In this thesis, a mathematical model for HIV and TB co-infection with TB treatment among populations of Ethiopia is developed and analyzed. The TB model includes an age of infection. We compute the basic reproduction numbers RTB and RH for TB and HIV respectively, and the overall repro- duction number R for the system. We find that if R < 1 and R > 1; then the disease-free and the endemic equilibria are locally asymptotically stable, respectively. Otherwise these equilibria are unstable. The TB-only endemic equilibrium is locally asymptotically stable if RTB > 1, and RH < 1. How- ever, the symmetric condition, RTB < 1 and RH > 1, does not necessarily guarantee the stability of the HIV-only equilibrium, but it is possible that TB can coexist with HIV when RH > 1: As a result, we assess the impact of TB treatment on the prevalence of TB and HIV co-infection. To derive and formulate the nonlinear differential equations models for HIV and TB co-infection that accounts for treatment, we formulate and analyze the HIV only sub models, the TB-only sub models and the full models of HIV and TB combined. The TB-only sub model includes both ODEs and PDEs in order to describe the variable infectiousness and e ect of TB treatment during the infectious period. To analyse and solve the three models, we construct robust methods, namely the numerical nonstandard definite difference methods (NSFDMs). Moreover, we improve the order of convergence of these methods in their applications to solve the model of HIV and TB co-infection with TB treatment at the population level in Ethiopia. The methods developed in this thesis work and show convergence, especially for individuals with small tolerance either to the disease free or the endemic equilibria for first order mixed ODE and PDE as we observed in our models. / Mathematical Sciences / Ph. D. (Applied Mathematics)

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-03-25 / A infecção pelo herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) e suas correlações clínicas não foram até o presente bem caracterizadas em indivíduos recém-infectados pelo HIV. Esse estudo avalia a prevalência e correlações clínicas da infecção pelo HHV-8 em uma coorte de 228 indivíduos recém-infectados pelo HIV (vírus da imunodeficiência humana), além de estudar a incidência desta infecção após um ano de acompanhamento. As sorologias para HHV-8 foram realizadas através de imunofluorescência indireta para antígenos latentes e líticos. Encontrou-se prevalência de 25,9% (59/228) no início do acompanhamento. No modelo de análise univariada, foram encontradas associações estatisticamente significantes com sexo masculino (p=0,05), transmissão entre homens que fazem sexo com homens (p=0,023), hepatite B (p=0,009), sífilis (0,034) e etnia negra (p=0,021). No modelo multivariado permaneceram as associações com modo de transmissão, hepatite B e etnia negra. Não foram evidenciadas diferenças nas medianas da contagem de linfócitos T CD4+ e na carga viral do HIV de acordo com positividade para o HHV-8. Em termos de incidência, foram observadas 23/127 (18,1%) soroconversões na coorte após 1 ano de acompanhamento. A partir deste estudo pode-se concluir que o HHV-8 é altamente prevalente em indivíduos recém-infectados pelo HIV. Além disso, as correlações encontradas entre o HHV-8 e outras infecções sexualmente transmissíveis corroboram a teoria de que estas infecções compartilham modos de trasmissão comuns. / Background: Human herpesvirus 8 (HHV-8) is the etiological agent for Kaposi’s sarcoma, which occurs especially in HIV-infected subjects. HHV-8 infection and its clinical correlates have not been well characterized in recently HIV-1-infected individuals. Methods: We assessed the HHV-8 seroprevalence, clinical correlates, and incidence after one year of follow-up in a cohort of 228 recently HIV-1-infected individuals using indirect immunofluorescence assay. Results: The prevalence of HHV-8 infection at the time of cohort enrollment was 25.9% (59/228). In the univariate model, there were significant associations with male gender (p=0.05), black ethnicity (p=0.021), men who have sex with men (MSM) practice (p=0.023), and previous hepatitis B virus (p=0.009) and syphilis (p=0.034) infections. In the multivariate model we could still demonstrate association with MSM, hepatitis B, and black ethnicity. No differences in mean CD4+ cell counts or HIV viral load according to HHV-8 status were found. In terms of incidence, there were 23/127 (18.1%) seroconversions in the cohort after one year. Conclusions: HHV-8 is highly prevalent among recently HIV-1-infected subjects. Correlations with other sexually transmitted infections suggest common transmission routes. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Magister Public Health - MPH (Public Health) / Over the past two decades, despite a growing tuberculosis (TB) epidemic, the South African health system and National TB Programme (NTP) have taken significant steps to ensure improved clinical awareness, early diagnosis, prompt treatment initiation and follow-up of treatment outcomes in cases of TB. The effects of these programmatic measures over time on changes in the severity of disease and presenting clinical profile of patients with pulmonary TB have not been studied. Doing so may provide another window on the impact of TB control initiatives in South Africa.