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Efeito do uso de bactérias probióticas na sobrevivência de larvas de Litopenaeus vannamei expostas à infecção experimental por Vibrio spp

CARVALHO, Joana Angélica Lyra Vogeley de 10 February 2011 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-14T15:03:25Z No. of bitstreams: 1 Joana angelica L V Carvalho.pdf: 451922 bytes, checksum: 66f7ebcb01d8574ab7c4cced0c81dce6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T15:03:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joana angelica L V Carvalho.pdf: 451922 bytes, checksum: 66f7ebcb01d8574ab7c4cced0c81dce6 (MD5) Previous issue date: 2011-02-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study aimed to evaluate the survival of Litopenaeus vannamei shrimp larvae treated with probiotic bacteria and subsequently infected by Vibrio harveyi and Vibrio alginolyticus. Shrimp were kept in two 80L tanks under similar culture conditions, but only one tank was previously treated with commercial probiotic (Bacillus spp.) added daily in the water at a concentration of 105 CFU/ml. This protocol was maintained until the animals reach the stage of development needed for the infection experiments by Vibrio spp. Three independent infection experiments were performed: Zoea1 to Zoea3, Mysis1 to Mysis3 and Postlarvae (PL)10 to PL14 with the following treatments with four replicates each: only V. harveyi; commercial probiotic + V. harveyi; only V. alginolyticus; commercial probiotic + V. alginolyticus; and without Vibrio spp. and probiotic (Control). In the experiment with PL, only the treatments with V. harveyi; commercial probiotic + V. harveyi and control were used. Vibrio species were inoculated only at the beginning of each experiment at a concentration of 107 CFU/ml. At the end of experiments, a sample of water and shrimp from each experimental unit was submitted to quantification of Vibrio spp. Additionally, was realized an antagonism test of Bacillus spp. against Vibrio spp. In the experiments with zoea and mysis, larvae cultured in treatment V. harveyi had a significantly lower survival when compared with treatments V. alginolyticus and control. There was a significant increase in survival of zoea and mysis larvae treated with probiotic + V. harveyi with 81.07 and 90.13%, differentiating the larvae infected only with V. harveyi with 12.80 and 69.13%, respectively. There were no significant differences in survival of postlarvae among treatments. Total Vibrio spp. counts decreased in the water and shrimp of treatments with the use of probiotic. The probiotic (Bacillus spp.) showed inhibitory activity against Vibrio spp. in vitro. The results indicated an increase in the survival of early larval stages (zoea and mysis) infected by V. harveyi after treatment with Bacillus spp. The administration of probiotic bacteria is a promising alternative for the prevention of Vibrio spp. in larviculture of L. vannamei. / O presente estudo teve como objetivo avaliar a sobrevivência de larvas de Litopenaeus vannamei tratadas com bactérias probióticas e posteriormente infectadas por Vibrio harveyi e Vibrio alginolyticus. Os camarões foram mantidos em dois tanques de 80L nas mesmas condições, mas apenas um deles foi previamente tratado com probiótico comercial (Bacillus spp.) adicionado diariamente na água na concentração de 105 UFC/ml. Este protocolo foi mantido até os animais alcançarem o estágio de desenvolvimento larval necessário para os experimentos de infecção por Vibrio spp. Foram realizados três experimentos independentes de infecção: Zoea1 a Zoea3, Mísis1 a Mísis3 e Pós-larvas (PL)10 a PL14 com os seguintes tratamentos com quatro repetições cada: somente V.harveyi; probiótico comercial + V. harveyi; somente V. alginolyticus; probiótico comercial + V. alginolyticus; sem Vibrio spp. e probiótico (controle). No experimento com PL, somente os tratamentos com V. harveyi; probiótico comercial + V. harveyi e controle foram utilizados. As espécies de Vibrio foram inoculadas apenas no início de cada experimento na concentração de 107 UFC/ml. Ao final dos experimentos, uma amostra de água e camarão de cada parcela experimental foi submetida à quantificação de Vibrio spp. Adicionalmente foi realizado um teste de antagonismo in vitro de Bacillus spp. contra Vibrio spp. Nos experimentos com zoea e mísis, as larvas cultivadas no tratamento V. harveyi apresentaram uma sobrevivência significativamente inferior quando comparadas com as dos tratamentos V. alginolyticus e controle. Houve um aumento significativo na sobrevivência de larvas zoea e mísis tratadas com probiótico + V. harveyi com 81,07 e 90,13%, em comparação com as larvas infectadas apenas com V. harveyi com 12,80 e 69,13%, respectivamente. Não foram observadas diferenças significativas na sobrevivência das pós-larvas entre tratamentos. A quantidade total de Vibrio spp. na água e camarões diminuiu nos tratamentos com o uso de probiótico. O probiótico (Bacillus spp.) apresentou atividade inibitória contra Vibrio spp. in vitro. Os resultados indicaram um aumento na sobrevivência dos estágios larvais iniciais (zoea e mísis) infectadas por V. harveyi após tratamento com Bacillus spp. A administração de bactérias probióticas é uma alternativa promissora para a prevenção de Vibrio spp. na larvicultura de L. vannamei.
