Made available in DSpace on 2015-09-25T12:18:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hermes de Oliveira Machado Filho 1.pdf: 2104504 bytes, checksum: dfcc01815062ed00299a1488661319cf (MD5) Previous issue date: 2011-12-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A rocky environments is a geomorphological shape which holds richness and specific endemism, even more, taking as reference semiarid conditions. Based on this perspective, this work aims to present the study of the floristic composition, emphasizing diversity, richness, and biogeographic patterns on a rocky outcrop, in the Environment Protection Area (APA), in the region of Cariri , located between the municipalities of Boa Vista and Cabaceiras, state of Paraiba (Northeast from Brazil). Field works have been done aiming the collecting of botanic material and observations in loco , over all the area extension, in the period between March 2010 and October 2010. Based on APG (Angiosperm Phylogeny Group) III, the checklist was elaborated to the studied area. Moreover, it was made a binary matrix of presence/absence of the registered species, in order to detect the similarity of the flora together to other areas, focusing mainly floras installed in the Brazilian semiarid zone. It was also made another binary matrix to verify the geographic distribution patterns of its species and established relations of this flora together to other South American biogeographical provinces. The analyses of geographic distribution have been supported in searches to specialized bibliography and data basis of neotropical species as: taxonomic papers, local floras, W3 Tropicos (Missouri Botanical Garden) and the species list on line of the Brazilian flora. In the studied area, 127 species were registered, distributed in 53 flowering plant families. Fabaceae was the most representative, with 14 species, result in agreement with the vast majority of the floristic studies taken in the Brazilian semiarid zones. Other families highlighted in number of species were: Convolvulaceae, Malvaceae and Euphorbiaceae, with nine species each; Asteraceae, with seven; Cactaceae, with six; Bromeliaceae, with five and Rubiaceae, with six species. The herbaceous and subshrub components were predominant over the others in the local flora. The similarity analyzes showed that the flora on rocky environments trends to form specific blocks, when compared to other formations. The species presented basically three patterns of geographic distribution: ample-continuous or tropical (CA), with 44% of total species; restrictcontinuous or pre-Andine sub-tropical (CR), with 34% and restrict (R), corresponding to the Caatinga/Savannah , with 22%. The analyzes of the flora similarity in the South American region has shown the close relation between floras in Caatinga and Savannah pattern, with level of meaning = 98,2 (Jaccard index). This result points to the existence, nowadays, of a floristic corridor among these vegetation types, this aspect probably features the Arc-Pleistocenic relict, when the Caatinga became a forest reduct and turning a floristic connection possible with the most diverse vegetation types, mainly with those which make the xeric corridor in South America. The obtained data through this study point to the existence of a diversified flora, showing biogeographic patterns closely related to the species distribution, several of them being endemic to Caatinga vegetation, as Allamanda blanchetti DC. (Apocynaceae). For all those reasons, the area dealt here, comes out as a center of great importance for local fauna and flora maintenance, as well as for the micro-region in the Cariri, Paraiba state, where it is located. / Os ambientes rochosos são feições geomorfológicas que abrigam riqueza e endemismo específico, ainda mais, tomando-se como referência condições de semi-aridez. Nesta perspectiva, o presente trabalho visa apresentar o estudo da composição florística, com ênfase à diversidade, riqueza e padrões biogeográficos em afloramentos rochosos na Área de Proteção Ambiental (APA) do Cariri, localizado entre os municípios de Boa Vista e Cabaceiras, Estado da Paraíba (Nordeste do Brasil). Foram realizados trabalhos de campo visando à coleta de material botânico e observações in loco‟ em toda a extensão da área no período entre Março/2010 e Outubro/2011. Baseando-se no APG (Angiosperm Phylogeny Group) III elaborou-se a lista florística da área estudada. Posteriormente, confeccionou-se uma matriz binária de presença/ausência das espécies registradas a fim de detectar a similaridade da flora com a de outras áreas, enfocando principalmente floras instaladas no domínio semiárido brasileiro. Também foi confeccionada uma matriz binária de presença/ausência desta vez englobando as províncias biogeográficas sul-americanas para verificar a distribuição geográfica dos táxons e estabelecer as relações da flora ora abordada com as demais províncias da América do Sul. As análises de distribuição geográfica foram apoiadas em consultas a bibliografia especializada e em bases de dados de espécies neotropicais, como: artigos de cunho taxonômico, floras locais, W 3 Tropicos (Missouri Botanical Garden) e na lista de espècies On line da flora do Brasil. Na área de estudo foram registradas 129 espécies distribuídas em 53 famílias de Angiospermas. Fabaceae foi a família mais representativa, com 14 espécies; corroborando com os resultados apontados na grande maioria dos estudos florísticos conduzidos em áreas do semiárido brasileiro. Outras famílias que se destacaram em número de espécies foram: Convolvulaceae, Malvaceae e Euphorbiaceae, com nove espécies cada; Asteraceae, com sete; Cactaceae, com seis; Bromeliaceae e Poaceae, com cinco e Rubiaceae, com quatro espécies. O componente herbáceo e o arbustivo foram predominantes sobre os demais componentes da flora local. A análise de similaridade evidenciou que, a flora de ambientes rochosos tende a formar blocos específicos quando comparados a outros tipos de formações. As espécies apresentaram basicamente três padrões de distribuição geográfica: contínuoamplo ou tropical (CA), com 44% do total de espécies; contínuo-restrito ou subtropical pré-andino (CR), com 34% e, restrito (R), correspondendo ao padrão Caatinga/Cerrado, com 22%. A análise de similaridade da