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:46:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 618598 bytes, checksum: 78e08690fd4db366e1e37fe332d558bc (MD5) Previous issue date: 2009-02-27 / The porcine circovirus, caused by the porcine circuvirus type 2 (PCV 2), and the porcine enzootic pneumonia, caused by the Mycoplasma hyopneumoniae, are infectious contagious diseases of great importance for worldwide swine production, both causes pneumonias with different presentation patterns. They have cosmopolite distribution and are among the major causes in economic losses. This work was made aiming the evaluation of the co-infection between porcine circovirus 2 (PCV2) and Mycoplasma hyopneumoniae using real time polymerase chain reaction (qPCR), immunohistochemistry and histopathological analyses. 120 lungs fragments, 45 being from fragments with macroscopic lesions (CLM) and 75 being from fragments without macroscopic lesions (SLM) were analyzed by histopathology procedures. Among these, 32 samples were randomly selected (being 16 without macroscopic lesions and 16 with macroscopic lesions) for the immunohistochemistry analyses (for Mycoplasma hyopneumoniae detection) and qPCR (for PCV 2 detection). No significant difference was observed between the groups (SLM and CLM) on the tests, indicating that the absence of macroscopic lesions doesn t reject the possible presence of agents neither the presence of microscopic lesions. The histopatological technique showed itself as an important tool for diagnosis approach. Although the lesion are not patognomonic for the agents in the analyses, they are quite suggestive about the viral and bacterium scene, and these findings, together with the presence of clinical signs and agent detection (more frequently made by qPCR and immunohistochemistry), confirm the diagnosis of each agent isolated or co-infection. Although the samples analyzed by RT-PCR had shown higher number of negative results and low viral quantity, many authors related that lungs are among the organs with the lowest viral quantities of PCV2, being, for that reason, the liver linfonodes, the main target of the PCV2, more indicated for viral quantification. It was verified a positive correlation between the immunohistochemistry analysis and the histopathology analysis using the Pearson statistical test, which confirms the presence of the agent in the histopathology observations. Forward studies using linfonodes samples (target of the PCV2) and samples collected from different lung anatomic regions must be realized for evaluation of a co-infection for more accurate results. / A circovirose suína, causada pelo circovirus suíno tipo 2 (PCV2), e a pneumonia enzoótica suína, causada pelo Mycoplasma hyopneumoniae, são doenças infecto-contagiosas de grande importância na suinocultura mundial, ambas causam pneumonias com diferentes formas de apresentação. Têm distribuição cosmopolita e estão entre as principais causas de perdas econômicas. O presente trabalho foi realizado com o objeto de avaliar a coinfecção entre Circovírus suíno 2 e o Mycoplasma hyopneumoniae, por meio da reação da polimerase em cadeia em tempo real (qPCR), técnica de imunoistoquímica e exames histopatológicos. Cento e vinte fragmentos de pulmões, sendo 45 com lesões macroscópicas (CLM) e 75 sem lesões macroscópicas (SLM) foram analisados pela histopatologia. Destes, foram selecionadas aleatoriamente 32 amostras (sendo 16 sem lesões macroscópicas e 16 com lesões macroscópicas) para a realização dos testes de imunoistoquímica (para a detecção do Mycoplasma hyopneumoniae) e qPCR (para detecção do PCV2). Não foi observada diferença significativa entre os grupos (SLM e CLM) em nenhum dos testes, o que indica que a ausência de lesões macroscópicas não descarta a possibilidade da presença dos agentes nem de lesões microscópicas. A técnica de histopatologia representou uma importante ferramenta para se aproximar ao diagnóstico. Embora as lesões não sejam patognomônicas para os agentes avaliados, elas são bastante sugestivas dos quadros viral e bacteriano, e esses achados, aliados a presença de sinais clínicos e detecção do agente (que são mais frequentemente realizados por qPCR e imunoistoquímica), confirmam o diagnóstico de cada agente isoladamente ou da coinfecção. Apesar das amostras analisadas pelo qPCR terem apresentado grande número de resultados negativos e baixa carga viral, diversos autores relatam que o pulmão é um dos órgãos com menor carga viral de PCV2, sendo desta forma os órgãos linfóides, principais alvos do PCV2, mais indicados para a quantificação viral. Foi verificada uma correlação positiva do teste de imunoistoquímica com o teste histopatológico de acordo com o teste estatístico de Pearson, o que confirma a presença do agente nas lesões observadas na histopatologia. Estudos futuros utilizando a coleta de linfonodos (órgão alvo do PCV2) e amostras coletadas de diferentes regiões anatômicas pulmonares devem ser realizados para avaliar a co-infecção de uma forma mais acurada.

