Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-10-18T16:25:49Z No. of bitstreams: 1 Maria Betania de Queiroz Rolim.pdf: 788007 bytes, checksum: eb84e4a25987ce5bcd8eff3754ddd230 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-18T16:25:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Betania de Queiroz Rolim.pdf: 788007 bytes, checksum: eb84e4a25987ce5bcd8eff3754ddd230 (MD5) Previous issue date: 2013-08-20 / In this work the purpose was to investigate the quality of honey marketed in popular markets of the City of Recife, Pernambuco. On total, 55 honey samples were submitted to carbon isotopic evaluation, microbiological and physicochemical tests, for, respectively, detect adulteration with corn sugar and cane sugar; identify coliforms 35°C and 45°C, mold and yeasts; and determine indexes of moisture, hydroxymethylfurfural, ash, reducing sugars, apparent sucrose, water insoluble solids, diastase activity and acidity. The results revealed that 31 (56,36%) samples were adulterated with sugars, 46 (83,64%) honeys were contaminated with molds and yeasts and 53 (96,36%) indicated physicochemical parameters unconforming with the Technical Regulation of Identity and Quality of Honey. Pure and adulterated honeys with C4 source, contaminated by fungi and / or physicochemically compromised, are marketed at the popular markets, in City of the Recife. Its ingestion may harm the consumer by risk acquire products unfit for consumption, with nutritional depreciation and microbial contamination. / Neste trabalho o objetivo foi pesquisar a qualidade de méis comercializados nas feiras-livres e mercados públicos da Cidade do Recife, Pernambuco. Ao total, 55 amostras de mel foram submetidas à análise isotópica do carbono, testes microbiológicos e ensaios físico-químicos, a fim de, respectivamente, detectar adulteração com açúcares provenientes do milho ou cana-de-açúcar; identificar coliformes 35°C, coliformes 45°C, bolores e leveduras; e determinar os índices de umidade, hidroximetilfurfural, cinzas, açúcares redutores, sacarose aparente, sólidos insolúveis em água, atividade diastásica e acidez. Os resultados revelaram que 31 (56,36%) amostras estavam adulteradas com açúcares, 46 (83,64%) apresentaram contaminação com bolores e leveduras e 53 (96,36%) indicaram parâmetros físico-químicos em desacordo com o Regulamento Técnico de Identidade e Qualidade do Mel. Méis puros e adulterados com açúcares provenientes de fontes C4, contaminados por fungos e / ou comprometidos físico-quimicamente, são comercializados nas feiras-livres e mercados-públicos, distribuídos na Cidade do Recife. Sua ingestão pode causar prejuízos à população consumidora pelo risco de pessoas adquirirem produtos impróprios ao consumo, com depreciação nutricional e / ou contaminação microbiana.

A interação entre bactérias e plantas resulta na ocorrência de vários processos biológicos no ambiente e pode ser regulada por diferentes fatores. Considerando que um recíproco reconhecimento ocorre entre as espécies de bactérias e plantas, alterações nos fatores bióticos e abióticos interferem diretamente nesta interação levando a modificações na composição das comunidades bacterianas associadas às plantas. No presente trabalho foram avaliados diferentes fatores que estão diretamente relacionados a este assunto. Atualmente, a aplicação de técnicas de microbiologia molecular permite acessar alterações causadas nestas comunidades de maneira independente do cultivo bacteriano. Desta maneira, foi demonstrado que na rizosfera de plantas de tabaco, os diferentes estágios de desenvolvimento são os principais determinantes da composição da comunidade bacteriana em detrimento do genótipo das plantas, sejam estas transgênicas ou convencionais. Utilizando plantas transgênicas e convencionais de eucalipto de diferentes genótipos, foi verificado que diferentes plantas não transgênicas podem apresentar comunidades bacterianas mais distintas do que quando os clones não transgênicos são comparados com os transgênicos. No entanto, efeitos específicos podem ocorrer na interação bactéria-planta, como o observado pela inibição da população de Methylobacterium spp. em plantas transgênicas de eucalipto TR-15. Avaliando o efeito da inoculação de bactérias endofíticas na composição de comunidades bacterianas associadas à plantas de batata de diferentes cultivares, os resultados mostram que a inoculação de Pseudomonas putida altera a comunidade bacteriana de maneira similar a alteração da variedade da planta. Os demais isolados avaliados, classificados como Paenibacillus sp. e M. mesophilicum, causam menores alterações na composição das comunidades bacterianas. Adicionalmente foi demonstrado que a colonização das plantas de batata pelo endófito P. putida resulta em pequena alteração no perfil metabólico da planta hospedeira. Por fim, buscando melhores métodos de isolamento da comunidade bacteriana da rizosfera de batata, os resultados mostraram que a mimetização do ambiente pode resultar em melhor acesso da diversidade bacteriana por meio de isolamento e cultivo das espécies componentes desta comunidade. / The plant-bacteria interactions result in the occurrence of biological process in the environment and might be regulated by different factors. Considering that a reciprocal recognition occur amongst bacteria and plants species, shifts in biotic and abiotic factors interfere directly on these interactions, leading to modifications in the composition of bacterial communities to plants associated. In the present work different factors related to this subject were evaluated. Nowadays, the applications of techniques of molecular microbiology allow assessing the shifts caused on these communities by a culture independent approach. On this way, it was demonstrated that in rhizosphere of tobacco plants, different stages of plants development are main determinants of bacterial community composition rather than the plants genotypes, transgenic or not. Using plants transgenic or not, carrying different genotypes, it was verified that different non-transgenic plants could harbor bacterial communities more distinct than those observed in association with transgenic plants. However, specific effects could be observed like the inhibition of Methylobacterium spp. population in eucalyptus transgenic plants TR-15. Considering the effect of endophytic bacteria inoculation in the composition of bacterial communities associated to different cultivars of potato plants, the results show that inoculation of Pseudomonas putida causes similar shifts in the bacterial community similarly to those observed when different cultivars are considered. Other evaluated strains, classified as Paenibacillus sp. and M. mesophilicum, caused minor alterations in the composition of bacterial communities. In addition, it was demonstrated that plant colonization by endophytic P. putida results in small effects on the metabolic profile of host plant. At least, aiming better methodologies for bacteria isolation from potato rhizosphere, the results show that mimicking the natural environment could result in a better assessment of bacterial diversity by isolation of species present in this community.