flora da área no cenário sul-americano evidenciou a estreita relação entre as floras das Províncias da Caatinga e do Cerrado, com nível de significância = 98,2 (índice de Jaccard). Esse resultado aponta a existência, na atualidade, de um corredor florístico entre essas formações, aspecto este que provavelmente caracteriza o relicto ArcoPleistocênico; quando a Caatinga tornou-se um reduto florestal e possibilitou uma conexão florística com as mais diversas formações vegetacionais, principalmente com as que compõem o corredor xérico, da América do Sul. Os dados obtidos através da realização desse estudo apontam a existência de uma diversificada flora exibindo padrões biogeográficos intrinsecamente relacionados à distribuição das espécies, várias delas endêmicas da Caatinga, como Allamanda blanchetti DC. (Apocynaceae). Por estas razões, a área aqui abordada configura-se como um centro de fundamental importância para a manutenção da flora e fauna local, bem como para a microrregião do Cariri Paraibano, onde a mesma encontra-se inserida.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-12-20T16:03:47Z No. of bitstreams: 2 Tese - Luciana Cristina Vitorino - 2015.pdf: 8226538 bytes, checksum: 818b91ae152e61751eb80f72e40d2ef6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-26T13:21:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Luciana Cristina Vitorino - 2015.pdf: 8226538 bytes, checksum: 818b91ae152e61751eb80f72e40d2ef6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-26T13:21:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Luciana Cristina Vitorino - 2015.pdf: 8226538 bytes, checksum: 818b91ae152e61751eb80f72e40d2ef6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-12-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / There is strong evidence that the Neotropical vegetation has been influenced by climate changes at the end of the Tertiary and Quaternary. The response of vegetation to the cold weather and dry these periods, consistent with the occurrence of the last glacial maximum, still remains in debate. It is suggested that the areas currently occupied by the Cerrado and seasonal forests (SDTFs) are remnants of a continuous vegetation that existed in the past. From the perspective of that species widely distributed in savannas and Brazilian SDTFs could help unravel the role of climate change Pleistocene on the current distribution pattern of genetic diversity in these vegetation types, we sampled 17 populations of Tabebuia serratifolia in SDTFs and 24 populations Tabebuia ochracea in savannas and sequenced intergenic non-coding regions of chloroplast (psbA-trnH, trnG-trnS e trnC-ycf6) as well as the nuclear region ITS (nrDNA). Later, we used coalescent analysis, Ecological Niche Modeling techniques (ENM) and simulations of demographic hypothesis for these species in an attempt to broaden the understanding of the changes undergone by neotropical landscape during the last ice age cycles. The sampled populations for both species showed high genetic diversity for both markers (hcpDNA = 0.8731 and hnrDNA = 0.7723 - T. serratifolia and hcpDNA = 0.927 and hnrDNA = 0.637 - T. ochracea), and large structure (Fst(cpDNA) = 0.528, P < 0.001 and Fst(ITS) = 0.742, P < 0.001 - T. serratifolia and Fst(cpDNA) = 0.742, P < 0.001 and Fst(ITS) = 0.544, P < 0.001 - T. ochracea). The coalescing analysis showed the time to the most recent common ancestor between haplotypes of the sampled populations, oldest to T. serratifolia (~ 3.4 Ma - 95% CI 1.9 - 6.8), which for T. ochracea (~ 1.9 Ma - 95% CI 0.1 - 2.3). The two species show standard recent population expansion and the niche modeling revealed for the T. serratifolia a higher potential distribution area during Holoceno medium while for T. ochracea the highest suitability area was predicted for maximum glacial last (LGM - 21ka), going in favor the hypothesis that the savannas and STDFs have submitted in the past, a wider distribution than currently known. / Há fortes evidências de que a vegetação Neotropical tenha sido influenciada por alterações climáticas ocorridas no final do período Terciário e no Quaternário. A resposta da vegetação ao clima mais frio e seco desses períodos, condizente com a ocorrência do último máximo glacial, ainda permanece em debate. Sugere-se que as áreas atualmente ocupadas pelo Cerrado e florestas estacionais (SDTFs) sejam remanescentes de uma vegetação contínua que existia no passado. Sob a perspectiva de que espécies amplamente distribuídas em savanas e SDTFs brasileiras pudessem ajudar a desvendar o papel das mudanças climáticas do Pleistoceno sobre o padrão atual de distribuição da diversidade genética nessas formações vegetais, nós amostramos 17 populações de Tabebuia serratifolia em SDTFs e 24 populações de Tabebuia ochracea em savanas e sequenciamos regiões intergênicas não codificantes de cloroplasto (psbA-trnH, trnG-trnS e trnC-ycf6), bem como a região nuclear ITS (rDNA). Posteriormente, utilizamos análises coalescentes, técnicas de Modelagem de Nicho Ecológico (ENM) e simulações de hipóteses demográficas para essas espécies, na tentativa de ampliar o entendimento das mudanças sofridas pela paisagem neotropical durante os últimos ciclos de glaciação. As populações amostradas para as duas espécies apresentaram alta diversidade genética para ambos os marcadores (hcpDNA = 0.8731 e hnrDNA = 0.7723 – T. serratifolia e hcpDNA = 0.927 e hnrDNA = 0.637 – T. ochracea), e grande estruturação (Fst(cpDNA) = 0.528, P < 0.001 e Fst(ITS) = 0.742, P < 0.001 – T. serratifolia e Fst(cpDNA) = 0.742, P < 0.001 e Fst(ITS) = 0.544, P < 0.001 – T. ochracea). As análises coalescentes mostraram um tempo para o ancestral comum mais recente, entre os haplótipos das populações amostradas, mais antigo para T. serratifolia (~3.4 Ma - 95% CI 1.9 - 6.8), que para T. ochracea (~1.9 Ma - 95% CI 0.1 - 2.3). As duas espécies apresentaram padrão de expansão populacional recente sendo que a modelagem de nicho revelou, para T. serratifolia, maior área de distribuição potencial durante o Holoceno médio enquanto que para T. ochracea a maior área de adequabilidade foi predita para o último glacial máximo (LGM – 21ka), indo de encontro à hipótese de que as savanas e as STDFs possam ter apresentado, no passado, uma distribuição mais ampla que a conhecida atualmente.

