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Classificação de informação usando ontologias / Information classification using ontologiesSilva, Eunice Palmeira da 28 September 2006 (has links)
Although the positive aspects that Internet possesses and the potential it permits, there is a problematic that consists on finding needed pieces of information among the deluge of available documents on the web. Tools that are able to semantically treat the information contained in the documents which follows a structure only focused on data presentation are still lacking. The MASTER-Web system solves the problem of integrated extraction of content-pages that belong to classes which form a cluster. In this context, we propose the extension of this tool to the scientific articles classification
based on ontologies. To achieve this goal, an ontology for the Artificial Intelligence domain was constructed and rule-based classification strategies were adopeted. The approach presented here employs this ontology and textual classification techniques to extract useful pieces of information from the articles in order to infer to which themes
it is about. This combination led to significative results: e.g. in the texts, the system is able to identify the specific subdivisions of AI and entails conclusions, distinguishing
correctlly the themes of the articles from the ones that are briefiy mentioned in the texts. The application of simple techniques and a detailed ontology lead to promising
classification results, independently of the document structure, proposing an eficient and plausible solution. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Apesar dos aspectos positivos que a Internet possui e do potencial que permite, existe a problemática, que consiste em encontrar a informação necessária em meio a uma enorme quantidade de documentos disponíveis na rede. Faltam, ainda, ferramentas capazes de tratar semanticamente a informação contida em documentos que seguem uma estrutura preocupada apenas com a exibição dos seus dados. O sistema MASTERWeb, resolve o problema da extração integrada de páginas-conteúdo pertencentes às classes que integram um grupo (cluster ). Neste contexto propomos a extensão dessa ferramenta para a classificação de artigos científicos baseada em ontologias. Para isso foi construída uma ontologia do domínio de Inteligência Artificial e adotadas estratégias de classificação utilizando sistemas de regras. A abordagem apresentada aqui, emprega esta ontologia e técnicas de classificação textual para extrair dos artigos informações úteis, e daí inferir sobre os temas tratados nestes artigos. Essa combinação conduziu a resultados bastante significativos: por exemplo, o sistema é capaz de identificar no texto as subáreas de IA que ele aborda e deriva conclusões, distinguindo os assuntos tratados pelo artigo daqueles que são brevemente citados no texto. A aplicação de técnicas simples e uma ontologia bem formada levam a resultados de classificação promissores, independentemente da estrutura do documento, propondo uma solução eficiente e plausível.
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Organização de conhecimento e informações para integração de componentes em um arcabouço de projeto orientado para a manufaturaRamos, André Luiz Tietböhl January 2015 (has links)
A constante evolução de métodos, tecnologias e ferramentas associadas na área de projeto fornece maior capacidade para o projetista. Entretanto, ela também aumenta os requisitos de interfaces e controle do conjunto de componentes de projeto consideravelmente. Tipicamente, este aspecto está presente na área de Projeto Orientado para a Manufatura (DFM) onde existem diversos distintos componentes. Cada um dos componentes existentes, ou futuros, pode ter foco diferente, consequentemente com requisitos de informação, utilização e execução distintos. Este trabalho propõe a utilização de padrões conceituais flexíveis de informação e controle de forma abrangente em uma arquitetura de Projeto Orientado para a Manufatura (DFM). O objetivo principal é auxiliar a análise e resolução de DFM, bem como dar suporte à atividade de projeto estruturando e propondo uma solução em relevantes aspectos em DFM: estruturação do contexto das informações (ou conhecimento) em DFM. A arquitetura utiliza as seguintes atividades de projeto em processos de usinagem: Tolerância, Custo, Acessibilidade da ferramenta, Disponibilidade de máquinas e ferramentas e Análise de materiais para demonstrar a relevância da correta contextualização e utilização da informação no domínio DFM . Sob forma geral, concomitantemente, as amplas necessidades de compreensão dos distintos tipos e formas da informação em DFM demandam que uma arquitetura de projeto tenha capacidade de gerenciar/administrar diferentes contextos de informações de projeto. Este é um tópico relevante tendo em vista que existem diferentes atividades DFM que eventualmente devem ser incluídas no ato de projetar. Tipicamente, cada uma delas tem requisitos distintos em termos de dados e conhecimento, ou contextualização do projeto, que idealmente poderiam ser gerenciados através da arquitetura de informação atual – STEP.Aarquitetura proposta gerencia contextos de informações de projeto através de ontologias direcionadas no domínio DFM. Através dela, será possível compreender e utilizar melhor as intrínsecas interfaces existentes nas informações deste domínio, além de, através disto, aumentar a flexibilidade e eficácia de sistemas DFM. / This work proposes the use of industry standards to support the utilization of Design for Manufacturing (DFM) techniques in a comprehensive scale in the design field. The specific aspect being considered