Estudos preliminares visando a identificação de possíveis agentes virais associados à síndrome multissistêmica do definhamento dos suínos (SMDS) revelaram uma possível associação inversa entre a presença de TTSuV1 e a ocorrência da SMDS. Com base neste achado, foi formulada a hipótese de que o TTSuV1 poderia ser capaz de inibir a multiplicação do PCV2, impedindo assim o desenvolvimento da SMDS. Buscando esclarecer esta questão, seria necessário desenvolver um sistema eficiente de replicação para este vírus, até o presente ainda não disponível. Em vista disso, foi desenvolvido um método de detecção de infecções por TTSuV em cultivos celulares para a avaliação de possíveis linhagens a serem potencialmente utilizadas para isolamento e multiplicação destes vírus. Genomas de TTSuVs foram detectados em células de linhagem de origem suína e não suína assim como em um dos lotes de tripsina. Os soros utilizados como suplemento para o meio de cultivo não apresentaram genomas de TTSuV. Desta forma, o lote de tripsina contaminado pode ser considerado uma importante fonte de contaminação, principalmente em células de origem não suína. Com o objetivo de avaliar uma possível associação entre os TTSuVs e a ocorrência da SMDS, a frequência de detecção e quantificação de genomas de TTSuV1 e TTSuV2 em tecidos e soros de suínos com e sem SMDS foram determinadas. A análise feita nos diferentes tecidos de suínos revelou uma aparente correlação inversa entre a presença do genoma de TTSuV1 e a ocorrência da SMDS. Quanto ao TTSuV2 em tecidos de suínos com e sem a SMDS, nenhuma diferença estatística foi observada. A distribuição do genoma de TTSuV1 e TTSuV2 nos diferentes tecidos examinados não revelou um órgão alvo específico. A frequência de detecção e a carga viral de TTSuV1 e 2 nas amostras de soro de suínos com e sem a SMDS não apresentaram diferença significativa. No entanto, a carga viral de TTSuV2 foi mais alta do que a carga viral de TTSuV1 nos soros de todos os grupos de animais estudados. Estes resultados indicam uma alta frequência de detecção de ambas as espécies de TTSuV em amostras de tecidos e soros de suínos com e sem a SMDS. / Preliminary studies aiming the identification of possible viral agents associated with the postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) revealed a possible negative association between TTSuV1 and occurrence of PMWS. Based on this finding was hypothesized that TTSuV1 might be able to inhibit the PCV2 multiplication, preventing the development of PMWS. To better clarify this, would be require an efficient system of replication for this virus, which has not been reported in the literature. In view of this, a method for detection of TTSuV infections in cell culture was developed to assess possible cell lineages to be potentially used for virus isolation and multiplication. TTSuV genomes were detected in cell lineages of porcine and nonporcine origin as well as a batch of trypsin. Sera used as media supplement was not found to contain TTSuV genomes. Thus, the contaminated batch of trypsin can be considered an important source of contamination, especially in cells of non-porcine origin. In order to evaluate a possible association between the TTSuVs and the occurrence of PMWS, the frequency of detection and quantification of TTSuV1 and TTSuV2 genomes in tissues and sera from pigs with and without PMWS were determined. The analysis in the different tissues of pigs reveal an apparent inverse correlation between the frequency of detection of TTSuV1 genomes and the occurrence of PMWS. Regarding TTSuV2 in tissues of PMWS and non-PMWS-affected animals no significant differences was observed. The distribution of TTSuV1 and TTSuV2 genomes in tissues did not reveal any particular target organ. The frequency of detection and viral load of TTSuV1 and TTSuV2 in sera samples were no significant statistically among animals PMWS-affected and healthy pig. The mean of TTSuV2 viral load was significantly highest than TTSuV1 in sera of all groups studied. These results indicate a high frequency of detection of both TTSuV species in tissues and sera samples from PMWS-affected and healthy pig.

