Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Agrarias / Made available in DSpace on 2012-10-17T09:04:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O presente trabalho visa a classificação de algumas espécies de fungos de clima subtropical na Ilha de Santa Catarina. O objetivo foi identificar e selecionar, através de Screening quanto ao seu potencial enzimático na hidrólise dos substratos sintéticos carboximetilcelulose, celulose microcristalina, papel de filtro ("Walseth" celulose) e salicina nas concentrações de 0,25 e 0,50% (p/v), quando comparados com o Trichoderma viride. Foram selecionados os fungos Ganoderma applanatum e Picnoporus sanguineus onde apresentaram resultados de degradação do substrato semelhante ou superior ao padrão. Para testar a eficiência dos complexos produzidos foram realizados testes de produção enzimática indutiva por via fermentativa, a cada 24 horas alíquotas de lmL do caldo de cultura foram submetidas a ensaios enzimáticos nos tempos de 60, 120 e 180 minutos utilizando os substratos citados anteriormente. A determinação da atividade enzimática baseou-se na quantificação dos açúcares redutores liberados ao meio pelo método do ácido dinitrosalicílico através de análise espectrofotométrica. Observou-se que o fungo Picnoporus sanguineus e Ganoderma applanatum apresentaram maior atividade celulolítica em 60 minutos de incubação. O Ganoderma applanatum apresentou atividade exoglicosidase (24,93 UI/mL) superior quando o substrato utilizado foi celulose microcristalina, com relação aos demais. O Picnoporus sanguineus apresentou atividade endo e exoglicosidases mais expressivas com relação ao Ganodenna applanatum. As enzimas liberadas no caldo de cultivo pelo Picnoporus sanguineus apresentaram uma redução da atividade em 120 minutos, porém foram mais resistentes quando comparadas ao Ganoderma applanatum.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2008. / Submitted by Priscilla Brito Oliveira (priscilla.b.oliveira@gmail.com) on 2009-09-14T19:58:52Z No. of bitstreams: 1 2008_JaquelineBarbosaDutra.pdf: 3093274 bytes, checksum: 2acee506e33894f1e208cf904c506a2e (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2009-12-12T13:27:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_JaquelineBarbosaDutra.pdf: 3093274 bytes, checksum: 2acee506e33894f1e208cf904c506a2e (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-12T13:27:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_JaquelineBarbosaDutra.pdf: 3093274 bytes, checksum: 2acee506e33894f1e208cf904c506a2e (MD5) Previous issue date: 2008-12 / Atualmente, o Brasil é o maior produtor mundial de maracujá-amarelo (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.). As podridões pós-colheita, principalmente a antracnose [Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc.], têm causado grandes perdas na produção desta cultura. Na maioria das vezes o controle dessa doença é realizado com fungicidas. Visando a redução do uso de agroquímicos no controle da antracnose em maracujazeiro, objetivou-se neste estudo avaliar o efeito da aplicação de fosfitos, hidrotermia e 1-metilciclopropeno (1-MCP), além da combinação destes métodos sobre a doença e qualidade dos frutos (perda de massa fresca, pH, sólidos solúveis totais e acidez titulável). O patógeno foi isolado de frutos com sintomas típicos de antracnose oriundos da Ceasa-DF, de onde também foram obtidos os frutos para a realização dos experimentos. Antes da aplicação dos tratamentos, em todos os experimentos, os frutos (estágio de 0% de desidratação e com a casca totalmente amarela) foram descontaminados em álcool 10% / 1 min, hipoclorito de sódio 10% / 2 min e água destilada esterilizada / 1 minuto. Os frutos foram marcados em quatro pontos eqüidistantes na região mediana e no centro de cada marcação realizou-se um ferimento (2mm). Posteriormente, os frutos foram inoculados (50μl de suspensão 106 conídios/ml) e mantidos em câmara úmida (incubador com iluminação diária de 12h; 25ºC / 72h). Em seguida, os tratamentos foram aplicados e os frutos mantidos em incubador (iluminação diária de 12h; 25ºC) durante cinco dias, avaliando-se diariamente o diâmetro das lesões. Ao final das avaliações, realizou-se análise físico-química dos frutos. Nos experimentos realizados com fosfitos utilizou-se inicialmente dez fosfitos nas doses recomendadas pelos fabricantes Fosfito Cu (25% P2O5 + 5% Cu – ‘Fitofós Cu’) - 2,5mL/L; Fosfito Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’) - 2,5mL/L; Fosfito K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’) 2,50mL/L; Fosfito Mg1 (30% P2O5 + 4% Mg – ‘Phytogard Mg’) 3,0mL/L; Fosfito Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) - 3,0mL/L; Fosfito Ca2 (10% P2O5 + 6% Ca – ‘Fitofós Ca’) - 4,0mL/L; Fosfito K2 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) 1,50mL/L; Fosfito Mg2 (40% P2O5 + 6% Mg – ‘Fitofós Mg’) - 1,5mL/L, Fosfito K3 (20% P2O5 + 20% K2O – ‘Nutex Premium 00-20- 20’) – 1,75mL/L; Fosfito K4 (30% P2O5 + 20% K2O – ‘Nutex Preminum 00-30-20’) – 1,75mL/L] e Carbendazim (‘Derosal’ - 1,0mL/L) imergindo-se os frutos em soluções com estes produtos (20 min). Frutos utilizados como testemunha receberam água destilada esterilizada por igual período. Quatro fosfitos [Mg2 (40% P2O5 + 6% Mg – ‘Fitofós Mg’), Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’), Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) e