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Contribution du modèle Age-Période-Cohorte à l'étude de l'épizootie d'Encéphalopathie Spongiforme Bovine en France et en Europe

Sala, Carole-Aline 15 December 2009 (has links) (PDF)
L'encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) est une maladie neuro-dégénérative fatale affectant les bovins ; elle est également une zoonose à l'origine du variant de la maladie de Creutzfeldt-Jakob. Identifiée pour la première fois au Royaume-Uni en 1986, cette maladie s'est rapidement étendue en Europe, malgré la mise en place de mesures de contrôle. En raison des particularités épidémiologiques de l'ESB (longue période d'incubation, âge précoce à l'infection et diagnostic post-mortem possible uniquement en fin d'incubation), l'évolution temporelle de l'exposition des bovins à l'ESB ne peut être appréhendée qu'à partir de la modélisation. Nous avons utilisé le modèle Age-Période-Cohorte afin de (ré)évaluer, en relation avec les principales mesures de contrôle, l'évolution de l'épizootie d'ESB à la lumière des données de surveillance les plus récente, en France, et dans six autres pays européens : Allemagne, Irlande, Italie, Pays-Bas, Pologne et Royaume-Uni.
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Effets sanitaires des faibles doses a faibles debits de dose : modélisation de la relation dose-réponse dans une cohorte de travailleurs du nucléaire

Metz, Camille 19 September 2011 (has links) (PDF)
L'objectif de cette thèse est de contribuer à l'estimation des risques radio-induits aux faibles débits dedose. Ce travail s'appuie sur la cohorte des travailleurs du nucléaire CEA-AREVA NC aprèsprolongation du suivi jusqu'en 2004. Une revue études épidémiologiques chez les travailleurs dunucléaire a été réalisée durant la première année de thèse. Une quantification de la relation doseréponsea été effectuée pour le risque de pathologies cancéreuses et non cancéreuses par différentesméthodes statistiques. Les facteurs modifiants la relation dose-réponse pour le risque de leucémieassocié à la dose ont été étudiés. Combinée à d'autres cohortes de travailleurs du nucléaire, cette étudepermettra de quantifier plus précisément les risques associés à de faibles doses chroniques, afin devalider les hypothèses actuelles du système de radioprotection.
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Conséquences et déterminants du déclin moteur chez le sujet âgé : analyses transversales et longitudinales dans la cohorte des 3 Cités.

Dumurgier, Julien 22 June 2011 (has links) (PDF)
Le déclin des performances motrices du sujet âgé est associé à un risque accru de morbimortalitéet représente une problématique majeure pour nos sociétés vieillissantes. Son origine est le plus souvent multifactorielle et nous nous sommes plus particulièrement intéressés au rôle des facteurs de risque vasculaire à partir des données longitudinales et transversales de la cohorte dijonnaise de l'étude des 3 Cités. Les performances motrices ont été évaluées à travers la mesure de la vitesse de marche sur 6 mètres chez des sujets âgés de 65 à 85 ans à l'inclusiondans l'étude.Nous avons ainsi observé que l'hypertension artérielle à l'inclusion dans l'étude était associée à une vitesse de marche plus lente et à un déclin de la vitesse de marche plus important au cours du suivi. Parmi les participants ayant eu une IRM cérébrale à l'inclusion, nous avons observé une relation entre la vitesse de marche et les volumes sous-corticaux de substance grise cérébrale, en particulier le volume du noyau caudé. Une vitesse de marche plus lente à l'inclusion était associée à un risque accru de mortalité toutes causes 5 ans plus tard, avec une association plus forte pour la mortalité cardiovasculaire.Ces résultats sont en faveur d'une contribution cérébrovasculaire au déclin des fonctions motrices du sujet âgé, et participent à une meilleure compréhension de ce processus.
