O camarão rosa (Farfantepenaeus subtilis) explotado pela pesca industrial na plataforma continental amazônica brasileira possui um ciclo de vida curto, mas complexo, habitando áreas oceânicas, mais ao norte da área de ocorrência, na fase adulta e larval, e áreas estuarinas e lagunares na fase de pós-larva e juvenil. O período de maior intensidade de reprodução se estende de maio a setembro e logo após a reprodução as larvas eclodem e iniciam sua migração para áreas costeiras, passando por diversas fases, onde se assentam e residem principalmente entre junho e outubro. A partir de setembro até janeiro do ano seguinte é maior a intensidade de recrutamento de juvenis às áreas oceânicas, onde passam a amadurecer e, a partir de dezembro, começam a ser capturados pela pesca industrial. A maior abundância da população adulta em termos de biomassa vai de março a agosto quando também se verificam as maiores capturas. As fêmeas crescem mais que os machos e estão presentes sempre em maior proporção nas capturas (61%). Os comprimentos assintóticos foram estimados em 231 mm ( k = 1,6 \'ano POT.-1\') e 205 mm (k = 0,94 \'ano POT.-1\'), para fêmeas e machos respectivamente. A população apresenta taxa de mortalidade natural relativamente elevada, 2,53 \'ano POT.-1\' para fêmeas e 1,83 \'ano POT.-1\' para machos, sendo observadas acentuadas flutuações de recrutamento e abundância, com evidências de que são fortemente governadas pelas condições ambientais. O estoque vem sendo explotado em níveis moderados nos anos recentes (E = 0,45), embora tenha sofrido elevadas taxas de explotação na década de 80, o que levou a uma redução do tamanho da população. O rendimento máximo sustentável, considerado uma média de longo prazo, foi estimado em 4.032 toneladas de cauda por ano, para um esforço de pesca de 19.370 dias de mar. Nos últimos anos, se observa uma tendência de recuperação da biomassa populacional, mas com as oscilações anuais características da espécie. A vazão do rio Amazonas é o fator ambiental que governa com mais intensidade as condições do ambiente costeiro na região e verificou-se que suas flutuações estão correlacionadas a alterações na abundância da população da espécie. Postula-se que o aporte e sobrevivência das larvas e pós-larvas no ambiente costeiro seja influenciada pela intensidade da vazão do rio. O período em que se assentam nos berçários na zona costeira coincide com a estação de vazante do rio, sendo a sobrevivência favorecida por vazões abaixo da média e vice-versa. Portanto, medidas de ordenamento voltadas para o uso sustentável do recurso devem estar associadas ao conhecimento das condições ambientais nesta fase, bem como a estudos sobre a abundância de pós-larvas e juvenis na faixa costeira. / The brown shrimp (Farfantepenaeus subtilis) exploited by the industrial fishery on the continental shelf of the Brazilian Amazon has a short but complex life cyele, inhabiting oceanic areas, at the north of the area of occurrence, during the adult and larval stages, and estuarine areas and lagoons in post-larval and juvenile. The period of highest intensity of reproduction extends from May to September and soon after the hatch, the larvae start their migration to coastal areas, passing through several stages, where they settle and remain resident between June and October. From September to January of the following year the intensity of recruitment to ocean areas is higher, and once there they start to mature and are caught by the industrial fishery from December on. The highest abundance of the adult population in terms of biomass is observed from March to August when the largest catches also occur. Females grow larger than males and are always present in greater proportion in catches (61%). The asymptotic lengths were estimated at 231 mm (k = 1.6 \'year POT.-1\') and 205 mm (k = 0.94 \'year POT.-1\') for females and males respectively. The population has a natural mortality rate relatively high, 2.53 \'year POT.-1\' for females and 1.83 \'years POT.-1\' for males, and pronounced fluctuations in recruitment and abundance are observed, with evidence of being strongly governed by environmental conditions. The stock has been exploited at moderate levels in recent years (E = 0.45), although it has suffered high rates of exploitation in the 80\'s, which led to a reduction in population size. The maximum sustainable yield, considered a long-term average, was estimated at 4,032 ton of tail per year for a fishing effort of 19,370 days at sea. In recent years, it is observed a tendency of recovering of the population biomass, but annual fluctuations are characteristics of the species. The flow of the Amazon River is the main environmental facto r that governs the conditions of the coastal environment in the region and it was found that it is correlated with the fluctuatícn of the brown shrimp population abundance. It is postulated that the uptake and survival of larvae and post larvae in the coastal environment is lnfluenced by the intensity of river flow, The period during which they settle at the nurseries in the coastal zone coincides with the dry season and their survival is favored when the flow of the river is below the average, and vice versa. Therefore, management measures aimed at sustainable use of the resource must be associated with the knowledge of environmental conditions during this phase, as well as studies on the abundance of post-larvae and juveniles in the coastal zone.

