Submitted by MARIANA PIATTO BERTON null (mapberton@gmail.com) on 2017-08-30T18:09:32Z No. of bitstreams: 1 merged (1).pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-30T18:32:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 berton_mp_dr_jabo.pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-30T18:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 berton_mp_dr_jabo.pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) Previous issue date: 2017-08-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este estudo propôs avaliar uma outra forma de detecção de variações estruturais no genoma bovino, as variações no número de cópias CNVs, e sua associação com características de qualidade de carne. O capitulo 1 aborda considerações gerais e revisão de literatura das características de qualidade da carne e de sua inclusão em estudos genômicos, bem como a utilização das variações do número de cópias em estudos de associação com características de interesse econômico para a agropecuária brasileira. O capítulo 2 teve como objetivo explorar diferentes softwares para avaliar diferenças na detecção de CNVs em uma população de bovinos da raça Nelore. A diferença metodológica entre os softwares pode ser a causa da diferença de CNVR detectados em ambos os métodos. Os grupos funcionais enriquecidos significativos foram relacionados a funções de ligações de ATP, bem como estruturas das membranas celulares e resposta do sistema imunológico. A presença de genes do tipo LOC também é bastante interessante, pois estes são genes os quais ainda não foram confirmadas sua função biológica, necessitando de mais estudos para a determinação da mesma. O estudo de diferentes algoritmos na detecção de CNVRs pode divergir dependendo das plataformas e metodologias aplicadas em cada software, como foi observado no presente estudo. A sobreposição dos mesmos nos fornece maior confiabilidade na detecção de regiões de CNVs. O capítulo 3 propôs identificar regiões no genoma de bovinos da raça Nelore que apresentam variações no número de cópias (CNV: Copy Number Variation) e estudar a associação genética entre os CNVs com características quantitativas e qualitativas da carne. O enriquecimento de genes das regiões de CNV revelaram processos biológicos que podem estar envolvidos na qualidade de carne. Várias regiões genômicas foram associadas à QTL relacionadas à deposição de gordura (FABP7) e contração muscular (SLC34A3, TRDN), matriz extracelulares (INS e COL10A1), bem como genes transportadores de creatina (SLC6A18 e SLC6A19) foram identificadas, além das respectivas vias metabólicas. Estas devem contribuir para consolidar características que quando agregadas às informações genômicas, poderão auxiliar a seleção de Nelore (Bos indicus) em relação à qualidade da carne. Além disso, as CNVRs podem ser usadas como ferramenta auxiliar em futuros estudos de GWAS, cuja principal função é procurar mutações causadoras informativas, que vão auxiliar o melhor entendimento dos mecanismos de ação e a fisiologia de características importantes. A sobreposição de CNVs com SNPs aumenta as chances de encontrar regiões mais confiáveis para a detecção de QTLs relacionados com características de interesse. Uma vez detectadas as CNVRs podem ser inseridos em chips personalizados de baixa densidade permitem avaliação genética rentável e acessível para os criadores. / The aim of this study was to evaluate another way to detect structural variations in bovine genome, the variations in CNVs number of copies and its association with meat quality traits. Chapter 1 addresses general considerations and literature review of meat quality traits and their inclusion in genomic studies, as well as the use of variations in the number of copies in association studies with characteristics of economic interest for Brazilian agribusiness. Chapter 2 aimed to explore different softwares to evaluate differences in the detection of CNVs in a population of Nellore cattle. The difference in methodologies between the softwares can be the cause of the difference in CNVR detected in both methods. Significant enriched functional groups were related to ATP binding functions, as well as cell membrane structures and immune system response. The presence of genes of the LOC type is also very interesting, since the biological function of these genes have not been confirmed yet, requiring further studies to determine the same. The study of different algorithms in CNVRs detection can differ depending on the applied platforms and methodologies in each software, as it was observed in this study. The overlaps can provide more reliability in the detection of CNVs regions. Chapter 3 proposed to identify genome regions of Nellore cattle that presented variations in the number of copies (CNV: copy number variation) and to study the genetic association of CNVs with quantitative and qualitative traits in meat. The enrichment of CNV regions genes revealed biological processes which can be involved in meat quality. Several genomic regions were associated with QTL related to fat deposition (FABP7) and muscle contraction (SLC34A3, TRDN), extracellular matrix (INS and COL10A1), as well as creatine transporter genes (SLC6A18 and SLC6A19) were identified, in addition to their respective metabolic pathways. These regions should contribute to consolidate characteristics that when added to genomic information may help the selection of Nellore animals (Bos indicus) for meat quality. Furthermore, CNVRs can be used as an auxiliary tool in further GWAS studies, which will help to better understand the mechanisms of action and the physiology of important traits. The overlap of CNVs with SNPs increases the chances of finding more reliable regions to the detection of QTLs related to traits of interest. Once detected, the CNVRs can be inserted in low-density customized chips allowing cost-effect and affordable genetic evaluation for farmers.