K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’)] foram utilizados em experimentos em frutos combinados com CaCl2 (2%) e em experimentos in vitro em diferentes doses (25, 50, 100 e 200%) do recomendado pelo fabricante (1,5, 2,5, 3,0 e 2,5mL/L, respectivamente). Finalizando os experimentos com fosfitos, dois dos mais comumente utilizados [fosfito de K (K2 - 40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) e Ca (Ca1 - 30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’] foram testados em frutos, em quatro doses diferentes (25, 50, 100 e 200%) do recomendado pelo fabricante (1,5 e 3,0mL/L, respectivamente). Nos experimentos com 1-MCP foram utilizadas diferentes doses (0, 50, 100, 200 e 300 nL/L) do gás por dois períodos de exposição (12 e 24h). Com tratamento hidrotérmico foram realizados experimentos variando-se a temperatura (43, 45, 47, 49, 51 e 53ºC por 5 min) e o tempo de exposição dos frutos (2, 3, 4, 5 e 6 min a 47ºC). Os resultados obtidos foram os seguintes: nos experimentos realizados com dez fosfitos diferentes em frutos, três deles reduziram a severidade da doença [Fosfito K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’), Fosfito K2 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) e Fosfito Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’)] . In vitro, todos os fosfitos em todas as doses testadas foram eficientes na redução do crescimento micelial e da produção de conídios de C. gloeosporioides, embora em frutos, associados ao CaCl2, os tratamentos com esses mesmos fosfitos não tenham sido estatisticamente diferentes da testemunha e do tratamento com fungicida no 1º experimento. No 2º experimento, os fosfitos Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) e K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’), em associação ao CaCl2, foram eficientes na redução da severidade da doença. O 1-MCP, nas doses e tempos de exposições testadas, não reduziu a antracnose em frutos de maracujazeiro. Nos experimentos com tratamento hidrotérmico, os melhores resultados foram alcançados pelos tratamentos com temperatura de 47 e 49ºC e com tempo de exposição dos frutos de 4 e 5 min. Em função desses resultados, os experimentos combinados foram realizados aplicando-se inicialmente o tratamento hidrotérmico (47 e 49ºC/ 4 e 5 min) e em seguida imergindose os frutos por 20 min em soluções com os fosfitos K2 (FK2) e Zn (FZn). No primeiro experimento, as combinações FK2 ou FZn/47ºC/5min e FZn/47º/4min reduziram significativamente a severidade da doença em relação à testemunha e ao tratamento com o fungicida. No segundo experimento, as combinações FK2/47ºC/4 ou 5 min, FZn/47ºC/4 ou 5 min e FZn/49ºC/5min reduziram significativamente a severidade da doença em relação à testemunha e ao tratamento com o fungicida, sendo essa redução mais acentuada nas combinações FZn/47ºC/4 ou 5 min. Nenhum dos tratamentos aplicados alterou significativamente as propriedades físico-químicas analisadas. _____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Currently, Brazil is the world's largest producer of passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.). The postharvest rots, mainly anthracnose [Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc.] cause losses of this culture. In most cases the control of the disease is accomplished through the use of fungicides, therefore is important to reduce the use of chemicals in the control of anthracnose in passion fruits by alternative methods. The objective of this study was to evaluate the effect of the application of phosphites, hot water treatment and 1-methylcyclopropene (1-MCP), and combinations of these methods on the disease intensity and on fruit quality (% of mass loss, pH, soluble solids and titratable acidity). The pathogen was isolated from a fruit with typical symptoms of anthracnose collected at CEASA-DF, where the fruits were also obtained to carry out the experiments. Before the implementation of treatments in all experiments, the fruit (stage of 0% of dehydration and the rind completely yellow) were decontaminated in 10% alcohol / 1 min, 10% sodium hypochlorite / 2 min and sterile distilled water / 1 min. The fruits were marked on four equidistant points in the median region and in the center of each mark an injury was made (2mm). Then, the fruits were inoculated (50μl of suspension 106 conidia / ml) and placed in humid chamber (incubators with lighting daily of 12h; 25ºC / 72h). The treatments were applied and the fruit stored in incubator (lighting daily of 12h; 25ºC) for five days, evaluating every day the diameter of lesions. At the end of the evaluations, it was carried out a chemical and physical analysis of the fruits. In experiments performed with phosphites was used initially ten phosphites at doses recommended by the manufacturers [Phosphite Cu (25% P2O5 + 5% Cu – ‘Fitofós Cu’) - 2,5mL/L; Phosphite Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’) - 2,5mL/L; Phosphite K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’) 2,5mL/L; Phosphite Mg1 (30% P2O5 + 4% Mg – ‘Phytogard Mg’) 3,0mL/L; Phosphite Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) - 3,0mL/L; Phosphite Ca2 (10% P2O5 + 6% Ca – ‘Fitofós Ca’) - 4,0mL/L; Phosphite K2 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) 1,5mL/L; Phosphite Mg2 (40% P2O5 + 6% Mg – ‘Fitofós Mg’) - 1,5mL/L, Phosphite K3 (20% P2O5 + 20% K2O – ‘Nutex Premium 