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Familias de T-normas diferenciaveis, funções de pertinencia relacionadas e aplicações

Zanusso, Maria Bernadete January 1997 (has links)
Tese (Doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnologico / Made available in DSpace on 2016-01-08T21:24:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 109896.pdf: 12768831 bytes, checksum: 25ecdab49d31ad24acee84e8d41645f1 (MD5) Previous issue date: 1997 / Proposição de uma família de t-normas e t-conormas diferenciáveis que realizam operações de interseção e união de conjuntos difusos, respectivamente, junto com uma função de pertinência que se relaciona com elas através de sua inversa. Nas aplicações, a diferenciabilidade facilita a dedução do algoritmo da descida do gradiente, tanto para um sistema classificador que gera parâmetros de funções discriminantes como para uma rede neural com múltiplas camadas cujas saídas são graus de pertinência às classes. O relacionamento com a função de pertinência, parece garantir que os dados de entrada e os dados de saída estejam estreitamente relacionados, ainda que seja necessário realizar uma análise matemática mais precisa deste relacionamento, a nível das variações que ocorrem nas escalas de medida dos dados.
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Filogenia de hypoptopomatinae com ênfase em Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis (Siluriformes: Loricariidae), e descrições de duas novas espécies

Calegari, Bárbara January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000427068-Texto+Completo-0.pdf: 8347716 bytes, checksum: 26c36c058e667deb23fc44a8707abd13 (MD5) Previous issue date: 2010 / The Neotropical Loricariidae represents the most diverse catfish family (Order Siluriformes), comprising 716 valid species distributed in 96 genera. For this reason, Loricariidae is also one of the most taxonomic and phylogenetic complex families in the order. Hypoptopomatinae is a subfamily of the Loricariidae that includes above 100 species arranged in 19 genera. These fishes are generally known as "cascudinhos" and most are characterized by the reduced body size. Further on the valid species, Hypoptopomatinae includes a significant portion of undescribed diversity, which has been discovered in the recent past years. Most of these undescribed species are phenotypically similar to Microlepidogaster, Pseudotocinclus or Otothyropsis. In this study we analyzed a data matrix based on phylogenetic studies of previous authors, with the inclusion of 52 ingroup and six outgroup terminals. The analysis was conducted using the heuristic searching algorithm of multiple “Random Addition Sequence (RAS)” followed by branch swapping with “Tree Bissection and Reconnection (TBR)”. We also performed an implied weighting analysis implemented with “Parsimony Ratchet” and with a concavity constant of 3 (K = 3). The analysis of the 60 morphological characters using multiple TBR + TBR resulted in six maximally parsimonious trees of 319 steps, consistency index of 24 and retention index of 64. In the second analysis, conducted with implied weighting, one tree was obtained with fit= 25. 91063. The tree obtained with the weighted analysis had a better resolution than that with equal weighting of characters. The results of both analyses corroborate the monophyly of the Hypoptopomatinae and of the tribe Hypoptopomatini. In addition, the weighted analysis corroborated the monophyly of the tribe Otothyrini. The species of Microlepidogaster, although not found as clade, cluster in close proximity in the trees, indicating the need of a broader characters sampling. The species Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde", and "Tibaji" formed a clade with Otothyropsis marapoama, indicating their generic position as members of Otothyropsis. Pseudotocinclus is included within of a clade also containing Pseudotothyris + Otothyris, and Pseudotocinclus parahybae showing closer proximity to the clade formed by Pseudotohyris + Otothyris than to the other species of Pseudotocinclus. Finally, two new species were recognized and described, belonging the genera Microlepidogaster and Otothyropsis. / Loricariidae é a família mais diversa da Ordem Siluriformes, contendo 716 espécies válidas distribuídas em 96 gêneros. Por este motivo, Loricariidae é também uma das famílias de maior complexidade taxonômica e filogenética dentro da ordem. Hypoptopomatinae é uma subfamília que inclui mais de 100 espécies agrupadas em 19 gêneros. Estes peixes são geralmente conhecidos por “cascudinhos” e a maioria é caracterizada pelo tamanho reduzido. Além das espécies válidas conhecidas, Hypoptopomatinae possui um número significativo de espécies ainda não descritas, que vem sendo descobertas ao longo dos últimos anos. A maioria dessas espécies são fenotipicamente similares a Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis. Foi analisada uma matriz de dados, baseada em estudos filogenéticos de autores prévios, com