L’Ostéoarthrose (OA) est une maladie articulaire entrainant une dégénérescence du cartilage et une ossification de l’os sous-chondral. Elle touche un Canadien sur 10 et pourtant l’origine de cette pathologie est encore inconnue. Dans le cadre de ce projet, la contribution de deux facteurs de transcription, NFAT1 et PITX1, dans la régulation transcriptionnelle du promoteur d’IHH a été examiné compte tenu de l’implication potentielle de la voie hedgehog (Hh) et de ces facteurs dans la pathogenèse de l’OA. La voie de signalisation Hh régule la croissance et la différenciation des chondrocytes. Indian hedgehog (IHH), l’un des trois membres de la famille Hh, contrôle leur prolifération et leur différenciation. / Osteoarthritis (OA) is the most common joint disorder and is characterized by cartilage degradation and endochondral ossification. One in every ten Canadians is affected, yet its aetiopathogenesis remains unknown. In this present study, two new regulators of the IHH promoter, NFAT1 and PITX1, were studied. The downregulation of IHH expression by these factors could contribute to the OA pathogenesis. The Hedgehog (Hh) signaling pathway regulates chondrocyte growth and differentiation in the growth plate. Indian hedgehog (IHH), one of its members, stimulates chondrocyte proliferation and osteoblast differentiation. IHH is essential in skeletogenesis, osteoblastogenesis and cartilage growth.

De nombreux modèles ont été proposés pour expliquer les mécanismes de développement et de progression tumorale, néanmoins certains aspects comme la nature et la hiérarchie des altérations primaires et secondaires sont encore discutés. Pour répondre à ces questions, nous nous sommes intéressés à la progression tumorale des tumeurs hypophysaires à prolactine humaines. Ces tumeurs d'origine monoclonale sont souvent bénignes mais certaines présentent un phénotype agressif voire malin. Afin d'identifier les mécanismes impliqués dans la progression vers le phénotype agressif nous avons utilisé des techniques de génomique intégrative (puces à ADN, séquençage haut débit) couplant l'étude du transcriptome, du génome (variation du nombre de copie chromosomique, polymorphismes) et du miRNome à partir des mêmes échantillons tumoraux. Par cette stratégie nous avons identifié et hierarchisé des altérations spécifiques des tumeurs agressives et / ou malignes dans un modèle expliquant la progression tumorale des tumeurs hypophysaires à prolactine humaines. Nous avons montré que la sous-expression des microARNs miR-183, miR-744 et miR-98 stimule la prolifération via la surexpression de leurs cibles KIAA0101, TGFB1 et E2F2 spécifiquement dans les tumeurs agressives. Ceci entraine l'acquisition d'altérations chromosomiques (perte du chromosome 11 et le gain du chromosome 1q) permettant l'activation de la dissémination métastatique. Enfin, ce travail montre que l'approche de génomique intégrative multidimensionnelle permet d'apporter de nouveaux éléments pour la caractérisation des phénotypes tumoraux, le diagnostic des tumeurs agressives et la prédiction du comportement tumoral

Akademisk avhandling- Karolinska institutet. / Extra t.p., with thesis statement, inserted. Includes 6 articles by the author and S.H. From, reprinted from various periodicals. Includes bibliographies.

