Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-22T19:23:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FotomicrografiaDigitalEstudos.pdf: 19404159 bytes, checksum: 7d492efd8ff5f498be847f2728f36614 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T15:43:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FotomicrografiaDigitalEstudos.pdf: 19404159 bytes, checksum: 7d492efd8ff5f498be847f2728f36614 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T15:43:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FotomicrografiaDigitalEstudos.pdf: 19404159 bytes, checksum: 7d492efd8ff5f498be847f2728f36614 (MD5) Previous issue date: 2011 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os flebotomíneos compreendem um grupo de insetos de grande interesse médicoveterininário, sobretudo com sua associação vetorial com as leishmanioses. A identificação correta destas espécies no campo é prática imprescindível na pesquisa entomológica e controle de vetores de Leishmania, sobretudo no estado do Pará, onde a fauna de flebotomíneos é bastante diversificada em relação ao montante brasileiro. No entanto, esta prática tem sido realizada por técnicos treinados com base na “chave” atualizada em 2003, apoiada por desenhos manuais de vários pesquisadores, que muitas vezes são de difícil entendimento. Assim, este estudo objevitou apresentar a relevância do uso da fotomicrografia digital como instrumento de apoio para a identificação e registro de flebotomíneos do subgênero Psychodopygus. Utilizou-se como abordagem metodológica a captura de imagens de lâminas da coleção do Insetário de Flebotomíneos do Laboratório de Leishmanioses do Instituto Evandro Chagas, das diversas áreas de estudos epidemiológicos de leishmanioses do estado do Pará, no período de 1970 até a atualidade, por meio dos sistemas de: Axiostar, Canon via Phototube e câmera convencional sobreposta à ocular do microscópio. A partir das imagens capturadas, construiu-se uma base de dados organizada de acordo com a hierarquia taxonômica de Phlebotominae que posteriormente foram comparadas com as ilustrações tradicionais de chaves de identificação. Do total de 2105 lâminas, foram obtidas 222 imagens de flebotomíneos. Um banco de dados contendo 344 imagens referentes às 17 espécies de Psychodopygus foi preparado no decorrer do estudo. Conclui-se que as imagens das estruturas desenhadas por diferentes pesquisadores ao longo dos anos apresentavam diferenças, traduzindo a subjetividade da interpretação para a mesma espécie dentro do subgênero Psychodopygus; assim a fotomicrografia digital demonstra ser um recurso de grande utilidade e importância, devido apresentar vantagens, como: melhor qualidade de imagens, durabilidade, fidedignidade com o real observado e praticidade tecnológica, proporcionando maior segurança e ou confiabilidade ao profissional durante a investigação epidemiológica. / Sandflies are a group of insects of great medical interest, added by its vectorial association with the leishmaniasis. The correct identification of these species in the field is essential in the entomological research and control of vectors of Leishmania, principally in the state of Pará, where the Phlebotomine fauna is so diversified when we comparing to the Brazilian sum. However, this practical has been carried through for technician trained on the basis of the brought up to date “key” in 2003, supported for manual drawings of some researchers, that many times are of difficult agreement. Thus, this study it aimed to present the relevance of the use of the digital fotomicrography as an instrument of support for the identification and register of sandflies of the Psychodopygus subgenus. It was used as metodological boarding, the capture of images of blades of the collection of the Sandflies Insectary, Leishmaniais Laboratory, Evandro Chagas Institute, of several areas of epidemiological studies in Pará, in the period of 1970 until the present time, by the systems: Axiostar, Canon via Phototube and overlapping conventional camera over ocular the microscope. From the captured images, a database was constructed in accordance with the taxonomical hierarchy of Phlebotominae that had been later compared with traditional illustrations of identification keys. In the total of 2105 blades, 222 images of sandflies had been gotten. A data base contend 344 images referring to the 17 species of Psychodopygus was prepared diring the study. We conclude that the images of the structures drawn for different researchers throughout the years inside presented differences translating subjectiveness of interpretation for the same species of the Psychodopygus subgenus; thus the digital fotomicrography demonstrates to be a resource of great utility and importance, which had to present advantages, as: better quality of images, durability, fidedignity with the real observed and technological pratice, providing bigger security and or trustworthiness to the professional during the epidemiological inquiry.