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Análise e quantificação tridimensional em imagens de ultra-som intravascular / Intravascular ultrasound: tridimensional quantification and analysisSales, Fernando José Ribeiro 23 October 2009 (has links)
INTRODUÇÂO: A análise da composição das lesões in-vivo tem sido objeto de estudo de uma série de grupos de estudo sobre a doença aterosclerótica. Os métodos disponíveis para esse fim utilizam técnicas de análise espectral do sinal ultra-sônico retroespalhado antes deste ser transformado em imagens de ultra-som intravascular (IVUS), uma vez que não existem métodos que realizem tal inferência somente a partir das imagens. Neste trabalho, utilizamos técnicas de processamento de imagens e de reconhecimento de padrões para analisar a composição das lesões de acordo com a classificação proposta pela metodologia de Ultra-Som Intravascular com Histologia Virtual (IVUS-VH). MÉTODOS: Neste estudo utilizamos uma amostra de oito (08) artérias coronárias provenientes de cinco (05) pacientes, resultando num total de 96492 regiões de interesse para inferência da composição. Para a segmentação automática da interface lúmen-íntima e íntima-adventícia, aplicamos as técnicas de contornos ativos do tipo Snakes e para a determinação da energia potencial dos contornos, utilizamos técnicas de filtragem baseadas na difusão anisotrópica convencional e restritiva. Utilizamos três janelas quadradas diferentes de tamanhos 5x5, 7x7 e 9x9 pixels para extração dos atributos de texturas, dentre eles treze (13) baseados nas matrizes de co-ocorrência, seis (06) momentos invariantes à rotação, escala, translação e a ganho multiplicativo, baseados nos Momentos de Hu e propostos neste trabalho. Visando avaliar o efeito dos níveis de quantização das imagens nas matrizes de co-ocorrência, requantizamos originais de 256 níveis de cinza para 128, 64 e 32 tons. Como classificador, utilizamos o método dos k-vizinhos mais próximos (k-nn) e escolhemos os sete (07) vizinhos mais próximos como parâmetro de comparação. Como o k-nn é sensível com relação à métrica utilizada, testamos a distância euclidiana e a métrica de Mahalanobis. RESULTADOS: A segmentação automática da interface lúmen-íntima teve taxa média de acerto de 72,23% e a mediana da taxa de acertos foi de 81,20%, enquanto a taxa média de acertos para a interface íntima-adventícia foi de 80,86% e a mediana foi igual a 91,36%, considerando 495 quadros manualmente segmentados por um especialista. A melhor configuração do classificador foi utilizando a normalização de intensidades, com 256 níveis de cinza, com a janela 9x9 e usando a métrica de Mahalanobis. A taxa média de erros foi de 2.35%(DC), 20.51%(NC), 92.21%(FF) e 0.04%(FT), no entanto, se considerarmos somente três classes sem diferenciarmos os tecidos FF do FT temos a seguinte composição: 2.35% (DC), 20.51%(NC) e 0.04%(FT+FF), o que leva a uma taxa média de erros total de 5,15%. CONCLUSÕES: A classificação das lesões baseada somente em atributos de textura das imagens ainda não é possível com a nosso modelo se considerarmos os quatro tipos de tecido, uma vez que não conseguimos diferenciar de forma satisfatória dos componentes FF e FT. No entanto, se considerarmos somente três classes, temos resultados animadores, uma vez que conseguiremos identificar os componentes associados às placas ditas de maior risco de ruptura, os fibroateromas de capa fina (TCFA). Além disso, conseguimos um experimento associado ao trabalho, mostrar quantitativamente que há uma possível superestimação do componente NC ao redor de estruturas calcificadas nas imagens de IVUS-VH / INTRODUCTION: Several efforts for in vivo atherosclerotic plaque estimation has been realized worldwide. Current methods for related application are based on spectral analysis of backscattered ultrasound signals before intravascular image formation (IVUS), once there is not available techniques to perform composition analysis only from IVUS images. On this study, image processing and pattern recognition techniques has been used to classify plaques according to Intravascular Ultrasound Virtual Histology (IVUS-VH) classification. METHODS: A sample set of eight (08) coronary arteries from five (05) different patients, resulting on 96492 regions of interest for plaque analysis. For automatic segmentation of lumen-intima interface and intima-adventitia interface, active contours technique has been used. Conventional and restrictive anisotropic diffusion filters have been used for estimating the potential energy of active contours. Haralicks co-occurrence matrix and invariant moments based in Hu moments were used as features for pattern classification. Three different windows has been used on feature extraction procedure: 5x5,7x7 and 9x9 pixels. In order to analyze the influence of grey-scale quantization levels into Haralicks co-occurrence matrix, we tested four different types numbers of grey-scale levels: 32, 64,128 and 256. KNearest Neighbors algorithm as the classification rule, and we tested both Mahalanobis and Euclidian Metrics in this analysis. RESULTS: Segmentation of luminal-intimal layers average accuracy for was 72.30% and its median was 81.20%. Segmentation of intimal-adventitia layers average accuracy for was 80,86% and its median was 91,36%, for 495 manually segmented frames. Plaque classification according to IVUS-VH four classes scheme has shown not feasible with the proposed model, once average classification error-rate foe every component: 2.35%(DC), 20.51%(NC), 92.21%(FF) e 0.04%(FT). Our approach has not the ability to differentiate fibrotic tissue from fibro-fatty tissue. However, in the three classes scheme: DC, NC and (FF+FT), we achieved some encouraging results: 2.35% (DC), 20.51%(NC) e 0.04%(FT+FF), leading to an average error rate of 5,15%. With these results, a thin-cap fibroatheroma (TCFA) lesions detection algorithm for conventional IVUS images should be developed using our approach. Once TCFA plaques has been assigned to have an association with plaque rupture and sudden death, those results should be used for in vivo IVUS based TCFA detection. In an experiment related to this work, we have shown that there is an artifactual relationship between NC and DC components into VH images
