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Integração de métodos genômicos para seleção de genótipos de pacu (Piaractus mesopotamicus) resistentes à bactéria Aeromonas hydrophila /

Mastrochirico-Filho, Vito Antonio January 2020 (has links)
Orientador: Diogo Teruo Hashimoto / Resumo: O pacu Piaractus mesopotamicus é considerado uma das mais importantes espécies de peixe cultivadas no Brasil. Apesar desta representatividade, esta espécie possui poucas informações genéticas disponíveis, principalmente em relação à resistência às enfermidades. A infecção por Aeromonas hydrophila é responsável por grandes prejuízos econômicos na produção de pacu. Experimentos de desafio, baseados em testes de sobrevivência por exposição dos organismos a patógenos específicos, têm sido realizados para buscar estimativas confiáveis para seleção de famílias geneticamente resistentes às enfermidades. Portanto, os principais objetivos deste estudo foram: 1) avaliar a herdabilidade de resistência do pacu à infecção por A. hydrophila; 2) caracterizar a arquitetura genética com a identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) relacionados com resistência à A. hydrophila, por meio de sequenciamento/genotipagem de SNPs (RAD-Seq, restriction site associated DNA sequencing); 3) caracterizar genes do sistema imune, por meio de sequenciamento RNA-Seq, de indivíduos de pacu submetidos ao desafio de resistência à A. hydrophila. Moderados valores de herdabilidade foram encontrados para sobrevivência e tempo de morte, indicando que a resistência contra A. hydrophila em pacu pode ser melhorada por programas de melhoramento genético. 17.453 SNPs foram identificados pela técnica RAD-Seq, para investigar a arquitetura genética da resistência à infecção por A. hydrophila pelo estudo de associação ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Pacu Piaractus mesopotamicus is considered one of the most important cultivated fish species from Brazil. Despite this representativeness, few genetic information is available for P. mesopotamicus, especially regarding disease resistance. Aeromonas hydrophila infection is responsible for major economic losses in P. mesopotamicus production. Challenge experiments have been performed to evaluate reliable estimates on selection of families genetically resistant to diseases. Therefore, the main objectives of this study were: 1) evaluate the resistance heritability in 36 P. mesopotamicus families subjected to A. hydrophila challenge; 2) characterize the genetic architecture identifying QTLs (Quantitative Trait Loci) related to A. hydrophila resistance by SNP sequencing / genotyping; 3) characterize genes belonging to immune system of individuals submitted to the disease resistance challenge, by transcriptome analysis (RNA-Seq). Moderate heritability values were found for survival rate and time of death, indicating that resistance against A. hydrophila in P. mesopotamicus can be improved by breeding programs. 17,453 SNPs were identified by RAD-Seq technique to investigate the genetic architecture of resistance to A. hydrophila. When a linkage map was constructed, the length of linkage groups (27 linkage groups) varied from 79.95 (LG 14) to 137.01 (LG 1) cM, with a total integrated map length of 2,755.60 cM. 22 QTLs in 17 LGs associated with A. hydrophila resistance suggested a poly... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Citogenética em peixes de cabeceiras de dois riachos pertencentes à bacia do Alto rio Paraná, região de Toledo (PR) / Cytogenetic in fishes from two headwaters streams belonging to the Upper Paraná river basin, Toledo (PR)

Yano, Cássia Fernanda 25 February 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-10T18:13:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cassia Fernanda Yano.pdf: 1692770 bytes, checksum: 2f6626f3bb741520d86130373963a00f (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cytogenetics studies were carried out in two genera of fishes from Pindorama and Lopei streams, Upper Paraná River basin, with cytossistematic and ecologic-evolutionary approaches. In Heptapterus mustelinus, the first cytogenetics characterization in the genus was carried out, verifying 54 chromosomes (26m+18sm+4st+6a), which is a diploid number not observed among the Heptapteridae species till now studied. Differently from the others members of this family, multiple Ag-NORs and centromeric heterochromatin in almost all the chromosome of the complement were observed, being