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Anotação do transcriptoma parcial de Anopheles (Nyssorhynchus) darlingi Root, 1926Azevedo Junior, Gilson Martins de 17 May 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-05-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Disease-transmitting insects have been studied to characterize several
biological and evolutionary aspects. Whole Genome sequencing has been allowing
comparisons between the gene sequences of different species, providing molecular
data. The mosquitoes Anopheles gambiae (subfamily Anophelinae), the most
important vector of malaria in Africa, whose genome contains 278.253.050 base
pairs (bp), Aedes aegypti, transmitter of Dengue, with 1.310.090.344 bp and Culex
quinquefasciatus, vector of arbovirus, with 579.042.118 bp, both of (subfamily
Culicinae) are cited. In Brazil, the Anopheles darlingi (subfamily Anophelinae) is the
most important malaria vector, whose partial EST (Expressed Sequences Tags)
libraries of adults and larvae previously obtained were analyzed in this study. Genic
sequences of An. gambiae, Ae. aegypti and Cx. quinquefasciatus were analyzed for
the presence of orthologous genes, in these mosquitoes in comparison with An.
darling. An. darlingi’s ESTs (568 Unigenes) were virtually mapped in An. gambiae’s
chromosomes. After that, differential gene expressions were analyzed, which
allowed to statistically quantify the levels of differential expression of each gene, in
the transcriptome of An. darlingi. The An. darlingi sequences were mapped
according to onthologic terms of Gene Ontology (GO) and the sequences
differentially expressed, with good statistical value that indicates the orthology were
manually analyzed, according to the literature.The studies showed that 61% of An.
darlingi are orthologous in An. gambiae and the in silico chromosomal mapping
showed that the An. darling’s 568 Unigenes are represented in 793 chromosomal
regions of An. gambiae, corroborating with evolutionary studies that say that the two
species are evolutionarily close. An. darlingi sequences mapped in GO were
associated with 1249 ontholgy levels and sublevels that describe a gene according
to its function and cellular location. Differential expression analysis of some gene
products was found more intense in larvae than in An. darlingi adults. Phylogenetic
analysis of the An. darlingi glutathione-s-transferase (GST) gene was also done, an
insecticide resistance gene which is well conserved, evolutionarily speaking, in An.
gambiae, Ae. aegypti and Cx. quinquefasciatus. The Phylogenetic tree grouped An.
darlingi and An. gambiae as sister species, because they are more evolutionarily
related than Ae. aegypti and Cx. quinquefasciatus. In this analyses, the
Phlebotomus papatasi was used as an external group, as the root of the tree. The
manual annotation of An. darlingi ESTs sequences helped to understand the gene
expression and evolutionary aspects of this mosquito related with An. gambiae, Ae.
aegypti and Cx. quinquefasciatus, and also provided important data for further
studies about individual genes of this malaria-transmitting species in Brazil. / Insetos transmissores de doenças têm sido estudados para caracterização de
diversos aspectos biológicos e evolutivos. Sequenciamentos de genomas inteiros
têm permitido comparações entre sequências gênicas de espécies diferentes,
fornecendo dados moleculares. Citam-se os mosquitos Anopheles gambiae
(subfamília Anophelinae), principal vetor da malária na África, cujo genoma contém
278.253.050 pares de bases (pb), o Aedes aegypti, transmissor do Dengue, com
1.310.090.344 pb e Culex quinquefasciatus, vetor de arboviroses, com 579.042.118
pb, ambos da (subfamília Culicinae). No Brasil, o Anopheles darlingi (subfamília
Anophelinae) é o principal vetor da malária, cuja bibliotecas de ESTs (Expressed
SequenceTags) parcial de adultos e larvas previamente obtidas foram analisadas
no presente trabalho. Sequências gênicas de An. gambiae, Ae. aegypti e Cx.
quinquefasciatus foram analisadas quanto a presença de genes em comum e
genes ortólogos, nesses mosquitos em comparação com An. darlingi. ESTs (568
Unigenes) de An. darlingi foram mapeadas virtualmente em cromossômos de An.
gambiae. Em seguida, foram realizadas análises de expressão diferencial gênica, o
que permitiu quantificar estatisticamente os níveis de expressão de cada gene, no
transcriptoma de An. darlingi. As sequências de An. darlingi foram mapeadas nos
termos ontológicos do Gene Ontology (GO) e as sequências diferencialmente
expressas, com bons valores estatísticos que indicam ortologia, foram analisadas
manualmente, segundo a literatura. Os resultados mostraram que, 61% das
sequências de An. darlingi são ortólogas em An. gambiae e o mapeamento
cromossômico in silico mostrou que os 568 Unigenes de An. darlingi estão
representados em 793 regiões cromossômicas do An. gambiae, corroborando
estudos evolutivos de que as duas espécies são próximas evolutivamente. As
sequências de An. darlingi analisadas no programa GO foram associadas a 1.249
níveis e subníveis de ontologias que descrevem um gene de acordo com sua
função e localização celular. Análises de expressão diferencial de alguns produtos
gênicos mostraram-se mais intensas em larvas do que em adultos de An. darlingi.