A aquicultura sofre diferentes pressões por um lado o impacto que as doenças causam na produção, e por outro a pressão por parte de grupos ambientalistas e do governo devido ao impacto ambiental. Diferentes soluções foram propostas para esses problemas como probióticos e imunoestimulantes para prevenir e controlar doenças com nenhum ou algum sucesso. Outra opção seria o biofloco para minimizar o impacto ambiental, com excelentes resultados zootécnicos. Porém não sabemos se o sistema de biofloco estimula ou inibe o sistema imune de camarões (Litopenaeus vannamei). Esse é o objetivo desse estudo, saber se o sistema de biofloco altera a contagem total e diferencial de hemócitos, os índices fagocíticos, utilizando ensaio de fagocitose in vitro com Sacaromises cerevisae e a produção de ânion superóxido pelo ensaio de Nitroblue tetrazolium (NBT). Na contagem total de hemócitos nos 2 primeiros meses os animais criados em água clara possuem uma contagem maior que os criados em biofloco enquanto que no 4° mês os animais de biofloco possuem uma contagem maior. Na contagem diferencial no 4°mês as células hialinas estão em maior porcentagem nos animais criados em biofloco enquanto que as granulares e simi-granulares estão em menor porcentagem nesses animais, quando comparamos com os animais criados em água clara. Os índices fagocíticos e a produção de ânion superóxido não apresentam diferença entre os animais criados em água clara e os criados em biofloco. / The aquaculture production suffers different pressure in one hand disease, and in the other its environment impact. Different solutions are offered to solve this problems such as probiotics and immunostimulant to prevent and control the diseases with some or no success. Another option is the biofloc to minimize its environmental impact, with excellent results to zootechincal characteristics. But it is not known whether biofloc stimulate or inhibits the shrimp (Litopenaeus vannamei) immune system. That is what our study aim to answer if the biofloc system affects or not the total and differential hemocytes count, the phagocityc indexes of in vitro phagocytosis with Sacaromises cerevisae and the production of superoxide anion with the Nitroblue Tetrazolium (NBT) assay. At the first 2 month the animal rare in clear water had a higher total hemocyte count, while it was higher in the animals rare in the biofloc at the 4th month. At the 4th month the hyalines cells had a higher concentration in animals rare at biofloc system, while the granular and semi-granular cells had a lower concentration in this animals when compared with the ones rare at the clear water system. The phagocityc indexes and the production of superoxide anion did not have any difference between animals rare at clear water system and biofloc system.

Neste trabalho de tese, estudamos o modelo de crescimento logístico de populações biológicas utilizando a abordagem de espaço de estados. Os estados não observados são as biomassas anuais, a equação de observação é linear e a equação de estado é não linear. As distribuições de probabilidade utilizadas para os termos de erro de observação aditivos são: Normal, t-student, Skew-normal e Skew-t. As distribuições Log-normal, Log-t, Log-skew-normal e Log-skew-t são consideradas para os erros de observação multiplicativos. A inferência nos modelos é realizada considerando-se métodos Bayesianos e as distribuições a posterior de interesse são aproximadas utilizando-se algoritmos MCMC e a aproximação de Laplace. Apresentamos duas aplicações, a primeira referente a pesca de camarão marinho na costa do Chile, na qual a variável observável é o rendimento médio anual de pesca (captura por unidade de esforço média). Na segunda é considerada a pesca de lagostim vermelho na costa de Chile, na qual além do rendimento médio anual da pesca, observa-se as estimativas anuais de biomassa vulnerável, obtidas através de estudos de área varrida. Para o primeiro conjunto de dados, os modelos com erros de observação multiplicativos têm melhor performance, particularmente os modelos Log-skew-normal e Log-skew-t. Considerando estes resultados, no segundo caso utilizamos somente erros multiplicativos e a distribuição a posteriori preditiva mostra que cada variável observável parece ter sua própria família de distribuição de probabilidades. Além disso, os resultados também revelam uma crescente complexidade do modelo ao incorporar a classe mais geral de distribuições assimétricas. / We study the logistic population growth model using a state-space approach. The non observable states are the annual biomass of the population with a linear observation equation and a non-linear state equation. The probability distribution used for the additives observation error terms are Normal, Student-t, Skew-normal and Skew-t, and Log-normal, Log-t, Log-skew-normal and Log-skew-t for multiplicative observation errors terms. The inference about the parameters of the models is performed using Bayesian methods, with MCMC algorithms and Laplace approximations. We present two applications to real data sets. The first in marine shrimp population off the coast of Chile, where observable variable is the average annual fishing yield. The second application is for the population of the red squat lobster off Chile, where in addition to the average annual fishing yield, a second observable variable was included. In the first case, the multiplicative observational errors models presented the best results. Particularly the Log-skew-normal and Log-skew-t models has the better performances. Considering these results, in the second application we use only multiplicative observation errors models.