these heterochromatin CMA3+/DAPI- in nine chromosome pairs, beyond that coincident with Ag-NORs. These data show a different way in the karyotypic evolution of H. mustelinus in relation to the others Heptapteridae genus. In the genus Astyanax, an interpopulation comparative analysis was carried out in Astyanax aff. paranae, Astyanax fasciatus and Astyanax altiparanae from Pindorama and Lopei streams, in way to observe the chromosomal differentiation and the evolutionary trends in the three species. It was verified 48 and 50 chromosome in Astyanax aff. paranae and A. fasciatus, respectively, with interpopulation differences in the karyotypic formulae. The diploid number obtained to A. altiparanae was 50 chromosomes, with the same karyotypic formulae in both populations. The three species presented multiple Ag-NORs, with interpopulation differences observed in Astyanax aff. paranae and A. fasciatus. In relation to the heterochromatin distribution pattern, interpopulation differences were verified. The occurrence of Ag-NORs/CMA3+ was observed in the three species, besides DAPI+ bands in A. altiparanae. The results showed that Astyanax aff. paranae and A. fasciatus presented more conspicuous interpopulation differences than A. altiparanae populations, probably due bionomic characteristic that avoid the presence of Astyanax aff. paranae and A. fasciatus to upper segments in the streams, leading to the fixation of chromosomal rearrangements in these populations. However, the absence of interpopulation karyotypic differences in A. altiparanae suggests gene flow between the two populations. By the way, the present study showed that cytogenetics is an important tool in understanding the chromosomal mechanism involved in the evolutionary process in fishes group, and that the association to ecological studies is fundamental to the comprehension of dispersion process of some group of fishes. / Estudos citogenéticos foram realizados em dois gêneros de peixes nos riachos Pindorama e Lopei, pertencentes à bacia do Alto rio Paraná, com diferentes abordagens: citossistemática e ecológico-evolutiva. Em Heptapterus mustelinus foi realizada a primeira caracterização citogenética no gênero, tendo sido verificado 54 cromossomos (26m+18sm+4st+6a), número diplóide não relatado entre os heptapterídeos até o momento estudados. Diferentemente da maioria das espécies da família, foram observadas Ag-RONs múltiplas e heterocromatina presente na região centromérica da maioria dos cromossomos do complemento, sendo estas heterocromatinas CMA3+/DAPI- em nove pares cromossômicos, além daquelas coincidentes com as Ag-RONs. Estes dados revelam um caminho diferente na evolução cariotípica de H. mustelinus em relação aos demais gêneros de Heptapteridae. No gênero Astyanax foi realizada uma análise comparativa entre populações de Astyanax aff. paranae, Astyanax fasciatus e Astyanax altiparanae coletadas nos riachos Pindorama e Lopei, verificando-se as tendências da evolução e diferenciação cromossômica nas três espécies. Nas populações de Astyanax aff. paranae e A. fasciatus foram verificados 48 e 50 cromossomos, respectivamente, mas com diferenças interpopulacionais nas fórmulas cariotípicas em ambas as espécies. O número diplóide para A. altiparanae foi de 50 cromossomos com mesma fórmula cariotípica em ambas as populações. As três espécies apresentaram Ag-RONs múltiplas, com diferenças interpopulacionais observadas em Astyanax aff. paranae e A. fasciatus. Em relação ao padrão de distribuição de heterocromatina, diferenças interpopulacionais foram verificadas. A ocorrência de Ag-RONs/CMA3+ foi observada nas três espécies, além de bandas DAPI+ em A. altiparanae. Os dados demonstraram que Astyanax aff. paranae e A. fasciatus apresentaram diferenças cariotípicas interpopulacionais mais conspícuas do que as populações de A. altiparanae, provavelmente por características bionômicas que restringem Astyanax aff. paranae e A. fasciatus a trechos superiores de riachos, com a fixação de rearranjos cromossômicos nas populações. Entretanto, a ausência de diferenças cariotípicas interpopulacionais em A. altiparanae sugerem fluxo entre as duas populações. De forma geral ficou evidente que a citogenética é uma importante ferramenta para o entendimento dos mecanismos cromossômicos envolvidos no processo evolutivo dentro dos grupos de peixes, e que a associação a estudos de ecologia é fundamental para compreender os processos envolvidos na dispersão de algumas espécies.