in an architecture is the definition and structure of DFM information context. In order to demonstrate the research concepts, some design activities are implemented the framework (which is focused in machining processes): Tolerancing model, Cost model based on material remove processes, Tool Accessibility model taking into consideration the part being designed, Availability of Machines and Tools model, and Material analysis. The broad needs of design–based frameworks, in general, require that its architecture must have the capabilities to handle di erent framework design information utilization contexts, or information context concepts. This is a relevant aspect since there are severalDFMcomponents/activities that preferably should be included in the design process. Traditionally, each one of them might have distinct data & knowledge requirements, which can be handled by the current information architecture – STEP – only in part. Additionally, each one of them might have, or need, di erent forms of understanding DFM information (information context). The framework handles information context concepts through the use of the ontologies targeted to the DFMfield. It is expected that a better comprehension and usage of the intrinsic information interfaces existent in its domain be achieved. Through it, more flexible and e ective DFM systems information-wise can be obtained.
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iSemServ: a framework for engineering intelligent semantic servicesMtsweni, Jabu Saul 01 1900 (has links)
The need for modern enterprises and Web users to simply and rapidly develop and deliver platform-independent services to be accessed over the Web by the global community is growing. This is self-evident, when one considers the omnipresence of electronic services (e-services) on the Web.
Accordingly, the Service-Oriented Architecture (SOA) is commonly considered as one of the de facto standards for the provisioning of heterogeneous business functionalities on the Web. As the basis for SOA, Web Services (WS) are commonly preferred, particularly because of their ability to facilitate the integration of heterogeneous systems. However, WS only focus on syntactic descriptions when describing the functional and behavioural aspects of services. This makes it a challenge for services to be automatically discovered, selected, composed, invoked, and executed – without any human intervention. Consequently, Semantic Web Services (SWS) are emerging to deal with such a challenge.
SWS represent the convergence of Semantic Web (SW) and WS concepts, in order to enable Web services that can be automatically processed and understood by machines operating with limited or no user intervention. At present, research efforts within the SWS domain are mainly concentrated on semantic services automation aspects, such as discovery, matching, selection, composition, invocation, and execution. Moreover, extensive research has been conducted on the conceptual models and formal languages used in constructing semantic services.
However, in terms of the engineering of semantic services, a number of challenges are still prevalent, as demonstrated by the lack of development and use of semantic services in real-world settings. The lack of development and use could be attributed to a number of challenges, such as complex semantic services enabling technologies, leading to a steep learning curve for service developers; lack of unified service platforms for guiding and supporting simple and rapid engineering of semantic services, and the limited integration of semantic technologies with mature service-oriented technologies.
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In addition, a combination of isolated software tools is normally used to engineer semantic services. This could, however, lead to undesirable consequences, such as prolonged service development times, high service development costs, lack of services re-use, and the lack of semantics interoperability, reliability, and re-usability. Furthermore, available software platforms do not support the creation of semantic services that are intelligent beyond the application of semantic descriptions, as envisaged for the next generation of services, where the connection of knowledge is of core importance.
In addressing some of the challenges highlighted, this research study adopted a qualitative research approach with the main focus on conceptual modelling. The main contribution of this study is thus a framework called iSemServ to simplify and accelerate the process of engineering intelligent semantic services. The framework has been modelled and developed, based on the principles of simplicity, rapidity, and intelligence. The key contributions of the proposed framework are: (1) An end-to-end and unified approach of engineering intelligent semantic services, thereby enabling service engineers to use one platform to realize all the modules comprising such services; (2) proposal of a model-driven approach that enables the average and expert service engineers to focus on developing intelligent semantic services in a structured, extensible, and platform-independent manner. Thereby increasing developers’ productivity and minimizing development and maintenance costs; (3) complexity hiding through the exploitation of template and rule-based automatic code generators, supporting different service architectural styles and semantic models; and (4) intelligence wrapping of services at message and knowledge levels, for the purposes of automatically processing semantic service requests, responses and reasoning over domain ontologies and semantic descriptions by keeping user intervention at a minimum.
