La thèse traite de l'industrialisation qui s'opère au sein des systèmes de distribution de la presse dans les pays de l'union européenne, notamment la France, la Grande-Bretagne, l'Allemagne, l'Italie et l'Espagne. L'accent est porté sur la libéralisation et la régulation du processus de diffusion des journaux et magazines selon des mécanismes et procédés empruntés à la logistique industrielle et au marketing distributeur propres au secteur de la distribution des marchandises courantes. Après avoir présenté les contraintes et les spécificités liées à l'étude comparative des marchés de la diffusion de la presse, nous proposons dans un premier temps, une analyse structurelle du système de distribution des titres afin de mettre en évidence les mutations managériales au sein de la chaîne d'édition et de diffusion. Dans un second temps, nous analysons le processus relationnel et de rémunération régulant le travail d'échange et de prestation entre les membres en vue de faire ressortir les pratiques marchandes. Le cadre de résolution globale s'inscrit dans une perspective méthodologique développée à l'origine par l'économie industrielle en vue d'analyser la structure du marché de l'offre d'une industrie, et se réfère également à des approches juridique, financière et de gestion. Hormis ce cadre théorique, la thèse essaie de rendre compte de l'environnement industriel des différents maillons de la chaîne de diffusion en s'appuyant sur les modèles d'analyse des canaux de la distribution courante. En somme, la démarche méthodologique que nous revendiquons se situe à l'intersection de l'économie industrielle et de l'économie de la culture et de la communication.

Cette thèse construit un concept, celui de l'autoritativité, en mettant en évidence la constitution d'un champ, celui de la littérature numérique, sur le support d'inscription informatique. Les pratiques du texte menant à la construction du champ, sont dites autoritatives, car se situant en dehors des institutions traditionnelles de référence. Une autonomisation des dispositifs de légitimation des auteurs dans le nouveau champ est un des signes de sa construction.<br /><br />Au préalable, l'influence du procédé de transmission dans l'élaboration théorique des figures de l'usager a été mise en perspective. L'anonyme, dans une idéologie de diffusion des médias de masse, devient consommateur-usager des objets techniques, interacteur-constructeur agissant dans un univers de représentations, et enfin acteur cherchant à se différencier dans une société de la consommation de soi.<br /><br />L'informatique est un support d'écriture à multiples entrées s'insérant dans l'histoire des procédés d'inscription. Seule une description sociotechnique historique était à même de rendre compte des particularités de l'informatique en tant que support et de l'auteur, responsable des agissements du scripteur. Ceci a permis de rappeler que la calculabilité du support engendre des formes spécifiques d'écriture et de souligner la relation existante entre une technologie d'inscription comme l'imprimerie et la constitution du champ littéraire et de l'auteur propriétaire.

Cette étude s’inspire du concept d’invention du quotidien du sociologue français Michel de Certeau en tant que définit dans son ouvrage L’invention du quotidien (1980). Une lecture et analyse approfondies des nouvelles ouest africaines anglophones nous permettent d’examiner comment à travers des actes créatifs, et au sein de leurs propres champs d’actions, les individus représentés se réaffirment en tant que sujets agissants dans un espace où cette subjectivité leur a été précédemment déniée. La première partie de cette étude consistera à présenter les conditions d’émergence de la nouvelle ouest africaine. Nous examinerons le contexte sociopolitique, le rôle de l’écrivain, l’industrie éditoriale, ainsi que la réception de la nouvelle africaine sur le continent et en dehors du continent africain, ce qui nous permettra de souligner le lien intrinsèque qui existe entre dignité, subjectivité et développement. Dans une deuxième partie, notre intérêt portera sur la mémoire de l'écriture collective de la guerre, du trauma, de la violence ainsi que les diverses stratégies créatives employées par les protagonistes pour réaffirmer leur existence et pour lutter contre la violence et le trauma. Dans la dernière partie de cette étude, nous examinerons les stratégies stylistiques et linguistiques que les nouvellistes ouest africains emploient dans l'objectif de créer une rupture avec la tradition littéraire coloniale et de réinventer un nouveau genre de la nouvelle / This study draws its inspiration from what the French sociologist Michel de Certeau identified as the invention of the quotidian in his well known The Practice of Everyday Life (1980). A close reading and analysis of West African short fiction will allow us to examine how through everyday creative practices and within their own private spheres the represented individuals reestablish a space of agency previously denied to them. The first part of our study will consist in presenting the various conditions of emergence of African short fiction. We will look at the socio-political context and at the role of the short story writer, the publishing industry as well as the reception of African short fiction in Africa and abroad, which will allow us to emphasize the intrinsic link between dignity, agency and development. Secondly, we will focus on the writing of the collective memory of war, trauma and violence and on the numerous creative strategies used by the characters to reaffirm their existence, to fight against violence and to heal from trauma. The final part of this study will examine the stylistic and linguistic strategies used by West African short fiction writers to create a rupture with the colonial literary tradition and to reinvent a new short story genre

