Nowadays, many business processes are supported by information systems (e.g. WfMS, CRM, ERP, SCM, etc.). Many of these systems have a strong characteristic of coordination of activities defined in the business processes, mainly for ensuring that these activities are performed as specified in the process model. However, there are domains that demand more flexible systems, for example, hospital and health domains, whose behavior can vary for each patient. Such domains of applications require an information system in which the business processes are weakly defined, supporting more flexible and dynamic executions. For example, the execution of some common activities may be violated, or some unusual activity may be enforced for execution. Therefore, in domains of applications in which the systems support a high levei of flexibility the business processes are susceptible to exceptional or even fraudulent executions. Thus, the provision of flexibility can not be considered without improving the security issues, since there is clearly a trade-off between flexibility and security requirements. Therefore, it is necessary to develop a mechanism to allow the combination of these two requirements in a system, that is, a mechanism that promotes a balance between flexibility and security. This thesis aims to design, implement and evaluate methods for detecting anomalies in logs of process-aware information systems, that is, the development of methods to find out which process instances may be an anomalous execution. Thus, when incorporating a method for detecting anomalies in such systems, it would be possible to offer a flexible and safer execution environment, since the system is also able to identify anomalous executions, which could be a simple exception or a harmful fraud attempt. Thus, the study of methods for detecting anomalous events will fill an area largely unexplored by the community of process mining, which has been mainly interested in understanding the common behavior in business processes. Furthermore, although this thesis does not discuss the meaning of an anomalous instance, the methods and algorithms presented here are important because they allow us to identify those instances. / Atualmente há uma variedade de sistemas que apoiam processos de negócio (ex. WfMS, CRM, ERP, SCM, etc.). Muitos desses sistemas possuem uma forte característica de coordenação das atividades dos processos de negócios, garantindo que essas atividades sejam executadas como especificadas no modelo de processo. Entretanto, há domínios com maior necessidade de flexibilidade na execução desses processos, por exemplo, em atendimento hospitalar, cuja conduta pode variar para cada paciente. Essa característica desses domínios demanda o desenvolvimento de sistemas orientados a processos fracamente definidos, ou com execução mais flexível. Nesses domínios, a execução de algumas atividades comuns pode ser violada, ou a execução de uma atividade "incomum" pode ser necessária, ou seja, tais processos são suscetíveis a execuções excepcionais ou mesmo fraudulentas. Assim, o provimento de flexibilidade não pode ser considerado sem melhorar as questões relacionadas à segurança, pois flexibilidade e segurança são requisitos claramente conflitantes. Portanto, é necessário desenvolver mecanismos ou métodos que permitam a conjugação desses dois requisitos em um mesmo sistema, promovendo um balanço entre flexibilidade e segurança. Esta tese tem por objetivo projetar, implementar e avaliar métodos de detecção de anomalias em logs de sistemas de apoio a processos de negócios, ou seja, o desenvolvimento de métodos utilizados para descobrir quais instâncias de processo podem ser uma execução anômala. Desta forma, através da integração de um método de detecção de anomalias com um sistema de apoio a processos de negócio, tais sistemas poderão oferecer um ambiente de execução flexível, mas capaz de identificar execuções anômalas que podem indicar desde uma execução excepcional, até uma tentativa de fraude. Assim, o estudo de métodos de detecção de eventos anômalos vem preencher um espaço pouco explorado pela comunidade de process mining, que tem demonstrado maior interesse em entender o comportamento comum em processos de negócios. Entretanto, apesar desta tese não discutir o significado das instâncias anômalas, os métodos de detecção apresentados aqui são importantes porque permitem selecionar essas instâncias.