Realizaram-se, ainda, a análise filogenética do gene da Glutationa-S-Transferase
(GST) de An. darlingi, um gene de resistência a inseticidas bem conservado em
termos evolutivos em An. gambiae, Ae. aegypti e Cx. quinquefasciatus. A árvore
filogenética agrupou o gene da GST de An. darlingi com An. gambiae como
espécies irmãs, estando estas proximamente relacionadas evolutivamente do que
em relação ao Ae. aegypti e Cx. quinquefasciatus. O Phlebotomus papatasi,
constou como grupo externo, para enraizamento dessa árvore. A anotação manual
de ESTs de An. darlingi auxiliou na compreensão da expressão gênica e aspectos
evolutivos desse mosquito em relação ao An. gambiae, Ae. aegypti e Cx.
quinquefasciatus, além de fornecer dados importantes para estudos posteriores
sobre funções gênicas individuais de An. darlingi transmissor da malária no Brasil.
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Citotaxonomia de arraias de água doce (Myliobatiformes, Potamotrygonidae) da bacia Amazônica centralValentim, Francisco Carlos de Souza 16 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The family Potamotrygonidae in the order Myliobatiformes comprises all the
Neotropical freshwater ray species. The knowledge about this fish group is
limited, for example, the species number is uncertain, some species names
are questionable, there is no information about how their diversification in
freshwater happened, and there are no studies about their real marine sister
group. Cytogenetic studies in this family are incipients. With the objective of
widen the knowledge about this fish group, that arouses interests in aquarium,
and are indicated as an overfishing group, were analyzed, cytogenetically,
seven nominal species and two cytotypes: Plesiotrygon iwamae (2n=74,
FN=120), Potamotrygon sp. C (cururu) (2n=67♂/68♀, FN=104/106), with a
sex determination system XX/X0, Potamotrygon sp. C1 female (2n=68,
FN=108), Potamotrygon scobina (2n=66, FN=102), Potamotrygon cf. scobina
(2n=66, FN=101), both with a probable sex determination system XX/XY,
Potamotrygon constellata (2n=66, FN=110), Potamotrygon leopoldi (2n=64,
FN=102), Potamotrygon orbignyi (2n=66, FN=106), with a confirmed XX/XY
system and Potamotrygon motoro from
differents localities of the central
Amazon basin. Among the specimens of Potamotrygon sp. identified a distinct
female specimen, which showed the same diploid number (2n=68) of
Potamotrygon sp. C, but with different morphology and karyotype formula.
Therefore, it may represent another species to be recognized and described
this taxon, provisionally named Potamotrygon sp. C1. However, the
occurrence of the system XX/XO may for now be characterized only in
Potamotrygon sp. C. All the species presented multiple nucleolar organizer
regions (NORs), although those regions were not always active, and the silver
nitrate stains number ranged from four to eight, in most of the metaphases
they were localized in the terminal position of the long arms, except in one
pair in P. constellata that was localized in the short arm. The constitutive
heterochromatin is located, in the centromeric regions of all the complement
chromosomes, in all the species. Chromosomal rearrangements, specially
fusions or fissions, inversions and translocations, were indispensable
mechanisms of karyotype evolution in the freshwater stingrays, and may be
involved in the speciation processes of this group. / A família Potamotrygonidae, ordem Myliobatiformes abriga todas as
espécies de arraias de água doce neotropical. Pouco ainda se conhece a
respeito deste grupo de peixes, por exemplo, o número de espécies é incerto,
alguns nomes ainda são duvidosos, como ocorreu sua diversificação em
água doce, qual o grupo irmão marinho. Estudos citogenéticos são ainda
incipientes nesta família. Com o objetivo de ampliar o conhecimento neste
grupo de peixes, de grande interesse na aquariofília e com indicativos de
sobrepesca, foram analisadas, citogeneticamente, sete espécies nominais:
Plesiotrygon iwamae (2n=74, NF=120), Potamotrygon sp. C (cururu)
(2n=67♂/68♀, NF=104/106), com sistema de determinação do sexo XX/X0,
Potamotrygon scobina (2n=66, NF=102), Potamotrygon cf. scobina (2n=66,
NF=101), ambas com provável sistema de determinação de sexo XX/XY,
Potamotrygon constellata (2n=66, NF=110), Potamotrygon leopoldi (2n=64,
NF=102), Potamotrygon orbignyi (2n=66, NF=106), confirmando a presença
do sistema XX/XY e Potamotrygon motoro de diferentes localidades da bacia
amazônica central. Entre os espécimes de Potamotrygon sp. foi identificado
um exemplar fêmea distinto, que apresentou o mesmo número diploide
(2n=68) de Potamotrygon sp. C, mas com morfologia e fórmula cariotípica
diferenciadas podendo, portanto, representar mais uma espécie a ser
reconhecida
e
descrita
neste
táxon,
provisoriamente
denominada
Potamotrygon sp. C1. Entretanto, a ocorrência do sistema XX/XO pode, por
ora, ser caracterizado apenas em Potamotrygon sp. C. Todas as espécies
têm regiões organizadoras de nucléolo múltiplas, com número variando de 4
a 8, as quais porém, nem sempre estiveram todas ativas. Estas regiões
encontram-se preferencialmente localizadas na região terminal dos braços
longos dos cromossomos, exceto um par presente em P. constellata que se
localizou nos braços curtos. A heterocromatina constitutiva, encontra-se
localizada
na
complemento,
região
em
centromérica
todas
as
de
espécies.
todos
os
cromossomos
Rearranjos
do
cromossômicos,
principalmente os do tipo fusão e/ou fissão, inversões e translocações, foram
mecanismos determinantes da evolução cariotípica das arraias de água doce,
podendo estar implicados nos processos de especiação desse grupo.