The Voltage-Dependent Anion Channel (VDAC) is a channel located in the outer mitochondrialmembrane of nearly all eukaryotic cells. It is responsible for the passage of numerous ions andmetabolites in and out of the mitochondria but is also involved in the regulation of the cell functionthrough interactions with other proteins. Its activity is known to be modulated by lipids. Experimentson Phaseolus coccineus VDAC32 (PcVDAC32) have notably suggested a direct interaction betweendioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE) head group and the bean VDAC32. Moreover, moleculardynamic simulations have proposed that charged residues of the mouse VDAC1 could be involved indirect interaction with 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (POPE) polar head.During this PhD thesis, we first constructed and optimised expression systems for production ofPcVDAC32 and of Saccharomyces cerevisiae VDAC1 (ScVDAC1) in yeast and assessed those forcomplementation in yeasts lacking their endogenous VDAC1. We then tested the effect of a polyhistidine-tag placed in C-terminal of the ScVDAC1 on its electrophysiological properties to validate itas a tool for VDAC study. We further analysed the effect of the lipid environment on the ScVDAC1and compared it with the results obtained for PcVDAC32. Finally, we assessed the effect of thesuppression of the Glu185 charge on the ScVDAC1 conductance, selectivity and voltage dependence.We found that expression of PcVDAC32 could complement the growth deficiency of the yeast lackingendogenous VDAC. We also showed that the presence of calcium ions in the experimental solutionsallowed the ScVDAC1 closed states to reach lower conductances. We observed that preincubation withergosterol greatly enhanced the reconstitution of ScVDAC1 in soy extract PLB. We demonstrated thatpH and salt concentration influence the ScVDAC1 functional characteristics and that, according tothose parameters, the presence of a 6xHis-tag can influence VDAC functions. Finally, we showed thatthe ScVDAC1 Glu185 located in the loop between β-strand 12 and 13 is involved in ScVDAC1selectivity and that its substitution by a glutamine residue decreases the ScVDAC1 sensitivity tomembrane curvature stress. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les récepteurs canaux pentamériques (RCPs) assurent la transmission synaptique dans le système nerveux, via des réorganisations structurales allostériques globales couplant la liaison de neurotransmetteur à l'ouverture et à la désensibilisation du canal ionique. Sur le RCP bactérien modèle GLIC, j'ai suivi ces changements conformationnels à plusieurs endroits de la protéine, par incorporation de couples fluorophore/quencher (bimane/tryptophane). Les données en détergent et en liposomes, à l'équilibre et en cinétique, m'ont permis d'identifier, et de caractériser structuralement, un intermédiaire rapide (milliseconde) de pré-activation, montrant une réorganisation majeure du domaine synaptique suite à l'application d'agoniste, mais où le pore reste fermé, et ainsi de proposer un modèle global des transitions d'activation et de désensibilisation. En combinant mutagenèse, électrophysiologie et approches structurales, j'ai également identifié une région critique, à l'interface entre les domaines extracellulaires et transmembranaires, pour l'activation et la désensibilisation. Enfin, un criblage fonctionnel m'a permis d'identifier de nouveaux modulateurs allostériques de GLIC.Mon travail de thèse contribue donc à la compréhension du mécanisme allostérique de GLIC, et présente de nouveaux outils pour l'étude des récepteurs du système nerveux humain. / Pentameric ligand-gated ion channels (pLGICs) are responsible for the synaptic transmission in the nervous system, occurring through their structural reorganizations allosterically coupling neurotransmitter binding to the opening or desensitization of the ion channel.Using the bacterial pLGIC model GLIC, I followed these conformational changes in several regions of the protein, through the incorporation of fluorophore / quencher pairs (bimane / tryptophan). The acquisition of data in detergent and liposomes, at equilibrium and in real time, allowed me to identify and structurally characterize a fast (millisecond) pre-activation intermediate. This new intermediate state is characterized by a major reorganization of the synaptic domain following agonist application, but with a closed pore, thus providing a comprehensive model for activation transitions and desensitization.Combining mutagenesis, electrophysiological and structural approaches, I also identified a critical region at the interface between the extracellular and transmembrane domains for activation and desensitization. Finally, a functional screening allowed me to identify new allosteric modulators of GLIC.This work contributes to the understanding of the allosteric mechanism of GLIC, and provides a structural template as well as new tools for the study of receptors in the human nervous system.

