Ctenomys flamarioni é um roedor subterrâneo endêmico do litoral do Estado do Rio Grande do Sul - Brasil. Devido à sua distribuição restrita ao ambiente costeiro, que está em constante mudança, e à fragmentação e destruição do habitat, devido à ação humana, essa espécie está nas listas de fauna ameaçadas de extinção. Estudos anteriores, com marcadores microssatélites e DNA mitocondrial, identificaram a baixa variabilidade genética na espécie, por outro lado, o estudo de loci que se esperam estar sob seleção seria uma ferramenta importante para identificar a relação dos indivíduos com o ambiente e os processos que moldaram a variabilidade genética da espécie ao longo da história. O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é composto por um grupo de genes estreitamente ligados que constituem o componente genético mais importante do sistema imunológico dos mamíferos. Dois principais mecanismos têm sido descritos como responsáveis pela manuntenção da diversidade do MHC e estão relacionados com o combate de parasitas e com mecanismos reprodutivos, que evitam o endocruzamento. Nesse estudo investigamos a variabilidade genética dos loci DRB e DQA do MHC e comparamos os índices de diversidades com os valores encontrados em estudos com outros ctenomídeos e com os encontrados para loci neutros da mesma espécie. A diversidade genética para o locus DRB de C. flamarioni foi menor do que a encontrada em estudos para o mesmo locus em outras espécies do gênero e também foi menor do que a encontrada em estudos para a mesma espécie, com marcadores neutros, inclusive para populações que passaram por reduções recentes (gargalos-de-garrafa). Os resultados indicam que a seleção balanceadora não foi suficiente para manter a diversidade genética nas populações estudadas e que as reduções populacionais, identificadas através dos loci neutros, devem ter sido bastante drásticas, por afetarem também a diversidade de um locus conhecidamente bastante variável (DRB de MHC). Não pudemos avaliar a diversidade do locus DQA devido a alta incidência de sequências muito divergentes encontradas, possivelmente pseudogenes. O estado de conservação de Ctenomys flamarioni é considerado crítico, por todos os fatores que afetam a espécie, como a instabilidade do ambiente em que ocorrem, a fragmentação e destruição do habitat pela ação humana e pela sua baixa diversidade genética, especialmente em um locus importante do sistema imunológico. A perda da diversidade no locus de MHC poderia estar relacionada à diminuição do número de indivíduos por população, que aumenta o risco de endogamia, que por sua vez pode levar à perda da aptidão reprodutiva, expressão de alelos recessivos deletérios e perda da flexibilidade adaptativa. Além disso, a perda da diversidade em um locus importante para a defesa do organismo contra parasitas aumenta a suscetibilidade dos indivíduos a doenças, e todos esses fatores elevam o risco de extinções locais, colocando em perigo o futuro da espécie. / Ctenomys flamarioni is a subterranean rodent, endemic to the coastline of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Due to its strict distribution to the coastal environment, which is constantly changing, and to habitat fragmentation and destruction caused by human actions, this species appears in lists of threatened fauna. Previous studies, using microsatellite markers and mitochondrial DNA, identified the low genetic variability in this species. On the other hand, the study of loci that are expected to be under balancing selection would be an important tool to identify the relation between individuals and their environment and processes which have molded the genetic variability of this species throughout history. The Major Histocompatibility Complex (MHC) is comprised by a closely connected group of genes that constitute the most important genetic component of the immune system of mammals. Two main mechanisms have been described as responsible for maintaining MHC diversity and are associated with parasite combat and reproductive mechanisms for inbreeding avoidance. In this study we investigated the genetic variability of the DRB and DQA loci of the MHC and compared these diversity indices with values found in studies about other ctenomyids and with values found for neutral loci in this species. The genetic diversity for the DRB locus in C. flamarioni was lower than what is found for the same locus in other species of the same genus and it was also lower than what was found in studies with this species using neutral markers, especially in populations which have gone through recent size reductions (bottlenecks). The results indicate that the balancing selection was not sufficient to maintain the genetic diversity in the studied populations and that population size reductions, identified through neutral loci, must have been very drastic, since they also affected the diversity of a loci which is known to be highly variable (DRB of the MHC). We could not evaluate the diversity for the DQA loci due to high incidence of very divergent sequences, possibly pseudogenes. The status of conservation of this species is considered critical due to all the factors that affect the species, such as the instability of the environment on which it occurs, habitat fragmentation and destruction caused by human actions, and its low genetic diversity, especially in an important locus of the immune system. The loss of diversity in the MHC locus could be associated to the decrease in number of individuals per population, which increases the risk of endogamy which, in turn, can lead to the loss of reproductive fitness, expression of deleterious recessive alleles and loss of adaptive flexibility. Moreover, the loss of diversity in a locus which is important in the defense of the organism against parasites increases the susceptibility of the individuals to diseases, and all these factors raise the risk of local extinctions, endangering the future of the species.