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Narrativas produzidas por indivíduos afásicos e indivíduos cognitivamente sadios: análise computadorizada de macro e micro estrutura / Narratives produced by aphasic individuals and cognitively healthy individuals: computerized analysis of macro and micro structureSilveira, Gabriela 09 August 2018 (has links)
INTRODUÇÃO: O tema de investigação, discurso de afásicos, fornece informações importantes sobre aspectos fonológicos, morfológicos, sintáticos, semânticos e pragmáticos da linguagem de pacientes que sofreram lesão vascular cerebral. Uma das maneiras de estudar o discurso é por meio de cenas figurativas temáticas simples ou em sequência. A sequência da história de \"Cinderela\" é frequentemente utilizada em estudos, por ser familiar em todo o mundo, o que favorece estudos transculturais; por induzir a produção de narrativas, ao invés de descrições, frequentemente obtidas quando se utiliza prancha única para eliciar discursos. Outra vantagem do uso das sequências da \"Cinderela\" é o fato de gerar material linguístico em quantidade suficiente para análise detalhada. OBJETIVOS: (1) analisar, por meio de tecnologias computadorizadas, aspectos macro e microestruturais do discurso de indivíduos sadios do ponto de vista cognitivo, afásicos de Broca e afásicos anômicos; (2) explorar o discurso como indicador de evolução da afasia; (3) analisar a contribuição do SPECT para verificação de evolução da afasia junto ao discurso. MÉTODO: Participaram do estudo oito indivíduos afásicos de Broca e anômicos que compuseram o grupo do estudo longitudinal (G1), 15 indivíduos afásicos de Broca e anômicos que compuseram o outro grupo de estudo (G2) e 30 cognitivamente sadios (GC). Os participantes foram solicitados a examinar as cenas da história \"Cinderela\" e depois recontar a história, com suas palavras. Foram exploradas tecnologias computadorizadas e analisados aspectos macro e microestruturais dos discursos produzidos. Para o G1, tivermos a particularidade de coleta de discurso também pela prancha \"Roubo dos Biscoitos\", análise do exame SPECT e acompanhamento longitudinal por um período de seis meses. RESULTADOS: Comparando o GC e o G2, em relação à macroestrutura, notou-se que os afásicos do G2 se diferenciaram significativamente do GC em todas as proposições e, em relação à microestrutura, sete métricas foram capazes de diferenciar ambos os grupos. Houve diferença significante macro e micro estrutural entre os sujeitos afásicos de Broca e anômicos. Foi possível verificar diferenças em medidas da macro e da microestrutura no G1 com o avançar do tempo de lesão após AVC. A história da \"Cinderela\" forneceu dados de microestrutura mais completos do que a prancha \"Roubo dos Biscoitos\". Os resultados do SPECT permaneceram os mesmos, sem demonstração de mudança com a evolução da afasia. CONCLUSÃO: A produção de narrativa gerou material para análise de macroestrutura e microestrutura, tanto aspectos de macro quanto de microestrutura diferenciaram indivíduos cognitivamente sadios dos sujeitos afásicos. A análise do discurso da \"Cinderela\" serviu como instrumento para mensurar a melhora da linguagem dos sujeitos afásicos. O uso da ferramenta computacional auxiliou as análises discursivas / INTRODUCTION: The aphasic discourse analysis provides important information about the phonological, morphological, syntactic, semantic and pragmatic aspects of the language of patients who have suffered a stroke. The evaluation of the discourse, along with other methods, can contribute to observation of the evolution of the language and communication of aphasic patients; however, manual analysis is laborious and can lead to errors. OBJECTIVES: (1) to analyze, by computerized technologies, macro and microstructural aspects of the discourse of healthy cognitive individuals, Broca\'s and anomic aphasics; (2) to explore the discourse as indicator of the evolution of aphasia; (3) to analyze the contribution of single photon emission computed tomography (SPECT) to verify the correlation between behavioral and neuroimaging evolution data. METHOD: Two groups of patients were studied: GA1, consisting of eight individuals with Broca\'s aphasia and anomic aphasia, who were analyzed longitudinally from the sub-acute phase of the lesion and after three and six months; GA2 composed of 15 individuals with Broca\'s and anomic aphasia, with varying times of stroke installation and GC consisting of 30 cognitively healthy participants. Computerized technologies were explored for the analysis of metrics related to the micro and macrostructure of discourses uttered from Cinderela history and Cookie Theft picture. RESULTS: Comparing the GC and GA2, in relation to the discourse macrostructure, it was observed that