Orientador: Patricia Maria Contente Moraes-Valenti / Resumo: O experimento inicial teve como objetivo avaliar o desempenho produtivo do tambaqui, camarão-da-amazônia, e curimbatá em sistema integrado. Foram avaliados os parâmetros zootécnicos e limnológicos dos sistemas de cultivo com tambaqui e camarão-da-amazônia e com tambaqui, camarão-da-amazônia e curimbatá. Após o período de cultivo dos animais foram feitos plantios de hortaliças no sedimento dos viveiros que é rico em nutrientes resultantes do cultivo anterior. O objetivo do segundo experimento, foi determinar o desempenho produtivo das culturas de alface, almeirão, espinafre e rúcula em sistema de integração agricultura – aquicultura (IAA), visando a produção em pequena escala. Os resultados observados no primeiro experimento não mostraram diferença entre os tratamentos, mas indicaram que o cultivo de tambaqui, camarão-da-amazônia e curimbatá é tecnicamente viável para a fase inicial de engorda (recria). Assim, o cultivo com três espécies favorece a produtividade e melhor eficiência do sistema de cultivo. Já nos resultados do segundo experimento, a rúcula apresentou maior produtividade entre as hortaliças cultivadas, apresentando diferença significativa entre os tratamentos realizados. Assim, os dados de produtividade mostraram a possibilidade do cultivo de hortaliças em viveiros de aquicultura utilizando o sedimento como substrato. / Abstract: The initial experiment had as objective to evaluate the productive performance of tambaqui, Amazon river prawn, and curimbatá in an integrated system. The zootechnical and limnological parameters of the cultivation systems with tambaqui and Amazon river prawn and tambaqui, Amazon river prawn and curimbatá were evaluated. After the period of cultivation of the animals were planted of vegetables in the sediment of the nurseries that is rich in nutrient resulting from the previous cultivation. The objective of the second experiment was to determine the productive performance of lettuce, endive, spinach and arugula cultures in an agriculture - aquaculture integration system (IAA), aiming at small - scale production. The results observed in the first experiment showed no difference between the treatments, but indicated that the cultivation of tambaqui, Amazon river prawn and curimbatá is technically feasible for the initial fattening phase. Thus, the cultivation with three species favors the productivity and better efficiency of the cultivation system. In the results of the second experiment, to date, there were significant differences between treatments, with arugula being the most productive species. The productivity data showed the possibility of growing vegetables in aquaculture nurseries using the sediment as a substrate. / Mestre

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-06T16:53:46Z No. of bitstreams: 1 Albino Luciani Goncalves Leal.pdf: 575820 bytes, checksum: 4cc0fd6d3bf7fe9198563d35eae04f53 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T16:53:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Albino Luciani Goncalves Leal.pdf: 575820 bytes, checksum: 4cc0fd6d3bf7fe9198563d35eae04f53 (MD5) Previous issue date: 2007-02-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Aquaculture requires high-quality feeds with high protein content. So, the determination of less-expensive sources of protein which provides good growth is advantageous. Shrimp wastes have been identified as an animal protein source with great potential. Shrimp protein hydrolysate (SPH), a derived product obtained from shrimp wastes, was considered an excellent alimentary source and may serve as an useful source of protein and flavorants in food formulations. This work aimed to evaluate the nutritional quality of SPH through growth performance of juvenile Nile tilapia and its protein utilization. SPH was included in isonitrogenous diets at levels of 0, 5, 10 and 20% of fish meal protein replacement (SPH0, SPH5, SPH10 and SPH20) and offered to juvenile Nile tilapia (1.7±0.4 g) stocked in 40-L glass aquaria in a 45-day feeding trial. The inclusion of SPH did not produce statistical differences (P≥0.05) on final weight (27.18, 29.46, 26.02 and 25.19 g), survival (100%), relative weight gain (1,571, 1,624, 1,388 and 1,301%), average daily gain, ADG (0.57, 0.62, 0.54 and 0.52 g day-1), specific growth rate, SGR (7.15, 7.38, 6.85 and 6.73 % day-feed conversion ratio, FCR (1.15, 1.09, 1.13 and 1.17) and protein efficiency