L’objectif de cette thèse était de caractériser les éléments appartenant à la voie de signalisation énergétique AMP-activated protein kinase chez l’huître creuse Crassostrea gigas afin de comprendre son implication dans la gestion de l’énergie, en particulier en réponse à des conditions physiologiques qui sollicitent de l’énergie telles que la reproduction, ou à des stress environnementaux comme l’hypoxie ou le jeûne. Au niveau génomique, les trois sous-unités constitutives du trimère AMPK ainsi que plusieurs éléments impliqués dans cette voie de signalisation et dans les métabolismes glucidiques et lipidiques, potentiellement cibles de l’AMPK, ont été décrits. Au niveau protéique, plusieurs anticorps hétérologues ciblant les isoformes de la sous-unité α et la phosphorylation du résidu thréonine 172 de la sous-unité α, témoin indirect de l’activité AMPK, ont été utilisés. Deux sous-unités α tronquées dans le domaine kinase ont été caractérisées principalement dans les tissus musculaires suggérant leurs implications dans la fonction musculaire. Au cours d’un stress hypoxique, une augmentation significative des quantités de sous-unités α tronquées a été observée dans le muscle lisse. Ce résultat suggère que pendant une durée d’au moins 6 h, ces protéines tronquées sont nécessaires au maintien du métabolisme aérobie dans le muscle lisse, lui permettant ainsi de remplir son rôle de fermeture statique des valves. Nous avons suggéré une hypothèse indiquant que l’accumulation in vivo de ces sous-unitésα tronquées pourrait exercer un rôle de modulation ou de transdomination négative de l’activité de la sous-unité α entière. Dans la gonade, nous avons observé une activation de l’AMPK tout au long du processus de gamétogénèse afin de supporter les processus cataboliques de création de gamètes. Une diminution de cette activation a été observée lors du stade anabolique de mise en réserve des ovocytes. Enfin, lors d’un conditionnement en milieu contrôlé, une approche physiologique par privation de nourriture et une approche pharmacologique par injection d’AICAR ont été réalisées pour provoquer une modulation de l’AMPK. Les analyses ont montré que ni le jeûne ni l’AICAR n’ont induit une augmentation de la phosphorylation de la sous-unité α. Cependant, plusieurs changements liés à l’injection de l’AICAR ont été observés sur la physiologie de l’huître : la modification du rapport AMP:ATP chez les huîtres nourries en comparaison aux huîtres à jeun, et une mortalité dépendante de la dose injectée d’AICAR chez les huîtres mises à jeun. La caractérisation de l’AMPK chez C. gigas ouvre de nombreuses perspectives exigeant des études fonctionnelles poussées afin de démontrer le rôle pivot de cette kinase dans la gestion de l’énergie, comme démontré chez de nombreuses espèces de vertébrés, et ainsi décrypter le métabolisme énergétique de l’huître. / The objective of this thesis was to characterize elements implicated in the energypathway of the AMP-activated protein kinase of the Pacific oyster Crassostrea gigas. Thecharacterization of the elements was performed in the scope of understanding their involvementin energy management, particularly in response to physiological conditions requiring energy, asreproduction or environmental stress, such as hypoxia or fasting.At genomic level, the three subunits of AMPK trimer and several elements involved inAMPK signaling pathway and in carbohydrate and lipid metabolism, supposedly under AMPKcontrol, were described. Additionally, at proteomic level, several heterologous antibodiestargeting AMPKα subunit isoforms and threonine 172 phosphorylation site of AMPKα subunit,indirect witness of AMPK activity, were assayed. Two truncated α subunits in the kinase domainwere characterized essentially in muscles, suggesting their involvement in muscle function.During a hypoxic stress, a significant increase of truncated α subunits protein amount wasobserved in smooth muscle. These results suggest that, for a period of at least 6 h, thesetruncated subunits are necessary for the maintenance of aerobic metabolism in smooth muscle ofC. gigas, allowing it to fulfill its static closing valves. We suggested that in vivo accumulation oftruncated AMPKα could serve as modulator or as transdominant negative regulator of the fulllengthAMPKα activity. In the gonad, AMPK appeared to be activated through the process ofgametogenesis, in order to support the catabolic processes of gametes creation. During theanabolic phase, when oocyte reserves were created, a signal disruption was observed. Finally,during controlled experiment, a physiological approach by food deprivation and apharmacological approach using AICAR injections were performed to modulate AMPK signal.This analysis showed that neither fasting nor AICAR induced an increase of AMPKphosphorylation, as expected. Although, several changes related to AICAR injection wereobserved in oysters physiology, such as the change of the AMP:ATP ratio in fed oysters and aAICAR dose-related mortality in fasting oysters. AMPK characterization in C. gigas opens newperspectives demanding extensive functional studies to establish the key role of AMPK in energymanagement, as demonstrated in vertebrates’ species, in order to understand the oyster’s energymetabolism.

