with high prolificacy, beyond its undeniable importance in food and sport fishing. In the present study, the chromosomal and genetic differentiation between species Cichla kelberi and Cichla piquiti and its likely natural hybrids. We used cytogenetic techniques and molecular markers PCR multiplex and PCR-­‐RFLP with nuclear and mitochondrial genes and, subsequently, the markers were applied to specimens collected in rivers Parana and Tiete in São Paulo. The cytogenetic techniques were performed for samples collected from the river Tiete, Uru city, while for the establishment and application of molecular markers were used samples of both cities, river Parana (Uru) and river Tiete (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). The cytogenetic results indicate a karyotype conservation between species Cichla piquiti and Cichla kelberi such species have diploid number of 2n=48 chromosomes acrocentric type, located nucleolus organizer regions in the pair 2 and constitutive heterochromatic centromeric regions. Furthermore, ribosomal genes are located on the same chromosome pairs for both species, but the 5S rDNA located on the third chromosome pair in interstitial position, and 18S rDNA corroborating markings NOR. Already in the molecular analysis, genomic differences were established between the species C. kelberi and C. piquiti, which allowed the establishment of efficient applicability markers for differentiation of the two species and in different populations, a fact confirmed by applying the same samples from four locations in the state of São Paulo. Furthermore, such genetic markers indicate that the samples identified as hybrid individuals of the species C. kelberi and C. piquiti are actually ...
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Rede de Kohonen

Francisco, Claudia Aparecida Cavalheiro January 2004 (has links)
Resumo: As redes neurais artificiais têm sido aplicadas com sucesso em diversos problemas de análise exploratória de dados multivariados relacionados à ecologia. Todavia, poucos são os trabalhos utilizando a rede de Kohonen (mapas auto-organizáveis) para classificação de padrões de dados ecológicos. A dificuldade encontra-se na obtenção de um conjunto adequado de dados para o treinamento e validação da rede. Para o desenvolvimento deste trabalho foram utilizados dados obtidos no projeto "Estudos ictiológicos na área de influência do AHE Corumbá" pelo Núcleo de Pesquisas em Limnologia, Ictiologia e Aqüicultura (Nupélia), Universidade Estadual de Maringá (UEM) em convênio com FURNAS Centrais Elétricas S.A. Este trabalho utiliza a rede de Kohonen como uma metodologia para a classificação das espécies de peixes em categorias tróficas do reservatório de Corumbá - GO, de acordo com a dieta, envolvendo duas fases distintas: fase rio (anterior ao represamento), com a classificação de 1845 estômagos de 33 espécies de peixes, e a fase reservatório (posterior ao represamento), com a classificação de 5492 estômagos de 36 espécies de peixes. As classificações foram obtidas nas duas fases distintamente, resultando em ambas, em uma separação de dois grandes grupos: o dos generalistas e o dos especialistas. Os peixes especialistas foram divididos em quatro grupos: insetívoros, herbívoros, piscívoros e detritívoros. Os insetívoros apresentaram um grande número de espécies, sendo necessário modelar uma nova rede, visando a separação desta categoria, em quatro sub-grupos. A rede de Kohonen mostrou-se uma ferramenta robusta para a classificação dos dados, apresentando resultados rápidos, com uma clara visualização dos agrupamentos, facilitando sobremaneira a interpretação dos resultados.
