Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-02-07T18:17:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AnalisesQuantitativasAplicadas.pdf: 698852 bytes, checksum: 333d9c3a9b8826f02936d7cd9456492c (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-02-27T12:10:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnalisesQuantitativasAplicadas.pdf: 698852 bytes, checksum: 333d9c3a9b8826f02936d7cd9456492c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-27T12:10:24Z (GMT). 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A análise de pedigree para estudo da variabilidade genética nos rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético foi estimada por meio dos cálculos dos parâmetros baseados na probabilidade de origem de gene, coeficiente de endogamia, parentesco e intervalo médio entre gerações, pelo software PEDIG®; do número efetivo de fundadores (Nfun), número efetivo de ancestrais (Na) e intervalo de gerações pelo software PROB_ORIG.exe presente no pacote PEDIG®; do número efetivo de genomas remanescentes (Ng), calculado pelo software SEGREG.exe. Foram calculadas as estatísticas descritivas, a análise de variância e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade para a característica Peso ao Nascer (PN) foram obtidas por meio de inferência Bayesiana pelo programa GIBBS2F90.exe. Os valores genéticos foram obtidos por meio do programa BLUPF90.exe e a regressão das Diferenças Esperadas na Progênie sobre o ano de nascimento foi realizada pelo Excel for Windows para obtenção da tendência genética do PN. O Nfun foi igual a 28,6, o Na igual a 22,8, o Ng igual a 11,2, a razão Nfun/Na foi 1,25, indicando a diminuição do número de reprodutores ao longo dos períodos e a razão Ng/Nfun foi de 0,39. Apesar do intervalo de gerações de 12,5 anos, o número efetivo de gerações foi próximo a cinco. O número total de animais estudados considerados endogâmicos foi 33,4%, sendo a máxima encontrada de 40,8%, a média da endogamia entre os animais endogâmicos foi 10,4%, e o valor médio da endogamia no arquivo total foi 3,5%. O PN de bezerros bubalinos apresentou média e desvio padrão de 36,6 ± 4,7 kg. A característica PN não apresentou distribuição Normal, com valor de W=0,976271 e P<W=0,000, conforme mostrou o teste de normalidade de Shapiro-Wilk. O modelo considerado na Análise de Variância mostrou-se significativo a P<0,0001, onde 30% da variação existente no PN pode ser explicada pelos efeitos considerados no modelo, e os outros 70% correspondem a diferenças genéticas e ambientais não consideradas no estudo. Somente os efeitos de composição racial, sexo e ano de nascimento foram significativos (P<0,01) sobre a característica PN. A distribuição da estimativa de herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos ao valor de 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética do PN mostrou-se negativa (-0,008kg/ano), porém próxima a zero, ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg/ano). A adoção de acasalamentos otimizados com controle de parentesco seria uma saída para controlar endogamia e, consequentemente, a perda de variabilidade genética, que deve ser trabalhada com base nas estimativas de herdabilidade direta e materna. / This work applies studies of quantitative genetics to the buffalo registry for the Pará State (Brazil) and provides information that can assist farmers in animal mating and selection. For the study of genetic variability in the herds of Genetic Improvement Program, pedigree analysis was estimated with parameter calculations based on probability of gene origen, endogamy coefficient, kinship coefficient and average generation interval, using the PEDIG® software; effective number of founders (Nfun), effective number of ancestors (Na) and generation interval, using the PROB_ORIG.exe software, which is included in PEDIG®; and effective number of remaining genomes (Ng) was obtained with the SEGREG.exe software. Statistics descriptive and variance analysis were calculated, and the Shapiro-Wilk test for Normality was completed using the Statistical Analysis System package. The heritability estimates for Birth Weight (PN) were found through Bayesian inference with the GIBBS2F90.exe software. The genetic values were obtained using the BLUPF90.exe software, and the regression of Expected Progeny Differences for year of birth was determined by Excel for Windows to assess PN genetic trend. Nfun was 28.6, Na was 22.8, Ng was 11.2, the Nfun/Na was 1.25, showing a reduction in the number of reproducers across time, and the Ng/Nfun rate was 0.39. Despite the generation interval of 12.5 years, the maximum effective number of generations was five. In the study, total number of animals that were considered endogamous was 33.4%, and the highest endogamy was found to be 40.8%. Average coefficient of endogamy among endogamous animals was 10.4%, and the general mean was 3.5%. The PN of buffalo calves yielded an average and a standard deviation of 36.6 ± 4.7 kg. PN did not present Normal Distribution, W=0.976271 and P<W=0.000, according to the Shapiro-Wilk test for normality. The model that was considered for variance analysis was significative at P<0.0001, where 30% of the existing variance in PN can be accounted for by the effects considered in the model, and the remaining 70% correspond to genetic and environmental differences that were not taken into account in the study. Only the effects of racial composition, sex and year of birth were significative (P<0.01) on PN. The distribution of direct heritability estimates revealed platykurtic and greater asymmetry, with a bimodal distribution where the first mode was near 0.10, and the second near 0.30; maternal heritability estimate was trimodal, with peaks very close to 0.15 and other, less outstanding, near 0.20. PN genetic trend was negative (-0.008kg/year), near zero, although the phenotypic trend was positive (0.156kg/year). Optimized matings, with kinship control, might be a solution to monitor endogamy and, consequently, the loss of genetic variability, which must be explored and take into account the estimates for direct and maternal heritability.