the GA2 aphasics differed significantly from the GC in relation to the total number of propositions emitted; considering the microstructure, seven metrics differentiated both groups. There was a significant difference in the macro and microstructure between the discourses of Broca\'s aphasic subjects and anomic ones. It was possible to verify differences in macro and microstructure measurements in GA1 with the advancement of injury time. In GA1, the comparison between parameters in the sub-acute phase and after 6 months of stroke revealed differences in macrostructure - increase in the number of propositions of the orientation block and of the total propositions. Regarding the microstructure, the initial measures of syllable metrics by word content, incidence of nouns and incidence of content words differed after 6 months of intervention. The variable incidence of missing words in the dictionary showed a significantly lower value after three months of stroke. Cinderella\'s story provided more complete microstructure data than the Cookie Theft picture. There was no change in SPECT over time, without demonstration of change with the evolution of aphasia. CONCLUSION: The discourse produced from the history of Cinderella and the Cookie Theft picture generated material for macrostructure and microstructure analysis of cognitively healthy and aphasic individuals, made it possible to quantify and qualify the evolution of language in different phases of stroke recuperation and distinguished the behavior of healthy and with Broca´s and anomic aphasia, in macro and microstructure aspects. The exploration of computerized tools facilitated the analysis of the data in relation to the microstructure, but it was not applicable to the macrostructure, demonstrating that there is a need for tool adjustments for the discourse analysis of patients. SPECT data did not reflect the behavioral improvement of the language of aphasic subjects
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Desenvolvimento e avaliação de modelo computacional para geração de alertas a partir de notificações de casos de meningite meningocócica / Development and evaluation of a computing model of alerts from meningococcal meningitis notification casesWagner Zaparoli 24 November 2008 (has links)
INTRODUÇÃO: este trabalho apresenta a arquitetura de um sistema de emissão de alertas para surtos e epidemias em tempo real, baseado em notificações eletrônicas da meningite, e discute os resultados dos testes e simulações realizados. MÉTODOS: esse sistema foi desenvolvido em quatro etapas: Concepção, Análise, Construção e Teste/Simulações. A Concepção contemplou a elicitação de requisitos, a qual definiu o que o sistema deve fazer. A Análise se preocupou com a modelagem e especificação das regras que definem como o sistema deve trabalhar. A Construção abrangeu a transformação das regras definidas e modeladas em linguagem de programação. A última etapa, Teste/Simulação, foi responsável por garantir que o sistema construído estava em conformidade com os requisitos elicitados na etapa de Concepção. RESULTADOS: vários artefatos foram criados e algumas constatações foram verificadas nesta etapa. Sobre os artefatos podemos citar os requisitos, casos de uso, diagrama de classes, modelo físico de dados, casos de teste e programas. Sobre as constatações podemos citar o disparo de alertas nas simulações realizadas pelo sistema dois dias antes que o alerta feito pelas autoridades de saúde do Estado de São Paulo usando os procedimentos habituais. DISCUSSÃO e CONCLUSÃO: O sistema desenvolvido pode ser classificado como um Early Warning System. Nas simulações, observamos que em duas oportunidades ele conseguiu evidenciar ocorrência de surto antecipadamente ao método tradicional utilizado pelo Centro de Vigilância Epidemiológico de São Paulo. Comparando-o com sistemas semelhantes em produção, verificamos que esse sistema se diferencia ao emitir ativamente alertas de surtos em tempo real. / INTRODUCTION: this essay presents the architecture of an alert system for epidemics based on real-time electronic notification of meningococcal meningitis, and discusses the results of tests and simulations made. METHODS: this system was developed in four stages: Conception, Analysis, Construction and Test/Simulation. The Conception covered the requirements elicitation, which defined what the system should do. The Analysis involved the modeling and specification rules that defined how the system should work. The Construction covered the transformation of defined and modeled rules in programming language. The last stage, Test/Simulation, checked the system under known scenarios, comparing the timing of outputs with the Brazilian notification surveillance framework. RESULTS: many artifacts were made and some evidences were verified. About the artifacts we can mention the requirements, use cases, class diagram, physical data model, test cases, and algorithms. About the evidences we can mention the fast alert production in simulations of this system as compared with the current procedure in use by health authorities. DISCUSSION AND CONCLUSION: this system can be classified as an Early Warning System. In simulations we observed that in two opportunities, it managed to put in evidence outbreak occurrence in advance to the traditional used method by Epidemiological Surveillance Center of São Paulo. In comparison with the similar systems under operation, we note this system is distinguished from them in issuing real-time outbreak alerts.
