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Uma abordagem de alinhamento múltiplo de sequências utilizando evolução diferencial

SILVA JÚNIOR, Antônio Luiz Vieira da 27 February 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-03-30T17:14:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ANTONIO.pdf: 1896299 bytes, checksum: 6648d14ae9c1893123a82366b851c19a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-30T17:14:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ANTONIO.pdf: 1896299 bytes, checksum: 6648d14ae9c1893123a82366b851c19a (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / CAPES / Alinhamento Múltiplo de sequências (MSA) é uma das tarefas mais importantes em bioinformática. A MSA é uma técnica fundamental para o estudo da função, estrutura e evolução de biomoléculas. A partir do uso de métodos de MSA é possível a criação de modelos estatísticos para a classificação de famílias de proteína , análise filogenética e a previsão de estruturas secundárias de proteínas. Como trata-se de um problema do tipo NP-difícil, torna-se inviável o uso de métodos exatos para a busca da melhor solução. Por isso, é importante o uso de métodos de optimização baseado em heurística para resolver o problema de MSA. Nesta dissertação, propomos uma abordagem para alinhamento múltiplo de sequências por meio da otimização de uma função objetivo utilizando Evolução Diferencial. Embora a ideia de usar algoritmos evolutivos não seja nova, a abordagem apresentada difere pelo uso da Evolução Diferencial e pela definição do alinhamento como uma dispersão de lacunas ao longo das sequências, sem levar em consideração fenômenos biológicos, como os de inserção ou surgimento de bases, deleção ou mutação de bases. A solução proposta tem provado ser capaz de fazer melhorias significativas em alinhamentos quando comparadas com o método do estado da arte Clustal. / Multiple sequence alignment (MSA) is one of the most important tasks in bioinformatics. The MSA is a fundamental technique to the study of function, structure and evolution of biomolecules. By using of MSA methods it’s possible to create statistical models for classification of protein families, phylogenetic analysis and the prediction of secondary structures of proteins. Being a NPhard problem, it is infeasible due to its completely, the use of exact methods to search for optimal solutions. Because of this it is important to use heuristic-based optimization methods to solve the MSA problem. In this dissertation, we propose an approach to multiple sequence alignment by optimizing an objective function using Differential Evolution. Although the idea of using Evolutionary Algorithms is not new, the approach presented differs from the use of Differential Evolution and definition of alignment as a dispersion of gaps along the sequences, without considering biological events such as insertion or emergence of bases, deletion or mutation of bases. The proposed solution has proven to be able to make significant improvements in alignments when compared to the state-of-the art Clustal method.
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Contrato didático : negociações, rupturas e renegociações a partir de uma sequência didática sobre progressão aritmética

SOUZA, Carla Maria Pinto de 17 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-10-21T14:44:16Z No. of bitstreams: 1 Carla Maria Pinto de Souza.pdf: 2829824 bytes, checksum: 28e8e39c11f5dafd6617b06c11458695 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-21T14:44:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carla Maria Pinto de Souza.pdf: 2829824 bytes, checksum: 28e8e39c11f5dafd6617b06c11458695 (MD5) Previous issue date: 2011-02-17 / This study aimed to investigate how a teacher negotiates the contract with teaching students in the 2nd year of high school, in the implementation of a didactic sequence previously established for the teaching of Arithmetic Progression (AP). The didactic sequence was designed considering the type of didactic situations proposed by Brousseau (action, formulation, validation and institutionalization). Thus, the activities aimed at teaching sequence that enable your application to be performed according to a didactic contract type approximation, which is one in which value is an active student in constructing knowledge. The observed results showed that although we proposed a sequence to be applied as a kind of didactic contract approximate; negotiations, renegotiations and breaks the rules of the didactic contract were made during the development of the sequence. We believe that these breaches of the rules were motivated by previous marks of didactic contract, or implicit and explicit rules by which teacher and students were accustomed. / Esse estudo teve por objetivo investigar como uma professora negocia o contrato didático com alunos do 2º ano do Ensino Médio, na aplicação de uma sequência didática previamente elaborada para o ensino de Progressão Aritmética (P.A.). A sequência didática foi idealizada contemplando a tipologia das situações didáticas proposta por Brousseau (ação, formulação, validação e institucionalização). Com isso, as atividades dessa sequência didática visaram possibilitar que sua aplicação fosse realizada de acordo com um contrato didático do tipo aproximativo, que é aquele em que se valoriza uma postura ativa do aluno na construção do conhecimento. Os resultados observados evidenciaram que embora tivéssemos proposto uma sequência para ser aplicada conforme um contrato didático do tipo aproximativo, negociações, rupturas e renegociações de regras de contrato didático foram feitas ao longo do desenvolvimento da sequência. Acreditamos que essas rupturas das regras estabelecidas foram motivadas por marcas de contrato didático anteriores, ou seja, pelas regras implícitas e explícitas, que professora e alunos estavam habituados.