Le laboratoire de Chimie Organique et Photochimie de l’ULB s’est intensivement impliqué dans la recherche portant sur le développement et l’étude de complexes polyazaaromatiques de ruthéniumII. En utilisant des ligands π-déficients tels que le 1,4,5,8-tétraazaphénanthrène (TAP) chélatés au centre métallique de RuII, des propriétés d’oxydo-réduction particulières à l’état excité du complexe peuvent être obtenues. Cette recherche s’est principalement focalisée sur l’étude de complexes de RuII photoréactifs dans un cadre biologique puisque ces complexes sont capables de photoréagir avec le matériel génétique ou les protéines par l’intermédiaire d’un transfert d’électron photo-induit (PET). Cependant, il existe un obstacle majeur à l’utilisation thérapeutique des complexes polyazaaromatiques de RuII, à savoir leur incapacité à traverser d’eux-mêmes la membrane des cellules vivantes. Ce projet vise à développer une stratégie ciblée de vectorisation de ces complexes, ce qui pourrait permet d’administrer l’agent thérapeutique uniquement aux cellules « malades ». Le ciblage de récepteurs surexprimés par les cellules endothéliales néo-formées, tels que l’intégrine αvβ3, a été envisagé dans le cadre de ce travail grâce à un ligand peptidique c(RGDfK). Ce ciblage associé à l’utilisation d’un complexe photoréactif de RuII permettrait un contrôle du type cellulaire, par la reconnaissance des intégrines αvβ3, ainsi qu’un contrôle temporel de l’activité thérapeutique du complexe, par l’illumination. De manière à combiner ces agents de ciblage et l’agent thérapeutique (complexe de RuII), des plateformes moléculaires de deux types ont été utilisées et comparées entre elles, à savoir le cyclodécapeptide RAFT et un calix[4]arène. La synthèse des conjugués RuII-RAFT-[c-(RGDfK)]4 et le RuII-calix[4]arène-[c-(RGDfK)]4 a donc été réalisée avec succès et leurs propriétés photophysiques et photochimiques ont été étudiées de manière à vérifier que la présence de la plateforme ne modifie pas les propriétés des complexes de RuII ancrés. Enfin, la pénétration des conjugués a également été évaluée et ce, sur différentes lignées cellulaires, de manière à mettre en évidence la spécificité du ciblage pour les récepteurs membranaires αvβ3. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

[French below]TLRs are the sentinels of our cells, they are located at the cell surface and alert the whole immune system of the presence of viruses or bacteria. They detect pathogens by recognizing their molecular patterns; this recognition is specific in order to avoid self-recognition, but they need some degree of promiscuity to remedy to pathogen heterogeneity or mutations. Promiscuity is generally defined as an indiscriminate association with molecules regardless their structure and is the contrary of specificity proper of the classic paradigm of key-lock receptor activation. My thesis results demonstrate that TLR4 and TLR2 are more promiscuous than what was believed and that this promiscuity leads to the recognition of cationic lipids and cardiolipins.Cationic lipids lipopolyamines are synthetic molecules nucleic acid nanocarriers proposed to be used for gene therapy, which consists in replacing a gene that is functioning improperly. This thesis demonstrates that lipopolyamines activate TLR2 by forming conserved and/or alternative H-bonds with TLR residues, simulating the recognition of bacterial lipopeptides and inducing pro-inflammatory cytokines secretion; which is deleterious when we aim to use these nanocarriers in the context of gene therapy. We propose the use of unsaturated cationic lipids to avoid TLR2 recognition. TLR activation could be useful instead to prepare one-component vaccine adjuvants, for which both antigen carrier and TLR activation are needed to turn on the immune system and produce antibodies. The second chapter of this thesis investigates the pro-inflammatory properties of other cationic lipids and describes new lipopolyamines able to activate both TLR2 and TLR4. The study of their adjuvanticity properties showed that they are as efficient as the aluminium salts in stimulating antibodies production.The promiscuity of TLR2 and TLR4 raised questions about the presence of endogenous TLR modulators, often countered by contamination concerns. In the third chapter, we investigate the pro- and anti-inflammatory properties of cardiolipin (CL). CL is a tetra-acylated diphosphatidylglycerol located in the inner mitochondrial membrane. Its fatty acid chain length and degree of unsaturation vary depending on species, tissue and pathological conditions. Here we show that unsaturated cardiolipin acts as a competitive TLR4 antagonist by occupying the binding site of LPS and that unsaturations discriminate between TLR4 antagonistic and agonistic activity. Under physiological conditions, mammalian CL chains are unsaturated, whereas there is an increase of saturated CL in patients affected