Disciple de César Franck, Charles Bordes a tracé son parcours de musicien en marge du Conservatoire et des institutions officielles. De son intégration à la « bande à Franck » jusqu’à la fondation des Chanteurs de Saint-Gervais et de la Schola cantorum, il a tissé un vaste réseau relationnel formé de compositeurs, d’interprètes, d’écrivains et de mélomanes, qui l’ont, par la suite, décrit comme un fervent artisan du renouveau musical français. Cette image a, en contrepartie, partiellement occulté l’œuvre de compositeur de Bordes. Ses mélodies présentent pourtant un remarquable intérêt. L’histoire de leur publication permet de mettre en évidence la complexité des relations avec le monde de l’édition à la fin du XIXe siècle et la nature du travail de révision posthume effectué par son ami Pierre de Bréville. L’analyse du corpus témoigne de l’originalité de la production, aussi bien sur le plan des choix littéraires – Bordes fut l’un des pionniers de la mise en musique des poèmes de Paul Verlaine et de Francis Jammes – que d’une écriture musicale inspirée et aux frontières de l’académisme sur le plan harmonique. Auteur de plus de trente-cinq mélodies avec piano, Bordes s’essaya également à la composition de mélodies orchestrées ou « symphoniques », comme nombre de ses contemporains au tournant du siècle. / Student of César Franck, Charles Bordes established himself as a musician outside the Conservatoire and the official institutions. From his integration with the “bande à Franck” to the founding of the Chanteurs de Saint-Gervais and the Schola cantorum, he formed a vast network of relationships among composers, interpreters, writers and music lovers, who would later describe him as a fervent architect of the French musical revival. This image overshadowed his contributions as a composer; his mélodies, however, still stimulate a remarkable interest. An examination of the history of their publication reveals the complexity of relationships within the musical publishing world at the end of the nineteenth-century and the nature of the posthumous reviewing work executed by his friend Pierre de Bréville. The analysis of the corpus shows the originality of the production, either about its literary aspects – Bordes was among the first artists to set the poetry of Paul Verlaine and Francis Jammes to music – or about his inspired musical language at the boundaries of academia from an harmonic point of view. Author of more than thirty-five songs for voice and piano, Bordes also tried his hand at the composition of orchestrated or “symphonic” songs like many of his contemporaries at the end of the century.

Gynaecia Cleopatrae, ou « La gynécologie de Cléopâtre » est une édition critique et une traduction en français d’un traité de gynécologie attribué à la reine Cléopâtre dont la composition remonterait au IVe siècle de notre ère en Afrique du Nord. Le texte est accompagné d’une introduction dont l’objectif est de placer le Gynaecia dans le contexte de la création de matériel gynécologique par les trois grandes écoles de médecines grecques, l’adaptation et la transmission des traités de gynécologie durant l’Antiquité et au Moyen Âge, ainsi que dans le contexte d’une tradition littéraire déjà existante associée à Cléopâtre. Les méthodes et les choix de l’édition et la traduction du Gynaecia sont aussi abordés, comme il se doit, dans l’introduction.