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Contribution à la description phénotypique et à l'étude des patients atteints d'hémochromatose HFE

Manet, Ghislain 11 December 2013 (has links) (PDF)
L'hémochromatose HFE due à la mutation C282Y entraine une surcharge en fer progressive. La surmortalité se produit après 50ans. La saignée répétée est un traitement efficace de peu d'effets secondaires. Justifier le dépistage est discuté depuis 60ans et dépend de l'efficacité du traitement et de la pénétrance en fonction d'enjeux économiques et sociaux. Ce travail apporte des éléments tirés de la cohorte LOGIFER depuis 25ans au CHU de Rennes, composée de 1835 homozygotes consultants du CHU, issus d'enquêtes ciblées, référés au CNR ou parents. Les motifs de recrutement, le sexe et l'âge ont évolué. 2/3 des patients sont des probants dont la moitié issus de dépistage, d'une meilleure représentativité. Le sexe-ratio est de 1.2. Ils sont caractérisés par la mélanodermie et les hépatopathies. Les atteintes articulaires sont peu spécifiques. Les mesures classiques de la surcharge sont univoques, très hétérogène selon les individus, elle augmente au moins jusque 60ans. Les femmes stockent le fer lentement jusqu'à la ménopause. L'alcool et le syndrome métabolique aggravent la surcharge. L'alcool accélère le dépistage clinique. Le syndrome métabolique crée une surcharge modérée, les arthropathies associées concernent d'autres articulations. Environ 20% des troubles au diagnostic contribuent à la pénétrance. L'Iron removal index repose sur la quantité de fer ôté pour entretenir le statut martial. Il a 2 usages probablement valables pour d'autres hémochromatoses. Mesurer la vitesse d'absorption du fer propre à un patient, complétant le phénotype et donnant une vue dynamique du risque de surcharge au contraire des critères classiques. Fournir un cadre de pilotage des saignées. Le rythme de traitement est personnalisable et prévisible au diagnostic (âge, sexe, fibrose, objectif de ferritine, poids). Corollairement, l'évolution du statut martial sous saignées implique des explorations complémentaires. Les patients génotypés suivis 8.5ans pendant le traitement ont une mortalité de 5%. A 54ans, il n'y a pas de surmortalité après ajustement sur le sexe, le lieu et l'année de naissance. Il y a une mortalité hépatique significative surtout des cancers primaires (ICM=18). Ils décèdent dans les 5ans du diagnostic. Elle est compensée par une sous-mortalité ultérieure cardiaque ou par d'autres cancers. La durée de vie baisse pour les patients anciennement recrutés en partie due au diagnostic tardif et aux traitements adjuvants moins efficaces. L'âge au décès va de 64 à 68ans. L'effet des saignées n'est pas quantifiable mais milite pour le traitement précoce. Le prédicteur de cirrhose de Guyader s'adapte à la prédiction des fibroses (indice de Youden similaire). L'analyse discriminante prédit les stades METAVIR avec un contrôle de fiabilité. Ces équations sont les meilleurs prédicteurs parmi les index proposés par la littérature. Le développement des résultats passe par la mise en place d'études longitudinales entre 65 et 80ans et l'étude des pathologies non létales.
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Modélisation des données d'enquêtes cas-cohorte par imputation multiple : Application en épidémiologie cardio-vasculaire.

Marti soler, Helena 04 May 2012 (has links) (PDF)
Les estimateurs pondérés généralement utilisés pour analyser les enquêtes cas-cohorte ne sont pas pleinement efficaces. Or, les enquêtes cas-cohorte sont un cas particulier de données incomplètes où le processus d'observation est contrôlé par les organisateurs de l'étude. Ainsi, des méthodes d'analyse pour données manquant au hasard (MA) peuvent être pertinentes, en particulier, l'imputation multiple, qui utilise toute l'information disponible et permet d'approcher l'estimateur du maximum de vraisemblance partielle.Cette méthode est fondée sur la génération de plusieurs jeux plausibles de données complétées prenant en compte les différents niveaux d'incertitude sur les données manquantes. Elle permet d'adapter facilement n'importe quel outil statistique disponible pour les données de cohorte, par exemple, l'estimation de la capacité prédictive d'un modèle ou d'une variable additionnelle qui pose des problèmes spécifiques dans les enquêtes cas-cohorte. Nous avons montré que le modèle d'imputation doit être estimé à partir de tous les sujets complètement observés (cas et non-cas) en incluant l'indicatrice de statut parmi les variables explicatives. Nous avons