ratio, PER (2.26, 2.33, 2.20 and 2.14), respectively. The inclusion of SPH in diets for Nile tilapia statistically affected (P<0.05) the final fish body composition. Protein and ash contents decreased and fat content increased with SPH inclusion levels. This study clearly demonstrates that SPH could be included in diets for Nile tilapia without adverse effects on growth and protein utilization. / A produção aqüícola requer rações de alta qualidade, com alto conteúdo protéico. Assim, a determinação de fontes protéicas de menor custo e que promovam bom crescimento é benéfica. Resíduos de camarão têm sido identificados como uma fonte de proteína animal de grande potencial. Hidrolisado protéico de camarão (HPC) foi considerado como uma excelente fonte alimentar e pode servir como uma adequada fonte de proteína e flavorizante em formulações alimentares. Este trabalho objetivou avaliar a qualidade nutricional do HPC através do desempenho em crescimento de juvenis da tilápia do Nilo e sua utilização protéica. SPH foi incluído em dietas isoprotéicas em níveis de 0, 5, 10 e 20% de substituição da proteína advinda da farinha de peixe (HPC0, HPC5, HPC10 e HPC20) e ofertadas aos peixes (1,7±0,4 g) estocados em aquários de 40 L, por um período experimental de 45 dias. A inclusão do HPC não produziu diferenças estatísticas (P≥0,05) no peso final (27,18, 29,46, 26,02 e 25,19 g), sobrevivência (100%), ganho de peso relativo (1.571, 1.624, 1.388 e 1.301%), ganho de peso diário, GPD (0,57, 0,62, 0,54 e 0,52g dia-1), taxa de crescimento específico, TCE (7,15, 7,38, 6,85 e 6,73 % dia-conversão alimentar, CA (1,15, 1,09, 1,13 e 1,17) e eficiência protéica, EP (2,26, 2,33, 2,20 e 2,14), respectivamente. A inclusão do HPC nas dietas para a tilápia do Nilo afetou estatisticamente (P<0,05) a composição final dos peixes. Os teores de proteína e cinzas diminuíram e o teor de gordura aumentou com os níveis de inclusão do HPC. Este estudo claramente demonstra que o hidrolisado protéico de camarão pode ser incluído em dietas para a tilápia do Nilo sem efeitos adversos em crescimento e utilização protéica.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T11:34:15Z No. of bitstreams: 1 Alexandre Duarte Rodrigues da Silva.pdf: 439100 bytes, checksum: 1b2fd1350f22fda3959acac92bbccf28 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T11:34:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alexandre Duarte Rodrigues da Silva.pdf: 439100 bytes, checksum: 1b2fd1350f22fda3959acac92bbccf28 (MD5) Previous issue date: 2010-06-14 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Culture of Litopenaeus vannamei in freshwater (0.0 g L-1) and low alkalinity and hardness (<50 mg L-1 CaCO3) were performed during 2008 to 2009, with the aim of evaluating the influence of adding of lime, to maximize production indices of shrimp. Post-larvae of this species, with 10 to 12 days (PL10-12), were initially acclimated to fresh water and then stored at density of 17 PL m-2, 12 experimental ponds of 60 m2. The concentrations of lime (4.0, 8.0, 12.0 and 16.0 t ha-1 cycle-1) were evaluated in the presence or absence of fertilizer-based K+ and Mg2+, in completely randomized. The diet was formed based pelleted feed, shrimp with 32% protein, and administered at feeders. The monitoring of physical and chemical qualities of water was carried out in different phases. After 60 days of cultivation,the best survival were observed in treatments of 8.0 and 12.0 t ha-1 without fertilizer, and application of 4.0 t ha-1 in crops with fertilizer. It was concluded that the use of lime favors the growth of L. vannamei in freshwater. / Cultivos do Litopenaeus vannamei, em água doce (0,0 g L-1) e com baixa alcalinidade e dureza (< 50 mg L-1 CaCO3) foram realizados no período de 2008 a 2009, com o objetivo de avaliar a influência da adição de calcário dolomítico, para maximizar os índices zootécnicos desses camarões. Pós-larvas dessa espécie, com 10 a 12 dias (PL10-12), foram inicialmente aclimatadas a água doce e, posteriormente, estocados a densidade de 17 PL m-2, em 12 viveiros experimentais de 60 m2. As concentrações de calcários (4,0, 8,0, 12,0 e 16,0 t ha-1 ciclo-1) foram avaliadas na presença ou não de fertilizantes a base de K+ e Mg2+, em experimentos inteiramente casualizados. A dieta foi constituída a base de ração peletizada,para camarão com 32% de proteína, e administrada em comedouros. O monitoramento das qualidades físicas e químicas da água foi realizado, nas diferentes fases experimentais. Após 60 dias de cultivo, as melhores sobrevivências foram observadas nos tratamentos de 8,0 e 12,0 t ha-1, sem fertilizante, e na aplicação de 4,0 t ha-1 em cultivos com fertilizante. Concluiu-se que a utilização do calcário dolomítico favorece o cultivo do L. vannamei em água doce.