published_or_final_version / Zoology / Master / Master of Philosophy

Les effets de la micro-algue toxique, Alexandrium minutum, sur l'huître creuse, Crassostrea gigas, ont été analysés par une approche intégrative. Cette démarche a conduit à s'intéresser à différents aspects de la physiologie de l'huître, tels que le comportement, l'activité digestive, des activités cellulaires et la reproduction. Dans un premier temps, le statut physiologique de A. minutum a été abordé en utilisant la cytométrie en flux, la microscopie ainsi que des marqueurs fluorescents. Cela nous a permis de démontrer que certaines conditions expérimentales étaient susceptibles de perturber la physiologie de ce dinoflagellé. Les systèmes expérimentaux permettant d'exposer les huîtres ont donc été conçus afin de limiter les conditions stressantes pour la micro-algue toxique. Dans un second temps, les huîtres ont été exposées à A. minutum, en milieu contrôlé, au cours de plusieurs expérimentations, et comparées à des huîtres témoins nourries avec Isochrysis galbana ou Heterocapsa triquetra. L'exposition de C. gigas à A. minutum provoque chez les huîtres une réponse comportementale, se traduisant notamment par une augmentation du temps d'ouverture et de la fréquence des micro-fermetures des valves. Une corrélation positive entre le temps d'ouverture des valves et la quantité de toxines accumulée par les huîtres a été observée. De même, des pathologies du muscle adducteur des huîtres ont été constatées, ce qui pourrait expliquer les changements de comportement des huîtres. Le dinoflagellé toxique induit une activation des mécanismes de défense des huîtres. Ainsi, une augmentation de la production de mucus a été observée au niveau des branchies, de même qu'une importante réaction inflammatoire dans la glande digestive. Les paramètres hémocytaires ont également présenté des variations. Des différences, en terme d'activité de la phénoloxydase et de la production d'espèces réactives de l'oxygène dans les hémocytes, ont été observées entre les huîtres exposées à A. minutum et les témoins. Les variations des paramètres hémocytaires semblent liées au stade de maturité des huîtres et à la quantité de toxines accumulées, mais aussi à leur statut métabolique lors de l'exposition. Les contenus de la glande digestive en lipides sont également modifiés suite à l'exposition à A. minutum. Une réduction significative des contenus en monoglycérides (MG) et diglycérides (DG) ainsi qu'une importante diminution du contenu en phosphatidylcholine (PC) ont été observés. La diminution de la PC étant parallèle à celle des MG et DG, cela suggère une diminution de la synthèse des lipides liée à une altération des tissus de la glande digestive. Finalement, les spermatozoïdes produits par les huîtres exposées à A. minutum présentaient une réduction de leur activité (diminution de la mobilité et du contenu en ATP) en comparaison aux huîtres témoins. Cette altération de la physiologie des gamètes pourrait avoir des répercussions sur la reproduction des huîtres. Etant donné la subtilité de certains changements et l'interconnexion des paramètres mesurés, la mise en place d'une approche intégrative nous a permis d'obtenir une vision holistique de l'interaction A. minutum / C. gigas. La présente étude a mis en évidence des interactions peu ou mal connues entre des caractères comportementaux, morphologiques et physiologiques des huîtres. Cela nous a conduit à mieux comprendre les interactions entre les micro-algues toxiques et les bivalves, ainsi que les impacts écologiques potentiels.