a inclusão de um total de 58 táxons terminais, sendo 52 considerados como grupo interno e seis como grupo externo. A análise filogenética utilizou o método de busca heurística através de múltiplos “Random Addition Sequences (RAS)” seguida de rearranjos dos ramos "Tree Bissection and Reconnection (TBR)". Também foi realizada uma análise com pesagem implícita de caracteres, implementada com “Parsimony Ratchet”, no programa TNT com uma constante de concavidade igual a 3 (K = 3). A análise de 60 caracteres morfológicos implementada com o algoritmo heurístico de múltiplo TBR + TBR resultou em seis árvores maximamente parcimoniosas com 319 passos, índice de consistência (CI) de 24 e índice de retenção (RI) de 64. Na segunda análise realizada com pesagem implícita foi encontrada uma árvore com fit = 25. 91063. A árvore resultante gerada na análise com pesagem implícita mostrou maior resolução do que aquela obtida na análise com pesos iguais. Os resultados obtidos das duas diferentes análises corroboram a monofilia da subfamília Hypoptopomatinae e da tribo Hypoptopomatini. Além disso, a análise com pesagem implícita encontrou suporte também para tribo Otothyrini. As espécies do gênero Microlepidogaster, apesar de não apresentarem-se como um clado, ocuparam posições sempre próximas entre elas, o que indica a necessidade de uma maior amostragem de caracteres. As espécies Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde" e "Tibaji" foram recuperadas agrupadas em um clado com Otothyropsis marapoama, indicando a alocação destas espécies também dentro desse gênero. Pseudotocinclus ficou agrupado juntamente aos gêneros Pseudotothyris e Otothyris, sendo Pseudotocinclus parahybae mais proximamente relacionado ao clado formado por Pseudotohyris + Otothyris do que as demais espécies de Pseudotocinclus. São reconhecidas e descritas duas novas espécies pertencentes aos gêneros Microlepidogaster e Otothyropsis.
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Diversidade críptica e divergência profunda no tapaculo preto Scytalopus speluncae (Aves: Rhinocryptidae)

Pulido-Santacruz, Paola January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000431115-Texto+Parcial-0.pdf: 40111 bytes, checksum: 341f5e66198379e8e905a199036cafa5 (MD5) Previous issue date: 2011 / The Brazilian Atlantic Forest harbors one of the world´s highest bird species richness, but to date there is a deficient understanding of the spatial patterns of genetic diversity and the evolutionary history of this biome. Here we estimated the phylogenetic and populational history of the wide-spread mouse-colored Tapaculo Scytalopus speluncae complex from 56 localities throughout its range across the Atlantic Forest, using data from two mitochondrial gene sequences (Cyt b and ND2). Our findings uncover at least seven cryptic, allopatric and well-supported lineages within S. speluncae that have originated in Early to Middle Pleistocene. Its phylogeographic pattern is broadly concordant with the hypothesis of more stable and ancient refugia in the northern region. At the same time our results refuted the scenario of non-persistence throughout glacial cycles of southern Atlantic Forest refugia in which they would have been very recently colonized from northern areas. Our results shown cryptic diversification in S. speluncae much higher than could be suspected by phenotypic analysis and suggest the high level of divergence and isolation among some lineages reflect potential species-level differences. The existence of such distinct lineages that could even represent different species suggests that the conservation of these lineages must be accessed in an independent way. / A Mata Atlântica abriga uma das maiores riquezas de espécies de aves do mundo, mas até agora, pouco é conhecido sobre seus padrões espaciais de diversidade genética e sua história evolutiva neste bioma. Utilizando-se de dados de sequências de genes mitocondriais (Cyt b e ND2), foi estimada a história evolutiva e populacional do complexo Scytalopus speluncae de 56 localidades ao longo de toda sua distribuição na Mata Atlântica. Os resultados mostram que S. speluncae é um complexo de pelo menos sete linhagens crípticas, alopátricas e bem suportadas, que se originaram no Pleistoceno Tardio e Médio. O padrão filogeográfico do grupo é amplamente concordante com a hipótese dos refúgios estáveis e antigos da parte norte da Mata Atlântica. Ao mesmo tempo, os resultados refutam o cenário de nãopersistência ao longo dos ciclos glaciais nos refúgios da parte sul, que por este cenário teriam sido colonizados muito recentemente por populações do norte. Além disso, a diversificação em S. speluncae mostrou-se muito maior do que era previsto através de análises fenotípicas, sugerindo um elevado nível de divergência e isolamento entre algumas linhagens. A existência de tais linhagens distintas que podem até representar espécies diferentes, portanto, implica que a conservação de cada linhagem deve ser avaliada de forma independente.