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-22T19:21:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T17:33:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T17:33:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) Previous issue date: 2011 / Terapia supressiva antirretroviral reduz significativamente morbidades e mortalidade relacionadas ao HIV, mas a emergência de vírus resistentes pode limitar o sucesso do tratamento. Objetivou-se neste estudo descrever, em portadores de HIV/sida experimentando falha à terapia antirretroviral (TARV), no estado do Pará, a prevalência de mutações nas enzimas transcriptase reversa e protease do HIV-1 e correlacioná-las à resistência aos antirretrovirais (ARV). Foi um estudo descritivo, retrospectivo, do tipo transversal, com dados obtidos na Unidade de Referência Especializada em Doenças Infecciosas e Parasitárias Especiais de Belém do Pará, de pacientes com perfil laboratorial de falha terapêutica. A presente amostra incluiu genotipagem de cinquenta pacientes no período de janeiro de 2004 a dezembro de 2005. Os critérios de inclusão foram: adesão à terapia imediata a genotipagem, falha terapêutica, perfil de resistência viral à TARV e ser paciente da rede pública de saúde. Foram descritos aspectos demográficos da população estudada, perfil de uso de TARV previamente a genotipagem, tempo conhecido de infecção pelo HIV, perfil quantitativo de células CD4+ e de carga viral, além do teste de genotipagem realizado. A resistência encontrada predominou em pacientes residentes em Belém (72%), no sexo masculino (90%) e na faixa etária de 30 a 49 anos de idade. As maiores prevalências de mutações na transcriptase reversa do HIV-1 foram: 214F (86%), 184V (76%), 215FY (56%), 211K (48%), 219QEN, 67N e 103N (42%) cada, 41L (32%), 70R (28%) e 210W (20%). Na protease 46IL (38%), 90M (32%) e 82AFT (20%) foram as mais prevalentes dentre as mutações principais e, dentre as secundárias, 63P (74%), 93LM (52%), 10FIV (48%) e 35D (46%). Atribuiu-se estas mutações a pressão seletiva dos ARV mais utilizados: 3TC, AZT, D4T, DDI, EFZ, IDV, NFV, RTV e SQV. O uso de múltiplos esquemas ARV, favoreceu a prevalência das mutações encontradas. Houve impacto dentro das classes com 32% de resistência completa a uma classe, 22% a duas classes e 4% a três classes. Conclui-se que pacientes expostos a única TARV previamente à genotipagem comparados aos expostos a mais de uma TARV, apresentaram menor prevalência de resistência aos ARV, com possibilidade de resgate terapêutico com ARV ativos disponíveis na época que, entretanto foi a minoria. / Suppressive antiretroviral therapy significantly reduces morbidity and mortality related to HIV, but the emergence of resistant virus may limit the success of treatment. The objective of this study describe, in HIV / AIDS experiencing failure with antiretroviral therapy, in state of Pará, the prevalence of mutations in reverse transcriptase and protease enzymes of HIV-1 and correlate them to resistance to antiretrovirals. A descriptive, retrospective crosssectional data obtained in the Reference Unit Specialized in Special Infectious and Parasitic Diseases from Belem-Pará, profile of patients with laboratory evidence of treatment failure. This sample was represented by genotyping of fifty patients from January 2004 to December 2005. Inclusion criteria were: adherence to therapy prior to genotype, treatment failure, viral resistance profile to antiretroviral therapy and be patient of public health. We described the demographic population profile of antiretroviral therapy prior to genotyping, long known HIV infection, quantitative profile of CD4 + and viral load, in addition to genotype testing performed. The predominant resistance found in patients living in Belém (72%), males (90%) and aged 30 to 49 years old. The highest rates of mutations in reverse transcriptase of HIV-1 were: 214F (86%), 184V (76%), 215FY (56%), 211K (48%), 219QEN, 67N and 103N (42% each), 41L (32%), 70R (28%) and 210W (20%). In 46IL protease (38%), 90M (32%) and 82AFT (20%) were most prevalent among the major replacements and, among the secondary, 63P (74%), 93LM (52%), 10FIV (48%), and 35D (46%) predominated. Was attributed to selective pressures these mutations most commonly used antiretrovirals: 3TC, AZT, D4T, DDI, EFV, IDV, NFV, RTV and SQV. The use of multiple antiretroviral regimens, boosted the prevalence of these mutations, with an impact within the classes in which there was 32% complete resistance to one class, 22% two classes and 4% to three classes of antiretrovirals. We conclude that patients exposed to HAART only prior to genotyping compared to those exposed to more than one HAART had a lower prevalence of resistance to antiretrovirals, with the possibility of rescue therapy with antiretrovirals assets available at the time that was the minority however.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-20T22:13:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T18:07:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T18:07:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) Previous issue date: 2009 / A hanseníase é uma doença infecto-contagiosa, de evolução lenta e progressiva, com grande incidência e prevalência nos estados que compõem a Amazônia legal onde o Pará ocupa lugar de destaque no número de casos no contexto nacional. A fim de se avaliar o perfil de citocinas e a atividade de macrófagos nas formas polares da hanseníase e correlacionar com os seus aspectos histopatológicos, foi realizado um estudo transversal com uma amostra composta por 29 pacientes portadores de uma das formas polares da hanseníase, tuberculoide ou virchowiana, dos quais foram colhidas biópsias de pele de lesões hansênicas. Pode-se observar, através da análise imonoistoquímica deste material que os grupos estudados não apresentaram diferença significativa quanto aos níveis de IL-10, TGF-β, CD68, iNOS e Lisozima. Os níveis de IL-4 não foram expressivos nos tecidos analisados e os níveis de IFN-γ foram maiores nos pacientes do grupo MHV. No polo virchowiano todas as citocinas tiveram uma tendência a uma