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-08T13:47:49Z No. of bitstreams: 1 Berwiek Zafnath Yflaar.pdf: 1435955 bytes, checksum: b4c29e5dd1e14e3a3680862a176fe3a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T13:47:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Berwiek Zafnath Yflaar.pdf: 1435955 bytes, checksum: b4c29e5dd1e14e3a3680862a176fe3a4 (MD5) Previous issue date: 2003-01-08 / The experimental study with nauplii of Dendrocephalus brasiliensis in Litopenaeus vannamei larval feeding was carried out, at the laboratory of pos-larval production of the Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária (IPA-PE), near Porto de Galinha in Ipojuca. The aim of this study was to evaluate the performance of Dendrocephalus brasiliensis as food for Litopenaeus vannamei larvae and post-larvae.The Litopenaeus vannamei larvae (Protozoea PZ3) were stocked in 15 containers fill up with 10 liter of water, at a density of 100 larvae/L and grown during 18 days until post-larvae (PL10). The experiment consisted of 5 feeding treatments: T1), live Artemia sp. nauplii; T2), live D. brasiliensis nauplii; T3), frozen D. brasiliensis; T4), a combination of live Artemia sp. nauplii and live D. brasiliensis nauplii; T5), a combination of live Artemia sp. nauplii and frozen D. brasiliensis nauplii. The Larvae were fed 8 times a day; during the first 2 days were putted 800 D. brasiliensis nauplii/L/day, form day 3 to day 6 were given 2000 D. brasiliensis nauplii/L/day and from the 7th day till the 4000 D. brasiliensis nauplii/L/day.The larvae were completed the metamorphosis to post-larvae (PL1) in, 169, 168, 170, 171 and 169 hours for treatments 1, 2, 3, 4 and 5. The mean weight and length at (PL1) stage were, 444.444 μg and 6 mm for T1, 592.59 μg and 5.866 mm for T2, 224.082 μg and 5.733 mm for T3, 448.838 μg and 5.6 mm for T4 and 290.474 μg and 5.866 mm for T5. The experiment was finished at the PL10 stage when the post-larvae were counted to determine the survival rate. The survival results shown: 58.8%; 35.5%; 36.6%; 76.3% and 79.3% for T1, T2, T3, T4, and T5. At the end of this experiment the PL reach a mean weight and length of 1552.538μg and 8.833mm for T1, 1253.617μg and 9.2mm for T2, 690.413μg and 8.433mm for T3, 1522.717μg and 9.3mm for T4 and 1391.33μg and 9.466mm for T5. The results as survival rate data, metamorphosis time, final weight and lenght of larvae of each experiment obtained were statistically analyzed using ANOVA (P<0,05), Tukey and SNK tests. There are significant differences between the 5 feeding treatments. According to the results are concluded that D. brasiliensis nauplii (congealed or live) may be useful in combination with live Artemia sp. nauplii, as food for Litopenaeus vannamei larvae. / O experimento com utilização de náuplios de Dendrocephalus brasiliensis na alimentação de larvas de Litopenaeus vannamei, foi realizado no laboratório de produção de pós-larvas da Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária (IPA-PE), localizada em Porto de Galinha no município de Ipojuca - PE. O objetivo desse estudo foi avaliar o desempenho do náuplio do D. brasiliensis como alimento para as larvas e Pós-larvas de L. vannamei. As larvas foram estocadas no estágio de PZ3 em 15 containeres (com 10 litros de água cada), numa densidade de 100 larvas/ L e criadas durante 18 dias até PL10. O experimento constituiu-se em 5 tratamentos alimentares de 3 repetições de cada: T1) náuplios de Artemia vivos mais microalgas; T2) náuplios de D. brasiliensis vivos mais microalgas; T3) náuplios de D. brasiliensis congelados mais microalgas; T4) uma combinação de náuplios de Artemia vivos (50%) e náuplios de D. brasiliensis vivos (50%) mais microalgas; T5) uma combinação de náuplios de Artemia vivos (50%) e náuplios de D. brasiliensis congelados (50%) mais microalgas. As larvas foram alimentadas 8 vezes ao dia, durante os primeiros 2 dias colocados 800 náuplios de D. brasiliensis /L/dia, do 3o ao 6o dia foram oferecidos 2000 náuplios de D. brasiliensis/L/dia e do 7o ao 10o dia foram oferecidos 4000 náuplios de D. brasiliensis/L/dia. As larvas completaram o metamorfose para PL1 em 169, 