O êxito na seleção de plantas geneticamente superiores está diretamente relacionado à existência de variabilidade genética apresentada naturalmente ou artificialmente. No entanto, o melhoramento de espécies apomíticas é dificultado pela impossibilidade de ocorrer a união de gametas com plantas deste modo de reprodução. Por outro lado, a utilização de plantas sexuais compatíveis a cruzamentos com plantas apomíticas, podem gerar novas combinações gênicas e indivíduos com alta heterose podem ser selecionados já na primeira geração para lançamento como novas cultivares. A descoberta de plantas diplóides sexuais em populações naturais de Paspalum plicatulum e a posterior duplicação das mesmas possibilitaram um grande universo no desenvolvimento de novos genótipos a partir de cruzamentos entre espécies relacionadas. O objetivo do trabalho foi de: (i) avaliar a produção de forragem de genótipos nativos superiores de espécies do gênero Paspalum; (ii) caracterizar a estabilidade e adaptabilidade de produção destes genótipos; (iii) estimar através de técnicas da genética quantitativa, a herdabilidade e a associação entre caracteres de importância forrageira; (iv) obter variabilidade genética por meio de hibridizações interespecíficas, utilizando genótipos superiores nativos de P. lepton e de P. guenoarum como genitores masculinos (apomíticos) e um genótipo de P. plicatulum como genitor feminino (sexual); (v) analisar as progênies superiores quanto ao modo de reprodução selecionando plantas estáveis reprodutivamente para lançamento como cultivares e as de reprodução sexual para novos cruzamentos. Os genótipos das espécies de P. lepton e P. guenoarum apresentam variabilidade genética em caracteres de interesse forrageiro, bem como desempenho variável de acordo com o local e o ano de cultivo. A produção de matéria seca total e de folhas são os caracteres que mais contribuem para a detecção da variabilidade genética observada, independentemente do ano de avaliação. O ganho genético na produção de folhas se mostra eficiente via seleção indireta pela matéria seca total, caráter de alta herdabilidade e de mais fácil seleção e aferição. Houve ampla variabilidade nos caracteres ligados a produção de forragem e alguns híbridos apresentaram heterose para a maioria dos caracteres analisados. A maioria das progênies selecionadas apresentaram a apomixia como modo de reprodução, o que potencializa o lançamento como cultivar. Já as plantas sexuais superiores serão usadas para recombinação com os melhores híbridos para obtenção de novas constituições genéticas. Os dendrogramas obtidos em nível de campo e de DNA foram capazes de discriminar os genótipos e podem auxiliar na orientação em novas hibridizações com plantas sexuais compatíveis. Houve pouca variabilidade na composição química entre os genótipos. Mais estudos deverão ser realizados para viabilizar o desenvolvimento de cultivares no uso em pastagens naturais, assim como no emprego como pastagens cultivadas. / The successful selection of genetically superior plants is directly related to the existence of natural or artificial genetic variability. However, the breeding of apomictic species is hampered by the inability of the union of gametes with plants of this mode of reproduction. In another hand, the use of sexual plants compatible to crosses with apomictic plants can generate new genetic combinations, and individuals with high heterosis can be selected on the first generation and releasae as new cultivars. The discovery of sexual diploid plants in natural populations of Paspalum plicatulum and their subsequent duplication to do possible the development of new genotypes from crosses between closely related species. Thus, this study aimed to: (i) evaluate the forage yield of superior genotypes of native species of Paspalum, (ii) characterize the stability and adaptability of production of these genotypes; (iii) estimate using techniques of quantitative genetics, the heritability and its association between important forage characters; (iv) get a genetic variability through interspecific hybridization, using superior genotypes of native P. lepton and P. guenoarum as male parents (apomictic) and one genotype of P. plicatulum as female parent (sexual); (v) analyze the superior progenies to reproduction, selecting plants reproductively stable for releasing as cultivars and, of sexual reproduction for new crossings. The genotypes of the species P. lepton and P. guenoarum take a genetic variation in their traits of interest forage; furthermore, their performance depend of location and year of cultivation. The total dry matter production and leaf are the traits that most contribute to the detection of genetic variability, independent of the year of evaluation. The genetic gain in leaf production is efficient to indirect selection for total dry matter; this character present high heritability and, easier selection and estimation. There was wide variability in characters linked to forage production and some hybrids showed heterosis for most traits analyzed. Moreover, most of the selected progenies showed apomixis as reproductive mode, which enhances the release as cultivar. The sexual plants should be used for recombination with the best hybrids to get new genetic constitutions. The dendrograms obtained through field and DNA characteristics were able to discriminate genotypes and could help to get new sexual hybridizations with compatible plants. A little variability in chemical composition between genotypes was observed. Thus, more studies should be conducted to enable the development of cultivars to use on native rangelands, even as the employment as pastures.

