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Filogenia morfológica e molecular e aspectos biogeográficos da subfamília chioninae (Bivalvia: veneridae)

Rocha, Valesca Paula January 2016 (has links)
ROCHA, V. P. Filogenia morfológica e molecular e aspectos biogeográficos da subfamília chioninae (Bivalvia: veneridae). 2016. 121 f. Tese (Doutorado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-06-24T15:32:56Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_vprocha.pdf: 5549832 bytes, checksum: 086e4291a3c9cb6ab828911520b7e337 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2016-06-24T16:04:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_vprocha.pdf: 5549832 bytes, checksum: 086e4291a3c9cb6ab828911520b7e337 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-24T16:04:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_vprocha.pdf: 5549832 bytes, checksum: 086e4291a3c9cb6ab828911520b7e337 (MD5) Previous issue date: 2016
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The complete plastid genome sequence of Passiflora cincinnata: genome rearrangements, massive plastid gene losses and implications to genome-plastome incompatibility / Sequência completa do genoma plastidial de Passiflora cincinnata: rearranjos no genoma, múltiplas perdas de genes plastidiais e implicações na incompatibilidade genoma-plastoma

Pacheco, Túlio Gomes 20 July 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-08-14T14:08:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1978433 bytes, checksum: 32b3bd186716af4ca62da484b2c51474 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-14T14:08:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1978433 bytes, checksum: 32b3bd186716af4ca62da484b2c51474 (MD5) Previous issue date: 2016-07-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A organização, ordem e conteúdo gênico de genomas plastidiais (plastomas) são bastante conservados em angiospermas, porém há exceções a esta regra. Este parece ser o caso do gênero Passiflora, pois há evidências de perdas não usuais de genes plastidiais para espécies deste gênero. Porém, nenhum plastoma de Passiflora foi publicado até o momento, o que dificulta estudos a respeito da evolução do plastoma deste grupo. Da mesma forma, o estudo das causas da incompatibilidade entre o genoma nuclear e plastoma, apresentada por alguns híbridos interespecíficos de Passiflora, tem se mantido obscuro devido à falta de sequências plastidiais disponíveis no banco de dados. Assim, visando começar a preencher estas lacunas e ainda permitir a caracterização de marcadores genéticos plastidiais e a construção de vetores para transformação plastidial em Passiflora, o presente trabalho teve como objetivo o sequenciamento, montagem, análise e caracterização do plastoma de Passiflora cincinnata. Os dados indicam uma massiva perda de genes plastidiais essenciais para a viabilidade celular (infA, rps7, rps16, rpl20, rpl22, ycf1 e ycf2), os quais, muito provavelmente, foram transferidos para o núcleo e seus produtos são importados pelos plastídios. Este genoma mostrou alta taxa de substituição de nucleotídeos para os genes accD e clpP. Apesar da alta divergência, a sequência traduzida destes genes mantém a maioria dos domínios funcionais previstos para as proteínas que codificam e com isso a funcionalidade dos mesmos não pode ser descartada. Além disso, múltiplas inversões também foram detectadas no plastoma de P. cincinnata, mudando a ordem de vários genes. Em conjunto, os dados sugerem uma incomum evolução do plastoma de P. cincinnata, caracterizada por perdas gênicas, inversões no genoma e presença de genes com aceleradas taxas de substituição de nucleotídeos. Assim, é possível sugerir que esta instabilidade do genoma e perda de genes essenciais possa estar relacionada com a incompatibilidade entre núcleo e plastoma observada em híbridos de Passiflora. Por fim, a sequência completa do plastoma de P. cincinnata, obtida neste trabalho torna viável a transformação plastidial nesta espécie, visando aplicações biotecnológicas, além de estudos evolutivos e de genética funcional. / The plastid genome (plastome) organization, gene content and order is well conserved in most angiosperms, but there are some exceptions. The Passiflora genus is one of those exceptions, because there are evidences of some unusual plastid gene losses to species of this genus. However, none plastome of Passiflora has been published to date, making studies related to the evolution and putative high instability of plastome in this group difficult. In parallel, the study of the causes of nucleus-plastome incompatibility, observed in interspecific hybrids of Passiflora, has remained obscure due to the lack of plastid sequences in the database. In the context, starting to fill these gaps and to enable the characterization of plastid genetic markers and the construction of vectors for plastid transformation in Passiflora, the aim of the present study was the sequencing, assembly, analysis and characterization of complete P. cincinnata plastome. The data indicate a massive loss of plastid genes that are essential for cell viability (infA, rps7, rps16, rpl20, rpl22, ycf1 and ycf2), which very likely were functionally transferred to the nucleus and its products are imported into plastid. This genome also showed a high rate of nucleotide substitution in several genes, such as accD and clpP. Despite this high divergence, the translated amino acid sequences of these genes retain most of functional domains predicted indicating that they can still encode functional proteins. In addition, multiple inversions were detected in the P. cincinnata plastome, changing the order of several genes. Taken together, the data suggest a markedly uncommon evolution of P. cincinnata plastome, characterized for gene losses, multiple inversions and genes with accelerated nucleotide substitution rates. Thus, it is possible to suggest that the genomic instability and essential genes losses, observed here, may be related to the genome- plastome incompatibility observed in Passiflora hybrids. This relation can be established and investigated of an accurate manner with the sequencing of other Passiflora plastomes. Finally, the complete plastome sequence of P. cincinnata obtained in this work enables the plastid transformation to this species, aiming biotechnology applications and studies of evolution and functional genetics.
