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Expressão das proteinas da familia PLUNC nas glandulas salivares maiores de pacientes autopsiados com AIDS em fase avançada e sem AIDS / Expression of PLUNC family protein in major salivary gland of the autopsied patients with advanced AIDS and without AIDSSilva, Andreia Aparecida da 13 August 2018 (has links)
Orientadores: Pablo Agustin Vargas, Lynne Bingle / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-13T01:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009 / Resumo: Introdução: Inúmeras lesões de origem infecciosa, cística, neoplásica e inflamatória foram reportadas nas glândulas salivares de pacientes HIV+. Objetivos: Os objetivos deste trabalho foram analisar e comparar a resposta do sistema imune inato (proteínas da família PLUNC) em glândulas salivares maiores, provenientes de pacientes autopsiados com AIDS e sem AIDS (grupo controle) no Departamento de Patologia da Faculdade de Medicina da Universidade Estadual de São Paulo (FMUSP) no período de 1996 a 2000. Material e Métodos: Os pacientes autopsiados foram divididos em 05 grupos: grupo 01- controle (pacientes HIV negativos), grupo 02- HIV+ sem alterações nas glândulas salivares maiores, grupo 03- (micobacteriose), grupo 04 (citomegalovirose) e grupo 05 (sialadenite) para a realização de reações de imunohistoquímica para os anticorpos SPLUNC 1, SPLUNC 2 A, SPLUNC 2B e LPLUNC 1. Para o grupo controle foi realizado técnica de hibridização in situ para SPLUNC 2. Resultados: a média de idade dos pacientes selecionados para o grupo controle foi de 60,92 anos + 9,48 anos enquanto que a média de idade dos pacientes HIV positivos foi de 37,75 anos + 11,11. Nos casos de micobacteriose e citomegalovirose foi observada maior intensidade de marcação nas regiões próxima a área de infecção, quando comparada com áreas na periferia da lesão para os anticorpos SPLUNC 2 A e 2B. O anticorpo LPLUNC 1 foi positivo apenas nos ductos salivares e apresentou positividade em 42,22%, 51,06% e 63,88% para as glândulas parótida, submandibular e sublingual respectivamente. Com relação à hibridização in situ, foi observado positividade em todos os casos. Conclusão: a família de proteínas PLUNC pode ter papel fundamental na proteção dos organismos frente a agentes infecciosos, no entanto são necessários maiores estudos. / Abstract: Objectives: The aim of this study was to determine the expression of PLUNC proteins in major salivary glands (MSG) of AIDS patients with or without infectious conditions and non-HIV patients using post-mortem material. Methods: Sex, age, CD4 cell count, and clinical history were obtained retrospectively from the clinical records of all patients (n=63). We analysed the expression of PLUNCs (SPLUNC1, SPLUNC2, LPLUNC1) using immunohistochemistry in parotid (n=45), submandibular (n=47) and sublingual gland (n=37) samples of AIDS patients [30 with normal histology, 21 with mycobacteriosis, 14 with cytomegalovirus (CMV) infection, 30 with chronic nonspecific sialadenitis, and 30 HIV-negative controls. In situ hybridization (ISH) for SPLUNC2 in the MSG of the HIVnegative group was performed. Immunoreactivity was assessed as positive or negative. Results: The mean age of the patients who died of AIDS (n=63) and CD4 cell count (n=44) were 37 years and 63 cells microL(-1), respectively. The mean age of the HIV negative patients was 61 years. SPLUNC 1 expression was detected in the mucous acini of submandibular and sublingual glands, and SPLUNC2 was seen in the serous cells of the MSG. LPLUNC 1 expression was only positive in the salivary ducts of the MSG. There was a higher expression of SPLUNC2 in AIDS patients with CMV infection and mycobacteriosis when compared with all other groups. The intensity of staining for SPLUNC2 was greater around the lesions than the peripheral ones. There were no significant differences between control subjects and AIDS patients without histologic alterations or with chronic nonspecific sialadenitis. ISH for SPLUNC 2 showed perinuclear positivity in the serous cells in all HIV-negative cases. Conclusions: SPLUNC1 and LPLUNC1 proteins were similarly expressed in the MSG of AIDS patients and non-HIV patients. CMV infection and mycobacteriosis increase SPLUNC2 expression in serous cells in the MSG of AIDS patients. Further studies are needed to understand the biological processes involved in SPLUNC2 expression in the MSG infected by CMV and mycobacteriosis. / Doutorado / Patologia / Doutor em Estomatopatologia