by the Barth Syndrome. Hence we suggest that unsaturated CL could negatively regulate the inflammation during cell damage or death, via TLR4 inhibition. By contrast, saturated CLs may be involved in the inflammatory state associated with the disease. Finally, our study provides new understandings of the mechanism of TLR4 regulation and extends the library of TLR4 agonists and antagonists to molecules of easier synthesis, lower price and higher biocompatibility compared to LPS-based structures. / Resumé en français Les récepteurs Toll-like (TLRs) sont des protéines transmembranaires qui constituent la première barrière de notre système immunitaire inné. Ils détectent la présence de bactéries et virus et alertent l’organisme via la sécrétion de molécules pro-inflammatoires appelés cytokines. Parmi les TLRs, TLR2 and TLR4 reconnaissent respectivement des lipides spécifiques aux bactéries, les lipopeptides et les lipopolysaccharides bactériens LPS. La reconnaissance de motifs moléculaires spécifiques aux pathogènes et absents dans notre organisme est essentiel afin d’éviter une réponse immunitaire venant du soi. Le but de notre thèse était de démontrer que les récepteurs Toll-like possèdent une certaine plasticité et peuvent reconnaître des ligands non identifiés jusqu’ici tels les lipides cationiques et la cardiolipine. Les lipides cationiques sont des molécules synthétiques utilisées comme agents de transfection. Notre travail démontre que les lipides cationiques dont la tête polaire est constituée par des polyamines peuvent mimer les propriétés des ligands naturels et induire la sécrétion de cytokines pro-inflammatoire via l’activation des TLRs. Cette interaction implique des interactions entre la chaine principale de la protéine et les lipides sans intervention des chaines latérales. Cette réaction inflammatoire est contre-indiquée en thérapie génique et nous proposons donc de remplacer les chaines acylées saturées par des chaines insaturées pour la synthèse des nouveaux agents de transfection non-immunogénique. D’autre part, l’activation des TLRs par des agents de transfections active le système immunitaire inné, ce qui permet l’activation du système adaptatif et la production d’anticorps. Nous avons étudié une large gamme des lipides cationiques et identifié des nouveaux activateurs á la fois de TLR2 et de TLR4. L’étude de leurs propriétés adjuvantes a démontré que les lipides cationiques sont des adjuvants comparables aux sels d’aluminium en terme de production d’anticorps. La cardiolipine est un lipide localisé dans la membrane des mitochondries et des bactéries. Le domaine hydrophobe est constitué de quatre chaines acylées qui chez les mammifères sont insaturées. Il a été démontré que la cardiolipine extracellulaire inhibe la sécrétion de cytokines induite par LPS. Notre travail de thèse démontre que cet effet inhibiteur est du à la capacité de la cardiolipine à bloquer le site de liaison du LPS. Le travail démontre aussi que lorsque les chaines acylées sont saturées, c’est le cas dans le Syndrome de Barth, la cardiolipine devient un activateur de TLR4 en interagissant avec TLR4 de façon similaire à LPS. Ce dernier résultat pourrait expliquer l’aspect inflammatoire du Syndrome de Barth et élargie la librairie de ligands de TLR4 á des molécules de structure plus simple et plus aisées à synthétiser que les dérivés de LPS et qui pourraient être utilisés comme adjuvants ou anti-inflammatoires. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

La régulation des protéines par les modifications post-traductionnelles (PTMs) est un événement clé dans le maintien des fonctions biologiques de la cellule. Parmi elles, on retrouve les modifications causées par une famille de molécules appelées Ubiquitin Like Modifiers (UBls), incluant l’ubiquitination, la neddylation ou encore la SUMOylation. Au contraire des modifications classiques faisant intervenir des petits groupements chimiques, telles que la phosphorylation ou l’acétylation, les UBls sont eux-mêmes des protéines se greffant sur le groupement amine en position e des lysines des protéines ciblées, générant des protéines ramifiées. Alors que la principale fonction de l’ubiquitination est la dégradation des protéines par le protéasome, les autres UBls sont encore mal caractérisées. Dans ce contexte, le but de cette thèse était de développer de nouvelles approches protéomiques afin de définir le rôle de la SUMOylation dans des cellules humaines. En effet, l’identification des sites de SUMOylation par spectrométrie de masse (MS) est un défi. Ceci s’explique par la très faible abondance des protéines SUMOylées dans la cellule ainsi que par la longue chaine de 19 à 34 acides aminés laissés sur la protéine ciblée après digestion à la trypsine. Afin de pallier à ces deux problèmes, un mutant de la protéine SUMO a été généré au sein du laboratoire. La première altération sur ce mutant est l’insertion d’une séquence 