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Identificação e caracterização de repetições de seqüências simples (microssatélites) e de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNP) em Trypanosoma rangeli e suas implicaçoes no estudo da estrutura populacional do parasitoSincero, Thaís Cristine Marques 24 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T16:56:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
274888.pdf: 2762357 bytes, checksum: 1bc3459f95132c9e903cdaa20d8a4261 (MD5) / O presente estudo realizou a identificação e análise de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNP) no gene do mini-exon (spliced leader) e na região intergênica do gene da histona H2A, e de sequências repetitivas (microssatélites) em formas epimastigotas e tripomastigotas das cepas SC-58 e Choachí de T. rangeli. Para a análise de microssatélites três abordagens foram utilizadas: a pesquisa em bibliotecas de EST/ORESTES (Expressed Sequence Tags/Expressed Sequence Tags), a pesquisa em bibliotecas genômicas geradas pela metodologia PIMA e a amplificação via PCR de loci previamente identificados em outras espécies. Os microssatélites identificados foram avaliados quanto à abundância, frequência e viabilidade como marcadores genéticos. Os loci identificados por PCR foram avaliados através da genotipagem de 20 cepas e dois clones de T. rangeli. A ocorrência de SNP foi investigada através da clonagem e sequenciamento do produto de amplificação do gene do spliced leader e da região intergênica do gene da histona H2A de formas epimastigotas de diferentes cepas de T. rangeli. Os resultados obtidos com estes marcadores permitiram o estudo da estrutura populacional do T. rangeli, gerando análises filogenéticas consistentes. Os resultados demonstram que o T. rangeli, assim como o T. cruzi, apresenta uma estrutura populacional predominantemente clonal, e a subdivisão populacional pode ser em parte explicada pela classificação nas linhagens KP1+ e KP1-. Uma subdivisão da população KP1- foi detectada e confirmada utilizando os marcadores microssatélites identificados, sugerindo eventos recentes de evolução, provavelmente influenciados pela troca de hospedeiros durante o ciclo de vida, pela localização geográfica e/ou por uma co-evolução do parasito com suas espécies vetores simpátricas. Novas sequências tipo EST (Expressed Sequence Tags), ORESTES (Open Reading Frame EST) e GSS (Genome Survey Sequences) do T. rangeli foram geradas no âmbito do presente estudo. A análise destas sequências, assim como a análise dos microssatélites e de SNP, trará novas perspectivas para compreensão do desconhecido ciclo do parasito em seus hospedeiros mamiferos, assim como para o diagnóstico específico de infecções causadas por T. cruzi e/ou T. rangeli.
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A epistemologia e a psicologia de Jean Piaget e as neurociências uma revisão sistemática /Obana, João Enzio Gomes. January 2015 (has links)
Orientadora: Alessandra de Morais / Coorientador: Edvaldo Soares / Banca: Adrian Oscar Dongo Montoya / Banca: Alfredo Pereria Júnior / Resumo: Este estudo objetiva investigar, na literatura científica, quais são e como estão sendo desenvolvidos os estudos científicos que buscam relacionar a Epistemologia e Psicologia Genéticas de Jean Piaget com as Neurociências e, quais possíveis contribuições desses estudos para a Educação. Métodos e procedimentos: Esta pesquisa foi realizada mediante revisão sistematizada. Teve como procedimento a localização, seleção e análise de estudos indexados em bases de dados: Scopus, BIREME, Sage Journals, IEEE, PubMed, Oxford Press Journals e ERIC, tendo-se como descritores de busca: Piaget and Neuroscience. Resultados: Foram localizados 145 artigos, os quais foram analisados com base em categorias pré-definidas, que permitiram a organização de um banco de dados, de forma a propiciar o cruzamento das informações identificadas. Após as primeiras exclusões restaram 76 estudos. Com a análise dos abstracts dos estudos restantes, obteve-se 28 estudos. Estes 28 foram lidos na íntegra e excluiu-se os que não relacionavam diretamente o temas, restando 17 estudos incluídos para a Revisão Sistemática. Conclusão: Após a análise devida, concluiu-se que os estudos apresentam relações diretas ou indiretas entre a teorias (piagetianas e da Neurociências). Diretas no sentido de trazer princípios piagetianos aliados à experimentação neurocientífica. As hipóteses piagetianas sobre o desenvolvimento cognitivo são em muitos aspectos confirmadas pelas Neurociências. Contudo, não há relações diretas com a Educação ou quaiquer questões de cunho pedagógico. / Abstract: This study aims to investigate, in the scientific literature, what are and how are the scientific studies being developed that seek to relate Epistemology and Genetic Psychology of Jean Piaget with Neurosciences, and what are the possible contributions of neurosciences to Education. Methods and procedures: This study was conducted under systematic review. The procedure included the location, selection and analysis of studies indexed in the databases: Scopus, BIREME, Sage Journals, IEEE, PubMed, Oxford Press Journals and ERIC, taking as search keywords: Piaget and Neuroscience. Results: 145 articles were found, which were analyzed based on predefined categories that allowed the organization of a database in order to facilitate the crossing of identified information. 76 studies remained after the first exclusions. With the analysis of the abstracts of the remaining studies, 28 studies were obtained. These 28 studies were read in full, and those not related directly to the themes were excluded, leaving 17 studies for Systematic Review. Conclusion: After due analysis, it was concluded the studies have direct or indirect relations between the theories (Piagetian and Neuroscience). Direct in bringing principles Piagetian principles combined with neuro-scientific experiments. The Piagetian hypotheses related to cognitive development are in many ways confirmed by Neuroscience. However, there is no direct relationship with Education or any educational profile issues. / Mestre
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Caracterização fenotípica e molecular da linhagem congênica de ratos SHR.LEW-Anxrr16 como um novo modelo genético para o estudo da ansiedadeMedeiros, Gabriela Ferreira de January 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Farmacologia / Made available in DSpace on 2013-06-25T23:14:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1
