Orientador: Helenice Bosco de Oliveira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T14:44:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sinkoc_VeronicaMaria_M.pdf: 2765446 bytes, checksum: 1e087ff6d8e23a0f150c621123e6b8ca (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Existe consenso de que a pandemia do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) desencadeou um aumento na incidência da tuberculose. Por outro lado, a tuberculose diminui a sobrevida de pessoas com HIV. Este estudo teve por objetivo descrever aspectos epidemiológicos, a apresentação clínica, diagnóstico e evolução de pacientes com co-infecção tuberculose-HIV . Foi realizado estudo descritivo de pacientes adultos com tuberculose, notificados em 1998, pelo Núcleo de Vigilância Epidemiológica do Hospital de Clínicas da Universidade Estadual de Campinas, que apresentavam sorologia positiva para o HIV. Foram incluídos pacientes com 13 anos de idade ou mais. Noventa e oito pacientes foram estudados. A relação masculino/feminino foi de 2,6/1, sendo que as mulheres eram mais jovens e com menos escolaridade que os homens. Houve referência de drogadição por 54,8% dos pacientes e etilismo por 57,3%. A exposição anterior a doentes de tuberculose aconteceu em 43,9%. O diagnóstico de infecção pelo HIV foi simultâneo ao de tuberculose em 31,6% e a tuberculose foi a doença definidora de AIDS em 46,9% dos pacientes. O diagnóstico de infecção pelo HIV simultâneo à tuberculose esteve relacionado à hospitalização, enquanto o uso de drogas esteve relacionado ao diagnóstico prévio de infecção pelo HIV. A média e mediana de contagem de linfócitos T CD4 foram respectivamente 187 e 111 cel/mm3 no momento do diagnóstico da tuberculose. A apresentação clínica pulmonar isolada aconteceu em 39,8%, a extrapulmonar em 30,6% e associação de ambas em 29,6%. O diagnóstico de tuberculose foi realizado com base na presença de bacilo álcool-ácido resistente ou M. tuberculosis em 65,3% e exames que sugeriam tuberculose em 34,7% dos pacientes estudados. A internação por ocasião do diagnóstico de tuberculose aconteceu em 53,1%. A evolução dos casos foi de cura em 35,7%, abandono 21,4%, óbito 32,7% e transferência, 10,2%. Ao comparar cura e óbito, a hospitalização possibilitou 7,3 vezes mais chance de óbito. Estes dados mostram a gravidade da tuberculose em pacientes com HIV. Estratégias para realizar diagnóstico precoce do HIV devem ser implementadas na população, favorecendo a aplicação de profilaxia para tuberculose e o controle da imunossupressão através de terapia anti-retroviral / Abstract: There is a consensus that the Human Immunodeficiency Virus (HIV) pandemia elevated the incidence of tuberculosis. On the other hand, tuberculosis reduces the survival rate of individuals with HIV. The objective of this study was to describe epidemiological aspects as well as the clinical, diagnostic and evolutional presentation of patients co-infected with HIV-tuberculosis. A descriptive study was conducted on adult tuberculous patients who presented seropositive HIV. These patients were reported in 1998 by the Epidemiological Surveillance Group, Clinical Hospital, State University of Campinas (UNICAMP). The study sample consisted of 98 patients whose ages were 13 years and above. The male/female ratio was 2.6:1. The women were younger than the men and had lower educational levels. Drug addiction was reported by 54.8% of the patients and 57.3% reported alcoholism. Previous exposure to tuberculosis had occurred in 43.9% of the patients. HIV and tuberculosis were diagnosed simultaneously in 31.6% and tuberculosis was the defining AIDS disease in 46.9% of the patients. The simultaneous diagnosis of HIV and tuberculosis was related to hospitalization while the use of drug was related to a previous diagnosis of HIV infection. The mean and median T CD4 lymphocytic counts at diagnosis of tuberculosis were 187 and 111 cells/mm3, respectively. The isolated pulmonary clinical presentation occurred in 39.8%, extrapulmonary in 30.6% and an association of both in 29.6%. Tuberculosis was diagnosed in 65.3% based on the presence of the Acid-Fast Bacilli (AFB) or the M. tuberculosis and by examinations that indicated 34.7%. After a diagnosis of tuberculosis, hospitalization occurred in 53.1%. The percentage of cases that evolved with a cure was 35.7%, 21.4% abandoned, 32.7% died and 10.2% were transferred. When cure was compared with death rate, it revealed that hospitalizations increased by 7.3 fold the chances of death. These data demonstrate the severity of tuberculosis in HIV patients. Strategies for early HIV diagnosis should be implemented so that tuberculosis can be prophylactically treated and immunossupression controlled with the antiretroviral therapy / Mestrado / Saude Coletiva / Mestre em Saude Coletiva

Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:04:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Calusni_AnaLuciaRoscani_D.pdf: 14978312 bytes, checksum: fabcaa4f8e5f09a9656a39cfb1bb7020 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: A tuberculose é um importante problema de saúde pública no Brasil e no mundo e a síndrome da imunodeficiência adquirida (aids) tem um papel importante no agravamento deste quadro. Estima-se que existam de 35 a 45 milhões de pessoas infectadas pelo Mycobacterium tuberculosis no Brasil; este grande número de casos vem despertando o interesse em se investigar melhor a epidemiologia da doença. Esta investigação tem como ferramenta importante as técnicas de biologia molecular, que estão sendo cada vez mais utilizadas. A técnica melhor padronizada e mais utilizada é o RFLP com a 1S6110, por meio da qual podemos demonstrar o número e as posições das seqüências de inserção 1S6110 no cromossomo do Mycobacterium tuberculosis. As amostras foram isoladas de pacientes portadores de tuberculose pulmonar, atendidos no Hospital das Clínicas da Unicamp, no período de janeiro de 1996 a março de 1999. Foram estudados 76 pacientes, a maioria do sexo masculino, com faixa etária entre 20 e 40 anos. O DNA cromossômico das cepas foi obtido através da técnica de extração internacionalmente padronizada. Após análise dos padrões de bandas obtidos e comparação dos dados com um banco internacional, cinqüenta e nove isolados revelaram perfil genotípico único, enquanto que outros dezessete foram agrupados em conglomerados distintos. Dez pacientes foram agrupados em conglomerados arbitrariamente designados como se segue: padrão "BE" com 2 pacientes, padrão "BF" com 6 pacientes, padrão "BH" com 2 pacientes e um padrão "AK", descrito em uma contaminação laboratoriaL em um paciente. Nos seis pacientes restantes, foram encontrados padrões anteriormente descritos por um grupo de Houston (EUA), que são: padrão"137" encontrado em Houston com 3 pacientes; padrão "Z" encontrado em EI Paso e Juarez com 1 paciente e padrão "AZ" encontrado em Nova York com 2 isolados. O fato de utilizar uma técnica padronizada por vários centros de pesquisa possibilita a comparação dos padrões obtidos e assim confirmar a transmissão global da tuberculose / Abstract: Tuberculosis is a major concem in developing countries. The contribution of genotyping techniques to trace epidemiological chains is remarkable, IS 6110RFLP being the preferred typing method. AIDS epidemics has had a major impact on the incidence of tuberculosis. Not so many genotyping studies have been made in Brazil in order to check for the number of IS6110 present in local strains of M tuberculosis, as well as the distribution and clustering ofM tuberculosis strains. We performed DNA finger printing using Restriction-Fragment-Length-Polymorphism (RFLP) analysis of at least one isolate from every patient with positive AFB smear, confirmed pulmonary tuberculosis at a major hospital in Campinas, São Paulo, Brazil from January 1996 through July 1999. All fmgerprints were analyzed using proper software, and compared to an international database from the Institute for the Study of Human Bacterial Pathogenesis, Department of Pathology, Baylor College of Medicine. Medical records were reviewed for relevant clinical data. During the study period, 98 patients were included, yelding 76 fingerprints. All M tuberculosis strains had an adequate number of IS6110 (5-21) for the analysis. HIV infection was confirmed in nearly half the patients when it was available. 58 strains exhibited unique patterns whereas 17 others could be grouped in 7 clusters (2 to 6 strains in each cluster). When compared to the mentioned database, 6 strains matched the same genotype from strains originated from El Passo, Juarez, Houston, and New York. Some clustered strains could be recovered during almost all the study period. M tuberculosis strains recovered from patients in Brazil can be genotyped using IS6110 RFLP, since they harbor an adequate number of such sequences. Recently acquired infections could be documented in 19% of cases since the strains could be clustered. The transmission of infection is intense, since some of clustered strains could be recovered during all the study period. The global dissemination of M tuberculosis strains could be evidenced by demonstration of identical fingerprints occurring in a distant country / Doutorado / Ciencias Basicas / Mestre em Ciências Médicas

Orientadores: Maria Cecilia Barisson Vilares, Marcelo de Carvalho Ramos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T20:36:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pavan_EricaMary_M.pdf: 4511784 bytes, checksum: f18e2ccff3e501d32cd9bb36915d1074 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: A isoniazida, a rifampicina e a pirazinarnida, têm sido utilizadas no tratamento da Tuberculose em muitos países, inclusive no Brasil. A resistência das cepas de Mycobacterium tuberculosis aos antibióticos tem resultado em falência do tratamento e aumento do custo para o sistema de saúde. As Mycobacterium tuberculosis resistentes às drogas de primeira linha tem emergido e estas tem sido reportadas mundialmente. Nas mutações no gene rpo? têm se evidenciado o mecanismo de resistência prevalente das cepas de Mycobacterium tuberculosis resistentes à rifampicina. A fim de caracterizar as bases genéticas da resistência às drogas, do Mycobacterium tuberculosis, foram analisadas mutações envolvendo a resistência à rifampicina utilizando os