6xHis à l’extrémité N-terminale de la protéine afin de faciliter l’enrichissement des protéines SUMOylés. La seconde altération de la protéine SUMO est la mutation d’une glutamine en arginine en position 6 à partir du C-terminal. Cette mutation a pour effet de libérer des peptides trypsiques ramifiés contenant seulement 5 acides aminés provenant de SUMO sur le peptide ciblé. Le premier but de cette thèse était de développer une méthode permettant de cibler spécifiquement les peptides SUMOylés lors d’une analyse par LC-MS. Cette méthode repose sur le patron de fragmentation propre de la chaine de 5 acides aminés commune à tous les peptides SUMOylés et utilise la technologie Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra (SWATH). Lors d’une telle analyse, l’échantillon est injecté une première fois en fragmentant de larges fenêtres de masses. Ceci permet d’obtenir des spectres MS/MS pour tous les peptides présents dans l’échantillon. Un algorithme est ensuite utilisé afin de détecter les fenêtres de masses contenant des peptides SUMOylés et de recalculer le rapport masse sur charge des peptides candidats. Les injections subséquentes permettent ensuite de fragmenter uniquement les peptides candidats. Cette méthode s’est avérée être complémentaire aux méthodes conventionnelles et a permis l’identification d’un total de 54 peptides SUMOylés à partir d’extraits protéiques enrichis sur billes NiNTA. La seconde approche envisagée était d’ajouter une étape d’enrichissement supplémentaire au niveau peptidique. Pour cela, un anticorps reconnaissant la chaine de 5 acides aminés laissée après digestion tryptique a été produit. Cette étape d’immuno-purification supplémentaire a permis l’identification d’un total de 954 sites de SUMOylation dans des cellules humaines lors d’une analyse à grande échelle. Afin de valider les nouvelles cibles identifiées, une étude fonctionnelle de la SUMOylation de la protéine CDC73 a été réalisée. Cette étude a montré que la SUMOylation de CDC73 était requise pour sa rétention nucléaire, confirmant ainsi un rôle important pour la SUMOylation de cette protéine. Cependant, le principal défaut de la précédente approche était la nécessité de cultiver 500 millions de cellules par condition étudiée. Cette approche a donc été optimisée afin de pouvoir réduire le nombre de cellules utilisées dans une analyse. L’optimisation de chacun des paramètres analytiques nous a permis de réduire ce nombre de 50 fois, permettant ainsi d’identifier plus de 1000 sites de SUMOylation à partir de seulement 10 millions de cellules. De plus, nous avons montré que cette approche permet l’identification concomitante des sites de SUMOylation et d’ubiquitination dans un seul échantillon biologique. Ceci a permis d’identifier un nouveau mécanisme de régulation des deubiquitinases par les UBls, ainsi que d’élucider les mécanismes de translocation du protéasome dans la cellule. Dans l’ensemble, nous avons développé des méthodes permettant de mieux caractériser la SUMOylation des protéines et avons prouvé que ces méthodes sont applicables à l’étude de plusieurs UBls en parallèle. Nous sommes certains que l’approche par immuno-purification permettra à l’avenir d’identifier la SUMOylation à un niveau endogène. / Protein regulation by post-translational modification (PTMs) is a key event in regulating cellular function. These modifications include a group termed Ubiquitin-Like modifiers (UBLs) that contain, but is not limited to, ubiquitylation, neddylation and SUMOylation. While conventional modifications, such as phosphorylation or acetylation, involve a small chemical group, UBLs are proteins attached from their C-terminus to the epsilon amine group of a lysine contained in the targeted protein, thus generating branched proteins. While the main function of ubiquitylation is protein degradation by the proteasome, other UBLs remain mostly unexplored. In this context, the aim of this thesis was to develop new proteomics strategies to characterize SUMOylation in human cells. Indeed, identification of SUMOylation sites by mass spectrometry (MS) is a challenge. This is due to the low abundance of SUMOylated proteins in the cells as well as the long 19 to 34 amino acid SUMO remnant left of the target after trypsin digestion. In this context, our research group has developed a mutant of SUMO containing two mutations. The first mutation consists of a 6xHis tag at the N-terminus of SUMO in order to facilitate SUMOylated substrates enrichment at the protein level. A second mutation was also introduced at the 6th position from the C-terminus and consists in a glutamine to arginine substitution in order to release shorter SUMOylated peptides after trypsin digestion. The first goal of this thesis was to develop a targeted approach to specifically fragment SUMOylated peptides during an LC-MS run. This was enabled by the common fragmentation pattern of all SUMOylated peptides