Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2018-03-27T18:48:03Z No. of bitstreams: 1 2017 - Tays Araujo Camilo.pdf: 3555895 bytes, checksum: 8b6818596f8654186472296bc3b528aa (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-27T18:48:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017 - Tays Araujo Camilo.pdf: 3555895 bytes, checksum: 8b6818596f8654186472296bc3b528aa (MD5) Previous issue date: 2017-03-07 / CNPq / Infectious Bronchitis Virus (vBIG) is a highly contagious viral agent among the species Gallus gallus, being considered one of the pathologies that most affects small and lare world poultry producers. Vaccination as a form of prevention to this disease, has not been effective, due to the great genetic variability found. As in the world, in Brazil there are already several studies characterizing the genetic variability found in this virus. In Rio de Janeiro, poultry farming suffers from the disease, but there is no recent study to analyze the genetic variability of the strains found, as a way of supporting epidemiological studies that may help in the future, in the choice of Protocols. The objective of this study was to characterize the S1 gene of the Chicken Infectious Bronchitis virus (vBIG) in chickens farms in the southern region of Rio de Janeiro, as well as to evaluate the genetic variability of the S1 gene in a BIG outbreak on a farm Of laying hens of the northern region of. Tissue samples were collected from animals presenting BIG-compatible clinical signs, such as weight loss, respiratory problems and low productivity. Samples of collected tissues were stored in solution of RNA Later and formalin 10% buffered for molecular and histopathological diagnoses, respectively. In order to perform the molecular analyzes, RNA extraction techniques, as well as RT-PCR (Reverse Transcriptase, Polymerase Chain Reaction), real-time PCR (RT-qPCR), Nested PCR (RT-nPCR), and Sequencing of some samples collected. For the histopathological analyzes, cleavage and preparation of microscopy slides were performed. The results obtained from the sequencing were compared to the sequence of the Ma5 vaccine strain as reference strain, in addition to other sequences deposited on GenBank, exhibiting a variable identity percentage of 72.41% to 100%. Among the samples from each farm, there was variability, even within the same bird. All sequences analyzed were described as genotype 1, belonging to strains 1 and 11; In the comparison of amino acids, there were changes in the hypervariable regions of the virus in the sequences classified as BR-1, being able to explain the low cross-protection that have been occurring in Brazilian plants. These results demonstrated the importance of virus identification, since it becomes an important tool in epidemiological surveillance and in the elaboration of efficient vaccine protocols. / O v?rus da Bronquite Infecciosa das Galinhas (vBIG) ? um agente viral altamente contagioso entre a esp?cie Gallus gallus, sendo considerado uma das patologias que mais acomete a avicultura mundial. A vacina??o como forma de preven??o a esta doen?a, n?o tem sido eficaz, devido a grande variabilidade gen?tica encontrada. Assim como no mundo, no Brasil tamb?m j? existem diversos estudos caracterizando a variabilidade gen?tica encontrada neste v?rus. No Rio de Janeiro, a cria??o av?cola sofre com a doen?a, por?m ainda n?o existe um estudo recente com o objetivo de analisar a variabilidade gen?tica das cepas encontradas, como uma forma de apoio a estudos epidemiol?gicos, que possam auxiliar no futuro, na escolha de protocolos vacinais mais adequados. Este estudo teve como objetivo realizar a caracteriza??o molecular do gene S1 do v?rus da Bronquite Infecciosa das Galinhas (vBIG) em granjas de frangos de corte na regi?o Sul fluminense, como tamb?m avaliar a variabilidade gen?tica do gene S1 em um surto de BIG em uma granja de poedeiras da regi?o Norte fluminense. Foram realizadas coletas de tecidos dos animais que apresentavam sinais cl?nicos compat?veis com BIG, como perda de peso, problemas respirat?rios e baixa produtividade. Amostras de tecidos coletados foram armazenadas em solu??o de RNA Later e formalina 10% tamponada para os diagn?sticos molecular e histopatol?gico, respectivamente. Para realiza??o das an?lises moleculares foram utilizadas t?cnicas de extra??o de RNA, bem como RT-PCR (?Reverse Transcriptase, Polymerase Chain Reaction?), PCR em tempo real (RT-qPCR), ?Nested? PCR (RT-nPCR), e sequenciamento de algumas amostras coletadas. Para as an?lises histopatol?gicas foram realizadas clivagem e elabora??o de l?minas de microscopia. Os resultados obtidos do sequenciamento foram comparados a sequ?ncia da cepa vacinal Ma5, como cepa refer?ncia, al?m de outras sequencias depositadas no GenBank, apresentando um percentual de identidade vari?vel de 72,41% a 100%. Dentre as amostras de cada granja, houve variabilidade, at? mesmo dentro de uma mesma ave. Todas as sequencias analisadas foram descritas como gen?tipo 1, pertencentes as linhagens 1 e 11; Na compara??o de amino?cidos, houve mudan?as nas regi?es hipervari?veis do v?rus nas sequ?ncias classificadas como BR-1, podendo explicar a baixa prote??o-cruzada que v?m ocorrendo nos plant?is brasileiro. Estes resultados demonstraram a import?ncia da identifica??o g?nica do v?rus, pois se torna uma ferramenta importante na vigil?ncia epidemiol?gica e em elabora??es de protocolos vacinais que sejam eficientes.