INTRODUÇÃO: O vírus da hepatite G (GBV-C) foi descoberto simultaneamente por dois grupos de pesquisa que buscavam identificar um agente causador de hepatite pós-transfusional não-A, não-B e não-C. Trata-se de um vírus linfotrópico que replica primariamente em células mononucleares do sangue periférico (PBMC), baço e medula óssea, sendo a replicação hepática menos importante. Sabe-se que, após um período de viremia assintomática, a maioria dos carreadores virais clareia o vírus ao longo do tempo havendo surgimento do anticorpo contra a glicoproteína do envelope viral, anti-E2. Uma vez que, provavelmente, não exista nenhuma associação entre o GBV-C e qualquer doença identificada até o momento, o mesmo tem sido considerado um vírus humano não patogênico. Entretanto, alguns estudos demonstraram haver uma interação benéfica entre o GBV-C e HIV a ponto de retardar a progressão da infecção pelo HIV para aids. OBJETIVOS: Avaliar a prevalência da viremia e de anticorpos contra a glicoproteína anti-E2 e estudar o efeito da interação GBV-C e HIV ao longo do acompanhamento de pacientes femininas baseado em valores da média e mediana de linfócitos T CD4+ , da carga viral do HIV e da carga viral quantitativa do GBV-C RNA. MÉTODOS: Foram estudas 248 pacientes femininas portadoras da infecção pelo HIV acompanhadas por um período de cerca de 10 anos, tendo como término de estudo a data limite de 01/01/2008, ou a data da última consulta no ambulatório ou a data do óbito. RESULTADOS: Das 115 pacientes expostas, 57 eram GBV-C RNA positivas (23%) e 58 eram anti-E2 positivas (23%). Não houve achado da presença concomitante do GBV-C RNA e do anticorpo anti-E2 nas pacientes estudas. Com relação à contagem de linfócitos T CD4+ e de carga viral basal do HIV no início do estudo, não observamos diferença estatística entre os valores em relação aos grupos (GBV-C RNA-/anti-E2- , GBV-C RNA+/anti-E2 - e GBV-C RNA -/anti-E2+), sendo o p=0,36 e 0,713, respectivamente. O risco relativo de óbito para o grupo GBV-C+/anti-E2- foi 63% menor do que para o grupo GBV-C-/anti-E2-. CONCLUSÃO: A prevalência da viremia por GBV-C RNA e a do anticorpo anti-E2 foi de 23%, perfazendo uma frequência de exposição ao GBV-C de 46%. Em análise multivariada, apenas a carga viral do HIV, maior que 100.000 cópias/mL, e manifestação de doença oportunística ao longo do acompanhamento das pacientes estiveram associadas à melhora da sobrevida. Provavelmente, o uso da terapia antirretroviral para o HIV foi fator limitante na análise de efeito protetor do GBV-C RNA em nossa casuística / INTRODUCTION: GB virus C (GBV-C) was discovered by two research groups that aimed to identify a possible agent responsible for a non-A, non-B and non-C pos-transfusion hepatitis. There is remarkable evidence that GBV-C is a lymphotropic virus that primarily replicates in PBMCs, spleen and bone marrow. This virus does not appear to be hepatotropic and does not replicate effectively in hepatocytes. After an asymptomatic viremia period, most subjetcs clear the virus over time with the development of antibody against a viral envelope glycoptrotein (anti-E2). Since there is probably no association between GBV-C and any identify disease, this virus has been considered not pathogenic. However, according to some studies, GBV-C co-infection in HIV seropositive patients is associated with a slower disease progression and longer survival after AIDS development in HIV infected patients. Objective: To evaluate the prevalence of GBV-C viremia, anti- E2 antibody and assess the effect of the interaction of GBV-C and HIV in an exclusive female cohort, in a follow up period of up to 10 years. Methodos: Two hundred forty-eight HIV infected women were enrolled in the study. Follow-up sample was obtained from 248 patients. Laboratorial variables as mean and median of values of CD4, HIV and GBV-C quantitative viral load, and clinical parameters as HAART use, OIs influence on survival were investigated. Results: One hundred and fifteen subjects were exposed to GBV-C: 57 were GBV-C RNA positive (23%) and 58 were anti-E2 antibody positive (23%). Viral RNA with concomitant anti-E2 antibodies was not found in any patient. There was no statistical difference among three studied groups (GBV-C RNA-/anti-E2 - , GBV-C RNA+/anti-E2- and GBV-C RNA -/anti-E2+), regarding CD4+ and viral load baselines (p=0,360 and 0,713, respectively). Relative risk of death for GBV-C RNA+/anti-E2- group was 63% lower than the GBV-C-/anti-E2 group. Conclusion: Forty-six percent of the enrolled individuals were exposed to GBV-C virus. Multivariate analysis demonstrated that only HIV load higher than 100.000 copies/mL and opportunistic disease during the follow-up period were associated to longer survival after AIDS development. Probably, antiretroviral therapy for HIV in our study blurred the observation of a putative protective effect related to GBVC RNA