00-20-20’) – 1,75mL/L; Phosphite K4 (30% P2O5 + 20% K2O – ‘Nutex Preminum 00-30-20’) – 1,75mL/L] and Carbendazim (‘Derosal’ - 1,0mL/L), immersing the fruits in solutions with these products (20 minutes). Fruit used as control received sterile distilled water for an equal period. Four phosphites [Mg2 (40% P2O5 + 6% Mg – ‘Fitofós Mg’), Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’), Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) e K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’)]were used in experiments in fruit combined with CaCl2 (2%) and in experiments in vitro at different doses (25, 50, 100 and 200%) of recommended by the manufacturer (1,5, 2,5, 3,0 e 2,5mL/L, respectively) . Finally the experiments with phosphites, two of the most commonly used (phosphite of K (K2 - 40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) and Ca (Ca1 - 30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) were tested on fruits, in four different doses (25, 50, 100 and 200%) of recommended by the manufacturer (1,5 e 3,0mL/L, respectively). In experiments with 1-MCP was used different doses (0, 50, 100, 200 and 300nL/L) of the gas through two periods of exposure (12 and 24h). With hydrothermal treatment experiments were carried out to varying temperature (43, 45, 47, 49, 51 and 53ºC for 5 min) and time of exposure of fruits (2, 3, 4, 5 and 6 min at 47ºC).The results obtained were as follows: in experiments conducted with 10 different phosphites in fruits, three of them reduced the severity of the disease [Phosphite K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’), Phosphite K2 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Fitofós K Plus’) e Phosphite Zn (40% P2O5 + 10% Zn – ‘Phytogard Zn’)]. In vitro, all phosphites at all doses tested were effective in reducing the mycelial growth and production of conidia of C.gloeosporioides, although in fruits, associated with CaCl2, the treatments with those phosphites were not statistically different from control and treatment with fungicide in the first experiment. In the second experiment, the phosphites Ca1 (30% P2O5 + 7% Ca – ‘Phytogard Ca’) e K1 (40% P2O5 + 20% K2O – ‘Phytogard K’), in combination with CaCl2, were effective in reducing the severity of the disease. The 1-MCP, in the doses and times of exhibitions tested, did not reduce anthracnose in the fruits of passion. In experiments with hydrothermal treatment, the best results were achieved by treatments with temperatures of 47 and 49ºC and with time the exposure of fruits of 4 and 5 minutes. Due to these results, the combined experiments were performed applying initially the hydrothermal treatment (47 and 49ºC / 4 and 5 min) and then immersing the fruits for 20 min in solutions with the phosphites K2 (FK2) and Zn (FZn). In the first experiment, the combinations FK2 or FZn/47ºC/5min and FZn/47ºC/4min reduced significantly the severity of the disease compared to the control and the treatment with a fungicide. In the second experiment, the combinations FK2/47ºC/4 or 5 minutes, FZn/47ºC/4 or 5 min and FZn/49ºC/5min reduced significantly the severity of the disease compared to the control and treatment with a fungicide, and this reduction was more accentuated in the combinations FZn/47ºC/4 or 5 minutes. None of the treatments changed significantly the fruit physical and chemical properties analyzed.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T06:14:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 296900.pdf: 1806723 bytes, checksum: 55ee991cfa12b5f4368db1ce2a180769 (MD5) / Fungos do gênero Pleurotus são reconhecidos por seu valor gastronômico, mas recentemente vêm recebendo especial atenção por suas propriedades terapêuticas, associadas à presença de polissacarídeos, em particular ß-D-glucanos, presentes na parede celular e no caldo de cultivo destes fungos. Portanto, este trabalho teve como objetivo estudar a produção de polissacarídeos extracelulares (EPS) por P. ostreatus e P. sajor-caju. A primeira espécie foi cultivada em biorreator em processo descontínuo com pulsos de glicose e semi-contínuo com cortes de 50 e 75 % do volume de meio de cultivo, utilizando um biorreator de 4 L. Quando a concentração de glicose no meio de cultivo atingiu 20 # 25 g L-1, nos cultivos conduzidos em processo descontínuo com pulsos de glicose, adicionou-se ao biorreator solução concentrada de glicose a fim de elevar a concentração para 30 g L-1; nos cultivos conduzidos em processo semi-contínuo, 50 ou 75 % do volume de meio de cultivo foi retirado do biorreator e igual volume foi adicionado de meio de cultivo fresco, contendo glicose em quantidade suficiente para que a concentração desta retornasse a 40 g L-1. P. sajor-caju foi cultivado em processo descontínuo simples variando-se as concentrações iniciais de (NH4)2SO4, extrato de levedura e peptona de soja do meio de cultivo POL (experimentos realizados em frascos agitados), o valor de pH (pH 3,0, pH 4,0 e sem controle), CaCO3 (com e sem adição de 1,0 g L-1) e concentração inicial de glicose (20 e 60 g L-1), utilizando biorreator de 4 L. Nos experimentos conduzidos em biorreator, valores de KLa de 15 h-1 e temperatura de 30 oC foram mantidos constantes. Nos experimentos conduzidos em processo descontínuo com pulsos de glicose, após 230 horas de cultivo obteve-se concentração máxima de EPS por P. ostreatus (0,8 g L-1), sendo a produtividade máxima