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Desenvolvimento de um modelo de cela para processamento de radiofármacos injetáveis / Development of a pattern hot cell for production of injectable radiopharmaceuticals

Fábio Eduardo de Campos 04 May 2010 (has links)
Para que sejam atendidos os requisitos normativos e reguladores dentro dos padrões nacionais e internacionais que tratam das condições inerentes à produção-processamento de materiais sensíveis à contaminação, tais como medicamentos injetáveis, um ambiente com atmosfera controlada deve ser criado. Tratando-se de materiais que têm aplicação medicinal, através de procedimentos específicos, mas que também apresentam em suas constituições agentes tóxicos, radioativos e periculosos, o ambiente deve assegurar que estes materiais, que em alguns casos possuem ainda característica de serem voláteis, não escapem para meio ambiente, sem que isto ocorra de uma maneira seletiva e segura, totalmente controlada. A condição de trabalho neste caso, recomendada pelas normas nacionais e internacionais vigentes, refere-se a uma atmosfera negativa em relação aos ambientes adjacentes. Apesar de a literatura estar amplamente provida de tecnologias referentes ao dimensionamento de sistemas, baseados em normas que determinam claramente os requisitos necessários, verifica-se a necessidade de desenvolver um ambiente controlado para produção de radiofármacos, compatibilizando o conceito de área limpa aos requisitos de segurança para manipulação de fontes radioativas abertas. Neste trabalho, dispositivos foram criados, métodos e procedimentos estabelecidos, com objetivo de possibilitar classificações diferentes do ar no interior da cela, sem barreiras físicas na área de trabalho, estabelecendo uma condição ergonômica, flexível e prática, refletindo em maior produtividade. O projeto resultou na criação de um ambiente totalmente favorável ao pronto atendimento dos requisitos normativos, composto de uma câmara de passagem responsável pela entrada e saída de material, sem que condições internas ao micro-ambiente fossem comprometidas. A estanqueidade da cela foi obtida utilizando-se portas dotadas de sistema eficiente de vedação através de juntas ativas e intertravamentos. Manipuladores tipo pinça asseguraram as operações de maneira ergonômica e segura, sem comprometer a estanqueidade e classificação do ambiente com graus de limpeza A e B. Para isso, utilizou-se um eficiente sistema de ventilação/ exaustão, dotado de filtros e dispositivos especiais desenvolvidos com exclusividade para que as condições impostas ao micro ambiente fossem estabelecidas a contento. Todos os parâmetros de funcionamento da cela foram avaliados através do planejamento de ensaios específicos. Os resultados dos ensaios demonstraram o atendimento aos critérios estabelecidos, indicando o potencial do projeto para o desenvolvimento de uma cela de produção de radiofármacos. / A controlled ambient should be established to the production/processing of materials susceptible to contamination, like injectable pharmaceuticals, in order to agree with normative and regulatory requirements. Considering medical but also toxic, radioactive and dangerous products, the ambient should work in special conditions to assure that the materials, which in same cases can be also volatile, do not escape to the external ambient, working in a selective, secure and controlled way. The conditions recommended by local and international rules in use, report an negative pressured ambient in relation to the adjacent areas. The technology related with the sizing of project to this kind of system is fully described in the literature, taking in account the rules that clearly describe the essential requirements. However, it is necessary to develop a controlled ambient for radiopharmaceutical production, in a way compatible with the concept of clean rooms and with the safety related to the manipulation of open radioactive wastes. In this work, some devices were created, methods and procedures were established making possible the classification of the ambient inside the hot cell, without physical barriers in the area, using ergonomic, flexible and practical conditions of work, that can results in the improvement of the productivity. The project resulted in the creation of a controlled ambient, in agreement with the normative requirements, using a pass through for entrance and exit of the materials, without compromise the internal air condition. The tight of the hot cell was obtained using doors with efficient sealing system and active joints. Tong manipulators were used to produce ergonomic and secure conditions, without compromise the internal conditions related to tight and classification in A and B grade, according to local and international rules. An efficient ventilation/exhaustion system was adopted to produce these results, composed by filters and special devices, developed exclusively to produce ideal conditions in the micro ambient. All the operational parameters of the cell were investigated by planning specific assays. The results of these assays were in agreement with the criterions established and indicated the potential of the project in the development of a hot cell for radiopharmaceutical production.