Submitted by Luiza Maria Pereira de Oliveira (luiza.oliveira@ufpe.br) on 2015-05-13T19:30:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO DIGITAL - ROBSON DIAS RAMALHO.pdf: 3690065 bytes, checksum: d1b80fe74ba5766afeb75425b6d23856 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-13T19:30:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO DIGITAL - ROBSON DIAS RAMALHO.pdf: 3690065 bytes, checksum: d1b80fe74ba5766afeb75425b6d23856 (MD5) Previous issue date: 2015-03-03 / CAPES / A pesquisa que deu origem a esta dissertação foi realizada a partir dos dados de irradiância solar global coletados em cinco localidades de Alagoas durante os anos de 2008 e 2009. Foram elas: Água Branca, Coruripe, Pão de Açúcar, Palmeiras dos Índios e Santana do Ipanema. Para obtenção dos dados de cada localidade (estação solarimétrica) foi utilizado um sensor de irradiação solar global, o piranômetro preto e branco. Este sensor foi montado sobre uma estrutura metálica de três metros de altura, em um eixo fixo, e posicionado na direção norte-sul, evitando possíveis sombreamentos. Para armazenamento dos dados de irradiância solar global foi utilizado um sistema de aquisição de dados com capacidade de armazenamento para 50 dias. Os dados foram analisados segundo a variabilidade de potência, chamado nesta dissertação, pelo termo “taxa de rampa”. Este termo mensura a súbita e a não controlável alteração da irradiância solar global, ao nível da superfície terrestre, devido à passagem de nuvens. Os resultados desta taxa de rampa podem ter valores positivos ou negativos. Nesta dissertação foram analisados os resultados negativos, pois são ocasionados por sombreamentos devido ao movimento de nuvens sobre o sensor. Os resultados negativos das taxas de rampa foram explorados nas escalas de tempo de 1, 5, 10, 15, 30, 60, 120 e 180 minutos. Foi observado que na escala de 1 minuto há uma maior probabilidade de ocorrência de grandes taxas de rampa. A dispersão geográfica das estações foi aplicada de forma a visualizar as amplitudes das taxas de rampa negativas. Para quantificá-la foi criada uma sexta localidade. Os dados desta localidade foram definidos como sendo a média dos resultados das taxas de rampa das cinco localidades. A partir da combinação das localidades as taxas de rampa foram consideravelmente reduzidas. Cada localidade, também, foi investigada de forma a indicar àquela de maior e menor variabilidade. A estação de Coruripe apresentou as maiores variações, principalmente no verão. A estação de Pão de Açúcar caracterizou-se como a de menor oscilação anual. Sendo, portanto, a melhor escolha para instalação de uma usina solar considerando apenas o parâmetro taxa de rampa. A análise da correlação dos resultados das taxas de rampa entre as localidades também foi explorada. Os fatores de correlação foram considerados fracos devido às grandes distâncias entre as localidades.