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Feridas complexas classificação de tecidos, segmentação e mensuração com o classificador Optimun-Path Forest /Pereira, Talita de Azevedo Coelho Furquim January 2018 (has links)
Orientador: Regina Célia Popim / Resumo: Introdução: As feridas complexas apresentam difícil resolução e associam-se a perda cutânea extensa, infecções importantes, comprometimento da viabilidade dos tecidos e/ou associação com doenças sistêmicas que prejudicam os processos normais de cicatrização, cursam com elevada morbimortalidade e têm sido apontadas como grave problema de saúde pública. Na prática clínica, é importante avaliar as feridas e documentar a avaliação. O registro incompleto sobre o paciente e o tratamento em uso é apontado como um desafio no acompanhamento das feridas e também prejudica ações de gestão, pesquisa e educação. A incorporação de fotografias de feridas à pratica profissional, mostra-se como uma estratégia para auxiliar profissionais na observação, evolução e registro claro e preciso. O Optimum-Path Forest (OPF) é um framework para o desenvolvimento de técnicas de reconhecimento de padrões baseado em partições de caminhos ótimos e particularmente eficiente para a classificação de imagens. O classificador OPF gera resultados a partir do cruzamento das classes e características selecionadas. Objetivo: Descrever as etapas do desenvolvimento de um aplicativo para dispositivos móveis capaz de segmentar e classificar tecidos de feridas complexas baseado no Optimum-Path Forest (OPF) supervisionado. Método: Foi aplicada uma nova metodologia inteligente para análise e classificação de imagens de feridas complexas por meio de técnicas de processamento digital de imagens e aprendizado de máquina com ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Introduction: Complex wounds are difficult to resolve and are associated with extensive cutaneous loss, major infections, compromised tissue viability and / or are related to systemic diseases that impair normal healing processes, have high morbidity and mortality and have been identified as severe public health problem. In clinical practice, it is important to evaluate the wounds and document the evaluation. The incomplete record on the patient and the treatment in use is pointed out as a challenge in the follow up of the wounds and also impairs management, research and education actions. The incorporation of wounds’ photos in the professional practice, stands out as a strategy to assist professionals in the observation, evolution and clear and precise recording. Optimum-Path Forest (OPF) is a framework for the development of pattern recognition techniques based on optimal path partitions and is particularly efficient for image classification. The OPF classifier generates results from the intersection of the selected classes and characteristics. Objective: Describe the steps in developing a mobile application capable of segmenting and sorting complex wound tissue based on the supervised Optimum-Path Forest (OPF). Method: A new intelligent methodology was applied for the analysis and classification of complex wound images using digital image processing and machine learning techniques with the supervised Optimum-Path Forest (OPF) standards classifier. The image bank of 27 comp... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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NOTÍCIAS AUTOMATIZADAS A evolução que levou o jornalismo a ser feito por não humanos / Automated news: the evolution that led journalismo to be clone by non humansCARREIRA, KRISHMA ANAÍSA COURA 10 April 2017 (has links)
Submitted by Noeme Timbo (noeme.timbo@metodista.br) on 2017-08-18T19:06:44Z
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Previous issue date: 2017-04-10 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This essay is based on the systematization of Ciro Marcondes Filho, which divides Journalism into four phases, in order to propose the addition of a new stage. The Fifth Journalism began at the end of the first decade of the 21st century and includes a feature radically different from the others: the possibility of news being generated by machines. The crossing of Journalism with Artificial Intelligence systems allows algorithms to perform tasks such as the calculation, writing, distribution and circulation of text, audio and even video. Factors such as speed of production, cost, ability to generate content in multiple versions, which can be constantly updated and customized, signal the possibility of expansion of Automated News. Research indicates that computer-generated news are well received by readers and is considered to be more objective than the ones written by journalists, although algorithms follow criteria of prioritization, association, classification and filtering that can reproduce prejudices. In addition, automation changes the traditional workflow in newsrooms and creates new functions. The reflections are based on the approach of the Actor-Network Theory and start from an exploratory and interdisciplinary bibliographic review of areas such as Social Communication, Technology Philosophy and Artificial Intelligence. This work also carried out a mapping which identified 59 journalism companies that automatically produce news on 8 coverage topics (politics, finance, sports, weather, crime, travel, traffic and entertainment) in 10 countries in North America, Europe And Asia. / Este trabalho parte da sistematização de Ciro Marcondes Filho, que divide o Jornalismo em quatro fases, para propor o acréscimo de uma nova etapa. O Quinto Jornalismo começou no final da primeira década do século 21 e inclui uma característica radicalmente diferente das demais: a possibilidade das notícias serem geradas por máquinas. O cruzamento do Jornalismo com sistemas de Inteligência Artificial permite que algoritmos executem tarefas como a apuração, redação, distribuição e circulação de texto, áudio e até vídeo. Fatores como velocidade na produção, custo, capacidade de gerar conteúdo em múltiplas versões, que pode ser atualizado constantemente e personalizado, sinalizam a possibilidade de expansão da Notícia Automatizada. Pesquisas indicam que as matérias feitas por computador têm boa recepção pelos leitores e são consideradas mais objetivas do que as redigidas por jornalistas, apesar dos algoritmos seguirem critérios de priorização, associação, classificação e filtragem, que podem reproduzir preconceitos. Além disso, a automação altera o fluxo tradicional de trabalho nas redações e cria novas funções. As reflexões se baseiam na abordagem da Teoria Ator-Rede e partem de uma revisão bibliográfica de caráter exploratório e interdisciplinar de áreas como Comunicação Social, Filosofia da Tecnologia e Inteligência Artificial. Este trabalho também realizou um mapeamento onde foram identificadas 59 empresas de jornalismo que produzem automaticamente notícias sobre 8 tópicos de cobertura (política, finanças, esporte, previsão do tempo, crime, viagem, trânsito e entretenimento) em 10 países da América do Norte, Europa e Ásia.