The framework was designed by following a model-driven approach and implemented using the Eclipse platform. It was evaluated using practical use case scenarios, comparative analysis, and performance and scalability experiments. In conclusion, the iSemServ framework is considered appropriate for dealing with the complexities and restrictions involved in engineering intelligent semantic services, especially because the amount of time required to generate intelligent semantic
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services using the proposed framework is smaller compared with the time that the service engineer would need to manually generate all the different artefacts comprising an intelligent semantic service.
Keywords: Intelligent semantic services, Web services, Ontologies, Intelligent agents, Service engineering, Model-driven techniques, iSemServ framework. / Computing / D. Phil. (Computer science)
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Desenvolvimento e utilização de ontologias em bibliotecas digitais: uma proposta de aplicaçãoRamalho, Rogério Aparecido Sá [UNESP] 25 March 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2010-03-25Bitstream added on 2014-06-13T19:03:13Z : No. of bitstreams: 1
ramalho_ras_dr_mar.pdf: 1320132 bytes, checksum: e9d768ced5bb5495c1b0c73b924672b4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Ao longo dos últimos anos, a crescente utilização das Tecnologias de Informação e Comunicação (TICs) tem impulsionado uma nova gama de necessidades informacionais. Os ambientes digitais favorecem a transposição dos limites convencionais de representação e disseminação do conhecimento registrado, incorporando novos elementos aos processos de produção, organização e recuperação de informações. Considerando as ontologias como uma nova e instigante categoria de sistemas de representação do conhecimento, buscou-se, a partir de um diálogo interdisciplinar, fundamentos que possibilitem analisar as aproximações desta nova abordagem computacional com os instrumentos e métodos tradicionalmente utilizados no área disciplinar de Organização do Conhecimento, investigando em que medida a área de Ciência da Informação pode contribuir para o desenvolvimento de ontologias e analisando os reflexos de sua utilização em bibliotecas digitais. Para tanto, foi realizado um estudo das principais teorias e tecnologias relacionadas ao desenvolvimento de ontologias e bibliotecas digitais, contextualizando-as a partir do corpus teórico da área de Ciência da Informação. Deste modo, foi desenvolvida a Ontologia de Informações Referencias (OIR) e um protótipo de Biblioteca Digital baseado em ontologias, denominado como BibliOntO, com o objetivo de analisar a aplicabilidade de ontologias em bibliotecas digitais. Como resultados, verificou-se que as ontologias possibilitam o desenvolvimento de novos tipos de serviços de informação e melhorias nos processos de representação, organização e recuperação de informações em ambientes digitais. Constatou-se também que sua aplicação em bibliotecas digitais representa uma interessante alternativa, contribuindo para um... / Throughout the last years, the increasing use of Technologies of Information and Communication (TICs) have stimulated a new gamma of informational necessities. The digital environments favor the transposition of the conventional limits of representation and dissemination of the registered knowledge, incorporating new elements to the processes of production, organization and recovery of information. Considering the ontologies as a new and riveting category of systems of representation of knowledge, we searched, starting from a interdisciplinary dialogue, bases that allow to analyze the approaches of this new computational approach with the instruments and methods traditionally used in the area of Knowledge Organization, investigating in what scale the area of Information Science can contribute to the development of ontologies and analyzing the consequences of its use in digital libraries. Therefore, a study of the main theories and technologies related to the development of ontologies and digital libraries was carried through, contextualized in the theoretical framework of the area of Information Science. In this way, the Ontology of Referential Informations (OIR) and a prototype of a Digital Library based on ontologies, called BibliOntO, was developed with the objective of analyzing the applicability of ontologies in digital libraries. As results, it was verified that the ontologies allow the development of new types of information services and improvements in the processes of representation, organization and recovery of information in digital environments. It was also evidenced that its application in digital libraries represents an interesting alternative, contributing for an adjusted attendance of the informational necessities of the users, in a way that the ontologies consist as a new... (Complete abstract click electronic access below)
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Implementação computacional e verificação de ontologias para a modelagem da confiança em transações na webBicca, Edson Rodrigues January 2011 (has links)
