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1	Mécanisme de l'enzyme d'oxydation de l'eau Ishida-Blanc, Naoko 16 December 2009 (has links) (PDF) L'oxydation de l'eau et la production du dioxygène atmosphérique sont réalisées par le Photosystème II. Le centre catalytique du PSII est constitué d'un cluster de 4 ions manganèse et de 1 ion calcium. Sous l'action de la lumière, le complexe Mn4Ca passe par 5 états d'oxydation successifs (S0 à S4) avant l'émission d'oxygène au cours de la transition S4 à S0. Bien que l'ion Ca2+ soit détecté dans les structures cristallographiques actuelles, son rôle reste à préciser. Un deuxième cofacteur est mis en jeu : le chlorure, dont la position et le rôle dans le dégagement d'oxygène ne sont pas clairement définis. Pour étudier ces deux cofacteurs, nous avons réalisé le remplacement biosynthétique du Ca2+ et du Cl- par du Sr2+ et/ou du Br- dans la cyanobactérie thermophile Thermosynechococcus elongatus. Le dégagement d'oxygène sous éclairement continu diminue après substitution des cofacteurs. Il varie dans l'ordre suivant : Ca/Cl>Ca/Br>Sr/Cl>Sr/Br. Dans le chapitre III, nous mettons en évidence que cette baisse d'activité est due à un ralentissement de certaines étapes du transfert d'électron, et plus particulièrement de la transition S3 à S0 durant laquelle une phase de délai a été mise en évidence. Nous montrons que cette phase de délai correspond à une modification de l'environnement électrostatique de la chlorophylle P680, impliquant très probablement des mouvements de protons. Nous arrivons ainsi à détecter un intermédiaire réactionnel au cours de la transition, grâce au ralentissement dû à l'échange des cofacteurs Ca2+ et Cl-. Ces cinétiques ralenties accompagnent une baisse du niveau d'énergie libre de l'état S3 et donc du potentiel d'oxydo-réduction du couple S3/S2. Dans le chapitre IV, le chlorure est remplacé biochimiquement par de l'iodure après une étude des conditions d'échangeabilité de l'halogénure. A nouveau, une baisse d'activité sous éclairement continu est expliquée par un ralentissement des cinétiques d'oxydation du cluster de Mn4Ca. Les propriétés thermodynamiques du PSII sont modifiées en présence d'Imais il reste à savoir si cela est dû à la réduction du cluster de Mn4Ca par l'iodure, ou à une augmentation du potentiel redox du couple S3/S2. Dans le chapitre V, nous nous intéressons à différents aspects structuraux des échantillons substitués biosynthétiquement. D'une part, nous mettons en évidence l'implication directe du Ca2+ dans la fixation des molécules d'eau substrat, ainsi que des phénomènes de protonation/déprotonation ayant lieu au cours du cycle des états Si. D'autre part, nous montrons que nos résultats sont en faveur de l'existence de deux sites de fixation aux halogénures. [CHIM:OTHE] Chemical Sciences/Other Photosytème II cofacteurs calcium chlorure transfert d'électrons échange cyanobactérie
2	Amélioration des connaissances de la physiologie de Candida shehatae pour une quantification des phénomènes biologiques et leur modélisation lors de la fermentation alcoolique des pentoses / Improvement of knowledge about Candida shehatae physiology to quantified biological phenomenon and model them during alcoholic fermentation of pentose Montheard, Julie 26 September 2013 (has links) Résumé confidentiel / No abstract Métabolisme du xylose Cofacteurs Modélisation métabolique Fermentation Éthanol Flux métabolique Candida shehatae Xylose metabolism Ethanol yield optimization Candida shehatae Metabolic flux analysis 579.5
3	Intégration du VIH-1 : Contrôle et régulation de l'interaction fonctionnelle entre l’intégrase et la chromatine / HIV-1 Integration : Control and regulation of the functional interaction between integrase and chromatin Matysiak, Julien 15 December 2016 (has links) L’intégrase (IN) du VIH-1 est une enzyme clé du cycle viral catalysant l’insertion stable de l’ADN viral dans le génome de la cellule infectée. L’IN participe également à de nombreuses étapes du cycle viral telles que la transcription inverse ou la maturation virale. Ainsi, la compréhension des mécanismes régulant l’intégration du VIH-1 représente un enjeu majeur dans le cadre notamment d’approches thérapeutiques. En effet, les études montrent que ces mécanismes sont finement régulés dans la cellule par des facteurs viraux et cellulaires agissant à différentes étapes du cycle viral. C’est donc dans ce contexte que nous avons étudié les facteurs à la fois viraux et cellulaires régulant ce processus. Dans un premier temps, les déterminants viraux modulant l’intégration dans la chromatine ont été analysés dans le cas de plusieurs modèles rétroviraux. Puis, dans un second temps, nous avons étudié l’impact de facteurs cellulaires, identifiés au laboratoire, sur les mécanismes d’insertion de l’ADN viral dans le génome cellulaire. Mon travail de thèse s’est ainsi articulé