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Ajuste do fornecimento automático de ração de acordo com a temperatura da água para tilápias criadas em tanques rede

Carmelin, Celio Aparecido January 2018 (has links)
Orientador: Claudio Angelo Agostinho / Resumo: O estudo teve como objetivo avaliar o fornecimento automático de ração em diferentes períodos para tilápias (Oreochromis niloticus), em diferentes situações ao longo do ano. Foram realizados dois trabalhos, o primeiro objetivou-se avaliar o desempenho de tilápias criadas sob efeito de altas temperaturas, em dois períodos diferentes, sendo o período 1 (0:00 ao 12:00hs) e o período 2 (12:00 a 24:00hs), entre os dias 15 de janeiro e 8 de março de 2017. Os melhores resultados para ganho de peso, peso total e peso médio foram encontrados nos peixes alimentados durante o período 1. Portanto, orienta-se fornecer o alimento, utilizando-se o sistema proposto, durante o período 1, para animais criados sob condições climáticas semelhantes às do experimento. O segundo trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho de tilápias criadas sob efeito de baixas temperaturas, em três períodos diferentes, sendo o período 1, (0:00 ao 12:00hs) o período 2 (12:00 às 24:00hs) e o período 3 (0:00 às 24:00hs), entre os dias 4 de abril e 15 de julho de 2017. Os melhores resultados para ganho de peso e peso total foram obtidos pelos animais alimentados durante o período 2. O pior tratamento foi o período 1 e o período 3 foi intermediário. Portanto, orienta-se fornecer o alimento, utilizando-se o sistema proposto, durante o período 2, para animais criados sob condições climáticas semelhantes às do experimento. / Abstract: The objective of this study was to evaluate the automatic feed supply in different periods for tilapia (Oreochromis niloticus), in different situations throughout the year. Two studies were carried out. The objective of the first study was to evaluate the performance of tilapia grown under high temperature conditions in two different periods: period 1 (0:00 to 12:00) and period 2 (12:00 to 24:00), between January 15 and March 8, 2017. The best results for weight gain, total weight and average weight were found in fish fed during period 1. Therefore, it is advised to provide the feed using the system proposed, during period 1, for animals reared under climatic conditions similar to those of the experiment. The second study had as objective to evaluate the performance of tilapia created under effect of low temperature, in three different periods, period 1 (0:00 to 12:00) period 2 (12:00 to 24:00) and the period 3 (0:00 to 24:00), from April 4 to July 15, 2017. The best results for weight gain and total weight were obtained by animals fed during period 2. The worst treatment was period 1 and period 3 was intermediate. Therefore, it is advised to provide the feed, using the proposed system, during period 2, for animals raised under climatic conditions similar to those of the experiment. / Doutor
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Exigência proteica e respostas metabólicas de juvenis de piapara (Megaleporinus obtusidens)

Almeida, Viviane do Nascimento Santana de January 2019 (has links)
Orientador: Leonardo Susumu Takahashi / Resumo: O objetivo do trabalho foi determinar a exigência proteica e os efeitos da proteína da dieta em indicadores fisiológicos e bioquímicos da piapara (Megaleporinus obtusidens). Para tanto, 300 juvenis (24 ± 1,26 g) foram distribuídos em 20 caixas de 130 L, totalizando 15 peixes/caixa. Foram formuladas 5 dietas isoenergéticas e com níveis crescentes de proteína digestível (21, 24, 27, 30 e 33% PD). Após 77 dias de alimentação, foi realizada a biometria dos peixes para avaliação dos parâmetros de desempenho produtivo e os indicadores fisiológicos: concentração de metabólitos no sangue (amônia sérica e triglicerídeos), relações somáticas, atividade hepática da alanina aminotransferase (ALT) e aspartato aminotransferase (AST) e atividade da enzima málica e glicose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH). A cada sete dias, foram determinadas a concentração de amônia total, pH, condutividade elétrica e concentração de oxigênio dissolvido na água das caixas. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com 5 tratamentos e 3 repetições. Os resultados de desempenho produtivo foram submetidos à análise de variância (ANOVA) e à regressão polinomial. No peso final, taxa de crescimento específico, ganho de peso e conversão alimentar foi observado efeito linear (p<0,05) e no consumo não houve efeito significativo. Na concentração de amônia na água foi observada diferença (p<0,05), sendo observado efeito linear com o aumento de proteína. Na concentração de triglicerídeos sérico, amônia sér... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this work was to determine the protein requirement and the effects of dietary protein on physiological and biochemical indicators of piapara (Megaleporinus obtusidens). For this, 300 juveniles (24 ± 1.26 g) were distributed in 20 boxes of 130 L, totaling 15 fish / box. Five diets were formulated isoenergetic and with increasing levels of digestible protein (21, 24, 27, 30 and 33% PD). After 77 days of feeding, the fish biometry was performed to evaluate the parameters of productive performance and the physiological indicators: concentration of metabolites in the blood (serum ammonia and triglycerides), somatic relations, liver enzymatic activity of alanine aminotransferase (ALT) and aspartate aminotransferase (AST) activity and lipogenesis, malic enzyme and glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PDH). Every 7 days, the concentration of total ammonia, pH, electrical conductivity and oxygen concentration dissolved in the water of the boxes were determined. The experimental design was completely randomized, with 5 treatments and 3 replicates. The results of productive performance were submitted to analysis of variance (ANOVA) and polynomial regression. In the final weight, specific growth rate, weight gain and feed conversion was observed linear effect (p<0,05) and in consumption there was no significant effect (p>0,05). At the concentration of ammonia in the water, a significant difference (p <0.05) was observed with a linear effect. In the serum triglycerides co... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Transferência de aflatoxinas da ração para lambaria (Astyanax altiparanae) cultivados em piscicultura / Transfer of aflatoxins from feed to lambari fish (Astyanax altiparanae) in fish farming

Michelin, Euder Cesar 09 August 2016 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar a transferência de aflatoxinas da ração para peixes lambari (Astyanax altiparanae), avaliando a influência dos níveis de toxina na ração sobre o desempenho dos peixes. As aflatoxinas foram incorporadas à ração extrusada para peixes tropicais, previamente testada para a presença de aflatoxinas, e as concentrações foram confirmadas por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Os tratamentos foram constituídos por: Controle - ração sem toxina; A. Ração + 10 &micro;g AFB1/kg; B. Ração + 20 &micro;g AFB1/kg e C. Ração + 50 &micro;g AFB1/kg. Os juvenis de lambari foram alocados em aquários com densidade de 1 peixe por litro. O experimento foi realizado por 120 dias, com três repetições. A cada 30 dias foram realizados levantamentos biométricos e avaliação do desempenho (taxa de crescimento, sobrevivência, ganho de peso). A determinação de aflatoxinas nas amostras foi realizada por CLAE em músculo e fígado. Mensalmente, dez peixes por aquário foram utilizados para compor uma amostra, totalizando 48 amostras de músculo e 48 amostras de fígado analisadas ao final do experimento. As aflatoxinas na dieta prejudicaram o desempenho dos lambaris, observando-se menor peso e tamanho dos peixes nos tratamentos com aflatoxinas em relação ao controle. Houve também menor consumo de ração pelos peixes do tratamento C no período final do experimento. De modo geral, observou-se que, principalmente a partir dos 90 dias de experimento, houve acúmulo de aflatoxinas no fígado e no músculo dos animais. A concentração de aflatoxina B1 observada no músculo dos lambaris ao final do período de exposição foi semelhante aos níveis empregados na dieta. Os resultados mostraram que o lambari é uma espécie sensível, havendo efeito das aflatoxinas sobre o desempenho e acúmulo de aflatoxinas no músculo e fígado. Assim, quando da exposição diária e prolongada de lambaris às aflatoxinas, conclui-se que os limites atuais das legislações para aflatoxinas em ração animal não garantem segurança à produção e à saúde dos consumidores. / The aim of this study was to evaluate the transfer of aflatoxins from feed to lambari fish (Astyanax altiparanae), assessing the influence of toxin levels on fish performance. Aflatoxins were incorporated into extruded feed for tropical fish, previously tested for aflatoxins, and the concentrations were confirmed by high-performance liquid chromatography (HPLC). The treatments were: Control - feed without toxin; A. Feed + 10 &micro;g AFB1/kg; B. Feed + 20 &micro;g AFB1/kg and C. Feed + 50 &micro;g AFB1/kg. Juveniles of lambari fish were placed in aquariums with density of 1 fish per liter. The experiment was conducted for 120 days, with three replications. Every 30 days biometric surveys were performed, including weight and standard length. Feed intake, feed conversion, growth rate and survival were also evaluated. Determination of aflatoxins was carried out by HPLC in muscle and liver. Monthly, a pool of 10 fish were used to make a sample, adding up to 48 samples of muscle and 48 samples of liver analyzed at the end of the experiment. Aflatoxins in the diet impaired the lambari performance, with lower weight and size of fish from aflatoxins treatments compared to control. There was also lower feed intake by fish from treatment C in the final period of the experiment. In general, it was observed that, mainly from 90 days of experiment, there was accumulation of aflatoxins in the liver of lambari fish and consequently in the muscle. Aflatoxin B1 concentration observed in the muscle of lambari fish at the end of the exposure period was similar to the levels used in the diet. Results showed that lambari fish is sensitive specie, with effects of aflatoxins on performance and accumulation of aflatoxins in muscle and liver. Therefore, when daily and prolonged exposure of lambaris to aflatoxins, it is concluded that the current regulation limits for aflatoxins in animal feed do not guarantee safety production and consumer health.