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Utilização nitrato de sódio em viveiros de camarão marinho

SILVA, Luis Otavio Brito da 01 November 2004 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-15T16:38:09Z No. of bitstreams: 1 Luis Otavio Brito da Silva.pdf: 481384 bytes, checksum: efd3c9a144f09ac28f9c1fc4d43626b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T16:38:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luis Otavio Brito da Silva.pdf: 481384 bytes, checksum: efd3c9a144f09ac28f9c1fc4d43626b1 (MD5) Previous issue date: 2004-11-01 / The fertilizers based on urea and ammonia as nitrogen source is more used in aquaculture, mainly for their low cost. However it should be pointed out that those fertilizers in high doses could cause ammonia toxicity. On the other hand, fertilizers based on nitrates, even with superior costs, present advantages over those based on ammonia, because nitrate is not toxic and it is totally oxidized in the cultivation atmosphere. It was aimed at with the present work to test the use of sodium nitrate in ponds of sea shrimp. It was considered two treatments: NS (sodium nitrate enriched with phosphate, silicate, boron, magnesium, sulfur and potassium) and SNS (urea, triple super phosphate and sodium silicate). Sampling and analyses of the water were accomplished, being weekly performed for the plankton and for the soil in the beginning and in the end of the cultivation cycle. The application of sodium nitrate was initially in the soil and later in the water. For statistical analysis it was used T test (P <0,05). Yield data for the cultivate (mean weigh to the first forty days of cultivation, mean final weight, time of cultivation, survival, productivity and feed conversion) in the Atlantis and Cana Brava farms, showed no present significant difference among the treatments. In thephytoplankton groups, diatoms (12.554 and 5.833 céls/ml) in the Atlantis farm and cyanobacteria (146.052 and 34.250 céls/ml) in the Cana Brava farm, significant differences were observed among the treatments (NS and SNS), respectively. The zooplankton groups (cladoceran, copepod and rotifers) in the Atlantis and Cana Brave farms did not present significant difference, among the treatments. In the chemical variables of the water, silicate (2.3508 and 3.4787 mg/L) and orthophosphate (0.0158 and 0.0068 mg/L) in the Atlantis farm, significant differences were observed, among the treatments (NS and SNS), respectively. The oxidation of the organic matter in the Atlantis farm (36,2 and 20%) and in the Cana Brava farm (6,5 and 0,2%), presented significant difference, among the treatments (NS and SNS), respectively. The treatment NS provided higher diatoms densities in the Atlantis farm and higher cyanobacteria densities in the Cana Brava farm. The treatment NS provided better concentrations of the chemical variables silicate and orthophosphate in the Atlantis farm, and a higher oxidation of the soil organic matter. / Os fertilizantes nitrogenados à base de uréia e amônia são mais utilizados na aqüicultura, principalmente por serem de baixo custo. Entretanto deve-se ressaltar que esses fertilizantes em doses elevadas podem causar toxidez por amônia. Por outro lado, fertilizantes à base de nitratos, mesmo com custos superiores, apresentam vantagens sobre os fertilizantes amoniacais, pois o nitrato não é tóxico e é totalmente oxidado no ambiente de cultivo. Objetivou-se com o presente trabalho testar a utilização de nitrato de sódio em viveiros de camarão marinho. Foram considerados dois tratamentos: NS (nitrato de sódio enriquecido com fósforo, silicato, boro, magnésio, enxofre e potássio) e SNS (uréia, superfosfato triplo e silicato de sódio). Foram realizadas coletas e análises da água e do plâncton semanalmente, e do solo no inicio e no final do ciclo de cultivo. A aplicação de nitrato de sódio foi feita inicialmente no solo e posteriormente na água. Para análise estatística utilizou-se teste “T” (P<0,05). Os dados de rendimento do cultivo (peso médio aos quarenta primeiros dias de cultivo, peso médio final, tempo de cultivo, sobrevivência, produtividade e conversão alimentar) nas fazendas Atlantis e Cana Brava, não apresentaram diferença significativa, entreos tratamentos. Nos grupos fitoplânctonicos diatomáceas (12.554 e 5.833 céls/ml) na fazenda Atlantis e cianobactérias (146.052 e 34.250 céls/ml) na fazenda Cana Brava, foram observadas diferenças significativa entre os tratamentos (NS e SNS), respectivamente. Os grupos zooplânctonicos (cládoceros, copépodos e rotíferos) nas fazendas Atlantis e Cana Brava, não apresentaram diferença significativa, entre os tratamentos. Nas variáveis químicas da água, silicato (2,3508 e 3,4787 mg/L) e ortofosfato (0,0158 e 0,0068 mg/L) na fazenda Atlantis, foram observadas diferenças significativa, entre os tratamentos (NS e SNS), respectivamente. A oxidação da matéria orgânica na fazenda Atlantis (36,2 e 20%) e na fazenda Cana Brava (6,5 e 0,2%), apresentaram diferença significativa entre os tratamentos (NS e SNS), respectivamente. O tratamento NS proporcionou maiores densidades de diatomáceas na fazenda Atlantis e maiores densidades de cianobactérias na fazenda Cana Brava. O tratamento NS proporcionou melhores concentrações das variáveis químicas da água silicato e ortofosfato na fazenda Atlantis, e uma maior oxidação da matéria orgânica dos solos.