308150.pdf: 1510945 bytes, checksum: 78f3e4cef9dc1d8c561694f1ae5a5a5c (MD5) / Um cruzamento entre as linhagens de ratos Lewis (LEW) e Spontaneously Hypertensive Rats (SHR) levou à identificação de um QTL (quantitative trait locus) no cromossomo 4, chamado de Anxrr16, influenciando a locomoção no centro do teste do campo aberto (CA), um índice experimental de ansiedade. Foi observado que, apesar dos animais da linhagem LEW normalmente exibirem um comportamento mais "ansioso" do que os SHR, a presença de alelos da linhagem LEW em Anxrr16 aumentava a locomoção no centro do CA de animais F2, ao contrário do esperado. Uma linhagem congênica (denominada SHR.LEW-Anxrr16, ou SLA16) foi então construída, através de cruzamentos entre as linhagens LEW (doadora) e SHR (receptora), para melhor investigar os efeitos desse locus. Através de testes comportamentais realizados durante a construção desta linhagem (PEREIRA, 2010), o efeito contra-intuitivo desse QTL foi confirmado, entretanto, os dados obtidos não foram conclusivos. O presente estudo teve como objetivos principais o refinamento e a caracterização genotípica e fenotípica da linhagem congênica SLA16, através da genotipagem de três gerações para 20 marcadores moleculares mapeados no cromossomo 4, bem como da avaliação destes animais em testes comportamentais relacionados à emocionalidade. Como uma possível hiperatividade motora foi observada no CA durante o desenvolvimento desta linhagem, e pelo fato da linhagem SHR ser um modelo animal do transtorno do déficit de atenção e hiperatividade (TDAH), a atividade locomotora dos animais congênicos também foi avaliada em ambientes familiares e não-familiares. Além disso, estes animais foram submetidos ao teste da mudança da configuração atencional (MCA) a fim de investigar possíveis efeitos de Anxrr16 sobre a atenção e a flexibilidade comportamental, envolvidos no TDAH. O efeito de Anxrr16 sobre a locomoção no centro do CA foi confirmado. Além disso, esse locus também influenciou medidas de emocionalidade da caixa branca e preta (CBP), do teste triplo (TT) e do labirinto em T elevado (LTE), sempre de maneira contra-intuitiva, de acordo com o estudo que identificou o QTL. Experimentos farmacológicos com uma droga ansiolítica (clordiazepóxido) e uma ansiogênica (pentilenotetrazol), apesar de inconclusivos, sugeriram que o QTL em questão está de fato relacionado à ansiedade. Em relação ao TDAH, diferenças na atividade locomotora foram encontradas, porém, estas desapareceram após um período de habituação, sugerindo que são dependentes do estado emocional do animal e, portanto, não refletem uma hiperatividade espontânea. Efeitos desse locus sobre a atenção e a flexibilidade comportamental não foram detectados, confirmando a ausência de efeito de Anxrr16 sobre fenótipos associados ao TDAH. Com base nestes resultados, conclui-se que o locus Anxrr16, aqui delimitado em uma região do cromossomo 4 de aproximadamente 86 milhões de pares de base, afeta fenótipos associados à ansiedade em ratos, bem como à atividade locomotora em ambientes novos e, portanto, a linhagem congênica SLA16 representa uma importante ferramenta para o melhor entendimento das vias moleculares envolvidas nos comportamentos relacionados à ansiedade. / An intercross between the inbred rat strains Lewis (LEW) and Spontaneously Hypertensive Rats (SHR) led to the identification of a quantitative trait locus (QTL) on chromosome 4, named Anxrr16, influencing locomotion in the central area of the open field (OF) test, an experimental index of anxiety. It was noticed that, even though LEW rats usually display more anxiety-like behaviors than SHR, the presence of LEW alleles on Anxrr16 increased the inner locomotion displayed by F2 animals, contrary to what would be expected. A congenic strain (named SHR.LEW-Anxrr16, or SLA16) was then developed, from a cross between the strains LEW (donor) and SHR (receptor), in order to further investigate the behavioral effects of this locus. Through the behavioral tests performed during the construction of this strain (PEREIRA, 2010), the counterintuitive effect of the Anxrr16 QTL was confirmed, however, the obtained data were not conclusive. The present study's main goals were to refine and characterize genotypically and phenotypically the congenic strain SLA16, by genotyping three generations to 20 molecular markers mapped on chromosome 4, as well as evaluating these animals in emotionality-related behavioral tests. As a possible motor hyperactivity was observed in the OF during the construction of this strain, and for the fact that the strain SHR is an animal model for attention deficit and hyperactivity disorder (ADHD), the locomotor activity of the congenic animals was also evaluated, in familiar and unfamiliar environments. Furthermore, these animals were submitted to the attentional set-shifting (SS) test in order to investigate potential effects of Anxrr16 on attention and behavioral flexibility, traits involved in ADHD. The effect of Anxrr16 over OF inner locomotion was confirmed. Moreover, this locus has also influenced emotionality measures in the light/dark box (LDB), in the triple test (TT) and in the T-maze (TM), in the same counterintuitive manner found in the study that identified Anxrr16 QTL. Pharmacological experiments using an anxiolytic (chlordiazepoxide) and a panicolytic (pentylenetetrazol) drug, although inconclusive, have suggested that this QTL is indeed related to anxiety. Regarding the ADHD phenotypes, differences in locomotor activity were found, however, they have disappeared after a habituation period, suggesting that they depend on the animal's emotional state and, therefore, do not reflect a spontaneous hyperactivity. Effects of this locus over attention or behavioral flexibility were not observed, confirming the absence of Anxrr16 influences on ADHD associated phenotypes. Based on these results, it is concluded that the Anxrr16 locus, herein delimited in a region of chromosome 4 of approximately 86 million base pairs, affects anxiety-related phenoptypes on rats, as well as the locomotor activity in novel places and, for that, the congenic strain SLA16 represents an important tool towards a better understanding of the molecular pathways involved in anxiety-related behaviors.