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Uso de rela??es sem?ntico-estruturais no aprimoramento do c?lculo da similaridade sem?ntica : um estudo voltado a estruturas ontol?gicas em l?ngua portuguesa

Brandolt, Josiane Fontoura dos Anjos 09 March 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 416526.pdf: 2208042 bytes, checksum: 26409ec36e39b51edbbc8ac6e980a237 (MD5) Previous issue date: 2009-03-09 / O presente trabalho tem como objetivo estudar alternativas para aprimorar a medida SiSe (Similaridade Sem?ntica), que foi proposta por Freitas [FRE07]. Esta medida visa o mapeamento de termos entre estruturas ontol?gicas distintas, utilizando uma adapta??o do Modelo Taxon?mico de Maedche e Staab [MAE02b] para o c?lculo da similaridade sem?ntica que faz uma compara??o da similaridade entre termos de estruturas ontol?gicas distintas atrav?s da an?lise da hierarquia em que os mesmos se inserem, seus superconceitos e subconceitos. Desta forma, o coeficiente resultante ? a similaridade sem?ntico-estrutural entre os termos das estruturas ontol?gicas. A medida SiSe levou a coeficientes de similaridade considerados relativamente satisfat?rios para o mapeamento sem?ntico-estrutural, por?m n?o atingiu seus objetivos em alguns casos para os quais foi testada. Incluem-se aqui os resultados considerados como falsos positivos e os casos de similaridade que a medida n?o detectou (falsos negativos). Partindo desses problemas, estrat?gias de similaridade estrutural s?o propostas para aprimorar, assim, a medida SiSe. As estrat?gias s?o baseadas, em sua maioria, em trabalhos da literatura que abordam a similaridade estrutural atrav?s de: i) atribui??es de fatores de adequa??o fundamentados na posi??o dos termos na hierarquia da estrutura ontol?gica; ii) atribui??es de conjuntos formados pelos superconceitos dos termos analisados; iii) atribui??es de conjuntos formados pelos subconceitos destes termos e; iv) o uso da medida de Jaccard corrigida. As estrat?gias s?o descritas e avaliadas de acordo com um recurso denominado Golden Mapping e m?tricas mais comumente utilizadas na literatura: precis?o, abrang?ncia e medida-F. Os resultados obtidos chegaram a 100% de acur?cia no que se refere aos falsos positivos da SiSe.
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Sistematiza??o das evid?ncias emp?ricas em desenvolvimento distribu?do de software

Techio, Ant?nio Rafael da Rosa 17 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 462229.pdf: 2509812 bytes, checksum: eb9cb98f480c81a2e0133205abf0d60e (MD5) Previous issue date: 2014-03-17 / Distributed Software Development (DSD) is a recent area and has been growing over the last few years. As a result, a quite number of research and industrial studies have been published. However, due to the large number of terms involved in this scenario, a concept is often used wrongly, making the process of searching for empirical evidence a complex task. The DSD scenarios are diverse and what works in one context might not directly apply in another. Thus it is necessary to understand how DSD related empirical findings should be reported to be useful for practitioners and researchers. Empirical research in DSD could be refined if there was a systematic way to identify the different dimensions and characteristics for which empirical evidence applies. For this reason, the goal of this dissertation is to identify the type of context information that is relevant to researchers and practitioners in studies with empirical evidence and propose a way to systematize the empirical evidence in DSD, in order to contribute, among other things, to the future development of research in the area. For the development of this research we have used both secondary (systematic mapping study) and primary (expert opinion survey) research methods. The main contribution of this research is the taxonomy to systematize the empirical evidences generated from scientific research conducted in the DSD area. / O Desenvolvimento Distribu?do de Software (DDS) ? recente como ?rea de pesquisa e vem crescendo ao longo dos ?ltimos anos. Como resultado, um grande n?mero de pesquisas e estudos na ind?stria foi publicado. No entanto, devido a grande quantidade de termos envolvidos nesse cen?rio, muitas vezes um conceito ? utilizado de forma equivocada, tornando o processo de busca por evid?ncias emp?ricas uma tarefa complexa. Os cen?rios de DDS s?o diversos e o que se aplica em um contexto talvez n?o se aplique diretamente em outro. Dessa forma ? necess?rio entender como os resultados emp?ricos em DDS podem ser relatados para ser ?til para profissionais e pesquisadores desta ?rea. A pesquisa emp?rica na ?rea de DDS poderia ser refinada se houvesse uma maneira sistem?tica para identificar as diferentes dimens?es e caracter?sticas para o qual se aplica a evid?ncia emp?rica. Por esta raz?o, o objetivo desta disserta??o de mestrado ? identificar que tipo de informa??o de contexto ? relevante, para pesquisadores e profissionais da ind?stria, em estudos com evid?ncias emp?ricas e propor uma forma de sistematiza??o das evid?ncias emp?ricas em DDS, visando contribuir, entre outras coisas, com o desenvolvimento de novas pesquisas nesta ?rea. Para o desenvolvimento desta pesquisa utilizou-se m?todos secund?rios (revis?o sistem?tica da literatura, do tipo mapeamento sistem?tico) e prim?rios (survey com especialistas) de pesquisa. Este estudo contribui no sentido de propor uma taxonomia para sistematizar as evid?ncias emp?ricas geradas a partir das pesquisas cient?ficas conduzidas na ?rea de DDS.