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Análise comparativa do cultivo do camarão marinho Litopenaeus vannamei em sistemas com biofloco e convencional no litoral sul de Pernambuco

REGO, Marcelo Augusto Soares 07 February 2012 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T12:17:02Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 776174 bytes, checksum: fc14dcc7f1e623f7f455c166d32bd350 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T12:17:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 776174 bytes, checksum: fc14dcc7f1e623f7f455c166d32bd350 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Among the new management technologies which have been proposed for carciniculture, the "BFT" system (Bio-Floc Technology) has shown to be key in allowing crops with high stocking densities, higher biosafety and reduced water exchange. The purpose of this study was to analyze the zoo-technical performance, water quality and the microbiological aspects of large scale culture systems of Litopenaeus vannamei in super-intensive with biofloc formation (BFT) and conventional (CON) systems on the southern coast of Pernambuco. For BFT, two tanks of 200m², stocked with 375 shrimp/m² were used and cultured for 130 days. Concerning the CON system, two ponds were utilized (2.85 ha each), stocked with 12 shrimps/m2 cultured through a period of time averaging 105 days. Weekly biometrics helped monitor shrimp growth and adjust feeding supply in both systems. The water physico-chemical variables were monitored daily, and even with significant differences between the BFT and CON systems, they were within appropriate levels for the species in relation to dissolved oxygen, pH, temperature and salinity. At the end of culture, shrimps displayed mean weight ± SD of 11,41 ± 2,06 g and 10,52 ± 2,23 g, survival rate of 32,4% and 59,1%, and production (Kg/m2) of 1,39 and 0,072, for BFT and CON systems, respectively. With respect to the concentrations of nitrogen compounds (NH3 and NO2), levels were high during the cultivation only in the BFT system. In the results related to microbiology, there was the presence of bacteria of the genus Vibrio and high load of fecal coliform in the shrimp cultured in the CON system. As for the BFT system, the presence of Staphylococcus coagulase-positive was found in shrimps from this culture. Despite the technical problems, which can be easily corrected, the BFT system utilized on a commercial scale in northeastern of Brazil showed great potential for replacing the conventional one, and may become a good alternative to increase productivity and control of effluents, thus confirming its sustainability. / Dentre as novas tecnologias de manejo que vem sendo propostas para a carcinocultura, o sistema “BFT” (Bio-Floc Technology) destaca-se por permitir o cultivo com altas densidades de estocagem, maior biosegurança e reduzida troca de água. O estudo teve como objetivo analisar o desempenho zootécnico, qualidade da água e aspectos microbiológicos no cultivo de Litopenaeus vannamei em larga escala, em sistemas super-intensivo com formação de biofloco (BFT) e convencional (CON) no litoral sul de Pernambuco. Para o BFT foram utilizados dois tanques de 200m², estocados com 375 camarões/m² e cultivados por 130 dias. Em relação ao sistema CON, foram utilizados dois viveiros (2,85 ha cada), estocados com 12 camarões/m2, cultivados por um tempo médio de 105 dias. Biometrias semanais serviram para acompanhar o crescimento dos camarões e reajustar a oferta de ração em ambos os sistemas. As variáveis físico-químicas da água foram acompanhadas diariamente e, mesmo apresentando diferença significativa entre os sistemas BFT e CON, estiveram dentro dos níveis adequados para a espécie em relação a oxigênio dissolvido, pH, temperatura e salinidade. Ao final do cultivo os camarões apresentaram peso médio ±DP de 11,41±2,06g e 10,52±2,23g, sobrevivência de 32,4% e 59,1%, e produção (Kg/m2) de 1,39 e 0,072, para os sistemas BFT e CON, respectivamente. Com relação às concentrações dos compostos nitrogenados (NH3 e NO2), esses apresentaram níveis elevados durante o cultivo apenas no sistema BFT. Nos resultados referentes à microbiologia, se verificou a presença de bactérias do gênero Vibrio e elevada carga de coliformes fecais nos camarões cultivados no sistema CON. Já para o sistema BFT, foi constatada a presença de Staphylococcus coagulase-positivo nos camarões provenientes desse cultivo. Apesar dos problemas ocorridos de caráter técnico, sendo esses possíveis de serem corrigidos, o sistema BFT, empregado em escala comercial no nordeste do Brasil, demonstrou potencial para substituir o convencional, sendo uma boa alternativa para o aumento da produtividade e controle de efluentes, ratificando sua sustentabilidade.
