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Reatividade de iso-α-ácidos e seus derivados hidrogenados frente ao radical 1-hidroxietila: implicações na perda de qualidade sensorial da cerveja / Reativity of iso-α-acids and its hydrogenated derivatives towards the 1-hydroxyethyl radical: implications in the sensorial quality loss of beerAlmeida, Natália Ellen Castilho de 18 February 2011 (has links)
Os iso-α-ácidos são os principais constituintes responsáveis pelo sabor amargo da cerveja, sendo estes facilmente degradados durante o seu processo de envelhecimento ou exposição a radiação luminosa, em particular o diastereoisômero trans-. O radical 1-hidroxietila é o radical majoritário formado na cerveja durante o processo de envelhecimento. O presente trabalho descreve a reatividade dos iso-α-ácidos frente ao radical 1-hidroxetila através do uso da técnica de spin-trapping com detecção por espectroscopia de ressonância paramagnética de elétrons (RPE) e espectrometria de massas (ESI-(+)-MS/MS). Observou-se que ambos os diastereoisômeros cis- e trans-iso-α-ácidos são degradados na presença do radical 1-hidroxietila com constantes de velocidade aparentes de 1,8 108 e 9,2 109 L mol-1 s-1, respectivamente. A reatividade dos dihidro-iso-α-ácidos com o radical estudado foi similar à reatividade da mistura diastereoisomérica dos iso-α-ácidos, apresentando constante de velocidade aparente de 1,5 109 L mol-1 s-1. Os análogos tetrahidro-iso-α-ácidos não apresentaram reatividade para com o radical 1-hidroxietila, sugerindo os hidrogênios alílicos como sítio reacional. Adicionalmente, os cálculos ab initio por DFT demonstraram que os valores de BDE para os hidrogênios alílicos das cadeias laterais prenila e isohexenoila são equivalentes e, desta maneira, sugerindo a maior reatividade do diastereoisômero trans- a ser creditada a um fator entrópico, já que ambos os grupos estão no mesmo plano espacial. Os produtos de oxidação foram determinados por LC-ESI-MSn e verificou-se a formação dos hidroxi-allo-iso-α-ácidos, recentemente descritos na literatura. O conjunto de resultados obtidos possibilitou a proposta de mecanismo para processo de oxidação e perda dos ácidos amargos da cerveja, observado no envelhecimento da bebida. / The iso-α-acids are the main responsible constituents for the bitter taste of beer, they are easily degraded during the aging and light exposed process, specially the trans- diastereoisomer. The 1-hydroxyethyl radical is the major radical produced during the beer aging process. The present work describes the reactivity of iso-α-acids towards the 1-hydroxyethyl radical as probed by the spin-trapping technique and detected by electron paramagnetic resonance (EPR) and mass spectrometry (ESI-(+)-MS/MS). It was observed that both diastereoisomers cis- and trans-iso-α-acids are degraded in the presence of 1-hydroxyethyl radical with apparent rate constant of 1.8 108 e 9.2 109 L mol-1 s-1, respectively. The reactivity of dihydro-iso-α-acids towards the studied radical was similar to the reactivity of the iso-α-acids diastereoisomeric mixture, showing apparent rate Constant of 1.5 109 L mol-1 s-1. The tetrahydro-iso-α-acids analogues did not observed reactivity towards the 1-hydroxyethyl radical suggesting the allilic hydrogens as the reaction sites. In addition, the ab initio DFT calculations demonstrated that the BDE values for the allilic hydrogens of the prenyl and isohexenoyl side chains are equivalents and according to that suggesting the higher reactivity of the trans- diastereoisomer to be accounted to an entropic factor since both goups are in the same plane of the space. The oxidation products were determined by LC-ESI-MSn and its was verified the formation of hydroxyl-allo-iso-α-acids. The data colected allows a mechanism to be proposed for the oxidation process and loss of bitter acids of beer during the beverage aging.