A água, por ser a substância de fundamental importância para a existência de vida, é alvo de diversos estudos, principalmente, ao longo das últimas décadas. Apesar de bastante conhecida, a água é uma substância com diversos comportamentos singulares, classificadas em geral como anomalias da água. Com a intenção de descrever tais anomalias, diversos modelos de água para estudos computacionais foram desenvolvidos até hoje, embora nenhum seja capaz de descrever todas as anomalias conhecidas. Baseados em modelos atomísticos de água, surgiram também modelos efetivos de interação entre partículas em um sistema de apenas uma espécie, com a ideia de generalizar o estudo sobre anomalias. Nossos estudos de Dinâmica Molecular e Monte Carlo são realizados em um sistema de partículas interagindo através de potenciais efetivos, compostos por duas escalas de comprimento: um ombro repulsivo a curtas distâncias e a outra sendo uma escala variável, que pode ser repulsiva ou fortemente atrativa, dependendo dos parâmetros utilizados. A análise mostra que o sistema apresenta comportamento anômalo. As regiões de anomalias de densidade, difusão e estruturais encolhem no diagrama de fase de pressão versus temperatura à medida que o sistema se torna mais atrativo. Uma transição líquido-líquido é formada com o aumento do poço de atração. Encontramos que a transição de fase gás-líquido é do tipo Ising em 3 dimensões (3D) para todos os potenciais e sua temperatura crítica aumenta com o aumento da atração. Nenhum comportamento tipo Ising 3D para a transição de fase líquido-líquido foi detectado nas simulações Monte Carlo, o que pode estar relacionado à presença de fases amorfas estáveis. Com relação a sistemas em confinamento, usando Monte Carlo, estudamos o transporte através de nanotubos. Posicionando dois volumes de controle com densidades diferentes, um em cada abertura do nanotubo, induzimos o transporte de partículas através do nanotubo confinante. As partículas do sistema interagem através de um potencial efetivo de duas escalas de comprimento. Analisamos uma família de três potenciais, onde variamos a escala de comprimento menor, desde um ombro repulsivo até um pequeno poço de atração. O estudo mostra que o sistema se configura em camadas no interior do nanotubo e que o transporte apresenta uma sequência de mínimos e máximos, a medida que o raio interno do nanotubo é reduzido, o que caracteriza um comportamento anômalo, já que se espera apenas uma redução no transporte a medida que o espaço interno do nanotubo diminui. Tal comportamento descrito para o transporte, e também a formação de camadas, apenas não são encontrados para o potencial com o poço atrativo. Com relação à estrutura e às propriedades de transporte, as partículas confinadas não diferem sob as mesmas condições para as duas geometrias empregadas. Através da análise da energia de interação das partículas confinadas, verificamos também que a origem da formação de camadas e o comportamento distinto do transporte se deve não apenas ao fato da existência de duas escalas de comprimento no potencial de interação mas também à presença de uma barreira de energia significativa entre essas escalas. / Water, being a substance of fundamental importance for the existence of life, has been the target of several studies, mainly in the last decades. Although well known, water is a substance with several different behaviors, generally classified as water anomalies. In order to describe such anomalies, various models of computational studies are developed to date, although none is able to describe all as known anomalies. Based on water models, also on effective models of interaction between parts in a system of only one species, with an idea to generalize the study on anomalies. Our Molecular Dynamic and Monte Carlo studies are performed in a system of particles interacting through core-softened (CS) potential, composed by two length scales: a repulsive shoulder at short distances and the another a variable scale, that can be repulsive or strongly attractive depending on the parameters used. The system shows water-like anomalous behavior. The density, diffusion and structural anomalous regions in the pressure versus temperature phase diagram shrink in pressure as the system becomes more attractive. The liquid-liquid transition appears with the increase of the attraction well. We found that the liquid-gas phase transition is Ising-like for all the CS potentials and its critical temperature increases with the increase of the attraction. No Ising-like behavior for the liquid-liquid phase transition was detected in the Monte Carlo simulations might be due to the presence of this stable amorphous phases. Considering confined systems, using Monte Carlo, we studied the transport through nanotube. Using two volumes of control with different densities, one at each opening of the nanotube, we induced the transport of particles through the confining nanotube. The particles of the fluid system interact through an core-softened potential with two length scales. We looked at a family of three potentials, where the scale changes from smaller length from repulsive shoulder to a small attraction well. The study shows that the system is formed in layers inside the nanotube and that the transport has a sequence of minimum and maximum as the internal radius of the nanotube is reduced, which characterizes an anomalous behavior, since it is expected only a reduction as the internal space of the nanotube reduces. Such behavior described for transport and also the layers formation only are not found for a potential with attractive well. By analyzing the interaction energy of the confined particles, we also verified that the origin of the layers formation and the distinct behavior of the transport are due not only to the existence of two length scales in the interaction potential but also to the presence of a barrier between these scales.