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-04-27Bitstream added on 2014-06-13T18:39:02Z : No. of bitstreams: 1 pegorer_mf_dr_botfmvz.pdf: 296741 bytes, checksum: d776b68ccb17f14c0ec5cbc0dce7853d (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Alguns estudos indicam que altos níveis de progesterona (P4) plasmática diminuem a pulsatilidade de LH e, conseqüentemente, o crescimento folicular. Isto pode diminuir a eficiência de protocolos para inseminação artificial em tempo fixo (IATF) que se baseiam na utilização de dispositivos intravaginais contendo P4. Objetiva-se com o presente trabalho avaliar a influência de diferentes concentrações de P4, associadas ou não à aplicação de eCG, nas taxas de ovulação e prenhez de novilhas da raça Nelore submetidas a protocolos para IATF. No experimento (exp.) 1, novilhas Nelore (n=15), cíclicas e pré-sincronizadas com tratamento hormonal, foram distribuídas aleatoriamente em quatro grupos experimentais. No dia da inserção do dispositivo intravaginal (D0) todos os animais receberam 2 mg de benzoato de estradiol (BE) e um dispositivo intravaginal contendo 0,558g de P4 (Triu B®, grupo 0,5G, n = 4) ou 1g de P4 (Cronipress®, grupo 1G, n = 4), ou 0,558g de P4 e PGF2α (150 μg d-cloprostenol, grupo 0,5G/PGF , n = 4) ou 1 g de P4 e PGF2α (grupo 1G/PGF, n = 3). Oito dias mais tarde (D8) administrou-se PGF2α em todos os animais e o dispositivo foi removido. Vinte e quatro horas após a remoção do dispositivo intravaginal, as novilhas foram tratadas com BE (1 mg, IM). Entre os dias D0 e D12 foram realizados, diariamente, exames ultrassonográficos dos ovários e mensurado o diâmetro folicular. Foram colhidas amostras de sangue para dosagem da P4 nos dias 0,1,2,4,8 e 10. No exp. 2, novilhas cíclicas da raça Nelore (n=292) foram tratadas com os mesmos protocolos do primeiro experimento. Entretanto, 30 a 36h após a aplicação do BE todos animais foram submetidos a IATF (D10). Em uma amostragem de novilhas de cada grupo os ovários foram examinados, por meio de ultrassonografia, nos dias 9 e 12, para determinar a taxa de ovulação após cada tratamento. No exp. 3, novilhas... / Previous reports indicate that high concentration of plasmatic progesterone (P4) decreases LH pulse frequency, and consequently follicular growth. This may reduce the efficiency of fixed-time artificial insemination (FTAI) protocols that utilize P4 in Bos indicus heifers. The objective of the present work was to evaluate the influence of different P4 concentrations associated or not with eCG in the ovulation and pregnancy rates of Nellore heifers submitted to hormonal protocols for FTAI. In experiment (exp.) 1, heifers (n=15) pre-synchronized with a hormonal treatment were randomly allocated in four experimental groups. At the time of intravaginal device insertion (D0) all animals received 2 mg of estradiol benzoate (EB) and an intravaginal progesterone-releasing device containing 0.558g of P4 (TRIU®, group 0.5G, n=4) or 1g of P4 (Cronipress®, group 1G, n = 4), or 0.558g of P4 and PGF2α (150 μg d-cloprostenol, group TRIU/PGF, n = 4), or 1g of P4 and PGF2α (group 1G/PGF, n = 3). Eight days later (D8), PGF2α (150 μg d-cloprostenol) was administered to all heifers, the P4 source was removed. Twenty four hours after removing the intravaginal device, the heifers were treated with EB (1 mg, i.m.). Ovarian ultrasonographic examinations were performed daily, from the day D0 to D12 to measure follicles diameter. Blood samples were collected during the days 0, 1, 2, 4, 8 and 10 to evaluate plasma P4 concentration. In exp. 2, cyclic Nellore heifers (n=292) were treated with the same protocols as in the exp. 1. However, 30 to 36 h later all animals were fixed-time inseminated on D10. In exp. 3, heifers (n=459) received the treatments described to groups 0.5G/PGF and 1G/PGF associated with 300 IU of eCG (i.m., groups 0.5G/PGF/eCG and 1G/PGF/eCG) at the time of intravaginal device removal (D8). In a subset of heifers from each group blood samples were collected on D8 and ovarian ultrasonography... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Gustavo Perina Bertoldi (gustavobertoldi4@gmail.com) on 2018-05-06T12:29:33Z No. of bitstreams: 1 007-2018-Gustavo Perina Bertoldi_FINAL.pdf: 1652603 bytes, checksum: a2c1580fad1bf953c7408a164a955564 (MD5) / Approved for entry into archive by Fabio Sampaio Rosas null (fabio@dracena.unesp.br) on 2018-05-07T12:59:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bertoldi_gp_me_dra.pdf: 1652603 bytes, checksum: a2c1580fad1bf953c7408a164a955564 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-07T12:59:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bertoldi_gp_me_dra.pdf: 1652603 bytes, checksum: a2c1580fad1bf953c7408a164a955564 (MD5) Previous issue date: 2018-03-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo foi avaliar a produção de proteína microbiana, pH e dinâmica ruminal, digestibilidade e degradabilidade ruminal de nutrientes, comportamento ingestivo, seletividade da dieta e imagens termográficas em bovinos Nelore canulados que passaram por período de restrição alimentar ou que consumiram concentrado antes da entrada no confinamento na fase de terminação. O delineamento experimental foi em quadrado latino contemporâneo 3 x 3. Foram utilizados 6 bovinos inteiros, com peso vivo aproximado de 236 ± 23 kg e com 20 meses de idade. Os tratamentos diferiram somente com relação ao tipo de dieta estabelecida na fase de pré-adaptação: Controle (volumoso ad libitum + suplemento mineral); Restrição (volumoso restrito a 1,4% do peso vivo + suplemento mineral) e Concentrado (volumoso ad libitum+ 0,5% do peso vivo de ingredientes). A duração do estudo foi em 115 dias, sendo 3 períodos experimentais (33 dias/período) e dois intervalos de washout (8 dias). Cada período foi dividido em: 14 dias de pré-adaptação, 6 dias em adaptação 1, 6 dias em adaptação 2 e 7 dias na dieta de terminação (72%, 79% e 86% de concentrado, respectivamente). Os dados deste estudo foram analisados pelo PROC MIXED do SAS (2003), sendo o teste de Tukey utilizado para comparação entre médias quando necessário, considerando o nível de 10% de significância. Conclui-se que que animais submetidos à restrição nutricional ou que consumiram ingredientes concentrados antes do confinamento apresentam comportamento ingestivo e aproveitamento dos nutrientes na fase de terminação semelhantes aos de bovinos Nelore sob pastejo ad libitum e que não foi possível identificar distúrbios metabólicos ruminais de bovinos Nelore tendo como base a temperatura externa do animal utilizando câmera termográfica. / The objective was to evaluate if ruminal pH, total tract digestibility, ruminal degradability of the nutrients, feeding behavior and thermography images were similar for cannulated Nellore cattle previously exposed to nutritional restriction or intake of concentrate feedstuffs when the finishing diet was introduced. It was used six 20-mo-old Nellore bulls cannulated in the rumen (236 ± 23 kg), which were randomly assigned to one of two 3 x 3 Latin squares and consequently to the following treatments: Control (forage ad libitum + mineral supplement), Restriction (forage restricted to 1.4% of body weight + mineral supplement) and Concentrate (forage ad libitum + 0.5% of the body weight of concentrate feedstuffs + mineral supplement). Each period lasted 33 days and it was divided as follows: 14 days of exposure to treatments, 12 days of adaptation (72% and 79% concentrate diets for 6 days each), and 7 days of finishing diet containing 88% concentrate (7% sugarcane bagasse, 7% Tifton hay, 73.5% cracked corn grain, 9.0% cottonseed meal, 1.2% urea, 0.8% limestone and 1.5% of a mineral/vitamin supplement containing sodium monensin). The study lasted 115 days, including a washout interval of 8 days that was adopted between periods 1 and 2 and 2 and 3. The data of this study were analyzed by PROC MIXED of the SAS (2003) and the Tukey test was used to compare means when necessary, considering the level of 10% of significance. Based on these results, we concluded that cattle previously exposed to nutritional restriction or intake of concentrate feedstuffs do not presented differences to ad libitum grazing Nellore bovines when the finishing diet was introduced and it was not possible to identify ruminal metabolic disorders of Nellore cattle based on the external temperature of the animal using a thermography camera. / FAPESP: 2016/02173-8

Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-08-08T13:37:44Z No. of bitstreams: 2 Tese - Kíria Karolline Gomes Moreira - 2018.pdf: 845151 bytes, checksum: 2ad2cdb82fbc13144dced7708c515c5b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-09T11:50:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Kíria Karolline Gomes Moreira - 2018.pdf: 845151 bytes, checksum: 2ad2cdb82fbc13144dced7708c515c5b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-09T11:50:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Kíria Karolline Gomes Moreira - 2018.pdf: 845151 bytes, checksum: 2ad2cdb82fbc13144dced7708c515c5b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-07-13 / Phytogenic additives with action similar to ionophores can be used as alternatives to synthetic additives. Two experiments were carried out to evaluate the effects of phytogenic antimicrobial additives on performance, carcass characteristics, nutrient digestibility and ruminal metabolic profile of Nellore bulls feedlot. In the first experiment, 114 Nellore steers (335.48 ± 25.70 kg) were assigned to a randomized complete block design with 4 treatments: monensin; S. Adstrigens extract; essential oils blend; functional oils cashew, castor and copaiba on the growth performance and carcass. The diet consisted of 19.49% sugarcane bagasse and 80.51% concentrate (DM basis). DMI of animals receiving monensin (104 days feedlot) was 16.2% lower than the animals that consumed dry extract and 8.6% lower than the animals that received functional oils (P <0.001). Animals that consumed dry extract of S. adstrigens showed higher consumption of NDF (P <0.001). FBW (μ = 485.60 kg) and ADG (μ = 1.42 kg/d) were not affected by treatments (P>0.05). FE was better (P <0.05) for MON (0.184 kg/kg) than BBT and MOE. There was no difference (P>0.05) for carcass characteristics. The use of phytogenic additives in feed of confined cattle did not influence the carcass characteristics, but the use of monensin still provides better performance results. In the second experiment, was to evaluate the characteristics of ruminal fermentation and digestibility of nutrients of a finishing diet with phytogenic additives. Five fistulated steers (initial BW = 275.40 ± 15.53 kg) were used in a 5 × 5 Latin Square design. Treatments were: no additive; monensin 30 mg/kg DM; extract of S. adstrigens 1.500 mg/kg DM; mixture of essential oils 118 mg/kg DM; mixture of functional oils from cashew, castor, and copaiba 250 mg/kg DM. The diet consisted on DM basis of 19.49% of sugarcane bagasse and 80.51% of concentrate with corn, soybean meal, urea and minerals. There were no effects (P>0.05) on nutrients intake, apparent digestibility concentration of VF, acetate:propionate ratio and concentration of NH3-N. Steers fed mixture of functional oils showed higher ruminal pH (6,75) than BBT (6,54; P <0.05). Phytogenic additives have the potential to replace synthetic antibiotics without penalizing the productive system of beef cattle. / Aditivos fitogênicos com ação semelhante aos ionóforos podem ser utilizados como alternativas, a fim de abranger mercados que tenham restrições quanto ao uso de aditivos sintéticos. Foram realizados dois experimentos com o objetivo de avaliar os efeitos de aditivos antimicrobianos fitogênicos sobre o desempenho, características de carcaça, digestibilidade dos nutrientes e perfil metabólico ruminal de tourinhos Nelore confinados. No primeiro experimento avaliou-se o desempenho animal e as características de carcaça de 114 tourinhos Nelore com peso corporal inicial de 335,48±25,70 kg. Os tratamentos foram: MON - monensina 30 mg/kg MS; BBT - extrato de Barbatimão (S. adstrigens) 1.500 mg/kg de MS; MOE – mistura de óleos essenciais de (cinamaldeído, eugenol, oleoresina de pimenta e carvacrol) - 118 mg/kg de MS; e, MOF – mistura de óleos funcionais de caju, mamona e copaíba 250 mg/kg de MS. O delineamento experimental foi em blocos inteiramente casualizado com 4 tratamentos e 5 repetições, sendo que os blocos foram definidos pelo PI dos animais e as baias foram consideradas como repetições. A dieta consistia em 19,49% de bagaço de cana in natura e 80,51% de concentrado na MS. O consumo de matéria seca dos animais que receberam MON durante os 104 dias de confinamento foi 16,2% menor que os animais que consumiram BBT e 8,6% menor que os animais que receberam MOF (P < 0,001). Animais que consumiram BBT apresentaram maior consumo de FDN (P < 0,001). PF (μ= 485,60 kg) e GMD (μ= 1,42 kg/d) não foram afetados pelos tratamentos (P > 0,05). A EA foi melhor (P < 0,05) para MON (0,184 kg/kg) quando comparada a BBT e MOE. Não houve diferença (P > 0,05) para as características de carcaça. O uso de aditivos fitogênicos na ração de bovinos confinados não influenciou as características de carcaça, porém a utilização da monensina sódica ainda proporciona melhores resultados de desempenho. No segundo experiemento, avaliou-se as características da fermentação ruminal e a digestibilidade aparente dos nutrientes de bovinos Nelore. Cinco bovinos castrados fistulados no rúmen (275,40 ± 15,53 kg) foram usados em delineamento Quadrado Latino 5 × 5. Os tratamentos foram: controle - sem aditivo; monensina sódica 30 mg/kg MS; extrato de Barbatimão (S. adstrigens) 1.500 mg/kg de MS; mistura de óleos essenciais de (cinamaldeído, eugenol, oleoresina de pimenta e carvacrol) - 118 mg/kg de MS; mistura de óleos funcionais de caju, mamona e copaíba 250 mg/kg de MS. A dieta continha na MS 19,49% de bagaço de cana e 80,51% de concentrado com milho, farelo de soja, ureia e minerais. Não houve efeito (P > 0,05) dos aditivos sobre o consumo, digestibilidade aparente dos nutrientes, concentração de AGCC, relação acetato:propionato e concentração de N-NH3. Novilhos alimentados com MOF apresentaram pH ruminal mais elevado (6,75) do que novilhos recebendo BBT (6,54; P < 0,05). Aditivos fitogênicos possuem potencial para substituir antibióticos sintéticos sem prejudicar o sistema produtivo de bovinos de corte.

