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Utilização de abelhas adultas em análises de citometria de fluxo / Use of adult bees in flow cytometry analyzes

Faustino, Alessandra de Oliveira 20 February 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-09-03T18:45:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 521431 bytes, checksum: f1d795099ef7fc1ce72a69d0855ecd37 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-03T18:45:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 521431 bytes, checksum: f1d795099ef7fc1ce72a69d0855ecd37 (MD5) Previous issue date: 2018-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O primeiro trabalho de citometria de fluxo utilizando abelhas da tribo Meliponini, quantificou o genoma de três espécies, as quais apresentaram conteúdo de DNA de 0,43 pg em Scaptotrigona xantotricha, 0,93 pg em Melipona rufiventris e 0,95 pg em Melipona mondury. Posteriormente à determinação do seu conteúdo genômico, S. xantotricha passou a ser utilizada como padrão interno, em todos os estudos de citometria com meliponíneos. Atualmente, valores de apenas 63 espécies de abelhas estão disponíveis, mostrando uma escassez de dados nesse grupo. Uma das razões para esse desprovimento de dados, pode ser devido à dificuldade do acesso as larvas e pupas, que foram as únicas utilizadas, até o momento, nos estudos de quantificação do genoma de abelhas. Sendo assim, a busca pela utilização de material mais acessível, pode ser uma estratégia para que mais espécies sejam analisadas. Portanto, o presente estudo teve como objetivo testar diferentes tampões para a quantificação do conteúdo de DNA nuclear em abelhas adultas. Para a preparação das suspenções nucleares, a serem analisadas no citômetro de fluxo, foram utilizadas abelhas adultas da espécie S. xantotricha e o padrão interno Drosophila melanogaster, juntamente com os tampões LB01, Galbraith, MgSO 4 e TRIS. Os histogramas obtidos, apresentaram bons níveis de resolução e coeficiente de variação satisfatórios, com percentuais menores do que 5%, variando de 2,24% com o tampão Galbraith a 3,34% com o tampão LB01. O tamanho do genoma de adultos de S. xantotricha apresentou valores muito próximos ou idênticos aos dados disponíveis na literatura para as larvas e pupas dessa mesma espécie. Da mesma forma, a razão experimental não apresentou grandes variações em relação à teórica (2,39), sendo o tampão MgSO 4 com razão de 2,34 o mais distante. Em relação à porcentagem de debri celular, as amostras que utilizaram os tampões Galbraith, MgSO 4 e TRIS, mostraram-se mais limpas em relação as que utilizaram o tampão LB01. Por fim, os resultados dos parâmetros analisados, no mesmo dia da extração e 24 após extração, foram muito semelhantes. Mediante o exposto, podemos concluir que a utilização de abelhas adultas para a determinação do conteúdo de DNA é tão eficaz quanto ao uso de larvas e pupas, visto que seus resultados não apresentaram diferenças estatisticamente significantes quando comparados com os dados da literatura. / The first work of flow cytometry using bees from Meliponini tribe quantified the genome of three species, to which they presented DNA content of 0.43 pg in Scaptotrigona xantotricha, 0.93 pg in Melipona rufiventris and 0.95 pg in Melipona mondury. After the determination of its genomic content, S. xantotricha became to be was used as the internal standard in all the studies of meliponine cytometry. Currently, values of just 63 species of bees are available, showing a scarcity of data in this group. One of the reasons for this data shortage may be due to the difficulty of access the larvae and pupae, which were the only ones used, until the moment, in the studies of quantifying the genome of bees. Thus, the search for the use of more accessible material may be a strategy for more species to be analyzed. Therefore, the present study aimed to test different buffers for the quantification of nuclear DNA content in adult bees. For the preparation of the nuclear suspensions, to be analyzed in the flow cytometer, adult bees of the species S. xantotricha and the internal standard Drosophila melanogaster, along with LB01, Galbraith, MgSO4 and TRIS buffers. The histograms obtained had good resolution levels and coefficient of variation of satisfactory, with percentages lower than 5%, ranging from 2.24% with Galbraith buffer to 3.34% with LBO1 buffer. The size of the genome obtained with the use of adults of S. xantotricha values very close or identical to the available data in the literature for the larvae and pupae of the same species. Similarly, the experimental coefficient did not show great variations in relation to the theoretical one (2.39), and the MgSO4 buffer with a ratio of 2.34 was the most distant. In relation to the percentage of debri cell, the samples using the Galbraith, MgSO4 and TRIS buffers were cleaner compared to those using the LB01 buffer. Finally, the results of analyzed parameter in the same day of extraction and 24 hours after extraction were very similar. In front of this fact, we can conclude that the utilization of adult bee for the determination of DNA content is so effective as to use of larvae and pupae, since its result not showed significant statistical differences when compared with the literature data.
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Farmacologia da Cecropia sciadophylla mart. nativa da Amazônia: efeitos antiúlcera gástrica e na musculatura esquelética correlacionados com a atividade da h+, k+-atpase e da ca+2-atpase.