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-24Bitstream added on 2015-04-09T12:48:10Z : No. of bitstreams: 1 000814070.pdf: 827556 bytes, checksum: 19beac5e595208be95c7d3716158c059 (MD5) / Este trabalho teve como objetivo caracterizar os valores sanguíneos de lactato em cães com degeneração valvular mitral em fases distintas da doença e correlacioná-los com as variáveis eletrocardiográficas, radiográficas, ecodopplercardiográficas e de pressão arterial, averiguando o seu valor como indicador diagnóstico da hipoperfusão tecidual em cães com insuficiência cardíaca. Foram avaliados 44 cães, distribuídos em grupo controle, composto por cães hígidos e os grupos Ia, Ib, II e IIIa, compostos por cães com insuficiência cardíaca congestiva classe Ia, Ib, II e IIIa respectivamente. A análise das concentrações séricas de lactato identificou valores estatisticamente superiores nos cães da classe II comparativamente aos animais controle, o mesmo ocorrendo com os animais da classe IIIa comparativamente aos animais controle, classe Ia e classe Ib. Contudo, os cães da classe II apresentaram resultados semelhantes aos animais incluídos na classe Ia e Ib e os cães da classe IIIa não apresentaram quaisquer diferenças significativas com os animais classe II. Houve correlação positiva do lactato sanguíneo e diâmetro interno do ventrículo esquerdo, fração de encurtamento e relação átrio esquerdo/aorta. Da mesma forma, identificou-se correlação positiva entre o lactato sanguíneo e frequência cardíaca, VHS e amplitude da onda P. Foi observada correlação negativa do lactato sanguíneo com a pressão arterial sistólica. Na análise de sensibilidade e especificidade o lactato jugular apresentou a maior área sob a curva ROC, sendo identificada a concentração de lactato sanguíneo de 3,25 mmol/L como a de maior sensibilidade e especificidade para diferenciar cães saudáveis de cães com ICC. Os resultados mostram que o lactato sanguíneo aumenta à medida que progride o quadro de insuficiência cardíaca congestiva / This study was aimed at characterizing the concentration of serum lactate in dogs with varying stages mitral valve degeneration, searching for a correlation between such parameter and the electrocardiographic, radiographic, echocardiographic and blood pressure data, as to investigate its value as a diagnostic indicator of tissue hypoperfusion in dogs with heart failure. The analyses of the serum concentration of lactate disclosed results estatistically higher in dogs belonging to CHF class II as compared to control animals, as well as between class IIIa dogs as compared to controls, class Ia, and class Ib dogs. However, the results of class II dogs were similar to those of classes Ia and Ib animals. Also, no difference was documented between the results of classes II and IIIa dogs. A positive correlation was identified between serum lactate concentration and the left ventricular internal diameter, fractional shortening, and left atrium-to-aorta ratio. A positive correlation was also observed between serum lactate and mean heart rate, VHS, and P wave amplitude. A negative correlation was documented between serum lactate and systolic blood pressure. A larger area under the ROC curve was disclosed for the jugular lactate, which showed the concentration of 3,25 mmol/L to provide the highest sensibility and specificity in differentiating healthy dogs from those presenting CHF. The results support that blood lactate increases as heart failure worsens