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Influência do pH ácido, alumínio e manganês na fisiologia reprodutiva em machos de Astyanax bimaculatus (Characiformes: Characidae) / Influence of acidic pH, aluminum and manganese on reproductive physiology of Astyanax bimaculatus males (Characiformes: Characidae)

Kida, Bianca Mayumi Silva 08 May 2014 (has links)
Os metais podem causar efeitos adversos de grande amplitude na função reprodutiva de animais, principalmente em organismos aquáticos. Eles podem alterar o sistema endócrino, atuando na esteroidogênese, afetando o processo reprodutivo dos peixes. Nosso objetivo foi investigar os efeitos dos metais alumínio (Al) e manganês (Mn) em pH ácido sobre a esteroidogênese de machos de Astyanax bimaculatus, sexualmente maduros, após uma exposição aguda de 96 horas e avaliar se os animais foram capazes de recuperar dos possíveis efeitos destes metais em água livre de metais. Esses animais foram expostos a uma concentração nominal de 0,5 mg.L-1 de Al e Mn (isolados ou combinados), e os grupos experimentais foram mantidos em pH ácido (5,5) para manter os metais biodisponíveis. Foi realizada uma exposição aguda de 96 horas, com amostragens em 24h e 96h, e depois também um período de 96h em água livre de metais, com amostragens em 120h e 192h, a partir do o início do experimento. Foram determinadas as concentrações plasmáticas de testosterona (T), 11-cetotestosterona (11-KT), 17&beta;-estradiol (E2) e cortisol (C) por ELISA. Além disso, foram realizadas análises histológicas dos testículos e avaliação da concentração espermática. Os metais estudados, além do pH ácido, foram capazes de aumentar as concentrações plasmáticas dos androgénos T e 11-KT. Também foi observado um aumento transitório de E2 em 24h, mas apenas em animais expostos ao Mn e depois uma diminuição em 96h. A exposição ao pH ácido e metais, sozinhos ou combinados não provocou alterações nos níveis de C. Sendo assim, Al e Mn , assim como a acidez da água podem atuar como desregulador endócrino em machos de A. bimaculatus, principalmente por estimulação da síntese de androgénos, causando alterações no sistema fisiológico. No entanto, 96 horas não foram suficientes para que os animais se recuperassem. Os testículos encontravam-se em estágio avançado de maturação, enquanto que a concentração espermática não apresentou alterações significativas que indicassem a atuação dos metais em conjunto ao pH ácido. Táticas reprodutivas podem ter sido utilizadas pela espécie para desencadear alterações na esteroidogênese testicular, principalmente acelerando o processo de espermatogênese e espermiogênese, o que pode interferir com a dinâmica reprodutiva / Metals can cause adverse wide range effects on reproductive function of animals, mostly in aquatic organisms. They can alter the endocrine system, acting on gonadal steroidogenesis, affecting the reproductive process of fish. We aimed to investigate the effects of the metals aluminum (Al) and manganese (Mn) in acidic pH on the steroidogenesis of Astyanax bimaculatus males, sexually mature, after an acute exposure of 96 hours and evaluate if the animals were able to recover of the possible effects of these metals in the water free of metals. Mature males were exposed to a concentration of 0.5 mg.l-1 of Al and Mn (isolated or combined) and the experimental groups were maintained at acidic pH (5.5) to keep the metals bioavailable. We performed an acute exposure of 96 hours, with samplings at 24h and 96h, and then also a period of 96h in water free of metals, with samplings at 120h and 192h from the beginning of the experiment. We measured the plasma levels of testosterone (T), 11-ketotestosterone (11-KT), 17?-estradiol (E2) and cortisol (C) by elisaimmunoassay. Furthermore, histological analysis of testes and evaluation of the sperm concentration were performed. The metals studied, in addition to acidic pH, were able to alter the plasma concentration of the androgens T and 11KT. A transitory increase (24h) of E2 levels was also observed, but only in animals exposed to Mn and then a decrease in 96h occurred. Exposure to acidic pH and metals, alone or combined did not trigger changes in C plasma levels. Generally, Al and Mn as well as the acidity of water can act as endocrine disruptor in A. Bimaculatus males, mainly by stimulating the androgens synthesis, causing changes on physiological system. However, 96 hours in water free of metals were not enough for the animals to recover from the effects of the metals. The testes were in the advanced stage of maturation, while sperm concentration was not significantly changed to suggest any influence of metals together with acidic pH in altering this variable. Reproductive tactic could be used by the species to trigger changes in testicular steroidogenesis, mainly accelerating the process of spermatogenesis and spermiogenesis, what may interfere with the reproductive dynamics
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Sistemas para a transposição de peixes neotropicais potamódromos. / Systems for neo-tropical fishes transposition.