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Variação genética para os caracteres fisiológicos, bioquímicos e nutricionais em sementes de uma população base de Myracrodruon urundeuva procedente de Aquidauana-MSBerti, Christian Luis Ferreira [UNESP] 02 August 2013 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2013-08-02Bitstream added on 2014-06-13T21:07:43Z : No. of bitstreams: 1
berti_clf_dr_ilha.pdf: 1092178 bytes, checksum: 68a8efc7ddc8d81323b76604a8b8df95 (MD5) / Dentre as espécies que vêm sofrendo interferência antrópica encontra-se a aroeira (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). Como estratégias de conservação propostas, destacam-se a ex situ e entre as estratégias para avaliar a variabilidade genética destaca-se a genética quantitativa, onde são estimados parâmetros genéticos para alguns caracteres. As árvores estudadas pertencem a uma população de polinização aberta de Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) localizada na rodovia de acesso à cidade de Aquidauana, MS. Este trabalho tem como objetivo quantificar a variação genética para os caracteres bioquímicos, físicos, fisiológicos e nutricionais em sementes de Myracrodruon urundeuva, identificar qual(is) teste(s) mais promissores para a determinação da viabilidade em campo de acordo com os teores dos mesmos e fornecer subsídios para conservação in situ e ex situ de Myracrodruon urundeuva. Foram realizadas análises físicas e fisiológicas (germinação, condutividade elétrica e massa de 100 sementes) e análises dos teores de: carboidratos, lipídios, amido, proteínas (albumina, globulina, prolamina e glutelina) e macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg e S) em sementes e obtidas as estimativas de parâmetros genéticos. O conjunto de análises físicas e fisiológicas apresenta-se como o mais apropriado a obter a chance de maior ganho genético por apresentarem os maiores valores de coeficiente de variação relativa, seguidos, respectivamente, de nutricionais e bioquímicos. As médias obtidas para os caracteres bioquímicos foram: albumina (61,34 mg g-1), globulina (10,87 mg g-1), prolamina (58,19 mg g-1), glutelina (289,54 mg g-1), lipídios (21,70 mg g-1), amido (2,61 mg g-1) e carboidratos totais (24,00 mg g-1). Para os caracteres físicos e fisiológicos as médias obtidas foram: condutividade elétrica... / Among the species that have suffered human interference is mastic (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). How conservation strategies proposals stand out ex situ and between strategies to assess the genetic variability highlights the quantitative genetics, which are estimated genetic parameters for some characters. The trees studied belong to a population of open-pollinated Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) located on the access road to the town of Aquidauna, MS. This study aims to quantify the genetic variation for characters biochemical, physical, physiological and nutritional seeds M. urundeuva identify which one (s) test (s) more promising for the determination of viability in the field according to the levels of the same and provide grants for conservation in situ and ex situ M. urundeuva. Analyses physical and physiological (germination, electric conductivity and weight of 100 seeds) and analysis of the levels of: carbohydrates, lipids, starch, proteins (albumin, globulin, prolamin and glutelin) and macronutrients (N, P, K, Ca, Mg and S) in seeds and obtained estimates of genetic parameters. The set of physical and physiological analysis presents itself as the most appropriate to get the chance of greater genetic gain by presenting the highest values of coefficient of relative variation, followed, respectively, nutritional and biochemical. The mean values of biochemical characters were: albumin (61.34 mg g-1), globulin (10.87 mg g-1), prolamin (58.19 mg g-1), glutelin (289.54 mg g- 1), lipids (21.70 mg g-1), starch (2.61 mg g-1) and total carbohydrates (24.00 mg g-1). For the physical and physiological characters the averages were: electrical conductivity (61.34 mg g-1), weight of 100 seeds (10.87 mg g-1) and germination (58.19 mg g-1). The characters had the following nutrient medium: nitrogen (61.34 mg g-1), phosphorus... (Complete abstract click electronic access below)
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A epistemologia e a psicologia de Jean Piaget e as neurociências uma revisão sistemáticaObana, João Enzio Gomes [UNESP] 24 February 2015 (has links) (PDF)
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000832880.pdf: 932297 bytes, checksum: cfadee4e9208ac1905cb9e2a5274a1b5 (MD5) / Este estudo objetiva investigar, na literatura científica, quais são e como estão sendo desenvolvidos os estudos científicos que buscam relacionar a Epistemologia e Psicologia Genéticas de Jean Piaget com as Neurociências e, quais possíveis contribuições desses estudos para a Educação. Métodos e procedimentos: Esta pesquisa foi realizada mediante revisão sistematizada. Teve como procedimento a localização, seleção e análise de estudos indexados em bases de dados: Scopus, BIREME, Sage Journals, IEEE, PubMed, Oxford Press Journals e ERIC, tendo-se como descritores de busca: Piaget and Neuroscience. Resultados: Foram localizados 145 artigos, os quais foram analisados com base em categorias pré-definidas, que permitiram a organização de um banco de dados, de forma a propiciar o cruzamento das informações identificadas. Após as primeiras exclusões restaram 76 estudos. Com a análise dos abstracts dos estudos restantes, obteve-se 28 estudos. Estes 28 foram lidos na íntegra e excluiu-se os que não relacionavam diretamente o temas, restando 17 estudos incluídos para a Revisão Sistemática. Conclusão: Após a análise devida, concluiu-se que os estudos apresentam relações diretas ou indiretas entre a teorias (piagetianas e da Neurociências). Diretas no sentido de trazer princípios piagetianos aliados à experimentação neurocientífica. As hipóteses piagetianas sobre o desenvolvimento cognitivo são em muitos aspectos confirmadas pelas Neurociências. Contudo, não há relações diretas com a Educação ou quaiquer questões de cunho pedagógico. / This study aims to investigate, in the scientific literature, what are and how are the scientific studies being developed that seek to relate Epistemology and Genetic Psychology of Jean Piaget with Neurosciences, and what are the possible contributions of neurosciences to Education. Methods and procedures: This study was conducted under systematic review. The procedure included the location, selection and analysis of studies indexed in the databases: Scopus, BIREME, Sage Journals, IEEE, PubMed, Oxford Press Journals and ERIC, taking as search keywords: Piaget and Neuroscience. Results: 145 articles were found, which were analyzed based on predefined categories that allowed the organization of a database in order to facilitate the crossing of identified information. 