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The fate of duplicate genes in plants / Destino evolutivo de genes duplicados em plantas

Silva, Hugo Rody Vianna 26 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-06T16:07:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1826443 bytes, checksum: d5304a575fc041fa7cd7350206cd3bad (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-06T16:07:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1826443 bytes, checksum: d5304a575fc041fa7cd7350206cd3bad (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Plantas são organismos paleopoliplóides que sobreviveram ao deletério processo de duplicação do genoma. Após a duplicação, cópias de um mesmo gene (parálogos) evoluem de forma divergente devido ao relaxamento da seleção purificadora, tornando os genes duplicados fonte de diversificação evolutiva. No entanto, nem todas as categorias de genes são retidas nos genomas, ou perdidas, de forma aleatória. Vários modelos evolutivos têm sido propostos para explicar o destino evolutivo e retenção tendenciosa de genes duplicados, para consequentemente entender melhor a poliploidia. Entretanto, a aplicabilidade destes modelos têm sido pouco investigadas. Usamos abordagens de genômica comparativa e de filogenia molecular para investigar o destino evolutivo de genes duplicados em plantas. Inicialmente, inferimos sobre a ancestralidade de duas pequenas famílias de genes duplicados — metionina sintase e oligossacarídeos de rafinose — em genomas de nove espécies de plantas superiores para, então, caracterizar as forças evolutivas que moldaram os destinos evolutivos dos parálogos, usando dados de resequenciamento de 31 genomas de soja. Posteriormente, usamos dados genômicos de 25 espécies de plantas taxonomicamente divergentes para associar mecanismos de duplicação, categoria funcional do gene e idade de duplicação na retenção tendenciosa de genes duplicados. Nas duas famílias gênicas, cada parálogo evoluiu de forma divergente devido ao relaxamento da seleção purificadora, o que permitiu que mutações aleatórias com valor adaptativo fossem eventualmente fixadas por seleção positiva. No entanto, a seleção purificadora parece ter sido mais restritiva em ao menos um dos parálogos de cada família gênica, preservando função ancestral. Tanto a idade quanto o mecanismo de duplicação contribuíram para variação nos padrões de retenção de genes duplicados nos 25 genomas alvos deste estudo. O destino evolutivo e a retenção de genes duplicados nos genomas parecem ser moldados por peculiaridades inerentes a cada organismo poliplóide. / Plants are paleopolyploid organisms that survived the deleterious process of genome duplication. After duplication, copies of the same gene (paralogs) evolve in different ways due to the relaxation of purifying selection, making the duplicated genes the greatest source of evolutionary diversification. However, not all categories of genes are retained in the genomes, or lost, randomly. Several evolutionary models have been proposed to explain the evolutionary fate and biased retention of duplicate genes, to thereby better understand polyploidy. However, the applicability of these models has been ill defined. We used approaches of comparative genomics and molecular phylogeny to investigate the fate of duplicated genes in plants. Initially, we inferred about the ancestry of two small families of duplicated genes — methionine synthase and raffinose oligosaccharides — in the genomes of nine species of plants to then characterize the evolutionary forces that have shaped the evolutionary fate of paralogs, using resequencing data from 31 soybean genomes. Later, we used genomic data from 25 taxonomically different plant species to associate mechanisms of duplication, functional gene category and age of duplication to the biased retention of duplicate genes. In each of the two gene families, paralog evolved in different ways due to the relaxation of purifying selection, which allowed random mutations with adaptive value be fixed by positive selection. However, purifying selection seems to be more restrictive in at least one of paralogs of each gene family, preserving the ancestral function. Both the age and the mechanism of duplication contributed to variation in duplicate genes retention patterns in the 25 target genomes in this study. The fate and retention of duplicate genes in the genomes is apparently shaped by peculiarities inherent to each polyploid organism.