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AVALIAÇÃO DE BIOMARCADORES INFLAMATÓRIOS, OXIDATIVOS E VASCULARES EM PACIENTES COM HIPERCOLESTEROLEMIA / EVALUATION OF INFLAMMATORY, OXIDATIVE, AND VASCULAR BIOMARKERS IN PATIENTS WITH HIPERCHOLESTEROLEMIAPereira, Renata da Silva 21 March 2011 (has links)
Hypercholesterolemia is a determining factor for the development of atherosclerosis, which is
considered the main cause of cardiovascular diseases. In Brazil, as in most developed
countries, cardiovascular diseases are the leading cause of death. Several mechanisms are
involved in the development of atheromatous plaque thus the purpose of this study was to
evaluate the association between hypercholesterolemia and inflammatory, vascular, and
oxidative biomarkers as well as to develop and validate an analytical method for the
automated measurement of nitrite, a metabolite of the oxide oxide (NO) in plasma samples. In
the first phase of this study an analytical method for automated measurement of plasma nitrite
was developed and validated. This method was precise (r2=0,9998, P<0,001), linear, simple,
inexpensive, and applicable to routine monitoring. In phase 2, inflammatory, vascular and
oxidative markers were assessed. The groups were: group with hypercholesterolemia (LDL-C
≥ 160 mg / dl) and normocholesterolemic group (LDL-C ≤ 130 mg / dL). Results showed that
levels of total cholesterol, LDL-C, HDL-C, triglycerides, apolipoprotein A, apolipoprotein B,
advanced oxidation protein products (AOPP), interleukin-6 (IL-6) and D-dimer were
significantly higher in hypercholesterolemic patients, while levels of thiol grouping (-SH) and
nitrate / nitrite (NOx) were lower in this group. There were also significant correlations for
LDL-C and IL-6 (r = 0.693, P <0.0001), LDL-C and NOx (r = -0.314, P <0.05) and LDL-C
and - SH (r = -0.327, P <0.05). Thus, hypercholesterolemia promotes increased oxidative
stress, inflammation, and fibrinolysis in atherosclerosis. / A hipercolesterolemia é um fator determinante para o desenvolvimento da aterosclerose, que é
considerada a principal causa de doenças cardiovasculares. No Brasil, assim como na maior
parte dos países desenvolvidos, as doenças cardiovasculares representam a principal causa de
morbimortalidade. Vários mecanismos estão envolvidos no desenvolvimento da placa de
ateroma, assim o objetivo deste estudo foi avaliar a associação entre a hipercolesterolemia e
biomarcadores inflamatórios, oxidativos e vasculares, bem como desenvolver e validar um
método analítico automatizado para a mensuração de nitrito, um metabólito do óxido nítrico
(NO), em amostras de plasma. Na fase 1 deste estudo, foi desenvolvido e validado um método
analítico automatizado para dosagem de nitrito plasmático. Este método foi preciso, linear
(r2=0,9998, P<0,001), simples, de baixo custo e aplicável a rotina laboratorial. Na fase 2,
foram avaliados marcadores inflamatórios, oxidativos e vasculares. Os grupos estudados
foram: grupo hipercolesterolêmicos (LDL-C ≥ 160 mg/dL) e normocolesterolêmicos (LDL-C
≤ 130 mg/dL). Os resultados demonstraram que níveis de colesterol total, LDL-C, HDL-C,
triglicérides, apoliproteína A, apoliproteína B, produtos protéicos da oxidação avançada
(AOPP), interleucina-6 (IL-6) e D-dímero foram significativamente maiores nos pacientes
hipercolesterolêmicos, enquanto os níveis de grupamento tiol (-SH) e nitrato/nitrito (NOx)
foram inferiores neste grupo. Foram ainda observadas correlações significativas para o LDLC
e IL-6 (r = 0,693, P <0,001), LDL-C e de NOx (r = -0,314, P <0,05) e LDL-C e SH (r = -
0,327, P <0,05). Dessa forma, a hipercolesterolemia promove o aumento do estresse
oxidativo, inflamação e fibrinólise durante a aterosclerose.