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Os efeitos da hibridização no crossover BCS-BEC com interações interbandasOliveira, Marcos Kelvin Lira de, 92-99404-7597 05 February 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-02-05 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In this work we discuss the behavior of a superconducting system described by a multiband model, so it is an extension of the BCS theory which describes well the low temperature superconductors. We consider the interbanding interaction, that is, the interaction between fermions that present different properties under the influence of hybridization, evaluating the crossover between the weak coupling (BCS) and the strong coupling (BEC) for symmetry type s Order parameter in T = 0 and in the presence of a hybridization. However, the objective of this work is to study superconductivity without a two-band model, with interband interactions, with the purpose of obtaining as equations for the superconducting Gaps and, concomitantly, to evaluate a development of the systems between the limit of weak couplings (BCS) and strong couplings (BEC) and estimate an influence that is a hybridization on the system. Using Zubarev's Green function method, we calculate interband superconducting order parameters and chemical potential as a function of the interaction 1/kpa, in order to obtain a complete study of the system. We explore the energies of excitation at the two limits of the coupling, considering their characteristics and we see that there is a discontinuity in the amplitude of the interband gap. Our results suggest that hybridization V acts at the expense of superconductivity, suppressing it, agreeing with other works, although this is not general, since some works show that V contributes to superconductivity up to a certain value and to other values, destroys it. We also notice that in interband interaction we have first and second order transitions and a tricritic point, in which We have the encounter of a first order line with a second order line. / Neste trabalho é tratado o comportamento de um sistema supercondutor descrito por um modelo multibandas, sendo isto uma extensão da teoria BCS a qual descreve bem os supercondutores de baixas temperaturas. Uma vez que a mesma se limita ao caso de uma única banda. Será Considerado a interação interbanda, isto é, a interação que se dá entre férmions que apresentam propriedades diferentes, sob a influência da hibridização, avaliando o crossover entre os limites de acoplamento fraco (BCS) até o acoplamento forte (BEC) para simetria tipo s do parâmetro de ordem em T = O. Portanto, o objetivo deste trabalho é estudar a supercondutividade no modelo de duas bandas, com interações interbandas, com o propósito de obter as equações para as amplitudes do gap supercondutor e, concomitantemente, avaliar a evolução dos sistemas entre o limite de acoplamentos fracos (BCS) e acoplamentos fortes (BEC) e estimar a influência que a hibridização tem sobre o sistema. Fazendo uso do método das funções de Green de Zubarev, calculamos os parâmetros de ordem supercondutor interbandas e o potencial químico como função da interação, a qual será descrita em termos do comprimento de espalhamento e do número de onda de Fermi, afim de obtermos um estudo completo do sistema. Exploramos as energias de excitação nos dois limites do acoplamento, considerando suas características e vimos que existe uma descontinuidade na amplitude do gap inter-banda. Nossos resultados sugerem que a hibridização V, atua em detrimento da supercondutividade, suprimindo-a, concor-dando com outros trabalhos, apesar de não ser isso geral, uma vez que alguns trabalhos mostram que V contribui para a supercondutividade até um determinado valor e para outros valores, a destrói. Percebemos também que na interação interbanda temos transições de primeira e segunda ordem e um ponto tricrítico, no qual temos o encontro de uma linha de primeira ordem com uma de segunda ordem. Este trabalho se baseia na tese do Professor Dr. Francisco Dinola.
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Mapeamento por hibridização in situ dos genes Lys Hsp70 e Hsp83 nos cromossomos meióticos do gafanhoto Schistocerca pallens (ACRIDIDAE)Vasconcelos Oliveira Silva, Sandra January 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004 / Algumas espécies de gafanhotos são pragas milenares de áreas cultivadas em
diversas regiões do mundo, provocando grandes prejuízos econômicos e ecológicos em
períodos de explosão populacional. No Brasil, as espécies mais ameaçadoras, que causam
danos significativos às lavouras e pastagens, são Rhammatocerus schistocercoides, Stiphra
robusta e Schistocerca pallens, nenhuma das quais foi geneticamente bem caracterizada,
apesar da grande importância prática. Neste trabalho foi iniciada a caracterização genética
de S. pallens, através da localização por hibridização in situ dos genes Lys, Hsp70 e Hsp83
em cromossomos meióticos. Aproximadamente 700 núcleos foram analisados para os três
genes e o percentual médio de marcação foi de 68,49%. Após análise de 108 núcleos
marcados, com uma freqüência de 94,44% o gene Lys foi mapeado no cromossomo G1. O
gene Hsp70 foi mapeado no cromossomo G2, onde foram observadas 89,94% das
marcações do total de 199 núcleos marcados. Para o loco Hsp83 foram contados 163