métodos SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) e sequenciamento. As cepas de MTB (Mycobacterium tuberculosis) foram genotipadas e avaliadas quanto à suscetibilidade a rifampicina. Como resultado, foram encontradas 13 cepas sensíveis a rifampicina e 65 resistentes. O DNA genômico foi obtido de cada cepa e um fragmento constando de 157pb do gene rpo? foi amplificado, submetido ao SSCP e ao sequenciamento. As mutações identificadas pertenciam a região do gene rpo? entre o códon 511 e 533. A S531L (44%) foi a mutação de maior prevalência, seguida das mutações H526D (21%), H526Y (3%), L533P (3%), D516V (3%) e a inserção Phe514 e Met515 (3%) / Abstract: Isoniazid, rifampin, and pyrazinamide, have been used as the standard treatment for tuberculosis in many countries, including Brazil. Antimicrobial resistance among Mycobacterium tuberculosis strains results in increased morbidity, mortality and costs of health care. Control of tuberculosis is thus threatened by widespread emergence of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis as reported worldwide. Mutations in the rpo? gene seems to be the most prevalent mechanism involved in rifampin resistance among M. tuberculosis strains. To characterize the genetic basis of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Brazil, mutations involved in rifampin resistance were detected using single strand conformation polymorphism (SSCP) and sequencing studies. A sample consisting of 73 isoniazid resistant and 5 isoniazid sensitive isolates recovered from August, 1999 through September, 2000 was screened for susceptibility to rifampin. As a result, 13 susceptible, and 65 resistant strains were detected. Genomic DNA was obtained from each isolate, and a fragment consisting of 157 bp of the rpo? gene was amplified, and submitted to SSCP and sequencing studies. Mutations involving codon 511 through codon 533 were identified. S531L (44%) was the most prevalent mutation found, followed by H526D (21%), and H526Y, L533P, D516V, Ins Phe514, Met515 (3% each). Our study corroborates previous studies done in Brazil which identified S531L as the most prevalent mutation, and several other mutations on the same gene segment (codon 511 through 533) / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo7888_1.pdf: 1257567 bytes, checksum: 36ff727af3cc6070f75599a020b1eaac (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / A persistência de tuberculose como um dos principais problemas de saúde pública, resulta além das precárias condições de vida e do elevado aumento da aglomeração urbana, da ausência de um bom programa de controle. A natureza crônica da tuberculose e a demora no diagnóstico e tratamento contribuem para um período prolongado de infecciosidade na comunidade. Neste contexto realizou-se um estudo caso-controle aninhado a uma coorte de 1114 doentes com tuberculose pulmonar, residentes no município de Recife, diagnosticados e tratados nos serviços de saúde dos SUS, desse município de maio/2001 a maio/2003. Teve-se como objetivo analisar a associação entre fatores biológicos, sócio-econômicos, clínicos além dos relacionados ao acesso aos serviços de saúde, com a demora para o início de tratamento de tuberculose pulmonar no município de Recife no período acima referido A variável dependente do estudo é a demora para o início do tratamento, conceituada como o tempo desde o início dos sintomas da tuberculose até o início do tratamento. Para efeito do presente estudo, considerou-se caso suspeito de tuberculose todo indivíduo que apresenta tosse há três ou mais semanas segundo o manual do Ministério da Saúde. Considerou-se como uma demora aceitável até aos sessenta dias, entre o início dos sintomas e o início do tratamento, e uma demora não aceitável um intervalo maior do que sessenta dias. Os resultados do estudo sugerem que o desemprego, tabagismo e a baciloscopia positiva estiveram associados à demora para o início do tratamento para tuberculose pulmonar. Houve uma associação negativa entre a perda de peso e a demora do tratamento

Orientador: Nelson Eduardo Duran Caballero / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-25T20:05:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_AnaOliviade_D.pdf: 2904177 bytes, checksum: e13a5d68aeaa9093e4e94b4fe739a51b (MD5) Previous issue date: 1999 / Doutorado

Orientador : Antonio Sergio Ramalho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T04:54:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Garlipp_CeliaRegina_M.pdf: 756829 bytes, checksum: 801a7f9cd095d71b5137fb35db4bd3ca (MD5) Previous issue date: 1980 / Resumo: o fenótipo acetilador da isoniazida (INH) foi investigado em 88 paulistas descendentes não miscigenados de japoneses internados para tratamento de tuberculose em sa-natórios de Campos do Jordão, SP. Foi utilizada uma modificação da técnica laboratorial recomendada por EIDUS e co1. (1973) e HODGKIN e col.(1974), investigando-se o percentual de acetilisoniazida presente na urina 10 horas após a ingestão de 10 mg de INH por kg de peso corporal.Os resultados obtidos permitiram estimar a freqüência de acetiladores lentos da isoniazida entre os paulistas descendentes não miscigenados de japoneses em, aproximadamente, 10%. Essa freqüência é muito semelhante a obser-vada por SUNAHARA e colo (1961b) no Japão / Mestrado / Mestre em Biologia Vegetal