76 studies remained after the first exclusions. With the analysis of the abstracts of the remaining studies, 28 studies were obtained. These 28 studies were read in full, and those not related directly to the themes were excluded, leaving 17 studies for Systematic Review. Conclusion: After due analysis, it was concluded the studies have direct or indirect relations between the theories (Piagetian and Neuroscience). Direct in bringing principles Piagetian principles combined with neuro-scientific experiments. The Piagetian hypotheses related to cognitive development are in many ways confirmed by Neuroscience. However, there is no direct relationship with Education or any educational profile issues.
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Herança, manutenção e origem dos diferentes tipos de cromossomos B em Prochilodus lineatus (Characiformes, Prochilodontidae) do rio Mogi-GuaçuPenitente, Manolo [UNESP] 21 February 2014 (has links) (PDF)
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000783206_20150121.pdf: 445977 bytes, checksum: 568c0580cc83af24804e6cc469e54cb0 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-23T10:59:21Z: 000783206_20150121.pdf,Bitstream added on 2015-01-23T10:59:53Z : No. of bitstreams: 1
000783206.pdf: 439530 bytes, checksum: d981e11be6f161c4a118125005a6a2bf (MD5) / Prochilodus lineatus constitui-se em uma espécie de grande ocorrência na bacia superior do rio Paraná, envolvendo, sobretudo, os rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu. Citogeneticamente, essa espécie apresenta número diploide de 54 cromossomos dos tipos meta/submetacêntricos e apresenta um interessante sistema de microcromossomos B, que pode ocorrer variação interindividual de zero a nove supranumerários, além de apresentar polimorfismo, sendo encontrados diferentes morfotipos. P. lineatus pode ser considerada uma espécie modelo de peixe neotropical, sendo muito utilizada para estudos concernentes à origem, comportamento meiótico e evolução dos cromossomos B, devido à facilidade de captura, manejo, alta frequência de supranumerários e polimorfismo. Atualmente existem muitas especulações a respeito de sua função, origem e herança, o que torna a análise da estrutura do DNA deste tipo cromossômico, assim como o estudo do seu padrão de herança de extrema importância. Diante disto, o presente trabalho teve como objetivo estudar a origem, manutenção e herança das variantes de cromossomos B encontradas em P. lineatus do rio Mogi-Guaçu, a partir da análise da composição do DNA, frequência na população natural e padrão de transmissão destes elementos genômicos. Os resultados obtidos a partir da análise da herança destes supranumerários mostrou dinamismo entre as variantes de supranumerários para prevalecerem nos genomas hospedeiros, por meio do padrão de transmissão (kB), onde o morfotipo B-metacêntrico apresentou kB acima da taxa Mendeliana, indicando um possível mecanismo de acúmulo (drive), enquanto que os morfotipos B-acro e B-submetacêntrico apresentaram kB abaixo da taxa Mendeliana, indicando estarem em estágio de extinção. Ao realizar a técnica de pintura cromossômica, utilizando as sondas B-específicas obtidas a partir da microdissecção de cada morfotipo, observou-se ... / Prochilodus lineatus is a species of high incidence in the upper Paraná River basin, involving mainly the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu Rivers. Cytogenetically, this species has a diploid number of 54 meta/submetacentric chromosomes and presents an interesting system of B microchromosomes, which can occur interindividual variation from zero up to nine supernumeraries, also it presents polymorphism and can be found in different morphotypes. P. lineatus can be considered a model species of neotropical fish, commonly used for studies concerning the origin, behavior and evolution of B chromosomes, due to ease of capture, handling, high frequency of supernumerary and polymorphism. Currently, there are only speculations about its function, origin and inheritance, which make the analysis of the DNA structure of this chromosomal type, as well as the study of the inheritance pattern, of the utmost importance. Faced with this, the present work aimed to study the origin, maintenance and inheritance of the B chromosomes variants found in P. lineatus from Mogi-Guaçu River, from DNA composition analysis, frequency in natural population and transmission pattern of these genomic elements. The results obtained from the inheritance analysis of these supernumerary showed a dynamism between supernumerary variants to prevail in the host genome through the transmission pattern (kB), in which the B-metacentric morphotype presented kB above Mendelian ratio, indicating a possible accumulation mechanism (drive), while the B-acro and B-submetacentric variants presented kB below Mendelian ratio, indicating that they were in extinction stage. When performing the chromosome painting technique, using B-specific probes obtained from each microdissected morphotypes, it was observed a homology between the B chromosome variants, indicating a common ancient variant origin. However, only the B-submetacentric chromosome probe (Bsm) showed ...
