Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Química, Programa de Pós-Graduação em Química, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-10-02T22:29:32Z No. of bitstreams: 1 2018_LuísGuilhermeGomesdeSá.pdf: 3389847 bytes, checksum: 36697c6195c5f03e137127fcce4f0363 (MD5) / Approved for entry into archive by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-10-09T19:01:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_LuísGuilhermeGomesdeSá.pdf: 3389847 bytes, checksum: 36697c6195c5f03e137127fcce4f0363 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-09T19:01:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_LuísGuilhermeGomesdeSá.pdf: 3389847 bytes, checksum: 36697c6195c5f03e137127fcce4f0363 (MD5) Previous issue date: 2018-10-09 / Peptídeos antimicrobianos (AMPs) têm despontado como uma alternativa promissora aos antibióticos convencionais. Sua forma de ação, baseada em características inerentes à AMPs, permite que sejam ativos contra os mais diferentes patógenos com poucos relatos sobre resistência. Dentre as diversas formas de identificar novas moléculas com atividade antimicrobiana, a pesquisa de sequências encriptadas dentro de proteínas complexas mostra-se uma boa fonte de moléculas bioativas. Considerando as propriedades físico-químicas de AMPs de origem natural como ponto de partida para a síntese de novos peptídeos com atividade antimicrobiana, bem como a possibilidade de encontrar sequencias de AMPs encriptadas dentro de proteínas, esta dissertação busca explorar esses fatos como forma de identificar AMPs intragênicos. Coleções de proteínas de duas espécies, Bos taurus e Gallus gallus, foram pesquisadas como fonte de novos AMPs. A pesquisa é feita com base nas características físico-químicas de AMPs por meio do software Kamal. Após avaliação da possiblidade de agir como agente antimicrobiano, três peptídeos foram selecionados e sintetizados por meio da técnica de síntese de peptídeos em fase sólida. Os peptídeos Bt01, Bt02 e Gg01 foram testados quanto sua interação com membranas modelo usando as técnicas de Dicroísmo Circular e Calorimetria Diferencial de Varredura, além de ter seu potencial antimicrobiano frente a culturas de Escherichia coli e Staphylococcus aureus. Todos os três peptídeos sintetizados apresentaram atividade antimicrobiana em concentrações na faixa de 4 – 8 μM. Posteriormente, um peptídeo foi selecionado para co-precipitação em sistemas poliméricos, sendo analisadas sua presença e dispersão no meio por meio de MALDI e espectroscopia de absorção UV-Vis. Por fim, a atividade antimicrobiana do filme sintetizado foi preliminarmente investigada frente a meios de cultura líquido de E. coli, mostrando inibição de crescimento microbiano para todas as concentrações testadas. / Antimicrobial peptides have emerged as a good alternative to conventional antibiotics. Their form of action, based on characteristics inherent to AMPs, allows them to be active against the varied pathogens with few reports of resistance. Among the several ways to identify new molecules with antimicrobial activity, the search for encrypted sequences within complex proteins is a good source of bioactive molecules. Based on the assumption that physical-chemical characteristics of naturally occurring AMPs can be used as a starting point for the synthesis of new peptides with antimicrobial activity, as well as the possibility to find AMP sequences encrypted within proteins, this dissertation seeks to explore these facts as ways to identify intragenic AMPs. The genome of two species, Bos taurus and Gallus gallus, was investigated as sources for new AMPs. The research is based on the physical-chemical characteristics of AMPs using the software Kamal. After evaluating the possibility of acting as an antimicrobial agent, three peptides were selected and synthesized by solid phase peptide synthesis. Their interaction with models membranes was evaluated using Circular Dichroism and Differential Scanning Calorimetry and their antimicrobial potential was determined against Escherichia coli and Staphylococcus aureus. Peptides Bt01, Bt02 and Gg01 presented antimicrobial activity in concentrations in the range of 4 – 8 μM. Additionally, one of the synthesized peptides was selected for co-precipitation in polymeric systems, and its presence and distribution in the product was evaluated by MALDI MS and UV-Vis spectroscopy. The antimicrobial potential of the synthetic film was evaluated against E. coli, showing antimicrobial activity at all the investigated concentrations.

A edificação é mais do que um complexo unitário definido por seus aspectos volumétricos e tipológicos. Além de procurar satisfazer requisitos conceituais, estéticos e estruturais, o projetista deve prever o comportamento funcional dos materiais e elementos construtivos utilizados nas fachadas das edificações. Este trabalho se insere dentro dos estudos relativos à conservação das fachadas. Através da observação do patrimônio edificado estuda a influência dos detalhes arquitetônicos no estado de conservação das fachadas do centro histórico de Porto Alegre. Utiliza um estudo comparativo entre levantamento fotográfico pré-existente (1989) e atual. Através deste foi possível analisar o envelhecimento natural e o estado de conservação das fachadas levando-se em conta a contribuição dos detalhes arquitetônicos para a conservação das mesmas. As edificações escolhidas para o estudo de caso, estão localizadas no Centro Histórico da cidade de Porto Alegre, foram construídas entre o final do séc. XIX e início do séc. XX. Para análise do estado de conservação foi necessário estudo sistemático dos condicionantes externos de degradação que atuam sobre a edificação ao longo do tempo. Após sistematização do conhecimento geral sobre os fatores de degradação das fachadas observou-se que os exemplares encontram-se em condições satisfatórias de conservação, visto que não sofreram manutenção preventiva nos últimos 17 anos, e estão inseridos em meio ambiente agressivo, devido à transformação urbanística que sofreu o Centro Histórico da cidade de Porto Alegre. Verificou-se que o uso de detalhes de proteção é responsável por grande parte do desempenho satisfatório das edificações no que se refere ao envelhecimento natural. Observou-se que frisos e molduras que possuem dimensão acima de 40mm cumprem a função de proteção da superfície da fachada eficientemente e detalhes acima de 100mm proporcionam plataforma para deposição de sujidades, independente da forma.