igual a 3,5 mg L-1 h-1. Os experimentos conduzidos em processo semi-contínuo com corte de 50 % do volume de meio de cultivo, apresentaram menor produtividade em biomassa micelial (23,4 mg L-1 h-1) e maior produtividade em EPS (6,06 mg L-1 h-1) que os experimentos conduzidos com corte de 75 % (61,02 e 4,03 mg L-1 h-1, respectivamente). Utilizando-se concentrações iniciais de (NH4)2SO4, extrato de levedura e peptona de soja, iguais a 2,5, 1,0 e 1,0 g L-1, respectivamente, a concentração de EPS (0,60 g L-1) produzidos por P. sajor-caju aumentou 54 %. Quando ajustou-se o pH em 4,0 e adicionou-se CaCO3 (1,0 g L-1) ao meio de cultivo, obteve-se aumento de 20 % da concentração de EPS (0,72 g L-1). Concentração inicial de glicose de 60 g L-1 proporcionou aumento da concentração de EPS de 94,4 % ( 1,45 g L-1), porém a produtividade foi 42,2 % menor que a obtida utilizando-se concentração inicial de glicose de 20 g L-1. / Pleurotus genus is recognized for its gastronomic value, but in recent years it has received attention also for its therapeutic properties associated with polysaccharides, ß-D-glucan in particular, present in the cell wall and in the culture broth. Therefore, this work was focused on extracellular polysaccharide (EPS) production, using P. ostreatus and P. sajor-caju species. The former was cultivated in fed batch culture and semi-continuous process with 50 and 75 % medium replacements, using 4 L bioreactor. When glucose concentration attained 20 - 25 g L-1 in fed batch culture, bioreactor was fed with sufficient glucose solution to reach 30 g L-1 and when residual glucose concentration reached 20 - 25 g L-1 in semi-continuous culture, 50 or 75 % of the fermented broth was removed and replaced by fresh medium with sufficient glucose concentration to reach 40 g L-1. P. sajor-caju was cultivated in simple batch culture varying the (NH4)2SO4, yeast extract and soy peptone initial concentrations in POL medium (using shake flasks), pH medium value (3.0, 4.0 and without control), calcium carbonate (without and with addition of 1.0 g L-1) and initial glucose concentration ( 20 and 60 g L-1), using 4 L bioreactor. In bioreactor assays, initial KLa was set to 15 h-1 and temperature was kept constant at 30 .C. In fed batch culture, after about 230 hours of cultivation, maximum EPS concentration was obtained (0.8 g L-1) by P. ostreatus, with productivity being equal to 3.5 mg L-1 h-1. In semi-continuous culture, results obtained with 50 % medium replacement suggest a lower mean value of biomass productivity (23.4 mg L-1 h-1) and a higher mean value of EPS productivity ( 6.06 mg L-1 h-1) than those obtained with 75 % medium replacement (61.02 and 4.03 mg L-1 h-1, respectively). Using initial concentrations of (NH4)2SO4, yeast extract and soy peptone equal to 2.5, 1.0 and 1.0 g L-1, respectively, the EPS concentration (0.60 g L-1) was enhanced 54 % by P. sajor-caju. When the pH was adjusted to 4.0 and CaCO3 (1.0 g L-1) was added to the culture medium, it was possible to enhance the EPS concentration by 20 % (0.72 g L-1). The initial glucose concentration equal to 60 g L-1 enhanced the EPS concentration by 94.4 % (1.45 g L-1), but productivity was 42.2 % lower than that obtained using 20 g L-1 of initial glucose concentration.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:39:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 325121.pdf: 2972216 bytes, checksum: 82e8be926d73b184424833510aca1739 (MD5) Previous issue date: 2013 / Phylloporia é um gênero poliporoide pertencente à Hymenochaetaceae, que apresenta basidiomas ressupinados, efuso-reflexo à pileados e estipitados, com basidiósporos pequenos de parede espessa e levemente coloridos, bem como estratégia de vida principalmente parasítica. Compreende atualmente 24 espécies distribuídas principalmente em regiões Tropicais. Neste trabalho, uma revisão taxonômica deste gênero, enfatizando 15 espécies que ocorrem na região Neotropical, é apresentada em 4 capítulos: 1. revisão morfológica geral a partir de materiais tipo e de referência de 12 espécies do gênero; 2. revisão de Phylloporia pectinata e de alguns de seus sinônimos heterotípicos, onde Phylloporia subpectinata é resgatada e apresentada como nova combinação; 3. proposição de três novas espécies de Phylloporia coletadas no Sul do Brasil, P. clarice, P. elegans e P. nodostipitata; e 4. estudo ultraestrutural sobre a morfologia dos basidiósporos a partir de 15 espécies de Phylloporia.<br> / Abstract : Phylloporia is a poliporoid genus belonging to Hymenochaetaceae, which presents basidiomata resupinate, effused-reflexed to pileate and stipitate, with small, thick-walled and slightly colored basidiospores, and parasitic life strategy as well. Nowadays, encompasses 24 accepted species mainly distributed in Tropical regions. In this work, a taxonomic revision of this genus, enfasizing 15 species with occurrence in the Neotropical region, is presented in 4 chapters: 1. a general morphologic revision of type and reference materials of 12 species; 2. a revision of Phylloporia pectinata and some of its taxonomic heterotypic synonyms, where Phylloporia subpectinata is presented as new combination; 3. the proposition of three new species of Phylloporia collected in South Brazil, P. clarice, P. elegans e P. nodostipitata; and 4. a ultrastructural study of the basidiospores morphology using the 15 species of Phylloporia.