A cultura da batata (Solanum tuberosum L) está se tornando cada vez mais importante, tanto do ponto de vista dos produtores, dos pesquisadores e dos consumidores, por ser um dos alimentos protéicos mais consumidos em todo o mundo, entretanto, o Brasil depende de variedades importadas, originárias de clima temperado o que não condiz com as nossas condições, refletindo assim em valores inferiores de produtividade e de qualidade. Apesar da grande evolução que esta cultura apresentou em todos estes anos de cultivo se faz necessário a busca por materiais mais produtivos, adaptados e resistentes. Os programas de melhoramento convencionais são extremamente importantes para a seleção de novos progenitores, entretanto o tempo gasto para desenvolver e lançar uma variedade é bastante longo. Diante deste cenário, novas metodologias estão sendo cada vez mais utilizadas no processo de identificação de bancos de germoplasma e cultivares mais promissoras. O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de marcadores microssatélites, 108 acessos de batata de cinco coleções contendo variedades comerciais, clones para programas de melhoramento e cultivo orgânico, visando a caracterização genética, a identificação de duplicatas e de possíveis parentais para uso nos programas de melhoramento. Para a caracterização molecular foram utilizados 10 iniciadores específicos (primers), gerando-se um total de 50 alelos (bandas) os quais foram analisados como dados binários, sendo que a partir destes dados foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de similaridade de Jaccard. Com este coeficiente e com o método aglomerativo UPGMA, foram realizadas análises de agrupamento utilizando o software NTSYSpc e um método de reamostragens (bootstraps), gerando dendrogramas que permitiram a distinção genética entre os acessos. O conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) e a heterogozidade esperada (He) foram significativos, sendo que os maiores valores foram 0,8594 e 0,8725, respectivamente, para o primer STM0019a. Em média, o número de alelos por loco foi cinco, variando de dois alelos para os primers STM 1053 e STM 1104 até 13 alelos por loco para o primer STM0019a. Para facilitar a visualização dos resultados, além de serem avaliados como um todo os 108 acessos foram divididos em grupos de acordo com as coleções (variedades comerciais, clones e cultivo orgânico), sendo que a maior variação pelo coeficiente de Jaccard foi de 0,39 a 0,93 para 57 acessos das coleções de cultivares orgânicos e comerciais. Ao se avaliar os 108 acessos juntos, o coeficiente de Jaccard variou de 0,42 a 0,93, mostrando a grande variabilidade genética entre os acessos das cinco coleções. Foram observadas seis possíveis duplicatas [ATLANTIC (Canadá) e ATLANTIC (Chile); 67-2 e 17-10 (clones CNPH1); COLORADO e ÁGATA (EPAMIG); 253 E 266 (clones CNPH2); MELODY e APTA 21-54 (cultivo orgânico); e 387-1 (E1) e VOYAGER], identificando-se também os acessos mais distantes geneticamente [clone 383-19 (EmbrapaCNPH1) e a cultivar comercial HPC-7B], permitindo desta forma a identificação de possíveis parentais para os programas de melhoramento. Os altos níveis de polimorfismo observados paraSolanum tuberosum sugerem que os marcadores microssatélites podem ser uma ferramenta útil para detectar as diferenças genéticas entre cultivares de batata. / The cultivation of potato (Solanum tuberosum L) is becoming increasingly important from the point of view of producers, researchers and consumers, for representing one of the food protein mostly consumed in the world. However, Brazil depends on imported varieties, originated from temperate climate which does not complies with our conditions, thus reflecting in lower productivity and quality. Despite the great progress that this crop presented in all these years of cultivation, it is necessary to search for more productive, adapted and resistant materials. The conventional breeding programs are important for the selection of new parents, but the time spent to develop and launch a new variety is quite long. In this scenario, new approaches are being increasingly used in the identification of germplasm banks and most promising cultivars. The objective of this study was to evaluate, using microsatellite markers, 108 accessions of five potato collections containing commercial varieties, clones for breeding programs and organic farming varieties, aiming at the genetic characterization, identification of duplicates and possible parents to be used in potato breeding programs. For the molecular characterization, 10 specific primers were used, generating a total of 50 alleles (bands) which were analyzed as binary data, and from this data a similarity matrix was obtained using the Jaccard coefficient of similarity. With this coefficient and the UPGMA method, cluster analysis were carried out using the NTSYSpc software and bootstraps analyses, generating dendrograms which allowed the genetic distinction between accessions. The polymorphism information content (PIC) and expected heterozygosity (He) were both significant, with the highest values (0.8594 and 0.8725, respectively) obtained for primer STM0019a. On average, the number of alleles per locus was five, ranging from two alleles for primers STM 1053 and STM 1104 to 13 alleles per locus for primer STM0019a. To facilitate the visualization of the results, in addition to being evaluated as a whole, the 108 accessions were divided into groups according to the collections (commercial varieties, clones and organic farming), where the highest variation for the Jaccard coefficient (0.39 - 0.93) was found for the 57 accessions of organic and commercial cultivars collections. When assessing the 108 accessions together, the Jaccard coefficient ranged from 0.42 to 0.93, showing a high genetic variability between accessions of the five collections. Six possible duplicates were found [\'ATLANTIC (Canada) and ATLANTIC (Chile); 67-2 and 17-10 (clones CNPH1); Color and AGATE (EPAMIG); 253 E 266 (clones CNPH2); MELODY and APTA 21-54 (organic farming); and 387-1 (E1) and VOYAGER], and also the more genetically distant accessions [clone 383-19 (EmbrapaCNPH1) and the commercial cultivar HPC- 7B] were identified, thereby enabling the identification of potential parents for breeding programs. High levels of polymorphism observed for Solanum tuberosum suggest that microsatellite markers can be a useful tool to detect the genetic differences between potato cultivars.

Heliothis virescens (Fabricius) é uma das pragas-alvo do algodão geneticamente modificado que expressa a proteína Cry1Ac de Bacillus thuringiensis Berliner (Bt). Estudos sobre a suscetibilidade de H. virescens à proteína Cry1Ac e sobre a estrutura genética e padrões de fluxo gênico nas escalas locais e regionais desse inseto são fundamentais para a implementação de programas de Manejo da Resistência de Insetos (MRI) no Brasil. Dessa forma, os principais objetivos do trabalho foram: (a) avaliar a suscetibilidade à proteína Cry1Ac em populações de H. virescens coletadas nas principais regiões produtoras de algodão no Brasil (Bahia, Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul) durante as safras agrícolas 2007/08 e 2008/09; e (b) avaliar a variabilidade genética e fluxo gênico de populações de H. virescens provenientes das culturas de algodão (safras 2007/08, 2008/09 e 2009/10) e de soja (safra 2009/10) utilizando sequências de DNA mitocondrial (DNAmit). As linhas-básica de suscetibilidade à proteína Cry1Ac foram estabelecidas mediante o uso de lagartas neonatas, por meio de bioensaios de incorporação das diferentes concentrações da proteína em dieta artificial. Para avaliar a variabilidade genética e o fluxo gênico entre populações de H. virescens utilizou-se sequências de DNAmit das subunidades I e II da citocromo oxidase COI e COII e a subunidade 6 da desidrogenase dinucleotídica da adenina nicotinamida nad6. As CLs50 estimadas variaram de 0,18 a 0,66 µg de Cry1Ac/mL de dieta para as populações coletadas na safra 2007/08 (variação de 3,7 vezes). Da mesma forma, as concentrações efetivas médias para a inibição do desenvolvimento larval (CE50) variaram de 0,0053 a 0,0161 µg de Cry1Ac/mL dieta (variação de 3,0 vezes). A partir da análise conjunta dos dados de concentração-mortalidade de todas as populações avaliadas, foram definidas e validadas as concentrações diagnósticas de 3,1 e 5,6 µg de Cry1Ac/mL de dieta para programas de monitoramento da resistência de H. virescens à proteína Cry1Ac no Brasil. Baseadas em análises de agrupamento (Neighbor-Joining e Análise de Componentes Principais) e Bayesiana (Structure) foram verificadas uma baixa estruturação entre as populações de H. virescens de diferentes regiões, bem como para aquelas coletadas em plantas hospedeiras diferentes. As análises de AMOVA também indicaram baixa estruturação genética entre as populações de H. virescens estudadas independente da cultura (Fst= 0,019) ou escala geográfica (Fst= 0,012), sugerindo um nível significativo de fluxo gênico. Em média, a distância genética entre as amostras foi de 0,1%. Uma rede de haplótipos obtida com os dados combinados resultou em 35 haplótipos, com quatro haplótipos únicos presentes somente nas amostras coletadas em soja. A principal característica dessa rede é a forma de estrela na distribuição dos haplótipos, bem como a ocorrência de muitos alelos em baixa frequência. Esse tipo de rede é característico de populações que passaram por uma recente expansão populacional e, de fato, a história demográfica de H. virescens, baseada