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Estudio de la diversidad genética de la morera de papel (Broussonetia papyrifera (l.) L’Herit. Ex vent.) en el pacífico mediante un marcador molecular de sexo y microsatélites

Peñailillo Lazo, Johany Freddy January 2013 (has links)
Tesis presentada a la Universidad de Chile para optar al grado de Magíster en Bioquímica área de Especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular y Memoria para optar al Título de Bioquímico / El poblamiento de la Polinesia corresponde al último proceso de colonización humana del planeta en tierras inhabitadas. Éste es un tema de gran interés debido a que aún existen interrogantes, como por ejemplo: ¿Hubo uno o más eventos colonizadores? y ¿Cuáles fueron las rutas seguidas por los viajeros? Las primeras investigaciones fueron abordadas mediante técnicas arqueológicas y lingüísticas, siendo posteriormente complementadas con el uso de marcadores moleculares. Muchos estudios de poblamiento humano mediante marcadores moleculares están orientados al estudio del ADN humano de poblaciones actuales, sin embargo, en Polinesia las poblaciones fueron severamente diezmadas producto del contacto europeo y los habitantes actuales no necesariamente son representativos de las poblaciones originales. Por esta razón se han buscado alternativas al análisis de muestras humanas, como es el estudio de especies comensales asociadas al hombre. Entre estas especies se encuentra Broussonetia papyrifera, una especie vegetal nativa de Asia, que fue introducida en la Polinesia por los grupos colonizadores dada su importancia como materia prima para la fabricación de textiles. En base a estos antecedentes, se plantea la siguiente hipótesis: “El estudio de polimorfismos genéticos mediante marcadores moleculares de sexo y SSR en individuos de Broussonetia papyrifera provenientes de Asia y distintas islas del Pacífico, permite identificar el sexo de los individuos, así como también identificar poblaciones genéticamente diferentes, que proporcionen información para dilucidar rutas de dispersión por acción antrópica para la comprensión del proceso de colonización de Oceanía Remota”. Los análisis con marcadores moleculares se realizaron con el material genético de un banco de ADN genómico, el cual fue construido durante el desarrollo de esta tesis. Este banco genómico se desarrolló a partir de muestras foliares contemporáneas de 191 individuos diferentes de B. papyrifera, provenientes de 3 países de Asia y 9 islas o grupos de islas, comprendiendo numerosas localidades de Polinesia. Los análisis de la identificación del sexo de las muestras del banco genómico, se realizaron tras la implementación de un método de análisis para la caracterización del sexo de los individuos de B. papyrifera. El diseño de este método incluyó un marcador SCAR desarrollado en esta tesis, el cual identifica a individuos de sexo masculino. Los análisis de identificación de sexo mostraron la presencia exclusiva de individuos femeninos en la totalidad de las localidades de la Polinesia, excepto en Hawái, donde se observó la presencia de individuos de ambos sexos, en una proporción similar a la observada en las localidades asiáticas analizadas. Estos resultados sugieren una historia de colonización o dispersión diferente y más compleja para Hawái, que de las demás localidades analizadas de la Polinesia. La genotipificación de los individuos de Polinesia se realizó con marcadores de microsatélites específicos para B. papyrifera, la mayoría desarrollados en el marco de este trabajo. Se seleccionó una batería de 14 marcadores SSR que se aplicó a los individuos de Asia y Polinesia. En Asia se encontró gran diversidad genética (96,6%), en cambio hay una baja diversidad genética (20,5%) entre las muestras polinésicas analizadas. A pesar de encontrar una diversidad genética reducida, se logró identificar poblaciones diferentes al interior de la Polinesia, demostrando la validez de la hipótesis de este estudio. El análisis de las poblaciones identificadas mediante la genotipificación sirvió para establecer relaciones entre éstas, las cuales permitieron inferir probables rutas de dispersión y poblamiento. Se identificó a la población de Taiwán como posible ancestro de las poblaciones polinésicas, lo cual es concordante con datos de la literatura. Se encontró que las poblaciones provenientes de Polinesia occidental se diferencian de las de Polinesia oriental. Además los individuos de B. papyrifera masculinos encontrados en Hawái presentan una gran distancia genética con las restantes poblaciones polinésicas, sugiriendo un segundo proceso de colonización, sin descartar migraciones en periodos históricos. En resumen, se identificó diversidad genética en poblaciones de B. papyrifera actuales, procedentes de las islas de la Polinesia, validando el uso de los marcadores moleculares propuestos. Aún más importante, es que esta investigación reafirma la utilización de B. papyrifera como