A mussarela de leite de búfala, principal queijo obtido a partir desse leite no Brasil, é um produto praticamente novo no mercado, com alta aceitação pelos consumidores e excelentes perspectivas. Seguindo tecnologia de produção tradicional italiana, caracteriza-se pela intensa manipulação durante a sua elaboração. No presente trabalho, avaliou-se a qualidade microbiológica de duas marcas comerciais de queijo mussarela de leite de búfala, sendo uma das marcas comercializada em embalagem com soro (A) e a outra em embalagem sem soro e a vácuo (B), adquiridas no comércio varejista da cidade de Piracicaba/SP. As análises microbiológicas compreenderam a determinação do NMP de coliformes totais e fecais, a pesquisa de Listeria spp., a contagem de Staphylococcus coagulase-positiva e a pesquisa de Salmonella spp. Com base nos resultados obtidos, pode-se afirmar que as duas marcas analisadas encontram-se em acordo com os padrões microbiológicos legais vigentes. No entanto, pôde-se notar que a qualidade microbiológica dos queijos comercializados em embalagem com soro mostrou-se inferior à dos oferecidos ao consumo em embalagem sem soro e a vácuo. / Buffalo mozzarella cheese, main cheese obtained from buffalo milk in Brazil, is practically a recent product in the market, showing high acceptance by consumers and excellent perspectives. Following traditional italian production tecnology, this cheese is intensely manipulated during its manufacture. In this study, the microbiology quality of two commercial brands of buffalo mozzarella cheese was evaluated, being one of the brands presented in bag with whey (A) while the other one is presented in bag without whey and under vacuum (B). The samples were acquired in the Piracicaba city commerce. Microbiology analysis comprehended the determination of the MPN of total and fecal coliforms, the Listeria spp. presence / absence, the coagulase-positive Staphylococcus accounting and the Salmonella spp. presence / absence. Based on the analysis results, both brands are according to current legal microbiology standards specifications. However, the microbiology quality of the cheeses packed in bag with whey was lower than the microbiology quality of those offered in bag without whey and under vacuum.

As rizobactérias promotoras de crescimento (PGPR) são microrganismos que ocorrem naturalmente no solo, são conhecidas por proporcionar melhorias no desenvolvimento das plantas atuando de diversas formas. Bacillus subtilis (cepa GB03) é uma PGPR disponível para comercialização como fungicida biológico concentrado, utilizada no tratamento de sementes de diversas culturas como algodão, soja, amendoim, trigo e cevada. Destaca-se pela capacidade de promover o crescimento de plantas por meio da emissão de voláteis. Vários estudos com Arabidopsis thaliana já comprovaram que B. subtilis (GB03) é capaz de auxiliar no desenvolvimento da planta por meio da promoção de crescimento e pela supressão de patógenos habitantes de solo. No entanto, o seu papel na proteção de plantas contra a herbivoria de insetos ainda não é bem caracterizado. Deste modo, buscou-se avaliar os efeitos da interação de B. subtilis (GB03) com plantas de rúcula (Eruca sativa) e Plutella xylostella (traça-das-crucíferas). Este inseto pertence à ordem Lepidoptera, considerado praga de maior importância no cultivo de Brassicaceae ao redor do mundo. Devido à sua alta prolificidade e capacidade de adaptação e ao seu curto ciclo de vida, tornou-se uma das pragas mais resistentes e de difícil controle da agricultura. Atualmente, os custos em escala mundial com o controle da praga anualmente chegam em torno de US $ 4 a 5 bilhões. Foram utilizados dois tratamentos, plantas inoculadas com B. subtilis (GB03) e controle (plantas não inoculadas). Avaliou-se o crescimento de plantas de rúcula e o peso seco de parte aérea. Para avaliar o desempenho e dano de P. xylostella em ambos tratamentos, previamente foram pesados grupos de quinze lagartas e submetidas a alimentação de plantas de rúcula durante 24 horas. Posteriormente, as lagartas foram retiradas e pesadas novamente e a área foliar consumida foi calculada por meio do software editor de imagens ImageJ®. A preferência de oviposição do inseto foi testada por meio de olfatometria, composta apenas de pistas olfativas e em arenas contendo tanto pistas olfativas quanto visuais. A emissão de voláteis foi caracterizada quantitativamente e qualitativamente por cromatografia gasosa e analisada por espectrometria de massas. A inoculação com GB03 em plantas de rúcula promoveu melhor crescimento das plantas em relação ao tratamento controle, ao mesmo tempo em que diminuiu os danos pelo consumo alimentar do inseto na planta. P. xylostella não apresentou distinção entre os odores das plantas nos testes de olfatometria. Entretanto, observou-se menor número de ovos em plantas com GB03 nos bioensaios de arena. Não foram constatadas diferenças significativas na emissão total de voláteis entre os tratamentos com e sem GB03, no entanto, foram encontradas concentrações diferentes dos compostos (Z)-3-hexenol e 2-ethyl-1-decanol. Outros testes devem ser realizados com a finalidade de estabelecer o papel desempenhado por GB03 na indução de defesas de plantas contra insetos. / The plant growth promoting rhizobateria (PGPR) are microorganisms that naturaly live in the soil, known by improving the plants\' development in many ways. Bacillus subtilis (strain GB03) is a comercial available PGPR, sold as a concentrated biological fungicide, applied in seed treatment of different cultures as cotton, soybean, peanut, wheat and