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T03:07:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 297103.pdf: 207947 bytes, checksum: eaca0841bbea8b409ef58133cad20397 (MD5) / Três métodos de indução à triploidia (3N) foram testados em ostras diplóides (Crassostrea gigas), sendo dois químicos, Citocalasina-B (CB) e 6-dimetilaminopurina (6-DMAP) e um físico de temperatura. O objetivo foi avaliar uma tecnologia de indução à triploidia apropriada às características peculiares do Laboratório de Moluscos Marinhos da UFSC. Três experimentos foram realizados separadamente, a 25º C, e em todos foram obtidas larvas triplóides viáveis. No experimento-I avaliou a eficiência de indução à triploidia com a CB [0,5 mg L-1] e 6-DMAP [390 µmols L-1], sendo o tratamento com CB (57% 3N) estatisticamente mais eficiente que a 6-DMAP (22,32% 3N). No experimento-II, testou a eficiência de indução à triploidia com a CB [0,5 mg L-1] e 6-DMAP [450 µmols L-1], não havendo diferença entre os tratamentos (CB - 55% 3N e 6-DMAP - 56% 3N). No experimento-III a eficiência de indução à triploidia com CB [0,5 mg L-1] e com choque de temperatura (25º-36º C), sendo que os tratamentos não tiveram diferença significativa (CB - 57,31% 3N e Temperatura - 45,29% 3N). Em ambos os experimentos foi observada uma alta mortalidade nos tratamentos com os químicos, em especial a CB. A partir desses resultados, a substituição da CB por outros métodos de indução demonstrados é necessária, tendo em vista seu alto custo de aquisição, e ainda a alta toxicidade da substância, tanto ao meio ambiente quanto ao operador.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos. / Made available in DSpace on 2012-10-23T03:09:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 245557.pdf: 1330055 bytes, checksum: 6489188032287553c96eedd3c82f79e7 (MD5) / A segurança do consumidor de moluscos bivalves, como as ostras, depende da sanidade destes a qual, por sua vez, depende das condições físicas, químicas e microbiológicas do ambiente de origem, do manuseio e tecnologia pós-captura, bem como da existência de legislação adequada, que se baseie na fiscalização de todas as etapas de produção. Esta pesquisa teve por objetivo monitorar a qualidade bacteriológica das águas onde os moluscos são cultivados e de ostras (Crassostrea gigas) em seis diferentes regiões de cultivo na Baía Sul da Ilha de Santa Catarina, por um período 12 meses, totalizando 15 coletas. Nas águas foram realizados ensaios microbiológicos para contagens de coliformes a 35°C, coliformes a 45°C, e de Escherichia coli. Na carne das ostras, além dos ensaios realizados nas águas, foram realizadas contagens de Vibrio spp., Estafilococos coagulase positivo, além de detecção de Salmonella spp. Embora as contagens tenham ficado abaixo dos limites máximos estabelecidos pela legislação brasileira, foram encontradas correlações positivas entre contagens de coliformes a 35°C, 45°C e E. coli nas águas onde são cultivadas, e na carne das ostras. Foram observadas diferenças estatísticas significativas entre as contagens de coliformes a 45°C nas amostras de águas onde são cultivadas as ostras provenientes da região mais contaminada (Barro Vermelho) e das regiões menos contaminadas (Caieira da Barra do Sul e Costeira do Ribeirão). Os parâmetros físico-químicos apresentaram pouca ou nenhuma correlação estatística com as contagens bacteriológicas realizadas nas águas onde os moluscos são cultivados, no entanto foi encontrada uma correlação positiva significativa entre a temperatura destas águas e a incidência de Vibrio spp. na carne dos moluscos. Considerando a Baía Sul como um todo, foi possível observar a influência do índice pluviométrico nas contagens bacteriológicas obtidas nas águas e consequentemente nas ostras, sendo que as maiores contagens de coliformes a 35°C, 45°C e Escherichia coli nas águas, e de Escherichia coli nas ostras, foram observadas no mês de novembro 2006, mesmo mês em que foram registrados os maiores acumulado pluviométricos, tanto mensal quanto na semana anterior a coleta. Os resultados encontrados, tanto para águas onde os moluscos são cultivados quanto para as amostras de ostras estão de acordo com os parâmetros descritos na legislação brasileira, estando todas as regiões aptas para o cultivo de moluscos bivalves. Contudo, ressalta-se a importância da implantação de saneamento básico em regiões de cultivo de moluscos bivalves, assim como o monitoramento bacteriológico constante de indicadores de qualidade, tanto nas águas onde os moluscos são cultivados, como nos moluscos, além do desenvolvimento de programas de qualidade para a cadeia produtiva de moluscos bivalves.