no teste de distribuição da diferença genética par-a-par entre haplótipos (distribuição de Mismatch) e nos resultados negativos nos testes de neutralidade seletiva indicam também um episódio de expansão populacional recente. As informações obtidas no presente trabalho serão fundamentais para o acompanhamento da efetividade das estratégias de manejo da resistência de H. virescens à proteína Cry1Ac no Brasil. / The tobacco budworm, Heliothis virescens (Fabricius), is one of target pests of genetically modified cotton expressing Cry1Ac insecticidal protein derived from Bacillus thuringiensis Berliner. Studies on susceptibility of H. virescens to Cry1Ac and the genetic structure and gene flow patterns at local and regional levels are crucial for establishing an Insect Resistance Management (IRM) program for Bt cotton in Brazil. Thus, the objectives of this study were (a) to evaluate the susceptibility of field-collected populations of H. virescens to Cry1Ac from major cotton-growing regions in Brazil (Bahia, Goiás, Mato Grosso and Mato Grosso do Sul) in the cropping seasons of 2007/08 and 2008/09; and (b) to evaluate the genetic variability and gene flow among H. virescens populations from cotton (2007/08, 2008/09 and 2009/10 cropping seasons) and soybean (2009/10 cropping season) with mitochondrial DNA markers. Baseline susceptibility data to Cry1Ac protein were estimated with neonate larvae thereby using diet incorporation bioassays. Genetic variation and gene flow among H. virescens populations were evaluated by using mitDNA sequences of cytochrome oxidase subunities I and II COI e COII and the subunity 6 of dinucleotide dehydrogenase of adenine nicotinamide nad6. The estimated LC50 values varied from 0.18 to 0.66 µg of Cry1Ac/mL of diet among the 2007/08 populations (3.7 fold variation). Similarly, the EC50 values based on growth inhibition ranged from 0.0053 to 0.0161 µg of Cry1Ac/mL of diet for the 2007/08 populations (3.0 fold variation). A joint analysis of the mortality data across all tested populations was used to develop candidate diagnostic concentrations for future monitoring programs. The proposed diagnostic concentrations of 3.1 and 5.6 µg of Cry1Ac/mL of diet were validated against field-collected populations from 2008/09 and will form the basis for future resistance monitoring programs with H. virescens. Based on cluster analysis (Neighbor-Joining and Principal Coordinate Analysis) and Bayesian analysis (Structure), a low structure was detected among H. virescens populations either by regions or host plants. AMOVA analysis also indicated low genetic structure among H. virescens populations across crops (Fst= 0.019) or geographic scale (Fst= 0.012), suggesting a significant gene flow. The mean genetic distance among samples was 0.1%. The haplotype network obtained with joint data resulted in 35 haplotypes, with four unique haplotypes present only in samples collected from soybean crop. The major characteristics of the haplotype network were the star-like pattern and the occurrence of many alleles at low frequencies. This type of network is typical for populations that passed through a recent population expansion and, in fact, the demographic history of H. virescens, based on distribution test of pair-wise genetic difference among haplotypes (Mismatch distribution) and negative results from tests of selective neutrality also indicate an episode of a recent population expansion.

A teca (Tectona grandis) é uma das principais espécies madeireiras do mundo, com alto valor econômico, muito famosa por sua beleza, resistência e durabilidade. A espécie ocorre naturalmente na Índia, Mianmar, Tailândia, Laos e Indonésia, onde estudos de diversidade têm sido realizados no que tange à conservação de recursos genéticos. Entretanto, existe a necessidade de estudos de diversidade genética de teca no Brasil que poderiam ser utilizados, principalmente, para a proteção de cultivares e para o melhoramento genético. Visto isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética de genótipos de teca utilizados nos plantios brasileiros. Para tanto foram testados 10 primers de microssatélites, obtidos na literatura, para a avaliação de 60 genótipos, 33 provenientes de sementes de plantios de teca em Cáceres, 14 correspondentes a clones obtidos em Cáceres e 13 genótipos referentes a clones de procedências fora do Brasil, sendo estas, Honduras, Malásia, Índia, Indonésia, Costa do Marfim e Ilhas Salomão. Os genótipos foram divididos em oito grupos, de acordo com sua procedência, para a análise da diversidade genética. Foram realizadas análises multivariadas pelo método bayesiano no programa STRUCTURE, análises de agrupamento e coordenadas principais. Dos 10 primers testados, nove se mostraram polimórficos, sendo então utilizados para as análises estatísticas. Elevada variabilidade genética para os genótipos de teca foi detectada, sendo o número médio de alelos por loco igual a 5,22. Os genótipos de Cáceres apresentaram 100% de polimorfismo, seguido pelos clones da Índia com 90% de polimorfismo. A heterozigosidade média observada ( o= 0,352) foi menor que a heterozigosidade média esperada ( e =0,443). Coerentemente com outros estudos em teca, a maior parte da variabilidade genética concentrou-se dentro dos grupos (Hs = 0,436). Com as análises do programa STRUCTURE foi possível definir a divisão dos genótipos em três grupos, sendo 73,4% dispostos em um único grupo (vermelho) representado pela maioria dos genótipos de Cáceres, 13,3% alocados no grupo verde compostos por alguns clones da Índia, Ilhas Salomão, um clone da Malásia, um de Honduras e os clones da Costa do Marfim e os 13,3% dos genótipos restantes possuíram uma mistura dos dois grupos (vermelho e verde). A análise de agrupamento, utilizando índice de Jaccard, indicou a separação dos genótipos em seis grupos distintos: grupo I pertencente ao clone da Indonésia, grupo II possuindo dois clones da Índia, grupo III com os genótipos de Cáceres e dois clones de fora (um da Índia e outro da Malásia), grupo IV possuindo os genótipos de Honduras e Malásia, grupo V com clones da Índia e grupo VI pertencente aos clones da Costa do Marfim e das Ilhas Salomão, sendo coerente com a análise de coordenadas principais. Através do agrupamento utilizando distância de Nei, foi possível inferir duas possíveis origens da teca implantada no Brasil: Malásia e Índia. Após a avaliação das divergências genéticas, sugestões são feitas no que tange a utilização de genótipos contrastantes para o uso como parentais em programas de melhoramento genético. / Teak (Tectona grandis) is one of the main timber species in the world with high economic value, famous for its beauty, strength and durability. The species occurs naturally in India, Myanmar, Thailand, Laos and Indonesia, where diversity studies have been conducted with regard to the conservation of genetic resources. However, there is a need for studies of genetic diversity of teak in Brazil that could be used mainly for the protection of plant varieties and for breeding. Therefore, the objective of this study was to characterize the genetic diversity of teak genotypes used in Brazilian plantations. We tested 10 microsatellite primers, obtained in the literature, to assess 60 teak genotypes, 33 genotypes from seeds of plantations in Caceres, 14 clones obtained in Caceres and 13 clones originated from Honduras, Malaysia, India, Indonesia, Ivory Coast and Solomon Islands. The genotypes were divided in eight groups, in accordance to its origin, for the genetic diversity analysis. Multivariate analysis were conducted using the Bayesian method implemented in the program STRUCTURE, as well as cluster and principal coordinates analysis. Of the 10 primers tested, 9 showed polymorphism, and were then used for statistical analysis. High genetic variability for the teak genotypes was detected, with the average number of alleles per locus equal to 5.22. Caceres genotypes showed 100% polymorphism, followed by the clones from India with 90% polymorphism. The average observed heterozygosity ( o = 0.352) was lower than the average expected heterozygosity ( e = 0.443). Consistent with other studies in teak, most of the genetic variability was concentrated within groups (Hs = 0.436). With the analysis of the STRUCTURE software it was possible to define the division of the genotypes into three groups, 73.4% placed in one group (red) represented the majority of the genotypes of Caceres, and 13.3% allocated in the green group composed of some clones from India, a clone from Solomon Islands, Malaysia and Honduras and the clones of the Ivory Coast. The 13.3% of the remaining genotypes possessed a mixture of the two groups (red and green). Cluster analysis using Jaccard index indicated the separation of the genotypes into six distinct groups: group I belonging to the clone from Indonesia, group II having two clones from India, group III with genotypes from Caceres and two clones from India and Malaysia, group IV having the Honduras and Malaysia genotypes, group V with clones from India and group VI with clones belonging to the Ivory Coast and the Solomon Islands. This result was consistent with the principal coordinate analysis. From the results described above, together with the cluster analysis using Neis distance, it was possible to infer two probable origins of teak implemented in Brazil: India and Malaysia. After assessing the genetic divergences, suggestions were made concerning the use of contrasting genotypes as parents in breeding programs.