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Evolução Geomorfológica do Sítio Natural de Fortaleza, Ceará / Geomorphological Evolution of Natural Site in Fortaleza, Ceará

Moura Fé, Marcelo Martins de January 2008 (has links)
MOURA FÉ, M. M. Evolução Geomorfológica do Sítio Natural de Fortaleza, Ceará. 2008. 250 f. Dissertação (Mestrado em Geografia) - Centro de Ciência, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2014-06-25T18:23:26Z No. of bitstreams: 1 2008_dis_mmmourafe.pdf: 6550486 bytes, checksum: ca07b23877ad1fabdf7630d631b69f52 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-06-25T18:54:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_dis_mmmourafe.pdf: 6550486 bytes, checksum: ca07b23877ad1fabdf7630d631b69f52 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-06-25T18:54:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_dis_mmmourafe.pdf: 6550486 bytes, checksum: ca07b23877ad1fabdf7630d631b69f52 (MD5) Previous issue date: 2008 / The natural site of Fortaleza city, despite of the present standards of use and occupation of the soil, still presents a significant natural diversity, which were approached in this work under a geomorphological analysis that is initiated in the geological long term and achieves in the present days. The objectives ot the work are the main aspects of the geomorphological genesis and evolution of the natural site of the city of Fortaleza, capital of the State of Ceará, Northeast of Brazil, having as theoretical support the Principle of Actualism, associated to an assembly of techniques that permitted the development of the analyses about the subject researched. The work, divided in three part, besides presenting a natural characterization of the city of Fortaleza, highlights the main elements of the morphostructural evolution of the area during the Cretaceous, the Quaternary and Tertiary periods and its inherent events. Regarding the most recent aspects of the geomorphological evolution, we discuss the present reliefs of the natural site of Fortaleza, with characterizations and vertical analyses, as well as the role of these reliefs in the present dynamics. Finalizing the research, we analyze the main process of environmental degradation of the landscape associated to the more significant urban development of Fortaleza, as well as the consequences of the environmental degradation for the routine one of the city in the century XXI. The results obtained could indicated the geomorphological features resultant of the action of geomorphological process during the Cretaceous still presents in the landscape, as well as its influence in the subsequent geomorphological evolution. Besides, we present a hypothesis of evolution for the deposition of the Barreiras Formation during the Tertiary, as well as a proposal of a possible paleo-valley of Cocó River, the main river of the city, which would have been changed during the Quaternary until achieve its present characteristics. On the basis of the mapping carried out and analyzed, we also propose a classification for the ponds that caractherized the natural site of Fortaleza. Finally, we present the main morphological characteristics of the city, as well as the present situation of its relifs. Finalizing, we analyze the influence of the process of development in the degradation of those features, the factors and the effects of the pressure exercised by the society, the worry about the way this situation is developing, the need of thinking and rethinking these conditions, as well as the importance of the natural site of the city, not well known to their citizens, in its essence and dynamics. / O Sítio Natural de Fortaleza, apesar dos atuais padrões de uso e ocupação, ainda apresenta uma significativa diversidade de elementos constitutivos, os quais foram abordados neste trabalho sob uma análise geomorfológica que se inicia no longo termo e alcança os dias atuais. Este texto objetiva essencialmente abordar os principais aspectos da gênese e evolução geomorfológica do sítio natural onde atualmente se situa e se desenvolve a cidade de Fortaleza, capital do Estado do Ceará, Nordeste do Brasil, tendo como elemento norteador e teórico o Princípio do Atualismo, associado a um conjunto de técnicas que permitiram o desenvolvimento das análises acerca do tema pesquisado. Ao longo da dissertação, dividida em três partes, além de apresentar uma caracterização natural da cidade de Fortaleza e discutir a ciência geomorfológica e o Princípio do Atualismo, tratamos dos principais elementos da evolução morfoestrutural da área ao longo do Cretáceo, bem como dos períodos Terciário e Quaternário da Era Cenozóica e seus eventos intrínsecos, eventos estes, essenciais para o início da configuração atual do meio físico analisado. Com relação aos aspectos mais recentes da evolução geomorfológica analisada, discutimos os relevos presentes no sítio natural de Fortaleza, com caracterizações e análises mais verticalizadas, bem como da participação, condicionante e