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Desenvolvimento do conceito de equivalência de estímulos por Sidman, reações da comunidade científica e a influência destas reações no desenvolvimento do conceitoAzoubel, Marcos Spector 30 November 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-11-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The behavior of the scientist is subject to the same laws as any other behavior. It
differs from other behaviors because of the contingencies set by the scientific
community. Part of the events presented by the scientific community is composed by
the reactions of its members to new data and new conceptual proposals. Such reactions
seem to play an important role in the emergence of new scientific theories and in the
modification of preexisting theories. Based on this, the general objective of this work
was to historically analyze the development of the concept of stimulus equivalence in
Murray Sidman's work, some reactions of the scientific community to Sidman's data
and conceptual proposals on stimulus equivalence, and to examine Sidman's responses
to the reactions of these authors. From these general objectives, three studies were
carried out in order to build and characterize a list of Sidman's publications; to
examine the development of the concept of equivalence of stimuli between 1971 and
1994; to analyze the reactions of the scientific community to Sidman (1971), between
1971 and 1982; to briefly characterize the works published between 1982 and 1994
that quoted Sidman (1971) and/or Sidman and Tailby (1982); to analyze a possible
dialogue between Sidman and S. Hayes between 1982 and 1994. It was possible to
verify, during the period between 1971 and 1982, that Sidman and his collaborators
ivestigated problems that appeared in literature outside behavior analysis, such as
neurology and neurolinguistics, but that their research did not have a strong impact on
these scientific communities. Nor does there seem to have been especially relevant
contributions from members of the scientific community for the development of the
concept of stimulus equivalence. Later, between 1982 and 1994, the impact on the
scientific community was notably increased, especially among behavioral analysts,
and researches and discussions by community members, in addition to Sidman's direct
collaborators, seem to have exerted influence in the development of the concept / O comportamento do cientista está sujeito às mesmas leis que qualquer outro
comportamento. Ele difere-se dos outros comportamentos por conta das contingências
dispostas pela comunidade científica. Parte dos eventos apresentados pela comunidade
científica é composta pelas reações de seus membros a novos dados e a novas
propostas conceituais. Tais reações parecem exercer importante papel no surgimento
de novas teorias científicas e na modificação de teorias pré-existentes. Com base nisso,
o objetivo geral deste trabalho foi analisar historicamente o desenvolvimento do
conceito de equivalência de estímulos na obra de Murray Sidman, algumas reações da
comunidade científica aos dados e às propostas conceituais de Sidman sobre
equivalência de estímulos e examinar respostas de Sidman às reações dos autores. A
partir desses objetivos gerais, foram realizados três estudos com intuito de listar e
caracterizar as publicações de Sidman; examinar o desenvolvimento do conceito de
equivalência de estímulos, entre 1971 e 1994; analisar as reações da comunidade
científica ao trabalho de Sidman (1971), entre 1971 e 1982; caracterizar brevemente os
trabalhos publicados entre 1982 e 1994 que citaram Sidman (1971) e/ou Sidman e
Tailby (1982); analisar um possível diálogo entre Sidman e S. Hayes, entre 1982 e
1994. Foi possível verificar, no período entre 1971 e 1982, que Sidman e seus
colaboradores partiram de problemas de pesquisa surgidos na literatura de fora da
análise do comportamento, como da neurologia e da neurolinguística, mas que as suas
pesquisas não impactaram fortemente essas comunidades científicas. Tampouco
parece ter havido contribuições especialmente relevantes de membros da comunidade
científica para o desenvolvimento do conceito de equivalência de estímulos.