O peptídeo antimicrobiano P34, produzido por Bacillus sp. P34, bactéria isolada do intestino do peixe Piau-com-pinta da bacia amazônica, tem potencial uso como bioconservante em alimentos, principalmente aqueles que sofrem tratamento térmico. Neste trabalho, foi realizado um estudo da modelagem cinética de inativação térmica do peptídeo antimicrobiano P34, além de calcular os parâmetros cinéticos e termodinâmicos em diferentes condições de estresse. Amostras de 1,0 ml da bacteriocina P34 em solução tampão pH 4,5, 6,0 ou 7,0 ou em solução tampão pH 7,0 com adição de 1 ou 5% de cloreto de sódio ou ainda em leite desnatado ou integral sofreram tratamento térmico entre 90°C e 120°C por até 300 min. Os resultados m ostram que a equação de reação de primeira ordem é a que melhor descreve a cinética de inativação térmica do peptídeo P34. Os valores D em pH 4,5 variaram entre 14 e 192 min, com valor z de 27 °C; em pH 6,0, esse parâmetro variou entre 2 6 e 191 min, com valor z de 33 °C; já em tampão fosfato 10 mM pH 7,0, os va lores D variaram entre 39 e 227 min com valor z de 27 °C; em pH 7,0 com adição de 1% de cloreto de sódio os valores D variaram de 28 a 245 min, com valor z de 37 °C; com a adição de 5% de sal em pH 7,0 os valor es D variaram entre 32 e 698 min, com valor z de 24 °C. A diminuição do pH reduziu a estabilidad e térmica do peptídeo P34. Em altas temperaturas a presença de sal reduziu a estabilidade térmica, enquanto nas menores temperaturas estudadas houve aumento da sua resistência. Resultados similares ocorreram em leite. Em altas temperaturas houve mais rápida inibição da atividade antimicrobiana do peptídeo P34. Os valores D, em leite desnatado, variaram entre 32 a 327 min, enquanto em leite integral, entre 17 a 194 min. Já em leite integral a 90 °C não houve inibição da atividade do peptídeo. A presença de gordura acelerou a inibição da bacteriocina, possivelmente devido ao rompimento da membrana dos glóbulos de gordura, permitindo a adsorção do peptídeo na fração lipídica em altas temperaturas. A análise termodinâmica sugere que o desdobramento da molécula do peptídeo P34 pode ser o passo determinante para a inativação térmica irreversível nas condições testadas. Os resultados mostram que o peptídeo P34 pode ser usado em condições de pasteurização ou de esterilização, mantendo parte de sua atividade antimicrobiana após o tratamento térmico. / The antimicrobial peptide P34, produced by Bacillus sp. P34, a bacterium isolated from the gut of the Piau-com-pinta fish from the aquatic environment of the Amazon basin, has potential use as bioconservante in foods, especially those that suffer heat treatment. In this work, a study was performed to analyse the applicability of various inactivation models available in the literature and their thermodynamic and kinetic parameters under different stress conditions were calculated. Aliquots of 1,0 ml of the bacteriocin at pH 4,5, 6,0 or at sodium phosphate buffer pH 7,0; and at skim or fat milk were heated in sealed tubes (1 mm of in the range of 90-120 °C for over 300 min. T he first-order model provided the best description of the kinetics of inactivation. The D values at pH 4,5 the D values ranged between 14-192 min, with z value of 27 °C; at pH 6,0 ranged from 25 to 191 min, with z value of 33 °C; at phosphate buffer at pH 7,0 ranged between 39-227 min, with z value of 38 °C; at pH 7,0 with addition of 1% of sodium chloride the D values ranged between 28-245 min, with z value of 37 °C; with the addition of 5% of the salt at pH 7,0 the D values ranged from 32 to 698 min, with z value of 24 °C. The low pH reduced the thermal stability of the peptide P34. At high temperatures the presence of salt reduced the thermal stability, while at the lower temperatures studied there was an increase of its resistence. Similar results occurred in milk. At high temperatures there was a faster inhibition of antimicrobial peptide P34. The D values, at skim milk, ranged between 32 and 327 min, while at fat milk, between 17 and 194 min. At 90 °C, in fat milk, the peptide was not inhibited. The presence of fat accelerated the inhibition of bacteriocin, possibly due to disruption of the membrane of fat globules, allowing the adsorption of the peptide in the lipid fraction at high temperatures. The thermodynamic analysis suggests that the unfolding of the molecule of the peptide P34 may be the a determining step for the irreversible thermal inactivation under the conditions tested. The results show that the peptide P34 can be used under pasteurization or sterilization conditions, manteining part of its antimicrobial activity after the thermal processing.

Este estudo teve por objetivo estimar, pelo modelo CENTURY, a alteração no estoque de carbono orgânico (CO) de solos do Planalto do Rio Grande do Sul durante o período de expansão da agricultura e o potencial de recuperação do estoque de CO através de diferentes sistemas de manejo. Foram utilizados solos de cinco Unidades de Mapeamento (UM), sob vegetação original de campo e floresta: LATOSSOLO VERMELHO Distófico típico (UM Cruz Alta e Passo Fundo), LATOSSOLO VERMELHO Distroférrico típico (UM Santo Ângelo e Erechim) LATOSSOLO BRUNO Alumínico câmbico e (UM Vacaria). Avaliou-se a expansão da agricultura nas UM, a variação no conteúdo de CO dos solos por decomposição microbiana e erosão e a emissão ou seqüestro de CO2 em cenários de manejo com diferentes adições de C, métodos de preparo do solo e perdas de solo por erosão. Durante o período de expansão da agricultura (1900-1980), o uso de sistemas de cultura com baixa adição de C, pousio, queima de resíduos e preparo convencional do solo, ocasionou reduções estimadas de 31 a 45% no estoque original de CO dos solos. Com a melhoria nos eventos de manejo a partir de 1981, houve a recuperação parcial no estoque de CO. Considerando o balanço de CO e CO2 para a região em estudo (52506 km2), o cenário de manejo 1 (PC trigo/soja com queima) apresentou perda total estimada de 159517,0x103 Mg de CO e emissão de 299562,10x103 Mg de CO2 à atmosfera. Nos demais cenários, foram estimados incrementos de CO em relação ao cenário 1, atingindo, em 2050, valores correspondentes a 68,5% (cenário 2 - PR trigo/soja sem queima), 92,7% (cenário 3 - PD trigo/soja, aveia/soja, aveia/milho) e 98,1% (cenário 4 - PD trigo/soja, aveia/milho) do estoque original de CO. Devido a alta adição anual de C (6,0 Mg ha-1) e uso do plantio direto, o cenário 4 apresentou seqüestro líquido de 52173,32x103 Mg de CO2.