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Estratégias de manejo para aclimatar o camarão marinho Litopenaeus vannamei (Boone,1931) à água doce

ALBUQUERQUE, Maria Luciene Luzia Tavares 01 March 2005 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T13:41:53Z No. of bitstreams: 1 Maria Luciene Luzia Tavares Albuquerque.pdf: 748109 bytes, checksum: ed6d14d8d94e3639f3bb58a2eb31663a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T13:41:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Luciene Luzia Tavares Albuquerque.pdf: 748109 bytes, checksum: ed6d14d8d94e3639f3bb58a2eb31663a (MD5) Previous issue date: 2005-03-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Experiments had been carried in the Laboratory of Shrimp culture of the Fishery Department of the Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE), the purpose to acclimatize post larvae of the marine shrimp Litopenaeus vannamei to freshwater, during the period of 2003 at 2004. The experiments had been carried through in three phases, using post larvae with nine and ten days (PL9-10) and post larvae with twenty five and twenty six days (PL25-26) produced by commercial hatcheries. The acclimatization had been developed in aquariums with capacity of 44 liters each where the post larvae had stocked a density 11,3 PL/L, of with an acclimatization average time of of ten days.In first experiment had been tested concentrations lime, associates with the renewal rate daily of water of aquariums. In second experiment had been tested the concentration of lime and diets with two levels of artemia and artificial feed for shrimp. At the third experiment five diets with levels different of artemia, artificial feed for fish and artificial feed for shrimp had been tested. In the end of acclimatization in three experiments, post larvae had removed of the aquarium, counted, measured and weighted to calculate the survival, final weight, weight gain, final length and length gain. At first experiment the renewal rate of 50% daily of water de 50% were more efficient at post larvae parameter growth. In second experiment, diet D1 provided best survival than diet D2 (P < 0.05). While in third experiment, the survival rates were best to make useful artificial feed for fish. As conclusion, the water ofrenewal rate and diets had influenced significantly (P<0,05) on zootechnical data of these specie. / Experimentos foram realizados no Laboratório de Carcinicultura do Departamento de Pesca da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), objetivando aclimatar pós-larvas do camarão marinho Litopenaeus vannamei à água doce, durante o período de 2003 a 2004. Os experimentos foram realizados em três fases, utilizando-se pós-larvas com idade de nove e dez dias (PL9-10) e 25 e 26 dias (PL25-26), provenientes de larviculturas comerciais. A aclimatação foi realizada em aquários com capacidade de 44 litros cada, onde as pós-larvas foram estocadas na densidade de 11,36 pós-larvas/L com um tempo médio de aclimatação de dez dias. No primeiro experimento foram testadas concentrações de cal, associadas com a taxa de renovação diária da água dos aquários. No segundo experimento testaram-se concentrações de cal e dietas com dois níveis de concentração de artêmia e ração comercial para camarão. No terceiro experimento foram testadas cinco dietas com níveis diferentes de artêmia, ração para peixe e ração para camarão. No final da aclimatação de cada experimento, as pós-larvas foram retiradas dos aquários, contadas e realizadas biometrias, para estimar respectivamente a sobrevivência, o peso final, ganho de peso, comprimento final e ganho de comprimento. No primeiro experimento a taxa de 50% de renovação diária da água foi mais eficiente sobre os parâmetros de crescimentos das pós-larvas. No segundo experimento, a dieta D1 proporcionou melhores índices sobrevivência que a dieta D2 (P < 0,05). Enquanto no terceiro experimento, os índices de sobrevivências foram melhores ao utilizar-se a ração de peixe. Pode-se concluir que a taxa de renovação da água e a alimentaçãoinfluenciaram (P < 0,05) nos dados zootécnicos da espécie.