en trois axes majeurs aboutissant à : ● La démonstration de la régulation de l’intégration rétrovirale par la structure chromatinienne de l’hôte ● L’identification de nouveaux cofacteurs cellulaires participant à la régulation de l’intégration dans la chromatine dont le complexe de remodelage FACT « Facilitates Chromatin Transcription » ● L’identification d’une nouvelle interaction fonctionnelle entre l’IN du VIH-1 et la queue amino-terminale de l’histone humaine H4 et de son rôle dans la sélectivité de l’intégration / HIV-1 integrase (IN) is a key enzyme of the viral cycle that catalyzes the stable insertion of viral DNA into the genome of the infected cell. IN also participates in many stages of the viral cycle such as reverse transcription or viral maturation. Thus, an understanding of the mechanisms regulating the integration of HIV-1 is a major challenge, particularly in the context of therapeutic approaches. Indeed, studies show that these mechanisms are finely regulated in the cell by viral and cellular factors acting at different stages of the viral cycle. It is in this context that we studied both viral and cellular factors regulating this process. Initially, the viral determinants modulating the integration in chromatin were analyzed in the case of several retroviral models. Then, we studied the impact of cellular factors, identified in the laboratory, on the mechanisms of insertion of the viral DNA in the cellular genome. My thesis work has thus been articulated in three major axes leading to: • The demonstration of the regulation of retroviral integration by the chromatin structure of the host • The identification of new cellular cofactors participating in the regulation of chromatin integration, including the FACT remodeling complex "Facilitates Chromatin Transcription" • The identification of a new functional interaction between the HIV-1 IN and the amino-terminal tail of human H4 histone and its role in the selectivity of integration. VIH-1 Intégration Intégrase IN Chromatine Sélectivité Cofacteurs cellulaires FACT MLV PFV ASV H4K20me1 HIV-1 Integration Integrase IN Chromatin Selectivity Cellular cofactors FACT MLV PFV ASV H4K20me1
4	Dépolitisations d'une épidémie - La lutte internationale contre le sida et les politiques de santé en Tanzanie Hunsmann, Moritz 13 June 2013 (has links) (PDF) Alors que les stratégies de lutte contre le sida en Afrique sub-saharienne mettent en jeu des compromis politiques nationaux fondamentaux, elles sont souvent formulées de manière hétéronome et dans un contexte marqué par la prédominance des bailleurs occidentaux. À partir de l'étude du cas tanzanien, cette thèse analyse différents aspects proprement politiques de la lutte contre le sida, à travers une double perspective : l'étude de l'élaboration des stratégies nationales de prévention et de traitement du VIH et l'analyse critique de leurs fondements biologiques et épidémiologiques. La recherche se fonde sur une enquête de terrain combinant 92 entretiens approfondis avec les principaux acteurs institutionnels au niveau national, et l'observation des processus décisionnels lors de réunions programmatiques. Cette thèse met ainsi en évidence l'attention politique inégale accordée aux différents récits causaux de la propagation du virus, et le rôle de ces histoires causales dans la formulation des politiques de prévention. Elle donne à voir les stratégies de non-décision ou de " contournement du politique " qu'adoptent les acteurs face aux arbitrages difficiles qu'impose la définition de priorités dans un contexte d'insuffisance des ressources. Enfin, à partir d'une analyse des controverses au sujet des effets de la réponse internationale au VIH/sida sur la cohérence des politiques de santé en Tanzanie, la thèse explore les contradictions d'une lutte verticale contre le sida dans un contexte marqué par un système de soins défaillant et une mauvaise santé générale de la population. Elle examine, sur cette base, les conditions d'élaboration d'une critique émancipatrice. VIH/sida sida VIH Tanzanie Afrique dépolitisation épidémie lutte contre le sida Afrique subsaharienne économie politique du sida soins de santé primaires Alma Ata prévention du VIH cofacteurs histoires causales transmission iatrogène politiques fondées sur des preuves aide sanitaire aide internationale aide au développement développement triage non-décision priorisation prévention structurelle programmes verticaux TACAIDS ONUSIDA Fonds mondial OMS Banque mondiale PEPFAR hétéronomie accès universel trithérapie antirétroviraux biopolitique souveraineté politiques de santé santé globale santé mondiale santé internationale système de santé distorsions intégration nutrition et VIH dépendance critique émancipatrice après-développement politique de l'urgence aide au développement critique de l'aide vie nue

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