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Farmácia, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T08:58:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 266561.pdf: 720941 bytes, checksum: 360b9d9357d5199a927963f36755e55f (MD5) / Existem evidências sugerindo que o coração de pacientes chagásicos crônicos está exposto ao estresse oxidativo, e que este fator contribui para a progressão da doença. O benzonidazol (BZN) é a única terapia etiológica disponível no Brasil, sendo que seu mecanismo de ação reside na modificação covalente de macromoléculas do parasita através de espécies reativas geradas durante seu metabolismo nitroredutor. Entretanto, além do mecanismo tripanocida, seu metabolismo pode acarretar efeitos oxidativos deletérios ao hospedeiro. O presente projeto é uma seqüência de estudos anteriores, realizado nos mesmos pacientes chagásicos crônicos, os quais demonstraram um aumento do estresse oxidativo proporcional ao grau de severidade da doença (OLIVEIRA et al., 2007), o qual foi atenuado através da suplementação com vitaminas E e C (MAÇAO et al., 2007). Portanto, o objetivo desse estudo foi avaliar o efeito da suplementação antioxidante com vitamina E (800 UI/dia) e vitamina C (500 mg/dia), após a terapia com BZN durante 2 meses (5 mg/Kg/dia), com o intuito de minimizar os efeitos deletérios que essa terapia ocasiona no hospedeiro. Os pacientes foram classificados e divididos em quatro grupos, de acordo com a classificação clínica e hemodinâmica de Los Andes modificada, em grupos IA (n=10); IB (n=20); II (n=7) e III (n=4). As atividades da superóxido dismutase (SOD), catalase (CAT), glutationa peroxidase (GPx), glutationa transferase (GST) e glutationa redutase (GR), além dos conteúdos de glutationa reduzida (GSH), vitaminas E e C, os marcadores de estresse oxidativo, como as substâncias reagentes ao ácido tiobarbitúrico (TBARS) e proteína carbonilada (PC), e os marcadores inflamatórios adenosina deaminase (ADA), mieloperoxidase (MPO) e óxido nítrico (NO), foram determinados no sangue dos pacientes, antes e após a terapia com BZN, e após a suplementação com a terapia antioxidante. Comparações entre os diferentes grupos foram realizadas usando ANOVA (análise de variância), complementada pelo teste de Tukey-Kramer, enquanto o teste t de Student foi usado para comparação pareada, antes e após alguma intervenção, admitindo um nível mínimo de significância de p 0,05. Os resultados revelaram que após dois meses de tratamento com BZN, as atividades das enzimas antioxidantes: GPx aumentaram em todos os grupos IA (p=0,0004), IB (p<0,0001), II (p=0,0087) e III (p=0,0008); da enzima SOD nos grupos IA (p<0,0001), IB (p=0,0007) e II (p=0,0087), CAT (IA (p=0,0390), IB (p=0,0001) e II (p=0,0068) e GST nos grupos IA (p<0,0001), IB (p<0,0001), II (p=0,0090), foram aumentadas em todos os grupos, exceto no grupo III; e os níveis de PC foram elevados nos grupos IA (p=0,0046), IB (p=0,0025) e II (p=0,0041), novamente exceto o grupo III, além da depleção de vitamina E nos grupos IA (p=0,0057), IB (p=0,0137) e II (p=0,0230). Após a suplementação antioxidante, a atividade da SOD nos grupos IA (p<0,0001); IB (p<0,0001); II (p=0,0002); da GPx nos grupos IA (p=0,0064), IB (p=0,0003), II (p<0,0001) e III (p=0,0108) e da GR nos grupos IA (p=0,0395) e IB (p=0,0345) foram diminuídas; os conteúdos de PC nos grupos IA (p=0,0034), IB (p=0,0003) e II (p=0,0014); TBARS nos grupos IA (p<0,0001), IB (p=0,0007), II (p=0,0011) e III (p=0,0341); NO nos grupos IA (p=0,0443), IB (p=0,0214) e II (p=0,0402); ADA nos grupos IA (p=0,0113) e IB (p=0,0022); e GSH nos grupos IA (p=0,0002), IB (p=0,0006), II (p=0,0211) foram diminuídos, enquanto que os níveis de vitamina E foram aumentados nos grupos IA (p=0,0006), IB (p=0,0118) e II (p=0,0061). Em resumo, o tratamento com BZN promoveu um insulto oxidativo em pacientes chagásicos crônicos demonstrado através dos aumentos das atividades de enzimas antioxidantes, aumentos dos níveis de PC e depleções de vitamina E, os quais foram atenuados através da suplementação antioxidante com vitaminas E e C durante seis meses, demonstrado pela diminuição das atividades das enzimas SOD, GPx e GR, menores níveis de PC, além de restaurar e aumentar os níveis de vitamina E. Além disso, a suplementação também diminuiu os níveis de TBARS e marcadores inflamatórios (NO e ADA) nos estágios com menor comprometimento cardíaco.