Para melhor compreender o papel dos micro-organismos nas doenças da cavidade bucal, é necessário inicialmente avaliar a diversidade microbiana naturalmente existente em indivíduos saudáveis, além de sua distribuição espacial na cavidade bucal. Muitos estudos são conduzidos elucidando o papel do biofilme e das bactérias na saúde bucal, porém poucas pesquisas focaram na atuação das leveduras. Neste sentido, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a diversidade e distribuição de leveduras do gênero Candida na microbiota bucal de indivíduos saudáveis. Foram coletadas amostras da boca pacientes adultos saudáveis. Foram obtidas amostras de 9 diferentes habitats da boca: bochechas direita e esquerda, assoalho da boca, palato, língua dorsal, língua ventral, dente molar, vestíbulo labial e saliva. Foram avaliados 100 pacientes com uma média de 28 dentes. Quarenta e nove indivíduos apresentaram leveduras na sua microbiota bucal. Candida albicans foi o micro-organismo mais prevalente (49%), seguido de Candida krusei, Candida parapsilosis, Meyerozyma guilliermondii (C. guilliermondii), Candida glabrata, Candida tropicalis e Candida dubliniensis. A associação das leveduras encontradas e os habitats bucais sugeriu que comunidades leveduriformes podem distinguir-se entre os diferentes tecidos da cavidade bucal. A língua (dorsal e ventral) apresentou colonização específica, caracterizada pelas espécies C. tropicalis e C. dubliniensis. De forma semelhante, a microbiota dos habitats revestidos por mucosa foi análoga. A microbiota da língua e dos tecidos duros assemelhou-se entre si em menor intensidade. Estes resultados introduzem a dimensão espacial desta diversidade microbiana que vem sendo estudada, complementando as informações obtidas nos estudos do microbioma humano. / To better understand the role of microorganisms in the diseases of the oral cavity, first it is necessary to evaluate the natural microbial diversity in healthy individuals, as well as their spatial distribution in the oral cavity. Many studies are conducted elucidating the role of biofilms and bacteria in oral health, but few research has focused on the yeast’s performance. In this sense, the objective of this study was to evaluate the diversity and distribution of Candida species in the oral microbiota of healthy individuals. Samples were colleted from the mouth of healthy adults. Samples of 9 different mouth habitats were obtained: right and left cheeks, floor of the mouth, palate, dorsal tongue, ventral tongue, molar tooth, labial vestibule and saliva. We evaluated 100 patients with an average of 28 teeth. Forty-nine subjects had yeasts in their oral microbiota. Candida albicans was the most prevalent microorganism (49%), followed by Candida krusei, Candida parapsilosis, Meyerozyma guilliermondii (C. guilliermondii), Candida glabrata, Candida tropicalis and Candida dubliniensis. The association found between the yeasts and oral habitats suggested that communities can be distinguished by the different tissues of the oral cavity. The tongue (dorsal and ventral) presented specific colonization, characterized by the species C. tropicalis, and C. dubliniensis. Similarly, the microbiota of the mucous habitats was similar. The microbiota of the tongue and hard tissue resembled each other in a lesser degree. These results introduce the spatial dimension of the microbial diversity that has been studied, complementing the information obtained in the human microbiome research.

CIPRIANO, A. K. A. L. A interação do cajueiro (Anacardium occidentale L.) com o fungo Lasiodiplodia theobromae reprograma a expressão de proteínas no caule, sítio de infecção do patógeno. 2014. 136 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2015-01-22T18:58:40Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_akalcipriano.pdf: 2753055 bytes, checksum: 892bde62cddf05cebf6ae0b3a737c969 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2016-01-06T19:27:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_akalcipriano.pdf: 2753055 bytes, checksum: 892bde62cddf05cebf6ae0b3a737c969 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T19:27:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_akalcipriano.pdf: 2753055 bytes, checksum: 892bde62cddf05cebf6ae0b3a737c969 (MD5) Previous issue date: 2014 / No Brasil, a indústria do caju é uma das principais fontes de renda e trabalho no campo e representa a maior parcela da economia na região nordeste, que concentra 94% da produção, destacando-se os estados do Ceará, Piauí e Rio Grande do Norte, respectivamente. Neste contexto, para otimizar o setor produtivo, estratégias de melhoramento genético de cultivares têm focado na seleção e desenvolvimento de clones anãos. Entretanto, essa prática tem contribuído para diminuição da variabilidade genética e, consequentemente, para maior vulnerabilidade ao ataque de patógenos. A resinose, causada pelo fungo Lasiodiplodia theobromae (Pat.) Griff & Maubl. é considerada a principal doença do cajueiro nas condições semiáridas. Métodos eficientes de controle da doença ainda não foram estabelecidos. Baseado na ausência de dados publicados com relação às respostas bioquímicas e fisiológicas do cajueiro infectado com L. theobromae, associado ao fato de que as plantas, para se defenderem do ataque de patógenos, acionam/alteram vias metabólicas controladas por diversas proteínas, o estudo da identidade dessas proteínas fornecem informações sobre os mecanismos relacionados à interação de compatibilidade/incompatibilidade entre o cajueiro e L. theobromae. Dessa forma, nesse estudo, foi realizada análise proteômica diferencial de caules de cajueiro (Anacardium occidentale), clone BRS 226 (resistente), mantido em condições controladas, em tempos iniciais pós-infecção com o L. theobromae, assim como, de plantas de cajueiro resultantes da polinização aberta do BRS 226, classificadas como resistentes e suscetíveis à resinose, em condições de campo, onde há alta pressão do patógeno. Proteínas diferencialmente expressas foram identificadas por eletroforese bidimensional (2D-PAGE) combinada com espectrometria de massas ESI-Q-TOF MS/MS. Plantas de cajueiro infectadas com L. theobromae acionam respostas fisiológicas associadas à reprogramação da expressão de um total de 73 proteínas, nos cenários investigados. Destas, 36 foram identificadas no clone BRS 226, artificialmente inoculado, e 37 nas plantas de cajueiro, cultivadas em condições de campo. Portanto, um número equivalente de proteínas é responsivo dentro dos cenários analisados e compartilham funções celulares em rotas metabólicas e de produção de energia, estresse/defesa, sinalização celular e enovelamento/metabolismo de proteínas. Proteínas responsivas a hormônios e envolvidas com estrutura celular foram diferencialmente expressas somente em plantas crescidas em condição de campo, enquanto proteínas de transporte foram reprogramadas no clone BRS 226. Plantas de cajueiro, cultivadas em campo, e inoculadas do clone BRS 226 compartilharam a expressão reprogramada de 6 proteínas idênticas, dentre as quais, proteínas 14-3-3 e anexinas, envolvidas com a sinalização celular, foram influenciadas ao mesmo tempo, aparentemente, pelos estresses abiótico e biótico. A reprogramação de funções celulares comuns somado a alteração na expressão de 6 proteínas idênticas, nas condições estudadas, mostrou sobreposição de respostas, que parece ser indicativo da infecção pelo L. theobromae no tecido caulinar. Essas observações revelam proteínas que são alvos dos mecanismos celulares acionados em plantas de cajueiro desafiadas com L. theobromae e constituem uma base inicial de resultados que podem ser, futuramente, integrados a programas de melhoramento genético do cajueiro, visando resistência, particularmente, à resinose.

Os oceanos constituem 71% da superfície da Terra e muitos microrganismos que provém deste ambiente podem secretar enzimas de alto interesse biotecnológico. As enzimas produzidas por microrganismos marinhos podem ser mais estáveis, devido à alta complexidade deste ambiente. Por este motivo, objetivou-se isolar e identificar os fungos presentes no sedimento marinho e verificar a atividade enzimática da amilase, celulase, lípase e protease dos mesmos em diferentes temperaturas (15°C, 20°C, 25°C e 30°C). As amostras de sedimento foram coletadas com auxilio de seringas estéreis à 10 metros de profundidade, e transportadas até o laboratório em caixas isotérmicas. Após o crescimento, fragmentos de micélio foram repicados no centro de placa de petri para isolamento das amostras. Diferentes substratos foram utilizados para avaliar a atividade da amilase, celulase, lipase e protease dos isolados. A capacidade de hidrolisar os substratos foi verificada em diferentes temperaturas (15°C, 20°C, 25°C e 30°C). Foram isoladas 22 cepas fúngicas, de 14 diferentes espécies, pertencentes a nove gêneros, dentre eles Helicosporium, Helicomyces, Paecilomyces, Phoma, Chaetomium, Geotrichum, duas espécies de Cladosporium sp., Aspergillus sp., Penicillium sp., Penicillium chrysogenum e Penicillium aurantiogriseum. O maior índice de positividade enzimática ocorreu na temperatura de 25°C, na qual 71% dos isolados hidrolisaram o substrato lipídico, seguido de protease com 50%, celulase 43% e amilase 36%. Todos os isolados produziram no mínimo um tipo de enzima, nas temperaturas testadas, ficando evidente a que o ambiente marinho é para descoberta de novas enzimas. / Oceans constitute 71% of the Earth's surface, and many microorganisms from this environment may secrete enzymes of high biotechnological interest. Enzymes produced by marine microorganisms might be more stable due to the great complexity of this environment. Therefore, we aimed at isolating and identifying the fungi present in marine sediment and at verifying the corresponding enzymatic activities of amylase, cellulase, lipase, and protease. Sediment samples were collected with sterile syringes at a depth of 10 meters and transported to the laboratory in cool boxes. After their growth, mycelial fragments were sub-cultured and inoculated in the center of Petri dishes for isolating the samples. Different substrates were used to evaluate the activity of amylase, cellulase, lipase and protease. The ability to hydrolyse the substrates was observed at different temperatures (15°C, 20°C, 25°C e 30°C).Twenty-two fungal strains were isolated from 14 different species belonging to nine genera, including Helicosporium, Helicomyces, Paecilomyces, Phoma, Chaetomium, Geotrichum, two different types of Cladosporium sp., Aspergillus sp., Penicillium sp., Penicillium chrysogenum, and Penicillium aurantiogriseum. The highest enzymatic production rate was found for lipase, produced by 71% of the isolated fungi, followed by protease (50%), cellulase (43%), and amylase (36%). All isolates produced at least one type of enzyme, evidencing that the sea is a environment for discovering new enzymes.