Made available in DSpace on 2014-06-12T17:16:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2560_1.pdf: 1380039 bytes, checksum: a86fe3080069b950616d35faf22fc89f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Universidade Federal de Pernambuco / A necessidade de conhecer e tomar decisões a partir de informações tratadas estatisticamente faz da variabilidade um conceito fundamental, uma vez que a Estatística existe porque os dados variam. Contudo, poucos estudos se preocuparam em pesquisar de modo sistemático compreensões de estudantes dos anos iniciais do Ensino Fundamental quanto à variabilidade, apesar de no Brasil o ensino da Estatística ser recomendado no currículo escolar para esses anos. Assim, o objetivo principal do presente estudo foi investigar as compreensões apresentadas por estudantes do 2º e 5º ano a respeito do conceito de variabilidade estatística. Para isso, utilizou-se cinco atividades abordando aspectos diferentes da variabilidade, que foram propostos a 48 (quarenta e oito) sujeitos do 2º e 5º ano, com os quais realizou-se entrevistas clínico-piagetianas, uma vez que as justificativas dadas pelos estudantes às questões propostas foi o interesse maior na pesquisa. Os aspectos da variabilidade explorados foram: explanação da variabilidade; identificação de ponto máximo / moda; predição a partir da moda, do ponto máximo e da tendência; quantificação de variação entre dois pontos; conservação de quantidade total; representação da variabilidade, de frequência nula e de acréscimos; comparação entre conjuntos de dados; além de identificação e proposição de ausência de variabilidade. Constatou-se que os estudantes do 5º ano apresentaram um desempenho significativamente maior do que aquele dos estudantes do 2º ano, em pelo menos metade das questões. O melhor desempenho do 5º ano ocorreu nos seguintes aspectos: explanação da variabilidade em dados qualitativos e dados numa série temporal; localização de ponto máximo; comparação entre pontos; representação da variabilidade; predição a partir do ponto máximo; predição a partir da tendência do gráfico e identificação de ausência de variabilidade. A explanação da variabilidade, quando solicitada aos estudantes após representarem dados, assim como a representação de frequência nula e a representação de acréscimos foram aspectos facilmente compreendidos pelos dois grupos de estudantes. Numa gradação dos aspectos da variabilidade que se mostraram mais complexos para os dois grupos pode-se destacar, numa ordem decrescente: a comparação entre conjuntos de dados; a predição a partir da moda; a comparação entre pontos com quantificação da variação; finalmente, a proposição de ausência de variabilidade. Foi realizada uma análise multidimensional (MDS), a qual evidenciou que o comportamento dos alunos do 2º ano foi diferente dos alunos do 5º ano. No gráfico do 2º ano ficou evidente que a possibilidade de respostas tendo como base a experiência de vida dos mesmos foi um fator importante. Já para os alunos do 5º ano, foram encontrados 4 (quatro) grupos que englobavam diferentes aspectos da variabilidade: representação da variabilidade e da frequência nula; explanação da variabilidade; localização e predição de ponto máximo; comparação entre conjuntos e quantificação da variação, os que se mostraram mais complexos. Assim, esse estudo evidenciou que estudantes desde o 2º ano de escolaridade são capazes de compreender aspectos da variabilidade, o que pode ser potencializado se os mesmos vivenciarem na escola situações de ensino que os desafiem a analisar e refletir sobre dados tratados estatisticamente

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os excrementos de herbívoros têm sido citados como um dos principais substratos para o isolamento de Zygomycetes. No entanto, existem poucos estudos relacionados ao conhecimento da composição de espécies desse grupo nesses substratos e à variabilidade genética existente entre Zygomycetes oriundos de diferentes regiões geográficas. Os objetivos desse trabalho foram: a) isolar e identificar Zygomycetes a partir de excrementos de herbívoros do Recife, Pernambuco, Brasil; b) comparar o número e a composição de espécies de Zygomycetes ocorrentes nos excrementos dos diferentes animais e entre os meses do ano; c) comparar as seqüências das regiões ITS do rDNA de Mucorales isolados com seqüências das mesmas espécies provenientes de diferentes regiões geográficas e depositadas no GenBank . A partir de coletas mensais (junho/2005 a maio/2006) de excrementos de anta, camelo, jumento-branco, cervonobre, waterbuck , lhama, cavalo e cutia, foram identificados 39 táxons de Zygomycetes distribuídos em 15 gêneros. Os resultados indicaram que a composição e o número de táxons variam para cada herbívoro e que a sazonalidade influencia a composição de espécies de Zygomycetes nos excrementos, mas não o número de táxons. Polimorfismo genético entre isolados de Cunninghamella elegans, Mycocladus blakesleeanus e Mucor circinelloides f. circinelloides foi constatado, enquanto os espécimes de Rhizopus oryzae foram incluídos em um mesmo clado. As quatro formas de M. circinelloides conhecidas formaram um grupo, não sendo possível a diferenciação genética entre as mesmas com a metodologia utilizada