Coronavírus, incluindo-se o Coronavírus aviário (ACoV), possuem o maior genoma composto por RNA conhecido entre os vírus. Aproximadamente dois terços desse genoma codificam proteínas não estruturais (Nsps), cujas funções parecem estar associadas à replicação e patogênese viral. Até o momento, esses alvos têm sido pouco explorados quanto a sua diversidade em diferentes linhagens de ACoV. O presente estudo teve como objetivo investigar a diversidade dos genes codificadores das proteínas não estruturais Nsp2 e protease Papaína-like (Plpro), utilizando-se linhagens brasileiras de ACoV. Para tanto, 10 linhagens de ACoV, isoladas em ovos embrionados, foram submetidas à RT-PCR direcionada aos genes codificadores de Plpro e Nsp2, seguindo-se o sequenciamento de DNA e a análise filogenética, juntamente com sequências homólogas obtidas no GenBank. Além disso, realizou-se a genotipagem por meio do sequenciamento parcial do gene codificador da proteína de espícula (região S1). Três das amostras virais obtidas e investigadas no presente trabalho apresentaram padrão de segregação discordante para os genes estudados. O isolado CRG I22 agrupou-se com linhagens virais pertencentes ao genótipo Massachusetts para S1 e com o grupamento de ACoVs brasileiros os genes da Nsp2 e Plpro. O isolado CRG I33 agrupou-se com linhagens virais pertencentes ao genótipo brasileiro para s1 e plpro e de maneira divergente para o gene da Nsp2. Para o isolado CRG I38, não foi obtida a genotipagem por s1, entretanto, similarmente ao observado para o isolado CRG I33, esse isolado agrupo-se com linhagens virais brasileiras para o gene plro e de maneira independente para o gene nsp2. As demais linhagens estudadas resultaram na formação de um grupamento especificamente brasileiro de ACoV, para os três genes estudados. Esses achados sugerem a ocorrência de recombinação nessas amostras discrepantes. Quanto às identidades médias entre as sequencias nucleotídicas analisadas, a região de s1 analisada apresentou as menores identidades (73,75% ±16,78), seguido pelo gene plpro (88,06% ±5,7) e do gene nsp2 (92,28% ±4,37), em acordo com a literatura. Assim sendo, os alvos investigados podem constituir ferramentas úteis na epidemiologia molecular do ACoV e na investigação de linhagens recombinantes do vírus. O presente estudo é o primeiro a investigar a diversidade genética de genes codificadores de proteínas não-estruturais em linhagens brasileiras de ACoV. Os resultados aqui apresentados reforçam a existência de um genótipo brasileiro de ACoV, para os 3 genes estudados. Entretanto, discrepâncias pontuais encontradas no padrão genotípico para s1, nsp2 e nsp3 permitem inferir uma diversidade genética maior do que a conhecida até o momento, possivelmente resultante de eventos de recombinação entre ACoVs brasileiros, ACoVs vacinais e outros ainda desconhecidos. Os resultados obtidos auxiliam na compreensão dos padrões e evolução dos ACoVs / Coronaviruses, including Avian coronavirus (ACoV), have the largest known RNA genome. Nearly two thirds of its genome codes for non-structural proteins (Nsps), whose functions appear to be linked to viral replication and pathogenesis. Hitherto these targets have been poorly explored regarding the ACoV lineages diversity. The present study aimed to assess the diversity of non-structural protein 2 (nsp2), papain-like protease (plpro) and spike protein (S1 subunit) coding genes, in Brazilian ACoV strains. To this end, 10 ACoV strains, isolated in embryonated eggs, had its 3rd and 5th passages submitted to RT-PCR targeting nsp2, plpro and s1, followed by DNA sequencing and phylogenetic analysis, herewith homologous sequences obtained from GenBank. Three of the ACoV strains sequenced showed a discordant segregation pattern for target genes. CRG I22 strain clustered with Massachusetts genotipe strains for S1, and with Brazilian cluster for nsp3 and plpro genes. CRG I33 strain, clustered with Brazilian strains for S1 and plpro genes, and was divergent for nsp2 gene. For CRG I38 strain, the S1 sequence was not obtained, however, similarly to what was observed for CRG I33, this strain grouped with the Brazilian lineage for plpro gene and was divergent for nsp2 gene. All the other ACoV here sequenced resulted in a specific Brazilian cluster for the three studied genes. Regarding the mean nucleotide identities measured, s1 gene showed the lowest identity (73.75% ±16.78), followed by plpro gene (88.06% ±5.7) and nsp2 gene (92.28% ±4.37), in accordance with previous reported data. Therefore, the targets of the present study are useful tools for ACoV molecular epidemiology studies and for the survey of recombinant ACoV strains. The presented study is the first one investigating the molecular diversity of non-structural proteins coding genes in Brazilian strains of ACoV. Results achieved herein reinforce the data over the circulation of ACoV Brazilian strains in this country, for the three investigated genes. However, divergences found between S1, nsp2 and plpro genetic patters allow inferring a higher molecular diversity than previously known. It is possible that this divergence is due to recombination events between ACoV from vaccines, Brazilian field strains and others still unknown. These results contribute on the comprehension over genetic patters and evolution of ACoV

El objetivo del estudio fue determinar la utilidad de la proteína C reactiva (PCR) en el manejo de la neumonía adquirida de la comunidad (NAC). Se estudiaron de forma prospectiva 169 pacientes con diagnóstico de NAC. Se utilizó como criterio diagnóstico de la presencia de infiltrado en radiografía de tórax anteroposterior frente y perfil, más uno de los siguientes signos y/o síntomas: fiebre o hipotermia, rales crepitantes, tos productiva y hemocultivos o cultivo de esputo con gérmenes compatibles con el diagnóstico de NAC. La edad promedio fue de 70,96 años (rango 25-97 años). La distribución por sexo fue la siguiente femenino 52% y masculino 48%. La mortalidad observada fue 7,69 % (13/169). Se compararon dos scores de severidad de neumonía: PSI (Pneumonia Severity Index) y CURB-65 (Confusion, Urea, Respiratory Rate, Blood Preasure, Age > 65) con proteína C reactiva. Se establecieron cinco categorías de PCR: I menor a 29 mg/l, II entre 29 y 39 mg/l, III entre 40 y 59 mg/l, IV 60 y 75 mg/l y V mayores 76 mg/l. Se consideraron valores positivos mayores o iguales a 39 mg/l. Se encontró correlación entre CURB-65 y PSI y entre CURB-65 (en todas las clases de severidad) y PCR (P < 0,000), como así también entre PSI categoría IV y PCR (P < 0,007). Los valores de PCR poseen relación con respecto a la gravedad de la neumonía utilizando CURB65.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-01-10Bitstream added on 2014-06-13T20:44:09Z : No. of bitstreams: 1 buchala_fg_dr_jabo.pdf: 2239800 bytes, checksum: 45318e9bad370d2fed0afb87b5d25d4f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A suspeita de Laringotraqueíte Infecciosa Aviária (LTI) em galinhas de postura de ovos comerciais da região de Bastos, Estado de São Paulo, foi notificada em 27/12/2002 ao Serviço de Defesa Sanitária Animal. A Coordenadoria de Defesa Agropecuária instituiu um programa de saúde animal para o controle da doença, com base no planejamento de fases que foram implantadas durante o seu desenvolvimento e amparadas por instrumentos legais especificamente elaborados para esta finalidade. A Portaria CDA no 2, de 10 de janeiro de 2003, proibiu o trânsito interestadual de aves de descarte da região e deu início à fase preparatória. A Resolução SAA no 27, de 30 de setembro de 2003, caracterizou a fase de execução com a delimitação da área infectada, denominada “Bolsão” de Bastos. A Portaria CDA no 4, de 20 de janeiro de 2004, estabeleceu um programa compulsório de vacinação contra a LTI. A partir de junho de 2004, nenhum novo caso de LTI foi observado no “Bolsão”. A Resolução SAA no 43, de 17 de novembro de 2005, declarou a LTI controlada com vacinação, dando início à fase de consolidação das medidas de profilaxia implantadas. Com a Resolução SAA no 55, de 20 de dezembro de 2006, e a Portaria CDA no 58, de 29 de dezembro de 2006, o programa evoluiu para a fase de manutenção. Todas as fases foram complementadas por medidas de biosseguridade implantadas pelos avicultores. / A suspect of Avian Infectious Laryngotracheitis (ILT) in layer hens from Bastos region, São Paulo State, was communicated on December 27, 2002, to the Official Service of Animal Health. The Coordenadoria de Defesa Agropecuária (CDA) instituted an animal health program for the control of the disease, based on the planning of phases established during the development of the program and supported by legal instruments especially developed for this aim. The Portaria CDA Nº 2 on January 10, 2003 forbade interstate traffic of adult layer poultry from the region and started the preparatory phase. The Resolução SAA no 27 on September 30, 2003, characterized the execution phase by the delimitation of the infectious zone identified as “Bolsão” of Bastos. The Portaria CDA no 4 on January 20, 2004, established a compulsory program of vaccination against ILT. From the month of June, 2004, no new case was observed in the “Bolsão”. The Resolução SAA no 43 on November 17, 2005, declared the ILT controlled with vaccination, and started the phase of consolidation of the implanted prophylactic measures. From the Resolução SAA no 55 on December 20, 2006, and the Portaria CDA no 58 on December 29, 2006, the program evolved to the phase of maintenance. All the phases were complemented by biosecurity measures implanted by the owners of the layer hens.