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Discriminação de populações com diferentes graus de similaridade por redes neurais artificiais / Discrimination of populations different degrees of similarity in artificial neural networks

Pereira, Tiago Martins 15 December 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 958045 bytes, checksum: a7576f2d825f5b6d63c2110fc9afce32 (MD5) Previous issue date: 2009-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The correct classification of individuals in pre-established groups has become of great importance in breeding. The multivariate statistical techniques commonly used in this type of problem are the discriminant functions of Fisher and Anderson, which are used to allocate an initially unknown individual in one of the g populations or pre-defined groups. In recent decades a new computing paradigm, artificial neural networks, has come along to solve various problems of Statistics, such as grouping of similar individuals, time series forecasting and also of particular interest, the problem of classification. The objective of this research was to conduct a simulation study in order to compare the discriminant functions of Fisher and Anderson and neural networks. We evaluated the number of incorrect classifications of individuals known to belong to different populations with different levels of dissimilarity measured by the Mahalanobis distance. Simulations were conducted using the software Genes (Cruz, 2006). Although Artificial Neural Networks presented a rate of incorrect classification of individuals rejected for being considered ambiguous as to its discriminatory characteristics, it proved to be a promising technique, since it presented a lower number of incorrect classifications of individuals when compared to the discriminant functions. / A correta classificação de indivíduos em grupos pré-estabelecidos tem se tornado de grande importância no melhoramento genético. As técnicas de estatística multivariada usualmente utilizadas nesse tipo de problema são as funções discriminantes de Fisher e as funções discriminantes de Anderson, que são usadas para alocar um indivíduo inicialmente desconhecido em uma das g populações ou grupos pré-definidos. Nas últimas décadas vêm surgindo um novo paradigma de computação, as redes neurais artificiais, que podem ser utilizadas para resolver diversos problemas da Estatística, como agrupamento de indivíduos similares, previsão de séries temporais e em especial, os problemas de classificação. O objetivo dessa pesquisa foi realizar um estudo comparativo entre as funções discriminantes de Fisher e de Anderson e as redes neurais artificiais quanto ao número de classificações erradas de indivíduos sabidamente pertencentes a diferentes populações, com distintos níveis de dissimilaridade. Essa dissimilaridade, medida pela distância de Mahalanobis, foi um conceito de fundamental importância na utilização das técnicas de discriminação, pois quantificou o quanto as populações eram divergentes. Quanto maior o valor observado para essa medida, menos similares foram as populações em análise. A obtenção dos dados foi feita através de simulação utilizando o programa computacional Genes (CRUZ, 2006). As redes neurais artificiais apresentaram uma taxa de indivíduos rejeitados por serem considerados ambíguos quanto às suas características discriminatórias. No entanto, mostraram-se uma técnica promissora no que diz respeito a problemas de classificação, uma vez que apresentaram um número de classificações erradas de indivíduos menor que aqueles dados pelas funções discriminantes.