A sistemática de Cnidaria Anthozoa foi revisada inúmeras vezes e por vários autores, sendo que os Ceriantharia sempre foram avaliados através de dados clássicos e muito pretéritos. O clado Ceriantharia, uma ordem dentre Hexacorallia, apresenta muitos caracteres dúbios e que poderiam colocar os animais em várias posições sistemáticas dentre Cnidaria. Ainda, as revisões de Ceriantharia são sempre derivadas de análises das mesmas espécies, principalmente do Mar Mediterrâneo. O presente trabalho tem como enfoque a discussão dos caracteres taxonômicos (morfológicos e moleculares) de Ceriantharia, sua posição sistemática, levantamento taxonômico de áreas no Oceano Atlântico praticamente inexploradas para o grupo e aspectos da biologia das espécies encontradas. Os resultados apontam para uma nova posição sistemática de Ceriantharia, levando o grupo à base de Anthozoa e como um ramo independente. A utilização de dados moleculares evidenciou o vigor do emprego de DNA barcoding na zoologia comparada de Ceriantharia. Aspectos de especiação e de revisão sistemática resultaram pelas análises moleculares. Ao mesmo tempo, os dados morfológicos são extremamente confusos e muito do que foi utilizado como caractere de delimitação de espécies pela tradição de se assumir homologias com Actiniaria é, aparentemente, inconsistente. O ciclo de vida de Isarachnanthus noturnus foi verificado, sendo que o seu estágio jovem, planctônico, e de dispersão é de longa duração. Dados sobre regeneração em pólipos também foi verificada e com a constatação de mecanismos divergentes entre as espécies. / The Cnidaria Anthozoa systematics was revised several times by a number of authors, and the Ceriantharia always evaluated using very classical and ancient data. The Ceriantharia clade, an Hexacorallia order, has many dubious characters that could place the animals in various systematic positions within Cnidaria. Also, the Ceriantharia reviews are always derived from analysis of the same species, mainly from the Mediterranean Sea. This work focuses on the discussion of taxonomic characters (morphological and molecular) of Ceriantharia, the systematic position, taxonomic survey of virtually unexplored Atlantic Ocean areas for the group and the biology of the observed species. The results suggest a new systematic position of Ceriantharia placing the group at the basis of Anthozoa and as an independent branch. The molecular data comparison showed the force of DNA barcoding use in Ceriantharia comparative zoology. The molecular data allowed the discussion of several aspects of speciation and systematics. At the same time, the morphological data are extremely confusing and much of it was used as delimiting species character by the tradition of assuming homologies with Actiniaria is, apparently, inconsistent. The life cycle of Isarachnanthus noturnus was observed, and the young, planktonic and dispersal stage is long-lived. Data on regeneration of polyps was also verified with the observation that mechanisms differ between species.

As matas secas representam um ambiente extremamente ameaçado, sendo considerado um dos mais ameaçados do mundo. Um fato que contribui para esta ameaça além da intensa pressão antrópica, é a falta de conhecimento, sem o qual é impossível se realizar ações para sua conservação. Na região do Rio Paranã as matas secas revelam espécies compartilhadas com a caatinga, concordando com a idéia de uma ocorrência mais ampla deste habitat no passado. Na região do Peruaçu, dentre as espécies que ocorrem nas matas secas e em suas outras fisionomias, como o carrasco, existem espécies compartilhadas com a Mata Atlântica (Enyalius pictus), e espécies aparentemente associadas à estes habitats secos e densos, na região do planalto dos gerais (Stenocercus quinarius). Na região do Peruaçu, estas espécies apresentaram uma estreita associação com estes habitats, assim como ocorre em outras localidades. Estas características de sua história natural, determinam ocorrências local e regionalmente, e permitem dispersão durante climas favoráveis à expansão de seu habitat e isolamento durante sua fragmentação. E. pictus, pode se dispersar entre as matas secas e úmidas, atingindo a região do Peruaçu, o que concorda com a idéia de uma maior abrangência das matas durante momentos do passado, mas aponta uma conexão com a Mata Atlântica e não Caatinga. Esta maior abrangência também é observado na distribuição de S. quinarius restrito hoje à fragmentos isolados de vegetação densa ao longo do Planalto dos Gerais. Os resultados obtidos demonstram extrema necessidade de levantamentos de espécies detalhados e registros de sua história natural nas áreas de mata seca, para melhorar nosso conhecimento sobre este bioma, ajudar no entendimento da história biogeográfica deste ecossistema, e a definir áreas prioritárias à conservação dentro de sua distribuição. / Dry Forests are environments extremely endangered, considered one of the most en-dangered ecosystems of the world. The lack of knowledge, together with intense anth-ropic pressure, contributes to this threat, and without this knowledge it is impossible to perform conservational actions to protect this habitat. At Paranã region dry forests revealed species shared with Caatinga, what is in agreement with the hypothesis of broader occurrence in the past. At Peruaçu region, among those species found at the dry forests and at its physiognomies, such as carrasco, there are species shared with the Atlantic Forest (Enyalius pictus) and those associated with this dry habitats from Planalto dos Gerais (Stenocercus quinarius). At Peruaçu region these species had a strong association with these habitats, as they show at other localities. These natural history features determine its occurrence locally as well as regionally, which results in dispersions during suitable climatic conditions for habitat expansion and isolation dur-ing habitat fragmentation. Therefore E. pictus could disperse between dry and wet forests, reaching Peruaçu region, also agreeing with the hypothesis of broader occur-rence of dry forests in the past, however indicated a connection with Atlantic Forest and not with Caatinga. This wider occurrence in the past is also observed in the distri-butional range of S. quinarius restricted today to small isolated fragments of denser vegetation along Planalto dos Gerais. These results indicate an extremely necessity for more species inventories, and records of their natural history associated with dry for-est, to improve our knowledge on it, to help the understanding of its biogeographical history and delineate priority areas for conservation within its distributional range.