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Feridas complexas: classificação de tecidos, segmentação e mensuração com o classificador Optimun-Path Forest / Complex wounds: tissue classification, segmentation and measurement with the Optimum-Path Forest classifierPereira, Talita de Azevedo Coelho Furquim 23 February 2018 (has links)
Submitted by Talita De Azevedo Coelho Furquim Pereira (talitapereira@bauru.sp.gov.br) on 2018-04-24T00:47:22Z
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Previous issue date: 2018-02-23 / Introdução: As feridas complexas apresentam difícil resolução e associam-se a perda cutânea extensa, infecções importantes, comprometimento da viabilidade dos tecidos e/ou associação com doenças sistêmicas que prejudicam os processos normais de cicatrização, cursam com elevada morbimortalidade e têm sido apontadas como grave problema de saúde pública. Na prática clínica, é importante avaliar as feridas e documentar a avaliação. O registro incompleto sobre o paciente e o tratamento em uso é apontado como um desafio no acompanhamento das feridas e também prejudica ações de gestão, pesquisa e educação. A incorporação de fotografias de feridas à pratica profissional, mostra-se como uma estratégia para auxiliar profissionais na observação, evolução e registro claro e preciso. O Optimum-Path Forest (OPF) é um framework para o desenvolvimento de técnicas de reconhecimento de padrões baseado em partições de caminhos ótimos e particularmente eficiente para a classificação de imagens. O classificador OPF gera resultados a partir do cruzamento das classes e características selecionadas. Objetivo: Descrever as etapas do desenvolvimento de um aplicativo para dispositivos móveis capaz de segmentar e classificar tecidos de feridas complexas baseado no Optimum-Path Forest (OPF) supervisionado. Método: Foi aplicada uma nova metodologia inteligente para análise e classificação de imagens de feridas complexas por meio de técnicas de processamento digital de imagens e aprendizado de máquina com o classificador de padrões Optimum-Path Forest (OPF) supervisionado. Criou-se o banco de imagens de 27 feridas complexas, que foram rotuladas por quatro especialistas conforme a classificação dos tecidos em quatro classes: granulação (vermelho), tecido fibrinóide (amarelo), necrose (preto) e hematoma (roxo), gerando 108 imagens rotuladas. Acrescentou-se duas classes: branco (o que está na foto, exceto o leito da ferida) e dúvida (divergência na classificação pelos profissionais). O classificador OPF foi treinado a partir dessas 108 imagens. Aplicou-se o OPF às imagens de feridas e verificou-se a acurácia. Em seguida, iniciou-se a construção do aplicativo. Resultados e Discussão: O presente estudo desenvolveu um esquema de classificação de tecido de feridas assistido por computador para avaliação e gerenciamento de feridas complexas, a partir de fotos de feridas da câmera digital de um smartphone. A aplicação do OPF a feridas complexas trouxe como resultado uma acurácia de 77,52% ± 6,14. Com esta ferramenta, foi desenvolvido como produto desta pesquisa um aplicativo para segmentação, classificação de tecidos e mensuração de feridas complexas. O aplicativo gera um relatório no formato Portable Document Format (PDF) que pode ser enviado por e-mail, impresso ou anexado a prontuário eletrônico compatível. Conclusão: Foi construído um banco com 27 imagens de feridas complexas, que quatro profissionais rotularam para treinamento do classificador OPF, aplicou-se o OPF às imagens de feridas complexas, avaliou-se a acurácia deste processo e desenvolveu-se um aplicativo para dispositivos móveis com as funções de segmentação da ferida, classificação de tecidos e mensuração da ferida. Os resultados mostraram que o valor da acurácia obtido na análise computacional teve valor significativo, equiparando-se a avaliação de especialistas em feridas. Comparando com estudos similares, a análise computacional de feridas mostrou-se com menor variabilidade em relação a avaliação de profissionais, sugerindo que a incorporação desta tecnologia na prática clínica favoreça o cuidado em saúde do paciente com feridas complexas, além de fornecer dados para a gestão, ensino e pesquisa. / Introduction: Complex wounds are difficult to resolve and are associated with extensive cutaneous loss, major infections, compromised tissue viability and / or are related to systemic diseases that impair normal healing processes, have high morbidity and mortality and have been identified as severe public health problem. In clinical practice, it is important to evaluate the wounds and document the evaluation. The incomplete record on the patient and the treatment in use is pointed out as a challenge in the follow up of the wounds and also impairs management, research and education actions. The incorporation of wounds’ photos in the professional practice, stands out as a strategy to assist professionals in the observation, evolution and clear and precise recording. Optimum-Path Forest (OPF) is a framework for the development of pattern recognition techniques based on optimal path partitions and is particularly efficient for image classification. The OPF classifier generates results from the intersection of the selected classes and characteristics. Objective: Describe the steps in developing a mobile application capable of segmenting and sorting complex wound tissue based on the supervised Optimum-Path Forest (OPF). Method: A new intelligent methodology was applied for the analysis and classification of complex wound images using digital image processing and machine learning techniques with the supervised Optimum-Path Forest (OPF) standards classifier. The image bank of 27 complex wounds was created, which were labeled by four specialists according to the classification of the tissues into four classes: granulation (red), fibrinoid (yellow) tissue, necrosis (black) and hematoma (purple), generating 108 images. Two classes were added: white (what is in the photo, except the wound bed) and doubt (divergence in classification by professionals). The OPF classifier was trained from these 108 images. The OPF was applied to the wound images and the accuracy was verified. Then, the application developing process was started. Results and Discussion: The present study developed a computer-aided wound tissue classification scheme for evaluation and management of complex wounds from photos of a smartphone. The OPF application to complex wounds resulted in an accuracy of 77.52 ± 6.14. With this 4 tool, it was developed the product of this research: an application for segmentation, tissue classification and measurement of complex wounds. The application generates a Portable Document Format (PDF) report that can be emailed, printed or attached to a compatible electronic medical record. Conclusion: A bank was made with 27 images of complex wounds, which four professionals labeled for training the OPF classifier, applied the OPF to complex wound images, assessed the accuracy of this process and developed a mobile application with the functions of wound segmentation, tissue classification and wound measurement. The results showed that the value of the accuracy obtained in the computational analysis had a significant value, being equal to the evaluation of specialists in wounds. Comparing to similar studies, the computational analysis of wounds showed less variability than professionals´ evaluation, suggesting that the incorporation of this technology in clinical practice favors the health care of patients with complex wounds, besides providing data for the management, teaching and research.