correlação negativa com a atividade de macrófagos, no polo tuberculoide a IL-10 apresentou uma tendência à correlação negativa com os níveis de iNOS, IFN-γ e lisozima, evidenciando uma inibição da atividade macrofágica por esta citocina. Pode-se concluir que não há diferença na expressão de citocinas de perfil TH1 e TH2 nas formas polares da doença de Hansen e as citocinas apresentam uma tendência a correlação negativa com a atividade de macrófagos no pólo MHV e uma tendência a correlação positiva no pólo MHT. Novas pesquisas são necessárias para esclarecer como populações apresentam mais susceptibilidade à hanseníase que outras, um estudo semelhante com um maior número de indivíduos poderá ter resultados mais expressivos. / Leprosy is an infectious disease that has a slow and progressive evolution, with high incidence and prevalence in the states that compose the Legal Amazon. Considering the number of cases, the Pará state plays a prominent role in the national context. In order to evaluate the cytokine profile and the macrophages activity in the polar forms of leprosy and correlate with their histopathological aspects, a transversal study was performed, with a sample of 29 patients who had one of the polar forms of leprosy, namely tuberculoid or virchowian, from who skin biopsies of leprosy lesions were taken. It could be observed, through the analysis of this immunohistochemical material, that the studied groups showed no significant variation in the levels of IL-10, TGF-β, CD68, iNOS and Lysozyme. The levels of IL-4 were not expressive in the analyzed tissues and the levels of IFN-γ were higher in patients in the MHV group. In the virchowian pole, all cytokines tended towards a negative correlation with the macrophages activity. In the tuberculoid pole, the level of IL-10 showed a negative correlation with the levels of iNOS, IFN-γ and lysozyme, indicating a macrophage activity inhibition for this cytokine. It can be concluded that there is no difference in cytokine expression of TH1 and TH2 profile in polar forms of Hansen's disease and cytokines have a tendency to negative correlation with the activity of macrophages in MHV pole and a tendency to positive correlation in the pole MHT. Further research is needed to clarify why some populations have more susceptibility to leprosy than others. A similar study with a larger number of individuals may have a more significant outcome.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:14:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) Previous issue date: 2011 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os rotavírus são os principais agentes virais causadores de gastrenterite aguda e responsáveis por 36% dos casos hospitalizações entre crianças menores de cinco anos, resultando em 453.000 óbitos anualmente, principalmente em países em desenvolvimento. Pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, possui RNA de dupla fita (dsRNA) com 11 segmentos codificando 12 proteínas. O genótipo G1 se apresenta geralmente com maior frequência nas investigações epidemiológicas, circulando em várias partes do mundo sob diferentes prevalências. Este estudo teve como objetivo analisar a variabilidade genética dos genes VP4, VP7 e NSP4 dos rotavírus G1 circulantes nos municípios de Belém e Marituba, Pará, Brasil, no período de 1982 a 2008. Foram selecionadas 83 amostras previamente caracterizadas como G1 e submetidas a RT-PCR. Os espécimes foram provenientes de sete estudos realizados no IEC. Foi possível a amplificação para os três genes em estudo de 63 (75,9%) espécimes. Foram detectadas as linhagens 1 (8/63, 12,7 %), 2 (29/63, 46,0%), 3 (18/63, 28,6%) e 9 (8/63, 12,7%) para o gene VP7. Co-predominaram as sublinhagens 2E e 3A concorrendo com um total de 57,1% (36/63) das amostras. Foram observadas três substituições de aminoácidos (97 [D→E], 147 [S→N] e 218 [I→V]) no gene VP7 nas regiões antigênicas (A, B e C) nas amostras das linhagens 1, 2 e 9. Todas as amostras apresentaram a especificidade P[8] para o gene VP4 e as linhagens 2 (21/63, 33,3%) e 3 (42/63, 66,7%) foram detectadas. No gene da VP4 ocorreram duas alterações (35 [I→V] e 38 [S→G]) na região antigênica em todas as amostras analisadas. Para o gene NSP4, todas as amostras pertenceram ao tipo E1. Houve mudanças de nucleotídeos nas posições 47 (C→T) e 101 (T→C), resultando em alteração aminoacídica nos resíduos 16 (S→P) e 34 (L→P) em todas as amostras analisadas e nove espécimes demonstraram alteração no sítio de toxicidade da NSP4 (aa 131). Tal análise permitiu ampliar o conhecimento da diversidade genética e da circulação de variantes de rotavírus G1, representando o primeiro estudo da epidemiologia molecular deste genótipo no Brasil e confirmar a alta heterogeneidade que este tipo apresenta. / Rotaviruses are major viral agents of acute gastroenteritis and responsible for 36% of hospitalization for diarrhea among children less than five years of age, resulting in 453.000 deaths annually, mostly in developing countries. Rotavirus is a member of Reoviridae family, and its genome consists of 11 double-stranded RNA (dsRNA) which encode 12 proteins. G1 rotavirus is commonly detected in epidemiological investigations, occurring under different prevalence rates. The aim of this study was to analyze the VP4, VP7 and NSP4 diversity genetic of G1 rotavirus circulating in Belém and Marituba, Pará, Brazil, from 1982 to 2008. We selected 83 samples previously characterized as G1 type and submitted to RT-PCR. The samples were from seven studies conducted in IEC. It was possible