Apesar dos esforços na realização de pesquisas com primatas na Mata Atlântica, ainda existem poucos estudos relacionando topografia, composição e distribuição de vegetação com o padrão de ocupação da área por primatas. Pela escassez dessas pesquisas, essas relações foram analisadas em duas áreas dentro da área de vida de um grupo de Sapajus nigritus numa área de Floresta Ombrófila Densa, localizada no Parque Estadual Carlos Botelho (PECB), Estado de São Paulo. Com o objetivo de descobrir se há ou não relação entre distribuição da vegetação arbórea com o padrão de uso da área (relacionadas com as rotas realizadas em 2007) pelo grupo deSapajus nigritus. Com o auxílio de uma imagem do IBGE de 1:50.000 da área do PECB, cedido pelo Instituto Florestal, em São Paulo, foi feito um recorte da área de vida do grupo no software ArcView 9.3 para seleção duas áreas; a primeira conhecida como área central (ou área núcleo) onde o grupo utiliza com mais frequência, foi denominada de área A, e a segunda área, uma pequena porção mais periférica da área de vida com inclinação mais acentuada, denominada de área B. Em cada uma dessas áreas foram instaladas três unidades amostrais; uma em área de topo de morro, uma em área de encosta e uma em área de fundo de vale, totalizando seis unidades amostras (G1, G2, G3, G4, G5 e G6). Cada unidade amostral, contendo quatro parcelas de 20 x 20 m (400 m2), espaçadas de 40 m e 60 m e subdivididas em subparcelas de 5 x 5 m (25 m2), totalizando 24 parcelas e 384 subparcelas, perfazendo uma área de 9.600 m2. O critério de inclusão foi DAP (diâmetro à altura do peito) 10 cm. Os resultados florísticos amostraram 672 indivíduos pertencentes a 146 espécies e 84 famílias (levando em conta os indivíduos não identificados e os mortos). As famílias que apresentaram maior riqueza de espécies foram respectivamente, Myrtaceae, Lauraceae e Fabaceae para todas as unidades amostrais. Das 146 espécies amostradas, 70 são espécies utilizadas pelo grupo de Sapajus nigritus como alimento, dentre elas, 43 (a maioria) estão amostradas em ambas as áreas e estão distribuídas na menor classe diamétrica.Quanto a fitossociologia, as espécies com maior valor no índice de importância (IVI) foram: Ocotea catharinensis (Canela-preta) para as grades amostrais em áreas de topo de morro e encosta, e Alchornea triplinervia (Tapiá) para as grades amostrais em áreas de fundo de vale. Os resultados indicaram que a composição fitossociológica da vegetação das parcelas amostradas em diferentes situações de topografia, não apresentou relação com o padrão de ocupação da área pelo grupo de macacos-prego, pois as espécies arbóreas estão amostradas em ambas as áreas de maneira homogênea. O fato de o grupo utilizar com mais frequência a área central da área de vida não está relacionado com a distribuição da vegetação e nem com as feições topográficas, mas sim pode estar relacionada a outros fatores, como a disponibilidade de frutos, variação sazonal, proteção contra predadores e outros fatores comportamentais. / Despite efforts in conducting research with primates in the Atlantic, there are still few studies topography, composition and distribution of vegetation with the pattern of occupation of the area by primates. Scarcity of such research, these relationships were analyzed in two areas within the home range of a group of Sapajus nigritus an area of dense rain forest, located in the Parque Estadual Carlos Botelho (PECB), State of Sao Paulo. Aiming to discover whether there is relationship between the distribution of trees with the usage pattern of the area (related to the routes taken in 2007) by the group Sapajus nigritus. With the aid of an image of the IBGE of 1:50.000 area PECB, assigned by the Forestry Institute, in São Paulo, a cut was made in the area of group life in ArcView 9.3 for selecting two areas, the first area known as central area (or core area) - where the group frequently used, was called area A, and the second area, a small portion of the peripheral area of life - with steepest slope, called Area B. In each of these areas were installed three sample units, one on top of the hill area, one in the hilly area and a background area in the valley, totaling six units strains (G1, G2, G3, G4, G5 and G6) . Each sample unit, containing four plots of 20 x 20 m (400 m2), spaced 40 m 60 m divided into subplots of 5 x 5 m (25 m2), totaling 24 plots and 384 plots, totaling an area of 9,600 m2. The inclusion criterion was DBH (diameter at breast height) 10 cm. The results floristic sampled 672 individuals belonging to 146 species and 84 families (taking into account the unidentified individuals and the dead). The families with the highest species richness were respectively Myrtaceae, Lauraceae and Fabaceae for all sample units. Of the 146 sampled species, 70 species are used by the group Sapajus nigritus as food, among them, 43 (the majority) are sampled in both areas and are distributed in the smallest diameter class. As for phytosociology, the species with the highest importance index (IVI) were: Ocotea catharinensis (Shin-black) for the sampling grids in areas of hill top and slope, and Alchornea triplinervia (Tapia) for the sampling grids in areas the valley bottom. The results indicated that the composition of phytosociological vegetation plots sampled in different situations topography was not related to the pattern of occupation of the area by the group of capuchin monkeys, because the tree species are sampled in both areas evenly. The fact that the group used more often to the central area of life is not related to the distribution of vegetation and with no topographic features, but may be related to other factors such as the availability of fruits, seasonal variation, protection against predators and other behavioral factors.