núcleos marcados, dos quais 97,54% das marcações foram localizadas em um cromossomo
médio identificado como M7. Para todos os genes hibridizados outras marcações foram
observadas, mas todas em freqüências inferiores a 30%. Estes são os primeiros genes
mapeados em S. pallens, sendo também os primeiros genes de cópia única mapeados na
família Acrididae. Além de servir como novos marcadores para individualização
cromossômica, os dados da localização destes genes poderão ser úteis como marcas físicas
para um eventual programa de seqüenciamento genômico da espécie
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Narrativas silenciosas: identidade e imigração na educação infantil / Silent narratives: identity and immigration in early childhood educationSantos, Priscila da Silva 05 October 2018 (has links)
Esta pesquisa se desenvolveu com o intuito de analisar como se dão os processos de hibridização identitária de crianças em contexto de imigração na Educação Infantil. Para tanto, a investigação tem como base o tripé conceitual narrativa/identidade/ infância. A partir desse tripé descrevem-se as interações de uma criança de origem boliviana com seus pares, com a pesquisadora e com as professoras, a fim de depreender como se constroem as narrativas sobre essa criança e também as negociações realizadas para que tais narrativas sejam afirmadas ou rejeitadas, tanto pelos que constituem a comunidade escolar, quanto pela própria criança imigrante. Diário de campo, fotografias, filmagens, entre outros materiais que se revelaram pertinentes à análise constituem o corpus da pesquisa. O trabalho estreita relações com a Sociologia da Infância, à medida que experimenta metodologias que tentam dar voz às crianças envolvidas na pesquisa. Os dados obtidos no interior da escola de educação infantil (narrativa do micronível) foram relacionados com a contextualização geopolítica que circunscreve a relação entre Brasil e Bolívia (narrativa do macronível), e também com documentos oficiais que orientam o currículo da Educação Infantil. A partir dos resultados obtidos, foi possível concluir que os processos de hibridização identitária de crianças em contexto de imigração se dão em três categorias de diferenciação: 1) Diferenciação horizontal (relativa às diferenças que as crianças estabelecem entre si, sendo tais diferenças muitas vezes pautadas pelos padrões presentes na sociedade, mas também pelos interesses particulares que regem as interações infantis); 2) Diferenciação hierárquica (diz respeito ao modo como são conferidos diferentes status à criança imigrante, a depender do imaginário que se tem a respeito de seu país de origem, no país em que se estabelece); e 3) Diferenciação diaspórica (a propósito do movimento impulsionado pelo sair de si em direção à diferença do outro, a fim de partilharmos as diásporas que incessantemente alimentam as constituições identitárias). / This research was developed with the purpose of analyzing how the processes of identity hybridization of children are in the context of immigration in Early Childhood. The research is based on the conceptual tripod: narrative,identity and childhood. This tripod describes the interactions of a child of Bolivian origin and his peers, the researcher and the teachers, in order to understand how these narratives about child are constructed and the negotiations carried out to affirm or reject them, considering the parties who constitute the school community and the immigrant child itself. field diary, photographs, filming, and other materials produced during the observation proved to be relevant to the analysis and constitute the corpus of the research. The work has to link closely with the Sociology of Childhood as it experiments methodologies that try to give voice to children involved in the research. The data obtained inside the school of children\'s education (micro-narrative) was linked to the geopolitical contextualization (macro-narrative) and also to official documents that guide the curriculum of Early Childhood Education. Based on the results drawn from the research, it was possible to conclude that the processes of identity hybridization of children in the context of immigration take place in three categories of differentiation: The first is \"Horizontal differentiation, which refers to the differences that children establish among themselves, in present patterns in society and a particular interests that govern children\'s interactions. The second is \"Hierarchical differentiation\", which refers to how different statuses are given to the immigrant child, depending on the imaginary one that society has made upon his country of origin, in the country in which it is established. The third is \"Diasporic differentiation\", which refers to the movement of \"moving from one\'s self\" towards the difference of the other in order to share the diasporas that incessantly feed the identity constitutions.