condicionada, desses relevos na dinâmica atual. Finalizando o trabalho, analisamos o principal processo de degradação da paisagem analisada, o processo de urbanização de Fortaleza, com a expansão da malha urbana e seus períodos mais significativos, citando suas causas, as direções dessa expansão e, principalmente, os elementos da paisagem alterados pela urbanização, bem como, os processos de degradação ambiental presentes no cotidiano da cidade no século XXI. Os resultados obtidos puderam apontar as feições geomorfológicas resultantes dos processos morfoestruturais de idade Cretácea e ainda presentes na paisagem, bem como sua influência para os processos posteriores. Além disso, apresentamos uma hipótese evolutiva para a deposição da Formação Barreiras ao longo do Terciário na área em tela, bem como uma proposta de um possível paleo-curso do rio Cocó, principal rio da cidade de Fortaleza, o qual teria sido alterado ao longo do Quaternário até alcançar suas características atuais. Com base no mapeamento realizado e analisado, propomos uma classificação para as lagoas ainda presentes e que constituem o sítio natural de Fortaleza. Por fim, apresentamos as principais características morfológica da cidade, bem como o estágio atual dos relevos da cidade e seu mútuo inter-relacionamento. Finalizando, analisamos a influência do processo de urbanização na degradação dessas feições, os fatores e os efeitos da pressão exercida pelo meio antrópico sobre o sítio natural, a preocupação com os rumos desse processo, a necessidade de se pensar e repensar este quadro, bem como, a importância de se conhecer esse sítio natural, esse meio físico tão presente no cotidiano de todos os citadinos e, ao mesmo tempo, ignorado e/ou desconhecido na sua essência e dinâmica.
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Processos evolutivos subjacentes ao gradiente latitudinal de diversidade de peixes recifais

Corrêa, Alexandre Siqueira January 2015 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-09-15T04:08:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334479.pdf: 1620375 bytes, checksum: 7f555c6138a11d2fdd14e1d10aea8260 (MD5) Previous issue date: 2015 / O aumento na riqueza de espécies dos polos em direção aos trópicos é um dos padrões de distribuição da diversidade mais prevalentes na natureza. Apesar de já ter sido descrito para diversos táxons e muitas hipóteses terem sido propostas para explicá-lo, o gradiente latitudinal de diversidade (GLD) permanece pouco entendido com relação a seus processos geradores. Parte desta falta de entendimento ocorre, pois, durante muito tempo, fatores históricos e evolutivos foram negligenciados como parte da sua explicação. Os peixes recifais são modelos ideais para a análise de tais aspectos, pois apresentam grande diversidade distribuída entre ambientes tropicais e extratropicais, além de relações filogenéticas relativamente bem resolvidas. Então, com o objetivo de explorar a dinâmica evolutiva por trás do GLD de peixes recifais, o presente estudo avaliou as hipóteses de que (1) linhagens tropicais apresentam maiores taxas de diversificação do que linhagens extratropicais, (2) linhagens extratropicais são, em sua maioria, originárias de linhagens tropicais, e (3) a tolerância térmica é um atributo conservado na história evolutiva de peixes recifais. Utilizando filogenias de quatro famílias recifais, Chaetodontidae, Labridae, Pomacentridae e Sparidae, eu construí modelos evolutivos a partir de um método comparativo filogenético (GeoSSE). Este método permite estimar com máxima verossimilhança os parâmetros especiação, extinção e dispersão entre zonas geográficas a partir de filogenias calibradas no tempo. Para avaliar se espécies proximamente relacionadas tendem a compartilhar maior afinidade de nicho térmico do que o esperado ao acaso (sinal filogenético), eu usei um método de randomização de caracteres associada a uma matriz de custos de transição entre estados de caracter. As taxas de especiação foram mais elevadas e as taxas de extinção tenderam a ser menores em linhagens tropicais, embora essa diferença na extinção não tenha sido detectada em duas famílias. Combinando esses resultados, encontrei maiores taxas de diversificação líquida para linhagens tropicais em todas as famílias analisadas. Taxas de dispersão foram maiores para as linhagens com origens tropicais dispersando para ambientes extratropicais. Em três das quatro famílias analisadas (Chaetodontidae, Labridae e Sparidae) encontrei um forte sinal filogenético para o nicho térmico, sendo espécies proximamente relacionadas mais similares em termos detolerância térmica. Ambientes tropicais são, portanto, importantes na geração e manutenção de espécies de peixes recifais, servindo ainda como fonte de linhagens para ambientes extratropicais. Os processos de especiação, extinção e dispersão de linhagens atuaram em sinergia para promover o GLD em peixes recifais. Estes resultados corroboram previsões clássicas sobre os processos evolutivos subjacentes ao gradiente latitudinal de diversidade enfatizando o essencial papel evolutivo dos ambientes tropicais marinhos. Além de desvendar o componente filogenético do GLD com peixes recifais, este trabalho ressalta a importância dos processos evolutivos na geração e manutenção dos padrões globais de diversidade biológica.