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Desempenho zootécnico do camarão marinho Litopenaeus vannamei (Boone,1931) cultivado com ração peletizada e extrusada

PESSÔA, Maurício Nogueira da Cruz 01 October 2008 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T15:07:14Z No. of bitstreams: 1 Mauricio Nogueira da Cruz Pessoa.pdf: 716355 bytes, checksum: 41120b87fa94d8d978b32032793ede5f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T15:07:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mauricio Nogueira da Cruz Pessoa.pdf: 716355 bytes, checksum: 41120b87fa94d8d978b32032793ede5f (MD5) Previous issue date: 2008-10-01 / The statistical evaluation of the use of extruded and pelleted ration in the Litopenaeus vannamei shrimp culture, under field conditions, were done with the objective of determinie the advantages of these diets on shrimp performance index. To perform the analyses were used 481 crops, from 8 commercial farms of northeastern Brazil. It was the technique used multiple linear regression to determine the parameters of handling variables that influenced the responses of crops such as production, productivity, the conversion factor of food (FCA), the weekly average growth, the average weight end, the quantity of feed consumed and survival. These responses were measured by the density of storage, but also in time of cultivation. It may be noted that there was no significant difference (P ≥ 0,05) between the use of feed on the variables average weight final and average weekly growth, as in other variables can be observed that for the storage density of 15 shrimps.m-2 there were differences of up to 20.1% in the FCA in favour of extruded ration, a production 9.7% higher when using pelleted ration of feed consumption and a 33.2% higher in pelleted feed. For densities of 60 shrimps.m-2 the difference in the FCA was 18.8% lower when you used to feed pelleted, production was 7.2% higher if using pelleted diet, consumption of feed was 8.5% lower when used if pelleted diet and productivity was 10.3% higher when the extruded feed was used for that density. / Avaliações estatísticas do uso de ração extrusada e peletizada, em cultivos do camarão Litopenaeus vannamei, nas condições de campo, foram realizadas com o objetivo de determinar as vantagens sobre os índices zootécnicos dos camarões. Análises foram feitas utilizando-se 481 cultivos, provenientes de oito fazendas comerciais do nordeste do Brasil. Foi utilizada a técnica de regressão linear múltipla para estimar os parâmetros de manejo que influenciaram nas variáveis respostas dos cultivos tais como produção, produtividade, fator de conversão alimentar (FCA), crescimento semanal, peso final, quantidade de ração administrada e sobrevivência. Essas variáveis foram avaliadas em função da densidade de estocagem e do tempo de cultivo. Não houve diferença significativa (P ≥ 0,05) entre o uso das rações sobre as variáveis, peso final e crescimento semanal. Nas demais variáveis observou-se que na densidade de estocagem de 15 camarões/m2 houve diferença de até 20,1% no FCA a favor da ração extrusada, uma produção 9,7% maior quando se utilizou ração peletizada e um consumo a mais de 33,2% de ração peletizada. Para densidades de 60 camarões/m2 a diferença no FCA foi de 18,8% menor quando se utilizou ração peletizada, a produção foi 7,2% maior utilizando-se ração peletizada, o consumo de ração foi 8,5% menor com ração peletizada e a produtividade foi 10,3% maior quando a ração extrusada foi utilizada.
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Análise quantitativa da carga viral do vírus da Mionecrose infecciosa (IMNV) em diferentes tecidos do camarão marinho Litopenaeus vannamei naturalmente infectado

SILVA, Suzianny Maria Bezerra Cabral da 01 February 2010 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-22T13:02:10Z No. of bitstreams: 1 Suzianny Maria Bezerra Cabral Silva.pdf: 1259614 bytes, checksum: e36cf9293552877b5a90863a34eee04d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T13:02:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Suzianny Maria Bezerra Cabral Silva.pdf: 1259614 bytes, checksum: e36cf9293552877b5a90863a34eee04d (MD5) Previous issue date: 2010-02-01 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei is the most important shrimp species in volume in world aquaculture. However, in recent decades, outbreaks of several diseases, especially viral diseases, were responsible for significant economic losses, threatening the sustainability of shrimp farming worldwide. In 2004, Brazilian shrimp farming was seriously affected by a new disease, caused by the Infectious myonecrosis virus (IMNV). Thus, disease control based on rapid and sensitive pathogen detection methods has become a priority worldwide. In this study, specific quantification method for IMNV was developed using real-time PCR with SYBR Green dye and viral load of the principal target tissues was quantified. A recombinant plasmid that contains the target IMNV sequence was constructed and a linear relationship between plasmid DNA and Ct values (R² = 0.992) was obtained for a range from 108 to 10² copies of IMNV. Viral load of IMNV was different for various tissues, being higher in haemolymph and muscle, followed by pleopods and gill. / O camarão marinho (Litopenaeus vannamei) é a mais importante espécie de camarão em volume na aqüicultura mundial. Entretanto, nas últimas décadas, surtos de diversas doenças especialmente as de etiologia viral foram responsáveis por perdas econômicas significativas,ameaçando a sustentabilidade da carcinicultura mundial. Em 2004, a carcinicultura brasileira foi seriamente afetada por uma nova doença, causada pelo vírus da Mionecrose infecciosa (IMNV). Assim, o controle de doenças baseado em métodos de detecção rápida e sensível de patógenos tornouse uma prioridade em nível mundial. No presente estudo, um método específico de quantificação para IMNV foi desenvolvido usando PCR em tempo real com o corante SYBR Green e a carga viral dos principais tecidos-alvo usados para o diagnóstico de IMNV foi determinada. Um plasmídeo recombinante contendo uma seqüência do vírus foi construído e uma relação linear de 0,992 foi obtida entre a quantidade de DNA plasmidial e os valores de Ct para uma faixa de 108 a 10² cópias de IMNV. A carga viral detectada nos tecidos mostrou que há diferença entre eles e os maiores valores estiveram presentes na hemolinfa e músculo, seguida de pleópodo e brânquia.