A área de pesquisa científica, denominada computação e biodiversidade, tem por desafio suprir a demanda por tecnologias de apoio à conservação da biodiversidade, fornecendo ferramentas computacionais aplicadas ao estudo da biodiversidade. Os modelos de distribuição geográfica de espécies têm uma importante contribuição para o entendimento da biodiversidade e no apoio para a tomada de decisão em conservação dos recursos de biodiversidade. Os resultados da modelagem de distribuição de espécies, não apresentam com clareza os tratamentos aplicados aos dados na etapa de pré-análise e os critérios de seleção das variáveis preditoras, o que agrava a incerteza quanto aos resultados obtidos e prejudica a reprodutibilidade do experimento. Assim, o objetivo desta pesquisa é apresentar o processo de modelagem de distribuição de espécie com destaque para as atividades de pré-análise e atividades de seleção das variáveis preditoras. O processo de modelagem de distribuição de espécies proposto é avaliado por meio de estudo de caso de Modelagem de Distribuição de Espécies do polinizador Centris hyptidis e das plantas oleaginosas Angelonia campestris e Angelonia cornigera, que considera como fator biótico a especialização da interações entre essas plantas e o polinizador. Neste estudo de caso pode-se verificar que a aplicação de técnicas estatísticas exploratórias de dados na etapa de pré-análise do processo de modelagem distribuição de espécies permite a avaliação da qualidade dos pontos de ocorrência, essenciais para o desempenho preditivo do modelo final. / The area of research called biodiversity informatics, or bioinformatics, has to face the challenge of meeting the demand for technologies to support the conservation of biodiversity, providing computational tools applied to the study of biodiversity. The models of geographic distribution of species have a fundamental implication for understanding the biodiversity and conservation decision making. Researches on modeling species distributions generally do not present clearly the treatments applied to the data in the pre-analysis and criteria for selection of predictor variables, which increases the uncertainty regarding the results and affect the reproducibility of experiment. The objective of this research is to present the process of species distribution modeling with emphasis on the activities of pre-analysis and activities selection of the predictor variables, such as to favor its repeatability and reproducibility by other researchers. The process of modeling species distribution proposed is validated on a case study of modeling distribution of pollinator species Centris hyptidis and oilseed Angelonia campestris and Angelonia cornigera, a biotic factor that considers the specialization of these interactions between plants and pollinators. In this case study we can observe one of the main contributions of this work: the application of statistical techniques for data exploration in the pre-analysis of species distribution modeling process, with improved capacity for evaluation and selection of points of occurrence essential to the performance of the predictive model.