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Revis?o taxon?mica de Dorisiana METCALF, 1952 (Hemiptera, Auchenorrhyncha, Cicadidae, Cicadinae, Fidicinini)

Ruschel , Tatiana Petersen 22 March 2015 (has links)
Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-05-26T11:51:28Z No. of bitstreams: 1 469145 Texto Completo.pdf: 7532257 bytes, checksum: 3edfcf4b53ba804d0a33894959a8c48e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-26T11:51:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 469145 Texto Completo.pdf: 7532257 bytes, checksum: 3edfcf4b53ba804d0a33894959a8c48e (MD5) Previous issue date: 2015-03-22 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The members of Cicadidae are insects popularly known as cicadas, easily recognized in your environment because of male singing. Cicadoidea is currently divided into Tettigarctidae and Cicadidae, and this into three subfamilies: Cicadinae, Cicadettinae and Tibicininae. Cicadinae has many neotropical tribes, Fidicinini, one of the most representative, is divided into Fidicinina and Guyalnina and has 16 genera. Into Fidicinina, Fidicina and Fidicinoides are the ones with highest number of described species and none of the other genera of the tribe has a taxomic revision, being absent publications that establish characters to distinguish them. Into Guyalnina, Dorisiana has economic importance as pest of coffee and also taxonomic problems, besides the lack of morphological characters needed for its determination, which is increased by the lack of a review covering all genera present in the tribe. The general goal of this work was execute the taxonomic revision of Dorisiana species improving the knowledge about the taxon, with the specific objective to analyze the morphology of the genus from deposited specimens of collections of national and international institutions; describe the morphological species, including photographs and ilustrations, mostly of the male genitalia; produce a pictorial dichotomous key to distinguish the Dorisiana species. Therefore, of the 16 species of the genus, previously known, four were synonymized, two new combinations and two new species were described, totaling 16 valid species, covered in the pictorial dichotomous key.From these results and studies that led to it, is perceived a great lack of group by works that delimit characters needed for your determination, for genus and species, which is also shared by others neotropical tribes. Starting of these assumptions suggested in the future more studies on characters for a cladistics analysis of the Dorisiana species and the continuity of the studies with the members of the tribe to establish reliable characters in recognition of evolutionary lineages. / Os cidad?deos s?o insetos conhecidos popularmente como cigarras, sendo facilmente reconhecidos no seu ambiente devido ao som emitido pelos machos. Cicadoidea se encontra atualmente dividida em Tettigarctidae e Cicadidae e, esta ?ltima em tr?s subfam?lias: Cicadinae, Cicadettinae e Tibicininae. Cicadinae comporta muitas tribos neotropicais, sendo uma das mais representativas Fidicinini, subdividida em Fidicinina e Guyalnina e contendo 16 g?neros. Em Fidicinina, Fidicina e Fidicinoides s?o os ?nicos que apresentam maior n?mero de esp?cies descritas e nenhum dos demais g?neros da tribo possui uma revis?o tax?mica, sendo ausentes publica??es que estabele?am caracteres para distingui-los. Dentro de Guyalnina, Dorisiana apresenta import?ncia econ?mica como praga do cafeeiro e tamb?m problemas taxon?micos, al?m da car?ncia de caracteres morfol?gicos necess?rios para sua determina??o, o que ? acrescido pela falta de uma revis?o que contemple todos os g?neros presentes na tribo. O objetivo geral desse trabalho foi realizar a revis?o taxon?mica das esp?cies de Dorisiana aprimorando os conhecimentos acerca do t?xon, tendo como objetivos espec?ficos analisar a morfologia das esp?cies do g?nero a partir de exemplares depositados em cole??es de institui??es nacionais e estrangeiras; descrever as esp?cies morfologicamente, incluindo fotografias e desenhos, principalmente das pe?as da genit?lia do macho; produzir uma chave dicot?mica pict?rica para determina??o das esp?cies. Para isso, a partir da an?lise dos exemplares encontrados nas cole??es nacionais e pelo envio de fotografias de material das institui??es estrangeiras, foi realizado o estudo morfol?gico dos esp?cimes e ilustra??es das principais estruturas para a distin??o das esp?cies de Dorisiana.Dessa forma, das 16 esp?cies do g?nero anteriormente conhecidas, quatro foram sinonimizadas, duas novas combina??es e duas novas esp?cies foram descritas, totalizando 16 v?lidas contempladas na chave dicot?mica pict?rica. A partir desses resultados, e dos estudos que levaram a ele, percebe-se uma grande car?ncia do grupo por trabalhos que delimitem caracteres necess?rios para a sua determina??o, tanto em n?vel de g?nero quanto de esp?cie, o que tamb?m ? compartilhado por outras tribos da regi?o neotropical. Partindo-se desse presuposto, sugere-se no futuro o levantamento de mais caracteres objetivando uma an?lise clad?stica de Dorisiana e a continuidade dos estudos com representantes da tribo para se estabelecer caracteres confi?veis no reconhecimento de linhagens evolutivas.