O avanço da World Wide Web tem mudado a forma como os negócios são conduzidos entre as organizações. A Web Semântica é o próximo passo na evolução da web. Ela trata de agregar significado semântico ao seu conteúdo, tornando-o mais acessível a máquinas. Dentre os componentes da Web Semântica encontram-se as ontologias, que são representações do conhecimento comumente acordados em um determinado domínio na forma de classes, atributos e relações. O conhecimento presente na ontologia deve ser compartilhado e sua estrutura não é definitiva. Dentre as opções de uso das ontologias, encontra-se a avaliação de confiança nas transações comerciais na web. Assim, buscou-se um modelo teórico de ontologias de confiança, sobre o qual foi realizada uma implementação computacional e sua verificação. O modelo apresenta uma ontologia genérica de confiança, e três específicas: confiança nos agentes, confiança nos serviços e confiança nos produtos. Usou-se a ferramenta Protégé para implementar as classes, os atributos e as relações da ontologia genérica e das ontologias específicas. A verificação se deu pelo método de Baumeister e Seipel e pela realização de alguns exemplos, com adaptações. A partir dos experimentos computacionais conclui-se que o modelo de ontologias para confiança na web testado pode ser usado em um sistema de informação com restrições, uma vez que apresenta deficiências. / The advance of World Wide Web has changed the way businesses are conducted between organizations. Semantic Web is the next step in web evolution. It joins semantic meaning to its content, making it more accessible to machines. One of Semantic Web components are the ontologies. They are knowledge representation commonly agreed in a particular domain, in a form of classes, attributes and relations. The ontology knowledge must be shared and its structure is not definitive. One of the uses for ontologies is the trust evaluation in web businesses transactions. So one theoretical model of trust ontologies was used, it was computationally implemented, and verified. This model presents one generic trust ontology, and three specific ontologies: agent trust, service trust and product trust. Protégé tool was used to implement the classes, attributes and relations of generic ontology and of specific ontologies. Verification was performed using Baumeister and Seipel’s method by doing some examples, with adaptations. From the computational experiments it was concluded that the model of ontologies for web trust can be used in an information system with restrictions, since it has some deficiencies.
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“WARES”, a Web Analytics Recommender SystemSedliar, Kostiantyn 10 1900 (has links)
No description available.
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Processing Geometric Models of Assemblies to Structure and Enrich them with Functional Information / Analyse de modèles géométriques d'assemblages pour les structures et les enrichir avec des informations fonctionnellesShahwan, Ahmad 29 August 2014 (has links)
La maquette numérique d'un produit occupe une position centrale dans le processus de développement de produit. Elle est utilisée comme représentation de référence des produits, en définissant la forme géométrique de chaque composant, ainsi que les représentations simplifiées des liaisons entre composants. Toutefois, les observations montrent que ce modèle géométrique n'est qu'une représentation simplifiée du produit réel. De plus, et grâce à son rôle clé, la maquette numérique est de plus en plus utilisée pour structurer les informations non-géométriques qui sont ensuite utilisées dans diverses étapes du processus de développement de produits. Une demande importante est d'accéder aux informations fonctionnelles à différents niveaux de la représentation géométrique d'un assemblage. Ces informations fonctionnelles s'avèrent essentielles pour préparer des analyses éléments finis. Dans ce travail, nous proposons une méthode automatisée afin d'enrichir le modèle géométrique extrait d'une maquette numérique avec les informations fonctionnelles nécessaires pour la préparation d'un modèle de simulation par éléments finis. Les pratiques industrielles et les représentations géométriques simplifiées sont prises en compte lors de l'interprétation d'un modèle purement géométrique qui constitue le point de départ de la méthode proposée. / The digital mock-up (DMU) of a product has taken a central position in the product development process (PDP). It provides the geometric reference of the product assembly, as it defines the shape of each individual component, as well as the way components are put together. However, observations show that this geometric model is no more than a conventional representation of what the real product is. Additionally, and because of its pivotal role, the DMU is more and more required to provide information beyond mere geometry to be used in different stages of the PDP. An increasingly urging demand is functional information at different levels of the geometric representation of the assembly. This information is shown to be essential in phases such as geometric pre-processing for finite element analysis (FEA) purposes. In this work, an automated method is put forward that enriches a geometric model, which is the product DMU, with function information needed for FEA preparations. To this end, the initial geometry is restructured at different levels according to functional annotation needs. Prevailing industrial practices and representation conventions are taken into account in order to functionally interpret the pure geometric model that provides a start point to the proposed method.