Posteriormente, entre 1982 e 1994, o impacto na comunidade científica foi
notavelmente aumentado, especialmente entre analistas do comportamento, e
pesquisas e discussões de membros da comunidade, para além dos colaboradores
diretos de Sidman, parecem ter exercido influência no desenvolvimento do conceito
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Who gets the anti-establishment vote? Crisis, elections, and populism in Western Europe / Para quem vai o voto anti-establishment? Crise, eleições e populismo na Europa OcidentalFalabella, Leonardo Jamel Edim 18 August 2017 (has links)
Why does the extreme right grow in some parts of Europe while the radical left rises in others? In studies about both party groups, the hypothesis that economic distress provides them with opportunity is frequently tested. Yet, little effort has been employed in comparing their performances under different economic conditions. This article fills this gap through panel data analysis, with disaggregated data from eight countries in election years between 2002 and 2011. It finds that voting for extreme right parties increases significantly after the financial crisis outbreak of 2008, with no corresponding evidence for radical left parties. Also, extreme right support has a positive link to regional GDP per capita and a negative link to unemployment rates. In contrast, radical left parties perform better where unemployment is higher. The results suggest that economic downturns are mostly beneficial to extreme right parties, but this effect is increasingly neutralized in regions of high unemployment. / Por que a extrema direita cresce em alguns países europeus, ao passo que a esquerda radical cresce em outros? Em estudos sobre ambas as categorias de partido, testa-se frequentemente a hipótese segundo a qual eles têm janelas de oportunidade em crises. Ainda assim, pouco esforço vem sendo feito para comparar como eles se saem sob diferentes contextos econômicos. Este artigo preenche tal lacuna através de análise de dados em painel, com dados desagregados de oito países, em eleições entre 2002 e 2011. O artigo aponta que a votação da extrema direita aumenta significativamente com o desenrolar da crise de 2008, ao passo que não se encontram evidências correspondentes para a esquerda radical. Ademais, o apoio eleitoral à extrema direita é positivamente ligado a índices regionais de PIB per capita, e negativamente ligado a taxas de desemprego. Por contraste, partidos de esquerda radical se saem melhores onde o desemprego é alto. Os resultados sugerem que quedas na atividade econômica são majoritariamente benéficas à extrema direta, mas que tal efeito é crescentemente neutralizado em regiões de alto desemprego.
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Alteridade, desrazão e futuridade na experiência da criação artística: iluminações poéticas para a Psicologia cultural a partir de Rimbaud / Otherness, unreason and futurity in the experience of artistic crea-tion: poetical Illuminations from Rimbaud to Cultural PsychologyLeão, Maria Eloisa do Amaral 27 June 2016 (has links)
Este estudo tem a intenção de apontar e discutir algumas possíveis articulações teórico-metodológicas e estéticas entre a psicologia cultural, a filosofia e a poesia em torno das no-ções de alteridade, dualismos e futuridade a partir de três enunciados do poeta francês Arthur Rimbaud (1854-1891) extraídos das suas Cartas do Vidente e tomados como iluminações de sua perspectiva poético-visionária para a perspectiva teórico-metodológica do construtivismo semiótico-cultural em psicologia (Simão, 2010). Visando expressar a pluralidade de experiên-cias no campo complexo das relações dialógicas de alteridade Eu-Outro-Mundo-caótico, a pesquisa é construída esteticamente como um mosaico, com base na filosofia de mosaico de William James e na polifonia de vozes de Mikhail Bakhtin, e constituída de três partes teóri-cas e uma experimental. Nas três partes teóricas, os enunciados rimbaudianos Eu é um outro, Racional desregramento de todos os sentidos e A poesia não marcará mais o ritmo da ação; ela estará na frente são endereçados, respectivamente, às noções de enunciado, dialogismo e polifonia de Mikhail Bakhtin, dos fatos afetivos ambíguos num mundo de experiência pura do empirismo radical de William James, e de futuridade em Jaan Valsiner. Na quarta parte, de-senvolveu-se a experimência (experimento+experiência) Andarilha sem razão e seus outros corpos-selves, originária da conjunção entre as linguagens teórico-metodológica e poética. Na tentativa de articular o dualismo razão-desrazão através da ambiguidade, é elaborada a noção de razão da desrazão. Rimbaud foi um poeta-visionário, renovador da poesia, andarilho-errante e migrante de espaços geográficos, corporais e mentais. Sua obra agenciou e ainda agencia amplamente a literatura, a filosofia, as artes visuais, o cinema, a música e a psicologia dos séculos XX e XXI. Trazê-la para o âmbito da psicologia e da filosofia é fazer da poesia uma interlocutora dos diálogos, debates e estudos de temas pertinentes àqueles dois campos do conhecimento / This study intends to point out and discuss some theoretical-methodological and aesthetic connections among cultural psychology, philosophy and poetry related to the notions of oth-erness, dualisms and futurity by taking three utterances of the French poet Arthur Rimbaud (1854-1891), selected from his Letters of the Seer as illuminations of his poetical and vision-ary perspective towards the theoretical-methodological