Martins, Sidney Lazaro 09 August 2005 (has links)
Os Sistemas para a Transposição de Peixes Neotropicais são, ainda, temas multidisciplinares polêmicos envolvendo cultura ambiental, engenharia, biologia, ecologia, política e economia. Nesse universo de interesses, o econômico diverge do ambiental, principalmente no escopo dos investimentos corporativos em energia hídrica, nos quais a busca de lucros suplanta o compromisso ambiental, deixando o ônus à sociedade e irrelevando o bem renovável dos peixes nos ecossistemas aquáticos. Há um grande interesse corporativo nacional para mistificar e irrelevar as estruturas para passagens de peixes em barramentos de modo à desjustificá-las como alternativa de mitigação de impactos e assim não expandi-las, tornando-as não obrigatórias principalmente em empreendimentos existentes, em que pese às questões ictiológicas abertas e não esclarecidas que deveriam estar em grau de consistência e confiança mais desenvolvidas. Os Estudos de Impactos Ambientais e os relicenciamentos dos barramentos são os instrumentos para disciplinar os STP’s, mas deixam a desejar quando os empreendedores ou investidores são também os agentes que financiam os estudos. As agências licenciadoras contam com uns corpos técnicos inexperientes e susceptíveis a informações parciais e com forte empenho político e econômico. A concepção, projeto, manuseio de vazões, níveis, velocidades, potência do escoamento são de natureza hidráulica para as quais os engenheiros, atendendo as premissas biológicas dos peixes, são os agentes indicados para o tratamento dos sistemas para a transposição de peixes em barragens. Neste trabalho há as propostas para STP’s nacionais baseadas em de estudos de similitude tridimensional; a apresentação de recomendações e critérios baseados na experiência nacional além da proposta experimental de criadouros artificiais em reservatórios e afluentes simulando-se os baixios e lagoas marginais. Para que as informações contidas neste trabalho não sejam reproduzidas erroneamente: as dimensões do STP devem ser concebidas em função das espécies a serem transportadas, que variam segundo as variáveis ambientais locais. O projeto de um STP não pode ser padronizado, pois implicará em erros. Padronizar um STP é reduzir a técnica e a ciência a um padrão primário, tipo “Manual de Bolso", o que não atenderia aos peixes, fadando a concepção ao insucesso. / The theme “Systems for Neo-tropical Fishes Transposition" is a multidisciplinary subject: it encompasses the fields of engineering, biology, ecology, politics, economy and environmental culture. It is also a polemic subject: in a broad range of interests, most of the time the economical overtake the environmental ones. This is especially true when corporative investments in hydroelectric energy are under consideration, where seek for profits supersedes the environmental commitments, leaving to the community the liability of endangering fish species’ renewal in aquatic ecosystems. In fact, there is a strong corporative interest, in the national context, to obstacle fish passage devices, not only for new dam structures, but also for the existing ones. Among the local entrepreneurs there is a tendency to mystify and underestimate fish passage structures, as a way to disqualify them as effective mitigative measures. The development of a “fish passages culture" in the country becomes even more difficult. Additionally, there are several non-clarified questions related to neo-tropical fish species; those issues should already be in a more developed consistency and soundness stage. Environmental Impact Assessments and existing dams Re-licensing Processes should play a disciplinary role for fish passage structures, but they usually fail when the investors and/or entrepreneurs are the ones who financially support those studies. Even worse, licensing agencies’ technical staffs frequently lack on reliable information and let themselves be guided by political and economical interests. The treatment of discharges, water levels, velocities, energy of flow, dimensions and layout or, in a broader sense, the conception and design of fish passage structures, should only be carried out by specialist engineers, with the invaluable supervision of biologists. The objective of this Thesis is the proposition of fish passage structures adapted to the conditions of Brazilian rivers and following the results of studies with reduced scale tri-dimensional models. Also some recommendations and criteria are presented, supported by the feedback from nationwide experience. Finally, a proposition is presented for the experimental implementation of artificial breeding farms along reservoirs and tributaries, where the conditions of swamps and peripheral ponds could be reproduced. The dimensions of the STP must be function of the species to be transponding, of this form its conception cannot be standardized, therefore it will imply in errors. To standardize a STP is to reduce the technique and science to a secundarista standard, Manual of Pocket, what it would not take care of to the fish, predestinateing the conception to failure.