Heliothis virescens (Fabricius) é uma das pragas-alvo do algodão geneticamente modificado que expressa a proteína Cry1Ac de Bacillus thuringiensis Berliner (Bt). Estudos sobre a suscetibilidade de H. virescens à proteína Cry1Ac e sobre a estrutura genética e padrões de fluxo gênico nas escalas locais e regionais desse inseto são fundamentais para a implementação de programas de Manejo da Resistência de Insetos (MRI) no Brasil. Dessa forma, os principais objetivos do trabalho foram: (a) avaliar a suscetibilidade à proteína Cry1Ac em populações de H. virescens coletadas nas principais regiões produtoras de algodão no Brasil (Bahia, Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul) durante as safras agrícolas 2007/08 e 2008/09; e (b) avaliar a variabilidade genética e fluxo gênico de populações de H. virescens provenientes das culturas de algodão (safras 2007/08, 2008/09 e 2009/10) e de soja (safra 2009/10) utilizando sequências de DNA mitocondrial (DNAmit). As linhas-básica de suscetibilidade à proteína Cry1Ac foram estabelecidas mediante o uso de lagartas neonatas, por meio de bioensaios de incorporação das diferentes concentrações da proteína em dieta artificial. Para avaliar a variabilidade genética e o fluxo gênico entre populações de H. virescens utilizou-se sequências de DNAmit das subunidades I e II da citocromo oxidase COI e COII e a subunidade 6 da desidrogenase dinucleotídica da adenina nicotinamida nad6. As CLs50 estimadas variaram de 0,18 a 0,66 µg de Cry1Ac/mL de dieta para as populações coletadas na safra 2007/08 (variação de 3,7 vezes). Da mesma forma, as concentrações efetivas médias para a inibição do desenvolvimento larval (CE50) variaram de 0,0053 a 0,0161 µg de Cry1Ac/mL dieta (variação de 3,0 vezes). A partir da análise conjunta dos dados de concentração-mortalidade de todas as populações avaliadas, foram definidas e validadas as concentrações diagnósticas de 3,1 e 5,6 µg de Cry1Ac/mL de dieta para programas de monitoramento da resistência de H. virescens à proteína Cry1Ac no Brasil. Baseadas em análises de agrupamento (Neighbor-Joining e Análise de Componentes Principais) e Bayesiana (Structure) foram verificadas uma baixa estruturação entre as populações de H. virescens de diferentes regiões, bem como para aquelas coletadas em plantas hospedeiras diferentes. As análises de AMOVA também indicaram baixa estruturação genética entre as populações de H. virescens estudadas independente da cultura (Fst= 0,019) ou escala geográfica (Fst= 0,012), sugerindo um nível significativo de fluxo gênico. Em média, a distância genética entre as amostras foi de 0,1%. Uma rede de haplótipos obtida com os dados combinados resultou em 35 haplótipos, com quatro haplótipos únicos presentes somente nas amostras coletadas em soja. A principal característica dessa rede é a forma de estrela na distribuição dos haplótipos, bem como a ocorrência de muitos alelos em baixa frequência. Esse tipo de rede é característico de populações que passaram por uma recente expansão populacional e, de fato, a história demográfica de H. virescens, baseada no teste de distribuição da diferença genética par-a-par entre haplótipos (distribuição de Mismatch) e nos resultados negativos nos testes de neutralidade seletiva indicam também um episódio de expansão populacional recente. As informações obtidas no presente trabalho serão fundamentais para o acompanhamento da efetividade das estratégias de manejo da resistência de H. virescens à proteína Cry1Ac no Brasil. / The tobacco budworm, Heliothis virescens (Fabricius), is one of target pests of genetically modified cotton expressing Cry1Ac insecticidal protein derived from Bacillus thuringiensis Berliner. Studies on susceptibility of H. virescens to Cry1Ac and the genetic structure and gene flow patterns at local and regional levels are crucial for establishing an Insect Resistance Management (IRM) program for Bt cotton in Brazil. Thus, the objectives of this study were (a) to evaluate the susceptibility of field-collected populations of H. virescens to Cry1Ac from major cotton-growing regions in Brazil (Bahia, Goiás, Mato Grosso and Mato Grosso do Sul) in the cropping seasons of 2007/08 and 2008/09; and (b) to evaluate the genetic variability and gene flow among H. virescens populations from cotton (2007/08, 2008/09 and 2009/10 cropping seasons) and soybean (2009/10 cropping season) with mitochondrial DNA markers. Baseline susceptibility data to Cry1Ac protein were estimated with neonate larvae thereby using diet incorporation bioassays. Genetic variation and gene flow among H. virescens populations were evaluated by using mitDNA sequences of cytochrome oxidase subunities I and II COI e COII and the subunity 6 of dinucleotide dehydrogenase of adenine nicotinamide nad6. The estimated LC50 values varied from 0.18 to 0.66 µg of Cry1Ac/mL of diet among the 2007/08 populations (3.7 fold variation). Similarly, the EC50 values based on growth inhibition ranged from 0.0053 to 0.0161 µg of Cry1Ac/mL of diet for the 2007/08 populations (3.0 fold variation). A joint analysis of the mortality data across all tested populations was used to develop candidate diagnostic concentrations for future monitoring programs. The proposed diagnostic concentrations of 3.1 and 5.6 µg of Cry1Ac/mL of diet were validated against field-collected populations from 2008/09 and will form the basis for future resistance monitoring programs with H. virescens. Based on cluster analysis (Neighbor-Joining and Principal Coordinate Analysis) and Bayesian analysis (Structure), a low structure was detected among H. virescens populations either by regions or host plants. AMOVA analysis also indicated low genetic structure among H. virescens populations across crops (Fst= 0.019) or geographic scale (Fst= 0.012), suggesting a significant gene flow. The mean genetic distance among samples was 0.1%. The haplotype network obtained with joint data resulted in 35 haplotypes, with four unique haplotypes present only in samples collected from soybean crop. The major characteristics of the haplotype network were the star-like pattern and the occurrence of many alleles at low frequencies. This type of network is typical for populations that passed through a recent population expansion and, in fact, the demographic history of H. virescens, based on distribution test of pair-wise genetic difference among haplotypes (Mismatch distribution) and negative results from tests of selective neutrality also indicate an episode of a recent population expansion.