A presente pesquisa teve a finalidade de padronizar a técnica de cardiotocografia a ser utilizada para avaliar a existência de hipóxia/sofrimento fetal durante a vida intrauterina, procurando estabelecer a partir do 7º mês da gestação os padrões de normalidade da frequência cardíaca fetal para fetos sadios e oriundos de inseminação artificial, bem como avaliar a influência da clonagem nos parâmetros obtidos no exame de cardiotocografia. Foram acompanhadas as gestações de 14 vacas, sendo os animais divididos em três grupos experimentais: Grupo de Clones Mortos composto de 5 vacas gestantes nas quais acompanhou-se a carditocografia de fetos gerados pela técnica de clonagem e nos quais a morte do bezerro ocorreu nas primeiras 36 horas de vida ; Grupo de Clones Vivos composto de 4 vacas gestantes nas quais acompanhou-se a carditocografia de fetos gerados pela técnica de clonagem e que permaneceram vivos após o nascimento; Grupo Controle - composto de 5 vacas gestantes nas quais acompanhou-se a carditocografia de fetos gerados por inseminação artificial e que deram origem a bezerros sadios. Os animais foram acompanhados por exames periódicos de cardiotocografia realizados nos seguintes momentos: 90, 60, 30, 15, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 dia antes do parto e no dia do parto. Para a realização dos exames foi utilizado o aparelho de cardiotocografia da marca Philips modelo Avalon FM30,no local onde as vacas se encontravam. Os exames tiveram uma duração de 20 a 40 minutos de traçado, sendo que o transdutor de ultra-som era acomodado de forma a obter o melhor sinal cardíaco fetal. Imediatamente após o nascimento, realizou-se a avaliação da viabilidade de bezerros recém-nascidos pelo método APGAR e a observação de bezerros tingidos de amarelo em decorrência da presença de mecônio nas secreções uterinas.Através dos traçados obtidos com a cardiotocografia foram analisados os parâmetros da cardiotocografia: linha de base, acelerações transitórias, acelerações prolongadas, variabilidade, taquicardia, bradicardia e desacelerações, sendo ao final calculado o índice cardiotocométrico. Nos animais classificados como hipoativo ou inativo aplicava-se estimulação por palpação retal com beliscamento do espaço interdigital do feto com o objetivo de modificar o comportamento fetal e evitar resultados falso positivos.O exame de cardiotocografia mostrou ser eficaz na avaliação da vitalidade fetal na espécie bovina. Os valores médios e o desvio padrão da frequência cardíaca fetal basal (linha de base) em fetos hígidos foi igual a 116,4 ± 9,07 bpm. Considerou-se taquicardia uma frequência cardíaca fetal igual ou maior do que 145 bpm e bradicardia uma frequência cardíaca igual ou menor do que 90 bpm. Considerou-se normal para bovinos uma variabilidade com valores situados entre 5 e 15 bpm. Verificou-se que a presença de acelerações transitórias são indicativas de bem estar fetal, sendo que o número de acelerações transitórios consideradas como fisiológicas varia entre 1 e 5. Desacelerações são indicativos da existência de sofrimento fetal, não sendo observadas em animais hígidos. No grupo de clones mortos, existem modificações da carditocografia compatíveis com a ocorrência de sofrimento fetal/ hipóxia intrauterina. Os fetos do grupo de clones mortos apresentaram com maior frequência momentos de hipoatividade fetal do que os fetos do grupo de clones vivos e fetos do grupo controle e os fetos do grupo de clone mortos foram classificados com maior frequência como não reativos ao estímulo de beliscamento das extremidades do que os fetos do grupo controle. Os fetos do grupo de clones mortos apresentaram com mais frequência bradicardia (11,8%) do que a observada no grupo controle (0,00 %). Observou-se que no grupo de clones mortos (1,4 ± 1,6) o número de acelerações transitórias foi significativamente menor do que o observado no grupo de clones vivos (3,50 ± 2,70) e no grupo controle (2,70 ± 1,80). / This research had the purpose to standardize the technique of cardiotocography to be used to assess the presence of hypoxia / fetal distress during intrauterine life, trying to establish from the 7th month of pregnancy the normal range of fetal heart rate in healthy fetuses and from artificial insemination and cloning to evaluate the influence of the parameters obtained in the examination of cardiotocography. Were followed the pregnancies of 14 cows and animals are divided into three experimental groups: Dead Clones Group - composed of 5 pregnant cows which was accompanied the cardiotocography of fetuses generated by the technique of cloning, in which the death occurred in the calf first 36 hours of life; Living Clones Group - composed of 4 pregnant cows which is accompanied cardiotocography of fetuses generated by the technique of cloning and remained alive after the birth, control group - composed of 5 pregnant cows in which follow - the cardiotocography of fetuses generated by artificial insemination and gave rise to healthy calves. The animals were monitored by periodic assessment of cardiotocography performed in the following periods: 90, 60, 30, 15, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 day before parturition and day of birth. For the examinations we used the apparatus of cardiotocography Brand Philips Avalon FM30 model, where the cows were. The tests had a duration of 20 to 40 minutes of track, and the ultrasound transducer was adjusted to obtain the best fetal cardiac signal. Immediately after birth, was held to assess the