amplification for 63 (75.9%) specimens. Lineages 1 (8/63, 12.7%), 2 (29/63, 46.0%), 3 (18/63, 28.6%) and 9 (8/63, 12.7%) of VP7 gene were detected. The sublineages 2E and 3A were co-predominant detected in 57.1% (36/63) of samples. Three amino acid substitutions (97 [D→E], 147 [S→N] and 218 [I→V]) were observed in VP7 antigenic regions (A, B and C) in samples of 1, 2 and 9 lineages. All samples showed P[8] specificity for VP4 gene and lineages 2 (21/63, 33.3%) and 3 (42/63, 66.7%) were detected. Two substitutions (35 [I→V] and 38 [S→G]) occurred in antigenic region of VP4 of samples analyzed. For NSP4 gene, all samples belonged to E1 type. Phylogenetic analysis of NSP4 gene revealed that occurred changes in nucleotide positions 47 (C→T) and 101 (T→C), resulting in amino acid substitutions at positions 16 (S→P) and 34 (L → P) in all samples and 9 specimens displayed amino acid substitution in NSP4 toxicity residue (aa 131). This study allowed us to broaden our understanding about genetic diversity and circulation of G1 variants and represents the first molecular epidemiology analyze of this genotype in Brazil corroborating the high heterogeneity of this genotype.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:15:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-05T12:11:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-05T12:11:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) Previous issue date: 2011 / Hanseníase é um problema de saúde pública no estado do Pará e um desafio para os Programas de Controle que almejam o estabelecimento de estratégias para minimização do agravo da doença. O entendimento do mecanismo genético e imunológico para explicar a manutenção da endemia pode ser uma das alternativas para melhoria da abordagem do problema na nossa região. O gene humano de resistência natural associada à proteína macrofágica – NRAMP1 é expresso em macrógfagos e parece estar envolvido com a influência no padrão de resposta imune à infecção com Mycobcaterium leprae. Nós avaliamos associação do polimorfismo deste gene, já descrito por BUU et al, 1995 com a hanseníase “per se” e com os tipos da doença, segundo os níveis de anticorpos anti-PGL-1 na população estudada. Um total de 122 pacientes com hanseníase e 110 não doentes procedentes de municípios endêmicos do estado do Pará, foram genotipados para o polimorfismo deste gene e analisados segundo os níveis de anticorpos anti-PGL-1 desta micobactéria. Observou-se associação com a hanseníase “per se” (p=0.0087), e o polimorfismo da região 3ۥ não traduzida do gene NRAMP1 com inserção/deleção de 4 pares de bases foi fortemente associado com a forma multibacilar (p= 0.025) comparado aos contatos não cosanguíneos. Heterozigotos e portadores do alelo com a deleção (159pb) foram mais freqüentes entre os casos multibacilares do que nos paucibacilares. Os haplótipos do gene NRAMP1 parecem exercer influência importante na apresentação clínica da hanseníase, revelada também pela positividade ao antígeno PGL-1 do mycobacterium leprae. / Leprosy is a public health problem in the Pará state and a challeng for the Control Programs that aim strategies improvement to elimination of this disease between us. The agreement of the genetic and immunology mechanism to explain maintenc endemic disease can be one of the alternatives for problem resolution. The human gene for natural resistance associated macrophage protein – NRAMP1 is expressed in macrophages and seems to be involved with influence cellular immune responses to mycobacterium leprae infection. We evaluated the polymorphism association of this gene as reported by Buu et al (1995) with leprosy “per se” and clinical forms according to the anti-PGL-1 levels in the population studied. A total of 122 leprosy patients and 110 individual healthy coming from endemic municipalities in Para were genotyped for the polymorphism of NRAMP1. Association was found with leprosy “per se” (p=0.0087) and 3’ untranslated region with insertion/deletion of four base pairs was significantly associated with multibacillary (p=0.025) compared to contacts not cosanguineos. Heterozygotes and haplotypes with four base pairs deletion were more frequent among multibacillary than paucibacillary. The NRAMP1 gene haplotypes seem to have important influence on leprosy clinical presentation also revealed by Mycobacterium leprae anti-PGL-1 positively.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-25T19:11:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoGeneticaMicobacterias.pdf: 2178660 bytes, checksum: 2d25a97aa686e758a27ecf791fce061f (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho(irvana@ufpa.br) on 2013-06-28T12:15:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoGeneticaMicobacterias.pdf: 2178660 bytes, checksum: 2d25a97aa686e758a27ecf791fce061f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-28T12:15:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoGeneticaMicobacterias.pdf: 2178660 bytes, checksum: 2d25a97aa686e758a27ecf791fce061f (MD5) Previous issue date: 2012 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nos últimos anos tem sido observado um aumento de relatos de infecções causadas por micobactérias não tuberculosas (MNT). No entanto, dados sobre frequência e espécies envolvidas em infecções pulmonares no Brasil são limitados, principalmente em estados da Região Norte do Brasil. O conhecimento das espécies de MNT associadas às infecções pulmonares tem importância clínica e epidemiológica, sendo as técnicas moleculares ferramentas capazes de oferecer um