<br> / Abstract : The increase in species richness from the poles toward the tropics is the most prevalent pattern of diversity distribution in nature. Although it has been described for many taxa and many hypotheses have been raised to explain it, the latitudinal diversity gradient (LDG) remains poorly understood with respect to its underlying processes. Part of this lack of understanding occurs because, for a long time, historical and evolutionary factors have been overlooked as part of the explanation. Reef fishes make ideal models for the analysis of these aspects, since they present great diversity distributed among tropical and extratropical environments and relatively well resolved phylogenetic relationships. The present study aimed to explore the evolutionary dynamics behind the LDG for reef fishes and evaluated the hypotheses that (1) tropical lineages have higher diversification rates than extratropical ones, (2) extratropical lineages are mainly originated from tropical ones, and (3) thermal tolerance is a conserved trait within the evolutionary history of reef fishes. Using phylogenies of four reef families, Chaetodontidae, Labridae, Pomacentridae and Sparidae, I built evolutionary models with a phylogenetic comparative method (GeoSSE). This method estimates the parameters speciation, extinction and dispersal between geographical areas by maximum likelihood from time calibrated phylogenies. To assess whether closely related species tend to share more thermal niche affinities than expected by chance (phylogenetic signal), I used a method of randomization of tip state information associated with a matrix of costs of character state transition. The speciation rates were higher and extinction rates tended to be lower in tropical lineages, although this difference in extinction has not been detected in two families. Combining these results, I found higher net diversification rates for tropical lineages in all families analyzed. Dispersal rates were higher for lineages with tropical origins dispersing into extratropical environments. In three of the four families analyzed (Chaetodontidae, Labridae and Sparidae) I found a strong phylogenetic signal for thermal niche, being closely related species more similar in terms of thermal tolerance. Tropical environments thus are important in generating and maintaining reef fish species, serving also as a source of evolutionary lineages to extratropical environments. The processes of speciation, extinction and dispersal have acted in synergy to promote theLDG in reef fishes. These results corroborate classical predictions about the evolutionary processes underlying the latitudinal diversity gradient emphasizing the essential evolutionary role of tropical marine environments. In addition to unravel the phylogenetic component of LDG for reef fishes, this work highlights the importance of evolutionary processes in the generation and maintenance of global patterns in biodiversity.
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As funções de Funcções do Cérebro- 1876: um estudo do evolucionismo de Domingues Guedes Cabral - 1852-1883 / The functions of 'Funcções do Cerebro' - 1876: a study of the evolutionism of Domingues Guedes Cabral - 1852-1883

Pereira Filho, Roberto Sobreira January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2012-05-07T14:48:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000037.pdf: 1178315 bytes, checksum: c52e2628c73f654956019664659355a0 (MD5) Previous issue date: 2008 / O livro Funcções do Cerebro (1876), do médico baiano Domingos Guedes Cabral (1852-1883), é reconhecido como um dos primeiros trabalhos nacionais a expor e defender teorias darwinistas. A importância deste fato liga-se diretamente à dinâmica do final do século XIX, quando os intelectuais brasileiros dialogavam intensamente com teorias européias a fim de interpretar os problemas nacionais contemporâneos, tais como Guerra do Paraguai, escravidão, regime político, adoção de mão de obra imigrante e educação do povo. Ciente da necessidade de maiores investigações em relação à recepção das teorias evolucionistas no Brasil, este trabalho se propôs a investigar o livro Funcções do Cerebro (1876) perseguindo dois objetivos principais: 1)esclarecer como Guedes Cabral compreendeu e utilizou o evolucionismo em sua argumentação e 2)demonstrar a finalidade do argumento de Guedes Cabral, ou seja, qual o sentido que suas idéias apresentam. Como orientação metodológica foram utilizados os trabalhos de Jean Baptiste Lamarck (1744­-1829), Herbert Spencer (1820-1903), Charles Darwin (1809-1882), e Ernst Haeckel (1834-­1919), além das discussões de Mayr (1998) e John C. Greene (1981) acerca dos significados do termo darwinismo.