viability of newborn calves by the method APGAR and the observation of colored yellow calves due to the presence of meconium in the uterine secretions. Through cardiotocography tracings were analyzed with the parameters of cardiotocography : the baseline, acceleration transient, prolonged accelerations, variability, tachycardia, bradycardia, and deceleration modes, and the final calculated the index cardiotocométrico. In the animals classified as inactive or hypoactive stimulation was applied by rectal palpation of the interdigital space with pinch of the fetus with order to modify the behavior and prevent fetal false positives. An examination of cardiotocography has proven effective in evaluation of fetal vitality in the bovine species. The mean values and standard deviation of the baseline fetal heart rate (from baseline) in healthy fetuses was equal to 116.4 ± 9.07 bpm. Tachycardia was considered a fetal heart rate equal to or greater than 145 bpm bradycardia and a heart rate less than or equal to 90 bpm. It was considered normal for cattle variability with values between 5 and 15 bpm. It was found that the presence of transient accelerations are indicative of fetal well-being, and the number of transient accelerations considered physiological ranges between 1 and 5. Deceleration is indicative of the existence of fetal distress and is not observed in healthy animals. In the group of clones dead, there are changes in cardiotocography consistent with the occurrence of fetal distress / intrauterine hypoxia. The fetuses of the group of clones had killed more often moments of fetal hypoactivity than the fetuses of the group of clones live fetuses and the control group and the group of fetuses dead clone were classified more frequently as non-reactive to stimulation of the pinch ends of the fetuses in the control group. The fetuses of the group of dead clones showed bradycardia more often (11.8%) than that observed in the control group (0.00%). It was observed that the group of dead clones (1.4 ± 1.6) the number of transient acceleration was significantly lower than that observed in the group of live clones (3.50 ± 2.70) and the control group (2 , 70 ± 1.80).

O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial de utilização de marcadores moleculares em genes candidatos da calpaína (CAPN) e calpastatina (CAST) como ferramenta auxiliar para programas de melhoramento de características relacionadas ao crescimento e maciez da carne. Foram avaliados 605 bovinos da raça Nelore, pertencentes à Agropecuária CFM Ltda, com idade média ao abate de 24 meses. Após a extração do DNA de amostras de sangue, por desproteinização em presença de NaCl, a identificação e determinação do polimorfismo para os marcadores moleculares CAPN316, CAPN530, CAPN4751, CAPN4753 e UOGACAST1, foi realizada pelo sistema de detecção TaqManTM utilizando-se PCR em Tempo Real. A análise de maciez da carne, aos 7, 14 e 21 dias de maturação, foi realizada com amostras de carne do Longissimus dorsi, retiradas entre a 12ª e 13ª costela e cisalhadas utilizando-se um Warner Bratzler Shear Force. Nenhum efeito significativo dos marcadores avaliados foi observado para as características de crescimento. Foi verificado efeito significativo, em relação à maciez da carne, para os seguintes polimorfismos: aos 7, 14 e 21 dias de maturação para o marcador CAPN4751; aos 21 dias para o marcador CAPN4753 e aos 14 e 21 dias para o marcador UOGCAST1. Em relação aos efeitos das combinações genotípicas para os marcadores dois a dois, os resultados foram significativos para a combinação CAPN4751/UOGCAST1 nos três tempos de maturação. Para a combinação de marcadores CAPN4753/UOGCAST1 também foram verificados resultados significativos para carnes maturadas aos 14 e 21 dias. Os resultados observados neste trabalho sugerem a possibilidade da utilização de seleção assistida por marcadores (MAS), visando o aumento da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore. / The objective of this study was to evaluate the potential utilization of molecular markers on candidate calpain and calpastati n genes as an auxiliary tool for breeding programs on traits related to growth and meat tenderness. A total of 605 Nellore animals, raised by CFM Agro-pecuária Ltda, were used in this study and slaughtered with 24 months in average. After DNA blood samples extraction, by desproteinization in presence of NaCl, the polymorphism (CAPN316, CAPN530, CAPN4751, CAPN4753 and UOGACAST1) identification and determination was realized by TaqManTM detection system using real time PCR. The meat tenderness analysis, at the 7, 14 and 21 days of maturation was realized with Longissimus dorsi meat samples, taken at the 12th and 13th rib interval and Warner Bratzler Peak Shear Force measurements were used. There were no significant effects of molecular markers in growth traits. There were significant effects, regarding to meat tenderness, for following polymorphisms: at 7, 14 and 21 days of maturation, for CAPN4751 marker; at 21 days of maturation, for CAPN4753, and finally, at 14 and 21 days of maturation, for UOGCAST1 marker. In respect to genotypic combination effects analysis for pairwise marker, the results were significant for CAPN4751/UOGCAST1 in three days of maturation. In combination effects for CAPN4753/UOGCAST1 markers, significant effects were also observed for meat tenderness at 14 and 21 days. Theses results suggest that marked selection assisted (MAS) can be used to improve meat quality in Nellore beef cattle.