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Perfil de uma unidade de pronto atendimento e ferramentas educativas relativas ao acolhimento com classificação de risco / Profile of a emergency care unit and educational tools related to reception with risk classification

Almeida, Kelviani Ludmila dos Santos 05 February 2018 (has links)
Submitted by KELVIANI LUDMILA DOS SANTOS ALMEIDA null (kelviani@hotmail.com) on 2018-04-04T23:50:26Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO MP. KELVIANI LUDMILA DOS SANTOS ALMEIDA. 04.04.pdf: 10787734 bytes, checksum: c995ddd4d0c22eccd545fc83a2573033 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Pizzani null (luciana@btu.unesp.br) on 2018-04-06T14:42:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 almeida_kls_me_bot.pdf: 10787734 bytes, checksum: c995ddd4d0c22eccd545fc83a2573033 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-06T14:42:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 almeida_kls_me_bot.pdf: 10787734 bytes, checksum: c995ddd4d0c22eccd545fc83a2573033 (MD5) Previous issue date: 2018-02-05 / Introdução. Em todo o mundo, nos últimos anos, percebeu-se um aumento significativo da procura de atendimento nos serviços de urgência e emergência, essa demanda está atrelada ao aumento das estatísticas de acidentes automobilísticos, da violência e a procura para cuidados não urgentes. A superlotação desses serviços é algo preocupante, uma vez que compromete a segurança dos pacientes envolvendo elevado tempo de espera, a classificação de risco, a educação do paciente e da equipe em relação a finalidade desse atendimento surgem como métodos de organização do fluxo. Objetivo. Identificar o perfil da demanda atendida na Unidade de Pronto Atendimento (UPA) de Itapeva, considerando a classificação de risco, e desenvolver material educativo digital a partir do perfil caracterizado. Método. O estudo foi realizado em 3 etapas, a primeira consistiu em uma revisão integrativa da literatura, que teve por objetivo conhecer o motivo da busca por atendimento da demanda não urgente, esta resultou em uma amostra de 8 estudos a partir da busca nas bases de dados: Biblioteca virtual em saúde (BVS), Web of Science, Embase, PubMed, Scopus e Cinahal. A etapa seguinte consistiu em um estudo quantitativo, transversal e descritivo que teve intuito de analisar o perfil de atendimentos da UPA do município de Itapeva. Quanto à amostragem, foi realizado cálculo estatístico para o tamanho amostral, considerando 95% de confiança e uma margem de erro de 5%, sendo recomendada amostra com n de 370 pacientes. A coleta de dados ocorreu através de acesso aos prontuários físicos localizados no setor de arquivo, no período de março a junho de 2017, referentes aos pacientes atendidos de janeiro a abril de 2017. A última etapa correspondeu a um estudo de desenvolvimento tecnológico com o objetivo de elaborar um material digital para educação em saúde, tanto para profissionais quanto para pacientes. O desenvolvimento foi realizado com o apoio do Núcleo de Educação a Distância Tecnologia e Informação em Saúde da FMB- UNESP. Resultados e discussão. A revisão integrativa evidenciou que a demanda não urgente procura atendimento pela facilidade de acesso e pela tecnologia que o serviço de urgência e emergência oferece. A análise da demanda atendida na UPA de Itapeva foi capaz de mostrar que quase 80% dos atendimentos tratavam de demanda não urgente, com queixas não recentes, e apenas aproximadamente 2% da amostra necessitou ser removida para o hospital de referência do município, o que apresenta a alta resolubilidade das unidades de pronto atendimento. Uma limitação do estudo foi a insuficiente capacitação do profissional enfermeiro para exercer atividade do acolhimento com classificação de risco. Foi necessário, portanto, elaborar estratégias que pudessem contribuir com essa necessidade da unidade, assim como colaborar com a educação dos pacientes para o uso do pronto atendimento. Esses levantamentos deram subsídios para a criação de dois produtos: um website e um vídeo educativo, o primeiro voltado aos profissionais e o outro voltado para a população. Conclusão. A população realiza uso indiscriminado da unidade de pronto atendimento, seja por desconhecimento da sua finalidade ou por conveniência de atendimento. A maior parte dos atendimentos consiste em demanda não urgente, e se faz necessária intervenção, como estratégias de educação em saúde, que possa direcionar a população para o oportuno atendimento, assim como a capacitação profissional, buscando alcançar melhores resultados na assistência. / Introduction. In recent years, there has been a significant increase in the demand for emergency services across the world. This demand is linked to the statistical increase of car accidents, violence and the search for non-urgent care. The overcrowding of these services is somewhat worrisome, since it compromises the safety of patients, involving high waiting time. Risk classification, patient and team education on the purposes of such services arise as methods of flow organization. Objective. Identify the profile of the demand served by the Itapeva Emergency Care Unit (UPA), considering the risk classification, and to develop digital educational material based on the characterized profile. Method. The study was carried out in 3 stages. The first consisted of an integrative review of the literature, which aimed to know the reasons involving the search for non-urgent care. It resulted in a sample of 8 studies taken from the database: Virtual Health Library (VHL), Web of Science, Embase, PubMed, Scopus and Cinahal. The next step consisted of a quantitative, cross-sectional and descriptive study which aimed to analyze the care profile of the UPA in the city of Itapeva. As for sampling, a statistical calculation was performed for the sample size, considering 95% confidence, a margin of error of 5%, and a sample with n corresponding to 370 patients. Data collection was taken from physical files located in its archive sector, from March to June 2017, referring to the patients attended from January to April 2017. The last step corresponded to a technological development study with aiming to develop digital material for health education for both professionals and patients. The development was carried out with the support of the Nucleus of Distance Education Technology and Information in Health of FMB- UNESP. Results and discussion. The integrative review showed that non-urgent demand seeks care due to the ease of access and the technology offered by the emergency service. The demand analysis at Itapeva’s UPA showed that almost 80% of the cases dealt with non-urgent demands, with no recent complaints, and only approximately 2% of the cases analysed needed to be sent to the reference hospital in the municipality, which demonstrates the high resolubility of the immediate care units services. One limitation of the study was the insufficient training of nurses to carry out host activity with risk classification. It was therefore necessary to devise strategies which could contribute to that necessity, as well as collaborate with the education of patients regarding the use of immediate care. Those surveys provided support for the creation of two products: a website and an educational video, the first aimed at professionals and the second aimed at the population. Conclusion. The population makes indiscriminate use of the immediate care service, either for lack of knowledge of its purpose or for convenience of service. The majority of the visits consisted of non-urgent demand, which requires intervention such as health education strategies which can direct the population to the appropriate service, as well as professional qualification, seeking to achieve better results in care.
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Uma ferramenta para predição de mudanças conjuntas baseadas em informações de repositórios de software / A tool for predicting joint changes based on information from software repositories

Kuroda, Rodrigo Takashi 01 August 2017 (has links)
A manutenção é uma fase do ciclo de vida do software reconhecida por demandar uma grande quantidade de esforço em comparação às outras, como o desenvolvimento. As tarefas da manutenção envolvem a modificação do software, mais especificamente os artefatos que o compõe. O fato de modificar um determinado artefato pode afetar outras partes do software, cujo fenômeno é conhecido como impacto de mudança. Técnicas e ferramentas para apoiar a análise de impacto de mudança geralmente são baseadas em tipos de acoplamentos e têm sido propostas por diversos trabalhos na literatura, como as Regras de Associação e Aprendizado de Máquina usando Classificação. No entanto, essas técnicas não foram avaliadas do ponto de vista prático. Motivado pela falta de uma avaliação dessa perspectiva, esse trabalho realizou um experimento com uma ferramenta que implementa tais técnicas. Para tanto, foi desenvolvida uma ferramenta para automatizar a execução dessas técnicas para realizar predição de mudanças conjuntas de artefatos e apresentá-las ao desenvolvedor, além de coletar o feedback dos desenvolvedores na ferramenta. Com a ferramenta desenvolvida, foi realizada uma prova de conceito com o uso da ferramenta em tarefas de manutenção (defeitos) do projeto de software livre da Apache denominado CXF, por colaboradores novatos representados pelos alunos do curso de Ciência da Computação. Apesar de depender do desempenho das técnicas de predição de mudanças conjuntas, os resultados mostraram evidências que a ferramenta pode apoiar colaboradores novatos e, também, diminuir o esforço para realizar uma tarefa de manutenção de software, comparando quando nenhuma técnica é usada. / Maintenance is a stage of the software life cycle recognized by demanding a lot of effort in comparison to others, such as development. The maintenance tasks involve software modification, specifically the artifacts that compose it. Modifying a particular artifact can affect other parts of the software. This phenomenon is known as change impact. Techniques and tools to support the change impact analysis are usually based on types of couplings and have been proposed by several studies in the literature, such as the Association Rules and Machine Learning using Classification. However, these techniques have not been evaluated from the practical point of view. Therefore, a tool was developed to automate the execution of these techniques to predict joint changes of artifacts and present them to the developer, as well as collecting developers’ feedback on the tool. With the developed tool, a proof of concept was performed using the tool in maintenance tasks (bugs) of the Apache free software project called CXF, by novice collaborators represented by the students of the Computer Science course. Although it depends on the performance of joint change prediction techniques, the results showed evidence that the tool can support novice collaborators and also decrease the effort to perform a software maintenance task, comparing when no technique is used.