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-20Bitstream added on 2014-06-13T18:44:31Z : No. of bitstreams: 1 gibertoni_am_dr_jabo.pdf: 1047291 bytes, checksum: 9be7492afd065b969b043d3a6d16e4be (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foram realizadas a clonagem e expressão do gene da nucleoproteína (N) de uma estirpe vacinal de referência M41 do vírus da bronquite infecciosa (VBI), como proteína recombinante de fusão, contendo uma cauda de poli-histidina na extremidade carboxi-terminal, em 2 sistemas hospedeiros; na levedura metilotrófica, Pichia pastoris e na bactéria Escherichia coli. A proteína N derivada de um isolado variante do VBI de surtos a campo no Brasil, também foi expressa em E. coli. As características bioquímicas e imunoquímicas de tais proteínas recombinantes, foram determinadas, tendo sido evidenciado maior eficiência de produção no sistema hospedeiro constituído por E. coli, comparativamente ao sistema composto por P. pastoris. Uma vez obtidas, caracterizadas e purificadas, através da técnica de cromatografia de afinidade em resina de níquel-sepharose, as preparações de proteína N recombinante expressas em E. coli e derivadas ou da estirpe de referência M41 ou do novo isolado de campo no Brasil, foram utilizadas de forma bem sucedida, como antígenos alvo de ensaios indiretos de ELISA, que foram aplicados na detecção e mensuração de anticorpos dos isótipos IgG e IgM em aves infectadas com estirpes homóloga ou variantes do VBI. Foi, também, investigada a atividade imunogênica da proteína N recombinante em aves, que depois de imunizadas e re-imunizadas com essas proteínas recombinantes, produziram no soro sanguíneo e na secreção lacrimal quantidades elevadas de anticorpos anti-VBI específicos, mas não desenvolveram proteção efetiva contra o desafio com a estirpe homóloga desse vírus. Concluindo, a proteína N recombinante do VBI expressa pela E. coli possui elevada imunogenicidade, no sentido de induzir altos níveis de anticorpos específicos, e reatividade cruzada com proteínas N de outras variantes desse vírus, tendo um grande potencial de ser aplicada em... / Two host systems, represented by Escherichia coli and Pichia pastoris were used for cloning and protein expression of the nucleoprotein (N) gene of M41 strain of infectious bronchitis virus (IBV) as a fusion recombinant protein containing a poli-histidine tag. The N protein from a new variant Brazilian field isolate was also cloned and expressed by E. coli system. The biochemical and immunochemical properties of these recombinant N proteins were determined and higher efficiency on protein production was achieved by using the E. coli expression system. Both recombinant N proteins expressed by E. coli were purified in nickel-sepharose resin and used as antigen in indirect ELISA methods for the detection of IgG and IgM antibodies in birds infected with homologous and variant IBVs. The immunogenicity of N recombinant protein was also evaluated by immunizing and re-immunizing birds and high antibody levels were generated in lachrymal secretion and serum, but no effective protection against challenge with homologous virulent stain of IBV was induced. Concluding, the recombinant N IBV protein expressed by E. coli is highly immunogenic for inducing specific and crossreactive antibodies, and can be applied in the immuno-diagnosis of IB

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2012-07-18T19:29:56Z No. of bitstreams: 1 Federico Costa EStudos ecológicos sobre reservatórios....pdf: 1462379 bytes, checksum: 12cd0ac366f256448b7800dbac8ca53a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-18T19:29:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Federico Costa EStudos ecológicos sobre reservatórios....pdf: 1462379 bytes, checksum: 12cd0ac366f256448b7800dbac8ca53a (MD5) Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, Bahia, Brasil / A leptospirose é um importante problema de saúde urbana devido às epidemias anuais que ocorrem em comunidades carentes e à alta mortalidade associada às formas graves. Os ratos são considerados os principais reservatórios na transmissão urbana. Entretanto, não existem estudos que sistematicamente definam os fatores de infestação por ratos e as características ambientais que influenciam o risco de transmissão da leptospirose. Objetivos: 1) Determinar a associação entre infestação