barley. Moreover, it stands out by its capacity of plant growth promoting via volatiles emission. Several studies with Arabidopsis thaliana showed that B. subtilis (GB03) can help the plant development via growth promotion and by soil pathogens supression. However, its role in plant protection against insect herbivory has not been characterized yet. Thus, it aimed to evaluate the interaction effects among B. subtilis (GB03), arugula plants (Eruca sativa) and Plutella xylostella (Diamondback moth). This insect belongs to the order Lepidoptera and have been considered the main pest in Brassicaceae fields around the world. Due to its high prolificacy and plasticity in field survival, and its short life cycle, it has become one of the most resistant and hard control pest in agriculture. Currently, the annualy world costs with this pest control is about US $ 4-5 bilions. Here, it was used two treatments, innoculated plants with B. subtilis (GB03) and control (non-innoculated plants). The arugula plants growth and dry mass of shoots were evaluated. To analyze the performance and damage by P. xylostella in both treatments, it was previously weighed groups with fifteen caterpillars and submitted to feeding on arugula plants during 24 hours. After that, the caterpillars were removed and weighed again and the consumed leaf area was calculated by the image editor software ImageJ®. The insect oviposition preference was tested by olfactometry, with only olfactory cues and in arenas containing both, olfactory and visual cues. Volatiles emission was quantitatively and qualitatively characterized by gas chromatography and analyzed by mass spectrometry. GB03 innoculation in arugula plants promoted a better growth when compared to control, and, at the same time, there was an increasing in the plant damage by insect food consumption. P. xylostella did not show distinction between odors of the plants in olfactometry tests. Although, it was observed less number of eggs in plants with GB03 in arena bioassays. It was not found significant differences in total volatile emission between the treatments with and without GB03, even though different concentrations of (Z)-3-hexenol and 2-ethyl-1-decanol were observed. Other tests must be performed in order to estabilish the role played by GB03 in plant induction defense against insects.

Sabe-se que humanos, plantas e animais são colonizados por uma elevada diversidade de microrganismos e que esses organismos eucariotos dependem destes microrganismos para manutenção do seu desenvolvimento. Usando dois modelos de associação microrganismo-hospedeiro, foi testado a hipótese de que hospedeiros pertencentes a domínios da vida distintos, apesar de suas particularidades estruturais, genotípicas, filogenéticas e fisiológicas, compartilham similaridades nos modos de associação com a comunidade bacteriana. Sendo assim, o objetivo do presente trabalho foi mapear a comunidade bacteriana associada a plantas do gênero Anthurium endêmicas e/ou não. Paralelamente, mapear a comunidade bacteriana associada a gêneros distintos de cianobactérias, ao longo da curva de crescimento e quando esta é submetida a condições de cultivo distintas. Como resultados, primeiramente, foi observado que plantas Anthurium alcatrazense endêmicas da Ilha apresentam riqueza e diversidade menor que as plantas da espécie Anthurium loefgrenii coletada na ilha de Alcatrazes e também menor que as plantas Anthurium intermedium e Anthurium pentaphyllum coletadas na região de continente. Também foi observado que a estrutura da comunidade bacteriana associada as plantas de A. alcatrazense é distinta quando comparada com as plantas coletadas no continente e também da própria ilha de Alcatrazes. Essa dissimilaridade foi principalmente representada por OTUs afiliadas à Betaproteobacteria e Gammaproteobacteria. Esses resultados sugerem especificidade microrganismo-hospedeiro. Considerando a associação cianobactéria e bactérias heterotróficas, os resultados demonstraram que a comunidade bacteriana associada é especifica de acordo com o gênero de cianobactéria, composta principalmente por classes apresentando abundância relativa de sequencias distintas como, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Flavobacteria e Cytophagia. Por outro lado, foi possível observar que ao longo das fases de multiplicação da linhagem Microcystis aeruginosa, ocorre uma sucessão de grupos bacterianos, sendo principalmente representado pela variação da abundância de Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria e Flavobacteria relativo a fase estacionaria de multiplicação. Quando submetida em condições de cultivo distintas, foi possível observar que variações nas taxas de multiplicação da cianobactéria influenciaram uma modulação da estrutura da comunidade bacteriana associada, desta forma sugerindo que rápidas alterações na estrutura da comunidade bacteriana associada a M. aeruginosa, é resultado de processos de auto-regulação entre cianobactéria e bactérias heterotróficas associadas. De forma geral, pode-se sugerir que hospedeiros distintos apresentam padrões de associações com as bactérias similares, podendo estas similaridades sugerir estratégias para um melhor entendimento e manejo dos ecossistemas. / It is known that humans, plants and animals are colonized by a high diversity of microorganisms and that these eukaryotic organisms depend on these microorganisms to maintain their development. Using two microorganism-host association models, we hypothesized that hosts belonging to distinct domains of life, despite their structural, genotypic, phylogenetic and