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Avaliação da influência do meio ambiente do sistema de berçário na imunidade inata de Camarões Litopenaeus vannamei (Boone, 1931). / Evaluation of the influence of the environment of the nursery system in innate immunity of shrimps, Litopenaeus vannamei (Boone, 1931).

Renata Stecca Iunes 25 March 2013 (has links)
A aquicultura sofre diferentes pressões por um lado o impacto que as doenças causam na produção, e por outro a pressão por parte de grupos ambientalistas e do governo devido ao impacto ambiental. Diferentes soluções foram propostas para esses problemas como probióticos e imunoestimulantes para prevenir e controlar doenças com nenhum ou algum sucesso. Outra opção seria o biofloco para minimizar o impacto ambiental, com excelentes resultados zootécnicos. Porém não sabemos se o sistema de biofloco estimula ou inibe o sistema imune de camarões (Litopenaeus vannamei). Esse é o objetivo desse estudo, saber se o sistema de biofloco altera a contagem total e diferencial de hemócitos, os índices fagocíticos, utilizando ensaio de fagocitose in vitro com Sacaromises cerevisae e a produção de ânion superóxido pelo ensaio de Nitroblue tetrazolium (NBT). Na contagem total de hemócitos nos 2 primeiros meses os animais criados em água clara possuem uma contagem maior que os criados em biofloco enquanto que no 4° mês os animais de biofloco possuem uma contagem maior. Na contagem diferencial no 4°mês as células hialinas estão em maior porcentagem nos animais criados em biofloco enquanto que as granulares e simi-granulares estão em menor porcentagem nesses animais, quando comparamos com os animais criados em água clara. Os índices fagocíticos e a produção de ânion superóxido não apresentam diferença entre os animais criados em água clara e os criados em biofloco. / The aquaculture production suffers different pressure in one hand disease, and in the other its environment impact. Different solutions are offered to solve this problems such as probiotics and immunostimulant to prevent and control the diseases with some or no success. Another option is the biofloc to minimize its environmental impact, with excellent results to zootechincal characteristics. But it is not known whether biofloc stimulate or inhibits the shrimp (Litopenaeus vannamei) immune system. That is what our study aim to answer if the biofloc system affects or not the total and differential hemocytes count, the phagocityc indexes of in vitro phagocytosis with Sacaromises cerevisae and the production of superoxide anion with the Nitroblue Tetrazolium (NBT) assay. At the first 2 month the animal rare in clear water had a higher total hemocyte count, while it was higher in the animals rare in the biofloc at the 4th month. At the 4th month the hyalines cells had a higher concentration in animals rare at biofloc system, while the granular and semi-granular cells had a lower concentration in this animals when compared with the ones rare at the clear water system. The phagocityc indexes and the production of superoxide anion did not have any difference between animals rare at clear water system and biofloc system.
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Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico / Bayesian inference in biological population dynamic models with skewed and heavy tailed perturbation terms

Carlos Patricio Montenegro Silva 20 January 2016 (has links)
Neste trabalho de tese, estudamos o modelo de crescimento logístico de populações biológicas utilizando a abordagem de espaço de estados. Os estados não observados são as biomassas anuais, a equação de observação é linear e a equação de estado é não linear. As distribuições de probabilidade utilizadas para os termos de erro de observação aditivos são: Normal, t-student, Skew-normal e Skew-t. As distribuições Log-normal, Log-t, Log-skew-normal e Log-skew-t são consideradas para os erros de observação multiplicativos. A inferência nos modelos é realizada considerando-se métodos Bayesianos e as distribuições a posterior de interesse são aproximadas utilizando-se algoritmos MCMC e a aproximação de Laplace. Apresentamos duas aplicações, a primeira referente a pesca de camarão marinho na costa do Chile, na qual a variável observável é o rendimento médio anual de pesca (captura por unidade de esforço média). Na segunda é considerada a pesca de lagostim vermelho na costa de Chile, na qual além do rendimento médio anual da pesca, observa-se as estimativas anuais de biomassa vulnerável, obtidas através de estudos de área varrida. Para o primeiro conjunto de dados, os modelos com erros de observação multiplicativos têm melhor performance, particularmente os modelos Log-skew-normal e Log-skew-t. Considerando estes resultados, no segundo caso utilizamos somente erros multiplicativos e a distribuição a posteriori preditiva mostra que cada variável observável parece ter sua própria família de distribuição de probabilidades. Além disso, os resultados também revelam uma crescente complexidade do modelo ao incorporar a classe mais geral de distribuições assimétricas. / We study the logistic population growth model using a state-space approach. The non observable states are the annual biomass of the population with a linear observation equation and a non-linear state equation. The probability distribution used for the additives observation error terms are Normal, Student-t, Skew-normal and Skew-t, and Log-normal, Log-t, Log-skew-normal and Log-skew-t for multiplicative observation errors terms. The inference about the parameters of the models is performed using Bayesian methods, with MCMC algorithms and Laplace approximations. We present two applications to real data sets. The first in marine shrimp population off the coast of Chile, where observable variable is the average annual fishing yield. The second application is for the population of the red squat lobster off Chile, where in addition to the average annual fishing yield, a second observable variable was included. In the first case, the multiplicative observational errors models presented the best results. Particularly the Log-skew-normal and Log-skew-t models has the better performances. Considering these results, in the second application we use only multiplicative observation errors models.