diagnóstico espécie-específico, o qual é necessário para a instituição de terapia adequada. O presente trabalho descreve a diversidade de MNT isoladas de espécimes pulmonares encaminhados ao Instituto Evandro Chagas entre 1999 e 2011 para pesquisa de micobactérias. As MNT foram inicialmente caracterizadas por PCR-restriction analysis (PRA-hsp65) e reidentificadas por sequenciamento dos genes RNAr 16S, hsp65, rpoB e região ITS1. De acordo com os achados, o método de PRA-hsp65 mostrou-se uma ferramenta prática para identificação MNT, permitindo a distinção de uma grande variedade de espécies de forma rápida, simples e barata, em comparação com o sequenciamento. Além disso, como sugerido no presente estudo, de acordo com a diversidade de espécies local, este método pode ser passível de modificações para proporcionar maior poder discriminatório. Para isolados do complexo Mycobacterium avium (MAC), a aplicação da análise de sequência do gene rpoB não se mostrou como alternativa adequada para discriminação de isolados do Estado do Pará, gerando resultados discrepantes com baixa resolução taxonômica. Um espectro particular de MNT foi associado aos casos de infecção pulmonar na região, representado principalmente por espécies dos complexos M. chelonae-M. abscessus (M. abscessus, M. massiliense e M. bolletii), M. avium (M. avium, M. intracellulare e M. colombiense) e M. simiae (M. simiae e taxa não nomeados). Dentre esse último, duas potenciais espécies foram detectadas, M. paraensis sp. nov. e M. amazoniensis sp. nov., sendo propostas como novos membros do complexo M. simiae. Entre os indivíduos afetados, as principais características encontradas foram sexo feminino, a idade superior a 50 anos, etnia parda e história de infecção prévia por tuberculose. Embora este estudo não demonstre a real magnitude de infecções pulmonares por MNT no Estado do Pará, ele descreve a diversidade de espécies e claramente retrata a importância desse grupo na região, chegando a representar 13,5% dos isolamentos micobacterianos em um laboratório de referência. Conjuntamente a esse achado, a identificação de casos de MNT em indivíduos presuntivamente diagnosticados com TB, indica a necessidade de confirmação bacteriológica, especialmente nos casos de resistência primária ao esquema básico da tuberculose. / In recent years have been seen increased reports of nontuberculous mycobacteria (NTM) infections in the world. However, data on frequency and NTM species associated with pulmonary infections are still limited in Brazil, especially in states of Northern Brazil. The knowledge of species associated with NTM lung infections has clinical and epidemiological importance, being molecular techniques efficient tools to provide diagnostic species-specific, which is necessary for choice of appropriate therapy. This study describes the diversity of NTM isolated from respiratory specimens at the Evandro Chagas Institute between 1999 and 2011. The NTM were initially characterized by PCR-restriction analysis (PRA-hsp65) and reidentificated by sequencing of 16S rRNA, hsp65, rpoB and ITS1 targets. According to ours findings, the PRA-hsp65 method proved to be a convenient tool for identifying NTM, allowing distinction of a variety of species quickly, simply and inexpensively, as compared to the sequencing. Moreover, as suggested in this study, according to local species diversity, this method can be subject to modifications to provide greater discriminatory power. Sequence analysis of the rpoB gene of Mycobacterium avium complex (MAC) revealed that this target is not a suitable alternative for discrimination of isolates from State of Para, because it generated discrepant results with low taxonomic resolution. M. chelonae, M. avium and M. simiae complexes were the most frequent NTM. Two potential species were detected, M. paraensis sp. nov. and M. amazoniensis sp. nov., being proposed as new members of the M. simiae complex. Among the patients with NTM disease, the main characteristics found were women older than 50 years, pardo ethnic group and previous tuberculosis. Although this study does not show the real magnitude of NTM lung infections in State of Para, it describes the diversity of species and clearly reveals the importance of this group in the region, which has accounted 13.5% of mycobacterial isolates in a reference laboratory. The findings highlight the need for bacteriological confirmation of cases presumptively diagnosed as TB with primary resistance to therapy for TB.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-04T13:11:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ContribuicaoConhecimentoFauna.pdf: 48204466 bytes, checksum: c4773cd0cda85abc5d2bea05b66ea099 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-05T12:54:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ContribuicaoConhecimentoFauna.pdf: 48204466 bytes, checksum: c4773cd0cda85abc5d2bea05b66ea099 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-05T12:54:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ContribuicaoConhecimentoFauna.pdf: 48204466 bytes, checksum: c4773cd0cda85abc5d2bea05b66ea099 (MD5) Previous issue date: 2004-07 / Apesar da sua localização perto de Belém, Pará, a Ilha de Cotijuba tem sido assolada por surtos de malária durante os últimos anos, principalmente nos meses de abril a maio. A ilha faz parte de um arquipélago situado às margens da baía do Marajó, a 29 km de Belém, constituindo uma parte insular dessa cidade, e possui uma área de cerca de 60 km² e uma costa com 20 km de praias, que corresponde a 66% da