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Algoritmo guloso

MORAIS, Camila Mendonça 19 December 2014 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-28T13:29:01Z No. of bitstreams: 1 Camila Mendonca Morais.pdf: 1358642 bytes, checksum: 6f2183e2579739977dd39a9eefa8f2cc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-28T13:29:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camila Mendonca Morais.pdf: 1358642 bytes, checksum: 6f2183e2579739977dd39a9eefa8f2cc (MD5) Previous issue date: 2014-12-19 / This research aims to study the Greedy Algorithm, a type of optimization algorithm, and some of its applications, in order to develop a didactic sequence to be applied with secondary level students. In the study, the construction and logic of the algorithm were related to the graph and trees, concepts which were previously studied and analyzed as requisites to the comprehension of the properties and characteristics of the algorithm. Firstly, we synthetized the elaboration of the Theory of Graphs; then, we presented some concepts about graphs in general, such as its de nition, properties, classi cations and percusses. Next, we de ned trees - a special type of graph - and studied some of its fundamentals theorems for the comprehension of the algorithm, as well as some methods of codi cation such as the Pr ufer code. Finally, we de ned the Greedy Algorithm, specially the Kruskal algorithm, using a practical setting in order to exemplify its application. After the theoretical fundaments, we develop a didactical sequence to be applied in ve classes. In this didactical sequence, activities which involve graphs and trees were progressively applied, with contextualized questions such as exercises in such a way that in the last class of the sequence, the Greedy Algorithm could be de ned and studied, and the students were able to use them to analyze a project, which would be used as a nal instrument of evaluation. This didactical sequence aims to stimulate the student's logical reasoning, as well as to introduce these concepts in their school curriculum on secondary level. / O presente trabalho tem como objetivo principal estudar o Algoritmo Guloso, esp écie de algoritmo de otimiza cão, e algumas de suas aplica ções, para posterior desenvolvimento de uma sequência didática a ser abordada com alunos do Ensino M édio. Neste estudo, a constru ção e l ógica do algoritmo foram relacionadas a grafos e arvores, conceitos os quais foram previamente estudados e analisados como requisitos para a compreensão das propriedades e caracter ísticas do algoritmo. Primeiramente, fi zemos uma s íntese de como surgiu a Teoria dos Grafos; em seguida retratamos alguns conceitos sobre grafos em geral, como sua de finição, propriedades, classi ca ções e percursos. Na sequência, defi nimos arvores - um tipo especial de grafo - e estudamos alguns de seus principais teoremas fundamentais para a posterior compreensão do algoritmo, al ém de alguns m étodos de codi ca ção, como o c ódigo de Pr ufer. Finalmente, defi nimos o Algoritmo Guloso, especialmente o algoritmo de Kruskal, utilizando uma situa ção pr ática para exempli car sua aplicação. Ap ós toda a fundamenta ção, desenvolvemos uma sequência did ática para ser trabalhada em cinco aulas. Nesta sequência did ática, atividades envolvendo grafos e árvores foram progressivamente realizadas, com questões contextualizadas como exercí cios, para que na última aula da sequência o Algoritmo Guloso fosse defi nido e estudado, e os alunos capacitados a utiliz á-lo na an álise de um projeto, que seria utilizado como instrumento fi nal de avalia ção. Esta sequência did ática tem como objetivo estimular o raciocí nio l ógico dos estudantes, al ém de introduzir estes conceitos em seu currí culo escolar do Ensino M édio.