A família Psittacidae possui 332 espécies de papagaios, periquitos e afins, e os táxons Neotropicais formam um grupo monofilético (tribo Arini), dentro desta tribo está o gênero Aratinga. A sistemática deste gênero é mal resolvida, com poucos estudos morfológicos e algumas filogenias moleculares que apontam que não seja monofilético. Porém, é preciso destacar que esses estudos não amostraram uma quantidade representativa de espécies do gênero, o que deixa essas relações incertas. Para melhor compreender a história evolutiva do gênero Aratinga, realizamos uma análise filogenética com 21 das 22 espécies do gênero, o táxon monotípico Nandayus nenday que é proximamente relacionado a algumas espécies de Aratinga e representantes de outros gêneros da tribo Arini. Foram sequenciados cinco genes mitocondriais (12S, 16S, citocromo b, NADH2, COIII) e um nuclear (RAG-1). As filogenias obtidas por máxima verossimilhança e análise Bayesiana foram congruentes e indicam a ausência de monofilia do gênero Aratinga. A maioria das espécies do gênero foi posicionada em três clados com alto suporte, mas que não se apresentam agrupados em um clado monofilético. Estes três clados são congruentes com grupos previamente propostos com base em caracteres morfológicos. Nandayus nenday está dentro de um destes clados, que é grupo irmão de um clado que contém outros quatro gêneros da tribo Arini. A única espécie que não foi incluída em nenhum destes clados é Aratinga acuticaudata, que aparentemente é mais proximamente relacionada aos gêneros Diopsittaca e Guarouba. A maioria dos eventos de divergência das espécies do gênero Aratinga nesses diferentes clados parece ter ocorrido nos últimos 5 milhões de anos (Ma.). Enquanto as estimativas de datas de divergências entre os principais clados sugerem que elas ocorreram durante o Mioceno inicial. O padrão biogeográfico da diversificação dos clados de Aratinga foi complexo, possivelmente relacionado com o soerguimento dos Andes, com múltiplas colonizações da América Central antes e depois do fechamento do Istmo do Panamá e com ciclos glaciais do Pleistoceno. Esses resultados refutam a monofilia do gênero e uma revisão taxonômica do táxon parece ser necessária. / Family Psittacidae includes 332 species of parrots and all Neotropical taxa form a monophyletic group (tribe Arini), among those, is the parakeet genus Aratinga. This genus has an unresolved systematics, with few morphological studies and some molecular phylogenies suggest that it is not monophyletic. However, these phylogenies did not include a representative sample of species of the genus. To better understand the evolutionary history of genus Aratinga, we conducted a phylogenetic analysis that included 21 of 22 species of the genus, the monospecific taxon Nadayus nenday that is closely related to some Aratinga species, plus various taxa from tribe Arini. We sequenced five mitochondrial (12S, 16S, cytochrome b, NADH2, COIII) and one nuclear (RAG-1) genes. The phylogenies were reconstructed based on maximum likelihood analysis and Bayesian inference. Relaxed molecular clock estimates were conducted under a Bayesian analysis for inferring the divergence times of the phylogeny and to study the biogeographic history of these species. The phylogenies recovered by both methods were highly congruent and support the absence of monophyly for genus Aratinga. The majority of the species from the genus Aratinga was placed in three highly supported clades that did not group in a monophyletic clade. These three clades match previously suggested groups based on morphological characters. Nandayus nenday was included in one of these clades, that is closely related to a clade that contains four other Arini genera. The only species that was not included in any of these clades was Aratinga acuticaudata, that seems to be more closely related to the genera Diopsittaca and Guarouba with high support values. Most of the speciation within the Aratinga clades may have occurred during the last 5 Mya., but the divergence times between these clades seems to have occurred during the early Miocene. The biogeograhic pattern of the diversification of the Aratinga clades was complex, possibly related to the history of the Andes, multiple colonization of Central America before and after the closure of the Panama Isthmus and also Pleistocene glacial cycles. These results further refute the monophyly of genus Aratinga and a taxonomical revision may be necessary for the taxon.