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Ictiofauna associada a bancos de podostemaceae no complexos de cachoeiras de Dardanelos, rio Aripuanã - MT

Flausino Junior, Nelson 22 February 2008 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2015-11-06T19:52:13Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_ Nelson Flausino Junior.pdf: 2527818 bytes, checksum: a6392b78c0a73436c6c9ce813db8892e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-06T19:52:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_ Nelson Flausino Junior.pdf: 2527818 bytes, checksum: a6392b78c0a73436c6c9ce813db8892e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study presents a characterization of fish fauna associated with Podostemaceae banks in the Dardanelles complex of waterfalls on the river Aripuanã, Aripuanã, MT. The forragemento tactics were studied, diet, trophic structure and spatial and temporal variations of the fish assemblage associated with podostemáceas banks. A discussion of patterns of use of space and the possible occurrence of sharing food resources is presented. / O presente estudo apresenta uma caracterização da ictiofauna associada aos bancos de Podostemaceae no complexo de cachoeiras de Dardanelos no rio Aripuanã, Aripuanã, MT. Foram estudadas as táticas de forragemento, dieta, estrutura trófica e variações espaciais e temporais das assembleias de peixes associados aos bancos de podostemáceas. Uma discussão sobre padrões de uso do espaço e a possível ocorrência de partilha de recursos alimentares é apresentada.
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Evolução molecular adaptativa dos genes da família ldh em teleósteos

Castro, Nayara Sousa 29 June 2015 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-06T19:14:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Nayara Sousa Castro.pdf: 3041386 bytes, checksum: 04452ee2a4384fb66886d92dc109a417 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T19:14:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Nayara Sousa Castro.pdf: 3041386 bytes, checksum: 04452ee2a4384fb66886d92dc109a417 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-06-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The L-Lactate Dehydrogenase (LDH) is an enzyme key in the processes of anaerobic glycolytic metabolism and has three encoders genes in fish (LDH-A, LDH-B and LDH-C). The regulation of these genes is independent and has tissue specificity in vertebrates. They were originated by successive events of genome replication and its evolution showed be closely related to the development of adaptive thermal mechanisms and, also different physiological conditions as hypoxia. The main objectives of this study were understand the evolution of these genes in fish, basal group of the vertebrates, and identify specific replacements that may be considered adaptive to Amazon fish species and other parts of the world (temperate, subtropical and polar). Our results showed that the genes A and B originate from a genetic duplication event that occurred near the origin of vertebrates, and that in a second duplication event, the LDH-C gene was originated from the LDH-B. Thus, the LDH of the lamprey was identified as LDH-A, and from this gene had the differentiation in teleost. In addition, our study showed that LDH-A presents sites and lineages that have gone through or are still undergoing of the adaptive evolution (Amazonian and cold weather fish). In the same time their phylogeny combined with the time difference, pointed a later specialization of this gene as a result of the adaptation to the environment. The course of evolution for these genes appears to have resulted in the influence of natural selection with variants adapted to their environment and its functions. / A L-Lactato Desidrogenase (LDH) é uma enzima chave nos processos do metabolismo glicolítico anaeróbico e possui três genes codificadores em peixes (ldh-a, ldh-b e ldh-c). A regulação desses genes é independente, resultando em especificidade tecidual nos vertebrados. Esses genes foram originados por eventos sucessivos de duplicação do genoma e sua evolução mostra-se intimamente relacionada com o desenvolvimento de mecanismos adaptativos térmicos e de condições fisiológicas distintas, as quais compreendem a hipóxia. Entender a evolução desses genes em peixes, grupo base dos vertebrados, e identificar substituições pontuais que possam ser consideradas adaptativas para espécies de peixes da Amazônia e de outras regiões do planeta (Temperada, Polar e Subtropical) estão dentre os principais objetivos deste estudo. Nossos resultados mostraram que os genes A e B se originaram a partir de um evento de duplicação gênica próximo a origem dos vertebrados, e que, por um segundo evento de duplicação, o gene da LDH-C foi originado a partir da LDH-B. Assim, a LDH da lampreia foi identificada como uma LDH-A, a partir da qual o gene se diferenciou nos teleósteos. Além disso, nossos estudos mostram que a LDH-A apresenta sítios e linhagens que sofreram e estão sofrendo evolução adaptativa (peixes amazônicos e de clima frio) e sua filogenia, combinada com o tempo de divergência, apontou uma especialização mais recente desse gene como resultado da adaptação ao ambiente. O curso da evolução para esses genes parece ter resultado na vitória da seleção natural com variantes adaptadas ao seu meio ambiente e às suas funções.