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Filogenia de hypoptopomatinae com ?nfase em Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis (Siluriformes: Loricariidae), e descri??es de duas novas esp?cies

Calegari, B?rbara 17 August 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 427068.pdf: 8347716 bytes, checksum: 26c36c058e667deb23fc44a8707abd13 (MD5) Previous issue date: 2010-08-17 / Loricariidae ? a fam?lia mais diversa da Ordem Siluriformes, contendo 716 esp?cies v?lidas distribu?das em 96 g?neros. Por este motivo, Loricariidae ? tamb?m uma das fam?lias de maior complexidade taxon?mica e filogen?tica dentro da ordem. Hypoptopomatinae ? uma subfam?lia que inclui mais de 100 esp?cies agrupadas em 19 g?neros. Estes peixes s?o geralmente conhecidos por cascudinhos e a maioria ? caracterizada pelo tamanho reduzido. Al?m das esp?cies v?lidas conhecidas, Hypoptopomatinae possui um n?mero significativo de esp?cies ainda n?o descritas, que vem sendo descobertas ao longo dos ?ltimos anos. A maioria dessas esp?cies s?o fenotipicamente similares a Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis. Foi analisada uma matriz de dados, baseada em estudos filogen?ticos de autores pr?vios, com a inclus?o de um total de 58 t?xons terminais, sendo 52 considerados como grupo interno e seis como grupo externo. A an?lise filogen?tica utilizou o m?todo de busca heur?stica atrav?s de m?ltiplos Random Addition Sequences (RAS) seguida de rearranjos dos ramos "Tree Bissection and Reconnection (TBR)". Tamb?m foi realizada uma an?lise com pesagem impl?cita de caracteres, implementada com Parsimony Ratchet, no programa TNT com uma constante de concavidade igual a 3 (K = 3). A an?lise de 60 caracteres morfol?gicos implementada com o algoritmo heur?stico de m?ltiplo TBR + TBR resultou em seis ?rvores maximamente parcimoniosas com 319 passos, ?ndice de consist?ncia (CI) de 24 e ?ndice de reten??o (RI) de 64. Na segunda an?lise realizada com pesagem impl?cita foi encontrada uma ?rvore com fit = 25.91063. A ?rvore resultante gerada na an?lise com pesagem impl?cita mostrou maior resolu??o do que aquela obtida na an?lise com pesos iguais. Os resultados obtidos das duas diferentes an?lises corroboram a monofilia da subfam?lia Hypoptopomatinae e da tribo Hypoptopomatini. Al?m disso, a an?lise com pesagem impl?cita encontrou suporte tamb?m para tribo Otothyrini. As esp?cies do g?nero Microlepidogaster, apesar de n?o apresentarem-se como um clado, ocuparam posi??es sempre pr?ximas entre elas, o que indica a necessidade de uma maior amostragem de caracteres. As esp?cies Otothyropsis "LG2", O. "Canoinhas", "Rio Verde" e "Tibaji" foram recuperadas agrupadas em um clado com Otothyropsis marapoama, indicando a aloca??o destas esp?cies tamb?m dentro desse g?nero. Pseudotocinclus ficou agrupado juntamente aos g?neros Pseudotothyris e Otothyris, sendo Pseudotocinclus parahybae mais proximamente relacionado ao clado formado por Pseudotohyris + Otothyris do que as demais esp?cies de Pseudotocinclus. S?o reconhecidas e descritas duas novas esp?cies pertencentes aos g?neros Microlepidogaster e Otothyropsis.