área total da ilha. Por causa da epidemia, tomou-se necessário conhecer as espécies de anofelinos vetores de malária na ilha. Nos anos de 2002 a 2004 foram realizadas coletas periódicas de larvas e adultos de mosquitos e os seus criatórios foram localizados e caracterizados. Os imaturos foram coletados com auxílio de conchas e em bandejas plásticas. Para os adultos utilizou-se o método de captura manual com isca humana. Duas coletas de adultos na floresta foram realizadas, uma no período seco e outra no período chuvoso, com duração de 24 horas ininterruptas. Seis coletas bimensais no peridomicílio foram feitas, com duração de 6 horas. Tanto na floresta como no peridomicilio foram registradas apenas duas espécies em atividade atacando o homem, Anopheles (Nyssorhynchus) aquasalis e Anopheles (Anopheles) intermedius. A. aquasalis foi mais freqüente no peridomicílio, enquanto A. intermedius teve maior freqüência na floresta. Verificou-se que o maior número de casos de malária na ilha ocorre dois meses depois do início das chuvas, no mês de maio. Na i, como um todo, existem quatro lagos que são os possíveis criatórios de anofelinos da ilha e o lago da Gabriela é o principal criatório da ilha de Cotijuba, sendo responslha de Cotijubaável por 42% dos casos de malária na ilha no ano de 2003. As condições climáticas, o comportamento dos residentes e a falta de recursos para o efetivo controle dos vetores da doença, entre outros fatores, favorecem a persistência de malária na Ilha de Cotijuba. / In spite of its localization near the city of Belém, Pará, Cotijuba Island has been the site of outbreaks of malaria during recent years, especially in the months of April and May. The island is part of an archipelago at the southern margin of Marajó Bay, located 29 km from Belém, as an island portion of the municipality of Belém. The island has a total area of about 60 km² and 20 km of beaches that correspond to about 66% of the total area. Because of the epidemic, it tias become necessary to identify the anopheline species that are the malaria vectors on the island. From 2002 to 2004 periodic collections were made of mosquito larvae and adults, and their breeding sites were located and characterized. Larvae were collected with dippers, while adults were collected manually in individual tubes from human volunteers. Two collections were made of adults in forested areas, one collection during the dry season and the other during the rainy season. Each collection was made during a continuous 24 hour period. Six bi-monthly collections were made near residents' houses, each lasting 6 hours. Both in the forest and near houses, only two species of anophelines were found to bite people, Anopheles (Nyssorhynchus) aquasalis and Anopheles (Anopheles) intennedius. A. aquasalis was more common near houses, whereas A. intermedius was more common in the forest. Most of the island's malaria cases were found to occur two months after the beginning of the rainy season, in the month of May. On all of Cotijuba Island there are four lakes that are possible anopheline breeding sites, and Gabriela Lake is the principal breeding site, responding for 42% of the malaria cases on the island during 2003. Climatic conditions, the resident population's behavior and housing, and the lack of resources for effective vector control, among other factors, favor the continual presence of malaria on Cotijuba Island.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 fernandotadeuvcoimbra_dissert.pdf: 779048 bytes, checksum: c7f7e54ae8128229fc992f595d36eada (MD5) Previous issue date: 2012-11-07 / Introduction and Objective: The main objective of this study is to evaluate the motor reaction of the esophagus after undergoing endoscopic sclerotherapy of esophageal varices (EE) up to its eradication. Clinical implications and the ones with endoscopic evidence were subsidiarly of interest driven by the procedure. Casuistic and Methods: Fourteen patients with liver cirrhosis with esophageal varices; nine men and five women, mean age of 52.57 ± 14.58 years, who had already had episode (s) of variceal bleeding were studied. In eleven, the disease had alcoholic origin and three viral etiology by virus type B in two, and type C in one. Twelve were classified as Child-Pugh A, and two as B. They underwent endoscopic examination before the EE, and at least, one month after the procedure, to list any complications, while also questioning on dysphagia and retrosternal pain. EE was performed with 5%- ethanolamine oleate and 50%-hypertonic glucose in equal parts. Intravasal injections of 2 to 5 ml were performed at 2 cm-intervals , starting from the esophagogastric transition, towards cranial direction in each one of the varicose cords up to the complete elimination of varicose veins, according to the limit of 20 to 30ml/varix / session, and about 15 day-interval between the sessions. Electromanometric study of esophagus was performed from two to three days before the procedure and at least one month after the end of the endoscopic treatment, before the endoscopic examination of control . The average results were compared by the Student's t test, with a 5%-significance level. Results: At initial endoscopy, varicose veins of medium caliber in 11 patients, and thick-caliber in three were observed. Red spots were found in all cases. Varicose veins were eradicated in all patients at endoscopic examination, after-procedure, carried out on average of 3.07 ± 2.97 months from the end of EE. Four sclerotherapy sessions, in the mean time of 1.6 ± 0.71 months, were