Estudos preliminares visando a identificação de possíveis agentes virais associados à síndrome multissistêmica do definhamento dos suínos (SMDS) revelaram uma possível associação inversa entre a presença de TTSuV1 e a ocorrência da SMDS. Com base neste achado, foi formulada a hipótese de que o TTSuV1 poderia ser capaz de inibir a multiplicação do PCV2, impedindo assim o desenvolvimento da SMDS. Buscando esclarecer esta questão, seria necessário desenvolver um sistema eficiente de replicação para este vírus, até o presente ainda não disponível. Em vista disso, foi desenvolvido um método de detecção de infecções por TTSuV em cultivos celulares para a avaliação de possíveis linhagens a serem potencialmente utilizadas para isolamento e multiplicação destes vírus. Genomas de TTSuVs foram detectados em células de linhagem de origem suína e não suína assim como em um dos lotes de tripsina. Os soros utilizados como suplemento para o meio de cultivo não apresentaram genomas de TTSuV. Desta forma, o lote de tripsina contaminado pode ser considerado uma importante fonte de contaminação, principalmente em células de origem não suína. Com o objetivo de avaliar uma possível associação entre os TTSuVs e a ocorrência da SMDS, a frequência de detecção e quantificação de genomas de TTSuV1 e TTSuV2 em tecidos e soros de suínos com e sem SMDS foram determinadas. A análise feita nos diferentes tecidos de suínos revelou uma aparente correlação inversa entre a presença do genoma de TTSuV1 e a ocorrência da SMDS. Quanto ao TTSuV2 em tecidos de suínos com e sem a SMDS, nenhuma diferença estatística foi observada. A distribuição do genoma de TTSuV1 e TTSuV2 nos diferentes tecidos examinados não revelou um órgão alvo específico. A frequência de detecção e a carga viral de TTSuV1 e 2 nas amostras de soro de suínos com e sem a SMDS não apresentaram diferença significativa. No entanto, a carga viral de TTSuV2 foi mais alta do que a carga viral de TTSuV1 nos soros de todos os grupos de animais estudados. Estes resultados indicam uma alta frequência de detecção de ambas as espécies de TTSuV em amostras de tecidos e soros de suínos com e sem a SMDS. / Preliminary studies aiming the identification of possible viral agents associated with the postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) revealed a possible negative association between TTSuV1 and occurrence of PMWS. Based on this finding was hypothesized that TTSuV1 might be able to inhibit the PCV2 multiplication, preventing the development of PMWS. To better clarify this, would be require an efficient system of replication for this virus, which has not been reported in the literature. In view of this, a method for detection of TTSuV infections in cell culture was developed to assess possible cell lineages to be potentially used for virus isolation and multiplication. TTSuV genomes were detected in cell lineages of porcine and nonporcine origin as well as a batch of trypsin. Sera used as media supplement was not found to contain TTSuV genomes. Thus, the contaminated batch of trypsin can be considered an important source of contamination, especially in cells of non-porcine origin. In order to evaluate a possible association between the TTSuVs and the occurrence of PMWS, the frequency of detection and quantification of TTSuV1 and TTSuV2 genomes in tissues and sera from pigs with and without PMWS were determined. The analysis in the different tissues of pigs reveal an apparent inverse correlation between the frequency of detection of TTSuV1 genomes and the occurrence of PMWS. Regarding TTSuV2 in tissues of PMWS and non-PMWS-affected animals no significant differences was observed. The distribution of TTSuV1 and TTSuV2 genomes in tissues did not reveal any particular target organ. The frequency of detection and viral load of TTSuV1 and TTSuV2 in sera samples were no significant statistically among animals PMWS-affected and healthy pig. The mean of TTSuV2 viral load was significantly highest than TTSuV1 in sera of all groups studied. These results indicate a high frequency of detection of both TTSuV species in tissues and sera samples from PMWS-affected and healthy pig.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present work aims to investigate the relationship between infection with Schistosoma mansoni and other intestinal parasites. We performed two study designs: the first (Article 1) was an ecological study to evaluate the frequency and geographic distribution of diagnosed cases of infection with S. mansoni and intestinal parasites using a database survey of Health Department of the Sergipe State from 2005 to 2008. We created the database from the raw data of the Schistosomiasis Control Program of Sergipe (PCE-SE) in which we performed analysis of frequency and geographical distribution of infections caused by S. mansoni and other parasitic diseases with the software SPRING 5.0 to create maps. The results of this study revealed high incidence of schistosomiasis in many municipalities. Analyzing data from the IBGE (Brazilian Institute of Geography and Statistics) and the Superintendence of Water Resources (SRH) of these municipalities, it was observed that the municipalities with higher prevalence of schistosomiasis (> 15%) have lower sewerage coverage (Sanitation Index) as compared with those with a lower prevalence (< 15%) (p = 0.0513). We also observed higher education index (IDHE) in municipalities with prevalence of hookworm lower than 10% as compared to the ones with prevalence over 10% (p = 0.0365). The second model was a cross-sectional study in the city of Ilha das