physiological particularities, share similarities in the modes of association with the bacterial community. Thus, the objective of this work was to map the bacterial community associated with plants of the genus Anthurium endemic and / or not. In parallel, map the bacterial community associated with distinct genera of cyanobacteria, along the growth curve of and when it is submitted to different culture conditions. In this context, we observed that Anthurium alcatrazense plants endemic to the Island, present less richness and diversity than the plants of the species Anthurium loefgrenii collected in the island of Alcatrazes and smaller than the plants Anthurium intermedium and Anthurium penthaphyllum collected in the continent. We found that the structure of the bacterial community associated with the plants of A. alcatrazense is distinct when compared to the plants collected in the continent and island of Alcatrazes itself. This dissimilarity was mainly represented by OTUs affiliated with Betaproteobacteria and Gammaproteobacteria. These results suggest microorganism-host specificity. Considering the association cyanobacteria and heterotrophic bacteria, the results demonstrated that the associated bacterial community is specific according to the genus of cyanobacteria, composed mainly by abundance distinct from those of classes, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Flavobacteria and Cytophagia. On the other hand, it was possible to observe that during the multiplication stages of the Microcystis aeruginosa strain, a succession of bacterial groups occurs, mainly represented by the variation of the abundance of Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria and Flavobacteria relative to the stationary phase of multiplication. When submitted under different culture conditions, it was possible to observe that variations in cyanobacteria multiplication rates influenced a modulation of the associated bacterial community structure, thus suggesting that rapid changes in the bacterial community structure associated with M. aeruginosa is a result of processes of self-regulation between cyanobacteria and associated heterotrophic bacteria. In general, distinct hosts show patterns of associations with similar bacteria, and these similarities may suggest strategies for a better understanding and management of ecosystems.

Submitted by William Justo Figueiro (williamjf) on 2015-07-06T23:27:47Z No. of bitstreams: 1 09a.pdf: 771261 bytes, checksum: c8d36f36fd0e9b6396c5bad8e1ea3681 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-06T23:27:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 09a.pdf: 771261 bytes, checksum: c8d36f36fd0e9b6396c5bad8e1ea3681 (MD5) Previous issue date: 2014 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos / Microrganismos vivendo no interior dos tecidos das plantas sem causar efeitos prejudiciais visíveis de sua presença são chamados endofíticos. As bactérias endofíticas podem promover o crescimento das plantas de várias maneiras: através da secreção de reguladores de crescimento vegetal, pela solubilização de fosfato, entre outras. Na busca de práticas agrícolas ambientalmente sustentáveis, tem sido dada considerável atenção à fixação biológica de nitrogênio atmosférico. Assim, o objetivo do presente estudo foi avaliar, através de métodos dependentes de cultivo, a ocorrência de bactérias endofíticas em colmos e folhas de duas amostras das variedades “RG 121” e “RG 900” de arroz irrigado, num sistema de cultivo convencional. Foram coletadas plantas de arroz de duas variedades na Estação Experimental do Arroz, do Instituto Rio Grandense do Arroz (EEA-IRGA), Cachoeirinha/RS, no ano agrícola 2012/2013. As plantas coletadas em campo foram submetidas à desinfecção superficial, seguida do isolamento e cultivo das bactérias endofíticas em meios de cultura semi-sólidos, livres de nitrogênio: NFb (Azospirillum brasilense/A. lipoferum), JNFb (Herbaspirillum seropedicae/H. rubrisubalbicans) e LGI-P (Gluconacetobacter diazotrophicus). Ao final desses procedimentos, foram obtidos 190 isolados bacterianos, os quais agruparam-se, de acordo com suas características fenotípicas, em 29 morfotipos. A partir disso, o padrão de distribuição dos morfotipos entre oito condições foi avaliado por Análise de Correspondência Destendenciada (DCA). As oito condições foram: C1 = amostra (planta) 1, variedade “RG 121”, colmos; C2 = amostra 1, variedade “RG 121”, folhas; C3 = amostra 1, variedade “RG 900”, colmos; C4 = amostra 1, variedade “RG 900”, folhas; C5 = amostra (planta) 2, variedade “RG 121”, colmos; C6 = amostra 2, variedade “RG 121”, folhas; C7 = amostra 2, variedade “RG 900”, colmos; C8 = amostra 2, variedade “RG 900”, folhas. Os dois primeiros eixos da DCA explicaram 28,5 % da variância total do conjunto de dados - 23,9 % de explicação somente pelo eixo 1. Ainda, foi realizada uma Análise de Componentes Principais (PCA) na tentativa de estabelecer quais morfotipos melhor explicam as diferenças observadas entre as condições. Deste modo, os eixos 1 e 2 da PCA tiveram uma proporção de explicação acumulada correspondente a 45,61 %, sendo o eixo 1 responsável por 25,91 % destes. Por fim, em função do número de isolados obtidos por grupo fenotípico, pôde-se calcular o índice de diversidade de Shannon-Weaver (H’), que relaciona a riqueza e uniformidade de espécies (morfotipos) para cada área (condição) em estudo. Estes foram testados par-a-par pelos métodos de bootstrapping e permutação quanto a possíveis diferenças significativas. De modo que valores de H’ estatisticamente diferentes apresentados por