Cette thèse doctorale est le fruit de trois années de recherche, accomplie notamment à Paris et à Rome. Elle porte sur un commentaire au traité Sur les songes de Synésios de Cyrène, dont elle contient la première édition critique. Notre travail de recherche a nous permis d’établir que ce commentaire remonte, à peu près, aux années vingt du XIVe siècle, à savoir à la même période à laquelle Nicéphore Grégoras rédigeait son propre commentaire au même traité de Synésios. Cette coïncidence temporelle nous a amenés à nous poser la question du rapport entre les deux œuvres exégétiques : à laquel, par exemple, il faut attribuer la précédence chronologique ? Qui était l’auteur anonyme du commentaire inédit et quel rapport avait-il avec Grégoras ? L’effort de répondre à ces questions nous a amenés, enfin, à considérer les raisons d’intérêt que les Byzantins de l’époque pouvaient avoir à l’égard du traité de Synésios, étant donné qu’il est le seul, à l’exception de l’épistolaire, qui a été commenté par des savants à Byzance. La dernière partie de la thèse, donc, est dédiée à l’analyse de la première époque des Paléologues (de la fin du XIIIe au début du XIVe siècle). Notre conclusion est que, pendant une période de crise identitaire, les Byzantins pouvaient retrouver dans ce genre d’ouvrages remontant à l’Antiquité leurs propres racines culturelles. / This PhD dissertation deals with a commentary on Synesius of Cyrene’s On Dreams, of which it includes the first critical edition. It is the result of a three-years research: I spent most of this time in Paris and Rome.The research allowed me to establish that the commentary approximately dates back to 1320s, that is, to the same period in which Nicephorus Gregoras wrote his commentary on the same Synesius’ treaty. This chronological coincidence led me to investigate the relationship between these two different exegetical works. I could not avoid wondering, for instance, “Which commentary has the chronological priority?”, “Who is the anonymous author of the inedited scholia and which is his relationship with Gregoras?”. The effort to answer to these questions finally led me to consider the real reasons for interest in the treaty On Dreams in that period, since it is the only Synesius’ work – apart from his epistolary – which has been commented by Byzantine scholars. Thus, the last part of the dissertation is dedicated to the historical analysis of the first Palaiologan period (late 13th – early 14th century). My conclusion is that – during a period of identity crisis – Byzantine scholars might find in this kind of works (dating back to Antiquity) their own cultural roots.

Énoncé du problème : Depuis quelques années, la communication savante est menacée par l'essor d'éditeurs, de revues et de conférences prédatrices et l'impact négatif qu'ils ont sur la recherche, en contournant le processus d'examen par les pairs et en contaminant la communication savante avec des recherches de faible qualité (Cukier et al., 2020; Richtig et al., 2018). D'autre part, la littérature fait état d'une inquiétude quant au manque de connaissances de nombreux chercheurs pour identifier ce phénome (Asadi, 2018; Frandsen, 2017; Salehi et al., 2020; Taylor, 2019). En réponse, certains chercheurs estiment que les bibliothécaires académiques, qui sont devenus des leaders en nouveaux modèles de communication savante comme le libre accès, pourraient jouer un rôle plus actif, en informant et en transmettant aux étudiants et aux chercheurs des compétences pour faire face à ces défis, notamment celui de l'édition prédatrice (Corrall et al., 2013; Brantley et al., 2017; Zhao, 2014). D'autre part, la littérature souligne que les pays en développement sont les plus touchés par les publications prédatrices. En effet, un grand nombre de publications prédatrices proviennent des territoires de l'Asie, du Moyen-Orient et de certains pays d'Afrique (Bohannon, 2013; Shen et Björk, 2015; Xia et al., 2015; Demir, 2018; Patwardhan, 2019). Cependant, la région de l'Amérique latine, est très peu mentionnée dans la littérature. Questions de recherche : En accord avec l'énoncé du problème mentionné ci-dessus; cette thèse vise à répondre à la question suivante : Comment les bibliothèques académiques d'Amérique hispanique répondent-elles au problème de la publication prédatrice ? Cette thèse vise également à explorer les questions suivantes : (i) Comment a évolué la terminologie utilisée pour décrire l'édition prédatrice ? (ii) Quelles sont les meilleures pratiques ou stratégies utilisées pour combattre la publication prédatrice ? (iii) Quelles sont les lacunes de cette région pour soutenir leurs chercheurs dans la prévention de la publication prédatrice ? Méthodologie : Cette recherche a utilisé une méthodologie mixte basée sur une triangulation pour répondre aux questions de recherche. Trois méthodes principales de collecte de données ont été utilisées pour cette recherche : l'analyse de texte, des enquêtes et des entrevues de suivi. Résultats importants : Nos résultats suggèrent que de choisir la bonne terminologie pour décrire le phénomène de l'édition prédatrice faciliterait et aiderait une communication plus claire pour informer et soutenir les chercheurs sur cette problématique. Nos résultats suggèrent qu’il existe des approches différentes entre les régions de l'Amérique du Nord et de l'Amérique hispanique quant à la manière dont elles répondent et aident les chercheurs à faire face aux pratiques prédatrices. Nos résultats suggèrent que la question de l'édition prédatrice a une visibilité relativement faible en Amérique hispanique. En revanche, dans les pays plus développés, les bibliothécaires académiques semblent jouer un rôle de leader en sensibilisant les chercheurs aux dangers de l'édition prédatrice. Cependant il y a une préoccupation croissante parmi les bibliothèques académiques de la région de l'Amérique hispanique sur la nécessité de rechercher des stratégies et des alliances qui leur permettent d’améliorer leurs connaissances sur la communication savante afin de fournir un meilleur soutien à leurs chercheurs. Contribution : Cette étude nous a permis de mieux comprendre comment les bibliothèques d'Amérique hispanique répondent aux défis posés par les nouveaux modèles de communication savante, notamment le phénomène de l'édition prédatrice. Les résultats de cette étude sont importants, car ils aideront les bibliothèques académiques de cette région à s'informer sur l'édition prédatrice et à développer des stratégies pour soutenir leur communauté académique.