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-26T09:59:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 303437.pdf: 395745 bytes, checksum: 1ba3fefe906aa4dfb31bc194833092ac (MD5) / Para obter dados que permitissem o dimensionamento e planejamento de um laboratório, compatível com o mercado atual, foi analisado o histórico (2004-2010) do mercado de sementes diplóides de ostras do Pacífico do Laboratório de Moluscos Marinhos (LMM), da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), e o processo de produção utilizado no mesmo. A partir desta avaliação preliminar foram projetados três laboratórios, com capacidades de produção de 50, 100 e 150 milhões de sementes por safra, e realizadas análises de viabilidade econômico-financeiras com base nas técnicas de valor presente líquido (VPL) e taxa interna de retorno (TIR), tendo como condicionantes preços pré-fixados, do milheiro de sementes, de R$ 12,00, R$ 18,00 e R$ 24,00. Para cada laboratório, foram calculados os custos de capital e operacional para determinar quais os pesos relativos que incidem sobre cada um, bem como, os preços mínimos da semente de ostra que determinam a recuperação de todo o investimento (custo de capital e custo operacional), como forma de verificar o impacto da economia de escala sobre a atividade. Foi possível concluir a partir destas análises, que o mercado atual de sementes diplóides de ostras do Pacífico (de cerca de 45 milhões de sementes por safra) é pequeno e que a entrada da iniciativa privada nele representará uma alta no preço da semente. Um laboratório com capacidade para produzir esta quantidade de sementes teria que praticar um preço mínimo de R$ 17,00 para recuperar o investimento realizado. Com a demanda subindo para 90 milhões ou 135 milhões de sementes, este preço seria reduzido para R$ 10,80, ou R$ 7,80, respectivamente, devido à economia de escala. Ao se excluir o valor do terreno do custo de capital, esses preços mínimos diminuem, passando a ser de R$ 14,10, R$ 8,60 e R$ 6,30, respectivamente, demonstrando a influência da redução do volume de investimento inicial sobre a viabilidade do empreendimento. Um laboratório com capacidade de produção de 100 milhões de sementes, próxima a do LMM (mas operando para o mercado atual de apenas 45 milhões) teria que praticar um preço superior a R$ 18,00. Com este preço, obteve-se um VPL de -R$ 745.031,00 e uma TIR de apenas 1,85% ao ano, o que levaria a rejeição do empreendimento. Além disso, essa alternativa geraria um desperdício em custos variáveis da ordem de R$ 371.159,31. Com o preço de R$ 24,00, este laboratório demonstra viabilidade, apresentando um VPL de R$ 673.013,00 e uma TIR de 18,08%. Com relação ao investimento necessário, os custos mais relevantes dizem respeito à compra da área e de equipamentos, representando quase 70% do total. Entre os custos operacionais, a mão de obra direta e a energia consumida foram os itens mais representativos. A mão de obra, por ter sido classificada como um custo fixo teve a sua participação relativa reduzida à medida que aumentava o tamanho do laboratório e o preço da semente, tendo apresentado valores entre 42,28% e 20,62%. Para um mesmo preço de semente, esse item teve uma amplitude média de variação, entre um laboratório pequeno e um grande, de 16%. A