algumas das combinações de condições puderam ser relacionados à amostra (planta), à estrutura vegetal (colmos e folhas) e à variedade, isolada ou conjuntamente. O crescimento bacteriano em meios de cultura livres de nitrogênio, em condições microaerofílicas, infere a ocorrência da capacidade de fixação biológica de nitrogênio. / Microorganisms living within the tissues of plants without causing visible detrimental effects of their presence are known as endophytes. The endophytic bacteria can promote plant growth in various ways: by secreting plant growth regulators, by phosphate solubilization, among others. In pursuit of environmentally sustainable agricultural practices, considerable attention has been given to the biological nitrogen fixation. Thus, the aim of this study was to evaluate, by culture-dependent methods, the occurrence of endophytic bacteria in stems and leaves of two samples of varieties “RG 121” e “RG 900” of irrigated rice, on a conventional cropping system. Rice plants from two varieties were collected in the Estação Experimental do Arroz, from Instituto Riograndense do Arroz (EEA-IRGA), Cachoeirinha/RS, in the agricultural year 2012/2013. Plants collected in the field were submitted to surface disinfection, followed by isolation and cultivation of endophytic bacteria in semisolid, nitrogen-free, culture media: NFb (Azospirillum brasilense/A. lipoferum), JNFb (Herbaspirillum seropedicae/H. rubrisubalbicans) and LGI-P (Gluconacetobacter diazotrophicus). At the end of these procedures, 190 bacterial isolates were obtained, which were grouped, according to their phenotypic characteristics, in 29 morphotypes. From this, the pattern of distribution of morphotypes in eight conditions was assessed by Detrended Correspondence Analysis (DCA). The eight conditions were: C1 = sample (plant) 1, variety "RG 121", stems; C2 = sample 1, variety "RG 121", leaves; C3 = sample 1, variety "RG 900", stems; C4 = sample 1, variety "RG 900", leaves; C5 = sample (plant) 2, variety "RG 121", stems; C6 = sample 2, variety "RG 121", leaves; C7 = sample 2, variety "RG 900", stems; C8 = sample 2, variety "RG 900", leaves. The first two axes of DCA explained 28.5 % of the total variance of the data set - 23.9 % of explanation only by axis 1. In addition, a Principal Components Analysis (PCA) was performed in attempt to establish which morphotypes best explain the observed differences between the conditions. Thus, the axes 1 and 2 of the PCA had a proportion of accumulated explanation corresponding to 45.61 %, being the axis 1 responsible for 25.91 % of them. Finally, according to the number of isolates obtained by phenotypic group, the Shannon-Weaver diversity index (H’) were calculated, which relates the richness and evenness of species (morphotypes) for each area (condition) in study. These were tested pair-to-pair by bootstrapping and permutation methods for possible significant differences. Thus, statistically different values of H' presented by some of the combinations of conditions could be related to the sample (plant), plant structure (stems and leaves) and variety, individually or together. The bacterial growth in nitrogen-free culture media, under microaerophilic conditions, implies the occurrence of biological nitrogen fixation capacity.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T12:17:02Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 776174 bytes, checksum: fc14dcc7f1e623f7f455c166d32bd350 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T12:17:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 776174 bytes, checksum: fc14dcc7f1e623f7f455c166d32bd350 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Among the new management technologies which have been proposed for carciniculture, the "BFT" system (Bio-Floc Technology) has shown to be key in allowing crops with high stocking densities, higher biosafety and reduced water exchange. The purpose of this study was to analyze the zoo-technical performance, water quality and the microbiological aspects of large scale culture systems of Litopenaeus vannamei in super-intensive with biofloc formation (BFT) and conventional (CON) systems on the southern coast of Pernambuco. For BFT, two tanks of 200m², stocked with 375 shrimp/m² were used and cultured for 130 days. Concerning the CON system, two ponds were utilized (2.85 ha each), stocked with 12 shrimps/m2 cultured through a period of time averaging 105 days. Weekly biometrics helped monitor shrimp growth and adjust feeding supply in both systems. The water physico-chemical variables were monitored daily, and even with significant differences between the BFT and CON systems, they were within appropriate levels for the species in relation to dissolved oxygen, pH, temperature and salinity. At the end of culture, shrimps displayed mean weight ± SD of 11,41 ± 2,06 g and 10,52 ± 2,23 g, survival rate of 32,4% and 59,1%, and production (Kg/m2) of 1,39 and 0,072, for BFT and CON systems, respectively. With respect to the concentrations of nitrogen compounds (NH3 and NO2), levels were high during the cultivation only in the BFT system. In the results related to microbiology, there was the presence of bacteria of the genus Vibrio and high load of fecal coliform in the shrimp cultured in the CON system. As for the BFT system, the presence of Staphylococcus coagulase-positive was found in shrimps from this culture. Despite the technical problems, which can be easily corrected, the BFT system utilized on a commercial scale in northeastern of Brazil showed great potential for replacing the conventional one, and may become