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Alterações na expressão do Hormônio Concentrador de Melanina (MCH) na área hipotalâmica lateral do rato ao longo do desenvolvimento pós-natal e envelhecimento /Machado, Carla de Moraes. January 2015 (has links)
Orientador: José de Anchieta de Castro e Horta Junior / Coorientador: Jackson Cioni Bittencourt / Banca: Luiz Fernando Takase / Banca: Luciana Pinato / Resumo: O hormônio concentrador de melanina (MCH) do rato é um nonadecapeptídeo presente em neurônios localizados, principalmente, na área hipotalâmica lateral (LHA) que se projetam para diversas regiões do neuro-eixo. O MCH está envolvido em diversas funções, tais como: reprodução, certos aspectos do comportamento motivado, atividade locomotora, percepção sensorial, controle de temperatura, memória, aprendizagem, ansiedade, ciclo sono-vigília e comportamento alimentar. Nesse, o MCH atua como neuropeptídeo orexígeno. Durante o envelhecimento, ocorre a diminuição no consumo de energia associada à idade. Nesse trabalho, analisamos em diferentes faixas etárias, as variações da expressão do MCH na área hipotalâmica lateral, empregando métodos esterológicos (para estimar o número de neurônios MCH-ir, área, volume e densidade neuronal), reconstrução tridimensional (para estudo da distribuição dos neurônios MCH-ir) e densitometria óptica de tecido hibridizado para reconhecimento do RNAm do ppMCH (para mensuração da área hibridizada, densidade óptica média e densidade óptica integrada [DOI]) na LHA e em suas regiões. Foram utilizados 35 ratos Sprague-Dawley machos, divididos em 7 grupos experimentais de diferentes idades: 14 (lactente), 28 (pré-púbere), 50 (púbere), 90 (adulto jovem), 210 (adulto maduro), 540 (adulto senescente) e 750 (adulto senil) dias pós-natais. Os animais foram submetidos à perfusão transcardíaca, seus encéfalos coletados e processados para análise da expressão do MCH na área hipotalâmica lateral, segundo protocolos de imuno-histoquímica e hibridização in situ. A LHA apresentou um aumento significativo no número de neurônios apenas entre os grupos de 14 e 28 dias e sua área e volume foram significativamente menores apenas no grupo de 14 dias em relação a todos os grupos, com exceção do grupo de 750 dias. No entanto, com relação a densidade neuronal não foram observadas... / Abstract: The Melanin-Concentrating Hormone (MCH) is a nonadecapeptide located mainly in neurons in the lateral hypothalamic area (LHA), which innervate several regions of neuraxis. MCH is involved in many functions as reproduction, aspects of motived behaviors, motor activity, sensorial information, temperature control, memory, learning, anxiety, sleep-wake cycle and feeding behavior in which the MCH plays an orexigenic role. The energy consumption in aging is reduced as well as, the expression of MCH presents alterations associated with age. Therefore, we analyzed the variations in the expression of MCH at different ages in the lateral hypothalamic area, using stereology (to estimate the number of MCH-ir neurons, area, volume and neuronal density), 3D reconstruction (to study the distribution of MCH-ir neurons) and optical density after in situ hybridization protocol for ppMCH RNAm (to measure the hibridizated area, the mean optical density and the integrated optical density [IOD]) in the LHA and its three regions. In this study, 35 animals were divided in 7 experimental groups of 14 (neonate), 28 (prepubescent), 50 (pubescent), 90 (young adult), 210 (middle aged adult), 540 (senescent adult) and 750 (elderly adult) postnatal days. All the animals were perfused via the ascending aorta, the brains were collected and processed by immunohistochemistry and in situ hybridization protocols to analyze the expression of MCH in the lateral hypothalamic area. LHA neurons number increased only between groups of 14 and 28 days, and its area and volume significantly smaller in 14-days group when in respect to all other groups but the 750-days one. However, there weren't differences in neuronal density among groups. MCH-ir neurons distribution in LHA and contiguous regions was similar among all groups as well. Hypothalamic MCH-ir neurons has shown uniform rates in and out of LHA, but after analyzing its distribution in mamillary, tuberal and anterior ... / Mestre
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Inferência das tecnologias nas narrativas teatraisPozzetti, Gislaine Regina 28 September 2017 (has links)
Submitted by Filipe dos Santos (fsantos@pucsp.br) on 2017-10-27T12:27:00Z