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O olhar complexo do licenciando em ciências biológicas sobre o transplante cardíaco e a série médica House MD. como instrumento de potencialização do processo de ensino-aprendizagem

FREITAS, Wagner Gomes da Silva 29 August 2016 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-08-23T15:21:00Z No. of bitstreams: 1 Wagner Gomes da Silva Freitas.pdf: 2618788 bytes, checksum: 1e7396823ad84858f9a034696c6a679c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-23T15:21:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Wagner Gomes da Silva Freitas.pdf: 2618788 bytes, checksum: 1e7396823ad84858f9a034696c6a679c (MD5) Previous issue date: 2016-08-29 / With the insertion of new Information and Communication Technologies (ICT) in the contemporary social context, there are new and challenging obstacles to be surmounted by Professor of Biology in their daily teaching practice in the classroom. This context ultimately stimulate professional education to adapt to these new paradigms arising from the social environment in order to pedagogical practice be in consonance with current social demands, approaching thus, the classroom student context. In this manner, the school tends to every day more opt for a pedagogical approach focused on the complex paradigm of thought, articulating the different areas of knowledge in the construction of most faithful knowledge to the real facts of nature and society, combining this perspective of thought with resource usage and more attractive and dynamic teaching strategies for students, as in the case of using the medical series House MD. In this bias, this study busied herself qualitatively investigate the possibilities of development and educational viability of a Didactic Sequence guided by the complexity of thought and the use of the episode "Sex Kills" present in the medical series House MD. as potentiation resource of the teaching-learning process, through a process of the Practical Action Research conducted with 20 undergraduate 7th attending the course Biology Teaching Stage 3, during the 7 course of the period of Biological Sciences of the Academic Center of Victoria (CAV), which is linked to the Federal University of Pernambuco (UFPE). This intervention process occurred in four in-person meetings, weekly, where participants subject were able to discuss about the linear, systemic and complex paradigms, as well as the theoretical constructs of Zabala (1998) for the development of a didactic sequence and the use of medical series as potentiation learning resource. At the last meeting the participants had the opportunity to propose a Joint Teaching Sequence (JTS) glimpsing the possibility of a future application of it in a school setting high school. At the end of the investigative process, we come to some conclusions as the fact that the complex thinking have proved viable as a didactic sequence formulation framework, as well as the use of the episode "Sex Kills" of the medical series House MD. is favorable to the potentiation of learning. Also, the proposed Joint Didactic Sequence of underlicentiate was considered satisfactory in terms of viability and educational potential. / Com a inserção de novas Tecnologias de Informação e Comunicação (TIC) no âmbito social contemporâneo, surgem novos e desafiadores obstáculos a serem transpostos pelo professor de Biologia em sua prática pedagógica diária em sala de aula. Este contexto acaba por estimular o profissional da educação a se adaptar a estes novos paradigmas advindos do meio social, afim de a prática pedagógica estar em consonância com as demandas sociais vigentes, aproximando assim, a sala de aula do contexto do estudante. Desta forma, a escola tende a cada dia mais optar por uma abordagem pedagógica voltada para o paradigma complexo de pensamento, articulando as diferentes áreas do conhecimento na construção de conhecimento mais fidedignos aos fatos reais da natureza e da sociedade, aliando a esta perspectiva de pensamento o uso de recursos e estratégias didáticas mais atrativas e dinâmicas para os estudantes, como o caso do uso da série médica House MD. Neste viés, a presente pesquisa ocupou-se em investigar qualitativamente as possibilidades de desenvolvimento e a viabilidade pedagógica de uma Sequência Didática pautada na complexidade de pensamento e no uso do episódio “ Sexo Mata” da série médica House MD. como recurso de potencialização do processo de ensino-aprendizagem, através de um processo de Pesquisa-Ação Prática realizado com 20 Licenciandos do 7º cursando a disciplina de Estágio de Ensino de Biologia 3, durante o 7º período do curso de Ciências Biológicas do Centro Acadêmico de Vitória (CAV), que é vinculado à Universidade Federal de Pernambuco (UFPE). Este processo interventivo ocorreu em quatro encontros presenciais, semanais, onde os sujeitos participantes puderam discutir a respeito dos paradigmas linear, sistêmico e complexo, assim como dos construtos teóricos de Zabala (1998) para a elaboração de uma sequência didática e o uso das séries médicas como recurso de potencialização da aprendizagem. Ao derradeiro encontro, os participantes tiveram a oportunidade de propor uma Sequência Didática Conjunta (SDC) vislumbrando a possibilidade de uma aplicação futura da mesma em um contexto escolar do ensino médio. No fim deste processo investigativo, pudemos chegar à algumas conclusões como o fato de o pensamento complexo ter se mostrado viável como arcabouço de formulação de uma sequência didática, assim como o uso do episódio “Sexo Mata” da série médica House MD. se mostra favorável à potencialização da aprendizagem. Também, a proposta de Sequência Didática Conjunta dos licenciandos foi considerada satisfatória em termos de viabilidade e potencialidade pedagógica.