La tuberculose, maladie très ancienne, est plus que jamais présentée sur la scène sanitaire mondiale avec 9 millions de nouveaux cas par an. Cette maladie, qui demeure une cause majeure de mortalité, est un des problèmes les plus difficiles à résoudre en santé publique et à échelle internationale. Les diverses programmes de lutte, lancés par l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), pour prévenir et garantir la guérison des patients tuberculeux, se heurtent à des difficultés qui hypothèquent leur efficacité. En effet, l'expansion du virus de rinimunodéficience humaine (VIII) et son influence néfaste sur la susceptibilité à la tuberculose, l'accroissement rapide de la tuberculose multirésistante, la pauvreté ainsi que la croissance démographique, sont un ensemble de facteurs préjudiciables à l'application des mesures préventives et curatives. Les contextes économiques difficiles conduisant indubitablement au cumul de ces facteurs, ont fait une césure entre les pays riches et les pays pauvres quant à l'incidence et la révolution de la tuberculose à échelle mondiale. Pour atténuer la disparité des résultats des luttes antituberculeuses, les méthodologies employées en épidémiologie de la tuberculose doivent s'inscrire dans une démarche d'efficacité. Les marqueurs moléculaires, indispensables à l'identification et à la classification des souches appartenant au complexe Mycobacterium tuberculosis (MTC) ont chacun des potentialités qui leur sont propres dont il convient de cerner pour une utilisation adéquate dans les études épidémiologiques et phylogénétiques. Le but de cette thèse consiste à extraire des connaissances nouvelles des résultats de génotypage stockées dans les bases de données, connaissances relatives au polymorphisme du support génomique pour estimer la contribution de chaque marqueur dans la classification de MTC. Le recours à différentes méthodes de reconstruction phylogénétique et de modélisation des données fut indispensable. A la lumière des résultats obtenus, cette thèse propose une nouvelle méthodologie de classification, pour rétablissement d'une phylogéographie robuste de MTC en relation avec l'histoire des migrations humaines qui aurait débutée en Afrique subsaharienne. Chaque méthode de génotypage ayant une efficience et un cout propres, qu'il convient de mesurer par rapport aux moyens disponibles et aux résultats escomptes, il est donc intéressant de renforcer la connaissance des marqueurs et de proposer différentes alternatives menant à la classification des mycobactéries. Ainsi, les résultats obtenus dans cette thèse apportent plus de cohérence aux solutions proposées pour la caractérisation des clones de MTC circulant dans le monde. / Tuberculosis, very old disease, is more than ever presented on the global health scene with 9 million new cases per year. This disease, which remains a major cause of mortality is one of the most intractable public health and international issues. The various control programs, launched by the World Health Organization (WHO) to prevent and guarantee the cure of tuberculosis patients face difficulties that undermine their effectiveness. Indeed, the expansion of human virus rinimunodéficience (VIII) and its negative influence on susceptibility to tuberculosis, the rapid growth of multidrug-resistant tuberculosis, poverty and population growth, are a set of factors detrimental to application of preventive and curative measures. The difficult economic circumstances undoubtedly leading to accumulation of these factors have a break between rich and poor countries about the impact and the revolution of tuberculosis worldwide. To address the disparity of the results of tuberculosis struggles, the methodologies used in epidemiology of tuberculosis must be part of a process efficiency. Molecular indispensable to the identification and classification of strains belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) markers each have their own potentials that need to be identified for proper use in epidemiological and phylogenetic studies. The purpose of this thesis is to extract new knowledge of the results of genotyping data stored in databases, knowledge of the polymorphism of genomic carrier to estimate the contribution of each marker in the classification of TCM. The use of different methods of phylogenetic reconstruction and modeling data was essential. In light of the results obtained, the thesis proposes a new classification methodology for a robust recovery phylogeography of TCM in connection with the history of human migration have started in sub-Saharan Africa. Each genotyping method with cost efficiency and equity, should be measured in relation to the resources available and discounts results, it is interesting to strengthen the knowledge of markers and propose alternatives leading to the classification of mycobacteria. Thus, the results obtained in this thesis bring more coherence to the proposed characterization of clones MTC circulating worldwide solutions.