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Efeitos e reflexos da LRF sobre a gestão pública e evolução econômica dos estados brasileiros no período 2001 a 2010

Freire, Adriana Albuquerque Arraes January 2014 (has links)
FREIRE, Adriana A. A. Efeitos e reflexos da LRF sobre a gestão pública e evolução econômica dos estados brasileiros no período 2001 a 2010. 2014. 58f. Dissertação (mestrado profissional) - Universidade Federal do Ceará, Programa de Pós Graduação em Economia, CAEN, Fortaleza-CE, 2014. / Submitted by Mônica Correia Aquino (monicacorreiaaquino@gmail.com) on 2016-01-27T22:07:47Z No. of bitstreams: 1 2014_dissert_aaafreire.pdf: 726053 bytes, checksum: ed26ef99ee8b6accb1297e98fed7e7b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Mônica Correia Aquino(monicacorreiaaquino@gmail.com) on 2016-01-27T22:08:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dissert_aaafreire.pdf: 726053 bytes, checksum: ed26ef99ee8b6accb1297e98fed7e7b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-27T22:08:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dissert_aaafreire.pdf: 726053 bytes, checksum: ed26ef99ee8b6accb1297e98fed7e7b7 (MD5) Previous issue date: 2014 / In this work one views the fiscal responsibility law – hereafter FRL, and its effects with special attention to the public administration to fiscal behavior of Brazilian states. These have made great economic improvements over the period from 2001 to 2010. As it well known FRL is kind of landmark (issued from nº 4.320/64 law) as well as a hard-budget constraint legislation, which contributes to fiscal governance. More specifically, it illustrates the kind of policy outcome reflecting the role of external control of public administration by imposing procedural rules and homogeneity in the functioning of the public accounts. There is no question about the positive effect of the FRL – among other things it provides some transparency and accountability procedures, enabling environment for accelerating economic growth of Brazil’s states. Given all this, one aims to shed lights on the circumstances and character of the law under consideration that could be of use and, as consequence, refines the consolidated debt post – FRL (from 2001 to 2010); figure out fiscal indicators attached to it and the evolution of GDP from the states after the law. To this end, one made use of panel data to investigate the relationship between FRL indicators and the GDP per capita. The results, which include the indicators and their boundaries, allow us to view that the uniform comparison of the numbers to public management, considered only by year, is closely related to per capita GDP of Brazil´s states. This indicates similarity in the movements of retraction both stability and economic growth. The public debt is one of these indicators, clearly prominent in some states, below the limit in the majority, under control in others. / Este trabalho aborda os efeitos da Lei de Responsabilidade Fiscal – LRF – e legislação diretamente correspondente, produzidos sobre a gestão pública dos Estados brasileiros, no período de 2001 a 2010, bem como, seus reflexos na evolução econômica desses Estados considerando o mesmo período. A LRF representou um novo marco histórico para as finanças públicas desde a concepção da Lei nº 4.320/64 impactando na condução das políticas públicas principalmente por atuar como mecanismo de controle da gestão pública, induzindo uma readequação nos aspectos de acompanhamento contínuo e padronizado dos indicadores fiscais do setor público. Presume-se que o surgimento da LRF tenha influenciado positivamente a administração pública traduzindo-se em crescimento econômico para as unidades da Federação. Diante do contexto, os objetivos específicos deste estudo são: (1) Verificar se na composição das finanças públicas dos Estados e a Dívida Consolidada Líquida regrediu no período pós-LRF (2001 a 2010); (2) Encontrar relação ou comportamento semelhante entre a evolução dos indicadores fiscais da LRF com a evolução ou retração do PIB dos Estados no referido período de análise. Para tanto, utilizou-se o modelo de dados em painel a fim de verificar a relação dos indicadores da LRF com o PIB per capita. Os resultados da análise que engloba os indicadores e seus respectivos limites permitiram concluir que a comparação uniforme dos números da gestão pública, acompanhados anualmente, guarda estreita relação com o PIB per capita dos Estados do Brasil, indicando semelhança nos movimentos de retração, estabilidade ou crescimento econômico de ambos; sendo a dívida um destes indicadores, permaneceu alta em alguns Estados, abaixo do limite na maioria e sob controle em outros.