un buen modelo comensal para el estudio del poblamiento humano de la Polinesia / The settlement of Polynesia was the last process of human colonization of unhabited lands. This is a topic of great interest as there are still questions such as: Were there one or more colonization events? and What were the routes taken by early settlers? Research in this area was initially addressed by archaeological and linguistic techniques, and later supplemented by the use of molecular markers. At first, molecular marker analyses were oriented towards the study of contemporary human populations. However, due to European contact, populations were severely depleted and the current inhabitants are not necessarily representative of the original populations. For this reason, alternatives to the analysis of human samples, as is the study of commensal species associated with man, have been used. Among these species is Broussonetia papyrifera, a native plant from Asia that was introduced into Polynesia by the early colonizing groups, as a raw material for the manufacture of textiles. Based on this context, the following hypothesis is proposed: "The study of genetic polymorphisms using molecular markers of gender and SSR in individuals of Broussonetia papyrifera from Asia and various Pacific islands identifies the sex of individuals and genetically distinct populations, and provides information to propose possible dispersal routes by human action for understanding the process of colonization of Remote Oceania". The molecular marker analyses were performed with the genetic material of a genomic DNA bank, which was built during this thesis. This genomic DNA bank was developed from contemporary leaf samples of 191 individuals of B. papyrifera, from three Asian countries and nine islands or island groups in Polynesia. Analyses of sex identification were conducted after the implementation of an accurate method for determining the sex of B. papyrifera individuals. The design included a SCAR marker developed in this thesis, which identifies male individuals. Results of sex identification showed the exclusive presence of female individuals in all localities in Polynesia, except in Hawaii, where the presence of individuals of both sexes were observed in a similar proportions, as observed in the Asian locations analyzed in this work. These results suggest a different and more complex dispersal history for B. papyrifera in Hawaii, compared to all other Polynesian locations analyzed. B. papyrifera microsatellite markers were developed within the scope of this project, and were used in conjunction with other specific SSR markers. Genotyping was performed with a set of 14 SSR markers of samples from the Asian and Polynesian regions. Asian samples exhibited high genetic diversity (96,6%), while low genetic diversity (20,5%) was detected among the Polynesian samples. Nonetheless, different populations within Polynesia were identified, providing positive evidence for the hypothesis of this study. Relationships derived from the genotyping analysis of the identified populations, allowed inferring possible dispersal routes of during human settlement. We identified the population of Taiwan as a possible ancestor of the Polynesian samples, which is consistent with the literature. We found that populations from western Polynesia differ from those of Eastern Polynesia. Furthermore, the male individuals of B. papyrifera found in Hawaii are genetically distant from the other Polynesian populations, suggesting a second process of colonization or migration, which may have occurred even during historical periods. To summarize, genetic diversity was identified in contemporary B. papyrifera populations from the islands of Polynesia, validating the use of the proposed molecular markers. Even more importantly, this research strengthens the use of B. papyrifera as a commensal model for the study of human settlement of Polynesia / Proyecto FONDECYT 1120175
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Análisis de la variabilidad genética de ejemplares de la especie vegetal Broussonetia papyrifera en la Polinesia : evaluación mediante AFLP de un nuevo trazador de rutas migratorias humanas

Oyanedel Giaverini, Naria Factina January 2010 (has links)