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Filogeografia do Bugio Ruivo, Alouatta guariba (Primates, Atelidae)

Machado, Stela 22 March 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431415.pdf: 691621 bytes, checksum: 3caf932319c0f5de98667c470961c43e (MD5) Previous issue date: 2011-03-22 / N?s examinamos a diversidade gen?tica do DNA mitocondrial (regi?o controle e gene citocromo b) e locos de microssat?lites do primata do Novo Mundo, end?mico da Mata Atl?ntica, Alouatta guariba, para descobrir a sua estrutura??o gen?tica e hist?ria evolutiva bem como seu status taxon?mico. A filogenia mitocondrial mostra uma profunda diverg?ncia entre o clado A (sul de Santa Catarina) e a parte norte da distribui??o e um segundo grupo divergente entre o clado B (Rio de Janeiro), mais central, e o clado C(Esp?rito Santo) mais ao norte, embora a popula??o de S?o Paulo apresente hapl?tipos nos tr?s clados com 16 de 102 indiv?duos presentes no clado A, 11 de 16 no clado B e 14 de 32 no clado C. O tempo de diverg?ncia estimado entre os clados A e B/C foi de aproximadamente 750 mil anos atr?s e entre os clados B e C foi de aproximadamente 600 mil anos atr?s. Em concord?ncia com os resultados do DNA mitocondrial, os dados de microssat?lites mostram um claro isolamento das ?reas sul e central+norte. Portanto, nossos dados consistentemente refutam a hip?tese de uma subesp?cie ou esp?cie ao norte separada da central+sul (A. g. clamitans). Entretanto embora os dois grupos isolados identificados aqui certamente mere?am apropriadas estrat?gias de conserva??o, a aus?ncia de: completa concord?ncia entre dos dados de DNA mitocondrial e microssat?lites, rec?proca monofilia no DNA mitocondrial e claro caracteres n?o gen?ticos aconselham contra elevar ao status de esp?cie ou subesp?cie. A an?lise de "Bayesian Skyride plot" mostrou que A. guariba sofreu uma expans?o populacional h? aproximadamente 50.000 anos atr?s seguida por uma recente redu??o do tamanho populacional a 7.500 anos. Esta expans?o foi somente observada no clado A. Esta flutua??o no tamanho populacional pode ter ocorrido devido a mudan?as clim?ticas ou competi??o com A. caraya devido a alta sobreposi??o de nicho destas esp?cies
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Taxonomia e filogenia das esp?cies de Dasyloricaria Isbr?cker & Nijssen, 1979 (Siluriformes: loricariidae)

Burbano, Alejandro Londo?o 24 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438126.pdf: 8216166 bytes, checksum: 09a1819f75864391af4634c2bb50e051 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / A taxonomic revision and phylogenetic analysis of the genus Dasyloricaria were performed. This group belongs to the catfish family Loricariidae, subfamily Loricariinae and its distribution is strictly Trans Andean. Within the loricariines, individuais in Das yloricar?a can reach more than 20 cm of Standard Length. The taxonomic revision was based on 142 specimens of the main river basins of Colombia, Venezuela and Panama, from which were obtained rneasurements and counts. In this study are proposed as valid the species Dasylor?car?a jilarnentosa (Steindachner) from the upper, middie and lower Magdaiena River, lower Cauca River and Sin? River basin in Colombia, and the Maracaibo Lake basin m Venezuela, and Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) from the Atrato River basin in Colombia and Tuyra River basin m Panama, as well as a description of a new species, Dasyloricaria n. sp., from the middie and upper portions of the Magdaiena River, Coiombia. Redescriptions of the previousiy described species and the description of the new species are presented, including diagnosis, color in alcohol, distribution, sexual dimorphism, comments on each species, and an identification key of the species. After the taxonomic revision, a phylogenetic analysis was conducted based on 187 morphological characters (osteology and extemal morphology) and 23 terminal taxa. Species belonging to five subfamilies of the Loricariidae were included: Dasyloricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria n. sp, Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, Spatuloricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. clavipinna, Pseudoloricaria sp., Pseudoherniodon sp., Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarformis, Siurisorna rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostomus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostominae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomatmae), Neoplecostomus microps (Neoplecostominae), and Delturus brevis (Delturinae). Were obtained three equaily most parsimonious trees of 1006 steps each, consistency index of 0.34 and retention index of 0.52. Dasyloricaria was recovered as a monophyletic unit, presenting nine unique synapomorphies. Spatuloricaria is proposed as the sister group of Dasyioricaria. This ciade is supported by tbree unique synapomorphies, and was observed to be the most derived clade within the analysis. Rineloricariina sensu Isbr?cker was not recovered as inonophyletic. Relationships