La tuberculose (TB), maladie infectieuse contagieuse, est causée par une mycobactérie appartenant au complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC). Malgré de nombreuses campagnes de vaccination par le BCG (Bacilles de Calmette et Guérin) et les traitements antituberculeux, on observe une réémergence de la maladie depuis les années 80. Ce bouleversement s’explique par la coïnfection avec le virus du VIH/SIDA, la désorganisation des systèmes de santé et par l’apparition des bactéries résistantes aux principaux antibiotiques antituberculeux. Dans ce contexte une meilleure connaissance des mouvements et de l’évolution des clones circulants du bacille tuberculeux permettrait de détecter plus rapidement et de façon plus pertinente l’émergence d’épidémies. Le contrôle et la surveillance de la maladie représentent des moyens essentiels pour lutter contre l’expansion mondiale de la tuberculose. C’est ainsi que l’unité de la Tuberculose et des Mycobactéries de l’Institut Pasteur de la Guadeloupe (IPG) a mis en place une base de données de profils génotypiques pour l’étude de l’épidémiologie globale de la tuberculose. Dans le cadre de cette thèse, nous décrirons les méthodes de bioinformatique qui ont été utilisées pour la gestion et l’exploitation de la 6ème version (SITVIT2) de cette base de données des génotypes pour mieux comprendre l’évolution et la dissémination mondiale du bacille tuberculeux. Cette base intègre aussi plusieurs marqueurs moléculaires tels que les MIRU-VNTRs (« mycobacterial interspersed repetitive units-variable number of tandem repeats ») et le Spoligotype43 servant à mieux décrire et identifier les familles de profils génotypiques du MTBC. La banque de données SITVIT2 ne cesse d’évoluer, et elle contient actuellement des informations épidémiologiques sur 111 635 isolats cliniques. Cette base de données est consultable en ligne à l’adresse suivante : http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/. Nous avons également réalisé une base de données nommée SITVITBovis qui est dédiée à la tuberculose bovine. Cette base de données sera accessible à l’adresse : http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_Bovis/. Parallèlement au développement et à la gestion des bases de données, ce travail de thèse s’est appuyé sur plusieurs études épidémiologiques et phylogéographiques mettant en corrélation les données disponibles sur la résistance aux médicaments ou les caractéristiques démographiques (dont le sexe, l’âge, le statut VIH, et l’origine du patient). Notre initiative de recherche permet ainsi d’améliorer la caractérisation phylogénétique détaillée des lignées du MTBC, ainsi que l’épidémiologie des clones en circulation, afin d’élaborer une cartographie géographique des isolats cliniques prédominants pour les bacilles tuberculeux principalement impliqués dans la maladie, à l’échelle nationale, régionale et mondiale. La superposition ultérieure de ces cartes avec des données sociopolitiques, économiques et démographiques obtenues auprès de Systèmes d’information géographique (SIG) ont permis de dresser un portrait précis des disparités actuelles par pays ou sous-région. Cette thèse représente une importante collaboration avec plusieurs équipes de chercheurs travaillant également dans le domaine de l’épidémiologie moléculaire de la tuberculose. L’objectif à long terme de ce travail, est d’optimiser la structure de la base, et de pérenniser l’enrichissement de celle-ci (notamment par l’automatisation et la facilité de la saisie de données). Une représentation optimale et une meilleure accessibilité des données de la base conforteraient les efforts faits pour le contrôle et la surveillance de la TB dans monde. / Tuberculosis (TB) is a contagious infectious disease caused by mycobacteria belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC). Despite numerous campaigns of vaccination by the BCG (Bacillus Calmette-Guérin) vaccine, and TB treatments, there was a resurgence of the disease since the 80s. This disruption is due to coinfection with HIV/AIDS, disorganization of health systems and the emergence of bacteria resistant to anti-TB drugs. In this context, a better understanding of the movements and changes of circulating clones of tubercle bacilli would detect faster and more relevant emerging epidemics. The control and monitoring of the