por roedores e infecção por Leptospira em um estudo de coorte prospectivo realizado em uma comunidade carente de Salvador-BA. 2) Desenvolver e validar um escore domiciliar baseado em características da infestação de ratos para predizer o risco de leptospirose em Salvador. Métodos: Para o objetivo 1 realizou-se um estudo de caso-controle aninhado numa coorte longitudinal onde foram definidos como domicílios-casos aqueles que tiveram um ou mais indivíduos com infecção assintomática por Leptospira. Controles foram domicílios aleatoriamente selecionados daqueles que tiveram indivíduos sem infecção. Avaliaram-se domicílios registrando sinais de infestação por roedores e características ambientais e foi realizada regressão logística para identificar fatores de risco para infecção. Para o objetivo 2 desenvolveu-se um estudo caso-controle 1:2, onde domicílios-casos foram aqueles nos quais residiam pessoas (casos) com leptospirose. Utilizou-se metodologia similar a do objetivo 1 para avaliar e analisar fatores de risco. Adicionalmente foi desenvolvido um escore preditivo baseado no modelo de regressão logística que foi validado num grupo independente de domicílios-casos e controle. Utilizaram-se curvas características de recepção (ROC) para analisar o desempenho preditivo do escore. Resultados: Objetivo 1: Registrou-se elevado nível de infestação por Rattus norvegicus (>45%). Identificaram-se como fatores de risco de infecção: fezes de R. norvegicus (OR 4.6 IC 95% 1.9-10.7), tocas (OR 2.8, IC 95% 1.1-7.3), parede do domicilio sem reboco (OR 2.5, IC 95% 1.1-7.4) e renda domiciliar per capita (OR 0.9 por US$/dia, IC 95% 0.8-0.9). Objetivo 2: Achamos uma elevada proporção (>44%) de domicílios infestados. Os fatores de risco independentes para leptospirose foram tocas, fezes de Rattus norvegicus, trilhas, casa abandonada <10m e domicílio sem reboco. Designaram-se valores de escore para cada fator de risco (3, 3, 2, 2 e 2 respectivamente). A área sob a curva ROC foi 0,70 (IC95%, 0,64-0,76) para o grupo de desenvolvimento e 0,71 (95; 0,65-0,79) para o de validação. Conclusões: Foi identificada uma elevada proporção de domicílios infestados com R. norvegicus. Os fatores de risco para infecção por Leptospira e leptospirose grave foram similares. Foi definido e validado um escore preditivo que identifica domicílios de elevado risco dentro de comunidades com transmissão endêmica de leptospirose. Estes achados sugerem que a triagem da infestação por roedores e a identificação de domicílios de risco, podem constituir ações de uma estratégia recomendável para dirigir intervenções de controle de roedores em populações de risco. / Leptospirosis is a relevant problem of urban health because of the epidemics occurring in cities throughout the developing world and the high mortality associated with severe disease. In urban areas, leptospirosis is transmitted to humans by the rodent Rattus norvegicus. However, there are no studies that systematically defined rodent infestation factors and environmental characteristics that influence the risk for Leptospirosis transmission. Aims: 1) To identify environmental risk factors for asymptomatic or subclinical Leptospira transmission. 2) To develop and validate a household score based on rodent infestation characteristics to predict leptospirosis risk in Salvador. Methods: For aim 1 a nested case-control study was conducted in the study site. A household was regarded as a case household if at least one new Leptospira infection occurred among cohort subjects. Control households were randomly selected and households were surveyed for signs of rodent infestation and environmental characteristics. We used conditional logistic regression modeling to identify risk factors for Leptospira infection. For aim 2 we developed a case-control study (1:2), where case households were households in which leptospirosis cases resided. Control households were located within 30m of a case-household. We used similar methodology to that in aim 1 to identify and analyze risk factors for leptospirosis. Additionally, we used the logistic regression model to develop a predictive score for leptospirosis that was validated in an independent group of cases and control households. We used receiver operating characteristic (ROC) curve analysis to evaluate the performance of the prediction score. Results: Aim 1: we identified a high level of R. norvegicus infestation (>45%). We identified the following independent risk factors: R. norvegicus feces (OR 4.6 CI 95% 1.9-10.7), burrows (OR 2.8, CI 95% 1.1-7.3), unplastered walls (OR 2.5, CI 95% 1.1-7.4) and household per capita income (OR 0.9 for each US$ per day increase, CI 