Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:16:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327578.pdf: 5601588 bytes, checksum: 081b5bf082fa1a8f89f95fa5a8f1607f (MD5) Previous issue date: 2014 / Os objetivos deste estudo foram avaliar o efeito do processo de clarificação no mosto de uvas brancas, em função do tempo e do agente clarificante, como também desenvolver e validar um método para a quantificação simultânea de 24 compostos heterocíclicos (oxigenados, sulfurados e nitrogenados) em vinhos tintos e brancos. Para avaliação do processo de clarificação em função do tempo (12 e 30 horas) foi utilizado mosto de uvas brancas Sauvignon Blanc, Vermentino e Viognier, e para avaliar os agentes clarificantes (bentonite, enzima e sílica gel) foi utilizado mosto de uvas da variedade Chardonnay. Foram avaliados a cinética de fermentação dos mostos adicionados de cada agente clarificante, como também a evolução e o consumo dos compostos nitrogenados durante a fermentação alcoólica. Nos mostos e nos vinhos foram determinados o perfil de aminoácidos, íon amônio, aminas biogênicas e compostos fenólicos, por cromatografia líquida de alta eficiência, e glutationa por cromatografia líquida de ultra eficiência. Também foram determinados nos vinhos o perfil de compostos voláteis por cromatografia gasosa. Para a extração dos compostos fenólicos foram avaliados 4 métodos de extração, extração líquido-líquido, extração em fase sólida, ultrassom e QuEChERS. Este método foi utilizado também para caracterizar diferentes variedades de uvas Vitis labrusca e Vitis vinifera quanto a presença de compostos bioativos. A determinação dos compostos heterocíclicos nos vinhos franceses foi realizada por cromatografia gasosa através de microextração em fase sólida, a qual foi otimizada utilizando delineamento central composto por metodologia de superfície resposta. O método foi validado. Os vinhos franceses também foram caracterizados quanto ao perfil de aminoácidos e glutationa por cromatografia líquida de ultra eficiência. Os resultados deste trabalho demonstraram que, dentre os métodos de extração dos compostos fenólicos avaliados, a extração líquido-líquido apresentou os melhores resultados de precisão e repetibilidade. A caracterização das variedades de uvas V. labrusca e V. vinifera quanto a compostos bioativos mostrou que o tipo e a concentração destes compostos são mais dependentes da variedade de uva do que da espécie. Com relação ao processo de clarificação do mosto, este exerceu forte influência na composição química dos mostos como também na composição volátil e não volátil dos vinhos. O tempo de clarificação do mosto alterou significativamente o seu conteúdo nitrogenado, especialmente a concentração de aminoácidos, que foi maior no menor tempo de clarificação (12 h). Além disto, os mostos clarificados por menor tempo, foram correlacionados principalmente com os aromas varietais do vinho, enquanto o maior tempo de clarificação (30 h) do mosto originou vinhos com predomínio de aromas fermentativos. Os agentes clarificantes também influenciaram a composição do mosto e do vinho. O uso de bentonite resultou em mosto com menor concentração de nitrogênio enquanto a adição de enzima no mosto provocou efeito contrário. Vinhos obtidos da clarificação do mosto com enzima apresentaram maior concentração dos aromas varietais, enquanto a clarificação com bentonite resultou em vinhos com maior concentração dos ésteres majoritários e de sulfeto de hidrogênio. Foi observada uma relação entre os aminoácidos, arginina e alanina, que mais contribuíram como fonte de nitrogênio para as leveduras, com a formação dos compostos voláteis nos vinho, principalmente para os ésteres. Quanto à extração dos compostos heterocíclicos, a metodologia de superfície resposta mostrou que as melhores condições de extração foram pH 5,5; 3 g de NaCl e tempo de extração de 55 minutos. O método validado apresentou excelente precisão, exatidão, e limites de detecção e quantificação. Os vinhos provenientes de diferentes origens geográficas foram separados por análises multivariadas de acordo com a composição de aminoácido como também de compostos heterocíclicos-S,N,O.<br> / Abstract : The objectives of this study were to evaluate the effect of the white grape must clarification process over time using different clarifying agents and to developed and validate a method for the simultaneous quantification of 24 heterocyclic compounds of different classes (furans, thiophenes, thiazoles and alkylpyrazines) in white and red wines. The clarification process over time (12 and 30 h) was evaluated using musts of Sauvignon Blanc, Vermentine and Viognier grapes and to investigate different clarifying agents (bentonite, enzyme and silica) Chardonnay grape must was used. Also, the fermentation kinetics of the musts with clarifying agents added was investigated, along with the development and consumption of nitrogenous compounds during alcoholic fermentation. The musts and wines were analyzed by high performance liquid chromatography to determine the amino acids profile, ammonium, biogenic amines and phenolic compounds, and glutathione was determined by ultra