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Otimização de processos de obtenção de quitina e quitosana do exoesqueleto do camarão amazônico (Macrobrachium amazonicum, HELLER, 1863)

PINTO, Andréa da Silva 17 January 2014 (has links)
Submitted by Hellen Luz (hellencrisluz@gmail.com) on 2017-08-03T18:14:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OtimizacaoProcessosObtencao.pdf: 817977 bytes, checksum: 05c1ae3f4a997e19f47b6f7bec5fb3ce (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-08-04T12:41:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OtimizacaoProcessosObtencao.pdf: 817977 bytes, checksum: 05c1ae3f4a997e19f47b6f7bec5fb3ce (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-04T12:41:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OtimizacaoProcessosObtencao.pdf: 817977 bytes, checksum: 05c1ae3f4a997e19f47b6f7bec5fb3ce (MD5) Previous issue date: 2014-01-17 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os exoesqueletos de crustáceos, como camarão M. amazonicum (Heller, 1863) são uma das principais fontes alternativas de obtenção de quitina, precursor da quitosana. Diante das inúmeras dificuldades de se trabalhar padronizadamente com biomaterias, este trabalho teve como principal objetivo a extração de quitina e quitosana através de uma metodologia de planejamento experimental por superfície de resposta, para otimizar as principais etapas de desmineralização, desproteinização e desacetilação,. Para o planejamento das três etapas, as variáveis de resposta foram respectivamente, porcentagem de cinzas remanescentes (%CR), porcentagem de Nitrogênio total (%Ntotais) e porcentagem do grau de desacetilação (%GD). As caracterizações das etapas de Desmineralização, Desproteinização. e Desacetilação, foram analisadas consecutivamente por análise de cinzas, análise elementar e titulação potenciométrica. Após as conclusões das análises de cinzas, tanto no material in natura quanto no desmineralizado, foi possível obter, respectivamente 32,03±0,05% de (%CR) e 0,0% de (%CR). Os parâmetros de regressão do modelo de superfície de resposta foram estatisticamente significativos, com valores (R2) igual a 0,89. A superfície de resposta construída para a variável % CR com regiões de iso-repostas indicaram HCl igual 1,2 M e razão 0,08g/ml, isto determina a região ótima no modelo adotado para a otimização da desmineralização. Para os ensaios de desproteinização ressalta-se que, mesmo não havendo significância quanto as variáveis em estudo, o resultado da análise elementar mostrou que em todos os ensaios do planejamento, a extração de proteínas foi realizada com eficiência, mostrando uma média de grau de desproteinização próximo a 100%. Na etapa de desactilação as variáveis também não se mostraram significantes, com % Grau de Desacetilação variando de 18,24 – 57,22. Neste trabalho, pode-se concluir que nem sempre a literatura poderá ser o apoio para eficiente extração de quitina e quitosana, dependendo neste caso, exclusivamente de testes preliminares e adaptações exclusivas para cada espécie em estudo.