O presente trabalho teve como objetivo geral estudar a qualidade de carne (Longissimus dorsi) de machos inteiros da raça Nelore através de análise proteômica bidimensional. Para tanto, dois objetivos específicos foram propostos: (i) estudar a proteólise das carnes em diferentes tempos de maturação, no caso um, sete e 14 dias, e (ii) estudar o perfil protéico das carnes de bovinos machos inteiros Nelore com genótipos contrastantes para maciez, em diferentes tempos de maturação (um, sete e 14 dias), associados aos marcadores moleculares CAPN4751 (&mu;-calpaína) e UOGCAST1 (calpastatina). Amostras de sangue foram coletadas para realização de análises genotípicas. Para as análises eletroforéticas e de maciez, amostras maturadas por um, sete e 14 dias foram coletadas. A caracterização e determinação dos genótipos polimórficos (SNP) para os marcadores CAPN4751 e UOGCAST1 foram realizadas por meio de PCR em tempo real. Seis pools de amostras de animais foram preparados para a realização de eletroforese bidimensional. As análises estatísticas foram realizadas no pacote Statistical Analysis System(SAS). Foram encontrados 256 spots em comum na análise de proteólise, sendo 25 significativos (P&lt;0,05). Na análise de regressão múltipla, sendo maciez a variável dependente e os spots significativos a variável independente, foi possível verificar que 13 spots explicaram em 73% a variação de maciez durante a maturação. As análises de variância da intensidade para os volumes de expressão normalizados (IVEN) indicaram 21 spots significativos (P&lt;0,05) para os marcadores CAPN4751 e UOGCAST1. Análises de regressão múltipla para os spots significativos mostraram que alguns spots, além dos marcadores estudados, podem predizer a maciez da carne aos 14 dias de maturação. Portanto, as avaliações de spots permitirão identificar as proteínas diferencialmente expressas, auxiliando no melhor entendimento do complexo mecanismo que determina a maciez da carne. / The present work aimed to study beef quality (Longissimus dorsi) from Nellore bull through two-dimensional proteomic analysis. For this purpose, two specific objectives were proposed: (i) to study the proteolysis of meat at different aging times, if 24 hours, seven and 14 days, and (ii) to study the protein profile of meat from Nellore bull with contrasting genotypes for tenderness at different aging times (24 hours, seven and 14 days), associated with molecular markers CAPN4751 (&mu;-calpain) and UOGCAST1 (calpastatin). Blood samples were collected for genomic analyses. For electrophoretic analysis and tenderness, samples aged for 24 hours, seven and 14 days were collected. The characterization and determination of genotypes polymorphic (SNP) markers for CAPN4751 and UOGCAST1 were performed using real time PCR. Six samples of animals pools were set up to carry out two-dimensional electrophoresis. Statistical analyzes were performed in the package Statistical Analysis System (SAS). 256 spots were found in common in the analysis of proteolysis, with 25 spots significant. We found that 13 spots accounted for 73% of the variation in tenderness during aging. Analyses of variance of the intensity of expression for the normalized volumes (IENV), 21 spots indicated significant (P&lt;0,05) for the markers CAPN4751 and UOGCAST1. Multiple regressions analysis to significant spots showed to some spots, in addition to the markers studied may predict meat tenderness at 14 days of aging. Therefore, the assessments will identify the spots differentially expressed proteins, aiding in better understanding the complex mechanism that determines the softness of the meat.

Em um cenário em que a qualidade da informação é essencial para a sustentação do processo de gestão do sistema ou do processo de seleção animal, corretas atribuições de paternidade se tornam importante para a manutenção das informações de pedigree e, consequentemente, para a estimativa dos valores genéticos dos animais em programas de seleção. Com o advento do uso de marcadores moleculares do tipo SNP na seleção genômica e em diferentes painéis de teste de parentesco, maiores estudos se fazem cada vez mais necessários. Dessa maneira esse estudo buscou analisar os ganhos em acurácia dos valores genéticos para características produtivas em um cenário de seleção real entre avaliações genéticas que continham ou não animais com atribuições de paternidade por teste de DNA e além disso, verificar os possíveis conflitos de seleção entre elas. Como resultados foram encontrados ganhos em acurácia principalmente em animais mais jovens, mas de maneira geral todos os animais foram beneficiados e apresentaram ganhos acima de 8% os animais diretamente submetidos ao teste. Conflitos de seleção variaram entre 14 a 52% quando considerada somatória das diferenças de seleção nas duas avaliações genéticas, mostrando também, que existiu uma alteração na ordem de classificação dos animais nas características analisadas. Como o fator custo é um ponto importante quando se fala em avaliação genética e tudo que envolve a nova fase dos marcadores moleculares, um painel de paternidade eficiente é aquele que apresenta o melhor desempenho na determinação da paternidade sob um menor custo. Dessa forma, foram comparados alguns grupos de marcadores e o painel de 195 SNP proposto pelo grupo ISAG se mostrou eficiente, assim como outros, na determinação de paternidade em um grupo especifico de animais. Os resultados deste trabalho indicam também que o teste de parentesco por DNA é uma ferramenta que pode aumentar a precisão do arquivo pedigree por aumentar a conexão dos animais, ou seja, por criar maiores ou mais laços genéticos entre os indivíduos. Assim, poder-se-ia melhorar o desempenho da avaliação genética em um programa de melhoramento genético bovino através de pequenos grupos de marcadores moleculares com um custo-benefício atrativo. / In a scenario where information quality is essential to support a process management system or an animal selection process, correct paternity assignments become important for maintaining pedigree information and hence to estimate animals genetic values in breeding programs. With the advent of the use of SNP molecular markers in genomic selection and different kinship test panels, larger studies are increasingly necessary. Thus, this study investigated the gains in accuracy of breeding values for production traits (in a real selection scenario) between the genetic evaluations of animals with or without parenting assignment by DNA testing. It also verified possible selection conflicts between them. The following results showed gains in accuracy, especially in younger animals. However, in general, all animals benefited having gains greater than 8% where animals were directly impacted. Checking conflicts ranged from 14-52% when the sum of the differences of selection in both genetic evaluations was considered. This also showed that there was a change in the ranking of animals in the analyzed characteristics. As cost is also an important factor in genetic evaluations using new molecular markers, an effective parenting panel would be one that had the best performance in the paternity determination under a lower cost. Therefore, we compared some small marker groups and the 195 SNP panel proposed by ISAG group and determined this was efficient in estimating paternity on a specific group of animals. These results also suggest that kinship testing by DNA is a tool that can increase the accuracy of the pedigree file to increase the animals\' connection, or to create larger or more genetic links between individuals. This study shows that testing with small groups of molecular markers improves the performance of genetic evaluation in a bovine genetic selection program with an attractive cost-benefit.