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Expressão gênica e polimorfismos de CD33, LAIR1 e LAIR2 em populações e em pênfigo foliáceoCamargo, Carolina Maciel January 2015 (has links)
Orientadora : Profª Drª Maria Luiza Petzl-Erler / Co-orientador : Prof Dr Danillo Gardenal Augusto / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 26/06/2015 / Inclui referências : f. 103-126 / Área de concentração / Resumo: CD33, LAIR-1 e LAIR-2 são receptores semelhantes a imunoglobulina expressos pela maioria das células das linhagens mielóide e linfóide, e são importantes reguladores das respostas imunes. CD33 e LAIR-1 são receptores transmembrana, e LAIR-2 é um homólogo solúvel de LAIR-1 que antagoniza as funções inibidoras deste ao competir pelos mesmo ligantes. Essas proteínas são codificadas por genes localizados no complexo de receptores leucitários (LRC) estendido, no cromossomo 19q13.4. Nesse estudo, investigamos se polimorfismos de base única (SNP) de CD33, LAIR1 e LAIR2 contribuem para susceptibilidade ao pênfigo foliáceo (PF), uma doença autoimune da pele, endêmica no Brasil e caracterizada por autoanticorpos anti-desmogleína 1. A genotipagem foi realizada pelo método iPLEX MassARRAY (Sequenom, San Diego, CA). Encontramos associação de três SNPs de CD33 com PF em uma amostra de indivíduos de ascendência predominantemente europeia (rs273640 T+, OR=0.48, p=0.0025; rs2455069 G+, OR=0.53, p=0.0063; rs1803254 C/C, OR=1.9, p=0.0076), e associação de um quarto SNP em uma amostra de ascendência mista (rs3865444 G+, OR=0.52, p=0.0151). Dois SNPs de LAIR1 (rs56802430 G, OR=1.52, p=0.0329; rs11084332 C, OR=0.57, p=0.0022) e um de LAIR2 (rs2287828 T+, OR=1.9, p=0.0097) também contribuem para susceptibilidade ao PF. Além das associações individuais, observamos interações entre três SNPs de CD33 e quatro SNPs de LAIR2, que estão associados com PF em análises estratificadas. Adicionalmente, analisamos os níveis de RNAm de CD33, LAIR1 and LAIR2 por PCR quantitativa em células mononucleares do sangue periférico (PBMC) de controles. Nossos resultados demonstram que genótipos e haplótipos protetores ao PF estão associados com baixos níveis de CD33m, e que um haplótipo formado por quatro SNPs de LAIR2 está associado com maior susceptibilidade ao PF (OR=4.12, p=0.002) e com maior expressão de LAIR2 (p=0.007). Não encontramos relação entre expressão de LAIR1 e susceptibilidade ao PF. Nossos resultados sugerem que polimorfismos de CD33, LAIR1 e LAIR2 contribuem para susceptibilidade ao PF, e que a expressão diferencial de CD33 e LAIR2 possivelmente influencia a patogênese da doença. Palavras-chave: LAIR1, LAIR2, CD33, pênfigo foliáceo, autoimunidade, susceptibilidade genética. / Abstract: CD33, LAIR-1 and LAIR-2 are immunoglobulin-like receptors expressed in the majority of myeloid and lymphoid cells, and are important regulators of immune responses. CD33 and LAIR-1 are membrane-bound receptors, whereas LAIR-2 is a soluble homolog of LAIR-1 that antagonizes LAIR-1 inhibitory function by binding the same ligands. These proteins are coded by genes located within the extended region of the leukocyte receptor complex (LRC), in the chromosome 19q13.4. In this study, we analyzed if CD33, LAIR1 and LAIR2 single nucleotide polymorphisms (SNP) contribute to differential susceptibility to pemphigus foliceus (PF), an autoimmune blistering skin disease endemic in Brazil and characterized by desmoglein-1 specific autoantibodies. SNPs were analyzed by mass spectrometry-based genotyping (Sequenom, San Diego, CA). We report association of three CD33 SNPs with variable susceptibility to PF in a European predominant ancestry population (rs273640 T+, OR=0.48, p=0.0025; rs2455069 G+, OR=0.53, p=0.0063; rs1803254 C/C, OR=1.9, p=0.0076), and association of a fourth SNP in an admixed population (rs3865444 G+, OR=0.52, p=0.0151). We also found that two LAIR1 (rs56802430 G, OR=1.52, p=0.0329; rs11084332 C, OR=0.57, p=0.0022) and one LAIR2 SNP (rs2287828 T+, OR=1.9, p=0.0097) contribute for differential susceptibility to PF. Moreover, we observed interactions among three CD33 and four LAIR2 SNPs that are associated with PF in stratified analysis. Additionally, we measured CD33, LAIR1 and LAIR2 mRNA expression levels by real time PCR. We demonstrate that protective genotypes and haplotypes mark lower expression levels of CD33m, a mRNA CD33 variant. One LAIR2 haplotype harboring four interacting SNPs is strongly associated with higher susceptibility with PF (OR=4.12, p=0.002) and also with higher LAIR2 expression (p=0.007). We found no evidence of association between LAIR1 expression and PF susceptibility. Our data suggests that CD33, LAIR1 and LAIR2 genetic variants impact PF susceptibility, and that CD33 and LAIR2 variable expression possibly influences PF pathogenesis. Keywords: LAIR1, LAIR2, CD33, pemphigus foliaceus, autoimmunity, genetic susceptibility.