Orientadores: Luiz Antonio Daniel, Francisco Lombardi Neto / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-26T19:35:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferreira_JoseCarlos_D.pdf: 8032707 bytes, checksum: c0a14898c8e6c68edd74dd8465de34ae (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: O objetivo deste trabalho foi gerar mapas mensais de chuvas de intensidade máximas em 24 horas e de erosividade para o Estado de São Paulo, usando dados mensais de precipitação de intensidade máxima de um dia. Foram selecionados os dados de precipitação pluviométrica máxima de um dia, de 343 postos pluviométricos do Estado de São Paulo, operados pelo DAEE, com séries históricas completas de 31 anos, todas iniciando em 1962 e terminando em 1992. As estimativas de probabilidade de ocorrência de eventos máximos de intensidade de precipitação pluviométrica foram calculadas pela metodologia proposta por GUMBEL(1958), baseada numa distribuição de fteqüência conhecida com o Tipo I de Fischer- Tippett a dois parâmetros. A partir dos níveis máximos de intensidade de chuva de um dia, foram feitas as desagregações de chuvas de intensidade máxima em 24 horas e em 30 minutos, segundo a metodologia proposta por OCCHIPINTI E SANTOS(1966). Com base nos níveis de precipitação máxima em 30 minutos foram calculados os índices de erosividade EI30 mensais para cada uma das 343 localidades. Os dados foram interpolados para gerar 12 mapas mensais dos níveis de intensidade máxima de precipitação em 24 horas e 12 mapas mensais de erosividade. Também foram gerados mapas dos níveis máximos de erosividade da estação chuvosa, da estação seca e dos totais anuais da erosividade no Estado de São Paulo. Os resultados dos cálculos dos níveis mensais de probabilidade de chuva de intensidade máxima foram submetidos à análise de componentes principais (ACP), com a vantagem da redução do número de variáveis de 12 para 4, sem perda de informações.Os resultados da ACP mostraram que os quatro primeiros Componentes Principais (ACP) conseguem reter cerca de 76% das informações acumuladas das variáveis originais. Os mapas mensais de precipitação máxima foram obtidos por meio das técnicas de georeferenciação, interpolação e reclassificação do Sistema de Informação Geográfica disponíveis no Idrisi.2. Com vistas ao uso em terraceamento, cada mapa foi reclassificado em intervalos de classe de 10 mm de chuva. Finalmente, com base nos parâmetros e da distribuição de Gumbel e no período de retorno T, foram desenvolvidas equações mensais de estimativas de chuva de intensidade máxima em 24 horas e de erosividade EI30, para cada uma das 343 localidades no Estado, disponibilizadas em software de aplicação prática. Os resultados obtidos das chuvas interpoladas no mRISI 2.0, pelo método do inverso do quadrado da distância mostraram-se eficazes, permitindo obter intervalos de chuva máxima de 24 horas de até um milímetro em qualquer localidade do Estado de São Paulo. Com isto, os mapas mensais de chuva máxima mostram versatilidade para aplicações dimensionamento de bacias de contenção de águas pluviais, canais de escoamento para terraços, além de auxiliar em projetos de construção de pontes, barragens, vertedores e estradas. O programa desenvolvido permite, além dos níveis máximos de chuva em 24 horas em qualquer período de retorno, obter estimativas de erosividade máxima mensal para qualquer localidade do Estado de São Paulo, de aplicação em engenharia e mais especificamente em estudos de combate a erosão e espaçamento entre terraços / Abstract: The objective of this work was to generate monthly maps of maximum intensity rains in 24 hours and of erosivity for the State of São Paulo, using monthly data of precipitation of maximum intensity of one day. The data of rain maximum in one day, of 343 were selected rain gage post of the State of São Paulo, operated by DAEE, with complete historical series 31 years old, alI beginning in 1962 and finishing in 1992. The estimates of probability of occurrence of maximum events of intensity of rain were calculated by the methodology proposed by GUMBEL(l958), based on a distribution of known frequency with the Tipo I of Fischer Tippett to two parameters. Starting ITom the maximum levels of intensity of rain of one day, they were made the disaggregations of rains of maximum intensity in 24 hours and in 30 minutes, according to the methodology proposed by OCClllPINTI & SANTOS(1966). With base in the levels of maximum precipitation in 30 minutes the erosivity indexes were calculated monthly EI30 for each one ofthe 343 places. The data were interpolated to generate 12 monthly maps of the levels of maximum intensity of precipitation in 24 hours and 12 monthly maps of erosivity. Maps of the maximum levels of erosivity of the rainy station were also generated, of the station it evaporates and of the annual totais of the erosivity in the State of São Paulo. The results of the calculations of the monthly levels of probability of rain of maximum intensity were submitted to the analysis of main components (ACP), with the advantage of the reduction ofthe number ofvariables of 12 for 4, without loss ofinformation. The results of ACP showed that the first four Main Components (ACP) they get to retain about 76% of the accumulated information of the original variables. The monthly maps of maximum precipitation were obtained through the