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Especificação de perfis e regras, baseada em ontologias, para adaptação de conteúdo na internet.Forte, Marcos 21 August 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
DissMF.pdf: 2025508 bytes, checksum: f2e422deb152e992fd87b135fec6cd65 (MD5)
Previous issue date: 2006-08-21 / The last decade was scenery of big transformations, among them the
social revolution caused by Internet stand out, changing the way that people find
information, communicate and buy products and services. Moreover, the convergence
of telephony, informatics and consume electronic, supplies more and more mobile
devices equipped with Internet access through wireless network.
This changing caused a big problem to the Internet content available at
Web: how the same content should be adjusted to different kinds of users witch have
particular preferences, and be presented in mobile devices featured with a big diversity
of functionalities? To solve this problem, many research proposals are been developed
at content adaptation area.
One challenge of this area is define, from a user request, witch adaptation
services are necessary and these execute sequence. In order to have the best decision,
delivery context and the available services have to be acknowledged. This information
are described at profiles and rules, considering that nowadays the majority of proposed
solutions are based in proprietary models and not compatibles among each other. As
well, the discovery of services generally is strongly based on syntactic matching, what
weak the discovery and composition of services.
Intending to contribute with content adaptation area, this dissertation
defines an ontology-based set of profiles and reused. Furthermore, shows how the rules
have to be integrated with services profiles, providing a rules and profiles independent
solution. Also are presented the benefits use of semantics at match and composition of
services in an open environment such as the Web.
The implementation and the case study of this proposition were based at
a component-based content adaptation framework. With the purpose of extend its
functionality, in order to support ontology, and others necessary functions, components
were reused, adapted or created. This extensions made possible achieve the case study
and the validation of proposed solution. / Esta última década foi cenário de grandes transformações, dentre estas
destaca-se a revolução social que a Internet está promovendo, alterando a forma como
as pessoas encontram informações, comunicam-se e compram produtos e serviços.
Além disso, a convergência da telefonia, computação e eletrônica de consumo, está
disponibilizando cada vez mais dispositivos móveis de acesso a Internet que se
comunicam via redes sem fio.
Essas mudanças causaram um grande problema para o conteúdo
disponível na Web: como um mesmo conteúdo pode se adequar a diferentes tipos de
usuário, que possuem suas próprias preferências, e ser apresentado em dispositivos
móveis compostos por uma grande diversidade de características funcionais? Para
resolver este problema, muitas pesquisas estão sendo realizadas no campo da adaptação
de conteúdo.
Um dos desafios nesse campo é definir, a partir de uma requisição do
usuário, quais serviços de adaptação serão necessários e em que ordem estes serão
executados. Para que essa decisão seja tomada corretamente são necessárias
informações sobre o contexto de entrega e os serviços de adaptação disponíveis. Essas
informações são descritas por meio de perfis e regras, sendo que no momento a maioria
das soluções propostas se baseia em modelos proprietários e incompatíveis entre si.
Além disso, a descoberta de serviços geralmente é amplamente baseada em
comparações sintáticas, o que compromete a descoberta e composição de serviços.
Com o objetivo de contribuir para a área de adaptação de conteúdo, esta
dissertação define um conjunto de perfis e regras baseado em ontologias. Além disso,
demonstra como as regras devem ser integradas aos perfis de serviços, proporcionando
uma solução que seja independente de novos tipos de serviços e regras. Também são
apresentados os benefícios que a descoberta e composição de serviços obtêm com o uso
de semântica em um ambiente aberto como a Web.
A implementação e o estudo de caso dessas propostas foi baseado num
framework para adaptação de conteúdo baseado em componentes. Para estender a sua
funcionalidade com o propósito de suportar ontologias, e outras funções necessárias,
componentes foram reusados, adaptados e criados. Essa extensão viabilizou a realização
do estudo de caso e a validar a solução proposta.