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Previous issue date: 2017-09-28 / This work problematizes the inferences that the technologies have contributed to the theatrical constituents throughout the history culminating with the necessity of their reframing, from the digital technologies. The objective is to discuss the issues that involve the conditions of presence, creation, time, space and participation of the spectator in today's theatrical practices. For this, it is questioned, as a problem situation of this thesis, that technical, aesthetic and poetic resonances the digital technologies inferred in theatrical narratives in the 21st century. The discussion is developed with bibliographical and cartographic research as a method, which supports the guiding thread of the new arrangements, configurations, hybridizations and deterritorizations that in the human historical trajectory were organized to give feedback to theatrical practices. Case studies bring to light paradigm reconfigurations of theatrical constituencies, sacred from the Greeks, such as the spectator paradigm that contemplates, acts, and interacts; The actor paradigm that begins to act in differentiated qualities of presence; The paradigm of text dramaturgy, which begins to be constructed in co-authoring with the user; The representation space paradigm consisting of bits; The paradigm of time, in which the symmetry experienced in the action becomes uninterrupted, and finally, the paradigm for the scenic elements that, like the presence, inhabit and constitute now in physical environments, sometimes in the liquid environments, without losing Its ephemeral art feature / Este trabalho problematiza as inferências que as tecnologias aportaram às constituintes teatrais ao longo da história e que culminaram na necessidade de resignificação destas, a partir das tecnologias digitais. Tem-se como objetivo discutir as questões que envolvem as condicionantes de presença, de criação, de tempo, de espaço e de participação do espectador nas práticas teatrais da atualidade. Para tal, questiona-se, como situação problema desta tese, quais ressonâncias técnicas, estéticas e poéticas as tecnologias digitais inferem nas narrativas teatrais no século XXI. Desenvolve-se a discussão tendo como método as pesquisas bibliográfica e cartográfica, que apoiam o fio condutor dos novos arranjos, configurações, hibridizações e desterritorializações que na trajetória histórica o homem organizou para retroalimentar as práticas teatrais. Estudos de casos trazem à luz reconfigurações de paradigmas das constituintes teatrais, sacralizadas desde os gregos, tais como, o paradigma de espectador que contempla, age e interage; o paradigma de ator que passa a atuar em qualidades de presença diferenciadas; o paradigma da dramaturgia de texto, que passa a ser construída em coautoria com o usuário; o paradigma de espaço de representação constituído em bits; o paradigma de tempo, em que a simetria vivida na ação passa a ser ininterrupta e, finalmente, o paradigma para os elementos cênicos que, tal como a presença, habitam e se constituem ora em ambientes físicos, ora nos ambientes líquidos, sem contudo perder sua característica de arte do efêmero
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Período mínimo para a aquisição do Tomato severe rugose virus (ToSRV) por Bemisia tabaci biótipo B em tomateiros e identificação de sítios de aquisição do vírus / Minimum time for the acquisition of Tomato severe rugose virus (ToSRV) by Bemisia tabaci biotype B in tomato plants and identification of virus acquiring sitesToloy, Rodrigo Solci 21 September 2015 (has links)
O Brasil atualmente ocupa a nona posição entre os maiores produtores de tomate (Solanum lycopersicum L.) do mundo. O desenvolvimento das plantas e a produção dos tomateiros, no entanto, podem ser afetados por diversos problemas fitossanitários, entre os quais aqueles causados por vírus. Atualmente, entre as viroses que mais tem se destacado estão aquelas causadas por espécies dos gêneros Begomovirus, Crinivirus e Tospovirus. Entre os begomovirus, especial atenção tem sido dada ao Tomato severe rugose virus (ToSRV), pois tem sido a espécie prevalente na maioria das regiões produtoras de tomate no país. Esse begomovirus, que até o momento foi relatado somente no Brasil, é transmitido pelo aleirodídeo (\"mosca branca\") Bemisia tabaci biótipo B, numa relação persistente circulativa. 8Estudos da relação do ToSRV com esse aleirodídeo indicaram períodos mínimos de acesso à aquisição e inoculação de 5 minutos. Esse trabalho teve como objetivos: a) identificar o menor tempo de alimentação da B. tabaci biótipo B para a aquisição do ToSRV em tomateiros e b) identificar possíveis sítios de aquisição do ToSRV em tecido foliar de tomateiro via microscopia de luz de epifluorescência por hibridização in situ. Insetos livres de vírus foram confinados em folha de tomateiro infectado com o ToSRV durante 1, 3 e 5 minutos e 24 h (controle) para a aquisição do vírus. Parte dos insetos foi utilizada para a detecção do vírus no vetor, enquanto a outra parte foi usada em testes de transmissão do ToSRV para tomateiros. A detecção do vírus no inseto e nos tomateiros foi feita por PCR. B. tabaci biótipo B foi capaz de adquirir o ToSRV nos diferentes tempos de alimentação. Os insetos foram capazes de transmitir o vírus para tomateiros, com eficiência de 33% a 100%. Análises de cortes histológicos longitudinais na região das nervuras de folhas de tomateiro infectados com o ToSRV, em microscopia de luz de epifluorescência por hibridização in situ, revelaram vários pontos de fluorescência localizados nas células do parênquima do floema, incluindo as células companheiras e nas células da epiderme. Essa fluorescência não foi constatada em tecido sadio. A localização do ToSRV em células do parênquima foliar do tomateiro, associada ao conhecimento de que