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UMA SEQUÊNCIA DE ATIVIDADES PARA O ESTUDO DE OPERAÇÕES COM FRAÇÕES COM USO DE MATERIAIS MANIPULÁVEIS

Morais, Vanessa da Silva Chaves de 17 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2018-06-27T19:13:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Vanessa da Silva Chaves de Morais.pdf: 7657643 bytes, checksum: 605342304605152a768586c40ce463e4 (MD5) Vanessa da Silva Chaves de Morais.pdf.jpg: 3776 bytes, checksum: 0122bd67c7051d79ae6b87529237ce56 (MD5) Previous issue date: 2012-08-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This research investigates the use of manipulatives for teaching fractions. The research has a qualitative character and, as instruments, had a diagnostic test and a field diary, in which were recorded observations of the teacher-researcher on the performance of students to engage in activities. The study was conducted with 91 students in the 6th grade of elementary school in a federal public school in the city of Santa Maria, RS. Researches on the existence of manipulatives for teaching operations with fractions were developed, as well as analysis of some textbooks of elementary school and verification of how the operations with fractions content is presented. We developed a sequence of activities to work with operations with fractions, with the support of manipulatives, and analyzed the performance of students by developing activities. It was noted that most students had good results with the use of these materials and, especially, it was established an environment of interaction and exchange of knowledge with the teacher-researcher and colleagues. It is considered that this experience can be used in the classroom and even in future workshops for mathematics teachers and educators who work in the teaching of mathematics in the early years of elementary school. Therefor, it has been developed a set of activities is presented as a product of this dissertation. / Este trabalho buscou investigar o uso de materiais manipuláveis para o ensino de frações. A pesquisa, de caráter qualitativo, teve como instrumentos um teste diagnóstico e um diário de campo, em que foram anotadas as observações da professora-pesquisadora sobre o desempenho dos estudantes ao se engajarem nas atividades. O trabalho foi desenvolvido com 91 alunos do 6º ano do Ensino Fundamental de uma escola da rede federal de ensino do município de Santa Maria, RS. Foram realizadas pesquisas sobre a existência de materiais manipuláveis para o ensino de operações com frações, análise em alguns livros didáticos do Ensino Fundamental e verificação de como está sendo apresentado o conteúdo de operações com frações. Elaborou-se uma sequência de atividades para o trabalho com operações com frações, com apoio de materiais manipuláveis, e analisou-se o desempenho dos alunos ao desenvolverem as atividades. Notou-se que a maioria dos estudantes apresentou bons resultados com o uso desses materiais e, principalmente, que foi estabelecido um ambiente de interação e troca de saberes com a professora-pesquisadora e colegas. Considera-se que esta experiência pode ser aproveitada em sala de aula e até mesmo em oficinas para futuros professores de Matemática e pedagogos que atuam no ensino de Matemática nos anos iniciais do Ensino Fundamental. Assim, elaborou-se um conjunto de atividades que é apresentado como produto desta dissertação.
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CONTRIBUIÇÕES DA ENGENHARIA DIDÁTICA COMO METODOLOGIA PARA O ENSINO DE CIÊNCIAS NOS ANOS INICIAIS

Zborowski, Cristina Angonesi 11 July 2017 (has links)
Submitted by MARCIA ROVADOSCHI (marciar@unifra.br) on 2018-08-20T16:50:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CristinaAngonesiZborowski.pdf: 2309154 bytes, checksum: ce05ac54ea00be9c278840892d101d33 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:50:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CristinaAngonesiZborowski.pdf: 2309154 bytes, checksum: ce05ac54ea00be9c278840892d101d33 (MD5) Previous issue date: 2017-07-11 / The main objective is to verify the contribution of Didactic Engineering as methodology to teach on food chain content to students of early elementary school classes. The research is based on a qualitative approach with a methodological precepts of Didactic Engineering. The research was carried out at Escola Franciscana Sant'Anna in Santa Maria/RS, taking into consideration a population of 79 students varying from nine to eleven year old being oriented by Science teacher. The methodology follows the steps of Didactic Engineering, which are: a) previous analysis; b) a priori construction and analysis; c) application of the didactic sequence; and d) a posteriori analysis and validation. In the early stages analysis an interview was applied along the Science’s classes, a textbook was analyzed by the students and a hands-on activity was performed in a non-formal space. The didactic sequence was elaborated from previous analyzes composed by eight activities during October and November of 2016. These activities looked for the use of different strategies to promote the construction of food chain concept, besides the understanding of other concepts related to the matter such as: photosynthesis and food web. The comparison between a priori analyzes and a posteriori analyzes showed that the proposed sequence is valid to build up the concepts related to the