validé cette approche à l'aide de plusieurs séries de simulations: 1) données complètement simulées, où nous connaissions les vraies valeurs des paramètres, 2) enquêtes cas-cohorte simulées à partir de la cohorte PRIME, où nous ne disposions pas d'une variable de phase-1 (observée sur tous les sujets) fortement prédictive de la variable de phase-2 (incomplètement observée), 3) enquêtes cas-cohorte simulées à partir de la cohorte NWTS, où une variable de phase-1 fortement prédictive de la variable de phase-2 était disponible. Ces simulations ont montré que l'imputation multiple fournissait généralement des estimateurs sans biais des risques relatifs. Pour les variables de phase-1, ils approchaient la précision obtenue par l'analyse de la cohorte complète, ils étaient légèrement plus précis que l'estimateur calibré de Breslow et coll. et surtout que les estimateurs pondérés classiques. Pour les variables de phase-2, l'estimateur de l'imputation multiple était généralement sans biais et d'une précision supérieure à celle des estimateurs pondérés classiques et analogue à celle de l'estimateur calibré. Les résultats des simulations réalisées à partir des données de la cohorte NWTS étaient cependant moins bons pour les effets impliquant la variable de phase-2 : les estimateurs de l'imputation multiple étaient légèrement biaisés et moins précis que les estimateurs pondérés. Cela s'explique par la présence de termes d'interaction impliquant la variable de phase-2 dans le modèle d'analyse, d'où la nécessité d'estimer des modèles d'imputation spécifiques à différentes strates de la cohorte incluant parfois trop peu de cas pour que les conditions asymptotiques soient réunies.Nous recommandons d'utiliser l'imputation multiple pour obtenir des estimations plus précises des risques relatifs, tout en s'assurant qu'elles sont analogues à celles fournies par les analyses pondérées. Nos simulations ont également montré que l'imputation multiple fournissait des estimations de la valeur prédictive d'un modèle (C de Harrell) ou d'une variable additionnelle (différence des indices C, NRI ou IDI) analogues à celles fournies par la cohorte complète
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L’épidémiologie de l’infection VIH chez l’adulte en Guadeloupe : étude à partir de la base de données hospitalière sur l’infection VIH (1988-2009) / The epidemiology of HIV among adults in Guadeloupe : a study from the guadeloupean hospital database of HIV (1988-2009)

Elenga, Narcisse 10 November 2014 (has links)
Avec un taux d’incidence cumulée de 56 cas pour 100 000 habitants, la Guadeloupe est la deuxième région de France la plus touchée par le VIH. La plupart des publications sur le VIH/Sida en Guadeloupe sont essentiellement descriptives, issues de rapports d’activité. La base hospitalière, alimentant la Base de données Hospitalière française sur l’infection à VIH, n’a été que très peu exploitée pour la recherche. L’objectif de ce travail est d’évaluer les aspects fondamentaux de la prise en charge de l’infection VIH. Ainsi le dépistage tardif, le retard à la prise en charge spécialisée, l’interruption du suivi, les infections opportunistes et les décès sont étudiés ainsi que leurs facteurs prédictifs.Dans ce travail articulé autour de six publications, nous avons mis en évidence les points suivants : tout d’abord, le diagnostic très tardif (CD4<200/mm3) concernait 40,12 % des adultes infectés par le VIH suivis en Guadeloupe. Comparé à la France métropolitaine, ce taux est encore très élevé et souligne l’importance de poursuivre les efforts de dépistage. Pour pouvoir bénéficier d’une prise en charge précoce, le patient doit être dirigé dans un centre de traitement de l’infection par le VIH sans tarder. Or, le retard dans cette prise en charge spécialisée touchait 36 % des patients. L’analyse des éléments associés à ce retard a permis d’en identifier les facteurs de risque.Pour optimiser les résultats thérapeutiques, les patients nécessitent un suivi régulier. Ainsi, le système de santé devrait avoir comme objectif, entre autres, la rétention des patients dans le circuit de soins. Or, plus de 22 % des patients de cette cohorte étaient perdus de vue et jamais revus. Les patients plus jeunes, ceux au stade B de la classification CDC et ceux non traités par TTARV étaient plus à risque d’interruption de suivi, dès la première année suivant le diagnostic de l’infection VIH.Bien que la proportion des patients suivis sous ARV soit proche de 100 %, il en existe toujours développant un Sida. La comparaison avec la Guyane et la France métropolitaine montre que les trois premières affections classantes en Guadeloupe étaient la candidose oesophagienne, le syndrome de cachexie liée au VIH et la pneumocystose. Il existait des différences notables avec la métropole, mais aussi avec la Guyane. Ce taux élevé de syndrome de cachexie liée au VIH pose question. Derrière ce diagnostic, pourraient se cacher d’autres maladies opportunistes non diagnostiquées, mais également des différences de codage. Le recul de la mortalité avec le temps a entraîné une modification qualitative des causes de décès. Celles rapportées dans la littérature étaient les mêmes que celles observées dans notre étude. Contrairement à la métropole où le cancer représentait la première cause de mortalité, en Guadeloupe, les infections liées au Sida constituaient la première cause de décès.Ce travail de thèse s’est donc efforcé de dégager, pour l’une des régions de France les plus affectées par le VIH, quelques grands indicateurs à partir de la Base Hospitalière FHDH. Cette base ne comportait pas toujours toutes les informations souhaitées, mais le nombre substantiel d’observations donnait une puissance importante aux variables étudiées. Ces résultats, bien que confirmant souvent les connaissances empiriques des cliniciens, aura pu aider à mieux appréhender l’épidémie du VIH en Guadeloupe. / With an accumulated incidence rate of 56 cases per 100 000 inhabitants, Guadeloupe is the second French region most affected by HIV. Most of the publications on HIV/AIDS were essentially descriptive, stemming from annual reports. The Guadeloupean Hospital Database on HIV was scarcely exploited for research. The objective of this work was to estimate the fundamental aspects of HIV/AIDS in Guadeloupe. So late presentation for care, delay between HIV diagnosis and first specialised consultation, follow-up interruption, incidence of depression, opportunistic infections and deaths were studied as well as their predictive factors. We were able to highlight the following points: first, the very late HIV diagnosis (CD4< 200 / mm3) concerned 40, 12 % of HIV- infected adults followed in Guadeloupe. 36 % of patients had delays between HIV diagnosis and first specialised consultation. However, more than 22 % of patients were permanently lost to follow-up and never seen again. The first three classifying affections were oesophageal candidiasis, HIV-wasting syndrome and pneumocystosis. The causes of deaths reported in the literature were similar to those observed in our study. AIDS-related infections were the first cause of deaths.This thesis work thus tried to generate, in one of the most HIV-affected French regions, some indicators from the French Hospital Database on HIV. This database often did not contain all the desired informations, but the important number of observations allowed to have high power for the studied variables. These results, although often confirming the clinicians' empirical knowledge, may help understand some aspects of the HIV epidemic in Guadeloupe.
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Contribution à la description phénotypique et à l'étude des patients atteints d'hémochromatose HFE / Contribution TO PHENOTYPICAL description AND SURVIVAL analysis of patients suffering from HFE hemochromatosis

Manet, Ghislain 11 December 2013 (has links)
L'hémochromatose HFE due à la mutation C282Y entraine une surcharge en fer progressive. La surmortalité se produit après 50ans. La saignée répétée est un traitement efficace de peu d'effets secondaires. Justifier le dépistage est discuté depuis 60ans et dépend de l'efficacité du traitement et de la pénétrance en fonction d'enjeux économiques et sociaux. Ce travail apporte des éléments tirés de la cohorte LOGIFER depuis 25ans au CHU de Rennes, composée de 1835 homozygotes consultants du CHU, issus d'enquêtes ciblées, référés au CNR ou parents. Les motifs de recrutement, le sexe et l'âge ont évolué. 2/3 des patients sont des probants dont la moitié issus de dépistage, d'une meilleure représentativité. Le sexe-ratio est de 1.2. Ils sont caractérisés par la mélanodermie et les hépatopathies. Les atteintes articulaires sont peu spécifiques. Les mesures classiques de la surcharge sont univoques, très hétérogène selon les individus, elle augmente au moins jusque 60ans. Les femmes stockent le fer lentement jusqu'à la ménopause. L'alcool et le syndrome métabolique aggravent la surcharge. L'alcool accélère le dépistage clinique. Le syndrome métabolique crée une surcharge modérée, les arthropathies associées concernent d'autres articulations. Environ 20% des troubles au diagnostic contribuent à la pénétrance. L'Iron removal index repose sur la quantité de fer ôté pour entretenir le statut martial. Il a 2 usages probablement valables pour d'autres hémochromatoses. Mesurer la vitesse d'absorption du fer propre à un patient, complétant le phénotype et donnant une vue dynamique du risque de surcharge au contraire des critères classiques. Fournir un cadre de pilotage des saignées. Le rythme de traitement est personnalisable et prévisible au diagnostic (âge, sexe, fibrose, objectif de ferritine, poids). Corollairement, l'évolution du statut martial sous saignées implique des explorations complémentaires. Les patients génotypés suivis 8.5ans pendant le traitement ont une mortalité de 5%. A 54ans, il n'y a pas de surmortalité après ajustement sur le sexe, le lieu et l'année de naissance. Il y a une mortalité hépatique significative surtout des cancers primaires (ICM=18). Ils décèdent dans les 5ans du diagnostic. Elle est compensée par une sous-mortalité ultérieure cardiaque ou par d'autres cancers. La durée de vie baisse pour les patients anciennement recrutés en partie due au diagnostic tardif et aux traitements adjuvants moins efficaces. L'âge au décès va de 64 à 68ans. L'effet des saignées n'est pas quantifiable mais milite pour le traitement précoce. Le prédicteur de cirrhose de Guyader s'adapte à la prédiction des fibroses (indice de Youden similaire). L'analyse discriminante prédit les stades METAVIR avec un contrôle de fiabilité. Ces équations sont les meilleurs prédicteurs parmi les index proposés par la littérature. Le développement des résultats passe par la mise en place d'études longitudinales entre 65 et 80ans et l'étude des pathologies non létales. / Hemochromatosis due to the HFE mutation C282Y causes a progressive iron overload. The mortality occurs after 50 years. Repeated bleeding is an effective treatment with marginal side effects. The rationale for screening, debated for 60 years, depends on the penetrance and the effectiveness of treatment relatively to economic and social issues. This work provides evidence from cohort LOGIFER, 25 years old at the CHU of Rennes, composed of 1835 homozygous: consultants from CHU, from targeted surveys, referred to the NRC or related. The reasons for recruitment, gender and age have changed. 2/3 of patients are probants, half of them coming from screening, providing better representativity. The sex ratio was 1.2. They are characterized by skin pigmentation and liver disease. Joint involvement are nonspecific. Traditional measures of overload are unequivocal , highly heterogeneous among individuals and increases until at least 60 years. Women store iron slowly until menopause. Alcohol and metabolic syndrome worse overload. Alcohol accelerates the clinical discover. Metabolic syndrome creates a moderate overload, associated arthropathies involve other joints. Approximately 20% of clinical signs at diagnosis contribute to the penetrance. The Iron removal index is based on the amount of iron removed to maintain iron status . It has two usages probably valid for other hemochromatosis. Measuring the rate of absorption of iron for a specific patient, supplementing the phenotype and giving a dynamic view of the risk of overload unlike conventional criteria. Providing a framework for controlling the bleeding pattern. The processing rate is customizable and predictable at diagnosis (age, sex, fibrosis, ferritin target, weight). Con,sequently, changes in iron status during maintaining treatment involves complementary explorations. Genotyped patients monitored for 8.5 years during treatment have a mortality rate of 5%. At 54 years, there is no excess mortality after adjustment for sex, place and year of birth. There is a significant hepatic mortality especially primary liver cancers (ICM=18). They die within 5 years of diagnosis. It is offset by a subsequent under mortality from heart diseases or other cancers. Life expectancy down for patients initially enrolled in part due to delayed diagnosis and less effective adjuvant treatments. The age at death is 64 to 68 years. The effect of phelbotomies is not quantifiable but advocates for early treatment. The Guyader's predictor of cirrhosis adapts to the prediction of fibrosis (similar Youden index). Discriminant analysis predicts METAVIR stages with the benefit of a reliability check. These equations are the best predictors among candidates proposed by the literature. Development goes through the implementation of longitudinal studies between 65 and 80 years and the study of non-lethal forms.