perspective of semiotic-cultural con-structivism in psychology (Simão, 2010) and cultural psychology. Aiming to express the plu-rality of experiences in the complex field of the I-Other-chaotic World dialogical relation-ships, this research is aesthetically shaped as a mosaic based on William James mosaic phi-losophy and Mikhail Bakhtins polyphony of voices, and it has three theoretical parts and a experimental one. In the three theoretical parts, the Rimbaudian utterances I is an other, Ra-tional derangement of all the senses and The Poetry will no longer rhythm the action; it will be forward are respectively addressed to the notions of dialogism and polyphony according to Mikhail Bakhtin, ambiguous affectional facts in a world of pure experience according to Wil-liam James and futurity according to Jaan Valsiner. The fourth part consists in the experimence (experiment+experience) \"Wanderer without reason and her other selves-bodies\", originating from the conjunction between the theoretical-methodological and the poetical languages. In an attempt to articulate the reason-unreason dualism through the ambi-guity, the notion of reason of unreason is to be elaborated. Rimbaud was a visionary-poet, renovator of poetry, wandering-wanderer and migrant of geographic, body and mental spaces. His work broadly addresses literature, philosophy, visual arts, movie, music and psychology of XX and XXI centuries. Bringing it to the context of psychology and philosophy means to make the poetry as an interlocutor within dialogues, discussions and studies about relevant issues to those two fields of knowledge
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Consciência e experiência no empirismo radical de William JamesRazzo, Francisco de Assis 12 November 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-11-12 / The focus of this study is to analyse the relation between consciousness and experience in the extent of the North-American Philosopher William James' radical empiricism. The approach of this research is to present the notion of consciousness as a function of knowledge in the experience as from the analysis of the essays Does Consciousness Exist? and A World of Pure Experience, posthumously published in the collect edition Essays in Radical Empiricism, in 1912. Such intent aims to understand what are the fundamental pressupositions of radical empiricism and its epistemological implications, as from the definition of philosophical view of world, as a result of the application of pragmaticism, second to James, as a method to solve metaphysical disputes and as a theory of truth. That way, the result of this work is to demonstrate what in what meaning the conceptions of consciousness in the extent of the radical empiricism imposes itself as a vigorous possibility of overcoming the reductionists conceptions about subjectivity and reality. In Does consciousness exist? it is postulated, in the search for overcoming the substancialists, transcedentalists and associationits conceptions of subjectivity, the notion that consciousness is nothing but the name of a nonentity, as characterized in the context of the flux of the participative reality of pure experience. However, on what thematic delimitation is concerned, it is fundamental to consider the jamesian proposal of the subjectivity in light of a philosophically coherent interpretation of his work, that is, taking the culmination of that conception of consciousness regarding pure experience into consideration, as it traces way which is not systematic but extremely coherent on what his philosophical criteria and interpretation of both essays without taking the very course traced by William James in the building of his work, into consideration / Este estudo tem por objetivo analisar a relação entre consciência e experiência no âmbito do
empirismo radical do filósofo norte-americano William James (1842-1910). O enfoque da
pesquisa é apresentar a noção de consciência como função do conhecimento na experiência, a
partir da análise dos ensaios A consciência existe? e Um mundo de experiência pura,
publicados postumamente em 1912 na coletânea Ensaios em Empirismo Radical. Tal intento
visa compreender quais são os pressupostos fundamentais e os desdobramentos
epistemológicos do empirismo radical, tomado na acepção de visão filosófica de mundo, e
resultante da aplicação do pragmatismo, segundo James, como o método para resolver disputas
metafísicas e como teoria da verdade. Deste modo, o resultado deste trabalho é demonstrar em
que sentido a concepção de consciência no âmbito do empirismo radical se impõe como uma
vigorosa possibilidade de superação de concepções reducionistas a respeito da subjetividade e
da realidade. Em A consciência existe? é postulada, na busca de superação das concepções
substancialistas, transcendentalistas e associacionistas da subjetividade, a noção de que a
consciência não é outra coisa senão o nome de uma não-entidade caracterizada no contexto
do fluxo da realidade participativa da experiência pura. Entretanto, no que se refere à
delimitação temática, é fundamental considerar a proposta jamesiana da subjetividade à luz da
interpretação filosoficamente coerente de sua obra, isto é, levar em consideração que a
culminação dessa concepção de consciência em relação à experiência pura trilha um caminho,
não sistemático, porém extremamente coerente no que diz respeito aos seus critérios e
compromissos filosóficos; sendo assim, segundo esta exigência, o estudo não se limita à