Flores, Sergipe, Brazil (Article 2), aiming to study in an area with high prevalence of schistosomiasis the interaction of several socio-environmental variables, epidemiological and clinical data with a geographical perspective. In this study, 570 individuals were studied using a questionnaire to collect data on socioeconomic, clinical, epidemiological and coproparasitological conducted from September 2008 to April 2010. This study has created a georeferenced database and geostatistical analysis conducted to determine and predict poliparasitism between S. mansoni and intestinalparasites, using the Kernel density estimator. The results showed that Trichuris trichiura (54.8%), Ascaris lumbricoides (49.2%), Entamoeba coli (25.6%) and S. mansoni (24.0%) were the predominant species. Spatial statistics has enriched the traditional measures of statistical estimation of the dispersion of epidemiologic risk factors determining the likely sites of contamination. We observed associations between S. mansoni infection and male gender (65.2% males, p = 0.003), being a farmer (p <0.001) or a fisherman (p <0.001), low educational level (p<0.001) and low income (p = 0.0005), any level of natural water contact (p <0.001) and drinking untreated water (p <0.001). We detected associations between A. lumbricoides (p=0,0002) and hookworm (p=0,01) infections with low income and between A. lumbricoides and T. trichiura with drinking untreated water (p=0.02 for both) and with open sewerage (p=0.001 and, p=0.0005, respectively). The data call for an integrated approach to effectively control multiple parasitic infections from the perspective of public health. / O presente estudo visa investigar a relação entre a infecção por Schistosoma mansoni e outras enteroparasitoses. A pesquisa foi delineada em dois modelos de estudo: no primeiro (Artigo 1) foi realizado um estudo ecológico objetivando avaliar a frequência e distribuição geográfica dos casos diagnosticados de Infecção por S. mansoni e enteroparasitas utilizando um levantamento da base de dados da Secretaria de Saúde do Estado de Sergipe de 2005 a 2008. A partir da matriz bruta do Programa de Controle da Esquistossomose de Sergipe (PCE-SE) formulou-se banco de dados no qual se realizou análises de freqüência e distribuição geográfica das infecções por S. mansoni e outros enteroparasitas com o software SPRING 5.0 para confeccção de mapas. Os resultados deste estudo revelaram elevada frequência de esquistossomose em diversos municípios do Estado. Analisando os dados do IBGE (Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística) e da Superintendência de Recursos Hídricos (SRH) destes municípios, foi observado que os municípios com uma prevalência da esquistossomose menor que 15% há maior rede de esgoto (Indice de Higiene) em comparação com aqueles com prevalências maiores do que 15% (p=0,05). Foi também encontrado maiores IDH educacionais nos municípios com prevalência de ancilostomídeos menores de 10% em comparação com os maiores de 10% (p=0,04). O segundo modelo foi um estudo transversal no município de Ilha das Flores-SE (Artigo 2), objetivando estudar em uma área com elevada prevalência de esquistossomose a interação de diversas variáveis socioambientais, epidemiológicas e clínicas com uma perspectiva geográfica. Neste estudo, foram estudados 570 indivíduos através de inquérito com coleta de dados socioeconômicos, clínico-epidemiológicos e coproscópicos georeferenciados, realizado de Setembro 2008 a abril de 2010. Neste estudo foi criado um banco de dados georeferenciado e realizado análise geoestatística para determinar e predizer 11 poliparasitismo entre S. mansoni e parasitas intestinais, através do estimador de densidade Kernel. Os resultados demonstram que Trichuris trichiura (54,8%), Ascaris lumbricoides (49,2%), Entamoeba coli (25,6%) e S. mansoni (24,0%), foram as espécies predominantes. A estatística espacial analisou a estimativa da dispersão de fatores de risco epidemiológicos para determinar os locais prováveis de contaminação. Foram encontradas associações entre infecção por S. mansoni e ser do gênero masculino (65.2% homens, p = 0,003), ser lavrador (p <0,001) ou pescador (p <0,001), ter baixo nível educacional (p<0,001) e ter baixa renda (p = 0,0005), ter qualquer nível de contato com águas naturais (p <0.001) e beber água não tratada (p <0,001). Detectamos associações entre A. lumbricoides (p=0,0002) e Ancylostoma/ Necator (p=0,01) com baixa renda e entre A. lumbricoides e T. trichiura com beber água não tratada (p=0,02 for ambos) e ter esgoto a céu aberto (p=0,001 e p=0,0005, respectivamente). Estes dados podem ser integrados ao programas de controle de esquistossomose e outras parasitoses.