disease are essential means to fight against the worldwide spread of tuberculosis. Thus the TB and Mycobacteria unit of the Pasteur Institute of Guadeloupe (IPG) has developed a database of genotypic profiles for the study of global epidemiology of tuberculosis.In this thesis, we discuss the Bioinformatical methods that have been used for the management and development of the 6th version (SITVIT2) of this database of genotypes to better understand the evolution and global dissemination of the tubercle bacillus. The database also includes several molecular markers such as MIRU-VNTRs (mycobacterial interspersed repetitive units- variable number of tandem repeats) and Spoligotype43 allowing a better description and identification of the families of genotypic profiles of Mycobacterium tuberculosis complex. SITVIT2 database is constantly evolving, and it currently contains epidemiological information on 111,635 clinical isolates. This database is available online at the following address: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/. We also developed a database named "SITVITBovis", which is dedicated to bovine tuberculosis. This database will be accessible at: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_Bovis/.Alongside the development and management of databases, this work was based on several epidemiological and phylogeographic studies correlating data on drug resistance or demographic characteristics (including sex, age, HIV status, and the origin of the patient). Our research initiative is thus focused to further improve in depth phylogenetic characterization of MTBC lineages, as well as the epidemiological analysis of circulating clones to generate evidence-based geographical mapping of predominant clinical isolates of tubercle bacilli causing the bulk of the disease both at country and regional level. Further superposition of these maps with socio-political, economical and demographical available through Geographic Information Systems (GIS) allows to have a precise view of prevailing disparities at the level of country or sub-region. This thesis represents an important collaboration with several researchers teams also working in the field of molecular epidemiology of tuberculosis.The long-term goal of this work is to further optimize the database structure, and sustain enriching it (including automation and ease of data entry). Optimum performance and accessibility of data in the database would reinforce efforts to control and surveillance of TB in the world.

Orientador: Jose Mario Martinez / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-07-15T09:06:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valli_MariaChristinaPedrosa_M.pdf: 2902462 bytes, checksum: 8343879ecfa0103ffa21d84d0e810d0b (MD5) Previous issue date: 1980 / Resumo: Não informado. / Abstract: Not informed. / Mestrado / Mestre em Matemática Aplicada

Acompanha memorial / Tese (livre docencia) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-17T05:36:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PintoJunior_Walter_LD.pdf: 1954361 bytes, checksum: c529f8c30757f8e06ef71576d9f3e945 (MD5) Previous issue date: 1978 / Resumo: No capítulo introdutório, após tecer um breve histórico e considerações gerais sobre os índices falcêmicos em diferentes populações, o autor descreveu de modo sucinto os fatores que influenciam a falciformação e o quadro clínico que compõe a anemia falciforme bem como das alterações clínicas associadas ao estigma siclêmico. Nesse mesmo capítulo chamou a atenção para os fatores que podem atuar na manutenção do polimorfismo da hemoglobina S. e a importância dessa hemoglobinapatia do ponto de vista antropológica. sócio-econômico. genético e de saúde pública. O segundo capítulo foi dedicado a uma revisão específica da eventual associação da hemoglobina S com a tuberculose pul- monar, estabelecendo os principais objetivos do trabalho ou seja, o de avaliar a freqüência de indivíduos com o gene da hemoglobina S no estado heterozigótico em pacientes negróides com tuberculose pulmonar e se a evolução clínica e o quadro radiológico da tuberculose pulmonar nos pacientes negróides estão de algum modo associados ao gene da hemoglobina S. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Not informed / Tese (livre docencia) - Univer / Genetica Medica / Livre Docente em Ciencias Medicas