interpretação exclusiva dos dois ensaios sem antes levar em consideração o próprio percurso
trilhado por William James na edificação de sua obra
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Entre Brasil e Portugal: trajetória e pensamento de Plínio Salgado e a influência do conservadorismo portuguêsGonçalves, Leandro Pereira 19 November 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-11-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This thesis aims to investigate the trajectory of Plínio Salgado for the formation and development of Brazilian integralism in its various stages, seeking multiple discursive matrices and cultural circularity in the field of appropriation, observing the process of cultural circularity in dealing with Lusitanian components. The analysis has established discussions with reference to bibliographical productions such as doctrinal, political, literary and religious, as well as manifestos, interviews and testimonials, that is, bibliographical elements that contributed to the understanding of Brazilian integralism, especially with regard to the leader Plínio Salgado, who was the main mentor of the movement. On the basis of the concept of political culture, the investigation has proposed the analysis of evolutionary thought of the integralist leader by focusing on the context of Lusitanian influence and basically Catholic, precept that accompanied him throughout his life. The research has been organized based on the understanding of the author's works since his first productions from the 1910s to his last writings in 1975. Belonging to a traditional and conservative family from the interior of the state of São Paulo, he was born in 1895 in the city of São Bento do Sapucaí. Still as a young man, he went to São Paulo where he excelled intellectually in the 1920s so as to subsequently form, in the following decade, the first mass movement in Brazil, the Brazilian Integralist Action. With multiple matrices, Salgado had the purpose of constructing an original political doctrine. However, the circularity of ideas of the period made the Head suffer considerable influences on the formation of his thought, having in Portugal the doctrinal example, Lusitanian Integralism: a movement with a nationalist character of the radical right wing that had visible formation based on the precursor of conservatism, the Action Française, which, as well as all the political groups of the early twentieth century, established a practical response to the theory given by Pope Leo XIII in 1891 through the encyclical Rerum Novarum. After the Lusitanian influence on the formation of Plínio s thought and idealization of integralism, once again Portugal was a highlight in the doctrinal organization of the author, when he was exiled between 1939 and 1946, a period of time which he used to reorder his thought, actions and political articulations, keeping Catholic spiritualism as a central force. With the end of the period of Vargas dictatorship, he returned to Brazil and declared himself to be Luso-Brazilian, becoming a supreme supporter of the politics of António de Oliveira Salazar, an image that he followed until the end of his life. One of the proposals of the thesis lies in the approach to the integralist movement from a multiplicity of perspectives, but predominantly in a comparative analysis with Portugal. The current thesis has searched for the verification of political actions so as to contribute to a better understanding of the relation between Portugal and Brazil, through the analysis of the radical conservatism enlarging this focus on the Portuguese right wing. The Christian political thought of the author holds a significant importance to the Political History of the 20th century, not only for Brazil, due to the fact that his actions and dialogues established with Lusitanian groups have been fundamental to the comprehension of the political matters of the two countries / Esta tese tem como objetivo a investigação da trajetória de Plínio Salgado para a formação e o desenvolvimento do integralismo brasileiro em suas mais variadas fases, buscando as múltiplas matrizes discursivas e a circularidade cultural no campo das apropriações, observando o processo de circularidade cultural no trato com os componentes lusitanos. A análise estabeleceu discussões com referência à produção doutrinária, política, literária e religiosa, além de manifestos, entrevistas e depoimentos, ou seja, elementos bibliográficos que contribuíram para a compreensão do integralismo brasileiro, notadamente em relação ao líder Plínio Salgado, que foi o principal mentor do movimento. Com base no conceito de cultura política, a investigação propôs a análise do pensamento evolutivo do líder integralista centrada no contexto de influência lusitana e basicamente católica, preceito que o acompanhou por toda a vida. A pesquisa foi organizada com base na compreensão das obras do autor, desde as primeiras produções na década de 1910 até seus últimos escritos em 1975. Pertencente a uma família conservadora e tradicional do interior paulista, nasceu em 1895, na cidade de São Bento do Sapucaí. Ainda jovem foi para São Paulo onde se destacou intelectualmente nos anos de 1920, para posteriormente formar, na década seguinte, o primeiro movimento de massa do Brasil: a Ação Integralista Brasileira. Com matrizes múltiplas, Salgado tinha como propósito a construção de uma doutrina política original. No entanto a circularidade de ideias do período fez com que o Chefe sofresse influências consideráveis