energia apresentou um comportamento mais sensível à economia de escala, porém com uma baixa amplitude de variação, com uma média de 2%, entre o menor e o maior laboratório, operando ao mesmo preço de semente. Dependendo do tamanho do laboratório analisado e do preço fixado para o milheiro da semente, a energia teve uma participação máxima de 30,14%, para um laboratório com capacidade para 150 milhões de semente e preço a R$ 12,00 e 22,51%, também, para um laboratório deste porte, porém com a semente a R$ 24,00. Em termos monetários, entretanto, a diferença de consumo de energia entre o maior e o menor laboratório foi bem representativo e da ordem de R$ 933.465,00. Por meio deste estudo foi possível observar que duas alternativas a economia de escala surgem para redução do custo de produção de sementes de ostras e, consequentemente, de seu preço: mudanças tecnológicas que imprimam novos e significativos patamares de eficiência ao processo produtivo e/ou a diversificação de produtos, através da produção de espécies nativas potenciais, como o mexilhão (Perna perna) e a vieira (Nodipecten nodosus).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:03:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 320337.pdf: 2088380 bytes, checksum: b82e99715a833e8a5eb4c51e691ed579 (MD5) Previous issue date: 2013 / Diversas áreas costeiras no Estado de Santa Catarina estão associadas a zonas de cultivo de ostras, pesca e lazer, sendo que algumas destas estão contaminadas por esgoto sanitário. Tecnologias vêm sendo desenvolvidas na tentativa de monitorar a contaminação nestes ambientes, dentre as quais, podemos destacar os biomarcadores e a ostra Crassotrea gigas como organismo sentinela. Neste estudo encontramos diferença significativa na trasncrição de genes de citocromo P450 (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 e CYP26F1) em amostras de glândula digestiva de ostras expostas por diferentes períodos a um local contaminado por esgoto sanitário. Também avaliamos os níveis de transcrição dos genes CYP356A2, CYP2AU2 e CYP30C1, em diferentes tecidos de ostras C.gigas, após um dia de exposição, sendo que os três genes responderam a presença de contaminantes. Essas informações permitem um avanço na caracterização da indução destes genes por contaminantes, bem como, através da execução deste projeto aprofundamos nossos conhecimentos relacionados aos níveis de transcrição de isoformas de genes de CYPs, uma vez que os genes CYP307A1, CYP3071A1 e CYP26F1 foram analisados pela primeira vez em diferentes tecidos de ostras C. gigas presentes em local contaminado por esgoto sanitário <br> / Abstract: Several coastal areas in the State of Santa Catarina are associated with oyster farming, fishing and leisure and some of these are contaminated by sanitary sewage. Technologies have been developed in an attempt to monitor contamination in these environments, among which we can highlight the biomarkers and the oyster Crassostrea gigas as sentinel organism. In this study we found significant differences in the transcription of cytochrome P450 genes (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 and CYP26F1) in samples of digestive gland of oysters exposed for different periods of exposure to a sanitary sewage contaminated site. We also assessed the levels of transcription of genes CYP356A2, CYP2AU2 and CYP30C1 in different tissues of oyster exposed for one day at the contaminated site, and the three genes were responsive to the contaminants. This information allows an advance in characterization of these genes by inducing contaminants, and by performing this design deepened our knowledge related to levels of transcript isoform of CYP genes, once the genes CYP307A1, CYP3071A1 and CYP26F1 were analyzed for the first time in different tissues of oyster C. gigas present in sewagecontaminated site.