A água, por ser a substância de fundamental importância para a existência de vida, é alvo de diversos estudos, principalmente, ao longo das últimas décadas. Apesar de bastante conhecida, a água é uma substância com diversos comportamentos singulares, classificadas em geral como anomalias da água. Com a intenção de descrever tais anomalias, diversos modelos de água para estudos computacionais foram desenvolvidos até hoje, embora nenhum seja capaz de descrever todas as anomalias conhecidas. Baseados em modelos atomísticos de água, surgiram também modelos efetivos de interação entre partículas em um sistema de apenas uma espécie, com a ideia de generalizar o estudo sobre anomalias. Nossos estudos de Dinâmica Molecular e Monte Carlo são realizados em um sistema de partículas interagindo através de potenciais efetivos, compostos por duas escalas de comprimento: um ombro repulsivo a curtas distâncias e a outra sendo uma escala variável, que pode ser repulsiva ou fortemente atrativa, dependendo dos parâmetros utilizados. A análise mostra que o sistema apresenta comportamento anômalo. As regiões de anomalias de densidade, difusão e estruturais encolhem no diagrama de fase de pressão versus temperatura à medida que o sistema se torna mais atrativo. Uma transição líquido-líquido é formada com o aumento do poço de atração. Encontramos que a transição de fase gás-líquido é do tipo Ising em 3 dimensões (3D) para todos os potenciais e sua temperatura crítica aumenta com o aumento da atração. Nenhum comportamento tipo Ising 3D para a transição de fase líquido-líquido foi detectado nas simulações Monte Carlo, o que pode estar relacionado à presença de fases amorfas estáveis. Com relação a sistemas em confinamento, usando Monte Carlo, estudamos o transporte através de nanotubos. Posicionando dois volumes de controle com densidades diferentes, um em cada abertura do nanotubo, induzimos o transporte de partículas através do nanotubo confinante. As partículas do sistema interagem através de um potencial efetivo de duas escalas de comprimento. Analisamos uma família de três potenciais, onde variamos a escala de comprimento menor, desde um ombro repulsivo até um pequeno poço de atração. O estudo mostra que o sistema se configura em camadas no interior do nanotubo e que o transporte apresenta uma sequência de mínimos e máximos, a medida que o raio interno do nanotubo é reduzido, o que caracteriza um comportamento anômalo, já que se espera apenas uma redução no transporte a medida que o espaço interno do nanotubo diminui. Tal comportamento descrito para o transporte, e também a formação de camadas, apenas não são encontrados para o potencial com o poço atrativo. Com relação à estrutura e às propriedades de transporte, as partículas confinadas não diferem sob as mesmas condições para as duas geometrias empregadas. Através da análise da energia de interação das partículas confinadas, verificamos também que a origem da formação de camadas e o comportamento distinto do transporte se deve não apenas ao fato da existência de duas escalas de comprimento no potencial de interação mas também à presença de uma barreira de energia significativa entre essas escalas. / Water, being a substance of fundamental importance for the existence of life, has been the target of several studies, mainly in the last decades. Although well known, water is a substance with several different behaviors, generally classified as water anomalies. In order to describe such anomalies, various models of computational studies are developed to date, although none is able to describe all as known anomalies. Based on water models, also on effective models of interaction between parts in a system of only one species, with an idea to generalize the study on anomalies. Our Molecular Dynamic and Monte Carlo studies are performed in a system of particles interacting through core-softened (CS) potential, composed by two length scales: a repulsive shoulder at short distances and the another a variable scale, that can be repulsive or strongly attractive depending on the parameters used. The system shows water-like anomalous behavior. The density, diffusion and structural anomalous regions in the pressure versus temperature phase diagram shrink in pressure as the system becomes more attractive. The liquid-liquid transition appears with the increase of the attraction well. We found that the liquid-gas phase transition is Ising-like for all the CS potentials and its critical temperature increases with the increase of the attraction. No Ising-like behavior for the liquid-liquid phase transition was detected in the Monte Carlo simulations might be due to the presence of this stable amorphous phases. Considering confined systems, using Monte Carlo, we studied the transport through nanotube. Using two volumes of control with different densities, one at each opening of the nanotube, we induced the transport of particles through the confining nanotube. The particles of the fluid system interact through an core-softened potential with two length scales. We looked at a family of three potentials, where the scale