arising from the five amino acid SUMO remnant. Digested peptides were first analyzed using SequentialWindow Acquisition of all THeoretical Mass Spectra (SWATH). In this experiment, large mass windows are fragmented. A custom algorithm is then used that detects mass windows in which candidates are located and determine their intact mass. In subsequent injections these peptides were then specifically targeted. This method was complementary to data dependent acquisition and enabled the identification of 54 SUMOylated peptides. In a second approach, we wanted to enrich for SUMOylated substrates at the peptide level. An antibody was raised against the five amino acid SUMO remnant and used for immunopurification of SUMOylated peptides. In total, we identified 954 SUMOylation sites in human cells. Moreover, functional analysis of the newly identified substrate CDC73 revealed that SUMOylation on K136 is required for its nuclear retention, thus showing a new role for the SUMOylation of this protein. Although this approach gave new insights into the characterization of SUMOylated substrates, high amounts of material were still required to obtain such results. The last goal of this thesis was to optimize the previously developed immunopurification. Systematic optimization of every analytical parameter was done and enabled the reduction of the number of cells required by a factor of 50, without affecting the number of SUMOylation sites identified. Moreover, we used this approach to profile for SUMOylation and ubiquitylation dynamics in human cells upon proteasomal inhibition with MG132. This revealed an unexpected regulation mechanism of deubiquitinating enzymes by UBLs and unraveled translocation mechanisms of the proteasome in the cell. Our SUMO proteomic approach demonstrates capability for the concomitant analysis of SUMOylation and ubiquitylation. In the future, we hope to extend this approach to endogenous SUMOylation.

La première partie de mon travail a consisté (i) en une étude génomique des souches de TOSV avec séquençage de 10 nouvelles souches afin i) d’enrichir les données disponibles dans Genbank (au début de ce travail, 6 séquences complètes); (ii) d’utiliser les 16 séquences complètes pour définir et évaluer le premier système de typage par technique de RT-q PCR en temps réel afin de discriminer les souches de LA et de LB. Dans la deuxième partie de ce projet, on s’est intéressée à des études structurales et fonctionnelles de la nucléoproteine (N) de TOSV afin d’élucider le mécanisme d’encapsidation d’ARN virale. La N est une protéine de 28 KD, sont rôle majeur est l’encapsidation de l’ARN génomique et sert en tant que co-facteur de la transciption/replication de TOSV. Les études crystallographique de la protéine N , du complexe protéique (N-ARN) ont été déterminé par Olal D et al 2014 au moment que nous avons obtenu la diffraction de crystal de la N sans ARN à 3,7 Å (code PDB: 5FVA). Ces études montrent la protéine N ainsi le complexe (N-ARN) en forme d’un anneau hexamèrique fermé alors encapside l'ARN dans une organisation filamenteux. Nous avons donc décidé de combiner ces résultats avec des études structurales complémentaires en solution , telles que la microscopie électronique (EM) et des études de « Diffusion des rayons X aux petits angles »(SAXS) pour de proposer un modèle décrivant correctement le mécanisme d'encapsidation en solution . Le protéine N se comporte principalement en pentamère déformé et ouvert, qui met en lumière la façon dont nucléoprotéine peut être organisée en filaments. / The first part of my work consisted (i) of genomic sequencing of 10 TOSV strains to increase the total number of complete sequences (at the outset, 6 complete sequences were accessible in Genbank). (ii) to use the 16 sequences to design and evaluated the first lineage-specific real-time RT-PCR assay (Lisp-TOSV) to discriminate between strains of lineages A and B Complete sequencing of the 10 strains was achieved. The second part of this project was dedicated for structural and functional studies of the TOSV N protein in order to decipher viral RNA encapsidation. TOSV Nucleoprotein (N) is a protein of 28 KD, is encapsidating the viral RNA genome and serves as a co-factor the RNA trancription/replication. The crystal structures of TOSV N protein , and the complex N-RNA were already determined (Olal D and al; 2014) while we just obtained diffracting crystal of the N free RNA at 3,7 Å (PDB code : 5FVA ). Crystallographic structures show an hexameric rings whereas N encapsidates the RNA in a filamentous organization. We therefore decided to combine these results with complementary studies, such as electron microscopy (EM) and samll angle X-ray scattering to build a low resolution structure model in solution describing properly the encapsidation mechanism. The N behaves mainly as an opened, deformed pentamer that shed light on how the N can be organized in filaments.