Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-15T17:53:16Z No. of bitstreams: 2 Adam Souza de Alencar Leão.pdf: 2611223 bytes, checksum: cd2daf2bf8565d02d484dba67f31b189 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-15T17:53:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Adam Souza de Alencar Leão.pdf: 2611223 bytes, checksum: cd2daf2bf8565d02d484dba67f31b189 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-08-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pirarucu (Arapaima gigas) is one of the largest freshwater fishes of the world; it can grow to up to 3 meters, and weight up to 200 kg. It is an economically important fish used as a traditional food source in the Amazon basin. It has suffered a long history of commercial exploitation, which has resulted in various populations with critically low levels of genetic variability. The current work is a population genetic study of this specie with the goal of estimating levels of genetic variability for the principal tributaries of the Amazon River, comparing them to those observed in the main channel of the Amazon River, analyzing if there has been a reduction of genetic diversity in the analyzed localities, and if Arapaima gigas is a genetically structured species. With this goal in mind, 11 microsatellite markers were used due to their high levels of polymorphism and those are sufficiently informative for this type of a study. Average heterozygosity calculated across all loci for each sampling locality varied from 0.32 in Araguaia River to 0.70 in Mamirauá. Considering only localities from the main channel of the Amazon River, observed heterozygosity was 0.45 in Iquitos and 0.70 in Mamirauá. Observed heterozygosities in the tributaries of the Amazon River ranged from 0.32 in the Araguaia River to 0.62 in the Tapajós River. The ANOVA results showed a heterogeneous pattern in the distribution of genetic diversity in Arapaima gigas among all sampled localities, and between localities from the main stream of the Amazon River and its tributaries. On average, however, higher average heterozygosities were observed in the main stream Amazon River compared with tributaries. This pattern could be explained by the main stream Amazon River may be a zone of contact for Arapaima from different regions which could be facilitated by the ebb and flow of várzea waters. AMOVA demonstrated that 76.46% of genetic variance is explained by within individual contrasts, while 20.28% is explained by among locality contrasts. The among locality contrast is consistent with low migration rates of this species. A Bayesian analysis shows that there is population structuring in the form of a gradient along the length of the Amazon basin; this analysis also shows that tributaries do not contain genetically differentiated populations with respect to the main stream of the Amazon River. The observed genetic structuring of Arapaima gigas allows us to divide the Amazon basin in three macro-regions that should be differentially managed due to their genetic particularities; these regions are western Amazon comprising the localities of Iquitos, Letícia, Eirunepé, Mamirauá, Tapauá, Lábrea, Manuel Urbano e Borba; central Amazon comprising the localities of Carauarí, Coarí, RDS Piagaçu-Purus, Manacapuru, Careiro da Várzea, Nhamundá, Santarém (São Miguel Island) and Jacaréacanga; and eastern Amazon and the Araguaia/Tocanins basin comprising the localities of Macapá, Mexiana, Marabá and Bananal Island (Araguaia River). However, the spatial autocorrelation analysis shows that across the length of its distribution, this species is connected by gene flow. We observed a signature of recent population reduction using the M value test in 11 localities of the 20 localities sampled for this study. The most drastic reductions were observed for samples collected in Mexiana Island and in the Araguaia River (Bananal Island). These results should be viewed as an important signal of genetic fragility of Arapaima gigas individuals from these localities. Based on the presented data, it is strongly recommended that one implements a differentiated management and conservation strategy for this species for the three macro-geographic regions of the Amazon basin identified through the genetic particularities of Arapaima gigas in each of these three regions. / O pirarucu (Arapaima gigas) é um dos maiores peixes de água doce do mundo, podendo crescer até 3 metros de comprimento e pesar até 200 quilos. É um peixe de grande importância econômica usado como fonte de alimento pela população tradicional na bacia Amazônica. É marcado por uma longa história de exploração comercial, o que reduziu a variabilidade genética de muitos grupos de indivíduos desta espécie. O presente trabalho reporta um estudo de genética de populações para o Arapaima gigas objetivando estimar níveis de variabilidade genética de espécimes coletados em 20 localidades ao longo da bacia Amazônica e Tocantins/Araguaia, investigar se há existência de estrutura genética e verificar se houve redução populacional. Para isso foram utilizados 11 marcadores microssatélites que devido ao seu elevado polimorfismo atendem às necessidades deste estudo. A heterozigosidade média observada sobre todos os locos para cada localidade amostrada variou de 0,32 para os espécimes coletados no rio Araguaia a 0,70 para para os espécimes coletados em Mamirauá. Considerando apenas localidades da calha principal do rio Amazonas, a heterozigosidade observada foi de 0,45 em Iquitos a 0,70 em Mamirauá. Enquanto que para os tributários da bacia Amazônica amostrados foi verificado 0,32 no rio Araguaia a 0,62, no rio Tapajós. Os resultados da análise de ANOVA, utilizada para testar se há diferenças significativas na distribuição da heterozigosidade observada em relação às localidades amostradas e em relação às amostras coletadas na calha e nos principais tributários da bacia Amazônica, mostraram um padrão heterogêneo na distribuição da variabilidade genética para a referida espécie, sendo que altos e baixos valores são distribuídos de maneira não uniforme entre as localidades amostradas para o presente estudo e foi encontrado um maior valor de variabilidade genética para as amostras coletadas na calha do que nos tributários amostrados. O fato de haver maior variabilidade genética nos indivíduos coletados na calha pode ser devido ao fato de a calha funcionar como um ponto de encontro de Arapaimas de várias localidades, com deslocamento favorecido pelas transgressões e introgressões das águas de várzea. Os resultados de AMOVA demonstram que os grupos analisados no presente estudo encontram-se moderadamente estruturados. Resultado condizente com os hábitos de baixa migração da referida espécie. Os resultados da análise Bayesiana mostram que há estrutura populacional na forma de gradiente ao longo da bacia amazônica, esses resultados também mostram que os rios tributários não comportam populações geneticamente diferenciadas em relação à calha principal. A estruturação genética encontrada para a espécie Arapaima gigas nos permite dividir a bacia Amazônica em três macroregiões que devem ser manejadas de maneira diferenciada devido às suas particularidades genéticas, essas regiões são Amazônia ocidental compreendendo as localidades Iquitos, Letícia, Eirunepé, Mamirauá, Tapauá, Lábrea, Manuel Urbano e Borba; Amazônia central compreendendo as localidades Carauarí, Coarí, RDS Piagaçu- Purus, Manacapuru, Careiro da Várzea, Nhamundá, Santarém (Ilha de São Miguel) e Jacaréacanga; e Amazônia oriental e bacia do Araguaia / Tocantins compreendendo as localidades de Macapá, Mexiana, Marabá e Ilha do Bananal (rio Araguaia). O teste de auto- correlação espacial mostrou que entre toda a amostragem deste estudo há fluxo gênico para a espécie Arapaima gigas. Foi observada redução populacional recente significativa através do teste de Mvalue para 11 das 20 localidades amostradas, sendo que reduções mais drásticas foram observadas para as amostras da Ilha de Mexiana na foz do rio Amazonas e Ilha do Bananal, no rio Araguaia. Esses resultados devem ser vistos como um aviso importante sobre a fragilidade genética dos grupos de Arapaima gigas dessas localidades. Desta forma, com base nos dados apresentados, é fortemente aconselhável que sejam implementados programas de manejo e conservação desta espécie de maneira diferenciada nas três macroregiões da bacia Amazônica, levando em conta as particularidades genéticas da espécie em cada região.

Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Fernando F. Mendonça / Banca: Diego Teruo Hashimoto / Banca: Paulino Martinez Portella / Resumo: Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a ... / Abstract: Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark's fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-30Bitstream added on 2014-08-13T18:01:11Z : No. of bitstreams: 1 000736106.pdf: 1310930 bytes, checksum: 28ecc16bb9798a305ffacdd9b95396fe (MD5) / O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é uma região do genoma com um denso agrupamento de genes que apresentam alto grau de polimorfismo. Os genes do MHC estão divididos em regiões que apresentam similaridades funcionais, contendo genes da classe I, II e III, sendo que em bovídeos a classe II é subdividida em dois agrupamentos denominados IIa e IIb. Genes da classe II do MHC têm chamado muito a atenção, se tratando de animais de produção, diante da necessidade de melhorar métodos de controle de doenças, por meio do desenvolvimento de novas vacinas e seleção de animais resistentes. Desta forma, o presente trabalho visou à realização de um estudo da diversidade alélica do gene DRB3 em três raças de búfalo de rio criadas no Brasil (Mediterrâneo, Jafarabadi e Murrah) utilizando a técnica de PCR-RFLP. As amostras de DNA foram extraídas de bulbo folicular de 24 animais da raça Mediterrâneo, 23 animais da raça Jafarabadi e 18 animais da raça Murrah. As reações de PCR foram realizadas com volume total de 30 μl e o produto de PCR obtido foi digerido com três enzimas de restrição: RsaI, HaeIII e PstI. Os pares de iniciadores de PCR produziram produto de PCR de aproximadamente 300 bp de tamanho. A digestão com a enzima de restrição RsaI apresentou oito alelos, com tamanhos aproximados: O (300 bp), RsaI-A (230+70 bp), RsaI-B (180+120 bp), RsaI-C (130+90+70 bp), RsaI-D (140+90+70 bp), RsaI-E (120+70+60 bp), RsaI-F (120+110+70 bp) e RsaI-G (110+70+60+55 bp), sendo cinco alelos (O, RsaI-A, RsaI-B, RsaI-C, RsaI-E) na raça Mediterrâneo, quatro alelos (O, RsaI-A, RsaI-F e RsaI-G) na raça Jafarabadi e três alelos (O, RsaI-A e RsaI-D) na raça Murrah. Em todos os produtos de PCR, das três raças, o genótipo homozigoto para o alelo O foi o mais frequente (300bp/300bp). Com a enzima de restrição HaeIII foram observados quatro alelos, com tamanhos aproximados ... / The Major Histocompatibility Complex (MHC) is a genome region with have a dense clusters of genes that showing a high degree of polymorphism. The genes of the MHC are divided in regions that show similar functions, and contain genes of the classe I, II and III. The class II, in bovides is subdivided in two clusters called IIa and IIb. Much attention has been given to class II genes, especially to the livestock, because the production animal has a need of more efficient methods to control diseases through the development of vaccines and selection of resistant animals. Therefore, the present work aimed study the allelic diversity of the DRB3 gene in three breeds of river buffaloes raised in Brazil (Mediterranean, Jafarabadi and Murrah) by PCR-RFLP. DNA samples were extracted from follicle bulb of 24 Mediterranean, 23 Jafarabadi and 18 Murrah buffaloes breeds. The PCR reactions have 30 μl of volume and the PCR product was digested with three restriction enzymes: RsaI, HaeIII and PstI. The primers pairs produced a PCR product with 300 bp size proximally. Digestion with the restriction enzyme RsaI presented eight alleles, with proximally sizes: O (300 bp), RsaI-A (230+70 bp), RsaI-B (180+120 bp), RsaI-C (130+90+70 bp), RsaI-D (140+90+70 bp), RsaI-E (120+70+60 bp), RsaI-F (120+110+70 bp) and RsaI-G (110+70+60+55 bp), and were five alleles (O, RsaI-A, RsaI-B, RsaI-C and RsaI-E) in the Mediterranean breed, four alleles (O, RsaI-A, RsaI-F and RsaI-G) in the Jafarabadi breed and three alleles (O, RsaIA and RsaI-D) in the Murrah breed. In all of the PCR products, of the three breeds, the homozygote genotype for the allele O was the most frequent (300bp/300bp). Digestion with the HaeIII restriction enzyme produced four alleles, with proximally sizes: HaeIII-A (220+80 bp), HaeIII-B (170+80+50 bp), HaeIII-C (210+80 bp) and HaeIII-D (170+130 bp), where the Mediterranean breed presented the four alleles ...

Orientador: Vítor Fernandes Oliveira de Miranda / Banca: Fábio Pinheiro / Banca: Alessandro de Mello Varani / Banca: Maurício Bacci Junior / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Resumo: Utricularia foliosa e U. gibba são espécies pertencentes à seção Utricularia e apresentam ampla distribuição e variabilidade morfológica. A ocorrência das duas espécies no Brasil e Cuba, a grande distância geográfica entre as regiões, assim como, as diversas barreiras e eventos demográficos ocorridos na região Neotropical podem ter desencadeado processos evolutivos nas espécies que poderiam ser elucidados mediante estudos genéticos de dinâmica populacional. Além destes estudos, trabalhos polínicos também constituem uma importante ferramenta para estabelecer diferenças entre espécies. Partindo destas considerações, o presente estudo teve como objetivos analisar a diversidade genética de populações de U. foliosa e U. gibba do Brasil e Cuba utilizando caracteres moleculares para posteriormente estabelecer relações entre as áreas de distribuição assim como inferir padrões demográficos e filogeográficos para ajudar compreender a história evolutiva de cada espécie. Além disso, caracterizar a morfologia polínica dos táxons de Lentibulariaceae que ocorrem na região ocidental de Cuba. Os resultados mostraram que U. foliosa possui altas taxas de diversidade genética, o que poderia estar condicionado pelo fluxo genético entre populações. As duas espécies mostraram compartilhamento de haplótipos entre as populações e as áreas geográficas (Brasil-Cuba), o que pode estar condicionado por recentes processos de dispersão influenciados pelo habitat aquático onde ocorrem. Por outro lado, a mor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Utricularia foliosa and U. gibba are species that belong to the section Utricularia and present a wide distribution and morphological variability. The occurrence of the two species in Brazil and Cuba, the geographic distance between the regions, as well as the different barriers and demographic events occurred in the Neotropical region may have caused evolutionary processes in the species that could be elucidated by genetic studies of population dynamics. Besides these studies, pollen analysis also constitutes a important tool to establish differences between these species. Based on these considerations, the present study aimed to analyze the genetic diversity of U. foliosa and U. gibba populations present in Brazil and Cuba using molecular characters to later establish relationships between the distribution areas as well as to infer demographic and phylogeographic patterns that may help to understand the evolutionary history of each species, and to characterize the pollen morphology of the Lentibulariaceae taxa that occur in western Cuba. The results showed that U. foliosa has high rates of genetic diversity, which could be conditioned by the genetic flow between populations. The two species showed shared haplotype between populations and geographical areas (Brazil-Cuba), which may be conditioned by recent dispersal processes influenced by the aquatic habitat where they occur. On the other hand, the pollen morphology of the family Lentibulariaceae in the western region of Cuba showed variation between Genlisea, Pinguicula and Utricularia, being is described for the first time for the genus Pinguicula ser. Albidae, the presence of endo-apertures with fastigia. / Doutor

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Desportos, Programa de Pós-Graduação em Educação Física, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-25T22:13:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 294472.pdf: 1279339 bytes, checksum: 13a89b8827b626cb0d0188dc9d78a91b (MD5) / Objetivo: Verificar a prevalência de fatores de risco cardiovasculares em adolescentes e analisar a associação da lipemia sérica, variabilidade alélica dos polimorfismos rs662799 do gene APOA5 e rs693 do gene APOB, gordura corporal e aptidão cardiorrespiratória em adolescentes e seus pais com ancestralidade européia. Métodos: Estudo transversal conduzido em adolescentes (11-17 anos) e seus respectivos pais do município de Saudades-SC. Participaram das análises descritivas e de prevalência, 274 adolescentes. Para a descrição das análises do polimorfismo -1131T>C do gene APOA5 foram analisados 173 adolescentes (78 pais e 95 mães); e, para a análise do polimorfismo XbaI do gene APOB, 213 adolescentes (121 pais e 158 mães). As variáveis investigadas foram: demográficas (sexo, idade e área de domicílio), maturação sexual, antropométricas (massa corporal, estatura, perímetro do abdôme, gordura corporal relativa), bioquímicas (colesterol total, HDL-c, LDL-c e triglicerídeos), genéticas [polimorfismos rs662799 do gene APOA5 (-1131T>C) e rs693 do gene APOB (XbaI)] e aptidão cardiorrespiratória. Resultados: Verificou-se que 12,3%, 42,9% e 59,8% dos adolescentes tinham excesso de peso, obesidade abdominal e gordura corporal alta, respectivamente. Ademais, 46% apresentaram níveis reduzidos de HDL-c, 41,9% hipercolesterolemia, 18,0% níveis elevados de LDL-c e 13,6% hipertrigliceridemia. Adolescentes com excesso de peso corporal apresentaram mais chance de terem níveis reduzidos de HDL-c. Nenhuma diferença foi verificada nos valores médios da lipemia sérica entre as variantes alélicas do polimorfismo -1131T>C do gene APOA5 e XbaI do gene APOB. Em relação às diferenças entre os sexos, observou-se que as moças portadoras do genótipo TT do polimorfismo -1131T>C do gene APOA5 apresentaram médias mais altas de colesterol total, LDL-c e triglicerídeos quando comparadas aos rapazes. Além disso, observou-se que aquelas portadoras do genótipo TC+CC apresentaram médias mais elevadas de triglicerídeos que os rapazes. A partir das análises de associação, filhos de pais com gordura corporal elevada tinham quase quatro vezes mais chance de apresentarem níveis reduzidos de HDL-c (p<0,05). Nenhuma associação foi verificada entre as variantes alélicas do polimorfismo -1131T>C do gene APOA5 e XbaI do gene APOB dos pais e a lipemia sérica em adolescentes. Conclusão: Não foi verificada associação da lipemia sérica com as variantes alélicas do polimorfismo -1131T>C do gene APOA5 e XbaI do gene APOB entre adolescentes e seus pais. / Objective: To examine the prevalence of cardiovascular risk factors in adolescents and to determine the association between serum lipemia, the variability of allelic polymorphisms rs662799 of the APOA5 gene and rs693 of the APOB gene, body composition and cardiorespiratory fitness in adolescents and their parents with European ancestry. Methods: Cross-sectional study conducted in adolescents (11-17 years) and their parents in Saudades-SC. Participating in the descriptive analysis and prevalence, 274 adolescents. For a description of the analysis -1131T>C polymorphism APOA5 gene were examined 173 adolescents (78 mothers and 95 fathers) and, for the analysis of XbaI polymorphism APOB gene, 213 adolescents (121 fathers and 158 mothers). Variables were: demographics (gender, age and area of residence), sexual maturation, and anthropometric (weight, height, abdome circumference, relative body fat), biochemical (total cholesterol, HDL-c, LDL-c and triglycerides), genetic [polymorphisms rs662799 of the APOA5 gene (-1131T>C) and rs693 of the APOB gene (XbaI)] and cardiorespiratory fitness. Results: We found that 12.3%, 42.9% and 59.8% of adolescents, respectively, overweight, abdominal obesity and high body composition. Furthermore, 46% have low levels of HDL-c, 41.9% hypercholesterolemia, 18.0% and 13.6% had high LDL-c and hypertriglycerimia, respectively. Adolescents with overweight have greater odds of having low levels of HDL-c. Regarding the differences between the genders, it was observed that the girls carrying the TT genotype of polymorphism -1131T>C in APOA5 gene had higher mean total cholesterol, LDL-C and triglycerides when compared to boys. In addition, we found that those girls with the TC+CC genotype showed higher triglyceride levels than boys. From the analysis of association, children of parents with high body fat were nearly four times more likely to have reduced levels of HDL-C (p<0.05). No association was found between allelic variants of the polymorphism -1131T>C and APOA5 gene XbaI gene ApoB serum lipemia parents and adolescents. Conclusion: There was no association of serum lipemia with allelic variants of the polymorphism -1131T>C of the APOA5 gene and XbaI of the ApoB gene between adolescents and their parents.

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:32Z : No. of bitstreams: 1 000847745_20170227.pdf: 184874 bytes, checksum: 77631070ff8a07f3359b1fb5c396f4ac (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-03T11:01:33Z: 000847745_20170227.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-03T11:02:41Z : No. of bitstreams: 1 000847745.pdf: 1720621 bytes, checksum: 5da3023273e6a040671b72235040def6 (MD5) / O desenvolvimento vegetal é influenciado por diferentes fatores como os microRNAs (miRNAs) e os fitohormônios, os quaisinteragem numa complexa rede de regulação. Entre os miRNAs, o miRNA156 (miR156) regula os fatores de transcrição SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like(SPL) afetando diferentes processos do desenvolvimento vegetal. Entre os fitohormônios, os brassinosteróides (BRs) participam na regulação dos eventos associados à fase juvenil da planta. A interação miR156/SPL-BRs não é conhecida, pelo qual, este estudo avaliou a interação destas duas vias durante o desenvolvimento juvenil de Arabidopsis thaliana. Formacaco da raiz principal (RP) e número de raizes laterais (RL) bem como o crescimento do hipocótilo foram utilizados como marcadores desta possivel interação. Foram utilizadas plantas de A. thaliana (Ecotipo Col-0) que expressam constitutivamente o miR156 (miR156-OE), plantas com níveis reduzidos do miR156 (Mimicry-156) e plantas selvagens (WT). Entre os BRs foi escolhido o 24-EpiBrassinolídeo (24-EBL) por ser o BR mais ativo. Plântulas miR156-OE apresentam maior comprimento da RP, maior número de RL e maior sensibilidade aos tratamentos com 24-EBL; fenótipos e comportamento opostosforam observados nas plântulas Mimicry-156. Além disso, plântulas miR156-OE apresentam maior comprimento do hipocótilo, enquanto as plântulas Mimicry-156 apresentam reduzido comprimento. Entre os genes SPLs que respondem ao tratamento com 24-EBL se encontram os SPL2, - 3, -4, -5, e -6. Entre os genes da via dos BRs foram observados alterações na expressão dos genes CPD, BZR1, BES1 e BAS1. Estes dados sugerem que a via genética do miR156/SPL interage com os BRs, e também contribuem para um melhor conhecimento da genética molecular do desenvolvimento de arabidopsis / Plant development is affected by different factors such as micro-RNAs (miRNAs) and phytohormones which interact in a complex regulation network. Among miRNAS, miRNA156 (miR156) regulates SQUAMOSA Promoter- Binding Protein-Like (SPL) transcription factor family affecting different plant development processes. Among phytohormones, brassinosteroids (BRs) participate in regulation of vegetal juvenile processes. miR156/SPL-BRs interaction is unknown whereby the aim of this work was to evaluate the interaction between those two pathways during Arabidopsis thaliana juvenile development. Main root (RP), lateral root number (RL) and hypocotyl length were selected as markers of this interaction. A. thaliana (Col-0 ecotype) overexpressing miR156 (miR156-OE), plants with miR156 reduced activity (Mimicry-156) and wild type (WT) plants were used. 24-Epibrassinolide (24- EBL), the most active BRs, was selected. miR156-OE plants have longer RP length, more RL and 24-EBL sensitivity. Opossite phenotypes were observed on Mimicry-156 plants. Besides, miR156-OE plants have longer hypocotyl length while Mimicry-156 plants have shorter. SPLs genes, SPL2, -3, -4, -5, and -6 responded to 24-EBL treatment. BRs pathway genes, CPD, BZR1, BES1 and BAS1 had changes in gene expression. Our data suggest a interaction between the miR156/SPL and BRs pathways and help to understand the molecular genetics of Arabidopsis development

Made available in DSpace on 2016-01-13T13:27:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-13T13:33:08Z : No. of bitstreams: 1 000854711.pdf: 939255 bytes, checksum: 61106a7424ba71676a1c01f768d508d0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No presente estudo avaliou-se a eficiência da indução à triploidia em duas espécies (pacu Piaractus mesopotamicus e tambaqui Colossoma macropomum) e seu respectivo híbrido interespecífico tambacu (♀ tambaqui x ♂ pacu). O principal objetivo foi avaliar a indução por choque de temperatura quente e frio e a forma de identificação da ploidia dos peixes. Além disso, foi padronizado um protocolo de obtenção de cromossomos mitóticos a partir de larvas (citogenética de larvas). Nas avaliações de quantidade e qualidade das metáfases, observaram-se melhores resultados para o protocolo de citogenética de larvas utilizando a concentração de colchicina a 0,007% (4 h). Inicialmente, nos experimentos pilotos, foram avaliados choque quente e frio em pacu e tambaqui, os quais apresentaram melhores resultados de taxa de eclosão e índice de triploides nos tratamentos quentes. Dessa forma, apenas tratamentos quentes foram avaliados nos experimentos seguintes. Na indução do pacu, foram detectados 11,8% de triploides por citogenética em juvenis no choque a 43 ºC (2 min), 2 min após a fertilização. Para o tambaqui, em análise por citogenética de larvas, foram detectados 80% de triploides no choque a 43 °C (2 min), 2 min após a fertilização; entretanto, quando analisado na fase juvenil, este tratamento apresentou 29,4% de triploides. Já para o híbrido tambacu, foram detectados 33,3% de triploides na fase larval no choque a 43 °C (2 min), 2 min após a fertilização; e 8,7% na fase de juvenil. Entretanto, no choque a 41°C (2 min), 1 min após na fertilização, foram detectados 57,8% de triploides na fase juvenil. Quando o nível de ploidia foi analisado por meio da análise das Regiões Organizadoras do Nucléolo (NOR) nos cromossomos metafásicos, verificou-se variação intra-individual (NORs múltiplas) para o pacu, tambaqui e tambacu, assim como na análise dos núcleos interfásicos do tambaqui, inviabilizando essa... / In the present study, we evaluated the triploidy induction efficiency in two species (pacu Piaractus mesopotamicus and tambaqui Colossoma macropomum) and their respective interspecific hybrid tambacu (♀ tambaqui x ♂ pacu). The main objective was to evaluate the heat and cold shock temperatures and the form of identification of the fish ploidy. Furthermore, a protocol has been standardized to obtain mitotic chromosomes from larvae (larvae cytogenetics). In the evaluations of quantity and quality of metaphases, we observed better results for larvae cytogenetics using the concentration of 0.007% (4 hours). Initially, in the pilot experiments, we analyzed heat and cold shock treatments in pacu and tambaqui, which showed better results from hatching rate and triploid index in heat temperatures. Thus, only heat shocks were evaluated in the final experiments. In pacu, 11.8% of triploid juveniles were detected by cytogenetic method in the shock induction at 43 °C (2 min), 2 min after fertilization. For tambaqui, 80% of triploid were detected in larvae cytogenetic analysis for the shock at the 43 °C (2 min), 2 min after fertilization; however, when analyzed in the juvenile stage, we observed 29.4% of triploids. For the hybrid tambacu, we detected 33.3% of triploids in the larval stage at the shock at 43 °C (2 min), 2 min after fertilization; and 8.7% in the juvenile stage. However, in the shock at 41 °C (2 min), 1 min after fertilization, we detected 57.8% of triploid in the juvenile stage. When the ploidy level was analyzed by Nucleolar Organizer Regions analysis (NOR) on metaphase chromosomes, intra-individual variation was found (multiple NOR) for pacu, tambaqui and tambacu, as well as the analysis of interphase nuclei tambaqui, preventing this technique for verification of ploidy. In conclusion, although this study did not reach 100% triploidy, this work enables the triploid production for future studies and identifies them in the ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T19:33:13Z : No. of bitstreams: 1 prado_fd_me_botib.pdf: 676910 bytes, checksum: 6d6c9b4d7738938a01e94ca150d37e4a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A hibridação artificial interespecífica de peixes é utilizada em diversos estabelecimentos voltados à piscicultura no país, com a finalidade de produzir indivíduos mais vantajosos e favoráveis para o cultivo. Porém, devido principalmente às dificuldades encontradas na identificação dos híbridos, esta prática pode determinar o surgimento de sérios problemas como a contaminação genética dos estoques de cultivo, a comercialização de produtos híbridos como espécies puras, a introdução de espécies exóticas e escapes de produtos de piscicultura para o ambiente natural e até eventos de introgressão genética e extinção das espécies nativas. Neste contexto, o presente trabalho teve por objetivo analisar geneticamente exemplares das linhagens parentais de Pseudoplatystoma corruscans (pintado) e Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) e seus híbridos interespecíficos pintachara (macho de pintado x fêmea de cachara) e cachapinta (fêmea de cachara x macho de pintado), provenientes dos estoques de cultivo do CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, a fim de identificar e estabelecer marcadores genéticos para possibilitar sua identificação e diferenciação. Também foram analisadas geneticamente amostras de P. corruscans e P. reticulatum coletadas no Rio Paraguai, MS (bacia do Paraguai) e de P. corruscans capturados do rio Mogi- Guaçu, SP (bacia do Alto Paraná), a fim de identificar a possível ocorrência de híbridos entre estas espécies na natureza. As análises citogenéticas revelaram um número diploide de 2n=56 cromossomos para ambas as espécies parentais, com cariótipos caracterizados por cromossomos dos tipos 20m+12am+12st+12a e número fundamental (NF) igual a 100, indicando uma fórmula cariotípica conservada entre estas espécies. A análise dos padrões de heterocromatina pelo bandamento C revelou blocos heterocromáticos localizados nas porções... / Artificial interspecific hybridization of fish is used in various establishments linked to fish farming in the country, in order to produce individuais more advantageous and favorable for cultivation. However, due mainly to difficulties in the hybrid products identification, this practice may determine the onset of serious problems such as genetic contamination of the breeder stocks, marketing of hybrids as pure species, introduction of exotic species and escapes of farmed products to the natural environment and sometimes leading to events of genetic introgression and extinction of native species. In such context, the present study aimed to analyze genetically copies of the parental lines of Pseudoplatystoma corruscans (pintado) and Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) and their interspecific hybrids pintachara (female of pintado x male of cachara) and cachapinta (female of cachara x male of pintado), from the stocks manteined in CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, in order to characterize and establish genetic markers to allow their identification and differentiation. Samples of P. corruscans and P. reticulatum collected in the Paraguay river, MS (Paraguay basin) and P. corruscans captured in Mogi-Guaçu river, SP (Alto Paraná basin), also were genetically analyzed in order to identify the possible occurrence of hybrids between these species in nature. The cytogenetic analysis revealed a diploid number of 2n = 56 chromosomes for both parental species with karyotypes characterized by the formula 20m+12am+12st+12a and fundamental number (NF) of 100, indicating a karyotypic formula conserved among these species. The analysis of the heterochromatin C-banding patterns revealed heterochromatic blocks located in the pericentromeric and terminal portions of some chromosomes, the NOR was sim pie and located in one chromosome pai r and 5S ribosomal genes located on two different subtelocentric... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-27Bitstream added on 2014-06-13T19:12:56Z : No. of bitstreams: 1 000749214.pdf: 1021607 bytes, checksum: d716daae1fd7be486189d76347e657ad (MD5) / Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a... / Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark’s fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ...

O rio Iguaçu, caracterizado pelo alto endemismo relacionado à ictiofauna, possui pelo menos 8 espécies do gênero Astyanax: A. sp.A, A. sp. B, A. sp. C, A. sp. D, A. sp. E, A. sp. F e A. altiparanae. A espécie Astyanax sp. D vive em cabeceiras de pequenos rios. Foram feitas análises cromossômicas em A. sp.D de três populações provenientes de dois riachos da margem direita e um da margem esquerda do alto rio Iguaçu. Nas três localidades, os indivíduos analisados apresentaram um número diplóide modal de 50 cromossomos, distribuídos em 2 pares de cromossomos metacêntricos, 12 de submetacêntricos, 3 de subtelocêntricos e 8 de acrocêntricos (NF=84). Não foi detectado dimorfismo sexual cromossômico. Dentro de todas as populações foi verificada uma variação interindividual com relação ao número e localização de bandas heterocromáticas. Ao comparar os blocos C positivos das três localidades, estes se mostraram semelhantes. Através da mensuração das variações cromossômicas estruturais (inversões paracêntricas) identificadas pelo bandamento C, foi possível obter freqüências “alélicas” e “genotípicas” de dois pares cromossômicos polimórficos (18 e 19), sendo que cada par possui dois morfotipos. As freqüências, em todas as localidades, se mostraram concordantes com as proporções esperadas pelo equilíbrio de Hardy-Weinberg. Quando comparadas, as populações apresentaram freqüências “alélicas” e “genotípicas” estatisticamente similares, evidenciando semelhanças populacionais. A estatística-F foi usada para descrever uma possível estruturação entre as populações. Os valores obtidos através da análise de Fs t referente a dois pares cromossômicos polimórficos indicam que não há estruturação populacional, e que as populações provavelmente se comportam como uma só