a good alternative to increase productivity and control of effluents, thus confirming its sustainability. / Dentre as novas tecnologias de manejo que vem sendo propostas para a carcinocultura, o sistema “BFT” (Bio-Floc Technology) destaca-se por permitir o cultivo com altas densidades de estocagem, maior biosegurança e reduzida troca de água. O estudo teve como objetivo analisar o desempenho zootécnico, qualidade da água e aspectos microbiológicos no cultivo de Litopenaeus vannamei em larga escala, em sistemas super-intensivo com formação de biofloco (BFT) e convencional (CON) no litoral sul de Pernambuco. Para o BFT foram utilizados dois tanques de 200m², estocados com 375 camarões/m² e cultivados por 130 dias. Em relação ao sistema CON, foram utilizados dois viveiros (2,85 ha cada), estocados com 12 camarões/m2, cultivados por um tempo médio de 105 dias. Biometrias semanais serviram para acompanhar o crescimento dos camarões e reajustar a oferta de ração em ambos os sistemas. As variáveis físico-químicas da água foram acompanhadas diariamente e, mesmo apresentando diferença significativa entre os sistemas BFT e CON, estiveram dentro dos níveis adequados para a espécie em relação a oxigênio dissolvido, pH, temperatura e salinidade. Ao final do cultivo os camarões apresentaram peso médio ±DP de 11,41±2,06g e 10,52±2,23g, sobrevivência de 32,4% e 59,1%, e produção (Kg/m2) de 1,39 e 0,072, para os sistemas BFT e CON, respectivamente. Com relação às concentrações dos compostos nitrogenados (NH3 e NO2), esses apresentaram níveis elevados durante o cultivo apenas no sistema BFT. Nos resultados referentes à microbiologia, se verificou a presença de bactérias do gênero Vibrio e elevada carga de coliformes fecais nos camarões cultivados no sistema CON. Já para o sistema BFT, foi constatada a presença de Staphylococcus coagulase-positivo nos camarões provenientes desse cultivo. Apesar dos problemas ocorridos de caráter técnico, sendo esses possíveis de serem corrigidos, o sistema BFT, empregado em escala comercial no nordeste do Brasil, demonstrou potencial para substituir o convencional, sendo uma boa alternativa para o aumento da produtividade e controle de efluentes, ratificando sua sustentabilidade.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-23T11:53:56Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 439400 bytes, checksum: bdb2f56918fe165df7cddb4d2776eeed (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-23T11:53:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 439400 bytes, checksum: bdb2f56918fe165df7cddb4d2776eeed (MD5) Previous issue date: 2005-10-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A demanda por informações sobre o impacto causado por herbicidas de médio efeito residual no solo motivou o estudo de indicadores microbiológicos que possibilitassem medir o distúrbio provocado à microbiota do solo após a aplicação desses produtos para o controle de plantas daninhas, dando ênfase à cultura do feijoeiro. Dessa forma, foram conduzidos três experimentos com o objetivo geral de verificar o impacto provocado pelos herbicidas fomesafen e fluazifop-p-butil, isolados ou em mistura pré-formulada, largamente utilizados no manejo das plantas daninhas na cultura do feijoeiro, sobre a atividade dos microrganismos do solo. No primeiro experimento, realizado em campo, ao longo do cultivo do feijoeiro, em dois sistemas de plantio – convencional (SPC) e direto (SPD) – avaliaram-se, após a aplicação dos herbicidas mencionados, a respiração basal da microbiota do solo, o carbono da biomassa microbiana (CBM), o quociente microbiano (qMIC), o quociente metabólico (qCO2), a porcentagem de colonização de raízes do feijoeiro por fungos micorrízicos e, ao final do ciclo, o rendimento de grãos. No segundo experimento, a partir de amostras de solo representando SPC e SPD, verificou-se, em laboratório, o efeito da adição de diferentes concentrações dos mesmos herbicidas, isolados e em mistura pré-formulada, sobre a respiração basal da microbiota do solo, CBM e qCO2. No último experimento, avaliou-se o crescimento das estirpes de Rhizobium tropici BR 322 e BR 520, utilizadas como inoculantes na cultura do feijoeiro no Brasil, em meio de cultura, adicionado dos principais herbicidas utilizados ao longo do ciclo do feijoeiro (bentazon, s-metolachlor, imazamox e paraquat, além do fluazifop-p-butil e do fomesafen). De maneira geral, os indicadores microbiológicos avaliados ao longo do ciclo do feijoeiro se mostraram sensíveis à ação dos diferentes herbicidas testados, além de demonstrarem o menor impacto negativo do SPD sobre a microbiota do solo em comparação ao SPC. O qCO2 que estima a eficiência da microbiota do solo em utilizar o carbono da matéria orgânica, evidenciou que a aplicação dos herbicidas testados causou maior impacto negativo quando sobre o solo do SPC. Com o aumento da concentração do fomesafen, observou-se diminuição da microbiota do solo, sendo mais prejudicial na mistura comercial. A partir dos resultados da tolerância das estirpes de rizóbio aos herbicidas, verificou-se que o paraquat promoveu maior inibição do crescimento, seguido pelo fomesafen. Entre as estirpes, BR 520 apresentou maior tolerância à maioria dos herbicidas testados. / The search for information about the impact caused by herbicide on soil motivated the study of microbiological indicators that could measure the harm caused to soil microbiota after the application of products to control weeds, mainly in the common bean crop. Thus, three experiments were conducted in order to verify the impact caused by fomesafen and fluazifop-p-butyl