Endocrine disrupting chemicals (EDCs) are compounds that can interfere with hormone signaling pathways and are now recognized as pervasive in estuarine and marine waters. One prevalent EDC in California’s coastal waters is the xenoestrogen 4-nonylphenol (4-NP), which has been shown to impair reproduction, development, growth, and in some cases immune function of marine invertebrates. To further investigate effects of 4-NP on marine invertebrate immune function we measured total hemocyte counts (THC), relative transcript abundance of immune-relevant genes, and lysozyme activity in Pacific oysters (Crassostrea gigas) following bacterial infection. To quantify these effects we exposed oysters to dissolved phase 4-NP at high (100 μg l-1), low (2 μg l-1), or control (100 μl ethanol) concentrations for 7 days, and then experimentally infected (via injection into the adductor muscle) the oysters with the marine bacterium Vibrio campbellii. 4-NP significantly altered the effects of bacterial infection had on THC. Oysters exposed to both high and low 4-NP did not experience a bacteria-induced increase in THC, as seen in control oysters. We also determined that V. campbellii infection induced differential expression of a subset of immune-related genes tested (Cg-bigdef2, Cg-bpi1, Cg-lys1, Cg-timp) in some, but not all, tissues; 4-NP exposure altered expression patterns in two of these genes (Cg-bpi1 and Cg-tgase). Exposure to 4-NP alone also caused differential expression in some genes (Cg-bpi1, Cg-galectin1, Cg-clec2). Lastly, low levels of 4-NP significantly increased lysozyme activity 24 h post-infection. These results suggest that exposure to 4-NP can alter both cellular and humoral immune responses to bacterial infection in C. gigas.

Les rythmes biologiques constituent une propriété fondamentale de la vie, permettant aux organismes d’appréhender leur environnement et d’en anticiper les changements. Ces rythmes possèdent une double origine : une horloge moléculaire génère ces rythmes, qui sont ensuite synchronisés par des facteurs environnementaux. Si les organismes terrestres sont essentiellement soumis au rythme d’alternance jour/nuit, les espèces marines côtières et estuariennes occupent un biotope plus changeant encore : ils sont en effet également confrontés au rythme des marées. Pourtant, leurs rythmes biologiques sont à ce jour encore mal connus et les mécanismes moléculaires de(s) (l’) horloge(s) sous-jacente(s) ne sont pas caractérisés. Parallèlement, les efflorescences d’algues toxiques, en constante augmentation depuis 1970, constituent un problème écologique majeur, tant local qu’international. Les objectifs du présent travail consistaient à caractériser les rythmes de référence de l’huître Crassostrea gigas et d’en déterminer l’origine (moléculaire, zeitgebers). Il s’agissait ensuite d’étudier les perturbations potentielles de ces rythmes par l’algue toxique Alexandrium minutum, qui produit des toxines paralytiques et est régulièrement présente dans de nombreuses mers du globe. Les travaux réalisés ont permis de mettre en évidence l’existence d’un rythme d’activité valvaire circadien, faible et dual, et n’a pas permis de supporter l’hypothèse de l’existence d’une horloge circatidale. Nous avons formulé l’hypothèse que, chez C. gigas, le rythme tidal est soit d’origine exogène, soit produit par l’horloge circadienne synchronisée par les marées. Les analyses moléculaires réalisées sur le gène circadien cryptochrome dans le muscle adducteur - effecteur du mouvement des valves - ont montré que ce gène oscille à une fréquence tidale dans le muscle strié, favorisant notre seconde hypothèse. Par ailleurs, au-delà des gènes de l’horloge, l’algue A. minutum réprime l’expression de gènes impliqués dans différentes voies métaboliques importantes : la lutte contre le stress oxydant (cat, gpx), la respiration mitochondriale (cox1), l’immunité (ilk), la détoxification (mdr). Finalement nos analyses ont permis de mettre en évidence un impact génotoxique d’A. minutum chez C. gigas. / Biological rhythms constitute a fundamental property of life, allowing organisms to anticipate and adapt to their changing environment. These rhythms present a double origin: they are generated by a molecular clock and synchronized by environmental cues. Whereas terrestrial organisms are mainly subjected to day/night alternation, coastal and estuarine marine species inhabit an even more cycling biotope. They are indeed also submitted to tides. Nevertheless, biological rhythms in marine species are still unrecognized and molecular mechanisms of the underlying oscillator(s) are to date not determined. At the same time, toxic algae blooms are increasing since the 1970s and represent a major ecological concern, both at local and international levels. An objective of the present work was the characterization of biological rhythms in the oyster Crassotrea gigas and of their origin (molecular mechanism, zeitgebers). Furthermore, the work was designed to study the potential disruption of these rhythms by the toxic algal of worldwide distribution Alexandrium minutum, which produces paralytic toxins. The present results show the existence of a weak and dual circadian rhythm of valve activity in the oyster, and do not provide evidence for the existence of any circatidal clock. We suggested that, in the oyster C. gigas, the tidal rhythm could either be generated exogenously or endogenously by the tidally-synchronized circadian clock. Molecular analyses performed on the circadian gene cryptochrome in the adductor muscle of oyster, the effector of valve movements, revealed that Cgcry oscillates at tidal frequency in the striated muscle. This result supports our second hypothesis. Furthermore, A. minutum represses the expression of genes involved in key metabolic pathways: struggle against oxidative stress (cat, gpx), mitochondrial respiration (cox1), immunity (ilk), detoxification (mdr). Moreover, A. minutum impacts C. gigas at DNA level, being thus genotoxic.