georefferentiation techniques, interpolation and reclassification of the System of Geographical Information available in Idrisi.2. With views to the use in terracement, each map was reclassified in intervals of class of 10 mm rain. Finally, with base in the parameters and of the distribution of Gumbel and in the retum period T, monthly equations of estimates of rain of maximum intensity were developed in 24 hours and of erosivity EI30, for each one of the 343 places in the State, available in software of practical application. The obtained results ofthe rains interpolated in rnRISI 2.0, for the method ofthe nverse of the square of the distance they were shown effective, allowing to obtain intervals of maximum rain of24 hours ofto a millimeter in any place ofthe State of São Paulo. With this, the monthly maps of maximum rain show versatility for applications in planning of basins of contention of pluvial waters, drainage channels for terraces, besides aiding in projects of construction of bridges, barrages, overflow sistems and roads. The developed program allows, besides the maximum levels of rain in 24 hours in any retum period, to obtain estimates of monthly maximum erosivity for any place of the State of São Paulo, of application in engineering and more specifically in combat studies the erosion and spacing among terraces / Doutorado / Agua e Solo / Doutor em Engenharia Agrícola

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T13:48:45Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Paloma I.S. Dantas.pdf: 4741082 bytes, checksum: e499e75b7a77189538a9f8be0d6be226 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T13:48:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Paloma I.S. Dantas.pdf: 4741082 bytes, checksum: e499e75b7a77189538a9f8be0d6be226 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-24T13:48:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Paloma I.S. Dantas.pdf: 4741082 bytes, checksum: e499e75b7a77189538a9f8be0d6be226 (MD5) Previous issue date: 2016-11-18 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Shigella is a gram-negative and intracellular bacterium responsible for triggering Shigellosis, a diarrheal disease characterized by the presence of mucus and blood. . In an epidemiological study conducted by our group in the city of Manaus-Amazonas with children with severe diarrhea from 2007 to 2009, the genus Shigella was the fifth most isolated pathogen (2.2%). Based on the clinical data we observed a heterogenous symptomatology among patients with shigellosis, since then, our group has been investigating the genotypic and phenotypic characteristics of these isolates. Shigella is a highly virulent bacterium, its mechanisms of pathogenesis is due to the presence of plasmidial and chromosomal genes. Among the genes responsible for its virulence are the Ipas genes that promote the invasion of Shigella in epithelial cells and the death of macrophages, the IpaHs genes, which modulate the host's immune response and the enterotoxins Shet1 and Shet2. In the present study, our main objective was to verify the genetic variability of the main virulence factors in clinical samples of Shigella flexneri. The virulence genes were amplified with specific primers developed in the study, the obtained amplicons were sequenced and analyzed. The Ipa, IpaH, Set1A, Se1B and Sen genes were successfully amplified. A total of 474 sequences referring to the 19 virulence genes of Shigella were sequenced, however, only 12 genes, a total of 154 sequences were analyzed for the presence of polymorphism. In this study 9 point mutations were identified in 5 Shigella virulence genes, being the IpaD, SenA, IpaH3, IpaH2.5 and IpaH6 gene. The study of the identification of specific genetic determinants is essential to understand the mechanism of pathogenesis and the propagation of virulent variants in the population of Shigella. Our work is based on previous studies conducted by our group, since the initial amplification of the virulence genes of these isolates was ineffective. Although few genes are analyzed, nucleotide variations have been found in different isolates, which may or may not interfere in the expression of the virulence phenotype. A new sequencing will be required to confirm the variations found in the study, as well as in vitro and in vivo studies, to verify if these changes may interfere with the virulence phenotype of the Shigella clinical samples. / A Shigella é uma bactéria gram-negativa e intracelular, responsável pelo desencadeamento da Shigelose, uma doença diarreica caracterizada pela presença de muco e sangue. Em um estudo epidemiológico realizado por nosso grupo na cidade de Manaus-Amazonas com crianças que apresentavam diarreia severa nos anos de 2007 a 2009, o gênero Shigella foi o quinto patógeno mais isolado (2,2%). A partir dos dados clínicos observamos uma sintomatologia heterogênia entre os pacientes com shigelose, desde então, nosso grupo vem investigando as características genotípicas e fenotípicas desses isolados. Shigella é uma bactéria altamente virulenta, seus mecanismos de patogenicidade se deve a presença de genes plasmidiais e cromossomais. Entre os genes responsáveis pela sua virulência temos, os genes Ipas que promovem a invasão de Shigella nas células epiteliais e a morte dos macrófagos, os