168, 170, 171 e 169 horas, para T1, T2, T3, T4 e T5, respectivamente. O peso e comprimento médios no estágio de PL1 foram 444,444 μg e 6mm para T1; 592,29 μg e 5,866mm para T2; 222,082 μg e 5,733mm para T3; 448,838 μg e 5,6mm para T4 e 290,474 μg e 5,866mm para T5. Experimento foi finalizado no estágio de PL10 quando foi feita uma contagem para estimar a taxa média de sobrevivência. Os resultados da sobrevivência foram, 58,8%; 35,5%; 36,6%; 76,3% e 79,3%, para T1, T2, T3, T4 e T5, respectivamente. As médias do peso e comprimento no estágio de PL10 ficaram em 1552,538 μg e 8,833mm; 1253,617 μg e 9,2mm; 690,413 μg e 8,433mm; 1522,717 μg e 9,3mm e 1391,33 μg e 9,466mm para T1, T2, T3, T4 e T5 respectivamente. Foram utilizados métodos estatísticos ANOVA, teste de separação de Tukey e SNK para analisar os resultados da taxa de sobrevivência, metamorfose, peso e comprimento média final, e encontradas diferenças significativas entre os 5 tratamentos alimentares desse experimento. De acordo com esses resultados pode-se concluir, que os náuplios de D. brasiliensis (vivos ou congelados) associado aos náuplios de Artemia sp. vivos, podem ser útil na alimentação do Litopenaeus vannamei.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-10T11:11:21Z No. of bitstreams: 1 Edvaldo Cavalcanti de LIma Neto.pdf: 1484364 bytes, checksum: 176b6dea99569a96a24729551d8d6cab (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T11:11:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edvaldo Cavalcanti de LIma Neto.pdf: 1484364 bytes, checksum: 176b6dea99569a96a24729551d8d6cab (MD5) Previous issue date: 2006-02-20 / Viruses are among the most harmful pathogens found in aquaculture and are the most numerous and diverse of the pathogenic agents described to crustaceans. The knowledge about genes associated to immunity viral response, as well as the relationships between pathogen and host still very incomplete. Moreover, shrimp cell lines are not available, thus limiting primary systems of cellular culture to assist searches in genomic expression. The Expressed Sequence Tags (ESTs) analyses have become a common tool used to identify genes involved in some specific biological functions, particularly in organisms in which genomic data are not available. The Laboratory of Applied Genetics (LAGA) of the Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) is one of the members of the Shrimp EST Genome Project (ShEST), assisting on sequencing and search for genes related to shrimp immune response against the viral infections. Libraries of different tissues (muscle, hepatopancreas, ocular peduncle)and different larval stages of Litopenaeus vannamei were sequenced using BigDye Terminator Sequencing Kit (Applied Biosystems) or ET-Dye Terminator (Amersham/GE Healthcare) and M13 universal primer (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3'). The sequences were analyzed in automated sequencers MegaBace1000 (Amersham/GE Healthcare) and Applied Biosystems 377 (ABI377). These sequences were analyzed using the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). The results presented homology with interferon system proteins, like 2’,5’-Oligoadenylate binding protein, Toll like receptors, JAK/STAT and Interferon like protein. The 2’,5’-Oligoadenylate binding protein would be the first protein related to interferon system described in shrimps. A lot of sequences are still need to be investigated to complete the whole genome of Litopenaeus vannamei, nevertheless there are indications that this animal has a complex antiviral defense system, similar to interferon. / Os vírus estão entre os patógenos mais danosos encontrados na aqüicultura e são os mais numerosos e diversificados descritos para os crustáceos. O conhecimento sobre os genes associados à resposta imune viral, bem como a relação entre patógenos e hospedeiro ainda é escasso. Além disso, não há disponibilidade de linhas de célula para camarões, o que limita os sistemas primários de cultura celular, que por sua vez subsidiam pesquisas voltadas à expressão gênica. A análise de Seqüências Expressas Identificadas Expressed Sequence Tags (ESTs) tem se tornado uma prática comumente utilizada para identificar genes envolvidos em funções biológicas específicas, especialmente em organismos onde os dados genômicos ainda não estão disponíveis. O Laboratório de Genética Aplicada (LAGA) da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) é um dos participantes do projeto genoma EST