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Anfíbios dos campos da Mata Atlântica : influência relativa de gradientes ambientais e espaciais nos padrões de diversidade e estrutura filogenética /

Crivellari, Lucas Batista. January 2016 (has links)
Orientador: Denise de Cerqueira Rossa-Feres / Coorientador: Carlos Eduardo Conte / Banca: Paulo de Marco Jr / Banca: Mauricio Osvaldo Moura / Banca: Vitor Hugo Mendonça do Prado / Banca: Fernando Rodrigues Silva / Resumo: Com intuito de compreender os processos que determinam a composição e distribuição da diversidade de anfíbios em paisagens subtropicais, nós (1) inventariamos a composição dos anfíbios em áreas de campos naturais entremeados a formações florestais da Mata Atlântica, (2) avaliamos como características da paisagem (i.e., cobertura e uso do solo) e dos habitats (i.e., área, hidroperíodo, cobertura de dossel dos corpos d'água) influenciam os padrões de distribuição da diversidade taxonômica e filogenética e (3) avaliamos quais e como gradientes ambientais e espaciais influenciam a estrutura filogenética da metacomunidade regional. Empregamos três métodos de amostragem (transecção, amostragem em sítio de reprodução e busca ativa) em 12 unidades de conservação e entorno, distribuídas nos Estados do Paraná e de Santa Catarina. As amostragens foram realizadas em diferentes períodos entre 2004 e 2014. Nós registramos 63 espécies de 11 famílias de anfíbios, das quais 20 espécies foram associadas aos campos, 19 às áreas florestais e ecótonos e 21 espécies foram generalistas. Espécies com um único indivíduo registrado não foram avaliadas quanto ao uso de habitat. Para avaliar a influência das características estruturais do habitat e da paisagem sobre os padrões de distribuição dos anfíbios, nós selecionamos oito das unidades de conservação e amostramos mensalmente, ao longo de um ano, entre oito e 14 corpos d'água em cada unidade, totalizando 81 corpos d'água (poças temporárias, lagoas... / Abstract: In order to understand wich processes determine the composition and distribution of amphibian diversity in subtropical landscapes, the goals of this work was (1) inventorying the composition of amphibians in areas of natural grasslands associated with Atlantic Forest, (2) assess how land coverage (i.e., land cover and use) and breeding habitats features (i.e., area, depth) influence the distribution patterns of taxonomic and phylogenetic diversity, (3) evaluate how environmental and spatial gradients influence the phylogenetic structure regional metacommunity. We employ three sampling methods (transect sampling, survey at breeding site and active search) in 12 conservation units, distributed in the states of Paraná and Santa Catarina. Samples were taken at different periods between 2004 and 2014. We recorded 63 species of amphibians distributed in 11 families. In relation to use of habitat by amphibians, 20 species were preferably associated with grasslands, 19 were preferably forest and forest edge, 21 generalist (recorded on forest, edge and grasslands environments). Species with a single individual recorded were not evaluated for their habitat use. In order to assess how land coverage and breeding habitats features influence the distribution patterns of taxonomic and phylogenetic diversity, we selected eight conservation units and sampled monthly, over a year, a minimum of 8 and a maximum of 14 water bodies in each unit, totaling 81 water bodies (i.e., pools, permanent ... / Doutor
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Diversidade de ácaros em diferentes culturas e em plantas da vegetação natural do Peru, com ênfase nos Phytoseiidae (Mesostigmata) /

Jiménez Jorge, Sofía. January 2015 (has links)