genes IpaHs, que modulam a resposta imunológica do hospedeiro e as enterotoxinas Shet1 e Shet2. No presente estudo, nosso principal objetivo foi verificar a variabilidade genética dos principais fatores de virulência em amostras clínicas de Shigella flexneri. Os genes de virulência foram amplificados com iniciadores específicos desenvolvidos no estudo, os amplicons obtidos foram sequenciados e analisados. Os genes Ipa, IpaH, Set1A, Se1B e Sen foram amplificados com sucesso. Um total de 474 sequências referentes aos 19 genes de virulência de Shigella foi sequenciado, no entanto, apenas 12 genes, num total de 154 sequências foram analisadas quanto à presença de polimorfismo. Neste estudo foram identificadas 9 mutações de ponto em 5 genes de virulência de Shigella, sendo eles, o gene IpaD, SenA, IpaH3, IpaH2.5 e IpaH6. O estudo da identificação de determinantes genéticos específicos é essencial para compreender o mecanismo de patogênese e a propagação de variantes virulentas na população de Shigella. Nosso trabalho se baseia em estudos anteriores realizados por nosso grupo, uma vez que a amplificação inicial dos genes de virulência desses isolados foi ineficaz. Apesar de poucos genes serem analisados, variações de nucleotídeos foram encontradas em isolados diferentes, que podem interferir na expressão do fenótipo de virulência. Um novo sequenciamento será necessário para confirmar as variações encontradas no estudo, assim como estudos in vitro e in vivo, para verificar se essas alterações podem interferir no fenótipo de virulência das amostras clinicas de Shigella.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6318_1.pdf: 1477063 bytes, checksum: 2d685b6937ed7e90b986b630e1a9eb9d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Lutzomvia Iongipalpis, o principal vetor de Leishmania chagasi possui distribuição geográfica ampla na Região Neotropical. Devido à existência de barreiras climáticas e geogr|ficas nesta região, bem come pela capacidade de voo reduzida deste flebotomíneo, as populações desta espécie encontram-se isoladas geograficamente. Este isolamento possibilita o surgimento de diferenças genéticas entre as populações. Evidência disto são os diferentes padrões de manchas abdominais apresentados pelos machos desta espécie, alguns dos quais possuem um par (1M) enquanto outros possuem dois pares (2M) de manchas. Com o objetivo de estudar a variabilidade genética populações naturais de L. longipalpis do Estado de Pernambuco que exibissem machos 1M e 2M em simpatria, um fragmento do gene mitocondrial nd4 foi utilizado como marcador molecular. Foram detectados 28 haplótipos nos 71 espécimes analisados, o que corresponde a uma diversidade haplotípica de 0,944. Sete destes haplótipos (25%) foram comuns a ambos os fenótipos ( 1M e 2M), dando indícios de introgressão gênica nestas populações. Apesar da diversidade haplotípica elevada, as distâncias genéticas entre as populações analisadas foram muito baixas, variando de 0,0029 a 0,0092, o que é característico de populações panmíticas. Através de análise filogenética destes haplótipos juntamente com outros obtidos no banco de dados do GenBank pode-se considerar a influência do Rio São Francisco como barreira geográfica entre populações de L. longipalpis do Nordeste brasileiro

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-04T11:54:59Z No. of bitstreams: 2 TESE IONEIDE ALVES.pdf: 6696005 bytes, checksum: 74feedc7fa319b8af78f93510cb5fdd0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-04T11:54:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE IONEIDE ALVES.pdf: 6696005 bytes, checksum: 74feedc7fa319b8af78f93510cb5fdd0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / Esta pesquisa teve como objetivo geral avaliar a variabilidade e as tendências dos índices de detecção de mudanças climáticas, déficit e excedente hídrico, na bacia do rio Una, PE, a partir da analise do comportamento da precipitação anual, semestral, mensal e diária. Foram consideradas 15 localidades que dispunham de dados pluviométricos diários e mensais no período de 1965 a 2006. Para a obtenção dos índices de tendência climática, utilizou-se o software RClimdex 2.9.0. A classificação dos anos extremos foi obtida através do índice de seca. Os anos extremos foram comparados com as anomalias das temperaturas da superfície do mar nos oceanos Pacífico e Atlântico. A identificação das áreas com déficit e excedente hídrico ocorreu por meio da estimativa do balanço hídrico climático, bem como a classificação das áreas de maiores e menores riscos climáticos. Os índices de detecção de mudanças climáticas apontaram tendência de redução de chuva em toda a extensão da bacia, aumento na quantidade de dias secos e diminuição dos dias úmidos, e tendência positiva na quantidade de dias com precipitações iguais e superiores a 50 mm por dia no Litoral (Barreiros). As áreas com maiores deficiência hídricas encontram-se no Agreste e com maior disponibilidade hídrica na Zona da Mata e no Litoral. A bacia do Una apresenta alta variabilidade na distribuição espacial e temporal da precipitação diária, mensal, sazonal e anual. Os padrões de variabilidades dos oceanos Pacífico e Atlântico influenciam no comportamento pluviométrico por intermédio dos fenômenos oceânico-atmosférico de grande escala ENOS, ODP e Dipolo do Atlântico.