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-06T19:37:11Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1317937 bytes, checksum: b57d780dc1e2676fc7d25c235e76b1b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T19:37:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1317937 bytes, checksum: b57d780dc1e2676fc7d25c235e76b1b5 (MD5) Previous issue date: 2005-12-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As linhagens resultantes de intensos processos seletivos, antes de sua recomendação como cultivares, passam por criteriosas avaliações de campo na busca de informações precisas sobre seu comportamento agronômico e produtivo. Além dos ensaios de campo, as linhagens são avaliadas quanto à reação a doenças, em especial, as de reconhecida importância e maior potencial de causar perdas. Por outro lado, a pressão de seleção exercida tem levado à redução da base genética da soja no Brasil. Neste enfoque, os objetivos do trabalho foram: conhecer o desempenho agronômico e a reação ao cancro-da-haste de linhagens selecionadas; e avaliar a existência de diversidade genética entre e dentro de populações, após vários ciclos de seleção. Na realização do estudo foram, inicialmente, avaliadas cinco populações no primeiro ensaio (1998/99), sendo as linhagens mais promissoras reavaliadas em um segundo ensaio de campo (2001) e também quanto à reação ao cancro-da-haste (casa-de-vegetação). As análises univariadas indicaram diferenças entre as linhagens e entre as populações. As populações IV e V, oriundas do cruzamento de Coker 6738 x FT Cristalina RC4F 4 e Agratech 550 x FT Cristalina RC4F 4 foram as mais divergentes e também as de melhor potencial produtivo. Os resultados da análise discriminante foram concordantes com os observados nos estudos univariados e confirmaram as populações IV e V como as mais divergentes do grupo avaliado. Indicaram, ainda, que a seleção realizada reduziu a variabilidade genética dentro de populações, sendo que a seleção privilegiou linhagens similares aos genitores e padrões mais adaptados à região em que se realizou a seleção. Com a avaliação da reação ao cancro-da-haste foram identificadas linhagens que agregam boa produtividade e resistência a esta doença. As estimativas de correlação indicaram que avaliações aos 10 e 20 dias após a inoculação são suficientes para identificação de plantas com reação de resistência. / Before being recommended as cultivars, the lines resulting from intense selective processes undergo careful field evaluations aiming at precise information on their agronomic and productive behaviour. Besides field assay, the lines are evaluated on reaction to diseases, especially those of recognized importance and greater loss potential. However, such selection pressure has led to a reduction of the soybean genetic base in Brazil. Focusing on this issue, this work aimed to: understand the agronomic performance and stem canker reaction of the selected lines; and evaluate the existence of genetic diversity among and within populations after various selection cycles. Five populations were initially evaluated in the first assay (1998/99), with the most promising lines being re-evaluated in second field assay (2001) as well as for stem canker reaction (greenhouse). The univariate analyses showed differences among the lines and among the populations. Populations IV and V, derived from Coker 6738 x FT Cristalina RC4F 4 and Agratech 550 x FT Cristalina RC4F 4 crosses were the most divergent and showed the best productive potential, as well. The discriminant analysis results were in agreement with those observed in the xiunivariate analysis studies and confirmed populations IV and V as the most divergent in the group evaluated. The results also showed that selection carried out reduced the genetic variability within the populations, favoring lines similar to parents and controls more adapted to the region where the selection was conducted. Stem canker reaction evaluation identified lines that combine good productivity and resistance to this disease. The correlation estimates indicated that evaluations at 10 and 20 days after inoculation are sufficient to identify disease resistant – plants.

SILVA, J. F. Resistência genética e induzida de Vigna unguiculata (L.) Walp. à Aphis craccivora Koch e sua amostragem. 2001. 122 f. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2011. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-07-16T21:25:16Z No. of bitstreams: 1 2011_tese_jfsilva.pdf: 4457531 bytes, checksum: 4fbe9f0496227d02f6b0661f7fb85941 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-07-17T16:58:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_tese_jfsilva.pdf: 4457531 bytes, checksum: 4fbe9f0496227d02f6b0661f7fb85941 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-17T16:58:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_tese_jfsilva.pdf: 4457531 bytes, checksum: 4fbe9f0496227d02f6b0661f7fb85941 (MD5) Previous issue date: 2011 / The objective of this work were: to evaluate resistance of cowpea genotypes [Vigna unguiculata (L.) Walp.] to the black aphid [Aphis craccivora Koch, 1854] and to study the genetic variability of these genotypes for this feature; to evaluate the possible inducible action of cis-jasmone to resistance to this pest; to study the spatial dispersion of the aphid in cowpea culture, and to establish the number of samples required to estimate the population of the pest to use in integrated pest management programs. To evaluate the resistance preference, an experiment was conducted in a greenhouse at the Universidade Federal do Ceará (UFC) in Fortaleza, Ceará. The experimental design was randomized blocks with 51 treatments, represented by genotypes and four replications. We estimated the generalized Mahalanobis distances and grouping of genotypes was performed using the Tocher optimization method. For the evaluation of cis-jasmone three experiments were conducted, the first in Quixadá, Ceará, in the design of