necessary. There were no complications in eight cases. Four patients had superficial esophageal ulcers of ischemic aspect, in areas of sclerosis, while two others, in addition to ulcers, showed tenuous synechiae. The investigation of dysphagia and retrosternal pain showed that ten patients were asymptomatic, others maintaining evasive and low intensity symptoms. The comparison between the averages of the variables analyzed by esophageal electromanometry after EE, revealed significant reductions in resting pressure of lower esophageal sphincter (LES), percentage of LES relaxation, peristalsis percent, wave length of swallowing and extent of swallowing complexes. Conclusions: In conclusion, this procedure can completely eradicate varicose veins and, if performed moderately , does not produce important=significant tissue complications in the esophagus, or significant symptoms after finishing, but provides significant motor abnormalities of the organ, potentially capable of favoring gastroesophageal reflux and reduced ability to empty the organ. / Introdução e Objetivo: O principal objetivo desse estudo é avaliar o comportamento motor do esôfago após realização de escleroterapia endoscópica de varizes esofágicas (EE), até sua erradicação. Subsidiariamente interessam as implicações clínicas e as endoscopicamente evidenciáveis movidas pelo procedimento. Casuística e Método: Foram estudados 14 portadores de cirrose hepática, com varizes do esôfago, nove homens e cinco mulheres, com média de idades de 52,57 ± 14,58 anos, que já haviam apresentado episódio(s) de sangramento varicoso. Em onze, a afecção tinha origem alcoólica e, em três, era de etiologia viral, determinada por vírus de tipo B em dois e do tipo C em um. Doze haviam sido classificados como Child-Pugh A e dois, como B . Foram submetidos a exame endoscópico, antes da EE, e, pelo menos, um mês depois do procedimento, para listar eventuais complicações, quando também era feito questionamento sobre presença de disfagia e dor retrosternal. A EE foi realizada com oleato de etanolamina a 5% e glicose hipertônica a 50%, em partes iguais. Eram realizadas injeções intravasais de 2 a 5ml, a intervalos de 2cm, partindo da transição esôfago-gástrica, em direção cranial, em um a um dos cordões varicosos, até a eliminação completa das varizes, respeitando o limite de 20 a 30ml/variz/sessão e cerca de 15 dias de intervalo entre as sessões. De dois a três dias antes do procedimento e, pelo menos, um mês depois do final do tratamento endoscópico, antes do exame endoscópico de controle, foi realizado estudo eletromanométrico do esôfago. As médias dos resultados foram comparadas mediante a aplicação de teste t de Student, admitindo-se nível de significância de 5%. Resultados: No exame endoscópico inicial foram observados cordões varicosos de médio calibre em 11 doentes, e de grosso calibre, em três. Red spots foram encontrados em todos os casos. Ao exame endoscópico pós-procedimento, levado a efeito, em média, a 3,07 ± 2,97 meses do final da EE, as varizes estavam erradicadas em todos os pacientes. Para isso, foram necessárias de duas a quatro sessões de escleroterapia , no tempo médio de 1,6 ± 0,71 meses. Não foram constatadas complicações em oito casos. Quatro pacientes apresentavam úlceras esofágicas superficiais, de aspecto isquêmico, em área de esclerose, enquanto outros dois, além de úlceras, mostravam tênues sinéquias. O inquérito sobre disfagia e dor retrosternal revelou que dez pacientes estavam assintomáticos, os outros mantendo sintomas fugazes e de pequena intensidade. A comparação entre as médias das variáveis analisadas pela eletromanometria esofágica, revelou, depois da EE, reduções significantes de pressão de repouso do esfíncter inferior do esôfago (EIE), percentual de relaxamento do EIE, percentual de peristaltismo, duração das ondas de deglutição e amplitude dos complexos de deglutição. Conclusões: Concluiu-se que o procedimento pode erradicar completamente as varizes e que, desde que realizado parcimoniosamente, não produz complicações teciduais de monta no esôfago, nem sintomatologia relevante depois de finalizado, mas determina alterações motoras significativas do órgão, potencialmente capazes de favorecer refluxo gastroesofágico e redução da capacidade de esvaziamento do órgão.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rosinamariamartinskubota_dissert.pdf: 3276098 bytes, checksum: 36e94f7c1e90ab6c0f7f338492b83915 (MD5) Previous issue date: 2012-11-26 / Introduction: Multidrug therapy (MDT/WHO) forthe treatment of Leprosy´s can cause adverse effects related to Rifampicin (RMP) or Dapsone (DDS). These effects can change the therapeutic regimen. Objectives: To identify the causes of change intreatment and to evaluate the clinical dermatologica and conditions of patients who underwent alternative therapy. Method: A prospective, descriptive and cross-sectional study with instrument divided into pre and post discharge. Out of 182 patients treated between1995 to 2007with MDT/WHO; 34(18.7%) underwent alternative doses and of these, 21were located for the interview Chi-Square test with p-value<0.05 was used. Results: The sample comprised: all married, 40 to59 years, low socioeconomic and educational status. Paucibacillary (PB) and multibacillary (MB) patients without using DDS and RMP had as negative the last bacilloscopy (>50%), and the positive results of the others showed slow involution. The most frequent incidence according to clinical form was lepromatous in the intolerant to DDS and borderline leprosy in the ones