O presente trabalho teve como objetivo investigar se padrões variáveis de respostas podem ser instalados e mantidos por reforçamento negativo intermitente em um procedimento de esquiva em tentativas discretas. Seis ratos machos Wistar foram submetidos à modelagem e fortalecimento da resposta de pressão à barra com reforçamento positivo em uma caixa de condicionamento operante com duas barras (direita, D, e esquerda, E). Em seguida, essa resposta passou a ser reforçada negativamente em um procedimento de esquiva em tentativas discretas no qual um estímulo elétrico (US) de 0,5 s e 0,5 mA (em média) podia ocorrer ao final de um período de luz (CS). A emissão da resposta de pressão à barra durante o CS produzia o seu desligamento e um tom de 0,5 s e 10 Hz, cancelando o próximo US programado e iniciando um período de blackout sem qualquer contingência programada, após o qual um novo CS era apresentado. Duzentos US foram programados a cada sessão. O procedimento de esquiva se iniciou com reforçamento em FR 1 e FR 2 (com alternação das barras a cada 50 US programados). Posteriormente, sequências de três respostas foram reforçadas (com as duas barras disponíveis). Inicialmente, o reforçamento era contingente à variabilidade na emissão das sequências, avaliada pela disposição das respostas que as compõem entre as barras D e E: DDD, EED, DED etc. O variar foi reforçado de acordo com uma contingência Lag n, na qual apenas as sequências que diferiam das n anteriormente emitidas pelo sujeito evitavam o US, sendo o valor de n igual a 1, 2 ou 3. Uma vez que o desempenho se mostrou estável nessas fases, os sujeitos foram expostos ao procedimento Aco, no qual a distribuição de reforços foi acoplada àquela obtida na última sessão de Lag n, porém sem exigência de variação. Alguns sujeitos foram reexpostos à contingência Lag n após essa fase. Os resultados mostraram que todos os sujeitos apresentaram esquiva e altos índices variabilidade na emissão de sequências nas fases Lag n (medida pelo valor U), havendo queda sistemática desses índices sob o procedimento Aco. Os sujeitos reexpostos à Lag n mostraram recuperação dos altos índices de variação. Esses resultados sugerem que a variabilidade comportamental foi controlada pelo reforçamento negativo na contingência de esquiva proposta / This study aimed to investigate if variable patterns of responses can be acquired and maintained by intermittent negative reinforcement under a discrete-trial avoidance contingency. Six male Wistar rats were submitted to a lever-press response shaping session in an operant conditioning chamber with two levers (right, R, and left, L). Then, that response was negatively reinforced in a discrete-trial avoidance procedure in which a 0.5 s and 0.5 mA (average) shock (US) could occur after a light period (CS). Lever-press response emission during CS presentation turned off the CS, produced a 0.5 s and 10 Hz tone, canceled the next programmed US, and initiated a blackout period with no programmed contingency, after which a new CS was presented. Two hundred US were programmed per session. Initially, negative reinforcement occurred under FR 1 and FR 2 schedules (with levers alternation each 50 programmed US). Following, three response sequences were reinforced (with the two levers available). Reinforcement was contingent to behavioral variability, which was examined by comparing three-response sequences across R and L levers: RRR, LLR, RLR etc. Varying was reinforced according to a Lag contingency, in which only sequences that differed from n previous sequences avoided US (n was equal to 1, 2 or 3). After steady states were obtained in those contingencies, subjects were submitted to a yoke procedure, in which reinforcer distribution was yoked to the last Lag session, but without varying exigency. Some subjects were re-exposed to the Lag contingency after yoke procedure. Results showed that all the subjects avoided shocks and presented high levels of behavioral variability under the Lag contingency (measured by U value). During the yoke procedure, behavioral variability decreased systematically. Subjects that were re-exposed to the Lag contingency after yoke procedure recovered high levels of variation. These results suggest that behavioral variability was controlled by negative reinforcement under the proposed avoidance contingency