herbicide, isolated or in a commercial mixture on soil microbial activity. The first experiment was conducted under no-till (NTS) and conventional-till (CTS) systems. After herbicide application, the soil was evaluated measuring basal respiration of soil microbiota, microbial biomass carbon (MBC), microbial quotient (qMIC), metabolic quotient (qCO2), root colonization by mycorrhizal fungi and grain yield at the end of the cycle. In the second experiment, conducted in the laboratory, the effect of adding different concentrations of the same herbicide on basal respiration of soil microbiota, MBC and qCO2 was evaluated. The growth of Rhizobium tropici BR 322 and BR 520 was evaluated in the last experiment, by adding the herbicides (bentazon, metolachlor, imazamox and paraquat, plus the fluazifop-p-butil and fomesafen). Microbiological indicators were sensitive to the tested herbicides, besides showing the efficiency of NTS in comparison to CTS. The qCO2 showed that herbicide application caused higher negative impact in CTS. With increasing fomesafen concentrations, soil microbiota decreased, being in commercial mixture, paraquat provided higher growth inhibition, followed by fomesafen. The Rhizobium tropici strains BR 520 showed higher tolerance to most of tested herbicides.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:10:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AbinadabeJM_DISSERT.pdf: 2202389 bytes, checksum: c6fb8bcc059666158ed3af8030f88987 (MD5) Previous issue date: 2012-07-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Industrial activities, oil spills and its derivatives, as well as the incomplete combustion of fossil fuels have caused a great accumulation of hydrocarbons in the environment. The number of microorganisms on the planet is estimated at 1030 and prokaryotes the most abundant. They colonized diverse environments for thousands of years, including those considered extreme and represent an untapped source of metabolic and genetic diversity with a large biotechnological potential. It is also known that certain microorganisms have the enzymatic capacity to degrade petroleum hydrocarbons and, in many ecosystems, there is an indigenous community capable of performing this function. The metagenomic has revolutionized the microbiology allowing access uncultured microbial communities, being a powerful tool for elucidation of their ecological functions and metabolic profiles, as well as for identification of new biomolecules. Thus, this study applied metagenomic approaches not only for functional selection of genes involved in biodegradation and emulsification processes of the petroleum-derived hydrocarbons, but also to describe the taxonomic and metabolic composition of two metagenomes from aquatic microbiome. We analyzed 123.116 (365 ? 118 bp) and 127.563 sequences (352 ? 120 bp) of marine and estuarine metagenomes, respectively. Eight clones were found, four involved in the petroleum biodegradation and four were able to emulsify kerosene indicating their abilities in biosurfactants synthesis. Therefore, the metagenomic analyses performed were efficient not only in the search of bioproducts of biotechnological interest and in the analysis of the functional and taxonomic profile of the metagenomes studied as well / Atividades industriais, derramamentos de petr?leo e seus derivados, bem como a combust?o incompleta de combust?veis f?sseis t?m causado um grande ac?mulo de hidrocarbonetos no meio ambiente. O n?mero de microrganismos no planeta ? estimado em 1030, sendo os procariotos os mais abundantes. Eles colonizaram diversos ambientes durante milhares de anos, incluindo aqueles considerados extremos e representam uma fonte inexplorada de diversidade gen?tica e metab?lica com um grande potencial biotecnol?gico. Sabe-se que muitos microrganismos possuem vias metab?licas complexas atuando na biodegrada??o de hidrocarbonetos derivados de petr?leo e, em muitos ecossistemas, existe uma comunidade aut?ctone capaz de realizar essa fun??o. A metagen?mica tem revolucionado a Microbiologia permitindo o acesso ?s comunidades microbianas n?o cultiv?veis, sendo uma potente ferramenta para elucida??o de suas fun??es ecol?gicas, dos perfis metab?licos, bem como para identifica??o de novas biomol?culas. Assim, o presente estudo aplicou abordagens metagen?micas n?o apenas para sele??o funcional de genes envolvidos nos processos de biodegrada??o e biossurfacta??o de hidrocarbonetos derivados do petr?leo, mas tamb?m para descri??o da composi??o taxon?mica e metab?lica de dois metagenomas de microbiota aqu?tica. Foram analisadas 123.116 (365 ? 118 pb) e 127.563 sequ?ncias (352 ? 120 pb) dos metagenomas marinho e estuarino, respectivamente. Oito clones foram encontrados, sendo quatro envolvidos na biodegrada??o de petr?leo e quatro capazes de emulsificar querosene, indicando a habilidade de sintetizar biossurfactantes. Portanto, as an?lises metagen?micas realizadas foram eficientes n?o apenas na busca de bioprodutos de interesse biotecnol?gico como tamb?m na an?lise do perfil funcional e taxon?mico dos metagenomas estudados