research. Vygotsky's historical cultural theory was the theoretical reference of the developing of reflections based on concepts of mediation, process of formation and construction of spontaneous and scientific concepts, articulation between thoughts and language, and Proximal Development Zone (PDZ).The use of Didactic Engineering as a methodology has contributed to concept of food chain understanding since it provides great in-deep of the previous analyzes, besides the continuous evaluation of the proposed activities and the weighting of the difficulties or students attitudes front of the proposed activities, allowing the students to become more interested studying and reflecting on learning and development. / O objetivo principal deste trabalho foi verificar a contribuição da Engenharia Didática como metodologia para o ensino do conteúdo cadeias alimentares, nos anos iniciais do ensino fundamental. A pesquisa, de abordagem qualitativa, ancorada nos preceitos metodológicos da Engenharia Didática, foi realizada no Colégio Franciscano Sant’Anna, localizado na cidade de Santa Maria – RS com 79 alunos, com idade entre nove e onze anos, do quarto ano do ensino fundamental e a professora de Ciências das turmas. A metodologia utilizada seguiu as etapas previstas na Engenharia Didática, quais sejam: análises prévias, construção e análise a priori, aplicação da sequência didática, análise a posteriori e validação. Na etapa de análises prévias foram realizadas as seguintes atividades: entrevista com a professora de Ciências das turmas, análise do livro didático e uma atividade prática em um espaço não-formal. A sequência didática, elaborada a partir das análises prévias, foi composta por oito atividades realizadas no período de outubro e novembro de 2016. Essas atividades buscaram, a partir da utilização de diferentes estratégias, promover a construção do conceito de cadeia alimentar, além da compreensão de outros conceitos relacionados ao tema, como: fotossíntese e teia alimentar. O confronto entre as análises a priori e as análises a posteriori mostrou que a sequência proposta foi válida para a construção dos conceitos envolvidos na pesquisa. A teoria histórico cultural de Vygotsky foi o referencial teórico utilizado para o desenvolvimento das reflexões, baseadas nos conceitos de mediação, no processo de formação e na construção dos conceitos espontâneos e científicos, na articulação entre pensamento e linguagem e na Zona de Desenvolvimento Proximal (ZDP). A utilização da Engenharia Didática como metodologia contribuiu para a compreensão do conceito de cadeias alimentares, pois prevê maior profundidade nas análises prévias, além da avaliação contínua das atividades propostas e da ponderação das dificuldades ou atitudes dos alunos frente às atividades propostas, permitindo que os alunos se tornem mais interessados pelo estudo, aspectos que refletiram sobre a sua aprendizagem e o seu desenvolvimento.
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Análise do complexo gênico FANCD2/FANCI em mulheres brasileiras com câncer de mama herediitário / Analysis of the gene complex FANCD2/FANCI in Brazilian womem with hereditary breast cancer

Amstalden, Lucila Gobby 17 August 2018 (has links)
Orientador: Carmen Silvia Bertuzzo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-17T14:33:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Amstalden_LucilaGobby_D.pdf: 2331693 bytes, checksum: b9984b5e8cbc2821d446ee5281ae4200 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O câncer de mama (CM) é o tipo de câncer que mais comumente ocorre entre mulheres, com a estimativa de 49.240 novos casos diagnosticados em 2010 no Brasil. O CM apresenta fatores de risco conhecidos como idade, fatores sócio-econômicos, etnia, exposição excessiva a hormônios, radiação, dieta, exercícios físicos, história ginecológica e história familiar. Além dos fatores de risco, o CM apresenta fatores de prognóstico mensurados no momento do diagnóstico e que servem como preditor da sobrevida do paciente. Existem pelo menos 20 subtipos de CM distintos morfologicamente. O complexo formado pelos genes FANCD2 e FANCI tem a função chave de co-localizar o sítio nuclear de reparo para proteínas que diretamente estão relacionadas à recombinação homóloga como BRCA1, juntamente com FANCJ, RAD51, BRCA2/FANCD1 com FANCN. A descoberta de que o gene BRCA2 é, na verdade, FANCD1 atraiu pesquisadores para um novo alvo na corrida para a compreensão da história natural da doença, informação esta que permitirá avaliar a hipótese dos genes de reparo de DNA na susceptibilidade ou refratariedade para carcinogênese. O objetivo do atual estudo foi analisar as principais alterações nos genes FANCD2 e FANCI utilizando PCR e digestão enzimática e, paralelamente, rastreamento dos éxons dos genes por meio do sequenciamento automático. A casuística foi formada por 137 mulheres com CM hereditário. Foram encontradas oito alterações em 33 indivíduos e cinco variantes exônicas não relatadas, novas. Por meio de análise estatística, houve a correlação entre indivíduos mutados e dados clínicos. Esse estudo foi de grande valia para a detecção de alterações que podem funcionar como estopim para o desenvolvimento do câncer em indivíduos com CM com histórico familiar sem mutações em genes de alta suscetibilidade, como também servir para caracterizar um tipo histológico distinto auxiliando na terapêutica futura / Abstract: Breast Cancer (BC) is