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Análise comparativa do genoma plastidial de Myrtaceae

Machado, Lilian de Oliveira January 2017 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-07-25T04:09:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 347036.pdf: 3740412 bytes, checksum: 5b49a0b6ba26117eca45178ed0e7b0c1 (MD5) Previous issue date: 2017 / A família Myrtaceae pertence à ordem Myrtales e possui cerca de 130 gêneros e aproximadamente 6000 espécies. Essa família de frutíferas é considerada importante em várias formações vegetais, distribuindo-se em todos os continentes, exceto na região Antártica. No Brasil a distribuição ocorre em todos os estados. Acca sellowiana (goiabeira-serrana), Campomanesia xanthocarpa (guabiroba), Eugenia uniflora (pitanga) e Plinia spp. (jabuticabas) são espécies de Myrtaceae que têm mostrado boas perspectivas de aumento do uso comercial, tanto que estão no projeto plantas para o futuro da Região Sul e já são cultivadas em pequena escala, comparativamente a outras frutíferas exóticas. Estas espécies destacam-se pelo potencial organoléptico dos frutos, propriedades farmacológicas e valor ornamental, entre outros. Além disso, frutos destas espécies já são atualmente produzidos no Brasil, o que torna um excelente mercado a ser explorado no país. Desta forma, este trabalho tem por objetivo identificar e comparar os genomas plastidiais (cpDNA) de cinco espécies frutíferas de Myrtaceae: Acca sellowiana, Campomanesia xanthocarpa, Eugenia uniflora, Plinia cauliflora, Plinia aureana e uma espécie híbrida (Plinia sp.) visando avançar na compreensão de processos evolutivos e futuramente desenvolver marcadores microssatélites de cloroplasto (cpSSR) específicos visando estudos de diversidade genética dessas espécies em seus habitats. Para tanto, o genoma plastidial (cpDNA) das espécies foi extraído e purificado e seus plastomas foram sequenciados por meio de sequenciamento de nova geração (NGS), em plataforma Illumina MiSeq. Após o sequenciamento foi adotada a estratégia de montagem de novo, ou seja, sem utilização de outra espécie como referência. O plastoma completo de A. sellowiana possui 159.370 pb de comprimento, região longa de cópia única (LSC) de 88.028 pb, região curta de cópia única (SSC) de 18.598 pb e regiões repetidas invertidas (IRs) com 26.372 pb; E. uniflora possui um tamanho de plastoma completo de 158.680 pb, LSC de 87.495 pb, SSC de 18.537 pb e IRs com 26.324 pb; C. xanthocarpa possui um plastoma de 158.131 pb de comprimento, LSC de 87.596 pb, SSC de 18.595 pb e IRs com 25.970 pb; Plinia aureana 158.918 pb de comprimento, LSC de 88.204 pb, SSC de 18.462 pb e IRs com 26.126 pb; Plinia cauliflora 159.095 pb de comprimento, LSC de 88.162 pb, SSC de 18.615 pb e IRs com 26.159 pb; Plinia sp. 158.912 pb de comprimento, LSC de 88.132 pb, SSC de 18.462 pb e IRs com 26.159 pb. Dados de sequenciamento de plastomas completos de espécies da mesma família possibilitarão a realização de estudos comparativos para a identificação de polimorfismos espécie-específicos, os quais poderão gerar marcadores moleculares para estudos de evolução, ecologia, filogenia, filogeografia e diversidade genética.<br> / Abstract : Myrtaceae belongs to the order Myrtales in which about 130 genera and 6000 species are assigned. This family is considered important in various vegetation types, occurring in every continent, except Antarctica region. In Brazil, the family's species are distributed in all states. Acca sellowiana (pineaple-guava or feijoa), Plinia peruviana (jaboticaba), Campomanesia xanthocarpa (guabiroba) and Plinia spp. (jabuticabas). are Myrtaceae species that have shown potential for commercial use and are included in the project ?Plants to the Future?. In addition, these four species stand out for their organoleptic fruit flavours, pharmacological properties and ornamental value, among others. Moreover, currently, fruits of these species are produced on a small scale in Brazil, comparatively to the exotic fruit species, making them an excellent market opportunity to be further exploited in the country. Thus, this study aimed at to identify and to compare the plastid genomes (cpDNA) of four fruit species of Myrtaceae: Acca sellowiana, Campomanesia xanthocarpa, Eugenia uniflora, Plinia cauliflora, Plinia aureana and a hybrid species (Plinia sp.), in order to deepen on their evolutionary process and to develop specific chloroplast microsatellite