para a formação de seu pensamento, tendo, em Portugal, o exemplo doutrinário, o Integralismo Lusitano: um movimento de cunho nacionalista da direita radical que teve visível formação embasada na precursora do conservadorismo, a Action Française, que assim como todos os grupos políticos do princípio do século XX estabeleceram uma resposta prática à teoria proferida pelo Papa Leão XIII, em 1891, através da Rerum Novarum. Após a influência lusitana na formação do pensamento pliniano e a idealização do integralismo, novamente Portugal foi um destaque na organização doutrinária do autor, quando ficou exilado nos anos de 1939 a 1946, momento que utilizou para reordenar o seu pensamento, ações e articulações políticas, tendo a vertente do espiritualismo católico como força central. Com o fim do período ditatorial varguista, retornou para o Brasil com a afirmação de ser um luso-brasileiro, passando a ser um defensor supremo da política de António de Oliveira Salazar, imagem que seguiu até o fim da vida. Uma das propostas da tese está na abordagem do movimento integralista a partir de uma multiplicidade de perspectivas, mas com predominância de uma análise comparativa com Portugal. A tese buscou a verificação das ações políticas a fim de contribuir para o melhor entendimento da relação Portugal-Brasil, através da análise do conservadorismo radical ampliando esse foco com o português. O pensamento político-cristão do autor possui uma importância significativa para a História Política do século XX, não só para o Brasil, pois suas ações e os diálogos estabelecidos com grupos lusitanos são fundamentais para a compreensão da política dos dois países
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Maturation de sites métalliques de protéines par les protéines à radical S-Adénosyl-L-méthionine et la machinerie de fabrication des centres fer-soufre / Maturation of protein active sites containing metals by the radical S-Adenosyl-L-methionine proteins and the iron-sulfur cluster assembly machinery.Marinoni, Elodie 09 December 2011 (has links)
Les centres FeS sont un des cofacteurs protéiques majeurs, ils se trouvent aussi bien chez les bactéries que chez les eucaryotes. Ils ont des rôles essentiels de transfert d'électron, liaison de substrat et son activation, régulation d'expression de gènes, donneur de soufre etc. Leur agencement est très varié, allant du centre [2Fe-2S] à l'agrégat plus complexe MoFe7S9X (X = C, N ou O) de la nitrogénase. L'assemblage de ces centres se fait par des machineries protéiques. Nous avons étudié le système ISC (Iron-Sulfur Cluster) chez les bactéries, qui fabrique des centres [2Fe-2S] et [4Fe-4S]. Il est composé des protéines IscS, IscU, IscA, HscA, HscB et d'une ferrédoxine. Deux de ces protéines, IscS, qui est une cystéine désulfurase et IscU, protéine dite échafaudage, sont le cœur de la machinerie puisque IscS apporte le soufre sur la protéine IscU, qui, avec le fer qu'elle aura obtenu d'une autre protéine (non clairement identifiée à ce jour), fabriquera le centre fer-soufre et le transfèrera à une apoprotéine. Nous avons isolé un complexe stable (IscS-D35A-IscU)2 contenant un centre [2Fe-2S] dans des conditions anaérobie. Différentes formes du complexe ont été obtenues et cristallisées afin d'obtenir leurs structures, résolues par remplacement moléculaire. Ces structures nous ont permis de proposer un mécanisme d'assemblage des centres [2Fe-2S] à l'échelle atomique et électronique. Nous avons d'autre part étudié la protéine HmdB probablement impliquée dans la maturation de l'hydrogénase à fer. HmdB fait partie de la superfamille des protéines à radical SAM. Des cristaux de l'apoprotéine ont été obtenus et sa structure a été résolue par remplacement moléculaire. Même si une partie de la structure n'est pas visible du fait de l'absence de centre [4Fe-4S], elle donne une première vue du site actif de la protéine. / FeS clusters are widely used protein cofactors, found both in bacteria and eukaryotes. They play key roles such as electron transfer, substrate binding and activation, regulation of gene expression, sulfur donor etc. They are really various, ranging from the [2Fe-2S] cluster to the more complex MoFe7S9X (X = C, N or O) agregate of nitrogenase. Clusters assembly is carried out by protein machineries. We studied the ISC (Iron-Sulfur Cluster) in bacteria, who assembles [2Fe-2S] and [4Fe-4S] clusters. It is composed of IscS, IscU, IscA, HscA, HscB proteins and a ferredoxin. Two of these proteins: the cysteine desulfurase IscS, and the scaffold protein IscU, represent the core of the machinery as IscS provides sulfur protein on IscU, which, with iron obtained from another protein (not clearly identified to date), assemble the iron-sulfur center. The latter transfers it to an apoprotein. We isolated under anaerobic conditions a stable (IscS-D35A-IscU)2 complex containing a [2Fe-2S] cluster. Different forms of the complex were obtained and their structures were solved by molecular replacement. These structures allowed us to propose a mechanism for the assembly of the [2Fe-2S] clusters at the atomic and electronic levels. We have also studied the HmdB protein, which is proposed to maturate the [Fe]-hydrogenase. HmdB is a member of the radical SAM proteins superfamily. Crystals of the apoprotein were obtained and its structure was solved by molecular replacement. Although part of the structure is not visible due to the absence of the [4Fe-4S] cluster, this structure gives a first view of the active site of the protein.