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:42:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341667.pdf: 1775014 bytes, checksum: 4ef056cf0336ba5a482332d500d3acea (MD5) Previous issue date: 2016 / Polyporus dictyopus é um táxon com ampla variação morfológica caracterizada principalmente por apresentar basidiomas estipitados, com uma cutícula negra no estipe, a superfície do píleo vinácea, castanho a castanho amarelada, himenóforo poroide, sistema hifal dimítico, com hifas esqueleto-ligadoras e basidiósporos cilíndricos a elipsoides, hialinos de parede fina e lisa. Polyporus dictyopus é causador de podridão branca, apresenta uma distribução pantropical e reune pelo menos 16 sinônimos heterotípicos, propostos a partir de materiais coletados na América. Revisões taxonômicas de P. dictyopus, a partir de estudos morfológicos, já foram realizadas. No entanto, a hipótese de que este táxon represente um complexo de espécies filogenéticas delimitadas ainda não foi testada. Este trabalho apresenta análises macro e micromorfológicas detalhadas, assim como filogenéticas moleculares de materiais previamente identificados como P. dictyopus. Ao todo, foram revisados 45 espécimes, incluindo os tipos de alguns sinônimos. Foram obtidas 62 sequências (ITS, LSU e RPB2), sendo 32 de materiais do complexo P. dictyopus, e 30 de táxons relacionados. Os resultados das análises filogenéticas revelam que as amostras identificadas como P. dictyopus constituem dois clados independentes, correspondentes aos gêneros aqui tratados taxonomicamente: Atroporus e Neodictyopus gen. nov. ad int. Além disso, Neodictyopus atlanticus sp. nov. ad int., N. gugliottae sp. nov. ad int., N. dictyopus comb. nov. ad int., e A. rufoatratus comb. nov. ad int. são apresentados. Descrições detalhadas, ilustrações e uma chave são apresentadas para as espécies de Atroporus e Neodictyopus. Considerando os resultados obtidos nesse estudo, fica claro que reavaliações de outros grupos morfológicos e de complexos de espécies tradicionalmente tratados em Polyporus são necessárias para uma classificação menos artificial, inclusive do próprio gênero.<br> / Abstract : Polyporus dictyopus is a taxon with a wide morphological variation, characterized by stipitate basidiomata, with a black cuticle on the stipe, a vinaceous, brown to yellowish brown pilear surface, poroid hymenophore, dimitic hyphal system, with skeletal-binding hyphae, cylindrical to ellipsoid, hyaline, thin-walled and smooth basidiospores. Polyporus dictyopus causes white root, presents pantropical distribution and at least sixteen heterotypic synonyms were described based on samples from America. Taxonomic revisions of P. dictyopus from morphological studies have already been carried out. However, the hypothesis that this taxon is a complex of phylogenetic species has not been tested yet. This study presents detailed macro- and micro-morphological analysis and phylogenetic analysis with specimens previously identified as P. dictyopus. Around 45 specimens, including some types specimens, were examined. About 62 sequences (ITS, LSU, and RPB2) were achiev9ed, 32 of P. dictyopus complex, and 30 of related taxa. The results of the phylogenetic analysis revealed that specimens identified as P. dictyopus constitute two independent clades, corresponding to the genera here examined taxonomically: Atroporus and Neodictyopus gen. nov. ad int. Furthermore, Neodictyopus atlanticus sp. nov. ad int., N. gugliottae sp. nov. ad int., N. dictyopus comb. nov. ad int., and A. rufoatratus comb. nov. ad int. are presented. Detailed descriptions, illustrations and a key are prrovided for Atroporus and Neodictyopus species. Considering the results obtained in this study it is clear that revisions of other morphological groups and species complexes traditionally treated in Polyporus are needed for a more natural classification, even the genre itself.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:33:54Z : No. of bitstreams: 1 pereira_fd_me_jabo.pdf: 415622 bytes, checksum: 3ed753ebff04eb379e6987cc2a0756c8 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A citricultura brasileira representa um importante segmento econômico na pauta de produtos agrícolas, não só por seu expressivo valor de produção, como por sua importância na geração de empregos diretos e indiretos. No mundo, o Brasil destaca-se como maior produtor de citros, e exportador de suco concentrado de laranja. Entretanto, a citricultura ressente-se de problemas complexos, de natureza diversa, com particular destaque para o de ordem fitossanitária. Dentre esses problemas destaca-se a Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa. A doença deprecia os frutos para o mercado in natura e restringe a possibilidade de exportação. Além disso, provoca a queda prematura dos frutos e eleva o custo de produção devido à necessidade de controle. O presente trabalho teve o objetivo de estabelecer relações filogenéticas entre Citrus spp. e Guignardia spp., entender a origem evolutiva do patossistema Citrus – G. citricarpa, bem como avaliar a ocorrência de G. citricarpa como patógeno em momentos distintos na história evolutiva de Citrus. Os dados filogenéticos foram gerados utilizando-se marcadores moleculares do tipo AFLP e sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, em ambos os gêneros. As análises filogenéticas foram realizadas no programa PAUP* v.4.0b10. Os resultados das análises filogenéticas utilizando AFLP foram mais informativos que aqueles gerados com base no sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, tanto para Citrus quanto para Guignardia. As análises de AFLP permitem concluir que G. citricarpa e G. mangiferae, isoladas de C. medica, apresentam maior distância filogenética em relação aos isolados das outras espécies cítricas. A evolução do patossistema Citrus/Guignardia não pôde ser estabelecida, de forma geral, por meio da associação das filogenias... / The Brazilian citriculture represents an important economic sector in the agenda of agricultural products, not only for its impressive production value, for its importance in generating direct and indirect