Orientador: Gilberto José de Moraes / Banca: Jeferson Luiz de Carvalho Mineiro / Banca: Raphael de Campos Castilho / Resumo: O conhecimento dos ácaros de importância agrícola aumentou significativamente no Peru nos últimos 10 anos. Os principais grupos de ácaros de interesse agrícola são os fitófagos, pelo potencial de causarem dano às plantas, e os predadores, pela possibilidade de uso como agentes de controle biológico. O objetivo do trabalho aqui relatado foi a identificação das espécies de ácaros plantícolas, especialmente de espécies predadoras potencialmente úteis para uso prático na agricultura, coletadas no Peru. Coletas foram realizadas em 14 departamentos entre julho de 2012 e janeiro de 2013. Amostras de folhas, flores e frutos de 56 espécies de plantas foram tomadas. Esta dissertação está divida em três capítulos. No primeiro faz-se um breve relato sobre as condições ecológicas do Peru, assim como sobre a importância dos ácaros plantícolas. O segundo apresenta as espécies de ácaros encontradas neste trabalho, com ênfase na família Phytoseiidae. O terceiro apresenta a descrição de uma espécie nova desta última família. Os resultados mostraram que a diversidade de ácaros plantícolas no Peru é muito grande e muito pouco conhecida, a julgar pelo número de espécies novas encontradas (num total de 16). Os gêneros de Phytoseiidae mais abundantes no Peru foram Amblyseius Berlese e Euseius Wainstein, que conjuntamente corresponderam a mais de 70% dos fitoseídeos encontrados. Os gêneros mais diversos foram Amblyseius, Euseius, Proprioseiopsis Muma e Typhlodromips De Leon, que conjuntamente corresponderam a mais de 43% das espécies de fitoseídeos encontradas. A espécie nova de fitoseídeo descrita neste trabalho pertence ao gênero Neoparaphytoseius Chant e McMurtry. Esta difere de Neoparaphytoseius sooretamus (El-Banhawy) pelo tipo de ornamentação do escudo dorsal, forma do cálice da espermateca e pela ausência de macroseta no genu IV. A reavaliação dos tipos de N. sooretamus e a análise da nova espécie... / Abstract: Knowledge about mites of agricultural importance has increased significantly in Peru in the last 10 years. The main groups of mites of agricultural interest are phytophagous, due to the potential to cause damage to plants, and predators, due to the possible use as biological control agents. The objective of the work reported in this document was to identify the species of plant mites, especially predatory species potentially useful for practical use in agriculture, collected in Peru. The collection was done on 14 departments between July 2012 and January 2013. Samples of leaves, flowers and fruits of 56 plant species were taken. This dissertation is divided into three chapters. In the first, a brief report of the ecological conditions in Peru is given, before presenting a consideration about the importance of plant mites. The second chapter presents the mite species found in this work, with an emphasis on Phytoseiidae. The last chapter presents the description of a new species of this family. The work showed that the diversity of plant mites in Peru is very large and little known, judging from the number of new species found (a total of 16). The most abundant genera of Phytoseiidae in Peru were Amblyseius Berlese and Euseius Wainstein, which together accounted for over 70% of the phytoseiids found. The most diverse genera were, Amblyseius, Euseius, Proprioseiopsis Muma and Typhlodromips De Leon, which together accounted for over 43% of the phytoseiid species found. The new phytoseiid species described in this work belongs to the genus Neoparaphytoseius Chant e McMurtry. It differs from Neoparaphytoseius sooretamus (El-Banhawy) by the type of ornamentation of the dorsal shield, shape of the calyx of the spermatheca and the absence of macroseta on genu IV. A revaluation of the types of N. sooretamus and the analysis of the new species described showed the need to redefine Neoparaphytoseius, which was also done in the present work. Better ... / Mestre
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Sazonalidade climática e os efeitos na helmintofauna parasita de Dendropsophus nanus (Anura: Hylidae) da RPPN Foz do rio Aguapeí, município de Castilho, São Paulo /