performance liquid chromatography. The wines were also analyzed to determine the volatile profile by gas chromatography. For the extraction of phenolic compounds 4 extraction methods were evaluated: liquid-liquid extraction, solid phase extraction, ultrasound and QuEChERS. This method was also used to characterize different varieties of Vitis vinifera and Vitis labrusca grapes in relation to bioactive compounds. For the characterization of French wines in relation to heterocyclic compounds, solid phase micro extraction was used, which was optimized employing a composite central design, using the surface response methodology, and the determination was carried out by gas chromatography. This method was validated. the wine French also were characterized in relation to amino acid content and glutathione by ultra performance liquid chromatography. The results of this study showed that the extraction method which gave the best results for accuracy and repeatability was liquid-liquid extraction. The determination of bioactive compounds in V. labrusca and V. vinífera grapes showed that the classes and concentrations of these compounds have a stronger dependence on the grape variety than the species. In relation to the must clarification process, this showed a strong influence on the chemical composition of the musts as well as on the volatile and non-volatile composition of the wines. The time of must clarification significantly affected the must concentration of nitrogen compounds, especially amino acids, which was higher for the shorter clarification time (12 h). Moreover, the musts clarified for this shorter time were correlated mainly with the varietal aroma of the wine, while the longer must clarification time (30 h) originated predominantly fermentative aromas in the wines. The clarifying agents influenced the must and wine composition. The addition of bentonite resulted in musts with lower nitrogen concentration, while the addition of an enzyme had the opposite effect. The wines obtained from must clarification with enzyme showed higher concentrations of compounds with varietal aroma, while the clarification with bentonite resulted in wines with higher concentrations of the major esters and of hydrogen sulfide. A relation between the amino acids arginine and alanine was observed, and these provided the highest contributed of nitrogen to the yeast, with volatile compounds (mainly esters) being formed in the wines. Regarding the extraction of heterocyclic compounds, the response surfasse methodology showed that the best conditions for extraction were: pH 5.5, 3 g of NaCl and extraction time of 55 min. The validated method showed excellent accuracy, repeatability, and detection and quantification limits. The wines from different regions of France were separated in the multivariate analysis according to the amino acid composition as well as the heterocyclic compounds. Red wines from same region (Bordeaux Region) were separated according the vintage when the profile for the heterocyclic compounds was considered.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:18:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327295.pdf: 1265281 bytes, checksum: c85c6bb7186f0201236e123d0eda0929 (MD5) Previous issue date: 2014 / Estudos sobre a exigência proteica e fontes alternativas para o camarão marinho são de extrema importância para o desenvolvimento da carcinicultura, porém o suprimento desse nutriente pode variar de acordo com o sistema de cultivo. O objetivo deste estudo foi comparar a influência do nível de proteína em dois sistemas de cultivo, e avaliar a substituição da farinha de peixe pelo concentrado proteico de soja para Litopenaeus vannamei. No primeiro estudo, foram formuladas quatro dietas com diferentes níveis de proteína (243, 303, 329, 367 g de proteína bruta por kg de ração), para alimentar camarões nos sistemas semi-intensivo e superintensivo em biofloco. O nível de proteína nas dietas não interferiu nos parâmetros de qualidade de água, em ambos os sistemas avaliados. No sistema semi-intensivo é necessário 330 g de proteína por kg de ração, enquanto que, no superintensivo em bioflocos 303 g, para obter os melhores índices zootécnicos e menor custo. Na segunda etapa, foi avaliada a substituição da proteína da farinha de peixe pelo concentrado proteico de soja e para isto foram formuladas quatro dietas (0, 33, 66 e 100% de substituição) para sistema superintensivo de bioflocos. Após o cultivo, não foram observadas diferenças significativas nos parâmetros de qualidade de água, entretanto a substituição alterou a composição centesimal e perfil de aminoácidos do biofloco. Os camarões alimentados com 33% de substituição da farinha de peixe pelo concentrado proteico de soja obtiveram o mesmo desempenho e menor consumo que animais alimentados sem a substituição, demonstrando a viabilidade na substituição de 33%. Com isto, conclui-se que o L. vannamei necessita de quantidades diferentes de proteína, de acordo com o sistema de cultivo, e que a substituição de 33% da farinha de peixe pelo concentrado proteico de soja é viável no cultivo superintensivo em bioflocos.