Para se chegar a modelos mais precisos de unidades de conservação devemos pensar a importância do desenvolvimento do conhecimento sobre a dinâmica insular. O principal objetivo da pesquisa foi avaliar a relação entre as fisionomias vegetais encontradas em oito ilhas do litoral norte paulista e alguns de seus aspectos estruturais, com área, forma e distância da costa (isolamento), utilizando como indicadores espécies vegetais de diferentes estágios de sucessão ecológica, em matas de encosta. Foram selecionadas oito ilhas com diferentes áreas, formas e distâncias da costa: ilhas do Prumirim, Porcos Pequena, Comprida, das Couves (Ubatuba), ilhas do Mar Virado, Tamanduá e Maranduba (Caraguatatuba) e ilha da Vitória (Ilhabela). O trabalho foi desenvolvido com em três etapas: primeiro a apreensão sobre a área de estudo, por meio da produção de bases e produtos cartográficos em escala 1:10.000, incluindo um mapeamento das fisionomias vegetais com base em ortofotos e imagens de satélite; segundo, a produção de dados primários, por meio de estudo sobre as métricas de paisagem para todas a ilhas do litoral norte, avaliando e área, forma e isolamento. o levantamento bibliográfico das espécies arbóreas que ocorrem nas ilhas, e um trabalho de campo focal na ilha do Prumirim; e terceiro, o mapeamento de unidades de paisagens das ilhas e elaboração de proposta para o planejamento de seu uso testando três variáveis, conservação, assentamento e turismo. Dentre os resultados destacamos: os mapas de vegetação, com os quais foi possível mensurar e comparar os tipos de fisionomias que cobrem as ilhas; a análise da forma, do tamanho e isolamento da ilhas do litoral norte, que resultou em dados mais precisos sobre esses ambientes insulares e trouxe parâmetros de comparação para as ilhas selecionadas, no contexto da região costeira; o levantamento de espécies, revelando que das treze mais frequentes nas ilhas slecionadas, sete são pioneiras, características de formações secundárias, evidenciando o aspecto geral de mata alterada em estágio de regeneração e ressaltando da importância dessas espécies generalistastas; a alta correlação entre o número de espécies em cada ilha com a área e forma, um dos preceitos da teoria biogeográfica de ilhas; e por último, a partir da delimitação das unidades de paisagens, a proposta de uso para as ilhas na qual, em síntese, identificamos um forte potencial para a conservação e o turismo ordenado, equação da qual acreditamos, depender o futuro das ilhas. Esperamos que este trabalho traga além de um aprofundamento sobre o conhecimento desses ambientes insulares, uma inquietação sobre as formas de se pensar a conservação não só de ilhas, mas de tantos outros ambientes isolados, como os fragmentos continentais da mata Atlântica. / To achieve more precise models of conservation units, it´s needed to consider the importance of development of knowledge of the insular dynamics. The main goal of the study was to evaluate the relationship between the types of vegetation found in eight island of northern coast of Sao Paulo state, it´s relationship as well structural features like area, shape, and distance from the shore, using as parameter vegetal species of different stages in ecological sucession in coastal rainforests. Eight islands were selected: Prumirim, Porcos Pequena, Comprida and Das Couves in Ubatuba municipality; Mar Virado, Tamanduá and Maramduba, in Caraguatatuba municipality, and Ilha da Vitória, in Ilhabela complex. The study was developed in three stages: a general overview of the study area, with generation of maps in 1:10,000 scale, including the mapping of vegetation; second, collection of primary data by metric study of landscapes of all islands in the northern coast, evaluating area, shape and isolation. Land field studies in Prumirim island, where most of the data was collected, complemented by iterature evaluation of arboreal species which was also performed to compare species distribution. Third, the mapping of landscapes units and elaboration of a proposal of planning of usage of the studied areas, using three variables: conservation, settling and tourism. Our results include: vegetation maps, where the vegetal covering was measured and compared, and analysis of landscape metrics, which sheds light into insulated areas parameters. The literature analysis of species showed clearly the relevance of pioneer species, which are very frequent in the studied areas. We have identified also a high correlation between the number of species in a given island with its area and shape, in concordance with the island biogeography theory. Finally, from the landscape units studied, we could elaborated a proposal of usage of these islands, identifying a strong potential for ecological tourism, and most importantly, to conservation of these unique areas. We hope that this work can bring new insights into conservation policies in isolated areas.

Por que os trópicos sustentam tanta diversidade? Essa é a pergunta principal que motivou este trabalho. Uma das frentes para contribuir ao entendimento deste fenômeno é estudar a origem da diversidade. Diversas hipóteses de diversificação existem, e existe também uma acalorada discussão no campo de estudo que busca testar essas diferentes hipóteses. Uma das hipóteses mais conhecida, se também não a mais polêmica, é a Hipótese de Refúgios. O objetivo deste trabalho foi, portanto, testar a Hipótese de Refúgios na Floresta Atlântica através de um estudo de caso. Para tanto, inicialmente os padrões de distribuição morfológica e genética do marsupial Didelphis aurita Wied, 1826 foram investigados através do método de quadrantes. As medidas cranianas revelaram uma correlação longitudinal para fêmeas, mas ausência de associação geográfica na variação do crânio dos machos. Entretanto, complementarmente, outro critério foi utilizado. Através de uma Análise de Componentes Principais sobre a variação da latitude e longitude resumiu-se a variação geográfica em apenas uma variável. Esta acaba se refletindo em uma diagonal da latitude e longitude, que acompanha a própria distribuição da Floresta Atlântica na costa brasileira. Agora, os grupos são formados se apresentam diferenças significativas ao longo desta diagonal, permitindo que populações biológicas distintas, mas próximas geograficamente, sejam separadas. Assim, verificou-se que a associação longitudinal das fêmeas provém basicamente da diferenciação das populações da Bahia, e mais, isso também afeta os machos. Contudo, o sinal não aparece através do outro critério devido ao fato de machos também apresentarem diferenciações em menor escala dentro da distribuição ao sul da Bahia, possivelmente devido à presença do ecótone entre a Floresta Atlântica e o cerrado latu sensu. Por usa vez, os dados genéticos como explorados através da variação geográfica