randomized blocks with five replications and five treatments as follow: untreated control; application of the insecticide endosulfan and deltamethrin, and the application of cis-jasmone a single dose of 60 g.ha-1, three applications of 20 g ha-1 and six of 10 g ha-1 on the cultivar Vita 7. In the second, in the same place, the seeds of the TVu 408 P2, BRS Gurguéia and Vita 7 were soaked in a solution of cis-jasmone with 60 g ha-1 or in water for 24 hours. The design was factorial 3x2 in blocks. In the third experiment, conducted in the UFC, we used a randomized block design with four replications and four treatments consisting of an untreated control, and applications of cis-jasmone at doses of 50 g ha-1, 100 g ha-1 and 200 g ha-1. The cultivar was Vita 7. For the evaluations, the number of colonies of aphids present in every plant was counted. To evaluate the spatial distribution of aphid were grown in two field trials in the UFC. The first field had an area of 216 m² and second 576 m². The fields were divided into 15 and 25 plots, respectively. The cultivar used was Vita 7 spaced in 0.25 m x 0.8 m. On those fields were performed six collections of data in each field where they were evaluated ten plants per plot. It was count the number of colonies of aphids present throughout the plant. The results show that the genotypes BRS Guariba, TVu 410, BRS Paraguaçu TVu 36, Sempre Verde, TVu 408 P2, Setentão e Epace 10 have greater resistance to the aphid than the others. The largest differences were found between BRS Guariba and Sete Semanas and between Tvu 410 and Sete Semanas, while the BRS Guariba and TVu 410 were the most similar. We observed the division of the genotypes in eight groups and the character that contributes to the most divergence was the number of nymphs. The crosses among the genotype Setentão and the genotypes BRS Guariba ,TVu 410, BRS Paraguaçu, TVu 36, TVu 408 P2 and between Epace 10 and Sempre Verde, BRS Guariba and TVu 410 may result in new genetic combinations intended to improve resistance to aphid. In all experiments, cis-jasmone did not reduce the infestation of A. craccivora and so concluding that this product, under field conditions, does not induce resistance. The dispersion indices indicate that aggregate was the case in this study, which was confirmed by data fitting the frequency distribution of the Negative Binomial. Forty five is the appropriate number of samples to estimate the population of A. craccivora in the fields of V. unguiculata to be used in Integrated Pest Management programs. / Objetivaram-se neste trabalho: avaliar a resistência de genótipos de feijão de corda [Vigna unguiculata (L.) Walp.] ao pulgão preto [Aphis craccivora Koch 1854] e estudar a variabilidade genética desses genótipos para esta característica; avaliar a ação indutora da cis-jasmona para a resistência a esta praga; estudar a dispersão espacial do pulgão na cultura de feijão de corda; e estabelecer o número de amostras necessárias para a estimativa da população da praga para o uso em programas de Manejo Integrado de Pragas. Para a avaliação da resistência foi conduzido um experimento de preferência em casa de vegetação na Universidade Federal do Ceará (UFC), em Fortaleza, Ceará. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com 51 tratamentos, representados pelos genótipos, e quatro repetições. Foram estimadas as distâncias generalizadas de Mahalanobis e o agrupamento dos genótipos foi realizado utilizando o método de otimização de Tocher. Para a avaliação da cis-jasmona foram conduzidos três experimentos, sendo o primeiro em Quixadá, Ceará, no delineamento de blocos casualizados com cinco repetições e cinco tratamentos sendo: uma testemunha; aplicação dos inseticidas endosulfan e deltamethrin; e a aplicação da cis-jasmona em dose única de 60 g.i.a. ha-1, em três aplicações de 20 g.i.a. ha-1 e seis de 10 g.i.a. ha-1 sobre a cultivar Vita 7. No segundo, no mesmo local, as sementes das cultivares TVu 408 P2, BRS Gurguéia e Vita 7 foram embebidas em uma solução de cis-jasmona na concentração de 60 g.i.a. ha-1 ou em água por 24 horas. O delineamento utilizado foi em blocos casualizados no arranjo fatorial 3x2. No terceiro experimento, conduzido na UFC, utilizou-se o delineamento de blocos casualizados com quatro repetições e quatro tratamentos que consistiam de uma testemunha; e aplicações de cis-jasmona nas doses de 50 g.i.a. ha-1, 100 g.i.a. ha-1 e 200 g.i.a. ha-1. A cultivar utilizada foi a Vita 7. Para as avaliações foi contado o número de colônias de pulgão presentes em toda planta. Para estudo da dispersão do pulgão foram cultivados dois campos experimentais na UFC. O primeiro campo tinha uma área de 216 m² e o segundo 576 m². Os campos foram divididos em 15 e 25 parcelas, respectivamente. A cultivar utilizada foi a Vita 7 no espaçamento de 0,25 m x 0,8 m. Foram realizadas seis coletas de dados em cada campo onde foram avaliadas dez plantas por parcelas. Foi contado o número de colônias de pulgão presentes em toda a planta. Os resultados demonstram que os genótipos BRS Guariba, TVu 410, BRS Paraguaçu, TVu 36, Sempre Verde, TVu 408 P2, Setentão e Epace 10 apresentam maior resistência ao pulgão. As maiores divergências encontradas foram entre o BRS Guariba e Sete Semanas e entre TVu 410 e Sete Semanas, enquanto o BRS Guariba e TVu 410 foram os mais similares. Foi observada a divisão dos genótipos em oito grupos e o caractere que mais contribui para a divergência é o número de ninfas. O cruzamento entre o genótipo Setentão e os genótipos BRS Guariba,TVu 410, BRS Paraguaçu, TVu 36, TVu 408 P2 e entre o Epace 10 e o Sempre Verde, BRS Guariba e TVu 410 podem resultar em novas combinações genéticas visando o melhoramento da resistência ao pulgão. Em todos os experimentos a cis-jasmona não reduziu a infestação de A. craccivora concluindo-se que essa substância, em condições de campo, não induz a resistência. Quanto a dispersão os índices de agregação utilizados indicam que do tipo agregada o que foi confirmado pelo ajuste dos dados a distribuição de frequência Binomial Negativa. Quarenta e cinco é o número de amostras adequado para a estimativa da população de A. craccivora em campos de V. unguiculata para aplicação em programas de Manejo Integrado de Pragas.