Wilson, Fabrício Marcel. January 2015 (has links)
Orientador: Luciano Alves dos Anjos / Coorientador: Reinaldo José da Silva / Banca: Drausio Honorio Morais / Banca: Robson Waldemar Ávila / Resumo: Os parasitas representam importante papel na manutenção da diversidade local de hospedeiros e das funções ecossistêmicas, porém são os primeiros organismos a desaparecer por causa das ações antrópicas sobre o ambiente natural. Variações sazonais relacionadas ao ambiente são fatores importantes e que influenciam direta ou indiretamente na relação parasita-hospedeiro e na estrutura da comunidade de helmintos. O objetivo deste estudo é descrever e comparar a composição e estrutura da comunidade de helmintos associados ao anfíbio anuro Dendropsophus nanus, da RPPN Foz do Rio Aguapeí, município de Castilho, estado de São Paulo, nos hidroperíodos de seca e cheia. Foram coletados 298 anuros em quatro campanhas, duas na estação seca e duas na estação cheia, totalizando 40 dias de coleta. Parâmetros parasitários como prevalência, intensidade média de infecção, abundância média e agregação dos parasitas nas populações de hospedeiros, assim como a estrutura da comunidade de helmintos foram avaliados. Foi encontrado uma riqueza de onze taxa, sendo a metacercária de Lophosicyadiplostomum sp. o taxa mais abundante, seguido por Cylindrotaenia cf. americana. A comunidade de helmintos alcançou um padrão de agregação elevado. Espécimes da família Cosmocercidae foram classificados como co-dominantes nos dois hidroperíodos. C. cf. americana foi dominante na seca e co-dominante na cheia, enquanto Cosmocerca podicipinus e o oligochaeta Dero (Allodero) lutzi foram co-dominantes na seca. Os outros taxa foram considerados colonizadores sem sucesso. Os resultados indicaram que não houve diferença dos parâmetros prevalência, intensidade média de infecção e abundância média entre os hidroperídos, porém a diversidade parasitária variou entre as estações, sendo a diversidade na seca maior que na cheia / Abstract: Parasites play an important role in maintaining the local diversity of hosts and the ecosystem functions, however they are the first organisms that disappear because of human activities upon the nature. Seasonal variations related to the environment are important factors that directly or indirectly influence the host-parasite relationship and helminth community structure. This study aims to describe and compare the composition and helminth community structure associated with the amphibian anuran Dendropsophus nanus, from the RPPN Foz do Rio Aguapeí, municipality of Castilho, São Paulo State, in the dry and rainy hydro-periods. A total of 298 frogs were collected in four sampling efforts, two in the dry season and two in the rainy season, totaling 40 days of sampling. Parasitic parameters such as prevalence, mean intensity of infection, mean abundance and aggregation of parasites in host populations, as well as the structure of helminth community, were evaluated. A richness of eleven taxa was found, with the metacercariae of Lophosicyadiplostomum sp. the most abundant taxa, followed by Cylindrotaenia cf. americana. The helminth community reached a high pattern of aggregation. Cosmocercidae family specimens were classified as co-dominant in both hydro-periods. Cylindrotaenia cf. americana was dominant in the dry season and co-dominant in the rainy season, while Cosmocerca podicipinus and the oligochaeta Dero (Allodero) lutzi were co-dominant in the dry season. The other taxa were considered settlers without success. Even though the parasite diversity varied between periods and the diversity was higher in the dry season than in the rainy season, the results showed no difference in the prevalence parameters, mean infection intensity and mean abundance between the hydro-periods / Mestre

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