the cancer type more commonly occurs among women with estimative of 49.240 new cases in 2010. The BC presents risk factors as: age, social-economic factors, ethnicity, hormone exposure, radiation, diet, physical exercises and familiar history. Besides the risk factors BC has prognosis factors measured in diagnostic. There's, at least, 20 subtypes of BC morphologically different. Corcerning molecular epidemiology, the BC is associated to many genes and in mutations in various genes as BRCA1 e 2, p53, PTEN. The FANCD2/FANCI complex have a key function of co-localize motif of DNA repair to proteins that directly act on homologue recombination as BRCA1 with FANCJ, RAD51, BRCA2/FANCD1 with FANCN. The discovery the BRCA2 is, actually, FANCD1 gene has leaded researchers to the new target in knowledge of natural history of disease.The aim of this study was to analyse alterations in FANCD2 and FANCI genes through PCR followed enzimatic restriction. At same time, was performed the screening of the genes exons. The casuistic was constituted from 137 women with hereditary breast cancer. We encountered eight alterations in 25 individuals and 5 exonic variants not reported. This study was very important with the purpose to detect alterations can be responsible by the cancer evolution in BC patients without mutations in high susceptibility genes and to server to characterize a distinct histological types to future therapeutic / Doutorado / Ciencias Biomedicas / Doutor em Ciências Médicas
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Escrevendo relatorios em sala de aula : genero discursivo, circulação e referenciação / Report writing in the classroom : speech genre, circulation and referentiation

Nascimento, Cecilia Eller Rodrigues 02 December 2009 (has links)
Orientador: Ines Signorini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Estudos da Linguagem / Made available in DSpace on 2018-08-13T12:30:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nascimento_CeciliaEllerRodrigues_M.pdf: 12418556 bytes, checksum: d58ca816cdb264b1309682b28f3a5a9a (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Esta dissertação analisa o impacto da reescrita na aprendizagem de gêneros discursivos/textuais escritos, após o desenvolvimento de uma sequência didática, além dos reflexos dos modos de circulação do texto no estabelecimento da referenciação. A pesquisa se identifica com os estudos aplicados da linguística, mas dialoga com vários outros campos, como a Filosofia da Linguagem, Didática de Línguas, Antropologia, Linguística textual e estudos sobre referenciação de orientação etnometodológica. Os registros foram obtidos numa quarta série do Ensino Fundamental I, em escola pública de periferia localizada em cidade do interior de São Paulo. Vários tipos de dados foram gerados, visando à triangulação e à compreensão mais profunda do fenômeno complexo que é aprender a escrever na escola. Houve dois momentos de obtenção de registros distintos, porém complementares, já que o primeiro guiou o planejamento e a execução do segundo. O primeiro momento foi de observação, com influências da etnografia aplicada à educação, e o segundo, de intervenção, influenciado por conceitos da pesquisa-ação, no qual uma sequência didática foi realizada pela classe em torno do gênero relatório. Duas reescritas orientadas por bilhetes integraram esse processo. Este trabalho parte do pressuposto de que o texto não tem caráter fixo, acabado, e sim provisório. Trata-se de um momento em um processo. Por isso, a reescrita surge como possibilidade de elaboração de versões cada vez mais adequadas a um novo momento de interlocução, mediado pelo bilhete orientador. Este, por sua vez, funciona como um gênero catalisador, já que potencializa o desenvolvimento de práticas de linguagem específicas. Três momentos de produção de texto são analisados, os quais revelaram (i) que um comando aberto, sem orientação posterior ou correção específica leva a pouco desenvolvimento do estado de escrita, uma vez que os alunos tendem a optar pelo que já lhes é familiar; (ii) o comando específico precisa ser acompanhado de informações sobre o gênero e sobre os interlocutores eleitos, já que estas não são óbvias, nem facilmente inferidas; (iii) com a sequência didática, os alunos podem chegar a uma compreensão mais precisa sobre o gênero a ser produzido e suas esferas de circulação; contudo, a intervenção posterior, visando à reescrita, é fundamental para um desenvolvimento mais significativo em relação à aprendizagem do gênero escrito proposto / Abstract: This master's thesis analyses the impact of rewriting on learning written speech/discourse genres, after the implementation of a didactic sequence, as well as the influences of the text's circulation modes on referentiation establishment. The research relates to the field of Applied Linguistics, but also dialogues with other areas, such as Language Philosophy, Language Didacticism, Anthropology, Text Linguistics and studies on referentiation which follow etnomethodological guidelines. The data was produced in an Elementary fourth grade of a public school, located in an underprivileged neighborhood of a São Paulo state's small town. Different types of data were produced, envisaging triangulation and trying to grasp a deeper understanding of learning how to write in school, without undermining its complexity. The data producing process can be divided in two distinct, though