do camarão Litopenaeus vannamei (ShEST) auxiliando no seqüenciamento e busca de genes de L. vannamei que atuam na resposta imune dos camarões contra as infecções virais. Foram seqüenciadas bibliotecas de diferentes tecidos (músculo, hepatopâncreas, pedúnculo ocular, etc) e diferentes fases larvais de Litopenaeus vannamei usando BigDye Terminator Sequencing Kit (Applied Biosystems) ou ET-Dye Terminator (Amersham/GE Healthcare) e o primer M13 universal (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3'). As seqüências foram analisadas em seqüenciadorores automáticos MegaBace1000 (Amersham/GE Healthcare) e Applied Biosystems 377 (ABI377). Estas seqüências foram analisadas usando-se a Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Os resultados obtidos apresentaram homologia com proteínas do sistema interferon, como 2’,5’-Oligoadenylate binding protein, Toll like receptors (TLRs), JAK/STAT e interferon like protein (IntlP). A 2’,5’-Oligoadenylate binding protein pode ser a primeira proteína descrita para camarões que está relacionada ao sistema interferon. Muitas seqüências ainda precisam ser processadas para completar o genoma de Litopenaeus vannamei, contudo já há indícios de que este tenha um complexo sistema de defesa contra vírus, semelhante ao sistema interferon.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-10T11:59:02Z No. of bitstreams: 1 Elizabel Oliveira Silva.pdf: 202306 bytes, checksum: 5779b75737b7f15c90824c1eeae271ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T11:59:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elizabel Oliveira Silva.pdf: 202306 bytes, checksum: 5779b75737b7f15c90824c1eeae271ac (MD5) Previous issue date: 2006-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The objective of that work was to determine the coefficient of apparent digestibility of the dry matter ando f the crude protein and the apparent digestibility corrected by leaching of the dry matter, being used ration with vegetable ingredients in substitution of the animal protein in complete diets for the shrimp sea L. vannamei (Boone, 1931). The experiment was accomplished in the Station of Aquaculture in UFRPE. It was used juvenile shrimps of the species L vannamei, with weight medium initial of 4 + 1,5g, originated Farm Costa Dourada – PE. The animals were housed in 16 glass aquariums (60x40x50 cm), with 6 animals for aquarium. The experimental diets will consist of four rations with different levels of vegetable protein (0%, 25%, 50% and 75%) in substitution the fish flour. The experimental design used was allocated in with four treatments and four repetition. It was not verified of the substitution of the animal protein on the apparent digestibility of the protein (94, 91; 96, 20; 93, 33; 92, 48%) and dry matter (93, 33; 95, 30; 92, 25; 90, 92%) as well as in the apparent digestibility corrected by leaching of the dry matter ( 93,36; 95, 06; 91, 46; 90, 64%) of the experimental diets, respectively. / O objetivo desse trabalho foi determinar o coeficiente de digestibilidade aparente da matéria seca e da proteína bruta e a digestibilidade aparente corrigida por lixiviação da matéria seca, utilizando-se ração com ingredientes vegetais em substituição da proteína animal em dietas completas para o camarão marinho Litopenaeus vannamei (Boone, 1931). O experimento foi realizado na Estação de Aqüicultura da UFRPE. Utilizou-se camarões juvenis da espécie Litopenaeus vannamei, com peso médio inicial de 4 ± 1,5g, provenientes da Fazenda Costa Durada – PE. Os animais foram alojados em 16 aquários de vidros (60x40x50 cm), com 6 animais por aquário. AS dietas experimentais consistirão de quatro rações com diferentes níveis de proteína vegetal (0%, 25%, 50% e 75%) em substituição a farinha de peixe. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado com quatro tratamentos e quatro repetições. Não foi verificado influencia da substituição da proteína animal sobre a digestibilidade aparente da proteína (94, 91; 96, 20; 93, 33; 92,48%) e matéria seca (93, 33; 95, 30; 92, 25; 90, 92%) bem como na digestibilidade aparente corrigida por lixiviação da matéria seca (93, 36; 95,06; 91, 46; 90, 64%) das dietas experimental, respectivamente.