Homonota uruguayensis é um pequeno lagarto endêmico da Savana Uruguaia, ecorregião pertencente ao Bioma Pampa. Distribui-se em uma área muito restrita no sudoeste do estado do Rio Grande do Sul (Brasil) e noroeste do Uruguai onde ocorrem afloramentos de basalto provenientes dos derrames vulcânicos que originaram a Formação Serra Geral. Assim como ocorre com a biodiversidade da Savana Uruguaia em geral, essa espécie é ainda pouco conhecida. Essa região vem sofrendo com uma crescente descaracterização dos seus ecossistemas originais e possui uma parcela ínfima de áreas protegidas. A filogeografia é uma ferramenta que possibilita o acesso à distribuição geográfica da variabilidade genética dentro de uma espécie, auxiliando na identificação de linhagens evolutivamente independentes que mereçam maior atenção em programas de manejo e conservação. Para compreender melhor a história evolutiva dessa espécie, 106 amostras de H. uruguayensis provenientes de sete localidades no Rio Grande do Sul e cinco no Uruguai, e amostras de dois grupos externos (H. borelli e H. fasciata, um indivíduo cada) foram caracterizadas através do sequenciamento de genes mitocondriais (citocromo b e 12S) e nucleares (BDNF). Além disso, dezesseis variáveis morfométricas foram caracterizadas e analisadas em um subconjunto dos indivíduos coletados. Os resultados mostraram que H. uruguayensis possui uma marcada estruturação filogeográfica, com a formação de quatro clados de linhagens mitocondriais que diferem em até 5% entre si, e sem compartilhamento de haplótipos mitocondriais entre as localidades. Embora diferentes métodos de análise tenham recuperado topologias distintas, uma comparação entre diferentes hipóteses topológicas feita através de uma análise bayesiana sugere que a população localizada mais ao norte da distribuição (Cerro do Tigre) representa a divergência mais ancestral nessa espécie. A estruturação dos haplótipos mitocondriais é coincidente com a distribuição geográfica, sugerindo um cenário de intensa filopatria com isolamento por distância. Apesar da grande variação encontrada nos genes mitocondriais, nenhuma variação foi observada no gene nuclear BDNF. As análises morfométricas corroboram os resultados genéticos mostrando uma tendência à diferenciação morfológica entre algumas populações. Segundo as estimativas, a separação entre H. uruguayensis em relação a seus grupos irmão se deu na transição do Mioceno para o Plioceno e a coalescência das linhagens mitocondriais de H. uruguayensis está no limite do Pleistoceno, por volta de 2,5 Ma. A população de Cerro do Tigre pode estar passando por um processo de especiação e por isso deve ser priorizada em um programa de manejo e conservação da espécie. / Homonota uruguayensis is a small gecko endemic to the Uruguayan Savanna, an ecoregion belonging to the Pampa biome. It is distributed in a narrow area, restricted to the southwest of the Rio Grande do Sul state (Brazil) and the northwest of Uruguay, where there are basalt outcrops resulting from the volcanic eruptions that originated the Serra Geral formation in Southern Brazil. As it occurs with most of the biodiversity within this region, this is still a poorly studied species. This region is undergoing a growing degradation of its autochthonous ecosystems, but only a very minor proportion of its area is under protection. Phylogeography is a tool that allows the characterization of the geographic distribution of the genetic variation within a species, which may help to identify evolutionary independent lineages that deserve higher priority status in management and conservation programs. For a better understanding of the evolutionary history of this species, 106 samples of H. uruguayensis individuals from seven localities in Rio Grande do Sul and five in Uruguay, and samples from two outgroup species (H. borelli and H. fasciata, one individual each), were sequenced for mitochondrial (cytochrome b and 12S) and nuclear (BDNF) genes. In addition, sixteen morphometric variables have been characterized and analyzed in a subsample of the collected individuals. Our results show that H. uruguayensis has a strong phylogeographic structure, with mitochondrial lineages forming four clades which differ up to 5% among them, and no haplotype sharing among localities. Even though different analytical methods recovered different topologies, a Bayesian factor comparison between them suggests that population in the northern edge of the distribution (Cerro do Tigre) represents the most ancient divergence within the species. The genetic structure of the mitochondrial haplotypes is concordant with geographic distribution suggesting a scenario of strong philopatry and isolation by distance. In spite of the wide variation shown by the mitochondrial genes, no variation was found for the nuclear BDNF gene. The morphological analyses corroborate the results from the mitochondrial markers, with some populations being distinct from the others. It was estimated that the separation between H. uruguayensis and its ougroups occurred between the upper and mid-Miocene, while the coalescence of H. uruguayensis haplotypes was in the Pleistocene limit, around 2.5 million years ago. The population from Cerro do Tigre may be undergoing an incipient process of speciation, and should therefore receive high priority in conservation and management programs for this species.