between Rineloricaria and (Spatuloricaria + Dasyloricaria) vere not resolved, even when they were found related within the analysis. Harttiini is found as monophyletic, including the genera Harttia and Sturisoma. Also, both Loricariini and Loricariinae are recovered as monophyletic. / Foram realizadas a revis?o taxon?mica e uma an?lise filogen?tica do g?nero Dasyloricaria. Este grupo de cascudos pertence ? fam?lia Loricariidae, subfam?lia Loricariinae e a sua distribui??o ? estritamente Transandina. Dentro dos loricarineos, em Das yloricaria se encontram indiv?duos que podem atingir mais de 20 cm de Comprimento Padr?o. A revis?o taxon?mica foi baseada em 142 exemplares das principais bacias da Col?mbia, Venezuela e Panam?, dos quais foram obtidas medidas e contagens. S?o propostas como v?lidas as esp?cies Dasyioncaria Jilamentosa (Steindachner) das por??es alta, m?dia e baixa do rio Magdalena, baixo rio Cauca e bacia do rio Sin? na Col?mbia, e bacia do lago de Maracaibo na Venezuela, e Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) da bacia do rio Atrato na Col?mbia e bacia do rio Tuira no Panam?, al?m da descri??o de urna nova esp?cie, Dasyloricaria sp, nov., da por??o m?dia e alta do rio Magdalena, na Col?mbia. Foram realizadas as redescri??es das esp?cies previamente descritas e a descri??o da nova esp?cie, assim como diagnoses, colora??o no ?lcool, distribui??o, dimorfismo sexual, coment?rios em cada uma delas e uma chave de identifica??o das esp?cies. Posterior ? revis?o taxon?mica, uma an?lise filogen?tica foi realizada. Esta an?lise foi conduzida a partir de 187 caracteres morfol?gicos (osteologia e morfologia externa) e 23 t?xons terminais. Foram incluidas esp?cies pertencentes a cinco subfam?lias de Loricariidae: Das loricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria sp. nov., Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, Spatu?oricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. ciavipinna, Pseudo?oricaria sp., Pseudoherniodon sp., Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarfrmis, Sturisoma rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostornus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostorninae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomat?nae), Neoplecostomus rnicrops (Neoplecostominae) e Delturus brevis (Delturinae). Foram obtidas tr?s ?rvores igualmente parcimoniosas de 1006 passos, ?ndice de consist?ncia de 0,34 e ?ndice de reten??o de 0,52. Dasyloricaria foi recuperado corno um grupo monofiletico apresentando nove s?napomorfias exclusivas. Spatuloricaria ? proposto ser o grupo irm?o de Dasyloricaria. Este dado ? suportado por tr?s smapomorfias exclusivas, e ? observado ser o agrupamento mais derivado dentro da an?lise. Rineloricarima sensu Isbr?cker n?o foi recuperado como monofil?tico. As rela??es entre Rineloricaria e (Spatuloricaria + Dasylor?caria) n?o foram resolvidas, ainda quando foram achados pr?ximos na an?lise. Harttiini foi encontrada monofiletica, incluindo os g?neros Harttia e Sturisoma. Igualmente, tanto Loricariini, como Loricariinae s?o recuperadas como monofil?ticas.
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Revis?o do g?nero Galictis (Mammalia, Carnivora, Mustelidae) utilizando m?todos morfol?gicos e moleculares

Bornholdt, Renata 23 March 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438122.pdf: 3145728 bytes, checksum: b418ed52b6536be2e9efb41f6b7dc59b (MD5) Previous issue date: 2012-03-23 / Taxonomy forms the basis for all biological sciences, since it is through this discipline that natural units are recognized and described. Without the correct delimitation, researches from other disciplines would be unable to report their results because they would not be sure about the identity of their study units. The current estimate that millions of species are still to be described reinforces the centrality of taxonomy, because is through its use that species are found, delimited and described. Carnivores are usually thought to be well-known mammals, but some of these taxa have not been described yet, while others have received little biogeographic and taxonomic attention, preventing a correct assessment of their richness and conservation status. The genus Galictis (Carnivora, Mustelidae) is an example of a little-studied mustelid from the Neotropics, one of the richest and most endangered regions of the world. Basic information, such as number of species, delimitation between them, diagnosis and geographic distribution, have never been thoroughly tested before, leading to uncertainties regarding the taxonomy of this genus. In order to perform a comprehensive revision of Galictis, morphological and molecular approaches were applied on the basis of records encompassing all the distribution of the genus. For the former approach, we analyzed skulls and skins from 22 zoological collections and the statistical tests showed the presence of two clusters of Galictis specimens, representing G. cuja and G. vittata. Phylogenetic analyses of mitochondrial and nuclear segments supported morphological results