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Projeto industrial para aeração automática de leiras de compostagem orgânica / Industrial project for automated aeretion of organic composting pilesFigueira Júnior, Edson Alves 30 March 2012 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Composting is a safety environmental alternative to reuse and treat organic wastes produced by human-beings. Although decomposition naturally happens, the handling of some factors, such as oxygen level, temperature, moisture content and pH, can alter the process speed, accelerating microbial activity. Aeration is a crucial practice during the composting process, since it can ensure adequate oxygen supply, temperature control and moisture content reduction in the windrows. Therefore, this work aimed to develop an automated process of compost pile aeration in order to accelerate and optimize the production of biofertilizers in an industrial plant. The trial was carried out at Valoriza Fertilizantes Company located in the city of Uberlândia - MG. Based on previous tests done in the company s standard ventilation system an automated system of forced aeration (SAFA) was projected. After installing this system, moisture content, oxygen level and temperature tests were performed aiming to verify the efficiency of the developed aeration system. / A compostagem é uma alternativa ambientalmente correta para o aproveitamento e tratamento dos resíduos orgânicos gerados pelo homem. Apesar de a decomposição ocorrer naturalmente, a manipulação de alguns fatores, como o nível de oxigênio, a temperatura, o teor de umidade e o pH, podem alterar a velocidade do processo, acelerando a atividade microbiana. A aeração é uma prática crucial durante o processo de compostagem, pois pode garantir suprimentos adequados de oxigênio, controlar a temperatura e reduzir o teor de umidade nas leiras. Objetivou-se neste trabalho desenvolver um processo automatizado de aeração de leiras de compostagem para acelerar e otimizar a produção de biofertilizantes em uma planta industrial. O experimento foi conduzido na Empresa Valoriza Agronegócios com sede na cidade de Uberlândia - MG. Baseado em testes realizados no sistema de ventilação padrão da empresa foi projetado um sistema de aeração forçada automatizado (SAFA). Após a instalação do sistema, testes de umidade, do teor de oxigênio e de temperatura foram realizados para verificar a eficiência do sistema de aeração desenvolvido. / Mestre em Engenharia Mecânica
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Análise e quantificação tridimensional em imagens de ultra-som intravascular / Intravascular ultrasound: tridimensional quantification and analysisFernando José Ribeiro Sales 23 October 2009 (has links)
INTRODUÇÂO: A análise da composição das lesões in-vivo tem sido objeto de estudo de uma série de grupos de estudo sobre a doença aterosclerótica. Os métodos disponíveis para esse fim utilizam técnicas de análise espectral do sinal ultra-sônico retroespalhado antes deste ser transformado em imagens de ultra-som intravascular (IVUS), uma vez que não existem métodos que realizem tal inferência somente a partir das imagens. Neste trabalho, utilizamos técnicas de processamento de imagens e de reconhecimento de padrões para analisar a composição das lesões de acordo com a classificação proposta pela metodologia de Ultra-Som Intravascular com Histologia Virtual (IVUS-VH). MÉTODOS: Neste estudo utilizamos uma amostra de oito (08) artérias coronárias provenientes de cinco (05) pacientes, resultando num total de 96492 regiões de interesse para inferência da composição. Para a segmentação automática da interface lúmen-íntima e íntima-adventícia, aplicamos as técnicas de contornos ativos do tipo Snakes e para a determinação da energia potencial dos contornos, utilizamos técnicas de filtragem baseadas na difusão anisotrópica convencional e restritiva. Utilizamos três janelas quadradas diferentes de tamanhos 5x5, 7x7 e 9x9 pixels para extração dos atributos de texturas, dentre eles treze (13) baseados nas matrizes de co-ocorrência, seis (06) momentos invariantes à rotação, escala, translação e a ganho multiplicativo, baseados nos Momentos de Hu e propostos neste trabalho. Visando avaliar o efeito dos níveis de quantização das imagens nas matrizes de co-ocorrência, requantizamos originais de 256 níveis de cinza para 128, 64 e 32 tons. Como classificador, utilizamos o método dos k-vizinhos mais próximos (k-nn) e escolhemos os sete (07) vizinhos mais próximos como parâmetro de comparação. Como o k-nn é sensível com relação à métrica utilizada, testamos a distância euclidiana e a métrica de Mahalanobis. RESULTADOS: A segmentação automática da interface lúmen-íntima teve taxa média de acerto de 72,23% e a mediana da taxa de acertos foi de 81,20%, enquanto a taxa média de acertos para a interface íntima-adventícia foi de 80,86% e a mediana foi igual a 91,36%, considerando 495 quadros manualmente segmentados por um especialista. A melhor configuração do classificador foi utilizando a normalização de intensidades, com 256 níveis de cinza, com a janela 9x9 e usando a métrica de Mahalanobis. A taxa média de erros foi de 2.35%(DC), 20.51%(NC), 92.21%(FF) e 0.04%(FT), no entanto, se considerarmos somente três classes sem diferenciarmos os tecidos FF do FT temos a seguinte composição: 2.35% (DC), 20.51%(NC) e 0.04%(FT+FF), o que leva a uma taxa média de erros total de 5,15%. CONCLUSÕES: A classificação das lesões baseada somente em atributos de textura das imagens ainda não é possível com a nosso modelo se considerarmos os quatro tipos de tecido, uma vez que não conseguimos diferenciar de forma satisfatória dos componentes FF e FT. No entanto, se considerarmos somente três classes, temos resultados animadores, uma vez que conseguiremos identificar os componentes associados às placas ditas de maior risco de ruptura, os fibroateromas de capa fina (TCFA). Além disso, conseguimos um experimento associado ao trabalho, mostrar quantitativamente