Tesis para optar al grado académico de Magíster en Bioquímica, área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular, y Memoria para optar al Título Profesional de Bioquímico / Esta tesis se enmarca en un proyecto de investigación cuyo objetivo es investigar el poblamiento humano de la Polinesia utilizando marcadores genéticos, con énfasis en la colonización de Isla de Pascua. Los estudios de variación genética en poblaciones humanas modernas presentan diversos inconvenientes para dilucidar los primeros asentamientos humanos y las posteriores migraciones históricas. Por ello, para el estudio de las migraciones humanas en el Pacífico se ha utilizado el análisis de algunas especies estrechamente asociadas a los humanos que sirven como reflejo de sus movimientos colonizadores. En consecuencia, se ha postulado que identificando las relaciones genéticas (filogenia) de estas especies trazadoras, se podría dilucidar las vías de los navegantes que las transportaban. Existen estudios que avalan el uso de trazadores de las migraciones prehistóricas mediante técnicas genéticomoleculares. Una de las especies introducidas a las islas del Pacífico desde el sudeste asiático es Broussonetia papyrifera, que fue llevada desde Asia hacia el este a toda la Polinesia y aún se cultiva abundantemente en muchas islas de Oceanía, incluyendo la Isla de Pascua. En este estudio se evaluó la utilidad de B. papyrifera como un nuevo trazador de migraciones en el Pacífico analizando la variabilidad genética de muestras foliares de esta especie provenientes de la Polinesia mediante AFLP (“Amplified Fragment Length Polymorphisms”). AFLP fue la herramienta de elección debido a su alta capacidad de detectar variabilidad genética, porque no requiere conocimiento previo de la secuencia nucleotídica y permite una rápida generación de datos. Los resultados obtenidos mediante AFLP muestran que esta técnica es capaz de detectar variabilidad genética entre muestras de B. papyrifera de distintas localidades e islas, pese al corto periodo de tiempo transcurrido. El análisis filogenético permite visualizar una clara distinción entre la muestra de B. papyrifera de Taiwán y las de la Polinesia, existiendo una tendencia al agrupamiento de gran parte de las muestras analizadas según regiones insulares. Se concluye que B. papyrifera presenta una variabilidad genética detectable mediante AFLP, por lo cual esta especie podría utilizarse como trazador de migraciones. No obstante, no se logró establecer relaciones de parentesco con un apoyo estadístico fuerte. Este es un primer acercamiento para resolver esta interrogante, por lo que es necesario profundizar en estos estudios para esclarecer las posibles rutas migratorias humanas en el Pacífico / This thesis is part of a research project, related to the human settlement in Polynesia using genetic markers, with emphasis on the colonization of Easter Island. Studies about genetic variability in modern human populations have several disadvantages in establishing the origin of the first settlers and later historical migrations. Therefore, researchers have used some closely related species to humans for the study of migrations in the Pacific, because these species can serve as a mirror of the colonizers’ movements. Accordingly, it has been proposed that the identification of genetic relationships (phylogeny) of these proxy species could elucidate the routes of the sailors who transported them. Several studies endorse the use of prehistoric migration tracers through genetic techniques. One species introduced to the Pacific islands from Southeast Asia is Broussonetia papyrifera, which was carried from Asia to all Polynesia and is still grown amply on many Pacific islands, including Easter Island. In this study we evaluated the usefulness of B. papyrifera as a new migration tracer in the Pacific by analyzing the genetic variability of leaf samples collected in Polynesia using AFLP (“Amplified Fragment Length Polymorphisms”). AFLP was the tool of choice due to its high ability to detect genetic variability, because it requires no prior knowledge of nucleotide sequences and allows rapid data generation. The results obtained by AFLP show that this technique can detect genetic variability between samples of B. papyrifera from different localities and islands, despite the short period of time. The phylogenetic analysis allowed to visualize a clear distinction between the sample of B. papyrifera in Taiwan and those of Polynesia, as well as a tendency to grouping of most of the samples analyzed by islands. We conclude that B. papyrifera presents intra-species genetic variability detectable by AFLP, so this plant can be used as a migration tracer. Nevertheless, it was not possible to establish kinship with strong statistical support. This is a first approach to resolve this question, so it will be necessary to deepen on these studies to clarify the possible colonization routes of the first settlers of Easter Island and contribute to the knowledge on prehistoric migrations in the Pacific
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De l'apprentissage en famille à la scolarisation républicaine. Deux cas d'étude en Guyane et en Polynésie française / De aprendizaje en familia a la escolarización republicana. Dos casos de estudio en Guayana y en Polinesia, Francia / From family education to republican schooling. Two case studies in French Guiana and French Polynesia / Dall’educazione in famiglia alla scuola repubblicana. Due casi di studio in Guyana ed in Polinesia francese

Alí, Maurizio 27 June 2016 (has links)