showing two monophyletic groups, corresponding again to G. cuja and G. vittata. No other morphological grouping or evidence of a third clade was recognized with our data. All these results corroborate the existence of only two species and indicate morphological characters that effectively diagnose them. These are very useful to identify museum specimens and should also help field-based work in some situations. The correct delimitation between these units allowed the investigation of some long-standing issues about the geographic distribution of Galictis species. For example, we demonstrate the exclusive presence of G. cuja in the northeastern region of Brazil, and established the southernmost limits of G. vittata in the Amazon basin. Finally, as species were well identified and characterized, it was possible to conduct phylogeographic inferences as well as analyses of intra-specific morphological variation in G. cuja. This species contains moderate to high levels of variability and some interesting geographic patterns. These included the morphological distinction of southern Chile and Argentina, the significant genetic structuring among three broad geographic domains, and the evidence of recent demographic expansion in the Brazilian southeast. The results presented here contribute to substantially enhance our knowledge on the genus Galictis, and should help enable further studies focusing on the evolutionary history of these carnivores in the Neotropics. / A taxonomia forma a base para todas as demais ci?ncias da Biologia, uma vez que ? atrav?s dessa disciplina que as unidades de vida na natureza s?o reconhecidas e descritas. Sem a correta delimita??o das esp?cies, pesquisas de outras ?reas n?o poderiam reportar seus resultados, pois n?o teriam a certeza da identifica??o das unidades de estudo. A estimativa de que existem milh?es de esp?cies ainda para serem descritas refor?a a import?ncia da taxonomia, pois ? utilizando as ferramentas dessa disciplina que as esp?cies s?o descobertas, delineadas e descritas. Mam?feros carn?voros s?o animais tidos como bem conhecidos; contudo, alguns t?xons desse grupo ainda n?o foram descritos e tantos outros receberam pouca aten??o biogeogr?fica e taxon?mica, impedindo estimativas corretas de riqueza, abund?ncia e status de conserva??o. O g?nero Galictis (Mustelidae, Carnivora) ? um exemplo de t?xon ainda pouco estudado na regi?o Neotropical, justamente uma das mais ricas e mais amea?adas regi?es do mundo. Informa??es b?sicas sobre esses mustel?deos, tais como n?mero exato de esp?cies, delimita??o entre elas, diagnose e distribui??o geogr?fica das mesmas, n?o foram ainda investigadas com rigor, o que acarreta incertezas sobre alguns t?picos e compromete a sua taxonomia. Para realizar uma revis?o taxon?mica ampla de Galictis, foram realizadas an?lises morfol?gicas e moleculares com base em registros provenientes de toda a distribui??o geogr?fica do g?nero. Para a primeira t?cnica, foram analisados cr?nios e peles tombados em 22 institui??es cient?ficas, e os testes morfol?gicos assim como a visualiza??o das peles evidenciaram a presen?a de dois conjuntos de esp?cimes de Galictis, representando as duas esp?cies usualmente reconhecidas, G. cuja e G. vittata. An?lises filogen?ticas com base em segmentos mitocondriais e nucleares corroboraram os resultados morfol?gicos, com a presen?a de dois clados bem apoiados que correspondem tamb?m a G. cuja e G. vittata. Nenhum outro agrupamento morfol?gico ou mesmo ind?cios de um terceiro clado no g?nero foi identificado. Esses resultados confirmam a exist?ncia de duas esp?cies e possibilitam o reconhecimento de caracteres morfol?gicos diagn?sticos para elas. Esses caracteres s?o de utilidade para a identifica??o de esp?cimes de museu e podem tamb?m auxiliar a identifica??o de indiv?duos na natureza. Com o correto delineamento das esp?cies, foi poss?vel definir a distribui??o geogr?fica das mesmas e resolver algumas quest?es atualmente controversas, como a defini??o da ocorr?ncia exclusiva de G. cuja na regi?o Nordeste do Brasil e o limite austral de G. vittata para a Bacia Amaz?nia. Por fim, a partir da defini??o confi?vel e robusta das esp?cies, obtida na primeira etapa desta tese, foi poss?vel realizar um estudo intra-espec?fico mais detalhado com foco em G. cuja, englobando an?lises filogeogr?ficas de marcadores moleculares, bem como varia??o morfol?gica ao longo de sua distribui??o. Essa esp?cie se caracteriza de forma geral por consider?vel variabilidade gen?tica e morfol?gica, em que se observam alguns padr?es geogr?ficos interessantes. Entre estes, pode-se destacar a diferencia??o morfol?gica de popula??es do Sul do Chile e Argentina, bem como, uma estrutura??o gen?tica significativa entre tr?s grandes dom?nios geogr?ficos, e evid?ncia de uma expans?o demogr?fica relativamente recente no sudeste brasileiro. Todos esses resultados embasam o conhecimento sobre o g?nero e propiciam ferramentas para estudos futuros que visem a entender a hist?ria evolutiva de Galictis na regi?o Neotropical.

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