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O radical de Jacobson de anéis de polinômios diferenciais / The Jacobson radical of differential polynomial ringsSantos Filho, Gilson Reis dos 28 August 2015 (has links)
O objetivo desta dissertação é estudar o radical de Jacobson de anéis de polinômios diferenciais. Mostramos um resultado de M. Ferrero, K. Kishimoro, K. Motose, que mostra que no caso geral, o radical de um anel de polinômios diferenciais é um anel de polinômios diferenciais sobre algum ideal do anel dos coeficientes. Assumindo que o anel dos coeficientes satisfaça uma identidade polinomial, mostramos seguindo B. Madill que este ideal é um ideal nil. Se o anel dos coeficientes é adicionalmente localmente nilpotente, seguindo J. Bell, B. Madill, F. Shinko, mostramos que o anel de polinômios diferenciais será localmente nilpotente. Ainda seguindo J. Bell et al, se o anel dos coeficientes é uma álgebra sobre um corpo de característica zero e tal álgebra satisfaz uma identidade polinomial, mostramos que o ideal nil é o radical de Köthe. Para tais demonstrações, cobriremos os tópicos preliminares necessários para entender os enunciados: radical nil, radical de Levitzki, radical de Baer, radical de Jacobson e propriedades, anéis PI, polinômios centrais, teorema de Kaplansky. / The aim of this work is to study the Jacobson radical of differential polynomial rings. We show a result of M. Ferrero, K. Kishimoto, K. Motose, which shows that in general, the radical of a differential polynomial ring is a differential polynomial ring over some ideal of the ring of coefficients. Assuming that the ring of coefficients satisfies a polynomial identity, we show following B. Madill that this ideal is nil. If the ring of coefficients is additionally locally nilpotent, following J. Bell, B. Madill, F. Shinko, we show that the differential polynomial ring is locally nilpotent. Still following J. Bell et al, if the ring of coefficients is an algebra over a field of zero characteristic and this algebra satisfies a polynomial identity, we show that the nil ideal is the Köthe radical. For the proofs, we cover the preliminary topics necessary for understanding the statements: nil radical, Levitzki radical, Baer radical, Jacobson radical and its properties, PI-rings, central polynomials, Kaplanskys theorem.