As áreas protegidas, tanto públicas quanto privadas, e suas áreas de entorno têm desempenhado um papel relevante na sobrevivência de diversas espécies de mamíferos de médio e grande porte. Por essa razão, este estudo teve como primeiro objetivo estimar a riqueza de espécies de mamíferos de médio e grande porte no interior de três áreas de estudo com diferentes níveis de proteção, assim como nas suas respectivas áreas de entorno. Em segundo, e como principal objetivo deste trabalho, foi estimar as probabilidades de ocupação () e detecção (p) de uma espécie ameaçada, o tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla), assim como avaliar se a ocorrência e o período de atividade dessa espécie são afetados pela presença humana. Todos os dados foram coletados por armadilhas fotográficas em três áreas de estudo no nordeste do Estado de São Paulo. A riqueza de mamíferos de médio e grande porte na região de estudo não é diferente entre as áreas com diferentes níveis de proteção ou entre interior e entorno. Quanto às análises de ocupação (uso), todas as covariáveis que influenciaram foram associadas com atividades humanas, positivamente para estradas e para áreas protegidas, e negativamente para proporção de área urbana. A relação positiva com estradas não pavimentadas é inesperada e pode sugerir que a espécie prefere mover-se ao longo da paisagem usando estradas para minimizar o tempo de viagem ou maximizar o forrageamento em paisagens alteradas. A presença humana não afetou positivamente ou negativamente o uso do espaço pelo tamanduá-bandeira, já que ambos ocorreram de maneira independente um do outro ( = 1). Este achado sugere que a falta de influência resulta em parte das características da paisagem de estudo (pressão de caça aparentemente baixa e uma razoável proporção de habitats nativos ainda presentes e protegidos), do desenho amostral empregado (concentrado em áreas protegidas e nas suas zonas de amortecimento) e, provavelmente, da baixa sobreposição nos períodos de atividades encontrada entre ambas espécies. Portanto, esses resultados indicam que tanto a sobrevivência da comunidade de mamíferos como, especificamente, do tamanduá-bandeira na região de estudo é fortemente dependente tanto das unidades de conservação (UC) como das áreas de vegetação nativas existentes em propriedades privadas protegidas pelo Código Florestal Brasileiro, além dos habitats perturbados no entorno dos grandes remanescentes. Todos os resultados encontrados são importantes para embasar a criação de novas áreas protegidas, assim como para o estabelecimento e manejo de zonas de amortecimento, pois indicam que estas têm papel chave na redução dos efeitos das atividades humanas sobre as UCs e na manutenção de populações viáveis das espécies presentes na região. / Protected areas, both public and private areas, and their surroundings have played an important role in the survival of several species of medium and large mammals. For this reason, this study aimed firstly to estimate the species richness of medium and large mammals within three study areas with different levels of protection, as well as their respective surrounding areas. Second, as the main goal of this study, it was to estimate occupancy () and detection (p) probability of an endangered species, the giant anteater (Myrmecophaga tridactyla), also assess if the occurrence and activity period of this species are affected by human presence. All data were collected by camera traps in three study areas in the northeast of São Paulo state. The species richness is not different between areas with different levels of protection or between interior and surroundings. Regarding occupancy analysis (use), all covariates that influenced giant anteater use were associated with human activities, positively to unpaved roads and protected areas, and negatively to proportion of urban area. The positive relationship with unpaved roads is unexpected and may suggest that giant anteater prefers to move along landscape using roads, perhaps to minimize travelling time or maximize foraging in altered landscapes. The human presence did not affect positively or negatively the use of space by giant anteater, since both species occurred independently of each other ( = 1). This finding suggests that lack of influence results in part from the landscape features of study area (apparently low hunting pressure and a reasonable proportion of native habitats still present and protected), the sampling design applied (focused on protected areas and their buffer zones) and probably due to low overlap between activity periods of both two species. Overall, results indicate that both mammals community and, specifically, giant anteater survivorship in the study region are strongly dependent upon the existence of nature reserves and areas of native vegetation existing in private properties which area protected by the Brazilian Forest Code, as well as the disturbed surrounding. All findings are important to support the creation of new protected areas, as well as the establishment and management of buffer zones, because they indicate that these zones have a key role in reducing the effects of human activities on protected areas and in the maintenance of viable species populations in the region.