O conhecimento que temos sobre a história natural de quelônios ocorrentes no Brasil, e principalmente no estado do Rio Grande do Sul, é ainda rudimentar. As principais causas dessa carência de informações na literatura são atribuídas à dificuldade de obtenção de dados de animais na natureza. As ações humanas colocaram em risco várias populações de quelônios e sua biodiversidade tem declinado por todo o mundo. Desta forma, este estudo busca informações básicas acerca da historia natural de populações sinantrópicas, investigando alguns aspectos da história natural de uma comunidade de quelônios que ocorre no Parque Estadual Delta do Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. O trabalho foi executado entre abril de 2003 e dezembro de 2006 em três pontos amostrais distintos no interior do Parque: Ilha da Pintada, Fazenda Kramm e Ilha das Flores. Os animais foram capturados manualmente e com armadilhas iscadas. Todo o animal capturado foi identificado como espécie, teve o sexo determinado a partir dos caracteres sexuais secundários e recebeu um número individual de identificação. Os espécimes foram pesados e medidos em comprimento (CC) e largura (LC) da carapaça, em comprimento (CP) e largura (LP) do plastrão, em altura do casco (AC), em comprimento da sutura médio ventral (CSMV), em largura cefálica (LCF) e o comprimento da cauda foi registrado em duas porções: distância da cloaca em relação à margem do plastrão (CD1) e comprimento total (CD2). A dieta dos animais foi analisada através do exame do conteúdo fecal, o qual foi obtido após manter os espécimes capturados confinados em baldes com água por cerca de 24 horas. A temperatura a que foram expostos os ovos durante a incubação, em condições naturais, foi monitorada a intervalos de três horas por um período de vinte e quatro horas mensalmente, durante os cinco primeiros meses de incubação. Cerca de 40% dos ovos retirados destes ninhos foram incubados em condições artificiais. Assim, foram comparados os gradientes de temperatura em ambas condições, bem como o período de incubação e o comportamento de eclosão e emergência dos filhotes. Durante este estudo, no Delta do Jacuí, foram registrados a tartarugatigre- d’água Trachemys dorbigni (66% das capturas), o cágado-preto Acanthochelys spixii (8%), o cágado-de-pescoço-de-cobra Hydromedusa tectifera (5%) e o cágado-cinza Phrynops hilarii (21%). Estas espécies ocuparam diferentes tipos de hábitats, tais como, banhados, canais, sacos, rios, canais de irrigação, quadras de arroz, poças e cavas. A destruição e a fragmentação do hábitat, a poluição e a desinformação humana foram as principais ameaças aos quelônios no Parque. As primeiras observações sobre a variação no padrão de escutelação em T. dorbigni, descritas nesta tese, revelaram que 7,7 % dos machos, 10,52% das fêmeas, 14,28% dos imaturos e 6,52% dos filhotes eram portadores de algum tipo de anomalia no casco, bem como apresentaram escudos epidérmicos supernumerários. A associação de diferentes fatores ambientais, interagindo sobre o desenvolvimento embrionário dos indivíduos, parece ser a responsável pela alteração do padrão de escutelação nesta espécie. O exame do conteúdo fecal demonstrou que parte da dieta de T. dorbigni foi composta de gastrópodes nativos (familia Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) e material vegetal (Poaceae, Angiospermae), além da presença de areia e material sintético. Estes resultados culminaram com uma informação inédita na literatura, qual seja, a predação de T. dorbigni sobre o mexilhão-dourado (Limnoperma fortunei). Este fato demonstra a importância do estudo deste quelônio como potencial controlador biológico do mexilhãodourado, uma espécie introduzida no delta. Outra informação importante e, também, original foi o primeiro registro de ocorrência da tartaruga-americana Trachemys scripta elegans, em ambientes ocupados pela espécie nativa T. dorbigni, no Parque Estadual Delta do Jacuí. Durante o estudo de alguns parâmetros populacionais de Trachemys dorbigni foram capturados 137 exemplares (30 machos, 93 fêmeas e 14 jovens), com taxa de recaptura relativamente baixa (5,1%). O período de atividade destes quelônios foi registrado entre os meses de agosto e abril. A densidade dos indivíduos residentes nas três áreas de coleta foi de 19.0, 7.3 e 4.0 tartarugas/ha e a biomassa, respectiva, foi de 62,2 Kg (20,73 Kg/ha), 49,94 Kg (8,32 Kg/ha) e 44,64 (4,96 Kg/ha). Não foram encontradas diferenças morfométricas significativas entre os espécimes coletados nas três áreas. A razão sexual foi igual a 1:1 e a distribuição de classes de tamanho revelou que a população era marcadamente composta por adultos (89,78%). Os ninhos construídos pelas fêmeas de Phrynops hilarii são constituídos de abertura, pescoço e câmara de incubação com dimensões médias de 143 por 126 mm. Os ovos (N = 78), oriundos de seis ninhos, foram caracterizados como esféricos, 34 x 32 mm (grau de esfericidade = 0,9561), brancos, de casca calcária e com peso médio de 21,47 g. Destes, 50 foram monitorados em condições naturais e 28, em condições artificiais. O período de incubação variou de 157 a 271 dias, em condições naturais, e de 130 a 191 dias, em condições artificiais e o sucesso de eclosão foi de 42,86 a 75% e 50 a 100% nas respectivas condições. A temperatura média no interior dos ninhos oscilou de 24,17 a 27,27°C, e foram similares às temperaturas médias do substrato, que variaram de 24,62 a 27,05°C e às médias do ar que oscilaram de 23,4 a 25,27 °C, enquanto que a temperatura média em condições artificiais foi de 22,18°C. Os filhotes eclodidos em condições artificiais foram significativamente maiores do que aqueles eclodidos em condições naturais. Os resultados obtidos neste estudo, além de revelar similaridades com outras espécies de quelônios, servirão como suporte para