esse aleirodídeo efetua picadas de prova intracelulares, de curta duração, durante o processo de penetração intercelular do estilete, podem explicar a aquisição deste begomovirus durante curtíssimos períodos de alimentação. / Brazil currently ranks ninth position among the largest tomato (Solanum lycopersicum L.) producers in the world. Several diseases, including those caused by virus, however, can affect plant growth and yield of tomatoes. Currently, among the most important virus diseases are those caused by species of the Genus Begomovirus, Crinivirus and Tospovirus. Among the begomoviruses, especial attention has been given to Tomato severe rugose virus (ToSRV), because it has been the prevalent species in most of the tomato producing regions of the country. This begomovirus, which so far has only been reported in Brazil, is transmitted by the whitefly Bemisia tabaci biotype B, in a persistent circulative relationship. Studies on the virus-vector relationship indicated five minutes as the minimum period of access for virus acquisition and inoculation by the vector. This study aimed to: a) identify the shortest feeding period of B. tabaci biotype B for acquisition of ToSRV in tomato plants, and b) identify possible ToSRV acquisition sites in infected leaf tissue via epifluorescence light microscopy by in situ hybridization. Virus free insects were confined in tomato leaf infected with ToSRV during 1, 3 and 5 minutes and 24 hours (control) for virus acquisition. Part of the insects was used for virus detection in the vector, while the other part was used on ToSRV transmission tests for tomato plants. Virus detection in both, insect tomato plants, was carried out by PCR. B. tabaci biotype B was capable to acquire the ToSRV on the different feeding times. The insects were capable to transmit the virus to the tomato plants, with efficiency of 33% to 100%. Analysis of longitudinal histological cuts of ToSRV infected leaves, in epifluorescence light microscopy by in situ hybridization, revealed several fluorescence spots located in phloem parenchyma cells, including the companion and the epidermal cells. Fluorescence was not verified on healthy tissue. The location of ToSRV in parenchyma cells of tomato leaf, associated with the knowledge that this insect performs very short intracellular feeding probes, during the process of intercellular penetration of the stylet, may explain the acquisition of this begomovirus during very short feeding periods.
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Mecanismos de evolução cromossômica e diferenciação cariotípica em espécies das subfamílias Hylinae (tribos Cophomantini e Lophiohylini) e Phyllomedusinae (Hylidae, Anura, Amphibia)Gruber, Simone Lilian [UNESP] 14 February 2013 (has links) (PDF)
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000713629.pdf: 1305461 bytes, checksum: fc93fa24bfaab78fbbbdb8eb677acfba (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A classe Amphibia, especialmente a família Hylidae, passou por extensas modificações na taxonomia e sistemática, realizadas com base, principalmente, em dados moleculares, mas quase nenhuma contribuição das informações citogenéticas. Os hilídeos são os anuros mais abundantes em número de espécies, porém, a maioria delas foi sequer cariotipada e grande parte das informações disponíveis na literatura está restrita apenas ao número e morfologia dos cromossomos. No presente trabalho, foram cariotipadas 28 espécies da subfamília Hylinae, sendo da tribo Cophomantini Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; da tribo Lophiohylini, as espécies Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; e da subfamília Phyllomedusinae, duas espécies, Phyllomedusa distincta e P. tetraploidea, bem como seus híbridos triploides. A maioria das espécies da subfamília Hylinae compartilha cariótipo 2n=24, FN=48, bandas C majoritariamente centroméricas e RON em cromossomos pequenos do par 11 em Cophomantini e do par 10 em Lophiohylini. As exceções são as do gênero Phyllodytes, da tribo Lophyohylini, cujas espécies têm 2n=22, FN=44 e RON no par 2, e as do gênero Aplastodiscus, da tribo Cophomantini, cujas espécies têm diferentes números cromossômicos de 2n=24, 2n=22, 2n=20 e 2n=18, mas compartilham o mesmo padrão de bandamento C e o mesmo par marcador de RON. As bandas de replicação por incorporação de BrdU... / The Amphibia class, especially the family Hylidae, went through extensive changes in taxonomy and systematics, based mainly on molecular data, but with almost no contribution of cytogenetic information. This family is the most speciose among the anurans, however, the great majority of the species was never karyotyped, and most of the cytogenetic information on hylids available in the literature is restricted to the number and morphology of the chromosomes. In the present work we karyotyped 28 representatives of the subfamily Hylinae, belonging to the tribe Cophomantini the species Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; to the tribe Lophiohylini the species Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; and two species of the subfamily Phyllomedusinae, Phyllomedusa distincta and P. tetraploidea, as well as their triploid hybrids. Most species of the subfamily Hylinae share the same karyotype with 2n=24, FN=48, C bands with predominantly centromeric distribution, and NOR located on small chromosomes belonging to the pair 11 in Cophomantini and to the pair 10 in Lophiohylini. The exceptions are the genus Phyllodytes, from the tribe Lophyohylini, whose species have 2n=22, FN=44 and NOR in the pair 2, and the genus Aplastodiscus, from the tribe Cophomantini, whose species have different chromosome numbers of 2n=24, 2n=22, 2n=20, Abstract and 2n=18, but sharing the same C-banding pattern and the same pair of NOR marker... (Complete abstract click electronic access below)