do marcador mitocondrial citocromo B, revelaram que também existe uma associação com a longitude, e novamente, ela provém principalmente da diferenciação dos extremos da distribuição. Aqui, não só a mesma quebra na Bahia aparece, mas também uma outra quebra mais ao norte, de indivíduos provenientes de Alagoas. Tanto para os dados morfológicos quanto para os moleculares, demonstrou-se que há isolamento por distância no gambá, entretanto, toda a distribuição ao sul da Bahia se comporta como uma grande população panmítica. Essa ausência de estruturação geográfica, também aparente em análises de diferenciação (Fst), unidas aos testes de neutralidade (D de Tajima e F de Fu) negativos e significativos, que dão sinal de expansão demográfica recente mostram, juntos, as assinaturas esperadas pela Hipótese de Refúgios. Contudo, a divergência entre as populações deste sul datam de aproximadamente 140.000&cong;60.000 anos, o que não pode ser atribuída como sendo reflexo do último interglacial, esperado em cerca de 20.000 anos. Explorando mais a fundo as análises de Fst e os testes de neutralidade, revelou-se que suas estimativas são altamente influenciadas por desbalanço no tamanho de amostras, assim como baixa representatividade e agrupamentos inadequados que unem populações biológicas distintas. Os aparentes sinais de refúgios obtidos foram, portanto, artefato de três população bem amostradas no Rio de Janeiro. Sendo assim, não se pode atribuir esta hipótese como tendo criado diversidade dentro da espécie D. aurita. / How can the tropics present such diversity? This question lies at the very core of this work. While for the origins of diversity, numerous hypotheses have been put forward over time, the pursuit of empirical proofs for them is almost as old as the hypotheses themselves. One of the better known such hypothesis, and at the same time one of the most controversial, is the Refugee Hypothesis. In this context, the main goal of this thesis has been to test the Refugee Hypothesis in the Atlantic Forest by means of a study case. Initially, the morphologic and genetic distribution patterns of Didelphis aurita Wied, 1826 marsupial have been investigated using the grids method. Cranial measurements revealed a longitudinal correlation for the females and, at the same time, the absence of any geographic correlation in the variation of male skulls. By means of a Principal Component Analysis, the latitudinal and longitudinal variations have been reduced to a geographical variation dependent on one variable only _ a diagonal that follows the extension of the Atlantic Forest along the Brazilian coast. Groups have been formed if they presented significant differences along this diagonal, thus allowing distinct, but geographically close populations, to be differentiated. It could hereby be proven that the longitudinal correlation for females reflects mainly the differentiation between populations from Bahia state, and even more, that this differentiation affects the males as well. The signature does not appear in the grid criterium for the males since they also present lower levels of differentiation in the south of Bahia, possibly due to the presence of the ecotone of the Atlantic Forest with the cerrado latu sensu biome. There is, nevertheless, a break in Bahia for both males and females. As for the geographic variation of the molecular mitochondrial marker cytochrome B, it also presented a longitudinal variation, and a clear differentiation between the two extremes of the analyzed distribution. Here, not only a similar break could be seen in Bahia, but another one further north in the specimens from Alagoas state. For both the morphological and the molecular data, while there is isolation by distance effect for the opossum, all the distribution south of Bahia behaves as a large panmitic population. This lack of geographical structuring, also apparent in differentiation analyzes (Fst), together with neutrality tests (Tajima\'s D and Fu\'s F) which point towards recent geographic expansion, show the signatures expected by the Refugee Hypothesis. Since, however, the data indicates that the divergence of southern populations occurred approximately 140,000&cong;60,000 years ago, the diversification cannot be due to the last inter-glacial period from 20,000 years ago. To understand this seeming contradiction, further in-depth investigations of the Fst analyzes and the neutrality tests revealed that the estimations had been highly influenced by the heterogeneity in the number of samples, as well as by the low representability of some localities and also inadequate grouping of specimens, which mixed distinct biological populations. The apparent refugee signatures have thus been the misleading consequence of three well-sampled populations from Rio de Janeiro state. Therefore, the Refugee Hypothesis cannot be regarded as an explanation for the existing diversity of the species D. aurita.

Orientador: Fernando Roberto Martins / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T09:57:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moro_MarceloFreire_D.pdf: 9639656 bytes, checksum: a3305b2b5bbfdfc0f26e9f7aff82a96e (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Ignorado do ponto de vista dos estudos botânicos e da conservação durante a maior parte do século XX, o Domínio Fitogeográfico da Caatinga (DFC) foi reconhecido a partir das últimas duas décadas como uma região natural única, com vários endemismos e bem mais diversa floristicamente do que se assumiu no século passado. Com o recente aumento na produção de estudos florísticos e fitossociológicos no DFC, surge a oportunidade de produzir uma síntese geral para a região, avaliando quantas espécies já foram coletadas, suas frequências, quantas espécies devem existir, que tipos de ambientes dentro do domínio estão mais ou menos amostrados, além de mapear geograficamente áreas pouco estudadas. Esta tese, portanto, busca fazer uma síntese dos levantamentos florísticos e fitossociológicos e da diversidade vegetal para o domínio da Caatinga. Nós avaliamos a questão da similaridade florística entre diferentes ambientes utilizando técnicas de análise multivariada e comparamos pela primeira vez os diferentes subtipos de Caatinga não apenas florísticamente, mas também pelos seus espectros de formas de vida, mostrando que áreas em geologias cristalinas e sedimentares diferem tanto floristicamente quanto estruturalmente. Com isso, oferecemos aqui uma síntese geral de dados florísticos para o DFC, indo de uma síntese dos levantamentos, passando por uma síntese das espécies e chegando finalmente em uma síntese biogeográfica. Com isso, compilamos um volume considerável de literatura florística e fitossociológica antes dispersa na literatura e oferecemos um quadro geral sobre a diversidade vegetal do DFC / Abstract: Overlooked during most of the twentieth century, the Caatinga Phytogeographical Domain (DFC) has been recognized in the last decades as a unique natural area with much more diversity and endemisms than previously assumed. We are experiencing in the last decades an increase in the publication of floristic and phytosociological studies for the DFC, what offers the opportunity to produce a synthesis for this region. We aimed at evaluating how many species have been collected, their frequency, how many species are expected to exists, and which environment types are more or less sampled. We also mapped which are the most overlooked geographical regions within the CPD. We thus seek to summarize the floristic and phytosociological surveys produced for Caatinga and to sumarize the plant diversity and biogeographical patterns for this region. We evaluate the issue of floristic similarity between different environment types within Caatinga using multivariate analysis and compared the floristic similarity among different subtypes of Caatinga. We also show that areas in crystalline and sedimentary terrains differ not only floristically but also structurally, with different lifeform spectra in each environment. We offer here a general overview of the plant divertity in the DFC, making a synthesis of the available surveys, a synthesis of the recorded species and finally a biogeographical synthesis. Thus, we sumarize here a considerable amount of floristic and phytosociological data scattered in the literature and offer a general overview for the Caatinga domain / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador: André Victor Lucci Freitas / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T03:27:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_EduardoProenca_M.pdf: 42430863 bytes, checksum: 2e52ceb55e75dfe4450c676669d34918 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Muitos aspectos e detalhes da origem, evolução e padrões de distribuição das borboletas ainda não são totalmente compreendidos, como as relações filogenéticas entre a grande maioria dos grupos de borboletas, que permaneceram desconhecidas até recentemente. Estudos filogenéticos até alguns anos atrás foram baseados principalmente em caracteres morfológicos de adultos muito embora o uso de caracteres de estágios imaturos tenha aumentado em importância atualmente, principalmente por se mostrarem informativos onde os caracteres de adultos foram insuficientes. Ainda assim, existem poucos trabalhos que utilizem esses caracteres tanto para a filogenia quanto para a classificação das borboletas. Além das lacunas nas relações de ancestralidade comum das borboletas, também existem lacunas a serem preenchidas com relação aos padrões biogeográficos, principalmente com relação à biogeografia histórica. Nos neotrópicos, a região mais biodiversa do planeta, o estudo da origem e da biogeografia da maioria dos grupos de organismos incluindo borboletas, é um assunto de grande interesse. Isso porque a maioria desses grupos não possui uma boa compreensão de suas histórias evolutivas, e desvendar alguns desses pontos seria dar um passo em direção à compreensão dessa enorme diversidade Neotropical. Apesar de ser um grupo relativamente bem conhecido, o gênero Actinote (Nymphalidae: Heliconiinae) ainda carece de estudos para uma melhor compreensão das relações internas do grupo, bem como sobre os padrões de distribuição na Região Neotropical. No presente estudo foram realizadas, análises filogenéticas baseadas em caracteres morfológicos com 34, 31 e 29 táxons, respectivamente. Nas três análises a maior parte dos clados é suportado por homoplasias, embora alguns grupos reduzidos de espécies, tenham aparecido suportados por sinapomorfias. Embora muitas discussões apontem para uma grande importância no uso de imaturos para se resolver as relações de ancestralidade comum entre as borboletas, os caracteres de estágios imaturos de Actinote não se mostraram muito informativos para elucidar as relações desse grupo, apesar de terem grande valor taxonômico, ajudando na identificação da maioria das espécies. Isso provavelmente se deve há uma grande variação intra-específica e uma baixa congruência com os caracteres de adultos, o que tornaria difícil o uso desses caracteres para a resolução das relações evolutivas para esse grupo em particular. Para alguns autores essa dificuldade poderia ser resultado de uma rápida diversificação durante a história evolutiva dessas espécies, limitando a diferenciação morfológica. A análise biogeográfica foi efetuada com o programa Reconstructing Ancestral States in Phylogeny (RASP). De acordo com a hipótese biogeográfica ótima, o padrão de distribuição observado poderia ser explicado por 41 dispersões, seis eventos vicariantes e três extinções. Segundo a análise o ancestral de Altinote e Actinote era amplamente distribuído, ocupando os Andes e a Serra do Mar, no sudeste do Brasil. Um evento vicariante isolou então a linhagem ancestral de Altinote nos Andes e a linhagem ancestral de Actinote no sudeste da América do Sul. Os eventos vicariantes poderiam estar relacionados a eventos de mudanças climáticas, o que faz sentido para este grupo em particular, que é típico de ambientes frios de grandes altitudes. De acordo com esta hipótese, durante os períodos glaciais essas espécies de grande altitude poderiam se dispersar e alcançar ambientes em baixas altitudes. Quando as temperaturas aumentavam durante os períodos interglaciais, estas espécies eram mantidas nesses locais de maior altitude, onde as temperaturas permaneciam baixas, e ficavam isoladas. Se o período de isolamento fosse grande o bastante, as espécies poderiam então passar por eventos de especiação, se tornando novas espécies / Abstract: Many aspects and details of the origin, evolution and biogeographical patterns of butterflies are not yet fully comprehended. The phylogenetic relationships among most butterfly groups remained unknown until recently. Phylogenetic studies have been based mainly on morphological characters of adults, although characters of immature stages had increased in use and importance nowadays, specially due to their capacity of been informative where adult characters are not enough. There are few studies that use these characters either to phylogeny or classification of the butterflies. Besides the lack of information about the common ancestry of butterflies, there are also gaps to be filled about the biogeographical patterns, primarily related to the historical biogeography. In the neotropics, the planet's most biodiverse region, the study of origin and biogeography of most groups of organisms, including butterflies, is a subject of great interest. This because most of these groups are poorly understood concerning their evolutionary histories and shed light on some of these