futuras estratégias de conservação dos hábitats e das espécies ocorrentes no Rio Grande do Sul. / The knowledge we have about the natural history of chelonians occurring in Brazil, especially in Rio Grande do Sul state, is very limited. This lack of information is probably due to the difficulty of data collection from nature. Human actions jeopardize several chelonian populations and their biodiversity has been decreasing over the world. Thus, the present study focuses on basic information about natural history of synantropic populations; investigating some aspects of natural history of a chelonian community that occurs in the Delta do Jacuí State Park, Rio Grande do Sul state, Brazil. The present work was carried out between April 2003 and December 2006 in three distinct sampling stations inside the Park: Pintada Island, Kramm Farm, and Flores Island. The animals were captured manually or by baited traps. All animals captured were identified to species level, were categorized in males or females according to secondary sexual characters, and received an individual identification number. All specimens were weighed and the following measurements were taken: length (CL) and width (CW) of carapace, length (PL) and width (PW) of plastron, height of the shell (HS), length of the medium ventral suture (MVSL), head width (HW), and length of the tail recorded as the distance from the cloacae relative to the border of the plastron (TL1) and as total length (TL2). The diet of the animals was analyzed by examining fecal contents which was collected from captured animals kept in a bucket filled with water for a period of 24 hours. The ambient temperature, in which the eggs were incubated, in natural conditions, was monitored monthly every three hours for a period of 24 hours, in the first five months of incubation. About 40% of the eggs removed from these nests were incubated in artificial conditions. Thus, temperature gradients were compared in both conditions, as well as incubation period, hatching behavior and emergence of the juveniles. During the present study, the following chelonian species were found in the Delta do Jacuí State Park: Orbigni’s slider Trachemys dorbigni (66% of total captures), spiny necked turtle Acanthochelys spixii (8%), South American snake necked turtle Hydromedusa tectifera (5%) e o Hilaire’s side-necked turtle Phrynops hilarii (21%). These species occupied different types of habitats, such as marshes, canals, ponds, rivers, irrigation channels, rice fields, puddles, and cavas (artificial pool). Habitat destruction and fragmentation, pollution, and human action were the main threats to the chelonians in the Park. First observations about the variations in the pattern of scute formation in T. dorbigni, presented here, revealed that 7.7 % of males, 10.52% of females, 14.28% of immatures, and 6.52% of the juveniles carried a type of anomaly in the shell, as well as presented supernumerary epidermal shields. The combination of several environmental factors, acting on the embryonic development of the individuals might be responsible for the modification of the pattern of scute formation in this species. Analyses of fecal contents showed that part of the diet of T. dorbigni was composed by native gastropods (family Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) and plant material (Poaceae, Angiospermae). Also, sand and synthetic material was found in the feces. These results are novel since they indicate predation of T. dorbigni on golden mussel (Limnoperma fortunei), demonstrating the relevance of studying this chelonian as potential biological control for the golden mussel, an introduced species in the delta. Another new and important finding was the occurrence of the American turtle Trachemys scripta elegans, in environments occupied by the native species T. dorbigni, in the Delta do Jacuí State Park. During the study of some population parameters of Trachemys dorbigni a total of 137 specimens was captured (30 males, 93 females, and 14 juveniles), with a relatively low recapture rate (5.1%). The period of activity of these chelonians was recorded between August and April. The density of residents in the three sampling areas was 19.0, 7.3, and 4.0 turtles/ha and the respective biomass was 62.2 Kg (20.73 Kg/ha), 49.94 Kg (8.32 Kg/ha), and 44.64 (4.96 Kg/ha). No significant morphometric differences were found among specimens collected in the three sampling areas. Sexual ratio was 1:1 and the distribution of size classes revealed that the population was markedly composed by adults (89.78%). Nests constructed by females of Phrynops hilarii had an apperture, a neck, and an incubation chamber with mean dimensions of 143 by 126 mm. The eggs (N = 78), collected from six nests, were characterized as spherical, 34 x 32 mm (spherical degree = 0,9561), white, with a calcareous shell and a mean weight of 21.47 g. A total of 50 eggs were monitored in natural conditions, while 28 were kept in artificial conditions. The incubation period varied between 157 and 271 days, in natural conditions, and from 130 to 191 days, in artificial conditions. Hatching success ranged from 42,86 a 75% and from 50 to 100% in the respective conditions. Mean temperature inside the nests varied between 24.17 and 27.27°C, was similar to the substrate mean temperatures that ranged between 24.62 and 27.05°C, and to the air mean temperatures that oscillated between 23.4 and 25.27 °C. Mean temperature in artificial conditions was 22.18°C. Juveniles hatched in artificial conditions were significantly larger than those coming from natural conditions. In addition to reveal some similarities with other chelonian species, the results presented in this study may be used as a model for future conservation strategies for habitats and species occurring in Rio Grande do Sul state.