Made available in DSpace on 2016-06-21T13:43:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 833.pdf: 2723781 bytes, checksum: a830784ddefc542106be74ce8aa431fa (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Made available in DSpace on 2016-07-05T22:16:54Z (GMT). No. of bitstreams: 3 833.pdf.txt: 159741 bytes, checksum: 9e6065c4897ceb926534eb7e10453293 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 833.pdf: 2723781 bytes, checksum: a830784ddefc542106be74ce8aa431fa (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / A Yersinia pestis é o agente etiológico da peste, uma doença primária de roedores, transmitida por pulgas infectadas e que pode infectar o homem e outros mamíferos. O objetivo do trabalho foi realizar a tipagem de 63 cepas de Y. pestis de três focos de peste do PE. As cepas foram isoladas de diferentes fontes e períodos. Das 63 cepas, 20 foram isoladas de um epizootia, em agosto de 1967, na Chapada do Araripe-PE. Também foram estudadas oito cepas de Y. pestis isoladas em outros países, cinco cepas de Y. pseudotuberculosis e nove de Y. enterocolitica. Foram utilizados onze VNTRs pela técnica do MLVA. Dos onze VNTRs para as cepas da epizootia apenas um revelou-se polimórfico apresentando diferentes alelos. Os demais VNTRs revelaram-se monomórficos. Entre os onze VNTRs analisados para as 51 cepas de Y. pestis (43 brasileiras e 8 estrageiras) dois se revelaram monomórficos gerando amplicons com 7 e 2 unidades repetitivas (UR). Os outros nove VNTRs analisados revelaram-se polimórficos gerando dois a oito alelos. As cepas de Y. pseudotuberculosis apresentaram-se polimórficas para 10 VNTRs gerando amplicons de tamanhos diversos, o VNTR ms09 foi o único monomórfico gerando um amplicon de 700 pb com 28 UR. Das nove cepas de Y. enterocolitica analisadas com os onze locos, sete apresentaram-se monomórficos com amplicons de 700, 250, 270, 690, 231 e 379 pb. Os outros quatro VNTRs analisados apresentaram um padrão de amplificação polimórfico com amplicons de tamanhos diferentes para o mesmo loco. O padrão de amplificação gerado com as cepas de Y. pestis possibilitou distribui-las em 35 perfis genotípicos. A análise das cepas pelo dendrograma permitiu agrupá-las em cinco clados, onde no clado I ficaram agrupadas a maioria das cepas brasileiras de Y. pestis, as cepas estrangeiras de Y. pestis ficaram agrupadas nos clados II e IV, enquanto que Y. enterocolitica e Y. pseudotuberculosis ficaram nos clados III e V respectivamente. Diante dissso pode-se considerar que o MLVA mostrou-se uma ferramenta útil em estudos filogenéticos e epidemiológicos das cepas brasileiras de Y. pestis, além de estudos intraespecíficos com as espécies de Y. enterocolitica e Y. pseudotuberculosis. As análises revelaram diversidade genética entre as cepas de Y. pestis isoladas de diferentes fontes e períodos e sua continuação poderá gerar dados importantes para estabelecer relações filogenéticas entre as cepas, contribuindo para um melhor entendimento da disseminação e transmissão do agente etiológico da peste na natureza e a dinâmica da epidemiologia no Brasil

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-05-30T04:17:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2017Bitstream added on 2017-05-31T14:18:30Z : No. of bitstreams: 1 345998.pdf: 2631520 bytes, checksum: 33e64bae18ae8b813734b6b6d82f7a64 (MD5) / A erva-baleeira (Varronia curassavica Jacq.) é uma espécie subarbustiva de relevante importância medicinal, comumente encontrada nas restingas do litoral brasileiro, cujas áreas vêm sofrendo um processo histórico de pressão antrópica resultando em degradação e redução expressiva de suas áreas. Este trabalho teve como objetivo caracterizar a autoecologia de populações de V. curassavica em áreas de restinga, visando conhecer aspectos da sua dinâmica populacional, fenologia, biologia reprodutiva e da organização da diversidade genética, e assim contribuir com informações para fundamentar estratégias de conservação e uso sustentável para a espécie. Para tanto foram caracterizadas a estrutura e a dinâmica populacional ao longo de três anos, e avaliados o padrão de distribuição espacial e de genótipos da espécie e como estes estão relacionados com a restinga. A fenologia vegetativa e reprodutiva, e herbivoria foliar foram acompanhadas por dois anos, e verificada a existência de correlação dos eventos fenológicos com variáveis climáticas. Além disso, foram analisados aspectos da biologia floral e reprodutiva, estimada a taxa de cruzamento e caracterizada a diversidade e estrutura genética intra e interpopulacional de quatro populações da espécie empregando marcadores microssatélites. A população avaliada demonstrou taxa de incremento positiva, equilíbrio regenerativo e baixa mortalidade de plântulas. A espécie apresenta padrão agregado de dispersão e responde com diferenças demográficas e genéticas a heterogeneidade ambiental. Zonas de baixada seca são as áreas de ocorrência preferencial, com maior número de ingresso, alelos raros e exclusivos. Os índices de fixação foram distintos entre ambientes dentro da população estudada, evidenciando uma tendência a cruzamentos locais preferencias. Não foi registrada estrutura genética espacial para a população avaliada. Varronia curassavica apresentou produção contínua de folhas ao longo de todo ano, com abscisão foliar pouco sincrônica e em baixa intensidade. A floração e frutificação continuada demonstram que o clima parece ser pouco restritivo para a fenologia reprodutiva da espécie, contudo, picos distintos de intensidade foram registrados em períodos com aumento de temperatura e fotoperíodo. Frutos maduros foram amostrados em baixa intensidade, o que pode refletir um elevado número de abortos. A herbivoria não influenciou nas fenofases. A antese é diurna e a duração das flores é inferior a um dia. O elevado número de aborto de flores e frutos pode estar relacionado aos mecanismos de autoincompatibilidade (heterostilia e protoginia) registrados para a espécie. Os visitantes florais foram diversos, caracterizando uma síndrome de polinização generalista. Diptera, Hymenoptera e Lepidoptera foram as ordens de visitantes com maior riqueza de espécies e maior frequência. Os frutos foram dispersos predominantemente por pássaros e por formigas. Os estudos de genética demonstraram que a espécie é autotetraplóide, tipicamente alógama (tm = 0,98), com alta variabilidade genética (H ^E = 0,713), divergência interpopulacional baixa (GST = 0,048), e índices de fixação não significativos, evidenciando ausência ou efeitos reduzidos de endogamia e deriva genética nas situações estudadas. O fluxo gênico foi elevado (Nm = 4,87) e contribui para amenizar os efeitos de estruturação entre as populações. Todas as áreas avaliadas apresentaram potencial de conservação em longo prazo das populações de V. curassavica. Contudo, a crescente pressão antrópica em torno destas tem reduzido consideravelmente as restingas do Estado. Um maior rigor na proteção legal faz-se necessário para viabilizar a manutenção da biodiversidade existente. A integração dos estudos sobre os diferentes aspectos da autoecologia de V. curassavica permitiu compreender de maneira mais abrangente os processos aos quais as populações estão submetidas em seus ambientes de ocorrência e também identificar questões pertinentes à conservação da espécie e de sua importância dentro do contexto da restinga.<br> / Abstract : The erva-baleeira (Varronia curassavica Jacq.) is a shrubby species of medical relevance, commonly found in the restingas of the Brazilian coast, whose areas have undergone a historical process of anthropic pressure resulting in degradation and expressive reduction of their areas. This work aimed to characterize the autoecology of V. curassavica populations in restinga areas, aiming to know aspects of their population dynamics, phenology, reproductive biology and the organization of genetic diversity, and thus to contribute with information to support conservation and use strategies for the species. For this purpose, the population structure and dynamics were characterized over three years, and the spatial distribution pattern and genotypes of the species were evaluated, and how they are related to the restinga. The vegetative and reproductive phenology, and foliar herbivory were evaluated for two years, and the existence of a correlation of phenological events with climatic variables was verified. Furthermore, aspects of floral and reproductive biology were analyzed, the crossing rate was estimated and the intra and interpopulational diversity and genetic structure of four populations of the species was estimated, using microsatellite markers. The evaluated population has a positive increase rate, regenerative equilibrium and low seedling mortality. The species presents an aggregate spatial pattern and responds with demographic and genetic differences to environmental heterogeneity. Dry lowland zones are the areas of preferential occurrence, with more regeneration, rare and private alleles. The indices of fixation were distinct between the environments within the population studied, evidencing a tendency to local preferential crossings. No spatial genetic structure was found for the population evaluated. Varronia curassavica presented continuous leaf production throughout the year, with low leaf fall synchronization and intensity. The continuous flowering and fruiting demonstrate that the climate is not restrictive for the reproductive phenology of the species, however, distinct peaks of intensity were recorded in periods with increased temperature and photoperiod. Ripe fruits were sampled with low intensity, which may reflect a high number of abortions. Herbivory did not influence the phenophases. Anthesis is diurnal, and flowers last less than a day. The high number of flower and fruit abortions might be related to the mechanisms of self-incompatibility (heterostyly and protogyny) registered to the species. The high diversity of floral visitors indicates a generalist pollination syndrome. Diptera, Hymenoptera and Lepidoptera were the orders of visitors with greater richness of species and higher frequency. The fruits were predominantly dispersed by birds and ants. The genetic part of this study showed that the species is autotetraploid, typically outcrossing (tm = 0,98), with high genetic variability (H ^E = 0.713), low interpopulation divergence (GST = 0.048), and no significant fixation indices, indicating reduced or the absence of inbreeding and genetic drift in the study area. Gene flow was high (Nm = 4.87) and contributes to mitigate the effects of structure among populations. All the studied areas have the potential to ensure conservation of the species in the long term. However, increasing anthropogenic pressure around them has reduced the restingas of the State considerably. A greater rigor in legal protection is necessary to enable the maintenance of existing biodiversity. The integration of the studies on the different aspects of the autoecology of V. curassavica allowed to understand, in a more comprehensive way, the processes to which the populations are submitted in their environments of occurrence, also to identify questions pertinent to the conservation of the species and its importance within the restinga context.