Maciel, Lucinei Alves 11 November 2010 (has links)
Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-07-07T20:35:08Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Lucinei Alves Maciel.pdf: 1863455 bytes, checksum: a1a109eb4e2da8cb6f164b17e8b12813 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-08T20:09:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Lucinei Alves Maciel.pdf: 1863455 bytes, checksum: a1a109eb4e2da8cb6f164b17e8b12813 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-08T20:16:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Lucinei Alves Maciel.pdf: 1863455 bytes, checksum: a1a109eb4e2da8cb6f164b17e8b12813 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-08T20:16:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Lucinei Alves Maciel.pdf: 1863455 bytes, checksum: a1a109eb4e2da8cb6f164b17e8b12813 (MD5) Previous issue date: 2010-11-11 / Não Informada / Species of the genus Cecropia known as embaúba, are used in the folk medicine to treat hypertension, bronchitis, gastric ulcer, diabetes, arthritis and other regional endemic affections. Several authors have mentioned the anti-malarial activity of some species. With the aim to compare the activity of an Amazonian species without previous pharmacological study, the present work describes the Cecropia sciadophylla Mart, its collect and extraction, the chemical standardization criteria and the purification of the leaves aqueous extract (AE). The obtention of the semi-purified buthanolic fraction (BuF) and the pharmacological effects of these extracts, emphasizing the actions in the central nervous system, the antinociceptive effect, the action in the arterial blood pressure, the muscular action and the gastrointestinal activity are also described in this work. Partition of the aqueous extract of the leaves 2,5% (AE) with n-buthanol originated the BuF, more stable, more concentrated and more active, with the same chromatographic fingerprint of AE in the HPLC. For future molecular studies, 26 fractions with well defined retention times were isolated from BuF; some of them were already identified: catechin, quercetin-3-O-β-glucopyranoside and 2" -O-ramnosilvitexin. The general pharmacological screening of the extracts in mice showed hyperactivity and increased motricity, not described in other Cecropia species, but the anti-depressive effect was common to the others. The antinociceptive and the anti-inflammatory effects were poorly consistent, perhaps by the central stimulating activity. The intravenous injection of BuF produced hypotension without interfering with the noradrenalin action or with the cardiac activity. In vitro, the BuF relaxed the adrenergic tonus only in the intact endothelium aortic rings, indicating vasodilatory action dependent on the NO synthesis. Previous treatment of rats with the BuF protected the gastric mucosal against cold stress- and ethanol-induced ulcers; this effect was correlated with the reduction of the gastric secretion acidity and the in vitro inhibition of the H+, K+-ATPase activity. In rodents isolated diaphragm, the BuF potentiated the direct elicited twitches of the muscle fiber; this effect was correlated to the inhibition of the Ca+2-ATPase activity, but not by the acetylcholinesterase inhibition. / Espécies do gênero Cecropia conhecidas como embaúba, são usadas na medicina popular para pressão alta, bronquite, úlcera, diabetes, artrite e outras afecções endêmicas regionais. Alguns autores mencionam atividade antimalárica de algumas espécies. Com o objetivo de comparar a atividade de uma espécie amazônica sem estudo farmacológico anterior, o presente trabalho descreve a Cecropia sciadophylla Mart, sua coleta e extração, o critério de padronização química e purificação do extrato aquoso (EA) das folhas. A obtenção da fração butanólica (FBut) semi-purificada e a farmacologia desses extratos, enfatizando as ações no sistema nervoso central, a ação antinociceptiva, a ação pressórica, a ação muscular e a atividade gastrintestinal também são descritos neste trabalho. O chá das folhas a 2,5% (EA) particionado com n-butanol originou a FBut mais estável, concentrada e ativa, conservando o mesmo perfil cromatográfico em CLAE. Da FBut foram isoladas 26 frações com tempos de retenção bem definidos que foram preparadas para estudos moleculares futuros. Alguns compostos já foram identificados: catequina, quercetina-3-O-β-glucopiranosideo e 2"-Oramnosilvitexina. A triagem farmacológica geral dos extratos em camundongos evidenciou hiperatividade e aumento da motricidade, não descritas com outras espécies de Cecropia, mas o efeito tipo-antidepressivo detectado foi comum às demais. As atividades antinociceptiva e anti-inflamatória foram pouco consistentes, talvez em vista da ação estimulante central. A injeção endovenosa de FBut produziu hipotensão sem interferir com a ação da noradrenalina ou com a atividade cardíaca. In vitro a FBut relaxou o tônus induzido por noradrenalina apenas na aorta com endotélio íntegro, indicando ação vasodilatadora dependente da síntese de óxido nítrico. O tratamento prévio de ratos com FBut protegeu a mucosa gástrica contra úlceras por stress e as produzidas por etanol; este efeito foi correlacionado com diminuição da acidez livre da secreção gástrica e com inibição in vitro da atividade da H+, K+-ATPase da mucosa gástrica de suíno. No músculo diafragma de roedores, a FBut potenciou a contração ao estímulo direto da fibra muscular; este efeito foi correlacionado com a inibição da Ca+2- ATPase extraída de músculo esquelético de coelho, mas não à inibição da acetilcolinesterase.
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O efeito da umidade e de fatores edáficos na dinâmica de infecção e na manipulação comportamental de formigas infectadas por fungos entomopatogênicos em uma floresta de terra firme da Amazônia Central

Cardoso Neto, José Aragão 25 July 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-26T13:44:57Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - José A. Cardoso Neto.pdf: 1328784 bytes, checksum: 4ff955e231389d71b7fd2c667f905152 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-26T13:45:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - José A. Cardoso Neto.pdf: 1328784 bytes, checksum: 4ff955e231389d71b7fd2c667f905152 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-26T13:45:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - José A. Cardoso Neto.pdf: 1328784 bytes, checksum: 4ff955e231389d71b7fd2c667f905152 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T13:45:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - José A. Cardoso Neto.pdf: 1328784 bytes, checksum: 4ff955e231389d71b7fd2c667f905152 (MD5) Previous issue date: 2016-07-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The fungi of the genus Ophiocordyceps parasite several species of ants, manipulating the behavior (extended phenotype) of their hosts. The objective of the present study was to evaluate the effect of air humidity and HAND on the occurrence and expression of the extended phenotype of ants parasitized by the most abundant entomopathogenic fungi Ophiocordyceps unilateralis sl, O. kniphofioides Sl And O. australis s.l. Fifteen 250 - m - long plots were monitored seven times over 14 months, actively searching for corpses of parasitic ants biting leaf tissue, buried in mosses of trees, hugged in sticks, or on the ground. There were 4,277 parasitized ants, distributed in 26 species and 4 morphotypes. The fungus complex O. unilateralis s.l. Was the most abundant, with 3,811 ants parasitized and the ant species Camponotus atriceps was the most abundant, representing 2,599 parasitized ants. The occurrence and extended phenotype of the species of ants parasitized by O. australis s.l. And O. kniphofioides s.l. Had no relation to air humidity and HAND. The species of C. atriceps and C. bispinosus parasitized by O. unilateralis s.l. Had more parasitized individuals when the air humidity was higher, and these ants die at higher altitudes after periods of higher air humidity. Conversely, the abundance and height of C. senex parasitized was higher when the HAND was consequently drier. These results suggest that air humidity and HAND can control both the occurrence and expression of the phenotype of some parasites. In addition, the response to the same environmental gradient depends on the parasite species in question. / Os fungos do gênero Ophiocordyceps parasitam diversas espécies de formigas, manipulando o comportamento (fenótipo estendido) de seus hospedeiros. O objetivo do presente estudo foi avaliar o efeito da umidade do ar e do HAND (distância vertical da drenagem mais próxima), na ocorrência e expressão do fenótipo estendido das formigas parasitadas pelos complexos mais abundantes de fungos entomopatogênicos, Ophiocordyceps unilateralis s.l., O. kniphofioides s.l. e O. australis s.l. Foram monitoradas 15 parcelas de 250 m de comprimento por sete vezes ao longo de 14 meses, buscando ativamente os cadáveres de formigas parasitadas mordendo tecido foliar, enterradas em musgos de árvores, abraçadas em gravetos, ou sobre o solo. Foram encontradas 4.277 formigas parasitadas, distribuídas em 26 espécies e 4 morfotipos. O complexo de fungo O. unilateralis s.l. foi o mais abundante, com 3.811 formigas parasitadas e a espécie de formiga Camponotus atriceps foi a mais abundante, representando 2.599 formigas parasitadas. A ocorrência e o fenótipo estendido das espécies de formigas parasitadas por O. australis s.l. e O. kniphofioides s.l. não tiveram relação com a umidade do ar e HAND. Já as espécies de formigas C. atriceps e C. bispinosus parasitadas por O. unilateralis s.l. tiveram mais indivíduos parasitados quando a umidade do ar era maior, além dessas formigas morrem em alturas maiores após períodos de maior umidade do ar. Contrariamente, a abundância e a altura de C. senex parasitados foi maior quando o HAND era elevado, consequentemente, mais secos. Esses resultados sugerem que a umidade do ar e o HAND podem controlar tanto a ocorrência como a expressão do fenótipo de alguns parasitas. Além disso, a resposta ao mesmo gradiente ambiental depende da espécie de parasita em questão.