218 f. / Submitted by Cynthia Nascimento (cyngabe@ufba.br) on 2013-02-27T13:55:33Z No. of bitstreams: 1 Raphael Auguste Dantas.pdf: 13192676 bytes, checksum: 603215880bb113b01e93aa9cec4a9c3b (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-03-01T17:52:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Raphael Auguste Dantas.pdf: 13192676 bytes, checksum: 603215880bb113b01e93aa9cec4a9c3b (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-01T17:52:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Raphael Auguste Dantas.pdf: 13192676 bytes, checksum: 603215880bb113b01e93aa9cec4a9c3b (MD5) / CAPES / Os moluscos bivalves e crustáceos são encontrados ao longo de praticamente todo o litoral brasileiro e são utilizados na composição de diversos pratos típicos da culinária regional. A Baía de Todos os Santos é um dos maiores pólos baianos de extrativismo de mariscos, porém as marisqueiras da região utilizam técnicas rudimentares para processar este tipo de alimento, pois, a maioria, desconhece os conceitos básicos das Boas Práticas de Fabricação. A carne dos mariscos é altamente perecível e pode transmitir microrganismos com potencial patogênico, caso haja falhas higiênicas nas suas etapas de processamento. Entretanto, o risco que a população enfrenta ao consumir este tipo de alimento não depende, unicamente, da aplicação correta de técnicas higiênicas durante seu processamento e da aplicação do frio durante o seu armazenamento. O tipo de marisco ingerido, a estação do ano e a qualidade das águas estuárinas onde estes foram coletados também influenciam, diretamente, a qualidade do produto final. Neste trabalho, foi avaliada a qualidade higiênico-sanitária de vôngole (Anomalocardia brasiliana) e de siris da Família Portunidae processados nos distritos de Mutá, Pirajuía e Ourives pertencentes ao município de Jaguaripe e no município de Salinas da Margarida, todos situados no entorno da Baía de Todos os Santos. Foi acompanhada cada etapa de processamento dos mariscos através da tomada de tempo e temperatura e pesquisa da presença de Escherichia coli e estafilococos coagulase positiva nos utensílios e na superfície das mãos das marisqueiras. Em seguida, foram aliquotadas amostras de 250 gramas dos mariscos após o processamento, em pacotes individuais em embalagens sem vácuo e a vácuo em igual proporção. Parte do marisco foi refrigerada (7°C) e outra parte congelada (-18°C). A vida útil do produto foi avaliada através de sucessivas análises microbiológicas e físicoquímicas realizadas com 0, 3, 6, 9 e 12 dias de armazenamento para os mariscos refrigerados e 0, 1, 2, 3, 4, 5 e 6 meses para os mariscos congelados. As análises microbiológicas foram compostas por contagens de microrganismos mesófilos aeróbios e anaeróbios facultativos, microrganismos psicrófilos totais, bolores e leveduras, clostrídios sulfito redutores, estafilococos coagulase positiva, coliformes termotolerantes com identificação de E. coli e pesquisa de Salmonella spp para os mariscos congelados realizados de acordo com metodologia proposta pela American Public Health Association. Para os mariscos refrigerados, foram realizadas as mesmas análises microbiológicas, além da determinação do número mais provável de Vibrio parahaemolyticus. Foram realizadas análises físico-químicas de pH e Reações de Éber para H2S e amônia. Os resultados das análises foram submetidos a regressões lineares para correlacionar o tempo de armazenamento com o pH e os parâmetros microbiológicos. As etapas de processamento dos mariscos consistiram de colheita/captura, lavagem, cocção, catação e estocagem sob refrigeração. Durante a 6 cocção, a temperatura dos mariscos ultrapassou os 98°C durante um tempo médio de 15 minutos para o vôngole e nove minutos para o siri. Durante a colheita e catação do vôngole, 30% e 50% das marisqueiras, respectivamente, apresentaram contaminação da superfície das mãos por estafilococos coagulase positiva, enquanto durante a catação do siri, 60% das marisqueiras mostraram contaminação da superfície das mãos por essa bactéria. Os utensílios usados para conter os mariscos após a catação apresentaram presença de estafilococos coagulase positiva em 30% para o vôngole e 40% para o siri; 20% e 40% das mãos das marisqueiras mostraram contaminação por E. coli durante a colheita e catação do vôngole, respectivamente; 20% dos utensílios utilizados para o processamento do vôngole também estavam contaminados por essa bactéria. Não foi encontrada E. coli nas mãos das marisqueiras e utensílios utilizados durante as etapas de processamento do siri. V. parahaemolyticus e Salmonella não foram isolados nos dois mariscos analisados. As amostras de siri também não apresentaram contaminação por coliformes termotolerantes/E. coli e clostrídios sulfito redutores. Entretanto, foi encontrado contagem de microrganismos mesófilos de até 9,19 LogUFCg-1 para o vôngole refrigerado e 8,88 LogUFCg-1 para as amostras de siri refrigerado. Os microrganismos psicrófilos alcançaram valores de até 8,24 LogUFCg-1 para o vôngole refrigerado e 10,17 LogUFCg-1 para o siri refrigerado. Os bolores e leveduras foram afetados pelas baixas temperaturas e pelo vácuo oscilando suas contagens ao redor de 3 LogUFCg-1 para ambos os mariscos. Os estafilococos coagulase positiva alcançaram valor máximo de 5,31 LogUFCg-1 no vôngole refrigerado e 7 LogUFCg-1 no siri refrigerado. O vôngole apresentou contaminação de até 3,54 LogUFCg-1 para coliformes termotolerantes e 2,11 LogUFCg-1 para clostrídios sulfito redutores. Quanto às análises físico-químicas, os testes de amônia e H2S não se mostraram bons parâmetros para a avaliação da vida útil do siri apresentando resultado positivo no momento zero para as amostras refrigeradas e congeladas nos dois tipos de embalagens. Entretanto, para as amostras de vôngole refrigerado, nos dois tipos de atmosfera, o teste foi eficiente demonstrando resultado positivo no sexto dia de armazenamento do produto. No vôngole congelado, o teste de amônia revelou o processo de deterioração do produto com três meses de armazenamento, enquanto o teste de H2S revelou deterioração do produto em seis meses. Quanto ao pH, o vôngole atingiu o valor mais baixo (6,18) com três dias de armazenamento para as amostras refrigeradas em embalagem sem vácuo. Para o siri, o valor mais alto (8,65) foi alcançado com nove dias de armazenamento para as amostras refrigeradas em embalagem sem vácuo. O congelamento se revelou a melhor opção para armazenar os mariscos, uma vez que estendeu a vida útil dos mariscos por cinco meses, enquanto as amostras sob refrigeração tiveram vida útil de seis dias. A aplicação do vácuo não se mostrou vantajosa em relação às amostras embaladas sem vácuo. Uma melhor higiene das mãos e utensílios das marisqueiras utilizados durante a catação dos mariscos seria importante para reduzir significativamente a contaminação da carne processada por estafilococos coagulase positiva e E. coli e, provavelmente, aumentaria a vida de prateleira dos mesmos. / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Farmácia. Salvador-Ba, 2010.