changes from smaller length from repulsive shoulder to a small attraction well. The study shows that the system is formed in layers inside the nanotube and that the transport has a sequence of minimum and maximum as the internal radius of the nanotube is reduced, which characterizes an anomalous behavior, since it is expected only a reduction as the internal space of the nanotube reduces. Such behavior described for transport and also the layers formation only are not found for a potential with attractive well. By analyzing the interaction energy of the confined particles, we also verified that the origin of the layers formation and the distinct behavior of the transport are due not only to the existence of two length scales in the interaction potential but also to the presence of a barrier between these scales.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Jurídicas. Programa de Pós-Graduação em Direito / Made available in DSpace on 2012-10-18T07:34:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T19:39:35Z : No. of bitstreams: 1 181814.pdf: 3450010 bytes, checksum: 4d1af8d3316d47640b5a505a860e576f (MD5) / Estudo do atual estágio do "aborto eugênico" no Brasil, justificado pela situação vigente em que mesmo não sendo permitido pela legislação penal brasileira, ele vem sendo autorizado em situações determinadas e respeitados alguns requisitos, através da expedição cada vez mais freqüente de alvarás judiciais. Verificação dos casos em que está sendo autorizado, dos requisitos exigidos, da jurisprudência sobre o assunto e da possibilidade de sua descriminalização. Estudo do artigo do Projeto de Reforma do Código Penal que contempla tal modalidade abortiva. Tendência atual.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T20:53:57Z : No. of bitstreams: 1 gamba_bf_me_botib.pdf: 1144074 bytes, checksum: 38b7854a72a3108b08ac952129465214 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A síndrome de Smith-Magenis (SMS) é uma complexa anomalia caracterizada por atraso no desenvolvimento neuro-psico-motor (ADNPM), anomalias craniofaciais, esqueléticas e comportamentais. Dentre as anomalias destacamos braquicefalia, baixa estatura, distúrbio do sono, comportamentos de auto-injúria e movimentos estereotipados. SMS é causada por uma deleção intersticial do cromossomo 17(p11.2) ou mutação no gene RAI1, presente nesta região cromossômica. Sua prevalência é estimada em 1:25.000 nascidos vivos podendo chegar até 1:15.000. O diagnóstico clínico para SMS é confirmado pela técnica de citogenética molecular FISH. Neste trabalho realizamos estudo citogenético por bandamento GTG, GTG em alta resolução e FISH no total de 17 casos com suspeita clínica para SMS. Para realização de FISH foram utilizadas duas sondas comerciais da CYTOCELL ®, uma contendo o gene FU1 e outra o gene RAI1. Os resultados clínicos desta casuística comparados com a literatura internacional mostrou que embora fizemos algumas considerações, demonstramos a similaridade do diagnóstico clínico de SMS nos subgrupos SMS-del e SMS-like tanto brasileiros quanto da literatura. Os resultados citogenéticos do bandamento GTG revelaram que sete casos (7/17) apresentam deleção 17(p11.2) e o FISH confirmou a deleção tanto do gene FU1 como do gene RAI1 nos sete casos identificados. Este trabalho é de grande importância por tratar de uma afecção rara, pouco conhecida, e subdiagnosticada no Brasil. Assim destacamos que o uso de ficha clínica específica para SMS é importante para a definição da hipótese diagnóstica, 7/17 casos avaliados apresentaram deleção 17p11.2, e deleção dos genes... / Smith-Magenis syndrome (SMS) is a complex anomaly characterized by developmental delay (ADNPM), craniofacial anomalies, and behavioral disorders. Among the anomalies highlight brachycephaly, short stature, sleep disturbance, behavior of self-injury and stereotyped movements. SMS is caused by an interstitial deletion of chromosome 17 (p11.2) or mutation in the retinoic acid-induced 1 (RAI1) gene, present in this chromosomal region. Its prevalence is estimated at 1:25.000 live births and may reach up to 1:15.000. The c1inical diagnosis for SMS is confirmed by molecular cytogenetic technique of FISH. In this work we performed a cytogenetic study by GTG, GTG high resolution and FISH total of 17 cases with c1inical suspicion for SMS.To perform FISH probes were used two commercial CYTOCELL ®, one containing the FLl1 gene and another gene RAI1. The c1inical results in this series compared to the literature showed that although we made some considerations, we demonstrate the similarity of the clinical diagnosis of SMS in both sub-del SMS and SMS-like Brazilians and literature. The cytogenetic results of GTG banding revealed that seven cases (7 1 17) have deletion 17(p11.2) and FISH confirmed the deletion of both the FLl1 gene and the gene RAI1 the seven cases identified. This work is of great importance for treating arare, little known and under-diagnosed in Brazil. Thus we emphasize that the use of medical records specific to SMS is important to define the diagnosis, 7 117 cases showed stable 17p11.2 deletion, and deletion of genes FUI and RAI, no significant differences between the c1inicalfeatures of this sample group comparing it with the literature and this is about the largest sample of Brazilian SMS already described