Titre de l'écran-titre (visionné le 12 janvier 2024) / Les protéines sont des machines moléculaires essentielles au fonctionnement des organismes vivants. Malgré plus de 60 ans de recherche en ce sens, notre compréhension des mécanismes qui façonnent leur évolution reste loin d'être complète. Les nouvelles méthodes d'édition de génome offrent de nouvelles possibilités en termes de méthodologie pour l'étude à haut débit de l'effet des mutations sur la fonction des protéines. Les connaissances découlant de ces nouvelles approches ont un potentiel important pour améliorer la santé humaine, animale et végétale. Les travaux effectués dans le cadre de cette thèse ont en premier lieu élaboré une nouvelle méthodologie basée sur l'édition de base pour l'étude à haut débit de l'effet des mutations sur la fonction des protéines. Cette approche a identifié plus de 700 sites ayant une importance fonctionnelle dans les gènes essentiels de levure. Les données générées par cette expérience ont aussi permis d'identifier des propriétés de sgRNA déterminantes pour l'efficacité de l'édition base. Dans le deuxième chapitre, nous avons utilisé une approche de mutagenèse systématique pour caractériser les mutations menant à la résistance à un antifongique, la 5-fluorocytosine, dans le gène FCY1. Nous avons en même temps pu mesurer les compromis résistance-fonction pour les mutants de ce gène, et pu valider la capacité de notre jeu de données à prédire le phénotype de résistance de mutants d'orthologues provenant d'espèces de levures pathogènes. Finalement, nous avons utilisé nos connaissances des propriétés de FCY1 acquises au chapitre précédent pour en faire un modèle d'évolution des protéines. Plus précisément, nous avons exploré le rôle potentiel de l'épistasie en trans entre des mutants de perte de fonction dans la transition d'un complexe homomérique vers hétéromérique suite à une duplication de gène. Nous avons découvert des centaines de paires d'allèles inactifs de FCY1 pouvant se complémenter, et avons pu explorer les propriétés de ces mutants et des complexes hétéromériques résultants. / Proteins are molecular machines essential to the functioning of living organisms. Despite more than 60 years of research in this direction, our understanding of the mechanisms that shape their evolution remains far from complete. Recently developed genome tools methods offer new possibilities in terms of methodology for the high-throughput study of the effect of mutations on protein function. The knowledge resulting from these new approaches has significant potential in human, animal, and plant health. In the first chapter of this thesis, we developed a new methodology based on base editing for the high-throughput study of the effect of mutations on protein function. This approach identified more than 700 sites of functional importance in essential yeast genes. The data generated by this experiment also made it possible to understand sgRNA properties that are decisive for the efficiency of base editing. In the second chapter, we used a systematic mutagenesis approach to characterize the mutations leading to resistance to an antifungal, 5-fluorocytosine, in the FCY1 gene. At the same time, we measured the resistance-function trade-offs for mutants of this gene and validated the ability of our dataset to predict the resistance phenotype of orthologous mutants from pathogenic species. Finally, we used our knowledge of the properties of FCY1 acquired in the previous chapter to use it as a model for protein evolution. Specifically, we explored the potential role of trans epistasis between loss-of-function mutants in the transition from a homomeric to a heteromeric complex following gene duplication. We have discovered hundreds of pairs of inactive FCY1 alleles that can complement each other, and have been able to explore the properties of these mutants and the resulting heteromeric complexes.