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Evolução molecular adaptativa dos genes da família LDH em teleósteos

Castro, Nayara Sousa 29 June 2015 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-07T15:50:19Z No. of bitstreams: 2 Flávio Augusto Leão da Fonseca.pdf: 279865 bytes, checksum: ae9258fabce24d13ff79b708b8f6aba7 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-07T15:50:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Flávio Augusto Leão da Fonseca.pdf: 279865 bytes, checksum: ae9258fabce24d13ff79b708b8f6aba7 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-06-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The L-Lactate Dehydrogenase (LDH) is an enzyme key in the processes of anaerobic glycolytic metabolism and has three encoders genes in fish (LDH-A, LDH-B and LDH-C). The regulation of these genes is independent and has tissue specificity in vertebrates. They were originated by successive events of genome replication and its evolution showed be closely related to the development of adaptive thermal mechanisms and, also different physiological conditions as hypoxia. The main objectives of this study were understand the evolution of these genes in fish, basal group of the vertebrates, and identify specific replacements that may be considered adaptive to Amazon fish species and other parts of the world (temperate, subtropical and polar). Our results showed that the genes A and B originate from a genetic duplication event that occurred near the origin of vertebrates, and that in a second duplication event, the LDH-C gene was originated from the LDH-B. Thus, the LDH of the lamprey was identified as LDH-A, and from this gene had the differentiation in teleost. In addition, our study showed that LDH-A presents sites and lineages that have gone through or are still undergoing of the adaptive evolution (Amazonian and cold weather fish). In the same time their phylogeny combined with the time difference, pointed a later specialization of this gene as a result of the adaptation to the environment. The course of evolution for these genes appears to have resulted in the influence of natural selection with variants adapted to their environment and its functions. / A L-Lactato Desidrogenase (LDH) é uma enzima chave nos processos do metabolismo glicolítico anaeróbico e possui três genes codificadores em peixes (ldh-a, ldh-b e ldh-c). A regulação desses genes é independente, resultando em especificidade tecidual nos vertebrados. Esses genes foram originados por eventos sucessivos de duplicação do genoma e sua evolução mostra-se intimamente relacionada com o desenvolvimento de mecanismos adaptativos térmicos e de condições fisiológicas distintas, as quais compreendem a hipóxia. Entender a evolução desses genes em peixes, grupo base dos vertebrados, e identificar substituições pontuais que possam ser consideradas adaptativas para espécies de peixes da Amazônia e de outras regiões do planeta (Temperada, Polar e Subtropical) estão dentre os principais objetivos deste estudo. Nossos resultados mostraram que os genes A e B se originaram a partir de um evento de duplicação gênica próximo a origem dos vertebrados, e que, por um segundo evento de duplicação, o gene da LDH-C foi originado a partir da LDH-B. Assim, a LDH da lampreia foi identificada como uma LDH-A, a partir da qual o gene se diferenciou nos teleósteos. Além disso, nossos estudos mostram que a LDH-A apresenta sítios e linhagens que sofreram e estão sofrendo evolução adaptativa (peixes amazônicos e de clima frio) e sua filogenia, combinada com o tempo de divergência, apontou uma especialização mais recente desse gene como resultado da adaptação ao ambiente. O curso da evolução para esses genes parece ter resultado na vitória da seleção natural com variantes adaptadas ao seu meio ambiente e às suas funções.

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