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Variação genética para os caracteres fisiológicos, bioquímicos e nutricionais em sementes de uma população base de Myracrodruon urundeuva procedente de Aquidauana-MS /Berti, Christian Luis Ferreira. January 2013 (has links)
Orientador: Mário Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Marco Eustaquio de Sá / Banca: Bruno Ettore Pavan / Banca: Marco Antonio Camillo de Carvalho / Banca: Camila Regina Baleroni Recco / Resumo: Dentre as espécies que vêm sofrendo interferência antrópica encontra-se a aroeira (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). Como estratégias de conservação propostas, destacam-se a ex situ e entre as estratégias para avaliar a variabilidade genética destaca-se a genética quantitativa, onde são estimados parâmetros genéticos para alguns caracteres. As árvores estudadas pertencem a uma população de polinização aberta de Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) localizada na rodovia de acesso à cidade de Aquidauana, MS. Este trabalho tem como objetivo quantificar a variação genética para os caracteres bioquímicos, físicos, fisiológicos e nutricionais em sementes de Myracrodruon urundeuva, identificar qual(is) teste(s) mais promissores para a determinação da viabilidade em campo de acordo com os teores dos mesmos e fornecer subsídios para conservação in situ e ex situ de Myracrodruon urundeuva. Foram realizadas análises físicas e fisiológicas (germinação, condutividade elétrica e massa de 100 sementes) e análises dos teores de: carboidratos, lipídios, amido, proteínas (albumina, globulina, prolamina e glutelina) e macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg e S) em sementes e obtidas as estimativas de parâmetros genéticos. O conjunto de análises físicas e fisiológicas apresenta-se como o mais apropriado a obter a chance de maior ganho genético por apresentarem os maiores valores de coeficiente de variação relativa, seguidos, respectivamente, de nutricionais e bioquímicos. As médias obtidas para os caracteres bioquímicos foram: albumina (61,34 mg g-1), globulina (10,87 mg g-1), prolamina (58,19 mg g-1), glutelina (289,54 mg g-1), lipídios (21,70 mg g-1), amido (2,61 mg g-1) e carboidratos totais (24,00 mg g-1). Para os caracteres físicos e fisiológicos as médias obtidas foram: condutividade elétrica... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Among the species that have suffered human interference is mastic (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). How conservation strategies proposals stand out ex situ and between strategies to assess the genetic variability highlights the quantitative genetics, which are estimated genetic parameters for some characters. The trees studied belong to a population of open-pollinated Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) located on the access road to the town of Aquidauna, MS. This study aims to quantify the genetic variation for characters biochemical, physical, physiological and nutritional seeds M. urundeuva identify which one (s) test (s) more promising for the determination of viability in the field according to the levels of the same and provide grants for conservation in situ and ex situ M. urundeuva. Analyses physical and physiological (germination, electric conductivity and weight of 100 seeds) and analysis of the levels of: carbohydrates, lipids, starch, proteins (albumin, globulin, prolamin and glutelin) and macronutrients (N, P, K, Ca, Mg and S) in seeds and obtained estimates of genetic parameters. The set of physical and physiological analysis presents itself as the most appropriate to get the chance of greater genetic gain by presenting the highest values of coefficient of relative variation, followed, respectively, nutritional and biochemical. The mean values of biochemical characters were: albumin (61.34 mg g-1), globulin (10.87 mg g-1), prolamin (58.19 mg g-1), glutelin (289.54 mg g- 1), lipids (21.70 mg g-1), starch (2.61 mg g-1) and total carbohydrates (24.00 mg g-1). For the physical and physiological characters the averages were: electrical conductivity (61.34 mg g-1), weight of 100 seeds (10.87 mg g-1) and germination (58.19 mg g-1). The characters had the following nutrient medium: nitrogen (61.34 mg g-1), phosphorus... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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