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T13:52:09Z No. of bitstreams: 1 Flavia Maria Maciel Carneiro de Souza.pdf: 432222 bytes, checksum: 47380c92c63248a05ae6b56a5134cf13 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T13:52:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Flavia Maria Maciel Carneiro de Souza.pdf: 432222 bytes, checksum: 47380c92c63248a05ae6b56a5134cf13 (MD5) Previous issue date: 2007-02-15 / Marine shrimp Farfantepenaeus subtilis is found along the Brazilian northeast coast. It tolerates salinity variations and grows quickly under culture conditions. However, it has a feeding habit predominantly carnivorous, using mainly polichaets as your main feeding source. The present work aimed at to induce the natural food in the experimental culture of F. subtilis through different fertilization strategies. A randomized entirely design with three treatments and three replicates was applied, being one with inorganic fertilizer: Control (CT) - 3 mg/L of urea and 0.3 mg/L of mono ammonium phosphate; and two with organic fertilizers: Wheat bran (FT) - 25 g/m2; Soybean meal (FS) – 18.75 g/m2. Nine 500L fiber glass tanks were used, with a stocking density of 16 shrimps/m2 (≈ 2.0 g), that were fed with a 35% crude protein commercial ration at 8:00, 12:00 and 16:00 hrs. The water and plankton samples were accomplished biweekly, and benthos was monthly. During the culture the water quality maintained it self adequate to shrimp culture. The growth data showed no significant difference (P≤0.05) among the treatments, where it was verified a growth rate of 0.44 g/week and a mean survival of 75%. With relation to the natural food, the phytoplankton (921 cells/mL) was predominated by the diatoms with 86, 49 and 83%, respectively, for thetreatments CT, FT and FS. The phytobenthos was also represented by Bacilariofíceae with 88%, 66% and 78%, respectively, for CT, FT and FS. The zooplankton (9.220 individuals/L) it was represented mainly by rotifers in the treatments CT (45%), FT (38%) and FS (65%). In zoobenthos the predominance was copepods in the treatments CT (97%), FT (91%) and FS (88%). The study showed similarity among the organic and inorganic fertilizers, indicating that the fertilization process was not efficient to supply enough natural food organisms, but it was observed that the three protocols applied were similar in terms of the F. subtilis shrimps growth and maintenance of water quality. / O camarão marinho Farfantepenaeus subtilis é encontrado por toda a costa do Nordeste do Brasil, tolera variações de salinidade e se desenvolve rapidamente sob condições de cultivo. Porém, tem um hábito alimentar predominantemente carnívoro, destacando-se os poliquetas como seu principal item alimentar. O presente trabalho objetivou induzir o alimento natural no cultivo experimental de F. subtilis, através de diferentes estratégias de fertilização. Foi adotado um delineamento inteiramente casualizado com três tratamentos, sendo um com fertilizante inorgânico: Controle (CT) - 3 mg/L de uréia e 0,3 mg/L de monoamônio fosfato; e dois com fertilizantes orgânicos: Farelo de Trigo (FT) - 25 g/m2 e Farelo de Soja (FS) – 18,75 g/m2, com três réplicas para cada tratamento. Foram utilizados nove tanques circulares em fibra de vidro, com capacidade de 500 L, os quais foram estocados com 16 camarões/m2 (≈2,0g). A alimentação artificial constou de ração comercial com 35% de proteína bruta e foi ofertada em bandejas, às 8:00, 12:00 e 16:00 h. As coletas de água e de plâncton foram realizadas quinzenalmente, e as coletas de bentos mensalmente.Durante o cultivo a qualidade de água se manteve adequada ao cultivo da espécie. Os dados de crescimento demonstraram não haver diferença estatística (P≤0,05) entre os tratamentos, onde foi constatado um crescimento de 0,44 g/semana e sobrevivência média de 75%. Quanto ao alimento natural, no fitoplâncton a média geral observada foi de 921 cél./mL e predominaram as diatomáceas com 86%, 49% e 83%, respectivamente, nos tratamentos CT, FT e FS. O fitobentos também foi representado pelas bacilariofíceas com 88%, 66% e 78,%, respectivamente, para os tratamentos CT, FT e FS. O zooplâncton teve uma média geral de 9.220 ind./L e esteve representado principalmente por rotíferos 45%, 38% e 65%, respectivamente, para CT, FT e FS. O zoobentos foi representado por copépodos com 97%, 91% e 88,%, respectivamente, para CT, FT e FS. O estudo demonstrou similaridade entre os fertilizantes orgânicos e inorgânicos, sugerindo que a fertilização não foi eficiente quanto à indução do alimento natural. Porém, demonstrou-se que os três protocolos testados foram igualmente eficientes para o crescimento do F. subtilis e para manutenção da qualidade da água.