Le bassin d’Arcachon est une lagune semi-fermée qui concentre de forts enjeux économiques grâce à la pratique de l’ostréiculture. Cette activité est affectée depuis une trentaine d’années par des phénomènes de mortalités estivales, et plus récemment par des surmortalités du naissain. Ces travaux se sont intéressés au rôle des polluants majeurs du bassin d’Arcachon dans ce contexte de crise en étudiant leurs effets sur la biologie de Crassostrea gigas. Une approche in situ a d’abord été adoptée afin d’identifier les contaminants les plus présents dans le milieu naturel. Des opérations de transplantation d’huîtres et des prélèvements de sédiments ont permis de quantifier divers contaminants et d’associer leur présence à des réponses biologiques. Les polluants ainsi identifiés ont ensuite été employés en conditions contrôlées au laboratoire. Trois expérimentations ont été réalisées : la première concerne l’étude des voies de contamination par le tributylétain ; la seconde concerne les effets des pesticides et du cuivre ; la troisième concerne l’effet des HAP sur des huîtres diploïdes et triploïdes. Nos résultats indiquent que les organismes transplantés au coeur de la lagune sont plus exposés aux polluants, en lien avec les caractéristiques hydrodynamiques du système. La plupart des paramètres biologiques étudiés sur le terrain ont par ailleurs montré une saisonnalité liée aux processus de gamétogenèse. Au laboratoire, la plupart des contaminants testés ont induit une réponse adaptative chez les huîtres exposées. Notre étude souligne l’importance de coupler approche de terrain et approche expérimentale pour comprendre le fonctionnement des écosystèmes côtiers. / The Arcachon Bay is a semi-enclosed lagoon and represents the core of strong economic stakes through the practice of oyster-farming. This activity has been affected for around thirty years by summer mortality events, and more recently by abnormally high death rates of juveniles. This work focused on the role of the Arcachon Bay’s main contaminants in this crisis, by studying their effects on the cupped oyster’s biology. Firstly, an in situ approach was adopted in order to identify the major pollutants of the bay: caged oysters were transplanted and sediments were sampled. The presence of contaminants in the samples was associated to biological responses. Secondly, the contaminants identified in situ were used in controlled conditions at the laboratory. Three experimentations were performed; the first dealt with the contamination pathways of tributyltin; the second focused on the biological effects of pesticides and copper; the third concerned the effects of PAH towards diploid and triploid oysters. Our results indicate that the inner stations present higher accumulation of metals and PAH, in accordance with the hydrodynamic features of the bay. The bioindicators used in situ exhibited seasonal trends related to the oysters’ gametogenesis. In the laboratory, most of the contaminants used at environmental levels induced an adaptive response of the exposed oysters. Our study highlights the importance of coupling in situ and laboratory approaches in order to understand the functioning of coastal ecosystems.