jobs. In the world, Brazil stands out as the largest citrus producer and exporter of concentrated orange juice. However, the citriculture suffers from complex problems of diverse nature, with particular emphasis on plant health. Among these problems highlight the Black Spot of Citrus (BSC), caused by the fungus Guignardia citricarpa. The disease depreciates the fruit for the fresh market and restricts the ability to export. Furthermore, causes the fall premature fruit and raises the cost of production due to need for control. This study aimed to establish phylogenetic relationships between Citrus and Guignardia, understanding the evolutionary origin of pathosystem Citrus - G. citricarpa, and to evaluate the occurrence of G. citricarpa pathogen at different period in evolutionary history of Citrus. The phylogenetic data were generate for both genera using AFLP molecular markers and ITS1-5.8S-ITS2 sequencing . Phylogenetic analysis were performed in the PAUP * v.4.0b10 program. The phylogenetic analysis using AFLP were more informative than ITS1-5.8S-ITS2 sequencing in both genera Citrus and Guignardia. The AFLP analysis conclude that G. citricarpa and G. mangiferae isolated from C. medica presents a larger phylogenetic distance if compared to the other citrus spp. strains. The evolution of the pathosystem Citrus/Guignardia could not be established, in general, through the association of phylogenies generated for Citrus spp. and Guignardia spp. except in the particular case of bo isolated from C. medica, which follow a pattern of associations in pathogen/endophyte

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-28Bitstream added on 2014-11-10T11:58:42Z : No. of bitstreams: 1 000789693.pdf: 3140266 bytes, checksum: 8020e0cbe99572a2e4a68115eacf1d3e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Lipases são hidrolases (triacilglicerol acil hidrolases, EC 3.1.1.3) capazes de hidrolisar ésteres carboxílicos de cadeia longa liberando monoacilgliceróis, diacilgliceróis, ácidos graxos e glicerol. Em adição, as lipases são eficientes em reações de síntese como esterificação, glicerólise, aminólise e transesterificação, essa capacidade relacionada ao deslocamento do equilíbrio da reação no sentido de hidrólise ou síntese dependendo da concentração de água presente no meio, característica que as tornam biocatalizadores muito versáteis, com importantes aplicações biotecnológicas, como em indústrias de alimentos, detergentes, farmacêutica, couro, têxtil, cosméticos e papel. O presente trabalho objetivou identificar as seis espécies de fungos lipolíticos, otimizar a produção dessa enzima pela linhagem selecionada, bem como purificar e caracterizar parcialmente a lipase produzida em condição otimizada. A atividade lipase foi determinada após cultivos submersos, objetivando o aumento da produção da enzima. Os fatores avaliados no processo de otimização da produção de lipase foram: meios minerais, tempo de cultivo, fontes de carbono e nitrogênio e suas concentrações, pH e inóculo. A avaliação das melhores condições de cultivo foi realizada pela atividade lipase, determinada pelo íon ρ-nitrofenol (pNP) liberado na hidrólise do substrato sintético ρ-nitrofenil palmitato a 37 °C. O uso de marcadores moleculares permitiu identificar os seis fungos lipolíticos até espécie, exceto para a linhagem Fusarium sp. CBMAI 1227. A metodologia de triagem dos fungos para produção de lipase em meio neutro permitiu a seleção do isolado Trichodemra harzianum CBMAI 1229 como melhor produtor. A melhor condição para produção de lipase (231,58 ± 35,59 U mL-1) foi alcançada após 120 horas de cultivo a 25 °C e 150 rpm de agitação utilizando meio mineral Olson e Johnson (1948), suplementado com óleo... / Lipases are hydrolases (triacylglycerol acylhydrolases EC 3.1.1.3) capable of hydrolyzing carboxyl esters of long-chain acylglycerol release mono- or diacyglycerol, free glycerol and fatty acid. In addition, the lipases are effective for synthesis reactions such as esterification, glycerolysis, transesterification and aminolysis, this capability related to the displacement of the equilibrium of the reaction towards synthesis or hydrolysis inherent in the concentration of water present in the medium, the characteristic that makes biocatalysts very versatile, with important biotechnological applications. Such as food, detergents, pharmaceutical, textile, leather, paper and cosmetics industries. This work aimed to identify six species of fungi that produce lipase, optimize the production of this enzyme by lineage selected and purify and characterize partially the lipase produced in optimal condition. Enzyme activity was determined after submerged cultures, aiming to increase enzyme production. The factors measured in this optimization process of lipase production were: mineral components, time of cultivation, source of carbon and nitrogen and their concentration, pH and inoculum. The use of molecular markers allowed us to identify the six lipolytic fungi until species, except for strain Fusarium sp. CBMAI 1227. The methodology of screening of fungi for the production of lipase in neutral medium allowed the selection of the isolated Trichodemra harzianum CBMAI 1229 as best producer. The evaluation of improved cultivation conditions was assayed by lipase activity, determined through hydrolysis releasing íon ρ-nitrofenol (pNP) of ρ-nitrophenyl-palmitate (pNPP) as substrate synthetic at 37 °C. The best condition for lipase production (231,58 ± 35,59 U mL-1) was reached after 120 hours of cultivation, 25 °C and 150 rpm in medium mineral Olson & Johnson (1948), suplemented with sunflower oil 3,0% (v/v), peptone 2,0% (w/v), yeast extract 0,2%...