A região da península Antártica possui uma plataforma profunda com características similares ao mar profundo e é uma região muito afetada pela variabilidade climática. Abaixo dos 60 m de profundidade, a meiofauna da baía do Almirantado e do talude adjacente no estreito de Bransfield é desconhecida. Este trabalho visa caracterizar a comunidade da meiofauna, gerando um conhecimento de base sobre sua biodiversidade e estrutura, relacionando com as variáveis ambientais (tipo de sedimento e quantidade/qualidade do alimento). Foi avaliado como a composição e a densidade da meiofauna variaram com a profundidade (100 e 1100 m), verticalmente no sedimento (0-6 cm) e entre dois anos com características climáticas contrastantes (dez/2008 e dez/2009). Também foi analisada a biomassa e diversidade dos Nematoda em nível específico em dez/2008. A densidade da meiofauna e a biomassa de Nematoda foram altas em comparação com outros locais. Houve grande variação na densidade da meiofauna entre os anos. Em dez/2008, ano mais quente, com pouca influência da cobertura de gelo e maior produtividade primária, a densidade variou com a profundidade, sendo alta dentro da baía, com maior concentração de fitodetritos, e baixa no estreito de Bransfield, onde o sedimento foi mais grosso indicando maior hidrodinamismo. Já em dez/2009, ano muito frio, com cobertura de gelo extensa e prolongada, com baixa produtividade primária não houve variação batimétrica da densidade ou das variáveis ambientais. A densidade e diversidade foram mais altas no estrato superficial do sedimento. Foram identificados 83 gêneros de Nematoda, que foram distinguidos em 185 morfoespécies, sendo que a maioria é espécie nova. A diversidade de espécies de Nematoda foi alta, como tem sido reportado para outras regiões antárticas e de mar profundo. A biomassa total de Nematoda foi cinco vezes mais alta que a média mundial, e variou entre as profundidades da mesma forma que a densidade. A biomassa individual, no estrato 0-2 cm, foi baixa na baía e alta no estreito. A morfometria mostrou que os indivíduos são mais longos e finos nas maiores profundidades, tanto batimétrica quanto vertical. A distribuição da meiofauna e da biomassa de Nematoda na área pareceu ser mais afetada por processos físicos (correntes, ressuspensão, topografia íngreme) do que pela quantidade de alimento disponível. / The Antarctic Peninsula has a deep shelf featuring similar conditions to the deep sea and it is highly affected by climatic variations. At Admiralty Bay and the adjacent slope in the Bransfield Strait, the meiofauna below 60 m depth is unknown. The present study aims to characterize the meiofauna community, and so generate a database on biodiversity and structure through the linkage to environmental variables (sediment type and quantity/quality of food). Composition and density of meiofauna have been evaluated across depth gradient (100 and 1100 m), sediment column (0-6 cm) and two years of contrasting climatic conditions (dec/2008 and dec/2009). Nematode biomass and diversity in specific level have been analyzed exclusively in the dec/2008 samples. Meiofauna density and nematode biomass were higher than in other localities. There was great variation of meiofauna density between the years. In dec/2008, density varied along the depth gradient: higher at the Admiralty Bay and lower at the Bransfield Strait, where the sediment was coarser (indicating high hydrodynamics). This year was the warmest, with weak influence of ice cover, high primary productivity and high phytodetritus concentration. Distinctively, in dec/2009, no bathymetric variation in meiofauna density or environmental variables was observed. This year was the coldest, with an extensive and enduring ice cover and low primary productivity. Density and diversity were higher in the superficial layer of the sediment. In total 83 nematode genera were found, comprising 185 morphospecies, mostly of new species. Species diversity of nematodes was elevated as reported in other Antarctic regions and in the deep sea. Nematode total biomass was five times higher than the global mean values, showing variation along the depth gradient. Individual biomass of layer 0-2 cm was low at the bay and high at the strait. Individuals were longer and thinner in deeper depths and sediment layers. Meiofauna and nematode biomass distributions seem to be more influenced by physical processes (currents, sediment ressuspension, steep topography) than by food availability.

Evidências apontam para o envolvimento da peroxidação lipídica em diversas patologias. Os hidroperóxidos de lipídios (LOOH) são os produtos primários da peroxidação lipídica e sua decomposição resulta em produtos de maior reatividade e toxicidade, como os radicais peroxila. Esses radicais desempenham papel importante na propagação da peroxidação lipídica e também podem gerar oxigênio molecular singlete (1O2) por meio da combinação de dois radicais peroxila. Neste trabalho investigamos a possibilidade dos LOOH, em particular dos hidroperóxidos de ácido linoléico (LAOOH), de servirem como fonte 1O2 na presença de oxidantes de relevância biológica como metais, peroxinitrito ou ácido hipocloroso. A formação de 1O2 foi claramente demonstrada na reação de LAOOH com esses oxidantes pelas detecções (i) da emissão bimolecular na região espectral do vermelho (λ>570 nm), (ii) da emissão monomolecular no infravermelho-próximo (λ=1270 nm), (iii) do espectro de emissão no infravermelho, e (iv) da intensificação e supressão da luminescência na presença de D2O e azida, respectivamente. Além disso, os mecanismos de reação foram estudados utilizando LAOOH marcados com oxigênio-18 (LA18O18OH) e captadores químicos específicos para 1O2 aliada à tecnica de detecção por HPLC acoplada à espectrometria de massa. Os resultados