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-10-13T14:14:46Z No. of bitstreams: 1 michellealvesvicentini.pdf: 761505 bytes, checksum: 2f59d68ce4001875ae7881a93f5e4930 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-10-22T12:56:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 michellealvesvicentini.pdf: 761505 bytes, checksum: 2f59d68ce4001875ae7881a93f5e4930 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-22T12:56:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 michellealvesvicentini.pdf: 761505 bytes, checksum: 2f59d68ce4001875ae7881a93f5e4930 (MD5) Previous issue date: 2008-03-05 / FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / As parasitoses intestinais representam um importante problema médico-sanitário, tendo em vista o grande número de pessoas acometidas e as inúmeras alterações orgânicas que podem provocar no hospedeiro. Infecções provocadas por Strongyloides venezuelensis apresentam uma resposta imune local tanto nos pulmões quanto no intestino, predominantemente do tipo Th2, caracterizada pela produção das citocinas IL-4, IL-5, IL-13 e IL-10, resultando em eosinofilia, aumento da produção de muco, mastocitose e altas concentrações de IgE. Por outro lado, infecções provocadas por micobactérias estimulam uma imunidade predominantemente do tipo Th1 caracterizada pela produção de IFN-, IL-12, TNF- e óxido nítrico. A tuberculose, causada pelo patógeno intracelular Mycobacterium tuberculosis, é uma das doenças infecciosas mais importantes, sendo responsável por aproximadamente 2,9 milhões de óbitos e 8 milhões de novos casos por ano. Ainda são escassos os trabalhos envolvendo co-infecções, e devido às complexas relações existentes entre parasitos e entre eles e seu hospedeiro, faz-se necessário observações criteriosas. No presente trabalho avaliou-se o efeito modulatório que o Mycobacterium bovis virulento exerce sobre a resposta imune de camundongos co-infectados com S. venezuelensis. Os resultados demonstraram que o perfil de resposta imune durante a infecção por S. venezuelensis parece ser diretamente influenciado pela presença do M. bovis, uma vez que o perfil de resposta Th2, específico ao verme, esteve diminuído nos animais co-infectados. Tal diminuição pôde ser constatada pelo aumento do número de ovos e vermes nos animais co-infectados quando comparado com os animais infectados somente com S. venezuelensis; assim como a diminuição dos níveis de IgE específica à larva L3 do verme detectada em diferentes pontos da infecção; diminuição dos níveis de IL-10 produzida por células de baço estimuladas in vitro com antígeno da larva L3 do verme; diminuição dos níveis de IL-4, IL-5 e IL-13 no intestino; diminuição da expressão de CD80, CD86 e CD25 em células de baço e linfonodo e aumento da expressão de CD28 em células de linfonodos mesentéricos. Em conjunto, esses resultados sugerem que a infecção por M. bovis, e a conseqüente ativação do perfil de resposta imune do tipo Th1, foi capaz de modular o desenvolvimento do perfil de resposta imune do tipo Th2 contra S. venezuelensis nos animais co-infectados, deixando-os mais susceptíveis à infecção com S. venezuelensis. Esse trabalho é o primeiro a avaliar os mecanismos imunoregulatórios envolvidos na co-infecção S. venezuelensis versus M. bovis. / The intestinal parasites are a major medical-health problem, in view of the large number of people involved and the numerous organizational changes which may result in the host. Infections caused by Strongyloides venezuelensis have a local immune response in both lungs as in the intestine, predominantly from the Th2 type, characterized by the production of cytokines IL-4, IL-5, IL-13 and IL-10, resulting in eosinophilia, increased production of mucus, mastocytosis and high levels of IgE. In addition, infections caused by mycobacteria stimulate predominantly an Th1-type immune response characterized by the production of IFN-, IL-12, TNF- and nitric oxide. Tuberculosis, caused by intracellular pathogen Mycobacterium tuberculosis, is one of the most important infectious diseases, accounting for approximately 2.9 million deaths and 8 million new cases per year. Are still scarce papers involving co-infections, and because of the complex relationship between parasites and between them and their host, it is necessary criterious evaluations. This study evaluated the modulatory effect that the virulent Mycobacterium bovis has on the immune response of mice co-infected with S. venezuelensis. The results showed that the profile of immune response during infection with S. venezuelensis seems to be directly influenced by the presence of M. bovis, because the profile of Th2 response, specific to the worm, was reduced in co-infected animals. This decline could be observed by increasing the number of eggs and worms in animals co-infected when compared with animals infected only with S. venezuelensis, as well as decreased levels of IgE specific to the L3 larvae of the worm detected at different points of infection, decreased levels of IL-10 produced by spleen cells stimulated in vitro with L3 larvae antigen; decreased levels of IL-4, IL-5 and IL-13 in the intestine, reducing the expression of CD80, CD86 and CD25 cells in the spleen and lymph nodes and increased expression of CD28 cells in mesenteric lymph nodes. Together, these results suggest that infection with M. bovis, and the consequent activation of the profile of Th1-type immune response, was able to modulate the development of the profile of Th2 type of immune response against S. venezuelensis in co-infected animals, leaving them more susceptible to infection with S. venezuelensis. This work is the first to evaluate the mechanisms involved in imunoregulatory mechanisms involved in co-infection S. venezuelensis versus M. bovis.