Le large éventail d'applications du système CRISPR-Cas a conduit à des innovations biotechnologiques qui sont sur le point de transformer l'industrie pharmaceutique actuelle. Néanmoins, l'atteinte d'un haut niveau d'efficacité à un gène cible reste encore aujourd'hui un défi pour l'édition du génome. Ceci est dû principalement à la capacité encore limitée de modifier tous les sites du génome humain, tout comme le faible taux de recombinaison homologue obtenu chez les cellules de mammifères. Ainsi, l'optimisation des processus de modification génique s'avère indispensable pour favoriser les diverses utilisations de l'édition du génome. Dans cette thèse, il a été question de (i) développer une méthode d'enrichissement de cellules génétiquement modifiées et (ii) augmenter la polyvalence de l'édition du génome en augmentant la plage de ciblage du système CRISPR-Cas9 dans le génome humain. L'objectif de la première partie de cette thèse visait à étudier la fonctionnalité du gène ATP1A1, codant pour la pompe sodium/potassium (Na⁺/K⁺ ATPase), comme marqueur endogène de l'édition du génome. Dans ce sens, nous avons modifié la sensibilité de cette pompe pour l'ouabaïne en insérant des mutations dominantes dans le locus ATP1A1, ce qui a permis de générer des cellules résistantes à l'ouabaïne. La capacité de multiplexage du système CRISPR-Cas permet de co-cibler simultanément ATP1A1 et le locus d'intérêt, où il est possible d'enrichir des évènements de réparation par NHEJ ou par RH dans les deux locus à la suite de l'ajout d'ouabaïne. Ainsi, nous avons démontré que cette approche peut être appliquée non seulement aux lignées cellulaires, mais aussi aux cellules primaires ce qui permet d'envisager une possible utilisation pour le développement thérapeutique ex vivo. Dans le deuxième objectif de cette thèse, il était question d'optimiser le système CRISPR1-Cas9 de Streptococcus thermophilus dans le but d'élargir le répertoire de nucléases pour l'édition du génome. Dans ce sens, nous avons optimisé l'expression de l'ARN guide et nous avons caractérisé diverses variantes de St1Cas9 permettant de cibler des régions riches en A/T. Autant sous forme de nucléase que d'éditeur de base, l'application de nos variantes de St1Cas9 in vitro a permis d'obtenir des hauts taux d'édition du génome humain. Ainsi, la taille de St1Cas9 est idéale pour sa vectorisation avec son ARN guide dans un seul vecteur adéno-associés (AAV). Dans ce sens, nous avons démontré que l'administration du vecteur AAV-St1Cas9 permet de sauver la létalité et les anomalies métaboliques dans un modèle murin de tyrosinémie héréditaire de type I. En tout, ces travaux illustrent des outils permettant d'augmenter le rendement d'édition et l'ouverture de nouvelles régions géniques pouvant être ciblées à l'intérieur du génome humain à l'aide du système CRISPR-Cas9. Ainsi, nous avons démontré la fonctionnalité des outils développés au cours de ce projet de thèse pour diverses applications ex vivo et in vivo, permettant ainsi d'élargir le potentiel thérapeutique de l'édition du génome.

Face aux développements des technologies de l'information et de la communication dans les domaines de l'enseignement supérieur et de la recherche, le secteur de l'édition a été conduit à prendre en compte la montée en puissance du numérique dans ses perspectives stratégiques.<br />L'évolution actuelle de l'édition universitaire numérique au niveau international laisse apparaître un réel décalage entre les disciplines et les bassins linguistiques, les STM anglophones s'inscrivant clairement dans un axe de transition forte vers une activité numérique devenant majeure. La situation internationale se voit reproduite en France pour les STM, mais la situation des SHS est par contre beaucoup plus en retrait par rapport au numérique, sans préjuger toutefois de la possibilité pour ce secteur de suivre l'évolution des STM.<br />Le secteur des revues s'est distingué des autres secteurs éditoriaux universitaires et a développé une activité non-marchande représentative sur la base des supports numériques. A l'exception des dictionnaires et encyclopédies, les autres genres éditoriaux, les ouvrages, essais, monographies... n'ont pas mis en place de réelle stratégie numérique, la situation étant au stade de l'étude et de l'analyse.<br />C'est dans ce contexte que s'inscrit ce travail de thèse. Il vise à apporter une analyse de la position de l'édition d'ouvrages universitaires face aux perspectives du numérique. Cette analyse a pour objectif la compréhension des enjeux et des caractéristiques qui distinguent ce domaine face dans la transition numérique. Il vise également à apporter des propositions de modèles et des préconisations en vue du développement d'une activité numérique pour ces secteurs.