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Análise da expressão gênica diferencial em ostras-do-pacífico Crassostrea gigas expostas a esgoto doméstico in situSilva, Guilherme de Toledo e 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Univesidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T20:51:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
270064.pdf: 1678063 bytes, checksum: de89498cbd9fdaf3dc0f4c547d9752f1 (MD5) / Nas últimas décadas, a contaminação dos ecossistemas marinhos tem aumentado como consequência da atividade humana, expondo os organismos a uma variedade de contaminantes oriundos da atividade industrial, agricultura e efluentes urbanos. O despejo de esgoto doméstico é a principal fonte de contaminação em ambientes costeiros e é considerado como uma das principais causas da diminuição da qualidade destes ecossistemas. Estudos que vêm sendo desenvolvidos no Laboratório de Biomarcadores de Contaminação Aquática e Imunoquímica visam a identificação e validação de novos biomarcadores de exposição ao esgoto doméstico em ostras para que possam ser futuramente utilizadas em programas de avaliação e biomonitoramento dos efeitos tóxicos causados por estes contaminantes. Este trabalho está dividido em dois capítulos. No primeiro capítulo são apresentados os resultados de experimentos realizados com ostras Crassostrea gigas expostas em um ambiente contaminado por esgoto doméstico. Foram analisadas a expressão de alguns genes previamente identificados em uma biblioteca subtrativa supressiva de cDNA em brânquias de C. gigas expostas a esgoto doméstico em condições de laboratório. A expressão do gene FABP apresentou uma indução significativa (28x) após 24 h de exposição, enquanto o gene GSTO obteve um aumento significativo na expressão após 1, 2 e 7 dias de exposição (8, 3.5 e 3.3x respectivamente). No segundo capítulo estão apresentados os resultados e uma discussão sobre os genes ativados e identificados em uma biblioteca subtrativa supressiva de cDNA em glândula digestiva de ostras C. gigas expostas por 24h no ambiente, sob condições de exposição real ao esgoto doméstico não tratado. Genes de diferentes categorias de função biológica foram encontrados após buscas no GenBank, incluindo alguns relacionados a resposta ao estresse, classe tipicamente utilizada em programas de biomonitoramento como biomarcadores moleculares de exposição. Também foram identificados genes relacionados com a o citoesqueleto, cadeia respiratória, desenvolvimento e diferenciação, divisão celular, metabolismo básico, maquinaria transcricional e traducional, transporte e armazenamento. Ambos trabalhos complementam os estudos em andamento no laboratório, ajudando na viabilização de metodologias práticas para o monitoramento de recursos marinhos utilizando organismos sentinela.
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Estudo clínico e citogenético-molecular de pacientes portadores de cromossomos autossômicos em anel / Clinical and molecular cytogenetic study of patients with autosome ring chromosomeGuilherme, Roberta dos Santos [UNIFESP] 28 July 2010 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2010-07-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os cromossomos em anel geralmente resultam de quebras em seus braços curto e longo seguidas pela fusão das extremidades fraturadas, causando a perda de material genético. Atualmente, com o surgimento de técnicas moleculares mais sensíveis é possível definir os pontos de quebra com precisão e descrever o mecanismo de formação de cada anel. No presente trabalho, foram analisados 13 pacientes com cromossomos autossomos em anel. Para avaliação da instabilidade do cromossomo em anel foram avaliadas 300 metáfases de cada paciente, por meio de bandamento G e de FISH com sonda centromérica. Os pacientes portadores de r(14) e r(15) foram avaliados em dois períodos diferentes, com um intervalo de 19 anos, para a realização do estudo longitudinal. Somente os anéis dos cromossomos 4 (caso II) e 22 (casos XII e XIII) apresentaram-se estáveis de acordo com os critérios de Kosztolanyi (1987), enquanto os demais foram considerados instáveis. O estudo longitudinal mostrou que os r(14) e r(15) passaram de estáveis a instáveis no intervalo de tempo analisado. Apesar da instabilidade dos cromossomos em anel ter aumentado ao longo dos anos, esses dois pacientes não apresentaram agravamento no seu quadro clínico, tendo este se mantido estável. Através da técnica de SNP-array foram definidos os pontos de quebra e os mecanismos de formação dos anéis