mostraram a formação de 1O2 marcado [18(1O2) ] na reação de LA18O18OH com os três oxidantes, revelando que os átomos de oxigênio do 1O2 são derivados do hidroperóxido. Em conjunto, as evidências obtidas levam à conclusão de que os LOOH podem servir como fontes potenciais de 1O2 em sistemas biológicos em situações onde haja a coexistência de LOOH e metais, peroxinitrito ou ácido hipocloroso. / Evidences point to the involvement of lipid peroxidation in several diseases. Lipid hydroperoxides (LOOH) are the primary products of lipid peroxidation and their decomposition generates more reactive and toxic compounds, such as peroxyl radicals. These radicals play an important role in the propagation of lipid peroxidation and may also generate singlet molecular oxygen (1O2) by the combination of two peroxyl radicals. In this study we have investigated the possibility of LOOH, in particular linoleic acid hydroperoxide (LAOOH), to be a source of 1O2 in the presence of biologically relevant oxidants such as, metal ions, peroxynitrite or hypochlorous acid. The formation of 1O2 was clearly demonstrated in the reaction of LAOOH with all the three tested oxidants by detecting: (i) the dimol light emission in the red spectral region (λ>570 nm), (ii) the monomol light emission in the near-infrared region (λ=1270 nm), (iii) the infrared light emission spectrum, and (iv) the enhancing effect of deuterium oxide and the quenching effect of azide on light emission. Furthermore, the mechanism was studied using LAOOH labeled with 18-oxygen isotope (LA18O18OH) and specific 1O2 chemical traps in combination with HPLC coupled to mass spectrometry detection. The results have showed the formation of 18-oxygen labeled 1O2 [18(1O2) ] in the reaction of LA18O18OH with the three oxidants, indicating that oxygen atoms in 1O2 are derived from the hydroperoxide. Altogether, the obtained evidences lead to the conclusion that LOOH may serve as a potential source of 1O2 in biological systems, in situations where LOOH can interact with metals, peroxynitrite or hypochlorous acid.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-15T18:15:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação IVO PPGZool 2016.pdf: 600528 bytes, checksum: 7e608235531106e720b624c63d220483 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-15T18:15:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação IVO PPGZool 2016.pdf: 600528 bytes, checksum: 7e608235531106e720b624c63d220483 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T18:15:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação IVO PPGZool 2016.pdf: 600528 bytes, checksum: 7e608235531106e720b624c63d220483 (MD5) Previous issue date: 2016-04-25 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A monocultura de dendê (Elaeis guineensis Jacq.) é uma atividade que vem se expandindo na Amazônia Oriental. A conversão de um ambiente florestal em áreas de plantação de dendê reduz a complexidade ambiental e altera a paisagem local. Neste trabalho foi utilizado o grupo dos primatas como alvo para investigar os efeitos da diferença na paisagem entre esses dois ambientes. O objetivo foi de avaliar o efeito desta monocultura na abundância, riqueza e distribuição das espécies de primatas na paisagem fragmentada. A área de estudo fica localizada no Complexo Agroindustrial do Grupo Agropalma, nos municípios de Moju, Tailândia, Acará e Tomé-açu, nordeste do Pará. Foram estabelecidos 16 pontos de amostragem, sendo oito em áreas de floresta e oito em plantações de dendê. Em cada ponto foi aberta uma trilha retilínea de 4200 metros. Foram realizadas três campanhas de campo, totalizando 71 dias de amostragem. O método utilizado foi o censo por transecção linear. Todas as trilhas foram estratificadas a cada 600 metros, para verificar a influência das métricas ambientais na distribuição da fauna de primatas ao longo das transecções. As unidades amostrais corresponderam às estratificações de 600m em cada uma das transecções nos dois ambientes avaliados, totalizando 112 amostras (56 em cada ambiente). As métricas ambientais medidas foram a área basal (DAP de 5 a 10 cm e DAP > 10 cm), a distância mínima para corpos d’água, distância mínima para a matriz oposta e a área dos fragmentos florestais e das áreas de plantação do dendê. Foram registrados 578 indivíduos, distribuídos em seis espécies: Sapajus apella, Cebus kaapori, Saimiri collinsi, Saguinus ursulus, Alouatta belzebul e Chiropotes satanas. No ambiente de plantação de dendê, houve apenas um único registro, sendo um grupo da espécie Saguinus ursulus. As espécies S. apella e S. ursulus estão distribuídas na maioria das amostras de floresta, e juntas representaram 78% da abundância total de primatas na área de estudo. Cebus kaapori e S. collinsi foram registradas apenas uma vez. Pelo Teste t, a abundância e a riqueza de primatas foram maiores nos fragmentos florestais (ambos p < 0,001). Na análise de PCA, as métricas ambientais que melhor explicaram a diferença entre os dois ambientes foram as medidas de área basal. A plantação de dendê exerceu um efeito negativo sobre a comunidade de primatas. Mais da metade dos registros nos fragmentos foram observados distantes da borda com a monocultura. A estrutura da vegetação menos complexa (ausência de sub-bosque e dossel mais aberto) e a redução de recursos colaboram com a não tolerância dos primatas à paisagem da matriz de dendê. No entanto, os fragmentos florestais da área estudada estão conseguindo manter todas as espécies de primatas com ocorrência prevista para essa região da Amazônia.