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-11-07T16:20:37Z No. of bitstreams: 1 Torquato Marques dos Santos Neto.pdf: 354695 bytes, checksum: 9dd614cfcb94578b80592c7d4d9d54a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-07T16:20:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Torquato Marques dos Santos Neto.pdf: 354695 bytes, checksum: 9dd614cfcb94578b80592c7d4d9d54a4 (MD5) Previous issue date: 2007-02-27 / The mastitis is the inflammatory process of infectious origin or not, that reaches the different structures of the mammary gland. It is characterized by alterations physical-chemistries and bacteriological of the milk and irreparable lesions in the mammary fabric. In goats explored for the production of milk, the mastitis is a serious problem, so much for increasing the costs of the production as for the risks to the public health. It was aimed at to evaluate clinicamente the animals, with relationship to the presence or not of mastites; To isolate and to identify the microorganisms found in the milk of the appraised animals; to determine the susceptibilitie of the isolated front to different antibiotics used in the mastitis treatment; to evaluate the antimicrobial activity of the propolis green in vitro; to determine the concentration minimum inibitory (CMI) of the green propolis; to evaluate the bactericidal effect and bacteriostatic of the green propolis. As experimental unit was established the use of the goat mammary half, for they be independent anatomicaly could present different infections. Initially 90goats were selected in nursing, presenting clinical mastite or subclinical, constituting a lot of 180 (hundred and eighty) affected mammary half for the disease. Samples of goat milk of some located properties were collected in the districts of Arcoverde, Brejo da Madre de Deus, Garanhuns, Jaboatão do Guararapes, Paudalho, Olinda, Pedra and São Lourenço, State of Pernanbuco; identified the microorganisms, isolated the colonies of Staphylococcus spp, the susceptibilitie was evaluated from the isolated front to different antibiotics used in the mastitis treatment (cefalotyne 30μg, gentamicyne 10μg, penicillyne G 10UI, sulfazotrim 25μg, tetraciclyne 30μg, neomicyne 30 μg, nitrofurantoyne 300 μg, ampicilyne 10μg, amoxicilyne 10μg, estreptomicyne 10μg, kanamicyne 30μg, lincomicyne 2μg and clorafenicol 30μg)and to the etanolics fractions and aqueous of the extracts of green propolis given in by the laboratory Necta-Farmacêutica®, for the diffusion methodology in disk.They were also certain the concentration minimum inibitory - CIM and bactericidal effect and bacteriostatic. The presence of clinical mastite was verified and it sub-practices medicine in the goat flock of the studied districts, and among the isolated ones starting from them sample of milk of animals with mastitis, form isolated colonies of Staphylococcus spp. In agreement with the evaluation done with the antibiotics used in the mastitis treatment the cefalotyne 30μg and the tetraciclyne 30μg they demonstrated larger efficiency front to these isolated with an index of 95.56% of sensibility. Being compared the values of the obtained inibition halus of the aqueous fractions and etanolic, it was verified that there was significant difference among them (p <0.01), suggesting that the formulation exercised activity antimicrobian in the studied cases. It was certain the concentration minimum inibitory of 100 mg/mL being obtained bactericidal effect in all the tested samples. It is suggested that obtained with the green propolis starting from the results, thiscan be used as an alternative treatment for goat mastitis, for having demonstrated efficiency with relationship to the bactericidal effect in the isolated ones tested. / A mastite é o processo inflamatório de origem infecciosa ou não, que acomete as diferentes estruturas da glândula mamária. Caracteriza-se por alterações físico-químicas e bacteriológicas do leite e lesões irreparáveis no tecido mamário. Em cabras exploradas para a produção de leite, a mastite é um grave problema, tanto por aumentar os custos da produção quanto pelos riscos à saúde pública. Objetivou-se com este estudo Isolar e identificar os microrganismos envolvidos nas mastites clínicas e subclínicas em cabras, determinar o perfil de sensibilidade dos Staphylococcus spp frente a diferentes antimicrobianos além de avaliar a atividade antimicrobiana determinar a concentração inibitória mínima (CIM) e avaliar o efeito bactericida e bacteriostático da própolis verde. Foram utilizadas 90 cabras em lactação, com mastite clínica ou subclínica, constituindo um total de 180 metades mamárias. As amostras de leite que foram submetidas ao exame microbiológico paraisolamento e identificação de Staphylococcus coagulase positiva e negativa que foram submetidos a testes de sensibilidade frente a 13 diferentes antimicrobianos e, às frações etanólica e aquosa do extrato de propólis verde cedidos pelo laboratório Necta-Farmacêutica®, utilizando a técnica de difusão em disco. Foi constatada a presença de mastite clínica e sub-clinica no rebanho caprino dos municípios estudados, e dentre os isolados a partir das amostras de leite de animais com mastite, form isoladas colônias de Staphylococcus spp. De acordo com a avaliação feita com os antibióticos utilizados no tratamento de mastites a cefalotina 30μg e a tetraciclina 30μg demonstraram maior eficácia frente a estes isolados com um índice de 95,56% de sensibilidade. Comparando-se os valores dos halos de inibição obtidos das frações aquosa e etanólica, constatou-se que houve diferença significativaentre eles (p < 0,01), sugerindo que a formulação exerceu atividade antimicrobiana nos casos estudados. Foi determinada a concentração inibitória mínima de 100 mg/mL obtendo-se efeito bactericida para todas as amostras testadas. Sugere-se, a partir dos resultados obtidos que a própolis verde, podeser utilizada como um tratamento alternativo para mastite caprina causada por Staphylococcus spp, por ter demonstrado eficácia in vitro quanto ao efeito bactericida nos isolados testados.