O objetivo do experimento I foi avaliar a interação entre dois ganhos médios diários [GMD - fator nutricional (ganho elevado GA = 0,700 e ganho baixo GB = 0,300 Kg/dia)] e a diferença esperada da progênie (DEP para idade ao primeiro parto - fator genético) na puberdade de novilhas Nelore. Foram utilizadas 58 novilhas desmamadas com 8 meses de idade, filhas de 4 touros [2 precoces (P) e 2 tardios (T)], formando um esquema fatorial 2 x 2, no qual o fator 1 foi o GMD e o fator 2 foi a DEP do touro, constituindo assim quatro tratamentos: Touro precoce com GMD elevado (PGA), touro precoce com GMD baixo (PGB), touro tardio com GMD elevado (TGA), touro tardio com GMD baixo (TGB). Houve efeito dos tratamentos na porcentagem de novilhas púberes durante o experimento (PGA e PGB = 100%; TGA = 83% até 27 meses de idade; TGB = 38% até 3 anos de idade). As novilhas do PGA apresentaram a menor (P = 0,0001) idade na puberdade (18 &#177; 1 meses). Contudo, a nutrição atrasou a puberdade em cerca de 10 meses nas novilhas filhas de touros precoces e tardios (PGA = 18 &#177; 1 vs. PGB = 29 &#177; 1 meses; TGA = 24 &#177; 1 vs. TGB = 34 &#177; 1 meses). Assim podemos concluir que a DEP para IPP foi o fator necessário para o adiantamento da idade a puberdade. No entanto, o GMD foi um fator limitante para o aparecimento da puberdade. O objetivo do experimento II foi avaliar o efeito do imprinting metabólico dos 3 aos 7 meses de idade na puberdade em novilhas cruzadas (Angus x Nelore). Os tratamentos foram arranjados em esquema fatorial 2 x 2, no qual o fator 1 foi GMD elevado e médio dos 3 aos 7 meses de idade (fase 1) e o fator 2 foi GMD elevado e médio dos 7 meses de idade até a puberdade (fase 2). Formando os seguintes tratamentos: CAA Novilhas cruzadas submetidas ao GMD elevado nas fases 1 e 2; CAM - GMD elevado na fase 1 e GMD médio na fase 2; CMA- GMD médio na fase1 e GMD elevado na fase 2; CMM GMD médio nas fases 1 e 2. O GMD médio foi atingido pela restrição do consumo de matéria seca (CMS) no GMD médio. As novilhas dos tratamentos CAA, CAM e CMA apresentaram puberdade na mesma idade (cerca de 12 meses). As novilhas cruzadas submetidas ao GMD elevado na fase 2 foram mais pesadas (P = 0,0379) na puberdade do que novilhas submetidas ao baixo GMD. O GMD elevado dos 3 aos 7 meses de idade não impactou na puberdade das novilhas cruzadas. O objetivo e a metodologia do experimento III foram semelhantes ao experimento II, no entanto foram utilizadas novilhas Nelore (N) ao invés de cruzadas e o experimento terminou aos 19 meses de idade. O tratamento NAA (84%) induziu maior (P = 0,0145) proporção de novilhas púberes do que o NMM (23%), mas não houve diferença na taxa de puberdade entre os tratamentos NAM (60%) e NMA (50%). Além disso, o comportamento das curvas de puberdade dos tratamentos NAM e NMA foram semelhantes, sendo assim não houve efeito de imprinting metabólico nas novilhas Nelore. O GMD elevado dos 3 aos 19 meses idade aumentou a porcentagem de novilhas Nelore púberes aos 19 meses de idade / The objective of experiment I was to evaluate the interaction between two average daily gain (ADG nutritional factor (high gain HG = 0,700 and low gain LG = 0,300 kg/day)] and expected progeny differences (EPD to age at first calving; genetic factor) on puberty attainment of Nellore heifers. Fifth eight heifers weaned at 8 months of age and daughters of 4 sires [2 precocious (P) and 2 later (L)]. A factorial design 2 x 2 was used, where the factor 1 was the ADG and the factor 2 was the EPD of sire, resulting in four treatments: Precocious sire with HG (PHG), precocious sire with LG (PLG), later sire with HG (LHG) and later sire with LG (LLG). There was effect of treatment in the percentage of pubertal heifers (PHG and PLG = 100%; LHG = 83% until 27 month of age; LLG = 38% until 3 years old). Heifers from the PHG treatment were the youngest (P = 0,0001) (18 months of age). However, the nutritional factor delayed puberty achievement by approximately 10 months the age at puberty in precocious and later heifers (PHG = 18 &#177; 1 vs. PLG = 29 &#177; 1 months; LHG = 24 &#177; 1 vs. LLG = 34 &#177; 1 months of age). The EPD to age at first calving was the main factor affecting the age at puberty. However, the ADG was limiting to puberty onset. The objective of experiment II was to evaluate the effect of metabolic imprinting from 3 to 7 months of age on puberty attainment of crossbreed heifers (Angus x Nellore). The treatments were arranged in 2 x 2 factorial design, where the factor 1 was high (H) and medium (M) ADG from 3 to 7 months of age (phase 1) and the factor 2 was high and medium ADG from 7 months of age to puberty onset (phase 2), resulting in the following treatments: CHH crossbreed heifers submitted to high ADG in both phases of experiment; CHM high ADG in phase 1 and medium ADG in phase 2; CMH medium ADG in phase 1 and high ADG in phase 2; CMM Medium ADG in both phases. The medium ADG were targeted by restricting of dry mater intake (DMI) in medium ADG. Crossbreed heifers of treatments CHH, CHM, CMH showed the same age at puberty, about 12 months. Heifers submitted to high ADG on phase 2 were heavier (P = 0,0379) at puberty than heifers submitted to low ADG. The high ADG from 3 to 7 months did not affect puberty onset in crossbreed heifers. The objective and methodology used in experiment III was the same of used in experiment II. However, Nellore heifers (N) were used instead of crossbreed heifers and the experimental period ended at 19 months of age. The NHH treatment (84%) induced higher (P = 0,0145) percentage of pubertal heifers than NMM (23%), but there was not difference in puberty rate between NHM (60%) and NMH (50%) treatments. Furthermore, the comportment of curves of puberty of treatments NHM and NMH were similar, thus there was not effect of metabolic imprinting in Nellore heifers. The high ADG from 3 to 19 months of age increased the percentage of pubertal Nellore heifers at 19 months of age