em 12 pacientes. Para os anéis nos quais não foram observadas perdas de material genético no braço curto e nem no braço longo foram utilizadas as técnicas de MLPA e de FISH com sondas subteloméricas e teloméricas, respectivamente. Assim, os cariótipos dos pacientes foram determinados como: 46,XY,r(3)(p26.1q29), 46,XX,r(4)(p16.3q35.2), 46,XY,r(10)(p15.3q26.2), 46,XX,r(10)(p15.3q26.13), 46,XY,r(13)(p13q31.1), 46,XY,r(14)(p13q32.33), 46,XX,r(15)(p13q26.2), 46,XY,r(18)(p11.32q22.2), 46,XX,r(18)(p11.32q21.33), 46,XX,r(18)(p11.21q23), 46,XY,r(22)(p13q13.33) e 46,XX,r(22)(p12q13.2). Verificamos que os anéis cromossômicos foram formados por meio de diferentes mecanismos: quebras em ambos os braços cromossômicos seguidas pela fusão das extremidades fraturadas (pacientes IV, VIII e X); quebra em um dos braços cromossômicos seguida pela fusão com região subtelomérica do outro braço (pacientes I, II, VII e XII); quebra em um dos braços cromossômicos seguida pela fusão com a região telomérica oposta (pacientes III e IX); fusão de regiões subteloméricas (paciente VI) e fusão de regiões teloméricas (paciente XI). Assim, os r(14) e um r(22) podem ser considerados anéis completos, uma vez que não houve perda de material genético relevante. O r(13) apresentou um mecanismo de formação mais complexo resultante da deleção de 11,1 Mb concomitante com uma duplicação intersticial de 1,5 Mb. Seu cariótipo foi definido como 46,XY,r(13)(p13q33.1).arr13q33.1(101,543,509-103,001,462)x3,13q33.1q34(103,003,268-114,142,980)x1 dn. Nós concluímos que o fenótipo dos pacientes portadores de cromossomos em anel podem estar relacionados a diferentes fatores, entre eles instabilidade do cromossomo em anel e a haploinsuficiência gênica. Além disso, fatores epigenéticos relacionados à configuração do cromossomo em anel poderiam alterar a expressão gênica, uma vez que os pacientes com r(14) e r(22) apresentam alterações fenotípicas apesar serem portadores de anéis completos. / Ring chromosomes usually result from breaks in their short and long arms followed by fusion of both ends causing genetic material loss. Nowadays with more sensible molecular techniques it is possible to better define the breakpoints and mechanism of ring chromosome formation. In this study we analyzed 13 patients with autosome ring chromosomes. We scored 300 metaphases from each patient lymphocyte cultures, using G banding and FISH with centromeric probes, in order to investigate the ring chromosome instability. A longitudinal study was done in patient VI with r(14) and in patient VII with r(15). They were investigated in two different periods with 19 years difference. Only the ring chromosomes 4 (case II) and 22 (cases XII and XIII) were considered stable since they present al lest 95% metaphases cells with only one monocentric ring, while the others were considered unstable. The longitudinal study showed that the r(14) and r(15) turned unstable during the period analyzed. In spite of the ring chromosomes instability had increased over the years, these patients did not present worse in clinical findings. Using the SNP-array technique, breakpoints and mechanisms of ring chromosome formation were determined in 12 patients. For the rings that we did not observe loss of genetic material in the short neither in the long arm MLPA and FISH techniques with subtelomeric and pantelomeric probes, respectively, were used. Thus, the patients´ karyotypes were determined as: 46,XY,r(3)(p26.1q29), 46,XX,r(4)(p16.3q35.2), 46,XY,r(10)(p15.3q26.2), 46,XX,r(10)(p15.3q26.13), 46,XY,r(13)(p13q31.1), 46,XY,r(14)(p13q32.33), 46,XX,r(15)(p13q26.2), 46,XY,r(18)(p11.32q22.2), 46,XX,r(18)(p11.32q21.33), 46,XX,r(18)(p11.21q23), 46,XY,r(22)(p13q13.33) and 46,XX,r(22)(p12q13.2). Different mechanisms were found to be involved in ring chromosome formation: from breaks in both chromosome arms, followed by end-to-end reunion (patients IV, VII-X and XII); from a break in one chromosome arm followed by fusion with the subtelomeric region of the other (patients I-II); from a break in one chromosome arm followed by fusion with the opposite telomeric region (patients III and IX); from fusion of two subtelomeric regions (patient VI); from telomere-telomere fusion (patient XI). Thus, the r(14) and one r(22) can be considered complete rings, since there was no loss of relevant genetic material. The r(13) showed a more complex mechanism of formation resulting in a deletion of 11.1 Mb concomitant with an interstitial duplication of 1.5 Mb with karyotype determined as 46,XY,r(13)(p13q33.1).arr13q33.1(101,543,509-103,001,462)x3,13q33.1q34(103,003,268-114,142,980)x1 dn. We concluded that the phenotypes of ring chromosome patients can be related with different factors, including gene haploinsufficiency, gene duplication and ring instability. Epigenetic factors related to gene expression changes due to the circular architecture of the ring chromosome must also be considered, since even patients with complete ring chromosomes can present associated phenotypic alterations, as observed in our patients with complete r(14) and r(22). / FAPESP: 2007/58735-5 / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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