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Santé sexuelle après cancer en France : fréquence des troubles et prise en charge / Sexual health after cancer in France : the frequency of related problems and associated care

Ben Charif, Ali 15 February 2016 (has links)
Le cancer et ses traitements pèsent lourdement sur la vie quotidienne des patients et de leur entourage, brouillant les projets de vie jusque dans leurs aspects les plus intimes. La dysfonction sexuelle est l'une des conséquences fréquentes et majeures des traitements contre le cancer. Ces troubles potentiels sont connus mais insuffisamment documentés et imparfaitement expliqués aux patients. En France, il n’y a aucune recommandation nationale en matière de prise en charge de la santé sexuelle après-cancer. Ainsi, dans un cadre national pour l’amélioration de la prise en charge des patients, l’objectif de ce travail était d’évaluer la fréquence des troubles sexuels, la discussion avec les soignants et la satisfaction envers cette discussion, mais aussi de déterminer les facteurs susceptibles d’influencer ces trois indicateurs. Pour cela, nos analyses ont été réalisées sur des données de l’enquête nationale VICAN (n=4349) et de la cohorte régionale ELIPPSE40 (n=623). Ces analyses ont mis en évidence une forte prévalence de troubles sexuels significatifs dans toutes les localisations tumorales ainsi que des inégalités de prise en charge liées à l’âge, au genre, à la localisation tumorale et au type de centre hospitalier. Elles ont également souligné une faible satisfaction des patients envers les informations portant sur la santé sexuelle. Globalement, ces analyses ont permis de mieux connaitre les besoins des patients afin de suggérer des mesures pour améliorer leur prise en charge. / The chronic nature of cancer disease and the heaviness of its treatment and follow-up have a negative impact on daily life of patients and their families. Cancer disease changes life projects even in their most intimate aspects. Sexual dysfunction is one of the most common and annoying consequences of cancer treatments. These potential sexual problems are known but insufficiently documented and inadequately explained to patients. France has no standard practice guidelines regarding this specific issue at a national level. Thus, in the context of the national effort to improve patients’ care, the aim of this work was to assess the frequency of related problems, the discussion with healthcare providers about it and the satisfaction toward this discussion, but also to identify the factors that influenced those three indicators. For this purpose, our analyses were done using the representative national VICAN survey (n=4349) and ELIPPSE40 regional cohort (n=623). These analyses highlighted a high prevalence of substantial sexual problems for all cancer sites. Healthcare inequalities were observed in relation to the age, gender, cancer site and the type of care centre. They also emphasized a low patients’ satisfaction with sexuality-related information. Overall, they allowed to better understand the patients’ need and to suggest interventions to improve care of patients regarding sexual health after cancer.
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Les infections respiratoires aigües chez les pélerins du Hajj / Acute respiratory infections among Hajj pilgrims

Benkouiten, Samir 12 November 2014 (has links)
Chaque année, deux à trois millions de musulmans de plus de 180 pays à travers le monde affluent vers l'Arabie Saoudite pour l'accomplissement du grand pèlerinage à la Mecque, appelé communément le "Hajj". Les virus, et particulièrement celui de la grippe, sont les causes les plus fréquentes d'infections respiratoires aiguës chez les pèlerins.Nous avons décidé de réaliser une étude bibliographique afin de rechercher des preuves de l'efficacité des mesures non pharmaceutiques de prévention des infections respiratoires pendant le Hajj. En résumé, bien que le lavage des mains soit fréquent parmi les pèlerins, le port du masque reste un défi majeur et la distanciation sociale, visant à réduire les contacts avec les personnes infectées, difficilement réalisable pendant le séjour en Arabie Saoudite. Les données sur l'efficacité de ces mesures non pharmaceutiques dans le contexte du Hajj sont limitées et les résultats sont contradictoires, soulignant la nécessité d'études supplémentaires.En 2012 et 2013, nous avons conduit une étude prospective afin d'évaluer sur la même cohorte de pèlerins la prévalence de virus et de bactéries pouvant être responsables d'infections respiratoires aiguës, avant le départ de France pour le Hajj et au retour d'Arabie Saoudite. Nous avons ainsi démontré l'acquisition par les pèlerins de virus respiratoires, principalement rhinovirus, coronavirus (non MERS-CoV) et les virus grippaux, pendant leur séjour en Arabie Saoudite. Aucun n'a été testé positif pour le