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-22T08:52:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O. catharinensis Mez. é uma árvore nativa, monóica, com flores hermafroditas, dispersão zoocórica e ameaçada de extinção, que ocorre na Floresta Ombrófila Densa nos Estados da região Sul e Sudeste do Brasil. Estudos demográficos e o entendimento da distribuição da variabilidade genética entre e dentro de populações permitem melhor orientação das práticas de restauração, conservação e manejo de uma espécie. Este trabalho teve por objetivo contribuir para a definição de estratégias de conservação em populações naturais de O. catharinensis a partir da avaliação da estrutura demográfica, estrutura genética e estrutura genética interna. Para isto, foram amostrados indivíduos reprodutivos (DAP 5cm) em quatro populações naturais de O. catharinensis no Estado de Santa Catarina: Parque Estadual da Serra do Tabuleiro (PEST), Santo Amaro da Imperatriz, SC (27o44'43"S, 48o49'13"W), Parque Botânico do Morro Baú (PMB), Ilhota, SC (26o47'56"S, 48o55'49"W), Área Particular da MOBASA (CP), Corupá, SC (26º25'06"S, 49º22'02"W) e Área Particular do Produtor Antônio Alberton (GP), Grão Pará, SC (28º14'17"S, 49º17'40"W). O estudo da estrutura demográfica foi realizado a partir do georeferenciamento destes indivíduos nas populações. Obteve-se para a O. catharinensis uma densidade média para o Estado de Santa Catarina de 7 indivíduos por hectare, densidade inferior a registrada para a espécie em estudos realizados na década de 1950. Foi encontrada para a O. catharinensis uma distribuição espacial agregada e similar nas quatro populações estudadas. Sugere-se que esta distribuição agregada nos indivíduos adultos seja conseqüência da possível dispersão e deposição de sementes de maneira agrupada realizados pela fauna, especialmente por primatas (Cebus apella e Alouatta spp). A estrutura genética das quatro populações de O. catharinensis foi investigada utilizando-se 18 locos alozímicos. As estimativas do número médio de alelos por loco (2.2), percentagem de locos polimórficos (83.3%) e a diversidade genética (0.4265), foram similares às obtidas para outras espécies de Lauraceae. A endogamia detectada nas populações ( = -0.0114) e a endogamia total ( = 0.1330) sugerem estrutura nas populações; foi encontrada uma alta divergência entre as populações ( = 0.1428). Sugere-se que a divergência populacional está relacionada à migração e dispersão de sementes realizadas pelos dispersores da O. catharinensis, e associado com a paisagem e as distâncias entre as populações. O resultado obtido da estimativa do tamanho mínimo viável de cada população revelou a possibilidade de sobrevivência de 10 gerações de O. catharinensis, nos locais amostrados. Contudo, a área atual dos fragmentos amostrados mostrou-se insuficiente quando comparada a área mínima viável para conservação destas populações (64ha) por mais de 10 gerações. A análise de autocorrelação espacial evidenciou a presença de uma estrutura interna nas primeiras classes (até 100m), sugerindo a presença de uma estrutura familiar. Os resultados do presente estudo sugerem que a dispersão das sementes da espécie, que ocorre de forma zoocórica, também seja o principal fator responsável pela estruturação dentro das populações. Os presentes resultados sugerem que as estratégias para a conservação in situ da O. catharinensis devem ser intensificadas em diferentes populações localizadas em floresta climáxica entre cotas de 300 a 900m de altitude e que a conectividade dos fragmentos de floresta climáxica tem que ser restabelecida para a manutenção do fluxo gênico e para contrapor um futuro aumento da divergência entre as populações.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-02T18:21:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 666114 bytes, checksum: 86753123eb3b6d61a0fd45f6a38a117a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-02T18:21:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 666114 bytes, checksum: 86753123eb3b6d61a0fd45f6a38a117a (MD5) Previous issue date: 2002-04-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar o efeito da temperatura e do tipo de acondicionamento sobre a perda de peso e sobre as modificações nos teores de açúcares e amido nos grãos de espigas de milho verde dos híbridos AG 1051 e DINA 170 (ambos recomendados para a produção de milho verde), no intuito de se estudar o comportamento pós- colheita dos mesmos. A colheita das espigas ocorreu 83 dias após o plantio, quando as espigas dos híbridos AG 1051 e DINA 170 apresentavam 79,5% e 80,5% de umidade, respectivamente. Após a colheita, os trabalhos foram conduzidos no Laboratório de Pós-colheita do Departamento de Fitotecnia, da Universidade Federal de Viçosa. Dois ensaios foram conduzidos: um sob temperatura ambiente de 22oC ± 1,8oC; e outro a 5oC (simulando a temperatura de balcões frigorificados). Nestes ambientes de armazenamento, foram comparados três modos de acondicionamento: espigas empalhadas, espigas despalhadas e espigas embaladas (em bandejas de isopor seladas com filme PVC). Foram avaliadas as seguintes características, perda de peso e as modificações nos teores de açúcares solúveis totais, açúcares redutores, açúcares não redutores e de amido. Os dados foram submetidos à análise de variância pelo teste F e as médias comparadas pelo teste Tukey, ambos a 5% e a 1% de probabilidade ou por meio de regressão. Os resultados obtidos permitiram concluir que: o tratamento espiga embalada a 5oC e em temperatura ambiente foi o único que permitiu perda de peso aceitável comercialmente, independente do híbrido utilizado. Vale ressaltar que em temperatura ambiente, há possibilidade de ocorrência de fermentação a partir do quinto dia de armazenamento. A perda de peso do tratamento espiga empalhada do híbrido DINA 170, em temperatura ambiente, é menor que a do híbrido AG 1051, o que confirma a qualidade pós-colheita das espigas do híbrido DINA 170 para esta condição. A diferença no ciclo dos híbridos pode influenciar as concentrações de açúcares e amido nos grãos colhidos com aproximadamente 80% de umidade. Em temperatura ambiente, as