Submitted by CELSO MACHADO null (celso.machado@cesp.com.br) on 2016-04-12T16:24:11Z No. of bitstreams: 1 Macaúba - Celso dissertação Biblioteca .docx: 12180698 bytes, checksum: 0b51e871edef061aec85296cd07c23db (MD5) / Rejected by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão final da dissertação/tese deve ser submetida no formato PDF (Portable Document Format). O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Por favor, corrija o formato do arquivo e realize uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2016-04-13T17:13:45Z (GMT) / Submitted by CELSO MACHADO null (celso.machado@cesp.com.br) on 2016-04-13T19:02:08Z No. of bitstreams: 1 Macaúba - Celso dissertação Biblioteca .pdf: 4529090 bytes, checksum: 9a9d3777ab31e5e958b9e11c9799001f (MD5) / Rejected by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: No campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” foi informado que seria disponibilizado o texto parcial porém no campo “Data para a disponibilização do texto completo” foi informado que o prazo para disponibilização de texto completo não se aplica por se tratar de texto completo a ser disponibilizado imediatamente. Caso opte pela disponibilização do texto completo selecione no campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” a opção “Texto completo”. Caso queira disponibilizar imediatamente apenas o texto parcial indique no campo “data para disponibilização do texto completo” o tempo em que apenas a versão parcial estará disponível. Esta opção é utilizada caso você tenha planos de publicar seu trabalho em periódicos científicos ou em formato de livro, por exemplo e fará com que apenas as páginas pré-textuais, introdução, considerações e referências sejam disponibilizadas. Por favor, corrija esta informação realizando uma nova submissão. on 2016-04-14T20:27:20Z (GMT) / Submitted by CELSO MACHADO null (celso.machado@cesp.com.br) on 2016-04-15T11:10:36Z No. of bitstreams: 1 Macaúba - Celso dissertação Biblioteca .pdf: 4529090 bytes, checksum: 9a9d3777ab31e5e958b9e11c9799001f (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-15T13:01:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 machado_cm_me_ilha.pdf: 4529090 bytes, checksum: 9a9d3777ab31e5e958b9e11c9799001f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-15T13:01:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 machado_cm_me_ilha.pdf: 4529090 bytes, checksum: 9a9d3777ab31e5e958b9e11c9799001f (MD5) Previous issue date: 2106-03-01 / Com o advento do PNPB (Programa Nacional de Produção de Biodiesel), novas alternativas de produção de biodiesel são de suma importância para a sustentabilidade do programa. A macaúba (Acrocomia aculeata) é uma palmeira nativa das florestas tropicais e uma das espécies mais difundidas pelo cerrado brasileiro e outros biomas que o circundam. Por muito tempo, o olhar sobre a palmeira macaúba foi tido como planta problemática e invasora, devido principalmente à presença dos espinhos pontiagudos e finos que provocam lesões. Esta planta despertou o interesse de vários setores, pelo seu alto potencial de produtividade, teor de óleo, rusticidade e a utilidade de seus vários produtos nos mais diversos setores industriais. O objetivo deste trabalho foi conhecer as características ecológicas, serviços ambientais, fenológicas, silviculturais, genéticas de uma população base de macaúba para formar uma coleção de trabalho, com alta produtividade de sementes e porcentagem de óleo. Para tanto, foi avaliada uma população de A. aculeata, localizada no antigo canteiro de obras da UHE. Eng. Sergio Motta em Rosana, no Estado de São Paulo, Brasil. Para obter estimativas de parâmetros genéticos que contribuam para seleção de genótipos superiores para a propagação e plantação em larga escala e definição de ideótipos genético-agronômicos de macaúba. Os resultados demonstram que a população de macaúba estudada tem uma ampla variabilidade genética, refletindo diretamente na produtividade de frutos, demonstrando também o potencial de utilização dos materiais existente em programas de melhoramento genético e conservação genética, além de ser uma espécie pioneira antrópica com importância na sucessão secundária com facilitadora e promotora de novos incrementos ecológicos. Essas informações são fundamentais, principalmente para uma espécie cujo trabalho de melhoramento estão apenas no começo. / With the advent of PNPB (National Program for Biodiesel Production), new biodiesel production alternatives are critical to the program's sustainability. The macaúba (Acrocomia aculeata) is a native palm of rainforests and one of the most widespread species by the Brazilian savanna and other biomes surrounding it. For a long time, look at the palm macaúba was seen as problematic and invasive plant, particularly due to the presence of sharp, thin spikes that cause injuries. This plant has sparked interest from various sectors, for its high yield potential, oil content, hardiness and usefulness of its various products in various industrial sectors. The objective of this study is to understand the ecological characteristics, phenological, forestry and select matrices of a macaúba base population to form a collection of work with high seed yield and oil percentage. To that end, it evaluated one population of A. aculeata, located in the former site of the hydroelectric works. Eng. Sergio Motta Rosana in the state of São Paulo, Brazil. For estimates of genetic parameters that contribute to select genotypes for propagation and planting on a large scale and definition of genetic agronomic ideotypes of macaúba. The results show that the population of macaúba studied has a wide genetic variability, reflecting directly on the fruit yield, also demonstrating the potential use of existing materials in breeding programs and genetic conservation, as well as being a pioneer anthropic kind of importance in secondary succession with a facilitator and promoter of new ecological increments This information is critical, especially for a species whose breeding work is just beginning.