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Boundary element analysis for convection-diffusion-reaction problems combining dual reciprocity and radial integration methodsAl-Bayati, Salam Adel January 2018 (has links)
In this research project, the Boundary Element Method (BEM) is developed and formulated for the solution of two-dimensional convection-diffusion-reaction problems. A combined approach with the dual reciprocity boundary element method (DRBEM) has been applied to solve steady-state problems with variable velocity and transient problems with constant and variable velocity fields. Further, the radial integration boundary element method (RIBEM) is utilised to handle non-homogeneous problems with variable source term. For all cases, a boundary-only formulation is produced. Initially, the steady-state case with constant velocity is considered, by employing constant boundary elements and a fundamental solution of the adjoint equation. This fundamental solution leads to a singular integral equation. The conservation laws, usually applied to avoid this integration, do not hold when a chemical reaction is taking place. Then, the integrals are successfully computed using Telles' technique. The application of the BEM for this particular equation is discussed in detail in this work. Next, the steady-state problem for variable velocity fields is presented and investigated. The velocity field is divided into an average value plus a perturbation. The perturbation is taken to the right-hand-side of the equation generating a non-homogeneous term. This nonhomogeneous equation is treated by utilising the DRM approach resulting in a boundary-only equation. Then, an integral equation formulation for the transient problem with constant velocity is derived, based on the DRM approach utilising the fundamental solution of the steady-state case. Therefore, the convective terms will be encompassed by the fundamental solution and lie within the boundary integral after application of Greens's second identity, leaving on the right-hand-side of the equation a domain integral involving the time-derivative only. The proposed DRM method needs the time-derivative to be expanded as a series of functions that will allow the domain integral to be moved to the boundary. The expansion required by the DRM uses functions which take into account the geometry and physics of the problem, if velocity-dependent terms are used. After that, a novel DRBEM model for transient convection-diffusion-reaction problems with variable velocity field is investigated and validated. The fundamental solution for the corresponding steady-state problem is adopted in this formulation. The variable velocity is decomposed into an average which is included into the fundamental solution of the corresponding equation with constant coefficients, and a perturbation which is treated using the DRM approximation. The mathematical formulation permits the numerical solution to be represented in terms of boundary-only integrals. Finally, a new formulation for non-homogeneous convection-diffusion-reaction problems with variable source term is achieved using RIBEM. The RIM is adopted to convert the domain integrals into boundary-only integrals. The proposed technique shows very good solution behaviour and accuracy in all cases studied. The convergence of the methods has been examined by implementing different error norm indicators and increasing the number of boundary elements in all cases. Numerical test cases are presented throughout this research work. Their results are sufficiently encouraging to recommend the use of the techniques developed for solution of general convection-diffusion-reaction problems. All the simulated solutions for several examples showed very good agreement with available analytical solutions, with no numerical problems of oscillation and damping of sharp fronts.
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O radical de Jacobson de anéis de polinômios diferenciais / The Jacobson radical of differential polynomial ringsGilson Reis dos Santos Filho 28 August 2015 (has links)
O objetivo desta dissertação é estudar o radical de Jacobson de anéis de polinômios diferenciais. Mostramos um resultado de M. Ferrero, K. Kishimoro, K. Motose, que mostra que no caso geral, o radical de um anel de polinômios diferenciais é um anel de polinômios diferenciais sobre algum ideal do anel dos coeficientes. Assumindo que o anel dos coeficientes satisfaça uma identidade polinomial, mostramos seguindo B. Madill que este ideal é um ideal nil. Se o anel dos coeficientes é adicionalmente localmente nilpotente, seguindo J. Bell, B. Madill, F. Shinko, mostramos que o anel de polinômios diferenciais será localmente nilpotente. Ainda seguindo J. Bell et al, se o anel dos coeficientes é uma álgebra sobre um corpo de característica zero e tal álgebra satisfaz uma identidade polinomial, mostramos que o ideal nil é o radical de Köthe. Para tais demonstrações, cobriremos os tópicos preliminares necessários para entender os enunciados: radical nil, radical de Levitzki, radical de Baer, radical de Jacobson e propriedades, anéis PI, polinômios centrais, teorema de Kaplansky. / The aim of this work is to study the Jacobson radical of differential polynomial rings. We show a result of M. Ferrero, K. Kishimoto, K. Motose, which shows that in general, the radical of a differential polynomial ring is a differential polynomial ring over some ideal of the ring of coefficients. Assuming that the ring of coefficients satisfies a polynomial identity, we show following B. Madill that this ideal is nil. If the ring of coefficients is additionally locally nilpotent, following J. Bell, B. Madill, F. Shinko, we show that the differential polynomial ring is locally nilpotent. Still following J. Bell et al, if the ring of coefficients is an algebra over a field of zero characteristic and this algebra satisfies a polynomial identity, we show that the nil ideal is the Köthe radical. For the proofs, we cover the preliminary topics necessary for understanding the statements: nil radical, Levitzki radical, Baer radical, Jacobson radical and its properties, PI-rings, central polynomials, Kaplanskys theorem.
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