espigas embaladas , acumulam menores teores de amido, independente do híbrido utilizado. A embalagem com filme PVC, mesmo a 5oC, não foi capaz de reduzir as taxas de acúmulo de amido das espigas de milho verde de ambos os híbridos, durante dez dias de armazenamento. A taxa de degradação de açúcares solúveis totais é semelhante nos dois híbridos estudados, independente da temperatura de armazenamento, levando-se em consideração as diferenças iniciais de concentração obtidas no ponto de colheita. / To better understand the postharvest behavior of green corn-cobs of AG 1051 and DINA 170 hybrids (both recommended for the green corn yield), effects of temperature and package systems on weight loss and changes of sugar and starch content were evaluated. When cobs were harvested (83 days after planting), hybrids of AG 1051 and DINA 170 showed 79.5% and 80.5% of moisture content, respectively. After the harvest the work was carried out in the Postharvest Laboratory of the Phytotechnology Department in the Federal University of Viçosa. Two treatments were evaluated: a) with an environmental temperature of 22oC ± 1.8oC; and b) with a temperature of 5oC (in order to simulate a freezer temperature). Both storage environments were compared to three package systems: 1) cobs packed with straw; 2) cobs packed without straw; and 3) cobs wrapped and sealed with PVC film in styrofoam trays. Weight loss, changes in total soluble sugar, reducers and non-reducers sugars, and starch contents, were evaluated. Data was analyzed with the F test and averages were compared by the Tuckey test (p < 0.05 and p < 0.01) or by regression. Results showed that the wrapped cob stored at both studied temperatures (22oC and 5oC) was the only package system that obtained the commercial acceptable weight loss, independent of the hybrid that was used. It was verified that at environmental temperatures there is a possibility of fermentation from the fifth day of storage. The weight loss of cobs from the DINA 170 hybrid using the package system with straw at environmental temperature was less than to the AG 1051 hybrid, confirming the postharvest quality of the first hybrid under these conditions. With approximately 80% of moisture content, the difference in the life cycle of hybrids can affect the sugar and starch concentrations of the harvested grains. At environmental temperature the wrapped cobs accumulated less contents of starch, independently of the hybrid. The wrapped system was not able to reduce the accumulation rate of starch for both hybrids after 10 days, even at 5oC of temperature. The degradation rate of total soluble sugar is similar for both hybrids, independent of the storage temperature, considering the initial concentrations obtained at the day of harvesting. / Não foi localizado o cpf do autor.

Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-28T19:09:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 565699 bytes, checksum: 4f2e7d56105fde185f38ab1bb357efb7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-28T19:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 565699 bytes, checksum: 4f2e7d56105fde185f38ab1bb357efb7 (MD5) Previous issue date: 2000-08-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Este estudo foi realizado na região limítrofe ao Parque Estadual de Ibitipoca, na comunidade rural de Rancharia, que dista 10 km da referida unidade de conservação e 34 km da sede do município de Lima Duarte, na região da Zona da Mata do Estado de Minas Gerais. O objetivo do trabalho foi testar a metodologia de planejamento do ecoturismo, para se obter um zoneamento ecoturístico para a região trabalhada. A referida metodologia foi desenvolvida pela The Ecoplannete Institute (1994), do Canadá, difundida no Brasil na Fazenda Intervales, em São Paulo, para 28 consultores brasileiros. Como resultado primário, obteve-se o comprometimento dos protagonistas da comunidade rural de Rancharia, interessados em desenvolvê-la ambiental e socialmente, com a afirmação da missão e o estabelecimento dos objetivos que nortearam todo o trabalho. Como resultado secundário, foram feitos o levan- tamento e o inventário dos recursos ambientais, sociais e históricos, entre outros, com potencialidade para desenvolver produtos padronizados sob a ética da atividade. Como resultado terciário, foram utilizados os limites de mudanças aceitáveis como uma técnica para caracterizar e monitorar os possíveis impactos socioambientais negativos da atividade ecoturística. Como resultado quaternário, a pesquisa de mercado possibilitou o reconhecimento das tendências dos visitantes na região e as possibilidades em programar produtos e roteiros de viagens que inovem as experiências dos viajantes aventureiros, com maior qualidade de informações sobre a região de Rancharia. O entrelaçamento de todos esses resultados possibilitou o zoneamento da região, que permitirá desenvolver diretrizes de produtos com padrões definidos de sustentabilidade. / This work was carried out in the region of the boundaries of the "Parque Estadual de Ibitipoca", in the rural community named Rancharia, located 10 km from that conservation unit 34 km from de main kown of the municipality, Lima Duarte, in the "Zona da Mata" region of the State of Minas Gerais, Brazil. The objective of the work was to test the ecotourism planing methodology to obtain an ecotouristic zoning for the region. This methodology was developed by the Ecoplannete Institute (1994) of Canada, and was introduced in Brazil at the "Fazenda Intervales", in São Paulo State, for 28 Brazilian consultants. As a first result, the commitment of the leaders of the rural community of Rancharia, interested in environmental and social development was obtained; their statement of the goals and establishment of objectives directed all of the work. As a second result, a survey and an inventory of the environmental, social and historical resources were made, among others, viewing a professional development of standardized products. As a third result, the limits as acceptable changes were defined which were used as a technique to characterize and monitore the possible negative social and environmental. As a fourth result, the market research helped to acknowledge the profile as visitors in the region, and the possibilities of programming products and travelling routes, to enlarge the experience of adventurer travellers, offring better information quality of the region of Rancharia. The integration of all those results allowed the zoning of the region, which will allow the development of patterns for products whith definite sustainable standards.