95% 0.8-0.9). Aim 2: more than 44% of the households presented rodent signs. Independent risk factors for acquiring leptospirosis in a household were rodent burrows, Rattus norvegicus feces, rodent runs, household bordering an abandoned house, and unplastered walls. A prediction score was developed by assigning points (3, 3, 2, 2 and 2 respectively) to each risk factor. The area under the ROC curve for the scoring system was 0.70 (95% CI, 0.64-0.76) and 0.71 (0.65-0.79) for the development and validation datasets. Conclusions: Our study indicates that high proportions of urban slum households are infested with R. norvegicus. Risk factors for asymptomatic Leptospira infection and severe leptospirosis were similar. The prediction score showed good performance in identifying high-risk households for leptospirosis. These findings suggest that community-based screening for rodent infestation can be a strategy to target rodent and environmental control measures to populations at highest risk for leptospirosis

Rhodococcus equi (R.equi), uma bactéria gram-positiva intracelular facultativa, é uma causa importante de pneumonia em potros com idade entre 3 semanas e 5 meses. A manifestação clinica mais comum da doença é a broncopneumonia piogranulomatosa com abscedação. Na pneumonia causada por R. equi os primeiros sinais clínicos podem não ser aparentes até que as alterações patológicas estejam bastante avançadas, por esse motivo, o diagnóstico precoce e acurado de potros com pneumonia por R. equi se torna fundamental. O diagnóstico definitivo baseia-se na detecção de R. equi na cultura bacteriológica e identificação molecular a partir da amostra de lavado traqueal; no entanto, essa técnica é invasiva, traz riscos para o animal e é relativamente cara. A ultrassonografia (US) para detecção precoce tem se tornado uma pratica de rotina em muitas fazendas endêmicas para rodococose equina. Com o advento dessa prática de triagem, a forma mais identificada de pneumonia por R. equi tem sido a subclínica, onde os animais apresentam presença de alterações pulmonares mas não apresentam sinais clínicos da doença. Atualmente, vapA é o gene com função demonstrada na virulência. Identificação de R. equi por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) em amostras de fezes tem se mostrado efetivo para o reconhecimento precoce do agente. Ultrassonografia torácica e PCR das amostras de fezes e swab nasal foram realizadas em 22 potros desde as 3 até as 16 semanas de idade (intervalos de 15 dias) de 3 fazendas endêmicas de criação de cavalos no sul do Brasil para identificar a ocorrência de doença subclínica. A associação entre a ultrassonografia torácica e PCR das amostras de fezes possibilitaram a detecção de doença subclínica e identificação de pontos críticos de controle dessa doença. Considerando o fato de que 95.4% dos potros apresentaram doença subclínica e que nenhum deles desenvolveu a doença clínica demonstra que o tratamento desses casos não é justificável para a população analisada. / Rhodococcus equi, a gram-positive facultative intracellular pathogen, is an important cause of pneumonia in foals between 3 weeks and 5 months of age. Pneumonia caused by R. equi is an insidious disease in which clinical signs may not be apparent until pathologic changes are well progressed. Because of the insidious progression of infection to severe clinical signs, early and accurate diagnosis of foals with R. equi pneumonia is important. Definitive diagnosis is based on R. equi detection by bacterial culture and molecular identification from tracheobronchial aspirate (TBA), this procedure is invasive, labor-intensive, requires skill, carries risks to foals, and is relatively expensive. The sequential thoracic ultrasonography (TUS) to early detection of the disease has been adopted as a screening method in many endemic farms; for this reason, subclinical disease has been the most frequently observed form. Nowadays, vapA is the only virulent gene identified. Fecal polymerase chain reaction (PCR) is a noninvasive technique with good diagnostic accuracy. Thoracic ultrasound screening (TUS) and PCR from fecal and nasal swab samples were performed in 22 foals from 3 to 16 weeks of age from 3 endemic farms at south of Brazil to identify the occurrence of R. equi subclinical disease. The association of TUS and fecal PCR detection of virulent R. equi provided a possibility of identification of critical points in disease control. Considering the fact that 95.4% of the foals showed evidence of subclinical disease and none of them developed any signs of clinical disease, the antibiotic treatment was not reasonable for the foals followed.