markers (cpSSR) to carry out further studies on the genetic diversity of these species in their habitats. Therefore, the chloroplast DNA (cpDNA) of the species was extracted and purified, and the plastomas were sequenced by Illumina MiSeq plataform next-generation. After the sequencing, the de novo strategy was used, that this, without using another species as a reference. The complete plastid genome of A. sellowiana has 159,370 pb Kb in length, large single copy region (LSC) of 88,028 bp, small sigle copy region (SSC) of 18,598 bp and inverted reapt regions (IRs) with 26,372bp. E. uniflora has a complete plastid genome of 158,680 Kb, LSC of 87,495 bp, SSC of 18,537 bp and IRs with 26,324 bp. C. xanthocarpa has a complete plastid genome of 158,131 Kb in length, LSC of 87,596 pb bp, SSC of 18,595 bp and IRs with 25,970 bp; P. aureana has a complete plastid genome of 158,918 Kb in length, LSC of 88,204 pb bp, SSC of 18,462 bp and IRs with 26,126 bp; P. cauliflora has a complete plastid genome of 159,095 Kb in length, LSC of 88,162 pb bp, SSC of 18,615 bp and IRs with 26,159 bp and Plinia sp. has a complete plastid genome of 158,912 Kb in length, LSC of 88,132 pb bp, SSC of 18,462 bp and IRs with 26,159 bp. Complete plastomas of species of the same family will allow to perform comparative studies for the identification of species-specific polymorphisms, which can generate molecular markers for the study on evolution, ecology, phylogeny, philogeography and genetic diversity.
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A produção de espaço residencial em cidade de fronteira : a expansão recente de Sant'Ana do Livramento - RS

Schäffer, Neiva Otero January 1992 (has links)
Sant'Ana do Livramento surge e cresce numa vinculação estreita com a fronteira, na qual se estabelece sua individualidade. Sua estrutura e sua dinâmica expressam, num certo nível,os vínculos mantidos com a linha limite e a cidade de Rivera e, em outro, com as metrópoles platinas. A expansão física da cidade, a produção das áreas de uso residencial, tiveram esta conotação. O espaço construído prendia-se à linha divisória e era cercado por áreas rurais produtivas. As transrormações verificadas no curso de uma geração, a partir de meados da década de 60, apontam uma outra direção no processo de produção da cidade: a ruptura do espaço agrário circundante, a incorporação do mesmo ao uso urbano. A cidade rompe seus limites tradicionais e aproxima as práticas de seus agentes àquelas referidas à urbanização brasileira. A extensão da área construída, através da implantação de loteamentos destinados aos segmentos de menor renda e da formalização de espaços de melhor padrão construtivo, indica os processos de segregação e de acumulação que sustentam este novo momento. O trabalho procura identificar as transrormações na constituição dos espaços de uso residencial e analisar os procedimentos que, no âmbito do Est.ado e dos agentes privados, explicam sua expansão.
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Máquinas de vetores suporte usando o algoritmo evolução diferencial com busca local para classificação de dados

COSME, R. C. 30 January 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:33:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4083_.pdf: 853634 bytes, checksum: 128833f0f7dbbf4105fe8e92f379f1ab (MD5) Previous issue date: 2012-01-30 / Mineração de dados é uma área chave para diversos campos da ciência e engenharia. Neste contexto, um método de aprendizado estatístico, conhecido como máquinas de vetores suporte tem se apresentado como um método promissor para solucionar classificação de dados. Geralmente, o problema de máquinas de vetores suporte (inglês: Support Vector Machines - SVM) é formulado como um problema de otimização não-linear sujeito a restrições. Técnicas de otimização convencionais que utilizam a abordagem Lagrangiana são usadas para solucionar este tipo de problema. No caso de classificação de dados ruidosos as técnicas convencionais apresentam deterioração de desempenho, já que o problema de otimização resultante é multidimensional e pode apresentar muitos mínimos locais. Neste trabalho, é proposto o algoritmo Evolução Diferencial combinado com uma técnica de busca local, uma hibridização de busca tabu com o método Nelder-Mead, para encontrar os parâmetros ótimos dos classificadores SVM aplicados a dados ruidosos.

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