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-12T14:55:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-final-final.pdf: 2435687 bytes, checksum: 92035a21cfbbd32da4158d0712cc4cf7 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-12T14:56:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-final-final.pdf: 2435687 bytes, checksum: 92035a21cfbbd32da4158d0712cc4cf7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-12T14:56:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-final-final.pdf: 2435687 bytes, checksum: 92035a21cfbbd32da4158d0712cc4cf7 (MD5) Previous issue date: 2018-04-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os dados citogenéticos fornecem informações importantes sobre a diversidade de Loricariidae, pois eles corroboram as análises de classificação das espécies não descritas e ajudam na compreensão da diversidade inter-intraespecífica. No entanto, entre as espécies do clado Peckoltia, somente a determinação do número de cromossomos não resolve essas questões, porque a maioria das espécies exibe um número diplóide (2n) estável. Assim, o uso de outros marcadores cromossômicos, são necessários para esclarecer a organização genômica dessas espécies e entender sua diversidade. O mapeamento físico de DNAs repetitivos tem sido amplamente utilizado como uma ferramenta importante no estudo de problemas taxonômicos e evolutivos em peixes, bem como para entender os processos de organização genômica e diversificação. O objetivo do presente trabalho foi mapear sítios ribossômicos (rDNA) 5S e 18S em Ancistomus feldbergae e cinco espécies de Peckoltia: P. cavatica; P. multispinis; P. oligospila; P. sabaji e P.vittata, e discutir os mecanismos de organização e diversificação dessas sequências. Os resultados do presente estudo demonstram que todas as seis espécies analisadas possuem cariótipo constituído de 52 cromossomos, mas possuem fórmula cariotípica divergente. Regiões Organizadoras de Nucléolo (NOR) do tipo simples foram observadas em Ancistomus feldbergae, P. cavatica, P. multispinis e P.vittata, enquanto NOR múltiplas foram encontradas em P. oligospila e P. sabaji. Foram observadas variações extensas no número e localização dos sítios de rDNA 5S e 18S entre as espécies. Esses dados indicam que as inversões não são os únicos eventos mais importantes na evolução do cariótipo neste grupo e devem ser úteis na identificação das espécies estudadas aqui. Além das inversões, as transposições são importantes eventos evolutivos envolvidos, pelo menos, em clusters de rDNA que se espalham em Peckoltia e provavelmente em outras espécies de Hypostominae. / Cytogenetic data provide important information on the diversity of Loricariidae, as they corroborate the classification analyzes of the species not described and help in the understanding of inter-intraspecific diversity. However, among the species of the Peckoltia clade, the determination of the number of chromosomes alone does not resolve these questions, since most species exhibit a stable diploid (2n) number. Thus, the use of other chromosomal markers is necessary to clarify the genomic organization of these species and to understand their diversity. The physical mapping of repetitive DNA has been widely used as an important tool in the study of taxonomic and evolutionary problems in fish, as well as to understand the processes of genomic organization and diversification. The objective of the present work was to map ribosomal sites (rDNA) 5S and 18S in Ancistomus feldbergae and five species of Peckoltia: P. cavatica; P. multispinis; P. oligospila; P. sabaji and P.vittata, and discuss the mechanisms of organization and diversification of these sequences. The results of the present study demonstrate that all six species analyzed have a karyotype composed of 52 chromosomes but have divergent karyotype formulas. Nucleolus Organizing Regions (NOR) of the single type were observed in Ancistomus feldbergae, P. cavatica, P. multispinis and P.vittata, while multiple NORs were found in P. oligospila and P. sabaji. Extensive variations in the number and location of 5S and 18S rDNA sites among species were observed. These data indicate that inversions are not the only most important events in karyotype evolution in this group and should be useful in identifying the species studied here. In addition to inversions, transpositions are important evolutionary events involved, at least in rDNA clusters that spread in Peckoltia and probably in other species of Hypostominae.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-08-30T16:44:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LeandroS.Brasil_PPGZOO.pdf: 3528249 bytes, checksum: b66939a384c004d770779a3c23002542 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-08-30T16:44:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LeandroS.Brasil_PPGZOO.pdf: 3528249 bytes, checksum: b66939a384c004d770779a3c23002542 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-30T16:44:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LeandroS.Brasil_PPGZOO.pdf: 3528249 bytes, checksum: b66939a384c004d770779a3c23002542 (MD5) Previous issue date: 2018-08-03 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Conhecer os padrões de distribuição de espécies ao longo da paisagem e entender os mecanismos que os geram são perguntas extremamente relevantes, para que possamos avançar no conhecimento ecológico das comunidades biológicas. Essas questões supracitadas são essenciais para o gerenciamento e tomada de decisão