que há uma possível superestimação do componente NC ao redor de estruturas calcificadas nas imagens de IVUS-VH / INTRODUCTION: Several efforts for in vivo atherosclerotic plaque estimation has been realized worldwide. Current methods for related application are based on spectral analysis of backscattered ultrasound signals before intravascular image formation (IVUS), once there is not available techniques to perform composition analysis only from IVUS images. On this study, image processing and pattern recognition techniques has been used to classify plaques according to Intravascular Ultrasound Virtual Histology (IVUS-VH) classification. METHODS: A sample set of eight (08) coronary arteries from five (05) different patients, resulting on 96492 regions of interest for plaque analysis. For automatic segmentation of lumen-intima interface and intima-adventitia interface, active contours technique has been used. Conventional and restrictive anisotropic diffusion filters have been used for estimating the potential energy of active contours. Haralicks co-occurrence matrix and invariant moments based in Hu moments were used as features for pattern classification. Three different windows has been used on feature extraction procedure: 5x5,7x7 and 9x9 pixels. In order to analyze the influence of grey-scale quantization levels into Haralicks co-occurrence matrix, we tested four different types numbers of grey-scale levels: 32, 64,128 and 256. KNearest Neighbors algorithm as the classification rule, and we tested both Mahalanobis and Euclidian Metrics in this analysis. RESULTS: Segmentation of luminal-intimal layers average accuracy for was 72.30% and its median was 81.20%. Segmentation of intimal-adventitia layers average accuracy for was 80,86% and its median was 91,36%, for 495 manually segmented frames. Plaque classification according to IVUS-VH four classes scheme has shown not feasible with the proposed model, once average classification error-rate foe every component: 2.35%(DC), 20.51%(NC), 92.21%(FF) e 0.04%(FT). Our approach has not the ability to differentiate fibrotic tissue from fibro-fatty tissue. However, in the three classes scheme: DC, NC and (FF+FT), we achieved some encouraging results: 2.35% (DC), 20.51%(NC) e 0.04%(FT+FF), leading to an average error rate of 5,15%. With these results, a thin-cap fibroatheroma (TCFA) lesions detection algorithm for conventional IVUS images should be developed using our approach. Once TCFA plaques has been assigned to have an association with plaque rupture and sudden death, those results should be used for in vivo IVUS based TCFA detection. In an experiment related to this work, we have shown that there is an artifactual relationship between NC and DC components into VH images
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Automação como suporte ao manejo sustentado da irrigação na cultura da alface no no município de Itabaiana - SEGiacomelli, Waldiney 31 March 2011 (has links)
The present work was developed in the experimental area of the project "Pequeno Produtor, Grande Empreendedor that it is an area of vegetables production. It is located in the municipal district of Itabaiana in the state of Sergipe. The objective was to project and to create an automatized control of an irrigation system by leak, verifying the productive aspects related to the sustainability indicators. The
calculation for water replacement in the soil was based on the estimate of the evapotranspiration starting from the reading of the climatological greatness accomplished by the agriculture-meteorological station installed at the experiment place. The equation of Penman-Montheith was used, recommended by the Food and Agricultural Organization of the United Nations (FAO). Once the estimated evapotranspiration was known, the control system did the other calculations to establish the time for the replacement of the necessary water sheet. The final
comparison between the experiment and the normal production used by the producer points to a significant profit in the consumption of water and electric power. The microcontrolled control besides contributing for the decrease of the consumption of water supplies and electric power also provided an economy in the maintenance of the installed equipments. Doing so, a possibility of a higher economical profit is presented, contributing for life improvement of the small family producers, making their social and economic indicators better. / O presente trabalho foi desenvolvido na área experimental do projeto Pequeno Produtor Grande Empreendedor que é uma área de produção de hortaliças. Fica localizada no município de Itabaiana no estado de Sergipe. O objetivo foi projetar e
criar um controle automatizado de um sistema de irrigação por gotejamento, verificando os aspectos produtivos relacionados com os indicadores de sustentabilidade. O cálculo para a reposição de água no solo foi baseado na estimativa da evapotranspiração a partir da leitura das grandezas climatológicas realizadas pela estação agro-meteorológica instalada no local do experimento. Utilizou-se a equação de Penman-Montheith, considerada padrão desde 1998 e
recomendada pela Food and Agricultural Organization of the United Nations (FAO). Conhecida a evapotranspiração estimada, o sistema de controle realizou os demais cálculos para estabelecer o tempo necessário para a reposição da lâmina de água necessária. A comparação final entre o experimento e a produção normal utilizada pelo produtor aponta um ganho significativo no consumo de água e de energia elétrica. O controle microcontrolado além de contribuir para a diminuição do consumo dos recursos hídricos e energia elétrica, também proporcionou uma economia na manutenção dos equipamentos instalados. Com isso, chega-se a apresentar uma possibilidade de ganho econômico maior contribuindo para a melhoria de vida dos pequenos produtores familiares melhorando seus indicadores sócio-econômicos.
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