MERS-CoV. Aussi, une proportion importante de pèlerins a été infectée par Streptococcus pneumoniae, alors que leur couverture vaccinale contre le pneumocoque est faible. / Annually, over two million Muslims from more than 180 countries gather in the Kingdom of Saudi Arabia to perform the pilgrimage to Mecca, also known as the "Hajj". Respiratory viruses, and especially influenza virus, are the most common cause of acute respiratory infection among pilgrims.We conducted a review to summarize the evidence related to the effectiveness of non-pharmaceutical interventions in preventing the spread of respiratory infectious diseases during the Hajj. Overall, although hand hygiene compliance is high among pilgrims, face mask use and social distancing remain difficult challenges. Data about the effectiveness of these measures at the Hajj are limited, and results are contradictory, highlighting the need for future large-scale studies.In 2012 and 2013, we conducted for the first time a prospective longitudinal study of pilgrims, to determine the prevalence of viruses and bacteria potentially responsible for acute respiratory symptoms, before departing from France for the Hajj and before leaving Saudi Arabia. We thus demonstrated the acquisition of respiratory viruses, most notably rhinovirus, coronaviruses (other than MERS-CoV), and influenza viruses, by pilgrims during their stay in Saudi Arabia. None of the pilgrims was positive for MERS-CoV. Also, while vaccination coverage against pneumococcal infection is low among pilgrims, many of them have acquired Streptococcus pneumoniae.
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Épidémiologie du diabète de type 1 : incidence mondiale et ses déterminants / Epidemiology of type 1 diabetes : global incidence and determinants

Diaz Valencia, Paula Andrea 26 May 2015 (has links)
Introduction : L'augmentation de l'incidence mondiale du diabète de type 1 (DT1) a été calculée à 3,0% par année en moyenne et il a été prédit qu'elle serait de 40% en 2010 chez les enfants âgés de 0 à 14 ans. Les causes de cette augmentation ne sont pas encore déterminées; cette thèse met à jour les connaissances actuelles sur l'incidence mondiale du DT1, en profitant de la disponibilité croissante des bases de données publiques et en examinant la corrélation entre l'incidence et les caractéristiques des pays. Méthodes : Une recherche exhaustive et systématique des articles publiés sur l'incidence du DT1 dans le monde a été effectuée pour étudier les variations globales de cette incidence dans les divers pays. L'objectif initial de cette thèse était d'étudier la corrélation entre les variables environnementales disponibles dans les bases de données publiques, et l'incidence du DT1 selon les pays.Conclusions et implications : Au cours de cette thèse, nous avons quantifié la variation pays par pays de l'incidence du DT1 dans le monde chez les enfants et les adultes, montrons qu'une grande partie de cette incidence pourrait s’expliquer par la variabilité de facteurs environnementaux d’un pays à l’autre. Cette thèse a également profité de la disponibilité croissante de données publiques sur la variation des facteurs environnementaux et génétiques de pays à pays, qui peuvent être impliqués dans le fort effet de cohorte de naissance qui a été observé ; il est conseillé d'approfondir la recherche sur la grossesse et la période néonatale et son implication dans DT1. / Background: The increase of worldwide incidence of type 1 diabetes (T1D) was calculated to be on average 3.0% per year and it was predicted that it would be 40% higher in 2010 in children aged 0-14 years. The causes of this increase are still under study; this thesis updates our current knowledge on the global incidence of T1D, and taking advantage of the increasing availability of public databases examines the correlation between incidence and country characteristics. Methods: A comprehensive systematic literature search of published articles on the incidence of T1D worldwide was conducted to study global variations of the incidence within countries. The initial goal of this thesis was to study the correlation between environmental variables available in public databases with the country incidence of T1D. Conclusions and implications: During this thesis, we quantified the country-to-country variation in T1D incidence worldwide in children and adults, and show that a large part of this incidence could be accounted for by the variability of environmental factors within the countries taking advantage of the increasing availability of public databases. Environmental factors may be involved in the strong cohort effect we found; it is advisable to deepen the research on pregnancy and neonatal period and its implications on T1D. Here we could quantify that the increase of T1D was even larger than had been predicted in an earlier study.

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