Cette thèse présente une analyse anthropologique de l’éducation informelle chez deux communautés autochtones de l’Outre-mer français : les Wayana-Apalaï, en Guyane, et les Enata, en Polynésie française. A partir des données recueillies grâce à un travail ethnographique de longue durée, on a pu déterminer le temps consacré aux interactions éducatives dans le milieu domestique, les styles éducatifs dominants et les logiques éducatives des membres des deux communautés. La dynamique éducative a été interprétée en tant que processus de transmission des données culturelles liées à un paysage naturel et social déterminé. Les résultats obtenus montrent que les stratégies éducatives des Wayana-Apalaï et des Enata sont modelées par les contraintes propres à la dynamique postcoloniale et des impératifs imposés par l’économie de marché.Cette proposition de recherche veut investiguer et comparer deux cas d’étude hautement significatifs à propos desquels il existe une évidente lacune dans la littérature scientifique : c’est le cas de la scolarisation des jeunes amérindiens appartenant à l’ethnie wayana et, spécifiquement, au village d’Antecume Pata, dans le Haut Maroni, en Guyane ; et celle des jeunes de langue reo ma’ohi, en Polynésie. L’hypothèse de travail est qu’il existe un évident hiatus entre les curricula qui sont appliqués dans les écoles où sont scolarisés les jeunes natifs et les dynamiques de formation parentale traditionnelles. L’objectif de cette recherche est de démontrer que la prise en compte du contexte culturel et linguistique (et surtout du rôle qu’occupe la famille dans l’éducation des jeunes) doit participer à l'acquisition des compétences citoyennes dès le plus jeune âge, surtout dans un environnement pluriethnique. Pour tester cette hypothèse, un travail de longue durée sur le terrain a été envisagé afin d’obtenir un corpus ethnographique suffisant pour une évaluation transversale en considérant comme variables les styles éducatifs, les perceptions des parents, les attentes des maitres et les curricula scolaires à partir de la question « qu’est-ce que la réussite pour les familles des élèves et en quoi diffère-t-elle de la conception institutionnelle? » / This PhD thesis presents an anthropological analysis of informal education activities among two French autochthonous communities: the Wayana-Apalaï people, living in French Guiana, and the Enata people, in French Polynesia. Thanks to the data gathered through a long term ethnographic fieldwork, it was determined the time dedicated to educational interactions in the domestic environment, the dominant educational styles and the educational logic of both communities. The educational dynamic has been interpreted as a process of transmission of cultural data related to a natural and social landscape. The results obtained show that educational strategies applied by Wayana-Apalaï and Enata educators are shaped by the constraints of the post-colonial dynamics and the requirements imposed by the global market economy. / Esta tesis de doctorado presenta un análisis antropológico de las actividades de educación doméstica en dos comunidades autóctonas de la Francia de ultramar: los Wayana-Apalaï, quienes viven en el sector amazónico de la Guayana francesa, y los Enata, quienes habitan la isla de Hiva Oa, en la Polinesia Francesa. Gracias a los datos recogidos a través de un trabajo etnográfico de larga duración, se determinó el tiempo dedicado a las interacciones educativas en el ámbito doméstico, los estilos educativos dominantes y las lógicas educativas de ambas comunidades. La dinámica educativa se ha interpretado en función de su papel de transmisión de los datos culturales relacionados con un paisaje natural y social. Los resultados obtenidos muestran que las estrategias educativas aplicadas hoy en día por los educadores Wayana-Apalaï y los Enata intentan adaptar las lógicas educativas pre-coloniales (consideradas como “tradicionales”) a las limitaciones impuestas por la dinámica post- colonial y por la economía global. / Questa tesi di dottorato presenta un'analisi antropologica delle attività di educazione informale in due comunità autoctone della Francia d’oltremare: i Wayana-Apalaï, che vivono nel settore amazzonico della Guyana francese, e gli Enata, che vivono sull’isola di Hiva Oa, in Polinesia francese. Grazie ai dati raccolti attraverso una ricerca etnografica di lunga durata (2011-2015), è stato possibile determinare il tempo dedicato alle interazioni educative in ambito domestico, gli stili educativi dominanti e le logiche educative di entrambe le comunità. La dinamica educativa è stata interpretata come un processo di trasmissione dei dati culturali legate ad un paesaggio naturale e sociale determinato. I risultati ottenuti mostrano che le strategie educative applicate dagli educatori Wayana-Apalaï ed Enata sono il prodotto di una tensione tra le logiche precoloniali (considerate come la “vera tradizione”) ed i vincoli imposti dalle dinamiche post-coloniali e dall'economia globale.

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