without RMP. Adverse effects mostly accounted MB patients and appeared between 1-2months. According to 73.5% of the DDS intolerant, the change of the therapeutic regimen was related with hematological causes (48.5%), and the ones to RPM (26.5%) with hepatological problems (50%). In the post-discharge assessment, the nodules and plaques have disappeared and the amount of spots increased (p<0.05). Neural lesions, orpain in the limbs were developed, sensitivity and muscle strength diminished, and claw toes (p<0.05) appeared. Conclusion: The development of disability revealed the need of monitoring carefully the neural function in cases of discharge. / Introdução: A poliquimioterapia (PQT/OMS) para o tratamento da hanseníase pode causar efeitos adversos relacionados à Rifampicina (RMP) ou Dapsona (DDS). Esses efeitos levam à mudança terapêutica. Objetivos: Identificar as causas da mudança terapêutica e avaliar as condições clínicas dermatológicas dos pacientes que fizeram uso de doses alternativas. Método: Estudo prospectivo, descritivo e transversal com instrumento dividido em pré e pós-alta. De 182 pacientes tratados entre 1995 a 2007 com PQT/OMS, 34(18,7%) fizeram doses alternativas e destes, 21 localizados para a entrevista.Utilizou-se o teste Qui-quadrado com valor-p<0,05. Resultados: O perfil era constituído por casados, de 40 aos 59 anos, baixa condição socioeconômica e escolaridade. Os pacientes paucibacilares (PB) e multibacilares (MB) sem o uso de DDS e de RMP tiveram as últimas baciloscopias (BAAR) negativas (>50%), e os resultados positivos dos restantes mostraram involução lenta. A maior incidência quanto à forma clínica foi a virchowiana nos intolerantes à DDS e a dimorfa nos sem a RMP. Os efeitos adversos acometeram mais os pacientes MB e apareceram entre 1-2 meses. Dos 73,5% intolerantes à DDS, a mudança do esquema terapêutico foi relacionado às causas hematológicas (48,5%) e os à RMP (26,5%) os problemas hepatológicos (50%). Na avaliação pós-alta, as placas e nódulos desapareceram e as manchas aumentaram de número (valor de p<0,05). Desenvolveu-se lesões neurais, com dor geral ou localizada em membros, diminuição da sensibilidade e da força muscular, com aparecimento de garra móvel (valor de p<0,05). Conclusão: A evolução das incapacidades revelou a necessidade de monitorar atentamente a função neural nos casos de alta.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigonunescal_dissert.pdf: 1974084 bytes, checksum: 8c8b307639fa4bf12db9d2e634334a01 (MD5) Previous issue date: 2012-05-25 / Introduction: Lung cancer is one of the most incident neoplasms in the world representing the main cause of mortality for cancer. Many epidemiologic studies have suggested that physical activity may reduce the risk of lung cancer, other works evaluate the effectiveness of the use of the physical activity in the suppression, remission and reduction of the recurrence of tumors. Objective: To evaluate the effects of aerobic and anaerobic physical activity in the development and the progression of lung cancer. Material and Methods: Lung tumors were induced with a dose of 3mg of Urethane/kg, in 67 male Balb - C type mice, divided in three groups: Group 1 - 24 mice treated with Urethane and without physical activity; Group 2 - 25 mice with Urethane and subjected to aerobic swimming free exercise; Group 3 - 18 mice with urethane, subjected to anaerobic swimming exercise with gradual loading 5 to 20% of body weight. All the animals were sacrificed after 20 weeks, and lung lesions were analyzed. Results: The median number of lesions (nodules and hyperplasia) was 3.0 for group 1, 2.0 for group 2 and 1.5 to 3 (p = 0.052). When compared only the presence or absence of lesion, there was a decrease in the number of lesions in group 3 compared with group 1 (p = 0.03) but not in relation to group 2. There were no metastases or other changes in other organs. Conclusion: The anaerobic physical activity but not aerobical, diminish the incidence of experimental lung tumors. / Introdução: O câncer de pulmão é uma das neoplasias mais incidentes no mundo, sendo a principal causa de mortalidade por câncer. Muitos estudos epidemiológicos têm sugerido que a atividade física pode reduzir o risco do câncer de pulmão, outros trabalhos avaliaram a eficácia da utilização da atividade física na supressão, remissão e redução da recorrência de tumores. Objetivo: Avaliar os efeitos da atividade física aeróbia e anaeróbia no desenvolvimento e na progressão do câncer de pulmão experimental. Material e Métodos: Os tumores de pulmão foram induzidos com uma dose de 3mg de uretana/kg, em 67 camundongos Balb-C, divididos em três grupos: Grupo 1 - 24 camundongos tratados com uretana e sem atividade física; Grupo 2 - 25 camundongos tratados com uretana e submetidos ao exercício aeróbio em natação; Grupo 3 - 18 camundongos tratados com uretana, submetidos ao exercício anaeróbio em natação com carga gradual de 5 a 20% do peso corporal. Todos os animais foram sacrificados após 20 semanas, e as lesões pulmonares foram analisadas. Resultados: A mediana do número de lesões (nódulos e hiperplasias) foi de 3,0 para o grupo 1, 2,0 para o grupo 2 e 1,5 para o grupo 3 (p = 0,052). Quando comparado apenas a presença ou ausência de lesão, houve uma diminuição no número de lesões no grupo 3 em comparação com o grupo 1 (p = 0,03), mas não em relação ao grupo 2. Não houve metástases ou outras alterações em outros órgãos. Conclusão: A atividade física anaeróbia, mas não a aeróbia, diminuiu a incidência dos tumores de pulmão experimental.