O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito do Cloridrato de Zilpaterol (ZH), Ractopamina (RH) e aumento no nível de proteína da dieta, em dois experimentos distintos na dieta de animais Nelore em sistema de confinamento, nas características produtivas, metabólitos sanguíneos, características de carcaça, composição de corpo vazio e ganho, qualidade da carne e expressão gênica. Para isso, foram realizados dois experimentos. O Exp. 1 utilizou 48 machos, não castrados, distribuídos em blocos casualisados em 4 tratamentos em arranjo fatorial 2x2, sendo dois níveis de PB: 100 e 120% e dois níveis de RH: 0 e 300mg/animal/dia. No Exp. 2, foram utilizadas 72 novilhas da raça Nelore distribuídas em delineamento em blocos casualizados. As novilhas foram separadas em dois grupos: Controle (CONT) e Zilpaterol (ZH). Em ambos os experimentos, os animais foram pesados periodicamente e amostras de sangue foram coletadas. Após o abate, o PCQ foi avaliado, amostras da musculatura foram obtidas para análise de PCR. Depois do resfriamento das carcaças, a AOL e EGS foram avaliados, amostras do músculo Longissimus e a sessão entre a 9&ordf; e 11&ordf; costelas foram coletadas. Além disso, no Exp. 2, as novilhas foram abatidas de forma seriada, 0, 20 e 30 dias de suplementação com ZH e no último abate, foi realizada a desossa completa da meia carcaça. A suplementação com RH aumentou o GMD, diminuiu CMS na dieta com PB120, e aumentou a eficiência alimentar, o teor de proteína plasmática e a atividade da ALP na dieta PB120, diminuiu a glicose na dieta PB100. Além disso, a RH diminuiu a FC nas carnes sem maturação e a dieta com 120% de proteína aumentou a FC nas carnes 0 e 7 dias maturadas. No Exp. 2, as novilhas suplementadas com ZH tiveram aumento no GMD, PCQ, EA, creatinina plasmática e diminuição dos AGNE. A composição de corpo vazio foi alterada após 20 dias de suplementação com ZH. O ZH aumentou o ganho de PCV, ganho de proteína e rendimento da maioria dos cortes do traseiro especial. Houve um aumento na FC aos dias 7 e 14 de maturação. O painel sensorial detectou diminuição da maciez da carne de animais alimentados com ZH, independentemente do tempo de maturação, e diminuição a suculência da carne nos tempos 0 e 14 de maturação. O ZH aumentou a expressão das enzimas calpaínas e calpastatina. Os resultados do presente estudo mostram aumento no desempenho produtivo dos animais alimentados com RH e ZH. A suplementação com ZH aumentou o rendimento dos cortes e mudou a composição corporal de ganho. O uso de agonista &#946;-adrenérgico melhora a eficiência do sistema e aumenta a deposição de tecido magro da carcaça, gerando maior rentabilidade por animal abatido / The aim of this study was to evaluate the use of Zilpaterol and Ractopamine Hydrochloride, in two distinct experiments on Nellore diet in feedlot system, for growth performance, serum metabolites, carcass traits, empty body weight composition, carcass gain composition, meat quality and gene expression. The Exp. 1 used 48 bulls, randomly assigned to four treatments in a 2x2 factorial arrangement; two levels of dietary CP: 100% and 120% of metabolizable protein requirement, defined as CP100 and CP120, respectively. Moreover, two levels of RH: 0 and 300 mg/animal/per day. The Exp. 2 used 72 Nellore heifers assigned to a randomized block design. Heifers were separated into 2 groups: Control and Zilpaterol (ZH). In both experiments, the animals were weighed and blood samples were taken periodically. Animals were slaughtered and HCW was recorded, muscle samples were taken to PCR analysis. After chilling, LMA and fat thickness were recorded, longissimus samples and the 911th rib section were obtained. In addition, in the Exp. 2, heifers were sub groups were slaughterer at 0, 20 and 30 days of ZH supplementation, in the last slaughterer, the carcass were debone. Supplementation with RH increased ADG, reduced DMI at CP120, improved G:F, plasma total protein at CP120, also decreased plasma glucose concentration at CP100, and increased ALP activity at CP120. Ractopamine decreased meat shear force, at day 0 of aging. Greater dietary protein increased meat shear force after 0 and 7 days of aging. Heifers fed ZH had gains in ADG, HCW, G:F ratio, increased serum creatinine, and decreased serum NEFA. Zilpaterol increased carcass dressing percentages, and also decreased kidney-pelvic fat. The EBW composition was changed after 20 d of ZH supplementation. The ZH increased EBW gain, EB protein gain, and subprimal yield. There was an increase on WBSF after 7 and 14 d of aging. The sensory panelists reported a decreased on meat tenderness by ZH supplementation, regarding aging time, and a decrease on juciness at 0 and 14 d of aging. The ZH increased the calpain and calpastatin gene expression. These results indicate the efficiency of RAC and ZH to improve the performance,feed efficiency, and muscle mass deposition in Nellore bulls and heifers. Greater CP did not further improved the RAC effect. The ZH supplementation increased the subprimal yield and changed body gain composition. Finally, the use of &#946;-adrenergic agonist increase the beef cattle system&#39;s efficiency by increasing the lean carcass component, with greater profitability per slaughtered animal