<br> / Abstract: Studies about protein requirement and alternative sources for marine shrimp are of utmost importance for the development of shrimp culture, but the supply of this nutrient may vary according to the culture system. The aim of this study was to compare the influence of protein level in two cropping systems, and evaluate the replacement of fishmeal by soybean protein concentrate for Litopenaeus vannamei. In the first study, four diets with different protein levels (243, 303, 329, 367 g crude protein per kg of diet) were formulated to feed shrimp in semi-intensive and super-intensive systems biofloc. The level of protein in the diets did not affect the water quality parameters in both systems evaluated. In semi-intensive system 330 g of protein per kg feed is needed, whereas in biofloc system the shrimp need 303 g for best performance indexes and lower cost. In the second stage, was evaluated the replacement of the fishmeal protein by soy protein concentrate, four diets were formulated (0, 33, 66 and 100% replacement) to superintensive bioflocs system. After culture, no significant differences were observed in the parameters of water quality, however the substitution altered the chemical composition and amino acid profile of biofloc. Shrimps fed with 33% replacement of fishmeal by soybean protein concentrate achieved the same performance and lower consumption than animals fed without replacement, demonstrating the feasibility of replacing 33%. With this, it is concluded that L. vannamei require different amounts of protein, according to the cultivation system, and that the replacement of 33% of fish meal by soy protein concentrate is viable in superinensive biofloc system.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-09-19T04:12:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349741.pdf: 2880569 bytes, checksum: 953450aa8fe26a8bc38bf3c5e79b64fa (MD5) Previous issue date: 2017 / O mel, além de altos teores de frutose e glicose, apresenta em sua composição menores concentrações de compostos com importantes propriedades nutricionais e discriminatórias. Méis de melato têm sido especialmente valorizados pelo sabor forte característico e possíveis efeitos benéficos à saúde quando comparados aos méis florais, incluindo mel de melato de bracatinga (MMB), obtido a partir de exsudato de cochonilhas (Tachardiella sp) que infestam a espécie bracatinga (Mimosa scabrella Bentham). Assim, a discriminação com relação à garantia de origem em termos de fonte (floral ou melato) e identificação geográfica, bem como a avaliação de classes de compostos com possíveis propriedades bioativas, se tornam importantes aspectos de controle de qualidade e autenticidade. Devido à relevância econômica e produtiva no mercado internacional e escassez de estudos sobre o MMB, os objetivos deste estudo foram: determinar aminoácidos livres (AAL) a fim de elucidar a contribuição de cochonilhas (Tachardiella sp) e abelhas (Apis mellifera) ao MMB e discriminar geograficamente este mel de cinco municípios do Planalto Serrano de Santa Catarina utilizando quimiometria; discriminar méis de melato e floral, de mesma espécie botânica (Mimosa scabrella Bentham) a partir da comparação do perfil de proteoma utilizando análise de componentes principais (PCA); e determinar compostos fenólicos totais (TCP) e individuais, minerais e capacidade antioxidante in vitro pelos mecanismos de captura de radical livre (DPPH) e redução férrica (FRAP) a fim de avaliar a qualidade com relação à potencialidade funcional. Os resultados obtidos evidenciaram a presença predominante dos AAL serina (Ser), prolina (Pro), asparagina (Asn), ácido aspártico (Asp) e ácido glutâmico (Glu) com concentrações que variaram de < LQ para Pro, Asn e Asp a 1216 mg kg-1 para Glu em melato de cochonilhas (M), e de 56,7 mg kg-1 para Ser a 1447 mg kg-1 para Glu em MMB; a partir desta determinação observou-se uma efetiva contribuição de Pro pela abelha ao MMB e a discriminação de acordo com sua origem geográfica utilizando quimiometria. O perfil de proteoma apresentou um maior valor médio de spots proteicos em MMB (160) quando comparado ao mel floral de bracatinga (84) e spots proteicos comuns (45), que quando submetidos à PCA, discriminou estes méis de mesma espécie botânica. As concentrações obtidas para as capacidades antioxidantes in vitro variaram de 16,5 a 43,4 mg EAA 100 g-1 para DPPH e de 523 a 1004 µmol FeSO4.7H2O 100 g-1 para FRAP, e de 84,4 a 197 mg EAG 100 g-1 para TPC que, quando comparado a outros méis de melato, o MMB apresentou maiores resultados; além disto, apresentou maior número e diversidade de compostos fenólicos individuais, maiores concentrações de quercetina e ácidos benzoico, cafeico, clorogênico, ferúlico, cumárico e siríngico, compostos predominates diferenciados (ácido benzoico: 46,7 a 1520 µg 100g-1, ácido 3,4-dihidroxibenzoico: 96,7 a 228 µg 100g-1 e ácido salicílico: de 75,7 a 830 µg 100g-1) e compostos fenólicos ainda não reportados em méis de melato (coniferaldeído, hesperidina, isoramnetina, pinobanksina). Os macroelementos de maior concentração foram K+ (de 2323 a 6332 mg kg-1), Ca2+ (de 4,80 a 140 mg kg-1) e Mg2+ (de 40,4 a 80,7 mg kg-1), apresentando maiores