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This study aimed to estimate the prevalence of occult HBV infection in HIV-infected treatment-naive patients, in Goiânia, Goiás, to determine the viral load of HBV-DNA positive samples, to identify circulating genotypes/subgenotypes and to investigate the occurrence of mutations in P and S regions of the HBV genome. This is a cross-sectional study conducted in HIV-infected treatment-naive patients attended at a reference hospital for infectious diseases in the Goiania city. After serological screening of the population (n = 505), two groups of patients were selected for this study: (i) 99 anti-HBc positive/HBsAg negative and (ii) 29 HBsAg reactive individuals. HBV-DNA was detected by semi-nested PCR and quantified by real time PCR. The amplicons were genotyped by RFLP and nucleotide sequencing. The identification of mutations in the viral genome was made by deduction of the amino acid sequences from the nucleotides sequences. The search for occult HBV infection performed in 99 anti-HBc positive/HBsAg negative samples (Group 1) showed a prevalence of 16.2% (16/99, 95% CI: 9.8-25.2). Of 29 HBsAg positive patients (Group 2), HBV-DNA was detected in 69% (20/29). As expected, DNA levels in the HBsAg reactive patients were significantly higher than those found in patients with occult infection (mean 2.89 x 108 copies/ml vs 6.59 x 102 copies/ml, p < 0.01). The genotypes (subgenotypes) A (A1 and A2), D (D2 and D3) and F (F2) were identified, being A/A1 the most frequently found. Mutations in the S region of HBV were found in both groups of patients, whereas mutations in the P region were observed only in patients HBsAg positive. These results revealed a high prevalence of occult HBV infection, the predominance of genotype A (A1), and the presence of mutations in the viral genome of HBV-HIV co-infected treatment-naive patients in Goiânia, Goiás. / Estima-se que cerca de 10% dos indivíduos infectados pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) em todo o mundo apresentam infecção crônica pelo vírus da hepatite B (HBV). A coinfecção HIV-HBV aumenta o risco para desenvolvimento de cirrose e hepatocarcinoma. Ainda, indivíduos coinfectados apresentam perfis sorológicos atípicos mais frequentemente do que os monoinfectados, sendo que muitos deles podem apresentar hepatite B oculta (presença do HBV-DNA no soro e/ou fígado na ausência do HBsAg), além de mutações no genoma viral que podem ter implicações no prognóstico da hepatite B e na terapêutica. Este estudo teve como objetivos estimar a prevalência de infecção oculta pelo HBV em indivíduos infectados pelo HIV, virgens de tratamento, em Goiânia-Goiás, determinar a carga viral das amostras HBV-DNA positivas, identificar os genótipos/subgenótipos circulantes e investigar a ocorrência de mutações nas regiões S e P do genoma do HBV. Este é um estudo transversal conduzido em pacientes infectados pelo HIV, virgens de tratamento, atendidos em um hospital de referência para doenças infecciosas na cidade de Goiânia. Após triagem sorológica da população (n=505), dois grupos de pacientes foram selecionados para o presente estudo: (i) 99 anti-HBc positivos/HBsAg negativos e (ii) 29 indivíduos HBsAg reagentes. O HBV-DNA foi detectado por semi-nested PCR e quantificado por PCR em tempo real. Os amplicons foram genotipados por RFLP e sequenciamento de nucleotídeos. A identificação de mutações no genoma viral foi feita pela dedução de aminoácidos a partir de sequências de nucleotídeos. Ao pesquisar a infecção oculta para o HBV nas 99 amostras anti-HBc positivas/HBsAg negativas (Grupo 1), estimou-se uma prevalência de 16,2% (16/99; IC 95%: 9,8-25,2). Dos 29 pacientes HBsAg positivos (Grupo 2), o HBV-DNA foi detectado em 69% (20/29). Como esperado, os níveis de HBV-DNA nos pacientes HBsAg reagentes foram significativamente maiores do que os encontrados nos pacientes com infecção oculta (média: 2,89 x 108 cópias/mL vs 6,59 x 102 cópias/mL; p < 0,01). Os genótipos (subgenótipos) A (A1 e A2), D (D2 e D3) e F (F2) foram identificados, sendo A/A1 os mais frequentes. Mutações na região S do HBV foram encontradas nos dois grupos de pacientes, enquanto que as mutações na região P foram evidenciadas somente nos pacientes HBsAg positivos. Estes resultados revelaram uma prevalência alta de infecção oculta pelo HBV, a predominância do genótipo A (A1), bem como a presença de mutações no genoma viral dos pacientes HBV-HIV coinfectados, virgens de tratamento, em Goiânia-Goiás.