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Atividade diária e pesca do camarão-da-amazônia Macrobrachium amazonicum (HELLER, 1862), no município de Itacoatiara-AM

Fernandes, Ellan Rodrigo Monteiro Paes 29 July 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-06T18:38:09Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ellan R. M. P. Fernandes.pdf: 1918107 bytes, checksum: e40b31b039bd79b7c501e51d879121dc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-06T18:53:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ellan R. M. P. Fernandes.pdf: 1918107 bytes, checksum: e40b31b039bd79b7c501e51d879121dc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-02-06T18:53:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ellan R. M. P. Fernandes.pdf: 1918107 bytes, checksum: e40b31b039bd79b7c501e51d879121dc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T18:53:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ellan R. M. P. Fernandes.pdf: 1918107 bytes, checksum: e40b31b039bd79b7c501e51d879121dc (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / Agência de Fomento não informada / With wide distribution in various states of Brazil, the species of Macrobrachium amazonicum prawn has aroused interest in aquaculture. Behavior information and standard description of activities M. amazonicum are important to optimize the management in captivity of this species. The aim of this study was to describe the behavioral daily activities and selection of M. amazonicum substrate. The animals were kept in 30 L tanks with continuous aeration, weeds in the water column and bottom divided into 50% gravel and 50% sand. A total of 132 prawns (12 prawns reserves), divided into: Experiment 1 (T1: adults and juveniles; T2: youth; T3: adults) and experiment 2 with just 1 treatment (adult prawn with simulation of the flood pulse), both treatments were divided into three replicates of 10 shrimp per tank were observed for 48 hours at intervals of one hour in experiment 1 (T1, T2 and T3), and for 40 days in experiment 2 every 12 hours with the frequency register the activities and location on the substrate. For the analysis of behavioral data in all treatments was carried out principal component analysis (PCA) for "bootstrap" using R software, comparing the frequencies of the day and night and to compare the selection of substrate M. amazonicum was used chi-test square using PAST 2:16 software (P <0.05) in experiment 1, and principal component analysis (PCA) in experiment 2. Significant difference in behavioral activity M. amazonicum was recorded between the periods of day and night, and also before simulated flood pulse. In the experiments, the shrimp were most active at night, and environmental exploitation the most frequent behavior. In the daytime, the most common behavior was feeding. The selection of the substrate showed difference between periods in all experimental treatments 1 and experiment 2 observed difference in substrate selection before flood pulse. In the daytime, there was a greater preference for gravel substrate. At night the water column showed a higher occurrence of M. amazonicum. The behavioral pattern of activity exhibited by M. amazonicum shows a species with predominantly nocturnal exploratory habit. The presence of CG1 males and also reducing the space significantly increased the frequency of agonistic behavior in M. amazonicum. / Com ampla distribuição em diversos estados do Brasil, a espécie de camarão Macrobrachium amazonicum vem despertando interesse na aquicultura. Informações de comportamento e descrição do padrão de atividades de M. amazonicum são importantes para otimizar o manejo em cativeiro dessa espécie. O objetivo do presente estudo foi descrever as atividades diárias comportamentais e seleção de substrato de M. amazonicum. Os animais foram mantidos em aquários de 30 L com aeração contínua, macrófitas na coluna d’água e fundo divido em 50% de cascalho e 50% de areia. Um total de 132 camarões (12 camarões reservas), divididos em: experimento 1 (T1: adultos e juvenis; T2: juvenis; T3: adultos) e experimento 2 com apenas 1 tratamento (camarões adultos com simulação do pulso de inundação), ambos tratamentos foram divididos em 3 réplicas com 10 camarões por aquário, foram observados durante 48 horas em intervalos de uma hora no experimento 1 (T1, T2 e T3), e por 40 dias no experimento 2 em intervalos de 12 horas, com registro da frequência das atividades e localização no substrato. Para a análise dos dados comportamentais em todos os tratamentos foi realizada análise de componentes principais (PCA) por “bootstrap” utilizando software R, comparando as frequências do dia e noite e para comparar a seleção do substrato de M. amazonicum foi utilizado teste Qui-quadrado utilizando software PAST 2.16 (P<0,05), no experimento 1, e análise de componentes principais (PCA) no experimento 2. Diferença significativa nas atividades comportamentais de M. amazonicum foi registrada entre os períodos de dia e noite, e também perante pulso de inundação simulado. Nos experimentos, os camarões estiveram mais ativos no período noturno, sendo a exploração do ambiente o comportamento mais frequente. No diurno, o comportamento mais comum foi alimentação. A seleção do substrato apresentou diferença entre períodos em todos os tratamentos do experimento 1 e no experimento 2 observou diferença na seleção de substrato perante pulso de inundação. No diurno, houve maior preferência pelo substrato de cascalho. No noturno a coluna d’água apresentou maior ocorrência de M. amazonicum. O padrão de atividade comportamental exibido por M. amazonicum evidencia uma espécie com hábito exploratório predominantemente noturno. A presença de machos CG1 e também a redução do espaço aumentou significativamente a frequência do comportamento agonístico em M. amazonicum.
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Utilização de peptídeos quiméricos das proteínas de envelope (E) , não estrutural 1 (NS1) e não estrutural 3 (NS3) para produção de insumos diagnósticos da dengue

Rios, Katiúscia Alexandre 27 February 2014 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T10:49:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Katiúscia A. Rios.pdf: 5557349 bytes, checksum: 1964fe97b319914d498f0df13ea42974 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T11:00:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Katiúscia A. Rios.pdf: 5557349 bytes, checksum: 1964fe97b319914d498f0df13ea42974 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T11:00:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Katiúscia A. Rios.pdf: 5557349 bytes, checksum: 1964fe97b319914d498f0df13ea42974 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-03T11:00:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Katiúscia A. Rios.pdf: 5557349 bytes, checksum: 1964fe97b319914d498f0df13ea42974 (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Dengue infection has become a public health problem in tropical and sub-tropical areas. It is a viral disease transmitted by arthropods with high mortality rates. Its clinical diagnosis requires laboratory confirmation because several other conditions can also cause similar symptoms with acute fevers as well as the primary use antibodies or antigens for detection of DENV. The continued development of diagnostic tests that are cheap, sensitive, specific, easy to perform, and that are capable of giving early diagnosis of the dengue virus infection is still a needed. Using bioinformatics, we mapped peptides of Envelope protein (E), Nonstructural 1 and 2 which have antiginity, hidrofility and probality to apper on the surface. The first peptide, with molecular weight of the 17KDa, was called E/ENS3 and corresponds to two Envelope protein (E) sequences and a Nonstructural 3 sequence. The second peptide, with molecular weight of the 15Kda, was called ENS1/3 and it corresponds to a Envelope protein (E) sequence, a Nonstructural 1 sequence and Nonstructural 3 sequence. The peptides were expressed in prokaryotic sistem, purified and used in ELISA (Enzyme-Linked Assay Imunoabsorvente). Using Indirect ELISA in the IgM and IgG antibody detection previously characterized, we obtained as results: (1) IgG research using E/ENS3 and ENS1/3 peptides, sensibility was 65% and the specificity was 91,7% and (2) IgM research, sensibility was 75,7% and and the specificity was 91,8%. These results indicate that use of both E/ENS3 and ENS1/3 peptides may be a alternative to the serological diagnosis of dengue. / A infecção pelo vírus dengue continua sendo um grande problema de saúde pública em regiões tropicais e subtropicais do mundo, sendo a principal doença viral transmitida por artrópodes, com alta morbidade e mortalidade. O diagnóstico clínico da dengue requer confirmação laboratorial devido à semelhança dos sintomas com uma série de outras febres agudas e para detecção de infecções virais primárias ou secundárias. O desenvolvimento de testes baratos, sensíveis, específicos e de fácil execução, que sejam capazes de proporcionar diagnóstico precoce da infecção pelo vírus da dengue, é ainda uma necessidade. Neste trabalho mapeamos, por ferramentas de bioinformática, peptídeos das proteínas de Envelope (E), Não Estrutural 1 e 2 que apresentasse como características: elevada antigenicidade, hidrofilicidade e probabilidade de se apresentar na superfície. O primeiro peptídeo, com peso molecular de 17KDa, foi denominado E/ENS3 e corresponde a duas sequências da proteína de Envelope (E) e uma sequência da Não Estrutural 3. O segundo peptídeo, com peso molecular de 15Kda, foi denominado ENS1/3 e corresponde a uma sequência da proteína de Envelope (E), uma sequência da Não Estrutural 1 e uma sequência da Não Estrutural 3. Os peptídeos foram expressos em sistemas em sistema procarioto, purificados e utilizados em teste de ELISA (Enzyme-Linked Assay Imunoabsorvente). Foram realizadas a detecção de anticorpos IgM e IgG de amostras de laboratório, previamente caracterizadas, através de ELISA Indireto e obteve-se os seguintes resultados: (1) na pesquisa de IgG usando os peptídeos E/ENS3 e ENS1/3, a sensibilidade foi de 65% e a especificidade foi de 91,7% e (2) na pesquisa de IgM a sensibilidade foi de 75,7% e especificidade foi de 91,8%. Estes resultados indicam que a utilização dos peptídeos E/ENS3 e ENS1/3 podem ser uma alternativa para o diagnóstico sorológico da dengue
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Análise do transcriptoma de Fusarium decemcellulare agente causal do superbrotamento em guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis)

Lobo, Igor Kelvyn Cavalcante 15 July 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T11:33:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Igor K. C. Lobo.pdf: 3889233 bytes, checksum: 90f8aeeb9144c0133ea8b9fbfc42611c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T11:33:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Igor K. C. Lobo.pdf: 3889233 bytes, checksum: 90f8aeeb9144c0133ea8b9fbfc42611c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-03T11:34:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Igor K. C. Lobo.pdf: 3889233 bytes, checksum: 90f8aeeb9144c0133ea8b9fbfc42611c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-03T11:34:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Igor K. C. Lobo.pdf: 3889233 bytes, checksum: 90f8aeeb9144c0133ea8b9fbfc42611c (MD5) Previous issue date: 2016-07-15 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Guarana from Amazonia is much appreciated for its medicinal and energizing properties, and the Amazonas state is the second national contribution in production. However, this production has been affected by a major disease of culture: the overbudding, whose causal agent is the fungus Fusarium decemcellulare. The symptoms of the disease are overbudding, hyperplasia and hypertrophy floral and stem galls. In other studies, the development of symptoms similar to those overbudding’s symptoms is associated to production, or modulation, of auxin hormone by the pathogen. Thus, this study aimed identify genes from biosynthesis pathways of auxin hormone in Fusarium decemcellulare and analyze differences between transcriptomic profiles of homothallic and heterothallic individuals. Twelve libraries were sequenced referring to six biological replicates (three homothallic individuals and three heterothallic individuals) for each growth condition: BD and MS media. Quality control of reads was carried out by Trimmomatic-0.33, FastQC and SortMeRNA softwares. Mapping reads to reference genome was done with TopHat2 software and the transcriptome assembly in each condition, as well as differential expression, were performed using the Cufflinks package (Cufflinks, Cuffmerge and Cuffdiff). Functional annotation of transcripts was performed by KEGG Automatic Annotation Server (KAAS) and Blast2GO. To verify the ability to synthesize auxin, FDC200 and CML2241 were grown in MS medium, which was then analyzed by ultra performance liquid chromatography. Genes from two putative auxin biosynthesis pathway were identified at genomic and transcriptomic levels: the indole-acetaldehyde pathway, its deviation and the tryptamine pathway. The expression of these genes was detected in both individuals, heterothallic and homothallic. A gene from a putative aminocyclopropane (ACC) deaminase also has been identified at genomic and transcriptomic levels, which is responsible for degrading the precursor of hormone ethylene, ACC. Furthermore, the auxin hormone was detected in the MS medium, where FDC200 and CML2241 were grown, confirming biosynthesis of IAA (indole-3-acetic acid) by the fungus. Therefore, the data obtained suggest the use of auxin biosynthesis and blocking of plant ethylene production by Fusarium decemcellulare to evade the host defense system, and the symptoms of overbudding in guarana plant would be a consequence of hormonal imbalance caused by the fungus. / O guaraná da Amazônia é muito apreciado por suas propriedades medicinais e energéticas, sendo o Amazonas a segunda contribuição nacional na produção. Esta produção, entretanto, acaba sendo afetada por uma das principais doenças da cultura: o superbrotamento, que tem como agente causal o fungo Fusarium decemcellulare. Os sintomas da doença são: o superbrotamento de gemas, a hiperplasia e hipertrofia floral e as galhas do caule. Em diversos estudos, associa-se sintomas semelhantes aos do superbrotamento a uma produção, ou ainda modulação, do hormônio auxina por parte do patógeno. Assim, o objetivo deste trabalho foi de identificar genes de vias de síntese do hormônio auxina em Fusarium decemcellulare e analisar diferenças entre perfis transcriptômicos de isolados homotálicos e heterotálicos. Foram sequenciadas 12 bibliotecas, referentes a seis réplicas biológicas (três isolados homotálicos e três isolados heterotálicos de F. decemcellulare) para cada condição de crescimento: meios BD e MS. O controle de qualidade das reads foi realizado pelos softwares Trimmomatic-0.33, FastQC e SortMeRNA. O mapeamento de reads no genoma de referência foi realizado com o software TopHat2 e a montagem do transcriptoma final em cada condição, bem como o cálculo de expressão diferencial, foram realizados através do pacote Cufflinks (Cufflinks, Cuffmerge e Cuffdiff). A anotação funcional dos transcritos foi realizada através das ferramentas KEGG Automatic Annotation Server (KAAS) e Blast2GO. Para verificar a habilidade de F. decemcellulare em sintetizar auxina, os isolados FDC200 e CML 2241 foram crescidos em meio MS, o qual foi posteriormente analisado por meio de cromatografia líquida de ultra performance. Foram identificados, a nível genômico e transcriptômico, duas putativas vias de síntese do hormônio auxina: a via do indol-acetaldeído, mais o desvio desta via, além da via da triptamina. A expressão destes genes foi detectada tanto em indivíduos heterotálicos, quanto em homotálicos. Foi identificado ainda, também a nível genômico e transcriptômico, um gene de uma putativa aminociclopropano (ACC) deaminase, responsável por degradar o precursor do hormônio etileno, o ACC. Além disso, o hormônio auxina foi detectado no meio de cultura MS, onde foram crescidos os isolados FDC200 e CML2241, confirmando biossíntese por parte do fungo. Os dados aqui obtidos sugerem, portanto, que Fusarium decemcellulare estaria se utilizando da síntese de auxina e bloqueio da produção de etileno da planta para burlar o sistema de defesa da hospedeira, sendo os sintomas do superbrotamento em guaranazeiro uma consequência do desequilíbrio hormonal causado pelo fungo.
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Extração e caracterização química de polissacarídeos de basidiomicetos comestíveis de ocorrência na Amazônia

Pessoa, Felipe Barbosa 08 August 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-20T13:05:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Felipe B. Pessoa.pdf: 2891308 bytes, checksum: 9f5619e8fdd080b9c2dba4d27433d3d9 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-20T13:05:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Felipe B. Pessoa.pdf: 2891308 bytes, checksum: 9f5619e8fdd080b9c2dba4d27433d3d9 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-20T13:05:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Felipe B. Pessoa.pdf: 2891308 bytes, checksum: 9f5619e8fdd080b9c2dba4d27433d3d9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T13:05:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Felipe B. Pessoa.pdf: 2891308 bytes, checksum: 9f5619e8fdd080b9c2dba4d27433d3d9 (MD5) Previous issue date: 2016-08-08 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Besides being useful for human consumption, fungi are versatile organisms that degrade organic matter, producing value added substance. Among the bioactive substances present in these fungi, polysaccharides are the main products, which have a high value for chemical, pharmaceutical and medical industries. Knowing that the Amazon presents the greatest biodiversity of the planet and that in this forest there is still little information about the species of native basidiomycetes, the objective of the study was the cultivation of edible mushrooms Lentinus strigosus and Pleurotus ostreatus in regional wood residues as a substrates, aiming the extraction and Chemical characterization of polysaccharides isolated from the fruiting body of these mushrooms. For the cultivation, regional wood residues were used, according to the following substrate formulation: 68% sawdust of Simaboura amara (marupá) or Anacardium giganteum (cajuí), cereal meal mixture (30%) and calcium carbonate (2 %), homogenized and humidified to 75%. The substrates were autoclaved, inoculated and kept in a climatic chamber until complete colonization, and then transferred to the production chamber. After the fruiting, the mushrooms were harvested, dehydrated and analyzed for yield. They were grounded and successively subjected to cold and hot water extractions for subsequent purification and characterization of polysaccharides. The fractions obtained containing polysaccharides were purified by the process of freezing and thawing, Fehling solution and dialysis membranes with 12-14 kDa exclusion limit. The chemical structure of the polysaccharide was determined by an analysis of the monosaccharide composition, NMR and methylation. Regarding to the production, the results showed that the formulation containing cajuí allowed better results of biological efficiency (EB 221,17 and 104,88%); Yield (220.23 g kg-1 and 72.5 g kg-1) for P. ostreatus and L. strigosus, respectively. The organic matter loss (OML) was not significantly different for the two types of substrates used. Three β-D-glucans were isolated from the hot extraction (IHW-fraction A, B and C), which contains the main chain composed of β-D-Glcp units connection (1→ 3), and may be replaced by O-6 for β-Glcp terminals. Besides, these were isolated homopolysaccharide (methylated galactan) of cold extraction. Thus, it is possible to use regional waste timbers for the cultivation of native edible fungi in the Amazon region. The glucans described in this study are similar to those that have biological effects reported in scientific literature, as it is likely that they have a therapeutic potential. / Os fungos são organismos versáteis que degradam matéria orgânica, produzem substância de valor agregado, além de serem úteis para a alimentação humana. Dentre as substâncias bioativas presentes nos fungos, os polissacarídeos são os principais produtos que apresentam elevado valor para a indústria química, farmacêutica e medicinal. Sabendo que a Amazônia apresenta a maior biodiversidade do planeta e que nesta floresta existem poucas informações sobre espécies nativas de basidiomicetos, são necessárias pesquisas sobre o petencial destes fungos. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo o cultivo dos cogumelos comestíveis Lentinus strigosus e Pleurotus ostreatus em resíduos madeireiros regionais como substratos, visando à extração e caracterização química dos polissacarídeos isolados do corpo de frutificação destes cogumelos. Para o cultivo, foram utilizados resíduos maderireiros regionais, conforme a seguinte formulação de substrato: 68% de serragem de de Simaboura amara (marupá) ou Anacardium giganteum (cajuí), mistura de farelo de cereais (30%) e carbonato de cálcio (2%), sendo os mesmos homogeneizados e umidificados a 75%. Os substratos foram autoclavados, inoculados e mantidos em câmara climática até a completa colonização, sendo em seguida, transferidos para câmara de produção. Após o período de frutificação, os basidiomas foram colhidos, desidratados e analisados quanto à produtividade. Posteriormente foram moídos e submetidos às extrações aquosas à frio e à quente sucessivamente para purificação e caracterização dos polissacarídeos. As frações obtidas contendo os polissacarídeos foram purificadas pelo processamento de congelamento/degelo, solução de Fehling e diálises em membranas com limite de exclusão de 12-14 kDa. A estrutura química dos polissacarídeos foi determinada através das análises de composição monossacarídica, metilação e RMN. Em relação ao cultivo, os resultados mostraram que a formulação contendo cajuí permitiu melhores resultados quanto à eficiência biológica (EB 221,17 e 104,88 %); rendimento (220,23 g kg-1 e 72,5g kg-1) para P. ostreatus e L. strigosus, respectivamente. A perda de matéria orgânica (PMO) não diferiu estatisticamente para os dois tipos de substratos utilizados. Três β-D-glucanas foram isoladas das extrações à quente (fração IHW-A, B e C). Sua estrutura contém cadeia principal formada por unidades β-D-Glcp com ligação (1→3), podendo ser substituída em O-6 por terminais de β-Glcp. Além destas, foram isolados homopolissacarídeos (galactana metilada) das extrações a frio. Sendo assim, foi possível utilizar resíduos de marupá e cajuí para o cultivo de fungos comestíveis nativos da Amazôia. As moléculas descritas neste estudo são semelhantes as que apresentam efeitos biológicos relatadas na literatura, sendo provável que as mesmas tenham um potencial terapêutico.
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Estudo da diversidade e atividade larvicida de Agaricomycetes lignolíticos (basidiomycota) no Estado do Amazonas

Fonseca, Maria Dolores Pinheiro 31 May 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:33:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:34:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:34:23Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T13:34:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2016-05-31 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Studies on biodiversity has great importance to the rational use of natural resources, especially in mega-diverse regions such as the Amazonia. The study of fungal diversity Agaricomycetes is important to contribute with the knowledge of the diversity of them in the state of Amazon and introduce new records to the region. The relevance of this research is to contribute to the knowledge about biodiversity and the prospect of bioactive products, identifying fungi Agaricomycetes wood-degrading potential insecticide against larvae of mosquito of dengue virus, chikungunya and zika the Aedes aegypti. The methodology used for classical taxonomic identification was performed through analysis of macro-and microscopically, basidiomatas from the collections held in 12 municipalities of the state of Amazon (Autazes; Anamã; Careiro da várzea; Coari; Babu; Borba; Novo Aripuanã; Nova Olinda do Norte; Manaus; Manicoré; Parintins and Presidente Figueiredo) in the period from January to March 2013 and from January to May 2014. In that sense, it was possible to expand knowledge about the diversity of the Agaricomycetes. 323 specimens were collected, 263 of them were identified, represented by 40 genera, 76 species, classified into 15 families and 4 orders of Agaricomycetes. The healthy basidiocarps were recovered, of which 43 were pure cultures. These were used for the production of extracts, molecular identification and identification by MALDI-TOF. Molecular identification was through the sequencing of the Its regions 1 and 2 of the rDNA, and by MALDI TOF mass spectrometry. Molecular identification analyses were performed by comparison of the sequences deposited in GenBank. The result of the molecular sequencing allowed an alignment with the nucleotide sequences that matches the identification of fungi as being of the group, the Agaricomycetes similarity above 96 %. In MALDI TOF only 26 specimens were possible be submitted to IC/MALDI TOF MS analysis. Spectral data were obtained with peak patterns (ions) exclusive to fungi with similarity of protein mixtures, which refers to the percentage of identity for the amount of identical values. Larvicidal activity performed effectively, six fungi showed bioactive compounds with lethal capability against larvae of third stage of A. aegypti. The extract of P. sanguineus, presented mortality of probit to 5.3 larvae of A. aegypti, which gives this fungus, a potential entomopatogênico quite expressive. The other extracts were not possible being necessary for analysis, evaluation and increased sample number. / Os estudos sobre a biodiversidade são de suma importância para a utilização racional dos recursos naturais, principalmente em regiões mega-diversas, como a Amazônia. O estudo da diversidade de fungos Agaricomycetes é importante para contribuir com o conhecimento sobre a diversidade destes no Estado do Amazonas e apresentar novos registros para a região. A relevância dessa pesquisa está em contribuir para o conhecimento da biodiversidade e da prospecção de produtos bioativos, identificando fungos Agaricomycetes degradadores de madeira com potencial inseticida contra larvas do mosquito transmissor do vírus da dengue, chikungunya e zika o Aedes aegypti. A metodologia utilizada para identificação taxonômica clássica foi realizada através de análises dos basidiomas macro e microscopicamente, A partir das coletas realizadas em 12 municípios do Estado do Amazonas (Autazes; Anamã; Careiro da várzea; Coari; Barcelos; Borba; Novo Aripuanã; Nova Olinda do Norte; Manaus; Manicoré; Parintins e Presidente Figueiredo) no período de janeiro a março de 2013 e de janeiro a maio de 2014. Nesse sentido, foi possível expandir o conhecimento sobre a diversidade de Agaricomycetes na região. Foram coletados 323 espécimes, destes foram identificados 263, representados por 40 gêneros, 76 espécies, classificadas em 15 famílias e 4 ordens de Agaricomycetes. Os basidiocarpos saudáveis foram isolados, dos quais foram obtidas 43 culturas puras. Estes foram utilizados na produção de extratos, identificação molecular e identificação por MALDI- TOF. A identificação molecular foi através do sequenciamento das regiões Its 1 e 2 do rDNA, e pela técnica de MALDI TOF Espectrometria de Massa. As análises da identificação molecular foram realizadas por comparação das sequências depositadas no GenBank. O resultado do sequenciamento molecular permitiu um alinhamento com as sequências nucleotídicas que corresponde a identificação dos fungos como sendo do grupo Agaricomycetes, com taxa de similaridade acima de 96 %. Na técnica de MALDI TOF apenas 26 espécimes foram possíveis ser submetidas à análise IC /MALDI TOF MS. Foram obtidos dados espectrais com padrões de pico (íons) exclusivo para os fungos com similaridade das misturas de proteínas, o que refere-se a porcentagem de identidade para a quantidade de valores idênticos em massa. A atividade larvicida apresentou-se eficaz, seis fungos apresentaram substâncias bioativas com potencialidade letal contra larvas de 3º estádio de A. aegypti. O extrato de P. sanguineus, apresentou mortalidade de 5,3 probit para larvas de A. aegypti, o que confere a este fungo, um potencial entomopatogênico bastante expressivo. Os demais extratos não foram possíveis de análise sendo necessário para avaliação, e aumento do número amostral.
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Relação entre hidrologia e assembleia de palmeiras ao longo de gradientesaAmbientais na ESEC Cuniã (interflúvio Purus-Madeira)

Pansini, Susamar 23 August 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-16T11:49:28Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese parcial - Susamar Pansini.pdf: 500467 bytes, checksum: bf2e7b561436bbe06d2ee92c69f64f81 (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-16T11:50:14Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese parcial - Susamar Pansini.pdf: 500467 bytes, checksum: bf2e7b561436bbe06d2ee92c69f64f81 (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-17T20:18:49Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese parcial - Susamar Pansini.pdf: 500467 bytes, checksum: bf2e7b561436bbe06d2ee92c69f64f81 (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-17T20:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese parcial - Susamar Pansini.pdf: 500467 bytes, checksum: bf2e7b561436bbe06d2ee92c69f64f81 (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2016-08-23 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The relationship between environmental gradients and the set of palms trees (Arecaceae) was investigated in 48 permanent plots installed in 25 km2 of the forest in a fragment between the rivers Purus-Madeira in the Estação Ecologica do Cuniã (Ecological Station Cuniã - ESEC Cu-niã) which is located in the North of the province of Rondônia, Porto Velho municipality. 48 investigated plots, 30 are from the mainland and follow the curve of the ground level to mini-mize the internal variation in soils and topography and 18 plots are riparian and follow the course of streams. For the study of the relationship between the set of palm trees and environ-mental variations, data of surface soil samples were collected and granulometric analysis were made (percentages of silt, sand and clay), macro and micronutrients (pH, Ca, Mg, P, K, Fe, MN, Zn). The local hydrological conditions were measured by the distance of the nearest streams and vertical drainage gradient was measured by the depth of the water table sheet. The depth of the litter was measured every two meters along the centerline of each plot. The structure and floristic composition of the palm trees and the factors related to it was evaluated. The relation-ship between palm trees and gradient of soil, topography, elevation and depth of the local litter were studied, evaluating the most important factors for palm trees forest of canopy and subcan-opy and how small-scale variations change the response of species to environmental conditions. The community showed positive correlation with variable content of silt, phosphorus, sum of bases and distance of the stream, showing that species replacement is linked to local conditions. The study of the relationship between the palms and the hydrologic gradient was evaluated based on the monitoring of the water table, water distance and how species behave according to the variations of the local water conditions. Water is an important factor for the colonization of species of palm trees and affects them differently, based on the size of the species. Finally, it was evaluated how the palm trees set responds to the temporal variation by the analysis of mortality rates and the repopulation of the species. The main gradients related to mortality of palm trees in the area were elevation, and water distance. The repopulation was strongly influ-enced by the content of silt and the water distance. / A relação entre gradientes ambientais e a assembleia de palmeiras (Arecaceæ) foi investigada em 48 parcelas permanentes instaladas em 25 km2 de floresta em um trecho do interflúvio Pu-rus-Madeira na Estação Ecológica do Cuniã (ESEC Cuniã) que está localizada no norte do Estado de Rondônia, município de Porto Velho. Das 48 parcelas investigadas, 30 são de terra-firme e seguem a curva de nível do terreno para minimizar a variação interna de solos e topo-grafia e 18 parcelas são ripárias e seguem o curso dos igarapés. Para estudo das relações entre a assembleia de palmeiras e as variações ambientais, foram coletados dados de amostras superficiais de solo e feitas análises granulométricas (porcentagens de silte, areia e argila), macro e micronutrientes (pH, Ca, Mg, P, K, Fe, Al, Mn, Zn). As condições hidrológicas locais foram medidas pela distância do igarapé mais próximo e o gradiente vertical de drenagem foi medido pela profundidade do lençol freático. A profundidade de liteira foi medida a cada dois metros ao longo da linha central de cada parcela. Foi avaliada a estrutura e composição florística de palmeiras e os fatores a ela relacionados. Estudou-se a relação entre palmeiras e gradiente de solo, topografia, altitude e profundidade de liteira local, avaliando os fatores mais importantes para palmeiras do dossel e subdossel da floresta e como as variações em pequena escala alteram a resposta das espécies às condições ambientais. A comunidade apresentou correlação positiva com as variáveis de teor de silte, fósforo, doma de bases e distância do igarapé, mostrando que a substituição das espécies está ligada a condições locais. O estudo da relação entre as palmeiras e o gradiente hidrológico foi avaliado com base no monitoramento do lençol freático, distância da água e como as espécies se comportam segundo as variações das condições hídricas locais. A água é fator importante para a colonização das espécies de palmeiras e afeta de forma distinta, de acordo com o porte das espécies. Por fim, avaliou-se como a assembleia de palmeiras responde à variação temporal pela análise das taxas de mortalidade e recrutamento das espécies. Os principais gradientes ligados às taxas de mortalidade de palmeiras na área foram Altitude e distância da água. O recrutamento foi fortemente influenciado pelo teor de silte e distância da água.
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Desenvolvimento e caracterização de nanopartículas de Óxido de Ferro para o tratamento de leishmaniose cutânea via hipertermia por ondas curtas

Mendonça, Ayrles Silva Gonçalves Barbosa, 92-98116-8814 30 March 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-31T13:23:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-31T13:23:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-31T13:23:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-31T13:23:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / Leishmaniasis is a disease that affects around 12 million people worldwide, being prevalent in 5 continents and considered endemic in 98 countries. The cutaneous form is the most common and can be caused by approximately 20 species. In Brazil, the antimony drug is used as the first choice in the treatment of leishmaniasis. After intravenous administration, it is rapidly absorbed and almost 90% of the antimony is excreted within the first 48 hours by the kidneys. As a consequence, the administration of high doses is indispensable, which generates many side effects, including cardiorespiratory and renal alterations. In this sense, the general objective of this work was the development of pure maghemite nanoparticles and coated with glucuronic and fructose acid, shortwave, aiming to generate an innovative treatment protocol, via hyperthermia for the treatment of cutaneous leishmaniasis lesions. In addition to the synthesis of nanoparticles, characterization tests were performed, including field emission gun microscopy (FEG); X-ray diffraction; Fourier-transformed infrared spectroscopy (FTIR); Möusbauer spectroscopy and magnetic measurements (ZFC). Short-wave parameter definition tests and in vitro cell viability assays, with and without the use of short waves, were also performed. Results: The results of the FEG revealed a well ordered structure of nanoparticles, with an average diameter of 60nm. X-ray diffraction data, together with Möusbauer, indicated the oxidation state and crystalline phase of the iron oxide compatible with a pure sample of maghemite. The FTIR measurements indicated adsorption of the binders to the nanoparticles, especially when coated with glucuronic acid. The magnetization measurements by ZFC indicated, in all samples, magnetic properties compatible with ferromagnetic regime and saturation magnetization between 56 and 59 emu /g, indicating that these materials when exposed to an alternating electromagnetic field will allow hyperthermia. Finally, the in vitro assays indicated a real leishmanicidal effect when the pure or coated nanoparticles were exposed to the alternating magnetic field of the short waves for 30 minutes, which generated hyperthermia and consequent death of the pathogen. In view of the above, it is possible to conclude that the application of the proposed leishmanicide method indicated a high potential of use for the treatment of cutaneous leishmaniasis lesions / A leishmaniose é uma patologia que afeta cerca de 12 milhões de pessoas em todo mundo, sendo prevalente em 5 continentes e considerada endêmica em 98 países. A forma cutânea é a mais comum e pode ser causada por aproximadamente 20 espécies. No Brasil, o medicamento à base de antimônio é utilizado como primeira escolha na terapêutica da leishmaniose. Após administração endovenosa, ele é rapidamente absorvido e praticamente 90% do antimônio é excretado nas primeiras 48h pelos rins. Em conseqüência, faz-se indispensável a administração de doses elevadas, o que gera muitos efeitos colaterais, incluindo alterações cardiorrespiratórias e renais. Nesse sentido, o objetivo geral do presente trabalho constituiu-se como o desenvolvimento e caracterização de nanopartículas de maghemita puras e revestidas com ácido glicurônico e frutose, atrelado a aplicação de ondas curtas, visando a geração de um protocolo de tratamento inovador, via hipertermia, para o tratamento de lesões de leishmaniose cutânea. Para tanto, foram realizados, além da síntese das nanopartículas, ensaios de caracterização, que incluem, entre outros, microscopia de varredura, via FEG; difração de Raio-X; espectroscopia na região do infravermelho (FTIR); espectroscopia de Möusbauer e medidas magnéticas (ZFC). Ensaios de definição de parâmetro de ondas-curtas e ensaios de viabilidade celular in vitro, com e sem o uso de ondas curtas, também foram realizados. Os resultados do FEG revelaram uma estrutura bem ordenada de nanopartículas, com diâmetro médio na ordem de 60nm. Os dados de difração de raio-X, juntamente com Möusbauer, indicaram o estado de oxidação e fase cristalina do oxido de ferro compatível com uma amostra pura de maghemita. As medidas do FTIR indicaram adsorção dos ligantes às nanopartículas, sobretudo quando revestidas com ácido glicurônico. As medidas de magnetização por ZFC indicaram, em todas as amostras, propriedades magnéticas compatíveis com regime ferromagnético e magnetização de saturação entre 56 e 59 emu/g, indicando que esses materiais quando expostos à um campo eletromagnético alternado permitirão a hipertermia. Por fim, os ensaios in vitro indicaram um real efeito leishmanicida quando as nanopartículas puras ou revestidas foram expostas ao campo magnético alternado do ondas-curtas por 30 minutos, o que gerou hipertermia e consequente morte do patógeno. Diante do exposto, é possível concluir que a aplicação do método leishmanicida proposto indicou um alto potencial de utilização para o tratamento de lesões de leishmaniose cutânea via hipertermia por ondas-curtas com nanopartículas de maghemita.

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