concentrações destes e menores concentrações de Na+ (de 2,42 a 13,3 mg kg-1) quando comparado a méis de melato de outros estudos. A análise de matriz de correlação de Pearson entre as determinações de TPC, DPPH, FRAP, compostos fenólicos individuais e minerais demonstrou potencial influência sinérgica dos macroelementos na ação antioxidante através dos mecanismos analisados. A partir destes resultados, juntamente com as ações funcionais evidenciadas in vivo de méis relacionadas aos compostos antioxidantes e potencial sinergismo constituintes da menor fração da composição melífera, o MMB demonstrou características benéficas potenciais de propriedades funcionais. Além disto, a determinação de AAL e perfil proteômico, associados às ferramentas quimiométricas, podem representar uma estratégia analítica para autenticação de MMB com relação à discriminação geográfica e entre tipos de méis (floral e melato), respectivamente.<br> / Abstract : Honey, besides high levels of fructose and glucose, present in its composition, compounds in smaller concentrations of special interest with important nutritional and discriminatory properties. Honeydew honeys have been specially valued because of the different sensory attributes and possible health beneficial effects when compared to floral honeys, including bracatinga honeydew honey (Bhh), obtained from exudates of plant-sucking insects (Tachardiella sp.) that infest the bracatinga species (Mimosa scabrella Bentham). Then, discrimination with respect to origin guarantee in terms of source (floral or honeydew) and geographic identification, as well as evaluation from compound classes with potential bioactive properties, become important aspects of quality control and authenticity. Due to the economic and productive importance in the international market and lack of studies about Bhh, the aims of this study were: to determine free amino acids (FAA) to elucidate the contribution from plant-sucking insects (Tachardiella sp.) and bees (Apis mellifera) to the Bhh and to discriminate geographically this honey from five municipalities of the Serrano Plateau from Santa Catarina using chemometrics; to discriminate floral and honeydew honeys of the same botanical species (Mimosa scabrella Bentham) from the comparison of the proteome profile using principal component analysis (PCA); and to determine total phenolic compounds (TPC) and individual phenolic compounds, minerals and in vitro antioxidant capacity by free radical capture (DPPH) and ferric reducing (FRAP) mechanisms in order to evaluate the quality in relation to functional potentiality. The results obtained evidenced the predominant presence of the FAA serine (Ser), proline (Pro), asparagine (Asn), aspartic acid (Asp) and glutamic acid (Glu) with concentrations ranging from <LQ for Pro, Asn and Asp at 1216 mg kg-1 for Glu in honeydew from plant- sucking insects (H) and from 56.7 mg kg-1 for Ser at 1447 mg kg-1 for Glu in Bhh; from this determination an effective contribution of Pro by the bee to the Bhh and the discrimination according to its geographical origin using chemometrics was observed. The proteome profile showed a higher average value of protein spots in Bhh (160) compared to the bracatinga floral honey (84) and common protein spots (45), which when subjected to the PCA, discriminated these honeys from same botanical species. The concentrations obtained for in vitro antioxidant capacities ranged from 16.5 to 43.4 mg AAE 100 g-1 for DPPH and from 523 to 1004 µmol FeSO4.7H2O 100 g-1 for FRAP, and from 84.4 a 197 mg GAE 100 g-1 for TPC which, when compared to other honeydew honeys, Bhh showed higher results; furthermore presented higher number and diversity of individual phenolic compounds, higher concentrations of quercetin and benzoic, caffeic, chlorogenic, ferulic, cumaric and syringic acids, differentiated major compounds (benzoic acid: from 46.7 to 1520 µg 100g-1, 3,4-dihydroxybenzoic acid: 96.7 to 228 µg 100g-1 and salicylic acid: 75.7 to 830 µg 100g-1) and phenolic compounds not yet reported in honeydew honeys (coniferaldehyde, hesperidin, isorhamnetin and pinobanksin). The predominant macroelements were K+ (from 2323 to 6332 mg kg-1), Ca2+ (from 4.80 to 140 mg kg-1) and Mg2+ (from 40.4 to 80.7 mg kg-1), showing higher concentrations of these and lower concentrations of Na+ (from 2.42 to 13.3 mg kg-1) when compared to honeydew honeys from other studies. Pearson correlation matrix analysis between TPC, DPPH, FRAP, individual phenolic compounds and minerals showed potential synergistic influence of the macroelements on the antioxidant action through the mechanisms analyzed. From these results and functional actions evidenced in vivo of honeys related to the antioxidant compounds and potential synergism of constituents of the smallest fraction of the honey composition, the Bhh demonstrated potential beneficial characteristics of functional properties. In addition, the AAL determination and proteomic profile, associated with chemometric tools, can represent an analytical strategy for authentication of this honey with respect to the geographical discrimination and kinds of honeys (floral and honeydew), respectively.

Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. / Made available in DSpace on 2013-12-05T20:39:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1998

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-17. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:58Z : No. of bitstreams: 1 000853172.pdf: 668118 bytes, checksum: 6bb014fda576f413445f741abae4b6a9 (MD5) / O eucalipto é a espécie florestal mais utilizada em reflorestamento no país, em virtude do rápido crescimento das plantas, condições climáticas e tecnologias desenvolvidas. Porém, a interferência das plantas daninhas causa grandes prejuízos, decréscimo quantitativo e qualitativo da produção do eucalipto. Entre as possibilidades de manejo de plantas daninhas, o método químico é o mais utilizado, porém, poucos são os herbicidas registrados para a cultura do eucalipto, entre os quais o glyphosate é o mais usado por controlar um grande número de espécies. Existem poucos trabalhos a respeito dos efeitos diretos e indiretos do glyphosate nesta espécie florestal. Neste trabalho, clones de eucalipto urograndis foram submetidos ao contato direto com o glyphosate e indireto por meio de aplicação sobre plantas de Brachiaria decumbens, visando caracterizar o movimento do herbicida, exsudação radicular e seus efeitos na planta. Foram realizadas avaliações de intoxicação visual do eucalipto aos 7, 14 e 21 DAA e da massa da matéria seca das plantas aos 21 DAA. Também foram realizadas quantificações por cromatografia líquida de alta eficiência e espectrometria de massas (LC-MS/MS) em diferentes partes das plantas (superior e inferior) dos seguintes compostos: glyphosate, ácido amimetilfofônico (AMPA), ácido chiquímico, chiquimato-3-fosfato, fenilalanina, tirosina e triptofano. O glyphosate foi detectado nas plantas de eucalipto para os tratamentos com a aplicação direta e indireta do herbicida e houve translocação para os locais que não foram atingidos na aplicação, mesmo quando aplicado sobre a B. decumbens, entretanto o AMPA não foi. A presença de glyphosate nas plantas influenciou na alteração dos níveis de ácido chiquímico, fenilalanina, tirosina, triptofano e chiquimato-3-fosfato, além de causar níveis de intoxicação nas plantas de eucalipto e redução de ... / Eucalyptus is the most used forest species in reforestation in the country due to the rapid growth of plants, climatic conditions and developed technologies. However, interference by the weeds cause major damage, the quantitative and qualitative decrease in production of eucalyptus. Among the weed management possibilities, the chemical method is the most used, however, there are few herbicides registered for eucalyptus cultivation, in which glyphosate is most commonly used to control a large number of species. There are few studies regarding the direct and indirect effects of the glyphosate on this forest species. In this paper, Eucalyptus urograndis clones were subjected to direct contact with glyphosate and indirectly through application on Brachiaria decumbens plants, aiming to characterize the movement of the herbicide, root exudation and its effects on the plant. Visual evaluations were carried out through eucalyptus phytointoxication at 7, 14 and 21 DAA and of the dry mass of the plants at 21 DAA. Also, measurements were made on different parts of plants (top and bottom) of the following compounds by high-performance liquid chromatography and mass spectrometry (LC-MS / MS): glyphosate, aminomethylphosphonic acid (AMPA), shikimic acid, shikimate-3-phosphate, phenylalanine, tyrosine and tryptophan. Glyphosate was detected in eucalyptus plants for treatments with the direct and indirect application of herbicide and there was a translocation to sites that were not attain in the application, even when applied to the B. decumbens, however the AMPA was not. The presence of glyphosate on plants, influenced the change in the shikimic acid levels, phenylalanine, tyrosine, tryptophan, and shikimate- 3-phosphate, apart from causing intoxication in eucalyptus plants and reduction of dry mass. Glyphosate was detected in eucalyptus plants after application on the plants of B decumbens with low intoxicication ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-04-15Bitstream added on 2014-06-13T19:53:21Z : No. of bitstreams: 1 cagnin_rl_me_rcla.pdf: 1628326 bytes, checksum: 51888e5b621ee00120b483fec4fea17a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Neste trabalho de dissertação, apresentamos uma técnica de se construir sistematicamente sequências de aminoácidos que, ao serem dispostas ao longo de uma cadeia previamente conhecida, resultam em cadeias que se comportam como proteínas. Cada cadeia de aminoácidos, a uma dada temperatura, deve assumir uma forma funcional denominada estrutura nativa, não degenerada, na qual sua energia é a de menor valor possível. A técnica está baseada em um método Monte Carlo, introduzido por Wang e Landau, para se estudar transição de fases em sistemas magnéticos e que neste trabalho foi adaptada e aplicada para se desenhar proteínas. Para se verificar a eficiência do método, foi adotado o modelo de rede para proteínas, onde as cadeias são compostas por 27 monômeros interagindo através do potencial de Miyazawa-Jernigan e 20 tipos de aminoácidos. Um elevado número de sequências foram sintetizadas e todas foram sistematicamente testadas para verificar se cumpriam os requisitos de proteína. Com os resultados obtidos pôde-se verificar o sucesso da implementação da técnica. Trata-se então de uma ferramenta muito interessante e eficiente para o estudo do problema do enovelamento de proteínas / In this dissertation, we present a technique to search and order sequences of amino acids placed along a known chain to build one that behaves as a protein. At a given temperature, each designed sequence should fold to a special nondegenerated conformation known as native state. The energy of the sequence in this state is the lowest one. The technique is based on a Monte Carlo method, introduced by Wang and Landau, to study phase transition of magnetic systems and in this work was adapted and applied to protein design. We adopted the lattice model protein composed of 27 monomers interacting through the Miyazawa-Jernigan potencial and with 20 types of different amino acids. Many sequences were synthesized and all of them were systematically verified if they fulfilled the protein requirements and to check the efficiency of this method. The obtained results showed the success of the implemantation of this technique. Therefore, it is one more very interesting tool to efficiently study the protein folding problem

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:10:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-26. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:25:36Z : No. of bitstreams: 1 000844170.pdf: 1042558 bytes, checksum: d9674fe6c2ea8da3779631f581b0acf3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O estudo teve por objetivo avaliar o efeito da suplementação de vitamina C e triptofano sobre o desempenho e indicadores de estresse de frangos de corte criados em alta densidade. Um experimento foi realizado em delineamento experimental inteiramente casualizado em esquema fatorial 2 x 5 +1 (2 níveis de vitamina C: 0 e 250 mg/kg da dieta; 5 níveis de triptofano: 100%; 125%; 150%; 175% e 200% das recomendações associados á alta densidade de criação (17 aves/m²) e o controle negativo, dieta ausente de vitamina C + triptofano segundo as recomendações, associado á baixa densidade de criação (12 aves/m²), com seis repetições. As variáveis de desempenho analisadas foram: peso corporal, ganho de peso, consumo de ração, conversão alimentar, viabilidade e índice de eficiência produtiva. Os indicadores de estresse avaliados: glicose sérica, relação heterófilo:linfócito, colesterol, triglicerídeos, ácido úrico, VLDL, metabólitos de glicocorticoides urofecais e o título de anticorpos contra a doença de New Castle. O desempenho de frangos de corte é prejudicado quando criados em alta densidade. A adição de vitamina C promoveu melhora sobre o desempenho das aves, verificada na melhora na CA. A vitamina C e o triptofano não afetaram a resposta imunológica dos frangos e não influenciaram os parâmetros bioquímicos sanguíneos (P>0,05). A técnica de dosagem de metabólitos urofecais de corticosterona por Enzimainunoensaio se mostra adequada para avaliações não invasivas de estresse em frangos de corte. A suplementação em 200% de triptofano associado à vitamina C se mostra eficiente em reduzir o estresse causado pela densidade de criação e pode ser indicado para produção de frangos de corte em alta densidade promovendo melhora no bem-estar das aves / The study aimed to evaluate the effect of vitamin C and tryptophan supplementation on growth performance and stress parameters of broiler chickens raised in high stocking densities. An experiment was realized in a completely randomized design in a factorial arrangement 2 x 5 + 1 (vitamin C: 0 and 250 mg/kg of the diet; tryptophan: 100%; 125%; 150%; 175% and 200% of the recommendations associated to high stocking densities (17 birds/m²) and the negative control, diet without vitamin C + tryptophan according to the requirements, associated to low stocking density (12 birds/m²), with six replicates each. Growth performance variables analyzed were: body weight, weight gain, feed intake, feed conversion ratio, viability and productive efficiency index. Stress parameters measured were: serum glucose, heterophil: lymphocyte ratio, cholesterol, triglycerides, uric acid, VLDL, urofaecal corticosterone metabolites and antibody titers against NewCastle disease (P> 0,05). Growth performance is affected negatively by high stocking density. The feed conversion ratio of the broilers that received VC in the diet where improved (P< 0,05) compared with the unsupplemented ones. Vitamin C and tryptophan did not affect chicken immune response or biochemical blood parameters P> 0,05). The dosage of urofecal corticosterone metabolites for Enzyme immunoassay technique is adequate for noninvasive assessment of stress in broilers. Tryptophan supplementation in 200% associated with vitamin C was efficient to reduce stress caused by stocking density and can be indicated to broiler production promoting an improvement on the chicks welfare / FAPESP: 13/04524-4

Orientador: Nilva Kazue Sakomura / Coorientador: Edney Pereira da Silva / Banca: Sandra Regina Freitas Pinheiro / Banca: Nelson José Peruzzi / Banca: Simara Márcia Marcato / Banca: Nayara Tavares Ferreira / Resumo: Objetivou-se com esta pesquisa determinar as respostas de codornas japonesas e a elaboração de modelos matemáticos para determinar o nível ótimo dessas aves à ingestão de lisina, metionina+cistina, treonina e triptofano com base no modelo fatorial. Foram realizados quatro ensaios experimentais, utilizando 392 codornas japonesas no pico de postura em cada ensaio. Os ensaios foram delineados inteiramente ao acaso, com sete tratamentos e sete repetições compostas por sete aves. Os tratamentos consistiram de níveis crescentes de cada aminoácido teste. Os níveis propostos de lisina variaram de 0,402 a 1,409%, met+cis de 0,347a 1,155%, treonina de 0,254 a 0,845% e triptofano de 0,089 a 0,296% dos aminoácidos teste. Esses níveis foram estabelecidos para compreender todas as exigências (mantença, resposta e estabilidade ou platô de resposta). Para cada aminoácido foi estudado um nível controle com objetivo de confirmar a limitação do respectivo aminoácido teste. O período experimental foi de sete semanas, sendo três de adaptação e as outras quatro para elaboração do modelo fatorial. Nesse período foram acompanhados o consumo de ração, a produção de ovos, o peso de ovos e o peso corporal. As variáveis estudadas foram, consumo de ração (g), consumo do aminoácido teste (g/ave/dia), peso médio do ovo (g), massa de ovos (g) e peso das aves (g). As respostas de produção foram ajustadas pelo modelo broken line e modelo fatorial para fracionar as exigências em mantença e produção de ovos, b... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this research was to determine the responses to Japanese quails and the elaboration of mathematical models for the determination of the levels of lysine, threonine, tryptophan and methionine + cystine water intake. Four experimental trials were carried out using 392 Japanese quails Posture peak in each test. The trials were designed entirely at random, with seven treatments and seven replicates composed of seven birds. Treatments consisted of increasing levels of each amino acid test. Proposed lysine levels ranged from 0.402 to 1.409%, met + cis from 0.347 to 1.155%, threonine from 0.254 to 0.845% and tryptophan from 0.089 to 0.296% of the test amino acids. These levels were established to understand all requirements (maintenance, response and stability or response plateau). For each amino acid a control level was studied in order to confirm the limitation of the respective amino acid test. The experimental period was seven weeks, three of them being adapted and the other four for elaboration of the factorial model. In this period, the consumption of feed, egg production, egg weight and body weight were monitored. The variables studied were feed intake (g), test amino acid consumption (g / bird / day), mean egg weight (g), egg mass (g) and bird weight (g). The production responses were adjusted by the broken line model and factorial model to fractionate the maintenance and egg production requirements, as well as to calculate the level to optimize the egg mass of the population. In addition, the amino acid requirements of the Reading Model were estimated. The broken line model estimated the maximum response for egg mass of 9.67; 9.31; 9.49 and 10.37 g / d for Lys, Thr, Met + Cys and Trp, respectively. The values of m determined by the monomolecular function were 156, 64, 176 and 47 mg / Bwkg0.75 per day... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Luiz Edivaldo Pezzato / Banca: Ligia Uribe Gonçalves / Banca: Dalton José Carneiro / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos da substituição do farelo de soja (FS) pelo farelo de amendoim (FA) em dietas para juvenis de tilápia do Nilo. Os coeficientes de digestibilidade aparente (CDA) do FA foram determinados. O CDA para proteína foi de 90.9% e para os aminoácidos variou entre 87.2% para a glicina e 97.6% para a arginina. O FA foi então utilizado em substituição parcial e completa do FS em dietas práticas para a tilápia do Nilo, formuladas para conter 268.1 g kg-1 de proteína digestível e 3036 kcal kg-1 de energia digestível (base na matéria natural). A suplementação de aminoácidos foi baseada no conceito de proteína ideal. Os peixes (13.4 ± 0.20 g) foram alimentados por 90 dias com cada uma das cinco dietas: 0% FA, 25% FA, 50% FA, 75% FA e 100% FA. Os peixes alimentados com dieta 100% FA apresentaram piora no ganho de peso e conversão alimentar em relação aos peixes alimentados com dieta 0% FA. Decréscimo significativo na taxa de eficiência proteica e para o conteúdo em proteína das carcaças foi registrado nos peixes alimentados com as dietas 50% FA, 75% FA e 100% FA. O FA pode substituir até 25% do FS, sem prejuízos ao desempenho produtivo e a composição bromatológica da carcaça de alevinos de tilápia do Nilo / Abstract: The main objective of this study was to evaluate the effects of replacing soybean meal (SBM) with peanut meal (PM) in diets for juvenile Nile tilapia. The apparent digestibility coefficients (ADC) of PM were determined. ADC for protein was 90.9% and amino acids ranged from 87.2% for glycine to 97.6% for arginine. PM was then used as partial and complete replacements for SBM in practical diets for Nile tilapia formulated to contain equal digestible protein (268.1 g kg-1) and energy (3036 kcal kg-1) on as fed basis. Supplemental amino acids were added based on the ideal protein concept. Fish (13.4 ± 0.20 g) were fed for 90 days on one of the five diets: 0% PM, 25% PM, 50% PM, 75% PM and 100% PM. Fish fed 100% PM diet had lower weight gain and higher apparent fed conversion ratio than fish fed 0% PM diet. A significant decreased of protein efficiency ratio and whole body protein content was recorded in fish fed 50% PM, 75% PM and 100% FA diets. PM can replace SBM up to 25% without any interference on performance and whole-body composition of Nile tilapia fingerling / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-01-15Bitstream added on 2014-06-13T20:58:05Z : No. of bitstreams: 1 negrao_af_me_botfmvz.pdf: 363555 bytes, checksum: c16d926de235a96ead7f979f2853aad9 (MD5) / Este trabalho teve por objetivo efetuar o levantamento dos tipos polínico presentes no pólen apícola e realizar análises de seus teores proteicos e composição de aminoácidos, em diferentes estações do ano. O experimento foi conduzido no Setor de Apicultura da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Fazenda Experimental Lageado, UNESP, Campus de Botucatu. O pólen foi coletado semanalmente durante o período de setembro de 2012 a agosto de 2013, de cinco colmeias, semelhantes quanto ao número de quadros de cria e alimento, por meio de coletor de pólen frontal. O pólen retirado dos coletores foi misturado, pesado em balança analítica, desidratado em estufa de ventilação forçada, limpo e as bolotas classificadas por granulometria menor e maior que 2,0mm. Em seguida as amostras foram armazenadas em frascos estéreis, os quais foram mantidos sob congelamento para realização das análises. Os resultados foram avaliados por ANOVA, seguido do teste de Tukey para verificar diferenças entre as médias (P<0,05). Pode-se observar que o período do inverno (junho, julho e agosto) apresentou o maior teor proteico total (22,78±3,1%) e diferenças significativas entre granulometrias maior e menor que 2,0mm (20,38±2,6% e 23,58±2,9%, respectivamente). Não foram encontradas diferenças para a composição de aminoácidos no pólen nas diferentes estações do ano. Dentre os tipos polínicos encontrados destacam-se principalmente Asteraceae, Poaceae e Myrtaceae, encontrados em todas as estações do ano, comprovando que as abelhas concentram a coleta de recursos de acordo com a disponibilidade das plantas nas estações / This study aimed to carry out a survey of pollen types present in bee pollen and realize analyzes of their protein content and amino acid composition during different seasons. The experiment was conducted at the Sector of Apiculture, Faculty of Veterinary Medicine and Animal Science, Lageado Experimental Farm, UNESP, Botucatu. The pollen was collected weekly during the period of September 2012 and August 2013, from five hives, similar to the number of frames of brood and food through frontal collector pollen. The pollen from the collectors was mixed, weighed on an analytical balance, dried in an oven with forced ventilation, cleaned and acorns classified by grain size smaller and larger than 2.0 mm. Then the samples were stored in sterile vials which were kept under freezing for analyzes. The results were evaluated by ANOVA followed by Tukey's test to check for differences between means (P <0.05). It can be observed that the winter period (June, July, August) showed the largest total protein content (22.78% ± 3.1) and also significant differences when compared particle sizes greater than 2.0 mm and less than 2.0 mm (20.38 ± 2.6 ± 2.9% and 23.58%, respectively). No differences in the amino acid composition between the year seasons in bee pollen were found. Among the pollen types found stand out mainly Asteraceae, Poaceae and Myrtaceae, which were found in all seasons, proving that bees concentrated collection of resources according to the availability of plants in the seasons