sobre a conservação da biodiversidade, das condições ambientais e dos recursos ecossistêmicos. Nesta tese, utilizamos as comunidades de Zygoptera (Insecta: Odonata) de igarapés da Amazônia brasileira para investigarmos seus padrões de diversidade alfa (Capítulo 1), diversidade beta (Capítulo 2), elementos que estruturavam suas metacomunidades (Capítulos 3) e para uma análise de priorização espacial para conservação da ordem estudada na Amazônia (Capítulo 4). Utilizamos preditoras ambientais, biogeográficas e espaciais para investigar os mecanismos estruturantes para a distribuição das comunidades alvos da tese. Analisando a diversidade alfa (Capítulo 1) as hipóteses de heterogeneidade ambiental (clima) e produtividade primária foram mais importantes para os padrões de riqueza de espécies de Zygoptera. Considerando a diversidade beta (Capítulo 2), o turnover foi o componente mais importante para a mudança na composição de espécies ao longo da paisagem, conjuntamente com a distância espacial entre os sítios e a região biogeográfica (áreas de endemismo) foram as preditoras mais importantes para os padrões de diversidade beta de Zygoptera. Analisando os padrões de metacomunidades (Capítulo 3) verificamos que em comunidades de igarapés ambientalmente preservadas o padrão é Clementsiano, mas em comunidades de igarapés ambientalmente alterados o padrão é alterado para aninhamento de comunidades, onde estes igarapés representariam subconjuntos dos locais mais preservados. No quarto capítulo evidenciamos que a distribuição espacial das unidades de conservação da Amazônia não as torna eficiente para conservar o habitat de grandes porções de diversidade beta de Odonata. Uma vez que as áreas prioritárias estão localizadas principalmente na região sul da Amazônia e a maior parte destas áreas já está desmatada, pois estão inseridas dentro do arco do desmatamento, em seguida, considerando apenas áreas florestadas, as áreas prioritárias deslocam-se para a faixa mais central da Amazônia. Apartir daí sugerimos a criação de 2 novas unidades de conservação ou incentivos para atividades de baixo impacto nas regiões mais centrais, prioritárias e ainda florestadas, bem como, o incentivo para a restauração das áreas prioritárias já desmatadas. Uma possibilidade para isso, seria a implementação de programas que pagam por serviços ecossistêmicos, como créditos de carbono provenientes de reflorestamento, e/ou o desenvolvimento de atividades com menor impacto sobre a biodiversidade, como agrosilvicultura. Contribui consideravelmente para diminuir as lacunas wallaceanas e hutchisonianas de Zygoptera na Amazônia brasileira. / The distribution of species within a landscape and the mechanisms that determine this distribution are fundamental questions for the understanding of the ecology of biological communities. The understanding of these phenomena is essential for the management of ecosystems and decision-making on the conservation of biodiversity, environmental conditions, and ecosystem resources. In this dissertation, we focused on the communities of the damselflies, suborder Zygoptera (Insecta: Odonata), found in streams in the Brazilian Amazon region to investigate their alpha diversity (Chapter 1), beta diversity (Chapter 2), and the elements that structure metacommunities (Chapters 3), as well as the spatial priorities for the conservation of Amazonian odonates (Chapter 4). We used environmental, biogeographic, and spatial predictors to investigate the mechanisms that structure the distribution of the communities analyzed in this dissertation. In the case of alpha diversity (Chapter 1), environmental heterogeneity (climate) and primary productivity were the most important determinants of zygopteran species richness. For beta diversity (Chapter 2), turnover was the most important component of changes in species composition within the landscape, together with the spatial distance between sites, and the biogeographic region (centers of endemism), which were the most important predictors of zygopteran beta diversity. In our analysis of metacommunity patterns (Chapter 3), we found a Clementsian pattern in well-preserved streams, with a major change in the configuration of the communities in streams with environmental alterations, which represented subsets of the better preserved areas. In Chapter 4, we show that the spatial distribution of the conservation units in the Amazon region is relatively ineffective for the conservation of most of the beta diversity of the region’s odonates. As the priority areas are located predominantly in southern Amazonia, and most of these areas have already been deforested, given that they lie within the arc of deforestation, the priority areas were displaced toward the forested environments located nearer the center of the Amazon region. Based on this analysis, we suggest the creation of new conservation units or the implementation of incentives for the establishment of activities that cause reduced environmental impacts in more central, priority areas, which are still forested, as well as 4 the restoration of priority areas that have already been deforested. One possibility here would be the implementation of programs that pay for ecosystem services, such as carbon credits obtained through reforestation and/or the development of activities with a reduced impact on biodiversity, such as agroforestry. This study also makes a major contribution to the reduction of the Wallacean and Hutchisonian shortfalls on the zygopterans of the Brazilian Amazon region.