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Sistema FOQuE para expansão semântica de consultas baseada em ontologias difusasYaguinuma, Cristiane Akemi 22 June 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1
1634.pdf: 2033754 bytes, checksum: ef58063d765aca814c3608c0828d4965 (MD5)
Previous issue date: 2007-06-22 / Financiadora de Estudos e Projetos / As availability of data from several areas of knowledge grows, it is even more necessary to
develop effective techniques to retrieve the desired information, aiming to reduce irrelevant
answers and ensure that relevant results are not ignored. Considering this context, we present
the FOQuE system, developed to perform query expansion in order to retrieve semantically
relevant and broad results. Based on fuzzy ontologies, this system is able to obtain
approximate results that satisfy user requirements according to expansion parameters defined
by the user. The additional answers retrieved by the FOQuE system are classified according to
the semantic expansion performed and the relevance to the query, therefore it is possible to
improve results that are presented to the user. / Diante da crescente facilidade de acesso a dados de diversas áreas do conhecimento, cada vez
mais são necessárias técnicas eficazes para recuperar a informação desejada, visando reduzir
respostas irrelevantes e assegurar que resultados relevantes não sejam desprezados. Dentro
deste contexto, este trabalho apresenta o sistema FOQuE, desenvolvido para realizar diversos
tipos de expansão de consultas com o intuito de recuperar resultados semanticamente
relevantes e abrangentes. Baseado em ontologias difusas, este sistema é capaz de obter
resultados aproximados que satisfaçam aos requisitos do usuário, de acordo com parâmetros
de expansão especificados por ele. As respostas adicionais recuperadas pelo sistema FOQuE
são classificadas segundo o tipo de expansão realizada e a relevância para a consulta,
melhorando, assim, a forma como os resultados são apresentados ao usuário.
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Gerenciamento de anotações de biosseqüências utilizando associações entre ontologias e esquemas XMLTeixeira, Marcus Vinícius Carneiro 26 May 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2080.pdf: 1369419 bytes, checksum: 4100f6c7c0400bc50f4f2f9a28621613 (MD5)
Previous issue date: 2008-05-26 / Universidade Federal de Sao Carlos / Bioinformatics aims at providing computational tools to the development of genome researches. Among those tools are the annotations systems and the Database Management Systems (DBMS) that, associated to ontologies, allow the formalization of both domain conceptual and the data scheme. The data yielded by genome researches are often textual and with no regular structures and also requires scheme evolution. Due to these aspects, semi-structured DBMS might offer great potential to manipulate those data. Thus, this work presents architecture for biosequence annotation based on XML databases. Considering this architecture, a special attention was given to the database design and also to the manual annotation task performed by researchers. Hence, this architecture presents an interface that uses an ontology-driven model for XML schemas modeling and generation, and also a manual annotation interface prototype that uses molecular biology domain ontologies, such as Gene Ontology and Sequence Ontology. These interfaces were proven by Bioinformatics and Database experienced users, who answered questionnaires to evaluate them. The answers presented good assessments to issues like utility and speeding up the database design. The proposed architecture aims at extending and improving the Bio-TIM, an annotation system developed by the Database Group from the Computer Science Department of the Federal University from São Carlos (UFSCar). / A Bioinformática é uma área da ciência que visa suprir pesquisas de genomas com ferramentas computacionais que permitam o seu desenvolvimento tecnológico. Dentre essas ferramentas estão os ambientes de anotação e os Sistemas
Gerenciadores de Bancos de Dados (SGBDs) que, associados a ontologias, permitem a formalização de conceitos do domínio e também dos esquemas de dados. Os dados produzidos em projetos genoma são geralmente textuais e sem uma estrutura de tipo regular, além de requerer evolução de esquemas. Por suas características, SGBDs semi-estruturados oferecem enorme potencial para tratar tais dados. Assim, este
trabalho propõe uma arquitetura para um ambiente de anotação de biosseqüências baseada na persistência dos dados anotados em bancos de dados XML. Neste trabalho, priorizou-se o projeto de bancos de dados e também o apoio à anotação manual realizada por pesquisadores. Assim, foi desenvolvida uma interface que utiliza ontologias para guiar a modelagem de dados e a geração de esquemas XML. Adicionalmente, um protótipo de interface de anotação manual foi desenvolvido, o qual faz uso de ontologias do domínio de biologia molecular, como a Gene Ontology e a Sequence Ontology. Essas interfaces foram testadas por usuários com experiências nas áreas de Bioinformática e Banco de Dados, os quais responderam a questionários para avaliá-las. O resultado apresentou qualificações muito boas em
diversos quesitos avaliados, como exemplo agilidade e utilidade das ferramentas. A arquitetura proposta visa estender e aperfeiçoar o ambiente de anotação Bio-TIM,
desenvolvido pelo grupo de Banco de Dados do Departamento de Computação da Universidade Federal de São Carlos (UFSCar).
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