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Estudo estrutural e ultra-estrutural das gônadas masculinas dos diferentes morfotipos de Macrobrachium amazonicum.(Heller, 1862) (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae)

SILVA, Gicelle Maria Farias da January 2006 (has links)
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No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EstudoEstruturalUltra.pdf: 12940869 bytes, checksum: 5ea05896e4850498edddda10ce072761 (MD5) Previous issue date: 2006 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Macrobrachium amazonicum is the most commercially-explored fresh water shrimp in the Amazon, finding great acceptance in the consuming market. The objective of this work is to characterize the structure and the ultrastructure of the gonads of different M. amazonicum morfotipos in natural population. The shrimps (500 specimen) were collected in Furo das Marinhas (Mosqueiro – PA), by local fishermen and brought alive to the Laboratório, in an appropriate box containing local water. Fifty males were selected, weight, measured and killed. Gonads were collected and fragments were fixed in 2,5% glutaraldehyde 4% paraformaldehyde in sodium caccodylate buffer at 0,1M pH 7,2. For light microscopy the fragments were processed according to the standard histological technique for paraffin embedding. The sections were stained with Hematoxilin and Eosin. For transmission electron microscopy the gonads were post-fixed with 1% osmium tetroxide in sodium caccodylate buffer at 0,1M pH 7,2 and processed for embedding in Epon resin. Semithin sections were stained with toluidin blue. For scanning electron microscopy the fixed and post-fixed specimens were dehydrated, submitted to the critical CO2 drying point and then coated with gold and examined in electron microscope. Four morfotips in natural population were observed, in agreement with corporal dimensions and coloration. The morfotips were denominated as TC, CC, GC and GC’ according to Moraes-Riodades (2002). The biometric relation total/length cephalothorax and total/weight had presented negative allometrie.The testicles and are located in the cephalothorax. The testicle is constituted by seminiferous tubules; each tubule presents a very thin capsule of conjunctive tissue that divides the parenquime of the organ. The tubule is covered by flat cells and in its interior we observed a cell population of spermatogenic lineage in different maturation phases that were denominated as: spermatogônias, spermatocytes, spermatids and spermatozoids. The spermatogonias are the largest cells with cromatina organized in clots, located eccentrically in the tubule. The spermatocytes are round cells with cromatina in dense clots. The spermatids are small cells with great amounts of mitochondria. The spermatozoids are concave cells in the apical portion and convex cells in the distal portion, presenting a small spike assuming an aspect similar to a cup. In cross section, the vas deferens come covered by conjunctive tissue and they can present from a cubic to a cylindrical epithelium; they present in their interior an agglomeration of feeder cells located in the eccentric portion and spermatozoids located in the lumen of the ducts.The structural analysis of the M. amazonicum gonads, demonstated the of three distinct morfotips in the Furo das Marinhas. / O Macrobrachium amazonicum corresponde ao camarão de água doce mais explorado comercialmente na Amazônia, encontrando grande aceitação no mercado consumidor. Este trabalho teve como objetivo caracterizar a estrutura e a ultraestrutura das gônadas de diferentes morfotipos de M. amazonicum em população natural. 500 exemplares foram coletados do Furo das Marinhas e acondicionados em caixa de isopor e levados para o laboratório, onde foram identificados sexualmente e realizada a biometria com o auxílio de um paquímetro digital e pesados em balança digital. As gônadas de 50 machos foram dissecadas e fixadas em Karnovsky. Após 24h, as amostras foram desidratadas e incluídas em parafina. Em seguida, foram feitos cortes seriados de 5μm de espessura e corados em Hematoxilina e Eosina. Para a microscopia eletrônica, as gônadas foram pós-fixadas com tetróxido de osmio a 1% por duas horas em temperatura ambiente, desidratadas em série crescentes de álcool e incluídas em Epon 812®. Os cortes semi-finos foram corados com azul de toluidina a 1%. Os cortes ultrafinos foram contrastados com acetato de uranila e citrato de chumbo, sendo posteriormente analisados e fotografados em microscópio eletrônico de transmissão Zeiss 900. Para a microscopia eletrônica de varredura, as amostras foram fixadas, pós-fixadas e submetidas à secagem em ponto crítico em CO2 e posteriormente colocadas em stubs e submetidas à metalização com cobertura de ouro de 10nm de espessura para a análise em microscópio eletrônico varredura. Na população natural foram observados quatro morfotipos, de acordo com as dimensões corporais e a coloração. Os morfotipos foram denominados como TC, CC, GC e GC’ segundo a classificação de Moraes-Riodades (2002). As relações biométricas comprimento total e comprimento cefalotórax indicaram crescimento alométrico negativo e as relações peso e comprimento também indicaram alometria negativa. Os testículos estão localizados no cefalotórax e são constituídos por túbulos seminíferos; cada túbulo apresenta uma cápsula de tecido conjuntivo bem delgada que divide o parênquima do órgão. O túbulo é revestido por células achatadas e em seu interior foi observado uma população de células da linhagem espermatogênica em diferentes fases de maturação que foram denominadas de: espermatogônias; espermatócitos; espermátides e espermatozóides. As espermatogônias são as maiores células com cromatina organizada em grumos, situadas excentricamente no túbulo. Os espermatócitos são células arredondadas com cromatina em grumos densos. As espermátides são células pequenas com grandes quantidades de mitocôndrias. Os espermatozóides são células côncavas na porção apical e convexa na porção distal, apresentando uma pequena espícula assumindo um aspecto semelhante a uma taça ou cálice. Em corte transversal, os ductos deferentes apresentam-se revestidos por tecido conjuntivo e podem apresentar um epitélio cúbico a cilíndrico; apresentam em seu interior um aglomerado de células nutridoras localizadas na porção excêntrica e espermatozóides situados no lúmen dos ductos. A análise estrutural das gônadas de M. amazonicum, demonstrou a existência três morfotipos distintos no Furo das Marinhas.

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