Made available in DSpace on 2015-03-05T16:19:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 26 / Nenhuma / Este estudo foi realizado em dez fragmentos de floresta ripária localizados no sul do Brasil (30°09’S, 51°36’W; 46 m de altitude). Entre as dez florestas ripárias selecionadas, cinco estavam circundadas por pastejo de gado e as outras cinco estavam circundadas por plantações de eucalipto. Foi avaliada a sustentabilidade de Campomanesia rhombea, Diospyros inconstans, Myrciaria cuspidata e Sebastiania commersoniana através de análises da estrutura de tamanho, as quais foram realizadas em duas escalas. Em escala local, foram consideradas as populações presentes nos fragmentos circundados por pastejo de gado ou por plantações de eucalipto e, em escala regional considerou-se também áreas florestais maiores, tomadas como referência (Inventário Florestal Contínuo do Rio Grande do Sul). Em escala local, nas populações presentes em fragmentos circundados por plantações de eucalipto, prevaleceram indivíduos de pequenas classes de tamanho, e em áreas expostas ao pastejo de gado, as mesmas espécies apresentaram uma falha / This studied was carried in ten riparian forest fragments located southern Brazil. Of the ten riparian forests selected for study, five were embedded in pasturelands and five in eucalyptus plantations. We assessed the population sustentability of Campomanesia rhombea, Diospyros incontans, Myrciaria cuspidata and Sebastiania commersoniana through analyses of size structure, which were carried out at two scales. At a local scale, we consider populations in fragments surrounded by pastures or eucalyptus forest plantations, and at a regional scale we also consider larger forest tracts taken as reference areas (Rio Grande do Sul Forest Inventory databank). At local scale, the populations in fragments embedded by eucalyptus plantations prevailed small size classes individuals, and in areas exposed to cattle ranching, the same species seem to have a recurring failure of small individuals. Regional analyses included only established individuals with DBH > 1.6 cm. In this scale, populations in fragments surrounded by

Submitted by Filipe dos Santos (fsantos@pucsp.br) on 2017-05-24T13:11:18Z No. of bitstreams: 1 Wandir Vieira Leal Santos.pdf: 1106831 bytes, checksum: 4e5140f1e5dc0d7a60ca4310e412bcec (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-24T13:11:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Wandir Vieira Leal Santos.pdf: 1106831 bytes, checksum: 4e5140f1e5dc0d7a60ca4310e412bcec (MD5) Previous issue date: 2017-04-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação São Paulo - FUNDASP / Joaquim Monteiro Caminhoá (1836-1896), a physician, botanic and educator from Bahia state, Brazil, has become one of the most quoted authors in several academic productions in different times. However, theoreticians who analysed his most important work— Elementos de Botânica Geral e Médica, published in 1877 — has underexplored his singular views on botanic taxonomy. The analysis of the four volumes that are part of this work has allowed us to verify the urgency called by him in the reformulation of the concept of “specie”, which ought to be obtained under the light of science. That is because he considered that science, philosophy and theology could not be mixed. Therefore, he proposes that the studies should be carried out under constantly observation. In that way, Caminhoá has assumed a specific position in the face of one of the most controversial Botanic issues in the 19th century, a period in which a great amount of species needed to be indexed. Thus, the challenge of classifying plants in the face of this diversity has been set. In that context, the essentialist classification dogmatism has lost its domain to the possibilities sustained by the most recent evolutionist theories. In this tangle of doubts that surrounded the system of botanical classification, we found that Caminhoá had been determined to find evidences that could led him to a reliable classification of plants found in the national territory / O botânico, médico e educador baiano, Joaquim Monteiro Caminhoá (1836-1896) tornou-se um nome muito citado em diversas produções acadêmicas em diferentes épocas, mas a sua visão singular sobre a Taxonomia Botânica foi pouco explorada ao analisarem a sua mais importante obra, Elementos de Botânica Geral e Médica, publicada em 1877. A análise dos quatro volumes desta obra, permitiu verificar a urgência, reclamada por ele, na (re)formulação do conceito de espécie, a ser obtido inteiramente à luz da ciência, por considerá-la imiscível com a filosofia e com a teologia. Para tanto, ele propõe como norte a dirigir os estudos a observação constante. Desta forma, Caminhoá posicionou-se diante de um dos temas mais polêmicos da Botânica do século XIX, um período no qual, um surpreendente número de novas espécies precisavam ser identificadas. Com isso, estabeleceu-se o desafio de classificar os vegetais perante toda esta diversidade. Neste cenário, o dogmatismo da classificação essencialista perdeu o seu domínio ante as possibilidades defendidas pelos avanços das teorias evolucionistas. Neste emaranhado de dúvidas que cercavam a sistemática de classificação botânica, encontramos Caminhoá empenhado em encontrar evidencias que o conduzisse a uma classificação segura das plantas encontradas em território nacional