histories would lead us toward the comprehension of this huge Neotropical diversity. Despite being one relatively well known group, the genus Actinote (Nymphalidae: Heliconiinae) still lacks studies in phylogeny to solve the internal relationships of this group. It also lacks studies that seek to understand the distributional patterns of the group in the Neotropical region and which factors were responsible for the high diversity of Actinote in the southeast region of South America. In the present study we carried out three phylogenetic analyses based on morphology, with 34, 31 and 29 táxons respectively. In all analyses the majority of the clades were supported by homoplasies, although some groups of few species were maintained apparently the same in all the analyses supported by synapomorphies. Despite the fact that many discussions point out to a great importance in the use of immature characters to help solving the common ancestry relationships of butterflies, in the present work these characters were not very informative to elucidate the relations of this group, although they have a great taxonomic value, being helpful in the identification of the majority of species. This is probably due to a great intraspecific variation and a lower congruency with the adults' characters which would make it harder to use these characters to try and solve the evolutionary relationships of this particular group. Some authors claim that this difficulty could be a result of a rapid diversification during the evolutionary history of these species, restricting the morphological differentiation. The biogeographical analysis was carried out with the program Reconstructing Ancestral States in Phylogeny (RASP). According to the optimal biogeographical hypothesis, the distribution pattern observed could be explained by 41 dispersal, six vicariant and three extinction events. The analysis pointed out to a spread distributed ancestor of Altinote and Actinote, occupying the Andes and the Serra do Mar, in southeast Brazil. A vicariant event had isolated the ancestor lineage of Altinote in the Andes and the ancestor lineage of Actinote in the southeast of South America. The vicariant events could be related to climatic changes, what makes sense to this particular group, which is typical of cold high altitude habitats. According to this hypothesis, during the glacial periods the species of high altitude habitats could disperse and reach low altitude habitats. When the temperatures got higher in the interglacial periods these species were trapped in high altitude places, of lower temperature, and became isolated. If this isolation period lasted long enough, the species could pass through speciation events, turning into new species / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: João Semir / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T11:21:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Breier_TiagoBoer_D.pdf: 1087652 bytes, checksum: e8ab6c859380cf07d34a73fde28e3149 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O presente estudo aborda quatro comunidades de epífitos vasculares em diferentes formações florestais do Estado de São Paulo, comparando composição florística, formas de vida, síndromes de polinização e dispersão, com base nos dados coletados em uma amostragem padronizada realizada em áreas de 10,24ha em cada formação: Floresta de Restinga (Parque Estadual Ilha do Cardoso), Floresta Ombrófila Densa Submontana (Parque Estadual Carlos Botelho), Floresta Estacional Semidecidual (Estação Ecológica Caetetus) e Cerradão (Estação Ecológica Assis). Foram registradas respectivamente 178, 161, 25 e 16 espécies de epífitos vasculares, ou seja, plantas que crescem sem contato caule-solo, incluindo plantas com estruturas haustoriais. Ao todo, nas quatro parcelas, foram registradas 277 espécies de epífitos vasculares pertencentes 109 gêneros e a 37 famílias. As maiores similaridades, no nível de espécie, foram encontradas comparando a flora das florestas mesófilas entre si e a flora das florestas higrófilas entre si, as demais comparações par a par, entre uma floresta mesófila e uma higrófila apresentaram baixos valores de similaridade. A única espécie presente nas quatro formações foi Pleopeltis angusta (Polypodiaceae). Em todas as áreas, holoepífitos verdadeiros foram à forma de vida com maior número de espécies. Entomofilia e anemocoria foram respectivamente às síndromes de polinização e dispersão com maior número de espécies. Estudos detalhados sobre estrutura e distribuição espacial das comunidades de epífitos indicam grandes diferenças na ocupação do espaço, de acordo com o tipo de floresta. A riqueza de epífitos apresentou diferentes respostas, de acorco com o tipo florestal, a parâmetros quantitativos dos forófitos e a parâmetros quantitativos das parcelas. Palavras-chaves: epífitos vasculares, comunidades, síndromes de polinização, síndromes de dispersão, formas de vida, biogeografia, ecologia / Abstract: This work presents four communities of vascular epiphytes in different forest formations in the State of São Paulo, and it compares the floristic composition, life forms, pollination and dispersal syndromes, using data collected through standardized samplings, performed in 10,24ha areas in each formation: Coastal Plain Forest (Ilha do Cardoso State Park), Submontane Rain Forest (Carlos Botelho State Park), Seasonal Semideciduous Forest (Caetetus Ecological Station) and Woody Savanna Forest (Assis Ecological Station). I sampled respectively 178, 161, 25 and 16 species of vascular epiphytes (plants that grow without stem-soil contact, including plants with haustorial structures. Altogether, in the four plots studied, there were 277 species of vascular epiphytes belonging to 109 genera and 37 families. The highest similarity values, in the species level, were found in the comparison among the flora of mesophilous forests and among the flora of hygrophilous forests; the other paired comparisons, between one mesophilous and one hygrophilous forest, presented the lowest similarities values. The only species common to all four forest formations, in the plot sampling, was Pleopeltis angusta (Polypodiaceae). In all areas, the life form of true holoepiphyte was the richer. Entomophily and anemocory were, respectively, the most diverse syndromes. Detailed studies on the spatial distribution of epiphyte communities suggest large differences in space occupation, according to forest type. Epiphyte richness presented different types of relationship, according to forest formation, to quantitative parameters of phorophytes and to quantitative parameters measured in the plots. Keywords: vascular epiphytes, community, pollination syndromes, dispersal syndromes, life forms, biogeography, ecology / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal