Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:54:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 330549.pdf: 2250244 bytes, checksum: 52aafb6ef597f19f359fe112a89bcdc1 (MD5) Previous issue date: 2014 / Glifosato é um dos herbicidas mais usados no Brasil, sendo altamente solúvel em água e quando aplicado em ambiente terrestre e aéreo pode ocorrer a sua infiltração no solo e a percolação para os corpos d'água, atingindo diferentes organismos aquáticos não-alvos, como invertebrados e vertebrados. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do glifosato, na concentração de 65 µg/L, sobre a organização estrutural e ultraestrutural, bem como sobre os parâmetros bioquímicos de toxicidade nos ovários do peixe Danio rerio. Esta concentração foi estabelecida pelo CONAMA como a máxima permitida para os rios do Brasil. As células germinativas foram caracterizadas em quatro fases: ovogônia, ovócito pré-vitelogênico I, ovócito pré-vitelogênico II e ovócito vitelogênico, baseado em critérios morfológicos já estabelecidos na literatura. Verificou-se um aumento significativo no diâmetro dos ovócitos pré-vitelogênicos I e nos ovócitos vitelogênicos, assim como um aumento significativo no índice gonadossomático (IGS) em ovários de peixes expostos ao glifosato por um período de 15 dias (exposição subcrônica). Na análise estrutural das células germinativas não foram identificadas alterações morfológicas, porém na análise ultraestrutural, observou-se no citoplasma dos ovócitos formações membranosas concêntricas tipo myelin-like, associadas aos grânulos de vitelo periféricos, além de alterações nas cisterna dos corpos de Golgi. Houve também redução do número de mitocôndrias e cristas mitocondriais nas células foliculares. Constatou-se maior expressão de SF-1, em ovários expostos ao glifosato. Identificou-se também um aumento significativo no número de células imunomarcadas com o anticorpo anti-Bak, porém um número significativamente menor de células imunomarcadas com o anticorpo anti-Bcl2. Na exposição dos peixes ao glifosato por um período de 96 h (exposição aguda), identificou-se redução nos níveis de tióis não proteicos (NPSH) e um aumento significativo nos níveis de substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico (TBARS), caracterizando estresse oxidativo. Na exposição por um período de 360 h (15 dias), não houve a caracterização de estresse oxidativo. Mesmo na concentração de glifosato regulamentada para os rios do Brasil, efeitos subletais foram identificados nos ovários, sendo reconhecidos usando ferramentas bioquímicas e ultraestruturais. Desta forma, estas análises devem ser realizadas em testes toxicológicos na avaliação de parâmetros reprodutivos. Os efeitos adversos do glifosato sobre os ovócitos e as células foliculares demonstradas aqui representam um importante risco para a reprodução de peixes.<br> / Abstract: Glyphosate is one of the most commonly used herbicides in Brazil, being highly soluble in water and when applied in aerial and terrestrial environment can occur its infiltration into the soil and the percolation to the bodies of water, reaching different non-target aquatic organisms, such as invertebrates and vertebrates. The main goal of this study was to evaluate the effects of glyphosate, at a concentration of 65 µg/L, on structural and ultra-structural organization, as well as on the biochemical parameters of toxicity on the ovaries of the fish Danio rerio. This concentration was established by CONAMA as the maximum allowable for the Brazilian rivers. The germ cells were characterized in four stages: oogonia, previtellogenic I oocyte, previtellogenic II oocyte and vitellogenic oocyte, based on morphological criteria previously established on the literature. A significant increase on the diameter of the previtellogenic I and vitellogenic oocytes was verified, as well as a significant increase in the gonadosomatic index (GSI) in the ovaries of the fish exposed to the glyphosate for a 15 days period (sub-chronic exposure). In the structural analysis of the germ cells, morphologic changes were not identified. However, in ultrastructural analysis, concentric membranous formation of myelin-like kind were observed on the cytoplasm of the oocytes, associated to the peripheral yolk granules, and also morphological change Golgi cisterns. In follicular cells reduction on the number of mitochondria and mitochondrial cristae observed. In this analysis, it was also observed with. It was observed greater SF-1 expression in ovaries exposed to glyphosate. It was also identified a significant increase in the number of immunostained cells with the anti-Bak antibody, but a significantly lower number of immunostained cells with antibody anti-Bcl2. On exposure of fish to glyphosate for 96 hours (acute exposure), it was identified a reduction in levels of non-protein sulfhydryl (NPSH) and a significant increase in levels of thiobarbituric acid reactive substances (TBARS), featuring oxidative stress. On exposure of a period of 360 hours (15 days), there was no characterization of oxidative stress. Even with the glyphosate concentration regulated to Brazil's rivers, sublethal effects were identified on the ovaries, being recognized using biochemistry and ultrastructural tools. In this way, these analyses should be carried out in toxicological evaluation of reproductive parameters. The adverse effects of glyphosate on the oocytes and follicular cells shown here represent a major risk for the reproduction of fish.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:19:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328456.pdf: 1966427 bytes, checksum: 77c8c494fb6f3bed0000a38e7d9c2cef (MD5) Previous issue date: 2014 / Amauroderma é um gênero de macrofungos poliporoides de Ganodermataceae caracterizado por apresentar basidiomas sésseis a estipitados, com coloração em diferentes tons de marrom, sistema hifal dimítico, basidiósporos globosos, elipsoides a oblongos, hialinos a amarelados e com dupla parede, onde o endósporo é ornamentado (uma espécie apresenta endósporo liso). O gênero está distribuído em regiões tropicais e subtropicais, geralmente associados a raízes de árvores vivas ou mortas, mas também ocorrendo em troncos mortos. Apesar de bem delimitado morfologicamente, nenhuma análise filogenética do gênero foi realizada até o momento e suas relações em Ganodermataceae são assumidas por apenas três espécies. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos e filogenéticos sobre Amauroderma, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestrurais) bem como filogenéticas moleculares. Ao todo, foram revisados 144 espécimes (coletas e coleções de herbário), representando 17 espécies de Amauroderma e cinco de gêneros relacionados. Dentre estes, duas novas espécies são propostas, Amauroderma calcitum Ad int. com morfologia intermediária a A. partitum e A. calcigenum, e A. opacaespitosa Ad int., caracterizada por apresentar hábito cespitoso, basidiomas opacos com contexto marrom, sem linhas e esporos amplamente elipsoides. Também é proposta a sinonimização de A. omphalodes em A. camerarium, bem como são apresentados novos registros para o domínio fitogeográfico do Cerrado e para a Argentina. Por fim, é apresentada uma filogenia (ITS, LSU e ITS+LSU) com a proposição de um gênero novo (Foraminisporus Ad int.) e uma nova combinação (F. sprucei Ad int.), caracterizados por apresentar colunas endospóricas ocas, sendo esta uma sinapomorfia dos táxons. Ainda, Amauroderma é considerado um táxon polifilético. A partir dos resultados apresentados aqui, nota-se a eminente possibilidade de novidades científicas, tanto a nível específico quanto a nível genérico, bem como a necessidade de estudos que envolvam análises morfológicas (macro, micro e ultraestrutural) e moleculares com múltiplos marcadores.<br> / Abstract : Amauroderma is a polypore macrofungi genus oin theGanodermataceae characterized by sessile to stipitate basidiomata, dimitic hyphal system, and globose, ellipsoid to oblong, hyaline to yellowish, double-walled basidiospores with ornamented endospore (one species presents smooth endospore). Amauroderma occurs in tropical and sub-tropical regions, usually associated with roots of living or dead trees, also occurring in dead trunks. Despite its well morphological circumscription Amauroderma is phylogenetically understudied and its relationship in Ganodermataceae is based on few species. A taxonomic and phylogenetic approach of Amauroderma is presented, based on morphological (macro, micro and ultrastructure) and molecular analysis. Around 144 specimens (collections and herbarium material), representing 17 species of Amauroderma and five of related genera were studied. Two new species are proposed, Amauroderma calcitum Ad int. with intermediate morphology of A. partitum and A. calcigenum, and A. opacaespitosa Ad int., characterized by caespitose habbit, dull basidiomata with brown context without bands and broadly ellipsoid basidiospores. Furthermore, the synonym of A. omphalodes in A. camerarium is also proposed, as well as new records for Brazilian Cerrado and for Argentina. Finally, in a preliminary phylogenetic point of view Amauroderma is considered polyphyletic. Considering the results presented here is possible to observed that there are many scientific novelties among the Ganodermataceae (specific and generic level) and some of them are possible to see only using a detailed morphology combined with molecular studies.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-09-15T04:08:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334387.pdf: 2427839 bytes, checksum: d0ccfb04524cf81de776204eccbf0b9c (MD5) Previous issue date: 2015 / Os metais pesados, como cádmio, cobre e chumbo estão entre os poluentes mais comuns encontrados nos efluentes industriais e urbanos. Altas concentrações destes metais podem causar efeitos tóxicos graves, especialmente para os organismos que vivem nos ecossistemas aquáticos. Estes metais são encontrados com maior frequência no meio aquático e são considerados contaminantes ambientais que podem afetar o desenvolvimento, o crescimento, a fotossíntese e a respiração, organização celular e a morfologia de algas. As algas G. floridanum, H. musciformis e P. flagellifera possuem importância econômica por produzirem ágar, carragenana e compostos secundários halogenados, respectivamente. O presente estudo avaliou os efeitos fisiológicos, estruturais e ultraestruturais de Cd, Cu e Pb em G. floridanum, Cu e Pb em H. musciformis e Pb sob duas irradiâncias em P. flagellifera. Os experimentos com G. floridanum e H. musciformis foram realizados com PAR de 80 µmol fótons m-2.s-1 durante sete dias. Para G. floridanum foram utilizadas as concentrações de 50 e 100 ?M de Cd, Cu e Pb. Para H. musciformis e 0,05 e 0,1 mg.Kg-1 de Cu e 3,5 e 7 mg.Kg-1 de Pb. Para os experimentos com P. flagellifera foram realizados tratamentos e 0,5; 2,5 e 12,5 mg.Kg-1 de Pb sob as PAR de 50 e 100 µmol fótons m-2.s-1. As amostras de G. floridanum expostas ao Cd, Cu e Pb mostraram despigmentação do talo, alteração do cloroplasto, degeneração dos tilacóides, e diminuição em pigmentos fotossintéticos, tais como clorofila a e ficobiliproteínas, em amostras tratadas com Cd e Cu. Além disso, a espessura da parede da célula e a quantidade de plastoglóbulos aumentou. A microanálise de raios X (EDS) detectou Cd, Cu e Pb absorvidos pelas paredes celulares. Já nas amostras de H. musciformis, observou-se várias alterações intracelulares decorrentes da exposição ao chumbo e cobre, incluindo diminuição da ficobiliproteínas, bem como danos aos tilacóides. Além disso, a quantidade de carotenóides, flavonóides e compostos fenólicos foram diminuídos, como um reflexo aparente da mudança de rota metabólica para a produção de antioxidantes contra espécies reativas de oxigênio. A exposição ao cobre e chumbo também causou um aumento do número de grãos de amido das florídeas. Observou-se ainda, uma diminuição das taxas de crescimento de H. musciformis. Quanto ao experimento com P. flagellifera a PAR de 100 µmol fótons m-2.s-1 promoveu uma diminuição na quantidade de ficobiliproteínas, aumento na quantidade de clorofila a e carotenóides, promoveu leve aumento da viabilidade celular quando comparado com a irradiância de 50 µmol fótons m-2.s-1. Com maior intensidade de PAR, os tratamentos com Pb tiveram respostas mais intensas, como maior diminuição de taxa de crescimento. Os tratamentos com metais indicaram que tanto o Cd como Pb afetam negativamente o desempenho metabólico e a ultraestrutura celular de G. floridanum e porém o mais tóxico foi Cu. Para H. musciformis, no entanto, os resultados indicaram diferente susceptibilidade a diferentes concentrações de cobre e chumbo, sendo o Cu também o mais tóxico para esta espécie. Quanto ao efeito de Pb em P. flagellifera, os resultados se mostraram mais intensos no tratamento com maior concentração de Pb tratado sob PAR de 100 µmol fótons m-2.s-1.<br> / Abstract : Heavy metals such as cadmium, copper and lead are among the most common pollutants found in both industrial and urban effluents. High concentrations of these metals cause serious toxic effects, especially for organisms living in the aquatic ecosystem. These metals are most often found as environmental contaminants, and they have been shown to cause to affect the development, growth, photosynthesis and respiration, cellular organization and morphological algae. Algae G. floridanum, H. musciformis and P. flagellifera have economic importance for producing agar, carrageenan and halogenated compounds side, respectively. This study evaluated physiological and ultrastructural effects of Cd, Cu and Pb in G. floridanum, Cu and Pb in H. musciformis and Pb in two irradiances in P. flagellifera. The experiments with G. floridanum and H. musciformis were performed with PAR 80 ?mol photons m-2.s-1 for seven days. For G. floridanum were used concentrations of 50 and 100 ?M of Cd, Cu and Pb. For H. musciformis and 0.05 and 0.1 mg.Kg-1 Cu and 3.5 to 7 mg.Kg-1 Pb. For the experiments with P. flagellifera treatments were performed and 0.5, 2.5 and 12.5 mg.Kg-1 of Pb under the PAR 50 and 100 ?mol photons m-2.s-1. G. floridanum samples exposed to Cd, Cu and Pb shown depigmentation of the stem, change the chloroplast thylakoid degeneration, and decrease in photosynthetic pigments such as chlorophyll and phycobiliproteins, in samples treated with Cd and Cu. Furthermore, the thickness of the cell wall and the amount of plastoglobuli increased. The X-ray microanalysis (EDS) found Cd, Cu and Pb absorbed by the cell walls. Already in the samples of H. musciformis, several intracellular changes was observed from exposure to lead and copper, including decreased phycobiliproteins as well as damage to the thylakoids. Furthermore, the amount of carotenoids, flavonoids and phenolic compounds were decreased as a reflection of apparent change in the metabolic pathway for the production of antioxidants against reactive oxygen species. The copper and lead exposure also caused an increase in the number of florideans starch grains. There was also a decrease in the growth rates of H. musciformis. As to experiment with P. flagellifera the PAR 100 ?mol photons m-2.s-1 promoted a reduction in the amount of phycobiliproteins, increasing the amount of chlorophyll carotenoids, promoted a slight increase in cell viability compared to irradiance 50 ?mol photons m-2.s-1. With higher intensity of PAR in Pb treatments had stronger responses as greater reduction in growth rate. Metal treatments indicated that both Cd and Pb adversely affect the metabolic performance and cell ultrastructure of G. floridanum and yet most toxic was Cu. H. musciformis, however, the results showed different susceptibility to different concentrations of copper and lead, and Cu also more toxic for this this species. As for Pb effect in P. flagellifera, the results were more intense in the treatment with 12.5 mg.Kg-1 Pb treated under PAR 100 ?mol photons m-2.s-1.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-06T04:07:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334511.pdf: 2300650 bytes, checksum: 6747c7df4c3183ffa477f50adaa3eda4 (MD5) Previous issue date: 2015 / Passiflora setacea e P. tenuifila são espécies silvestres de maracujás endêmicas do Brasil, com importantes propriedades medicinais. A P. setacea apresenta também potencial para o mercado consumidor devido à qualidade de seus frutos e a P. tenuifila tem sido indicada para o melhoramento genético. A produção de metabólitos secundários via cultura de tecidos in vitro tem sido investigada como uma alternativa à utilização de plantas produzidas no campo, pois oferece ferramentas para promover a otimização da produção. Assim, os objetivos deste estudo foram: analisar a histologia de calos de P. setacea induzidos em 2,4-D; determinar efeitos de diferentes concentrações de ANA e fontes de Carbono, quanto à morfo-histologia, ultraestrutura e teores de metabólitos de calos de P.tenuifila e; caracterizar, com base na ultraestrutura, como a Matriz Extracelular (ME) determina a desintegração das células dos calos friáveis de espécies de Passilfora. Para o estudo sobre indução e histologia, amostras de calos de P. setacea e P. tenuifila, obtidos a partir de diferentes tipos de explantes e meios de cultivo in vitro, foram fixadas em glutaraldeído 2,5% com tampão fosfato de sódio 0,1M, pH 7,2 e desidratadas. Para MO, amostras foram infiltradas em hidroxietilmetacrilato, seccionadas em micrótomo, coradas com azul de toluidina ou submetidas à reação com vermelho de rutênio, para identificar substâncias pécticas. Para análise em MEV, amostras foram secas em ponto crítico de CO2 e, para análise em MET, amostras de calos de P.tenuifila foram pós-fixadas em tetróxido de ósmio, infiltradas em resina Spurr, seccionadas em ultramicrótomo, contrastadas com Acetato de Uranila e Citrato de Chumbo. Calos de P. tenuifila com 45 dias foram coletados para determinar: percentagem de explantes que induziram calos, teor de água, acúmulo de biomassa, análise de metabólitos, atividade antioxidante por DPPH e a dosagem de clorofila. A percentagem mais elevada de explantes que formaram calos de P. setacea foi observada em 2,5 e 5,0 µM de 2,4-D. Calos obtidos a partir de segmentos de hipocótilo em 5,0 µM de 2,4-D e de segmento nodal foliar em 2,5 µM de 2,4-D mostraram características histológicas indicando grande potencial para morfogênese e produção de metabólitos secundários. Em estudo com calos de P. tenufila, todas as fontes de carbono e concentrações de ANA permitiram altas22percentagens de produção de calos, sem diferenças entre os tratamentos. Todos os calos apresentaram textura friável e características histológicas similares. Compostos fenólicos, flavonóides e carotenóides (luteína, zeaxantina e a-caroteno) foram detectados em calos de P. tenuifila. Atividade antioxidante não foi registrada. As características histológicas observadas sugerem que os calos de P.tenuifila, com 45 dias de cultivo, estavam em estádio inicial. No estudo sobre a ME verificamos sua constituição péctica. A superfície dos calos estava revestida com ME membranosa, com aspecto liso externamente e granular ou fibrilar internamente. O aspecto granular ou fibrilar decorre da desconexão entre células. A presença de golgi, vesículas na periferia da célula e evidências da liberação de substâncias e dissociação intercelular foram registradas ultraestruturalmente e sugerem que a consistência friável dos calos de Passiflora é resultante da desconexão das células periféricas.<br> / Abstract : Passiflora setacea and P. tenuifila are wild species of endemic passion fruit in Brazil, with important medicinal properties. P. setacea has also potential for the consumer market due to the quality of its fruit and P. tenuifila has been used for the genetic improvement. The production of secondary metabolites through in vitro tissue culture has been investigated as an alternative to the use of plants produced in the field, it provides tools for promoting the production optimization. The objectives of this study were to analyze the histology of P. setacea callus induced in 2,4-D; examine the effects of different concentrations of NAA and carbon sources in the morphological- histology, ultrastructure and level of metabolites in P.tenuifila callus and; to characterize, based on ultrastructure, how the Extracelular Matrix (EM) determines the disintegration of cells in friable callus of Passilfora species. For the study of induction and histology, samples of P. tenuifila and P. setacea callus, obtained from differents types of explants and in vitro culture media were fixed in 2.5% glutaraldehyde in sodium phosphate buffer 0, 1M, pH 7.2 and dried. For OM, the samples were infiltrated in methacrylate, sectioned with a microtome, stained with toluidine blue or subjected to reaction with ruthenium red to identify pectic substances. For SEM analysis, samples were dried in a critical point of CO2, and for TEM analysis, samples P.tenuifila callus were post-fixed in osmium tetroxide, infiltrated in Spurr resin, sectioned with ultramicrotome, contrasted with uranyl acetate and lead citrate. P.tenuifila calllus were collected with 45 days to determine: percentage of explants that to induced callus, water content, biomass accumulation, analysis of metabolites, antioxidant activity and measurement of chlorophyll. The highest percentage of explants that to induced P. setacea callus was observed at 2.5 and 5.0 uM of 2,4-D. Callus from hypocotyl segment in 5.0 µM 2,4-D and from leaf nodal segment in 2.5 µM 2,4-D showed histological characteristics indicate great potential for morphogenesis and secondary metabolite production. In the study with P. tenufila callus, all sources of carbon and NAA concentrations allowed high induction percentages, without differences between treatments. All callus showed friable texture and similar histological characteristics. Phenolic compounds, flavonoids and carotenoids (lutein, zeaxanthin and a-carotene) were detected in P. tenuifila callus.24Antioxidant activity wasn`t recorded. The histological characteristics suggest that P.tenuifila callus with 45 days were in inicial stage. In the study about the EM we found your pectic constitution. The surface of the callus was coated with EM membranous, with smooth appearance externally and granular or fibrillar internally. The granular or fibrillar aspect stems from the disconnect between cells. The presence of Golgi, vesicles at the periphery of the cell and evidence of release of substances and intercellular dissociation were recorded by ultrastructure study and suggest that the Passiflora friable callus is the result of disconnection of peripheral cells.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-20T03:11:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334839.pdf: 1729721 bytes, checksum: a3bf14567c43d3b7e79df1a52480079d (MD5) Previous issue date: 2015 / Leucoagaricus Locq. ex Singer é caracterizado morfologicamente pela margem do píleo inteira a finamente estriada mas nunca formando pregas, lamelas livres, presença de anel, além da ausência de fíbulas e de pseudoparáfises. De acordo com estas características, são incluídas 90 espécies no gênero. Este é um dos gêneros saprotróficos que ocupam o solo mais representativos nas regiões tropicais e subtropicais. Porém, algumas regiões ainda permanecem pouco estudadas e poucos dados sobre a diversidade e distribuição de Leucoagaricus estão disponíveis. Com o objetivo de contribuir para a ampliação do conhecimento sobre a diversidade, distribuição e taxonomia de Leucoagaricus, foi realizado um estudo dos táxons do gênero com base em coletas realizadas na Mata Atlântica Subtropical do Sul do Brasil. Foram identificados 21 espécimes correspondendo a um total de 10 táxons : Leucoagaricus aurantiacus Heinem., Leucoagaricus brunneocingulatus (P. D. Orton) Bon, Leucoagaricus caerulescens (Peck) J. F. Liang et al., Leucoagaricus georginae (W. G. Sm.) Candusso, Leucoagaricus glabridiscus (Sundb.) Wuilb., Leucoagaricus goossensiae (Beeli) Heinem., Leucoagaricus griseus Heinem., ?Leucoagaricus melanotrichus f. citrifolius? Courtec. (nom. inval.), ?Lepiota besseyi? H. V. Sm. & N. S. Weber e ?Lepiota roseolivida? Murrill. São apresentadas fotografias ou desenhos dos basidiomas de todos os todos os táxons tratados, além de descrições macro e micromorfológicas com ilustrações.<br> / Abstract : Leucoagaricus Locq. ex Singer is morphologically characterized by entire or softly striate but not plicate pileus margin, free lamellae, presence of a ring, and absence of clamp connections and pseudoparaphyses. According to these features, 90 species are included in the genus. This is one of the most representative saprotrophic genera that colonized soil in tropical and subtropical forests. However, some regions are still understudied and few data regarding their diversity and distribution are available. In order to improve the knowledge about the diversity, distribution and taxonomy of Leucoagaricus from the subtropical Atlantic Forest in Southern Brazil. Twenty-one specimens were identified corresponding to a total of ten taxa: Leucoagaricus aurantiacus Heinem., Leucoagaricus brunneocingulatus (P. D. Orton) Bom, Leucoagaricus coerulescens (Peck) J. F. Liang et al., Leucoagaricus georginae (W. G. Sm.) Candusso, Leucoagaricus glabridiscus (Sundb.) Wuilb., Leucoagaricus goossensiae (Beeli) Heinem., Leucoagaricus griseus Heinem. ?Leucoagaricus melanotrichus f. citrifolius? Courtec. (nom. inval.), ?Lepiota besseyi? H. V. Sm. & N. S. Weber and ?Lepiota roseolivida? Murrill. Photographs or drawings of the basidiomes and macro and microscopic descriptions are presented for the taxa.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015 / Made available in DSpace on 2016-02-09T03:15:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337161.pdf: 1491998 bytes, checksum: 63fd33c3720b988200a0202995d42f61 (MD5) Previous issue date: 2015 / Os fungos entomopatógenos (Hypocreales, Ascomycota), conhecidos de modo geral como Cordyceps s.l., utilizam diferentes espécies de artrópodes como hospedeiros, onde desenvolvem parte do seu ciclo de vida. São responsáveis pelo equilíbrio de populações de insetos, contaminam os insetos hospedeiros e utilizam seus corpos como substrato para a produção de estruturas reprodutivas sexuais e ou assexuais. Os estudos sobre Cordyceps s.l. no Brasil são antigos ou escassos para uma diversidade potencialmente grande. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento desses fungos no Brasil e na região Neotropical, foram estudados aspectos sobre ecologia, morfologia e molecular de Cordyceps s.l. com foco em um táxon em especial, pertencente ao gênero Ophiocordyceps. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora é morfologicamente caracterizado por apresentar estipe filiforme, preto, com a região fértil bem delimitada, intumescida, vermelha. Foi descrita a partir de espécimes do Japão e é comumente encontrado na Coréia em meio à serapilheira, parasitando obrigatoriamente insetos da ordem Hemiptera. No Brasil espécimes morfologicamente relacionados vêm sendo coletados, parasitando a mesma ordem de insetos, e sendo assim previamente determinados como o táxon asiático, O. nutans. A fim de confirmar se o táxon que ocorre no Brasil representa a mesma espécie coletada no Japão foram coletados mais de 100 espécimes com morfologia semelhante a O. nutans. Foram realizadas análises morfológicas e moleculares, bem como a obtenção de culturas, os dados ecológicos também foram considerados neste estudo. No capítulo 1, são apresentadas evidências de que o táxon corresponda a um complexo de espécies crípticas, composto por duas linhagens Asiáticas e uma linhagem Neotropical. No capítulo 2, com base na filogenia gerada a partir de sequências ITS de DNA ribossomal, provenientes de espécimes Asiáticos e Brasileiros, foram observadas as três linhagens mencionadas, sendo, por tanto, proposta a espécie nova, Ophiocordyceps neonutans sp. nov. ad int. No capítulo 3 é apresentada uma possível nova espécie de Ophiocordyceps, que parasita insetos da ordem Hemiptera, no entanto da subordem Homoptera. Os peritécios ovoides e os esporos fusoides são as principais características diagnósticas desta espécie. Por fim, considerando o apresentado, os registros de O. nutans para o resto do mundo precisam ser revisados. Além disso, novas coletas e análises moleculares (multiloci) deste complexo se fazem necessárias, principalmente considerando as evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) para o entendimento das linhagens como espécies a serem descritas.<br> / Abstract : The entomopathogenic fungi (Hypocreales, Ascomycota), broadly known as Cordyceps s.l, use different arthropod species as hosts, where they develop part of their life cycle. Responsible for the balance of insect populations, they infect specific hosts contaminating their bodies using it as a substrate for production of sexual or asexual reproductive structures. Under the research project MICOLAB / UFSC which aims to contribute to the knowledge of these fungi in Brazil and in the Neotropics were studied aspects of ecology, morphology and molecular in Cordyceps s.l. focusing on a taxon in particular belonging to Ophiocordyceps genre. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora 2007 is morphologically characterized by having threadlike stipe, black, with a fertile region well delimited swollen, red. It was described from Japan specimens and is commonly found in Korea amid the leaf litter, necessarily parasite insects of the order Hemiptera. In Brazil morphologically related specimens have been collected, parasitizing the same order of insects, so they were predetermined as the Asian taxon, O. nutans. In order to confirm if the taxon that occurs in Brazil is the same species collected in Japan, were collected in Brazilian field expeditions more than 100 specimens with similar morphology to O. nutans. Morphological and molecular analyzes were performed, as well as obtaining cultures, ecological data were also considered in this study. In Chapter 1, evidence were presented that the taxon corresponds to a complex of cryptic species, composed of 2 Asian lineages and one geographically distinct Neotropical lineage of Ophiocordyceps nutans. In chapter 2, based on the phylogeny generated from ribosomal DNA ITS sequences, from Asian and Brazilian specimens. Three distinct lineages were observed, and was proposed a new species. Ophiocordyceps neonutans sp. nov. Ad int. parasitizing Pentatomidae (Hemiptera) in Brazilian territory. Chapter 3 presents a possible new species of Ophiocordyceps that parasitizes insects of the Hemiptera order, however in the suborder Homoptera. Perithecia ovoid and fusiform spores are the main diagnostic features of this species. Finally, considering the presented, O. nutans records for the rest of the world need to be reviewed. In addition, new collections and molecular analyzes (multiloci) of this complex are necessary, especially considering the ecological evidence (Host and geographical distribution) to understand the lineages as species to be described.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-04-19T04:12:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337932.pdf: 2390116 bytes, checksum: 30038e57b21fee52eab77f33b1446cb0 (MD5) Previous issue date: 2015 / Ophiocordyceps representa o maior e mais variado táxon de Ophiocordycipitaceae, tanto morfologico quanto ecologicamente. Ophiocordyceps dipterigena foi descrito por Berkeley e Broome (Cordyceps dipterigena), em 1875, a partir de um material coletado em uma mosca adulta no Sri Lanka (Ceilão). Atualmente o táxon, apresentando distribuição pantropical, é caráterizado morfologicamente pelos estromas filiformes, capitados, marrom alaranjados a amarelados, região fértil terminal, hemisférica e bem definida. Apresenta uma ampla variedade de hospedeiros (moscas adultas) e atualmente possui seis sinônimos heterotípicos. Apesar das evidências de um complexo taxonômico, nenhum estudo mais aprofundado (morfológico e molecular) foi realizado com este táxon até o momento. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos, ecológicos e filogenéticos sobre O. dipterigena, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestruturais) e de biologia molecular. Ao todo, foram revisados 84 materiais parasitas de moscas adultas de espécimes morfologicamente e ecologicamente próxima de O. dipterigena. Uma filogenia (ITS) do complexo O. dipterigena é apresentada, assim como uma discussão geral sobre diferentes possíveis novos táxons existentes. Novos caráteres relevantes para a interpretação de hipóteses de espécies são apresentados. O nome Cordyceps muscicola é resgatado da sinonímia de O. dipterigena sendo caráterizada por parasitar moscas grandes, geralmente aderidas na superfície abaxial, mas sempre com micélio recobrindo todo hospedeiro, até o momento ocorrente na Floresta Ombrófila Densa do território Catarinense. Além da lectotipificação do desenho do protólogo de C. muscicola e da epitipificação de um espécime da localidade do tipo (Blumenau) a espécie é combinada em Ophiocordyceps, O. muscicola. Outras três espécies (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 e sp. 3), que se diferenciam no complexo O. dipterigena, são apresentadas, são caráterizadas pela combinação de caráteres morfológicos e ecológicos. Outras possíveis espécies novas são discutidas. Este trabalho demonstra uma grande diversidade no complexo O. dipterigena e prevê o elevado potencial de revelar uma diversidade maior ainda com pesquisas futuras.<br> / Abstract : Ophiocordyceps is the largest and most varied taxon of Ophiocordycipitaceae, both morphologically and ecologically. Ophiocordyceps dipterigena was described by Berkeley and Broome (as Cordyceps dipterigena) in 1875 from material collected on an adult fly in Sri Lanka (Ceylon). Currently, the taxon presents pantropical distribution and is morphologically characterized by having filiform, capitate, orange-brown to yellowish stromata and a terminal, hemispheric, well defined fertile region. Ophiocordyceps dipterigena occurs on a wide variety of hosts (adult flies) and currently has six heterotypic synonyms. Despite the evidence of a possible taxonomic complex, no detailed investigation into the possibility of cryptic species has yet been conducted. This work offers the first comprehensive taxonomic, ecological and phylogenetic treatment of the O. dipterigena complex, supported by morphological and molecular analyses. In all, eighty-five collections morphologically and ecologically related to O. dipterigena were examined. A phylogeny (ITS) of the O. dipterigena complex is presented, as well as a general discussion on potentially new taxa in the complex. New characters relevant to the interpretation of species hypotheses are presented. The name Cordyceps muscicola is recovered from synonymy with O. dipterigena, characterized by a thoroughly myceliated host which often adheres to the abaxial surface of leaves, until the moment occurring in the Ombrophilous Dense Forest territory of Santa Catarina. In addition to the lectotypification of the protologue drawing of C. muscicola and epityfication of a specimen from the type locality (Atlantic rainforest of Blumenau), the species is recombined in Ophiocordyceps as O. muscicola. Three additional species are described (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 and sp. 3) which differ in the O. dipterigena complex on the basis of morphological and ecological characters. Other possible new species are discussed. This work demonstrates both a greater diversity within O. dipterigena complex than previously considered, and forecasts the high potential for revealing greater diversity with further research.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas. Programa de Pós-Graduação em Filosofia. / Made available in DSpace on 2012-10-26T11:15:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 310440.pdf: 3442278 bytes, checksum: ee966030d04ec43a7351f510d2d70e4a (MD5) / Este trabalho pretende responder à pergunta: como é possível que os nomes dos táxons biológicos sejam usados para se referir às entidades a que se referem? Para tanto, começamos, no capítulo 1, pela análise do conceito de linhagem biológica, argumentando que ele deve ser primordialmente entendido no sentido monofilético, isto é, o de que uma linhagem é um grupo formado por um ancestral e todos seus descendentes. Apresentamos então a ideia de que os táxons são, contemporaneamente, concebidos como linhagens e, portanto, seu estatuto ontológico não é o de classes naturais, mas sim o de entidades históricas individuais. Essa tese foi famosamente defendida por Ghiselin e Hull, mas o mais importante para os propósitos deste trabalho é o lugar central que ela ocupa na teoria da sistemática filogenética proposta por Willi Hennig. Comentamos alguns dos aspectos da ontologia que embasa a teoria de Hennig, e, no final do capítulo, levantamos algumas consequências da tese da individualidade. Uma dessas consequências, a ideia de que os nomes dos táxons são próprios, é apresentada por Ghiselin e Hull em associação com a teoria causal da referência, na tentativa de argumentar que os táxons não têm propriedades definitórias (essências). Desse modo, no capítulo 2, analisamos as duas principiais teorias da referência para nomes próprios - descritivista e causal-histórica - e o modo como elas são defendidas por diferentes autores. De acordo com a visão descritivista, a relação entre um nome próprio e seu portador é mediada por um componente epistemológico, em geral entendido como um conjunto de representações (de natureza linguística ou não) do portador. Para a teoria causal-histórica, por outro lado, um nome próprio se refere a seu portador em todos mundos possíveis, ou seja, independentemente do conhecimento que tenhamos das propriedades ou feitos do portador. Há, no entanto, um problema para uma defesa da teoria causal no caso dos nomes dos táxons biológicos. Trata-se do conhecido "problema qua": se não houver a mediação de um critério de identidade para o objeto nomeado, o referente do nome não pode ser identificado de modo inequívoco. Assim, no capítulo 3, defenderemos uma teoria da referência híbrida para os nomes de táxons, segundo a qual há dois elementos que compõem os sentidos desses nomes: critérios de aplicação e critérios de identidade. No sistema nomenclatural lineano, atualmente aceito, os critérios de aplicação são associados aos nomes por efeito dos códigos de nomenclatura. Os critérios de identidade, por outro lado, são contribuídos pelo contexto teórico circundante. Comparamos esse sistema com o PhyloCode, uma proposta recente de sistema nomenclatural na qual os nomes dos táxons seriam definidos filogeneticamente, isto é, em função de sua posição relativa na árvore da vida. Argumentaremos que a rejeição do PhyloCode por parte da comunidade de biólogos se deve ao fato de que esse código transforma critérios de identidade em critérios de aplicação, o que é heuristicamente indesejável para a sistemática filogenética. Entretanto, isso não implica que a ideia de que é possível estabelecer critérios de identidade deva ser rejeitada. Pensamos que a visão mínima de que é possível fornecer critérios de identidade para táxons pode ser apropriadamente chamada de essencialismo sobre táxons biológicos, e nossa defesa dela constitui uma segunda linha de argumentação do capítulo 3. O ponto é que se costuma entender a tese da individualidade das espécies como tendo refutado definitivamente o essencialismo. Entretanto, argumentaremos que essencialismo e antiessencialismo são posições sobre critérios de identidade, e não sobre o estatuto ontológico, das entidades. A tese da individualidade, pensamos, é insuficiente para a refutação do essencialismo. Para tanto, seria necessário defender que é impossível estabelecer critérios de identidade para os táxons. Terminamos com algumas respostas a essa objeção. / The object of this work is to answer the question: how is it possible that the names of biological taxa refer to the entities that they do refer to? In order to address the question, we begin the first chapter by analyzing the concept of biological lineage, arguing that it should be understood in a monophyletic sense, that is, a lineage is a group constituted by an ancestor and all of its descendants.We then present the idea that taxa are contemporarily construed as lineages; therefore, their ontological status is that of individual historical entities, and not of natural kinds. This thesis was famously defended by Ghiselin and Hull, but, for our present purposes, its meaningfullness lies in the fact that it plays a prominent role in Willi Hennig's theory of phylogenetic systematics. We present some of the aspects of Hennig's ontology and then, towards the end of the chapter, address some consequences of the individuality thesis. One of these consequences, namely, the idea that the names of biological taxa are proper, is presented by Ghiselin and Hull in association with the causal theory of reference, in an attempt to argue that taxa have no defining properties (i.e., essences). In chapter 2, we present the two main philosophical theories of reference for proper names - the descriptivist and causal-historical theories. According to the descriptivist view, the relation of reference is mediated by an epistemological component, generally understood to be a set of representations of the name-bearer. For the causal-historical theory, on the other hand, a proper name refers to its bearer in all possibile worlds, independently of any knowledge we may have about the properties or doings of the bearer. The causal theory, when held for proper names of taxa, faces a well-known difficulty, the so-called qua-problem: if reference is a direct relation, unmediated by at least a criterion of identity for the namebearer, it cannot be inequivocally identified. Thus, in chapter 3, we attempt to provide a hybrid theory of reference that is designed to address the qua-problem. According to this theory, taxon names have Fregean senses composed of two elements: a criterion of application and a criterion of identity. Criteria of application are provided by the nomenclatural codes when at reference-fixing events.Criteria of identity are contributed by the surrounding theoretical context. From the viewpoint of the theory thus provided, we compare current nomenclatural codes with the PhyloCode. We argue one of the main reasons for the lack of acceptance towards the PhyloCode may be the fact that it converts identity criteria into criteria of application. This conversion is undesirable for the heuristics of phylogenetic systematics. Nonetheless, one should not conclude that it is impossible to establish identity criteria for biological taxa. We construe essentialism as a position concerning identity criteria, not ontological status. That consitutes a second line of argument taken up in chapter 3. The point is that the adoption of the individuality thesis does not automatically refute essentialism. In order to do so, one must defend that criteria of identity for biological taxa are unavailable.We conclude by addressing that possibility, in the version presented by Ereshefsky.We defend that the objection is untenable on the grounds that (1) it rests on an unreasonable demand for identity criteria and (2) it brings the qua-problem back.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal / Made available in DSpace on 2013-03-04T17:53:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 305157.pdf: 943356 bytes, checksum: 6c5f0c33d5538ed2210c9e6df94896ad (MD5) / O efeito sinérgico dos fatores temperatura e impactos da urbanização foram testados in vitro em uma espécie de macroalga vermelha de importância econômica para extração de kappa carragenana, Hypnea musciformis (Wulfen) J. V. Lamouroux. Múltiplos ensaios de 96 hs foram realizados expondo a alga a extremos de temperaturas e a águas de ambientes urbanos considerando regiões com e sem saneamento básico, para verificação dos danos fisiológicos e morfológicos causados. Utilizou-se a fluorometria de pulso modulado (PAM), Oxigênio dissolvido, taxa de crescimento vegetativo, concentração de pigmentos, microscopia confocal e de luz para a caracterização e avaliação dos efeitos dos fatores em análise combinados e isoladamente sobre o desempenho fisiológico da planta. Os resultados indicam que houve estresse fisiológico em Hypnea musciformis com fotoinibição principalmente quando combinados temperaturas extremas e ambientes urbanos não saneados. Os danos maiores causados foram os relacionados aos tratamentos da temperatura extrema de 35°C sobre os parâmetros fotossintéticos (Fmax,Fv/Fm,?,?) os quais sofreram drásticas reduções quando comparados aos tratamentos de 25°C. O mesmo padrão de resultados foi observado para o oxigênio, onde os menores valores de oxigênio dissolvido para H.musciformis ocorreu na temperatura de 35°C e maiores para incubações de H.musciformis com máximo obtido 5,12 mg.L-1. Considerando a análise de componentes principais (PCA), o fator temperatura representou o eixo II explicativo responsável pelo entendimento de 19% da distribuição dos dados. O eixo I representou 65,03% da variação do conjunto de dados correlacionados, representado pelos nutrientes (nitrato, fosfato e nitrogênio amoniacal). A exposição aos tratamentos provocou o aumento da espessura da parede celular, redução do amido das florídeas e o aumento de algas endofíticas após o rompimento da mucilagem. As concentrações dos pigmentos fotossintetizantes, carotenóides e ficobiliproteínas tiveram estimulas a sua síntese, sofrendo reduções somente a 35°C em relação ao controle. A clorofila a manteve suas concentrações constantes em relação ao controle com redução na temperatura mais elevada para os tratamentos, principalmente na área urbana não saneada. Conclui-se que os impactos derivados da urbanização em áreas não saneadas e temperaturas extremas afetaram negativamente o desempenho fisiológico e a organização celular de H.musciformis. / The synergistic effect of temperature factors and impacts of urbanization were tested in vitro with a species of red seaweed of economic importance for the extraction of kappa carrageenan Hypnea musciformis. Multiple assays were performed 96 hours exposing the algae to extreme temperatures and water environments considering urban regions with and without basic sanitation, for verification of the physiological and morphological damage caused. We used a pulsemodulated fluorometry (PAM),dissolved oxygen, its growth rate, pigment concentration, and Light Confocal Microscopy for the characterization and assessment of the effects of factors combined and analyzed separately on the physiological performance of the plant. The results indicate that there were physiological stress in Hypnea musciformis photoinhibition especially when combined with extreme temperatures in urban environments and not sanitized. The damage caused were more related to the treatment of extreme temperature of 35°C on the photosynthetic parameters (Fmax, Fv / Fm, â, á) who suffered drastic reduction when compared to treatments of 25°C. The same pattern of results was seen for the oxygen dissolved, where the lowest values for the H.musciformis to occur at a temperature of 35°C and values were higher for incubations H.musciformis obtained with a maximum 5,12 mg L-1. Considering the principal component analysis (PCA), the temperature factor represented axis II explanatory responsible for understanding 19% of the data distribution. Axis I represented 65.03% of the variation of the set of correlated data, represented by the nutrients (nitrate and ammonium phosphate). The exposure treatment caused an increase of the cell wall thickness, starch reduction, blooms of endophytic algae after the breaking of wall. The concentrations of photosynthetic pigments, carotenoids and phycobiliproteins were stimulus their synthesis, suffering only cuts at 35°C compared to control. The chlorophyll a concentrations remained constant in their relation to the control with a reduction in the higher temperature for treatments, mainly in urban areas was wiped out. We concludes that the impacts arising from urbanization in areas and extreme temperatures affected negatively the performance of physiological and cellular organization H.musciformis.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal / Made available in DSpace on 2013-07-16T01:07:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O processo de desenvolvimento de uma área científica pode ser analisado através de dados registrados ao longo do tempo, sob a forma escrita ou mesmo através de outras representações, sejam ideográficas ou pictográficas. Na Paleontologia observa-se, entretanto, na bibliografia brasileira, a ausência de dados precisos e consistentes sobre sua história em âmbito mundial (Carvalho, 2000 e Teixeira et al., 2000). Em geral, informações desta natureza correspondem apenas a breves citações contidas nos capítulos introdutórios das obras que versam sobre esta área de conhecimento. Sendo assim, o presente estudo objetivou interpretar historicamente o desenvolvimento científico do estudo dos fósseis, relacionando tais acontecimentos à evolução do pensamento científico durante a Pré-História (Gayrard-Valy, 1994; Oakley, 1965) e a História (Adams, 1938; Darwin, 1859; Edwards, 1967; Fairbridge & Jablonski, 1979; Gayrard-Valy, 1994; Mather & Manson 1939, Papavero et al. 1997, 2000; Rudwick 1972, 1979, 1985, 1992, 1997 a e b; Schneer 1969; Teixeira et al. 2000; Zittel, 1901). O estudo, em sendo uma revisão e sistematização destes dados, permitiu a correta compreensão e integração dos fatos históricos que influenciaram o desenvolvimento científico da Paleontologia objetivando responder em que momento histórico se tornou uma ciência. Entretanto preliminarmente se fez mister a compreensão de quais seriam os requisitos para tal constatação. A formulação de métodos e a elaboração de um programa científico parecem ser uma unanimidade entre os estudiosos da ciência, sejam historiadores ou filósofos. É a partir desta premissa que a investigação realizada neste trabalho se pautou, embora devam ser levados em consideração que outros preceitos também sejam necessários.