Introdução: A sífilis em gestantes é um problema de saúde pública, com casos crescentes a cada ano. O tratamento do parceiro sexual da gestante com sífilis, é de suma importância, pois a falta de tratamento deste pode invalidar todas as medidas de controle instituídas durante o cuidado pré-natal. Objetivo: Descrever a ocorrência de tratamento do parceiro sexual e avaliar fatores maternos que favorecem a realização do tratamento do parceiro sexual das gestantes com sífilis gestacional atendidas no Hospital Fêmina (HFE). Método: Estudo transversal descritivo onde foram descritos os casos de pacientes com diagnóstico de sífilis gestacional atendidas no Serviço de Obstetrícia do HFE no período de 01 de janeiro de 2007 a 31 de dezembro de 2014, e seus respectivos parceiros. A coleta de dados foi realizada através dos dados encaminhados pelo Serviço de Controle de Infecção Hospitalar do Hospital Fêmina à Vigilância em Saúde do Município de Porto Alegre em sífilis, em conjunto com os prontuários das pacientes estudadas. O projeto teve aprovação do Comitê de Ética em Pesquisa do Grupo Hospitalar Conceição com protocolo de número 47914815.2.0000.5530. Resultados: Foram identificados 771 casos de sífilis em gestantes, e desses 570 não tinham informações sobre o tratamento do parceiro sexual da gestante. Dos 201 casos de gestantes com informações sobre o tratamento do parceiro sexual, 25 (12,44%) parceiros foram adequadamente tratados. Na análise univariada comparando gestantes com parceiros tratados para sífilis e não tratados, identificaram-se características associadas à ocorrência de tratamento adequado do parceiro em relação a mulheres que apresentaram sífilis gestacional: a) mais de oito anos de estudo (p=0.022), b) acompanhamento pré-natal adequado (p=0.010) e diagnóstico da sífilis no pré-natal (p=0.003). Conclusão: Escolaridade, diagnóstico precoce de sífilis, e a realização de pré-natal adequado parecem ser fatores determinantes para o adequado tratamento do parceiro e prevenção da transmissão vertical da doença. / Introduction: Syphilis in pregnant women is a public health problem, with increasing cases each year. Treatment of the sexual partner of the pregnant women with syphilis is very important because the lack of treatment may invalidate all control measures imposed during prenatal care. Objective: to describe the occurrence of treatment of the sexual partner and evaluate maternal factors that favor the realization of the treatment of the sexual partner of pregnant women with gestational syphilis treated in Hospital Fêmina. Method: This is a cross-sectional descriptive study, in which were described the cases of patients diagnosed with gestational syphilis in the Obstetrics Department of Hospital Fêmina, and their partners, from January 1st 2007 to December 31st 2014. Data collection was done through the data sent by the Department of Infection Control to Department of Health Surveillance of Porto Alegre in syphilis, along with the records of patients. Ethical principles will be were respected. The project had approval of the ethics committee of Grupo Hospitalar Conceição under protocol number 47914815.2.0000.5530. Results: 771 cases of syphilis in pregnant women were identified. No information on the treatment of the sexual partners was available in 570 of these cases. Among the 201 cases presenting information about the partners treatment, 25 (12.44%) of them were adequately treated. In the univariate analysis comparing women whose partners were treated for syphilis with those untreated demonstrates the associated characteristics as: a) more than eight years of study (p =0.022); b) adequate prenatal care (p= 0.010) and diagnosis of syphilis in prenatal care (p= 0.003). Conclusion: The years of study, the early diagnosis of syphilis and an adequate prenatal care appear to be determining factors for appropriate partner treatment and prevention of the vertical transmission of the disease.

Foram submetidos à análise molecular, 15 isolados do vírus da bronquite infecciosa (VBI) obtidos durante o período de 1988 a 2000, de surtos à campo da Bronquite Infecciosa (BI), em aves de corte ou de postura das regiões Sul e Sudeste do Brasil. Os resultados obtidos da análise filogenética das sequências parciais dos genes da glicoproteína de espícula (S1) e da nucleoproteína (N) evidenciaram que a maior parte dos isolados estão distribuídos em dois grandes grupos; o primeiro deles mais estreitamente relacionado às estirpes do genótipo Massachusetts e o segundo constituído apenas por isolados brasileiros autóctones com uma grande diversidade em relação às estirpes ou isolados do grupo Massachusetts e de outros países ou continentes. Os sítios polimórficos mais importantes formaram-se em locais específicos e de maneira agrupada nas sequências dos genes S1 ou N e predominam em regiões codificadoras das cadeias polipeptídicas S1 e N que configuram sítios estruturais e antigênicos importantes envolvidos, na expressão de propriedades biológicas relevantes. / Fifteen Brazilian field isolates of infectious bronchitis virus (IBV); were recovered, between 1988 and 2000, from commercial broiler or layer flocks located in South and Southeast Brazilian regions. Molecular and phylogenetic analysis of partial sequences of 5\'-proximal of S1 gene and 3\'-terminus of N gene from these IBV isolates, identified two main groups; the Massachusetts group and a Brazilian indigenous group, which presenting a high diversity regarding the first group or other IBV strains from different countries and continents. The major polymorphic sites are arranged in clusters and predominate in the regions of S1 and N genes which code for relevant structural and antigenic sites responsible for the expression of important biological properties.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-06Bitstream added on 2014-06-13T20:16:37Z : No. of bitstreams: 1 piza_vmt_me_jabo.pdf: 496784 bytes, checksum: 8e82f3b02d746dfe3daa52fd23b8be9e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Nesse estudo foi desenvolvido e aplicado o procedimento de imunocaptura para realizar a reação de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (IC-RT-PCR) a fim de ser amplificada uma região 5'_ proximal do gene 81 do vírus da bronquite infecciosa (VBI) com 228 pb e de forma a fazer a detecção e a diferenciação desse vírus, comparando-se os resultados dessa metodologia com os obtidos na técnica convencional de RT-PCR. Todas as 11 estirpes do VBI testadas foram amplificadas pelas duas técnicas moleculares, enquanto que nenhum dos vírus heterólogos (Pneumovírus Aviário do grupo A e B, Vírus da Doença de Gumboro e o Vírus da Doença de Newcastle) ensaiados levaram a amplificação específica do gene 81. O limiar de detecção para a técnica de IC-RT-PCR foi idêntico ao do método de RT-PCR e correspondeu a 102.8 Doses Infectantes Embrionárias 50%. Para um total de 35 amostras de tecidos do trato respiratório testadas e provenientes de aves infectadas experimentalmente, 32 foram positivas pela técnica de IC-RT-PCR e também pela RT-PCR convencional, enquanto que o isolamento viral foi obtido para 22 dessas amostras. A análise do produto amplificado do gene 81 na IC-RT-PCR através da técnica de RFLP (restriction fragment length polymorphism), com as enzimas Alul e Mboll, permitiu a diferenciação das 5 estirpes de referências e dos 6 isolados de campo analisados em 4 diferentes genótipos, correspondentes às estirpes de referência M41, Connecticut, ou 8E-17, ou a um isolado de campo. Portanto, a técnica de IC¬RT -PCR demonstrou um grande potencial para ser aplicada no diagnóstico direto do VBI, apresentando vantagens sobre a técnica convencional de RT-PCR, as quais foram derivadas da combinação da especificidade da imunocaptura em fase sólida com a sensibilidade da reação de PCR, o que pode proporcionar ganho de tempo e menor custo para a manipulação de um maior número de amostras. / In this study, the immunocapture procedure followed by reverse transcription and polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) technique was standardized and applied for the amplification of 5'- proximal pari of 81 gene of infectious bronchitis virus (IBV) in infected f1uid or tissue samples, which were collected from embryonating chicken eggs or experimentally infected birds. The results of this technique were compared with those obtained in conventional RT-PCR. Ali eleven IBV strains tested were amplified, while none of the heterologous avian viral pathogens (Groups A and B Avian Pneumovirus, Newcastle Disease Virus and Gumboro Disease Vírus) gave positive results. The limit of detection for IC-RT¬PCR was identical to the common RT-PCR and corresponded to 102.8 50% embryonic infectious doses. Thirty two out of thirty five respiratory tissue samples collected from experimentally infected chickens were positive by both molecular techniques (IC-RT-PCR I common RT-PCR), whereas the vírus isolation test detected IBV in twenty two of these samples. The AluL and Mobll RFLP analysis of the 228 bp amplicon generated from IC-RT-PCR led to the discrimination of the 5 reference strains and 6 field IBV isolates in four genotypes; which were associated to the M41, to Connecticut, ar to 8E-17 strain, or to a field isolate. Therefore, the IC-RT-PCR demonstrated in this study a high potential for the application in the direct diagnosis of IBV and has relevant advantages over the conventional RT¬PCR, because it combines the specificity of the immunocapture in a solid phase with the sensitivity of the PCR, providing simplicity, rapidity and low cost for the manipulation of a high number of samples.