complementary, moments. The first included observation, influenced by Etnography applied to Education, while the second consisted of an intervention which benefited from concepts of Action Research. A didactic sequence regarding the genre written report was conducted. Two rewritings prompted by guiding notes integrated this process. In this work, it is assumed that the text does not possess a static, finished status. On the contrary, it is considered to be temporary. The rewriting, then, emerges as a possibility of formulating versions which are ever more suitable to the new interlocution moment, mediated by the guiding notes. They work as a catalyst genre, since they potencialize the development of specific language practices. Three different moments of text writing are analyzed. They revealed that (i) an open command, lacking ulterior orientation and specific correction leads to little development of written abilities, once students tend to choose what is more familiar to them; (ii) when the comand is specific, it must be accompanied of information about the genre and the chosen interlocutors, since they are not obvious, neither easily inferred; (iii) with the didactic sequence, students may arrive to a more precise understanding on the genre they are supposed to produce and on its circulation spheres; the ulterior intervention aiming at rewriting is, notwithstanding, crucial to achieve a more significant development regarding the learning of writing / Mestrado / Lingua Materna / Mestre em Linguística Aplicada
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Uma sequência didática para o ensino de Parábola: a Engenharia Didática como apoio metodológico

Cavalcante, Luiz Henrique de Vasconcelos 27 March 2017 (has links)
Submitted by Margarida Santos (santos_margarida@hotmail.com) on 2017-06-22T15:28:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação final 4.0.pdf: 850832 bytes, checksum: 7984b9a1fdbc58da608dc987123f2c58 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-06-23T13:55:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação final 4.0.pdf: 850832 bytes, checksum: 7984b9a1fdbc58da608dc987123f2c58 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-06-23T13:55:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação final 4.0.pdf: 850832 bytes, checksum: 7984b9a1fdbc58da608dc987123f2c58 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-23T13:55:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação final 4.0.pdf: 850832 bytes, checksum: 7984b9a1fdbc58da608dc987123f2c58 (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / The present work presents an experience of using theories on didactics in mathematics teaching. The parabola concept, taught in the third year of high school, within the content of analytical geometry, was based on a teaching sequence. For the conception of the activity we look for the concepts of didactic situations and didactic contract, coming from French’s didactics of mathematics, in which they make up the theoretical framework of didactic engineering in order to base the elaboration of the teaching sequence. As a research methodology, we use the precepts indicated by didactic engineering in both the design of the teaching sequence and the application of the activity in the classroom. We made an exposition of the application of previous analyzes; a priori analysis and conception; a posteriori analysis and validation in the scope of our work with the objective of showing how the teaching sequence was elaborated following the steps dictated by the chosen methodology. We chose to develop a teaching sequence for the teaching of the parabola concept based on the use of the Geogebra program as an auxiliary tool to the teaching / learning process. We applied the sequence of teaching with a group of third year of high school who had not yet studied the subject and found that its use in the classroom proved to be satisfactory when performing the analysis a priori and validation of the experience. / O presente trabalho apresenta uma experiência de utilização de teorias sobre didática no ensino de matemática. Abordou-se o conceito de parábola, ensinado no terceiro ano do ensino médio, dentro do conteúdo de geometria analítica, tendo como base uma sequência de ensino. Para a concepção da atividade buscamos os conceitos de situações didáticas e contrato didático, oriundos da didática da matemática francesa, no qual compõem o quadro teórico da engenharia didática com o objetivo de fundamentarmos a elaboração da sequência de ensino. Como metodologia de pesquisa usamos os preceitos indicados pela Engenharia Didática tanto na concepção da sequência de ensino quanto aplicação da atividade em sala de aula. Fizemos uma exposição da aplicação das análises prévias; das análises a priori e concepção; das análises a posteriori e validação no âmbito do nosso trabalho com o objetivo de mostrar o como a sequência de ensino foi elaborada seguindo os passos ditados pela metodologia escolhida. Optamos por desenvolver uma sequência de ensino para o ensino do conceito de parábola baseada no uso do programa Geogebra como ferramenta auxiliar ao processo de ensino/aprendizagem. Realizamos a aplicação da sequência de ensino com uma turma de terceiro ano do ensino médio que ainda não havia estudado o assunto e verificamos que o seu uso em sala de aula mostrou-se satisfatório ao realizarmos as análises a priori e validação da experiência.
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Uma proposta de sequência didática a partir do trabalho com o gênero piada / A propose of didactic sequence from the work with joke genre

Cerqueira, Maria Goreti Barichello 03 July 2015 (has links)
Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-12-04T15:27:07Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Goreti Barichello Cerqueira - 2015.pdf: 1736161 bytes, checksum: 1fc3c06256e7a69159e886f2d5412a04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-12-07T11:50:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Goreti Barichello Cerqueira - 2015.pdf: 1736161 bytes, checksum: 1fc3c06256e7a69159e886f2d5412a04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-07T11:50:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Goreti Barichello Cerqueira - 2015.pdf: 1736161 bytes, checksum: 1fc3c06256e7a69159e886f2d5412a04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-07-03 / This work, based on the functionalist theory of language, aims to propose a didactic sequence, based on the analysis of linguistic-discursive dimensions visible in joke genre texts. Reflection practices are geared towards high school teachers with issues of semantic-pragmatic nature, drawn from the statements present in the humorous sphere, exploiting the changes in the activation of linguistic constructions, or its padding that make you laugh. The theoretical basis of reflection and proposals for action comes from functionalist theory, from actors such as – Halliday (1985), Dik (1989), Neves (1997, 2006, 2010), Martelotta (2010), Castilho (2010), Casseb-Galvão (2011), Rauber (2005); the teaching-learning proposals presented by Antunes (2003), Franchi (2006), Geraldi (1993), Pauliukonis (2011); of Bakhtin studies on genres, Bakhtin (2003), Marcuschi (2008), Faraco (2009); the analysis of the functioning of jokes based on Freud (1996a, 1996b, 1996c), Raskin (1985), Travaglia (1989b, 1990, 1995), Possenti (1998, 2000); the suggestion of integral formation of Zabala (1998). The methodology focuses on qualitative research with bibliographic feature and the results point to a plan implementation that recognizes the possibility that the studied texts can enhance the reflection on the effects of meaning and, therefore, allow the development of different linguistic and discursive students’ skills. / Este trabalho, com base na teoria funcionalista da linguagem, tem como objetivo propor uma sequência didática, a partir da análise de dimensões linguístico-discursivas visíveis em textos do gênero piada. As práticas de reflexão são voltadas para os professores do Ensino Médio e se constroem a partir de questões de natureza semântico-pragmática, elaboradas a partir de enunciados presentes na esfera humorística, que exploram as alterações no acionamento das construções linguísticas, ou seu preenchimento, o que leva ao riso. O aporte teórico da reflexão e das propostas de intervenção parte da teoria funcionalista, a partir de autores como Halliday (1985), Dik (1989), Neves (1997, 2006, 2010), Martelotta (2010), Castilho (2010), Casseb- Galvão (2011), Rauber (2005); das propostas de ensino-aprendizagem apresentadas por Antunes (2003), Franchi (2006), Geraldi (1993), Pauliukonis (2011); dos estudos bakhtinianos sobre gêneros discursivos, Bakhtin (2003), Marcuschi (2008), Faraco (2009); da análise do funcionamento das piadas com base em Freud (1996a,1996b, 1996c), Raskin (1985), Travaglia (1989b, 1990, 1995), Possenti (1998, 2000); da sugestão de formação integral de Zabala (1998). A metodologia centra-se na pesquisa qualitativa de cunho bibliográfico e os resultados apontam para uma proposta de aplicação que reconhece a possibilidade de que os textos estudados podem potencializar a reflexão sobre os efeitos de sentido e, com isso, permitir o desenvolvimento de diferentes habilidades linguísticas e discursivas nos alunos.

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