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-04-30Bitstream added on 2014-06-13T20:53:59Z : No. of bitstreams: 1 lourencao_jc_me_botib.pdf: 1696836 bytes, checksum: b5322f2b21a2b979131662a74b2c8aae (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Uma anomalia foi detectada na progênie F1 de um cruzamento controlado entre genitores normais e sem parentesco de Eucalyptus grandis, em um viveiro de mudas para plantios comerciais da empresa Suzano Papel e Celulose. As plantas anormais apresentaram altura reduzida, superbrotamento caulinar, redução drástica da área foliar e alteração na forma do limbo da folha. A proporção entre plantas afetadas e normais foi de 3:1 (3 plantas normais : 1 planta anômala), sugerindo uma segregação mendeliana do caráter, que foi confirmada pelo teste do qui-quadrado (χ 2=2,32; p>0,1). Através da técnica de BSA (Bulked Segregant Analysis) utilizada em conjunto com marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foi possível identificar um marcador ligado a essa anomalia de eucalipto, o qual foi convertido em SCAR (Sequence Characterized Amplified Region). A sequência SCAR apresentou identidade a sequências expressas de eucalipto do banco de dados de ESTs (Expressed Sequence Tags) do projeto FORESTs-FAPESP, portanto, encontra-se em uma região do genoma que pode estar envolvida direta ou indiretamente com o caráter da anomalia. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo a caracterização molecular dessa região genômica relacionada à anomalia observada em mudas de eucalipto. Na análise de ligação das marcas, molecular e morfológica, estas apresentaram-se ligadas a uma distância de 0,0 cM com 0% de freqüência de recombinação (LOD= 1000), demonstrando que o marcador molecular está relacionado à anomalia. A sequência SCAR apresentou similaridade a um EST de 632 pb do banco de dados GenBank e a um consenso de 841pb do banco de dados FORESTs-FAPESP, os quais apresentaram o domínio Bet v 1, uma família de proteínas relacionadas à defesa da planta. Como a região em estudo está relacionada a uma família multigênica, esta se apresentou em várias... / From a controlled crossing between two normal genitors without parentage from relationship of a seedling nursery for commercial crops of Suzano Papel e Celulose it was observed a lethal anomaly in Eucalyptus grandis full sib family F1. The abnormal plants had reduced height, lack of apical dominance, drastic reduction in the leaf area and an alteration in leaf blade. Segregation ratio was 3:1 (3 normal plants : 1 anomalous plant). Thus, this anomaly is probably inherited in a mendelian manner (χ2=2,32; p>0,1). By using the BSA (Bulked Segregant Analysis) approach used with RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers, it was possible to identify one marker linked to this anomaly, which was later converted to SCAR (Sequence Characterized Amplified Region). The SCAR sequence was similar to ESTs (Expressed Sequence Tag) from FOREST-FAPESP database, hence, it is inside a genome region that is supposed to be directly or indirectly involved in the anomaly character. Based on such pieces of information, the present research had as main objective to carry out the molecular characterization of the genomic region related to the anomaly observed in eucalyptus seedlings. During the linkage analyses of molecular and morphologic markers, the latter presented 0% recombination frequency and a distance of 0 cM with LOD=1000. The SCAR sequence was similar to EST of 632 bp from GenBank and a consensus of 841 bp from FORESTs, which presented the Bet v 1 domain, a protein family related to plant defense. As the analyzed region is related to a multigenic family, it was observed in several copies in the eucalyptus genome, making difficult its cloning. By the analyses carried out both in FORESTs and GenBank, it was noticed that the similarity between SCAR and EST is restricted to SCAR 5’ region. In the 3’race technique it was verified that EST 3’ region... (Complete abstract click electronic access below)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-10-03T15:51:36Z No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaVaqueiroFigueiredo.pdf: 2412111 bytes, checksum: aac5f57c499392efd2a7403283c9a6e2 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-11-21T12:49:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaVaqueiroFigueiredo.pdf: 2412111 bytes, checksum: aac5f57c499392efd2a7403283c9a6e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-21T12:49:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaVaqueiroFigueiredo.pdf: 2412111 bytes, checksum: aac5f57c499392efd2a7403283c9a6e2 (MD5) / As anomalias cromossômicas são a causa mais frequentemente descrita na literatura para explicar a etiologia das malformações congênitas, especialmente em casos que envolvem cardiopatia congênita (CC) e deficiência intelectual (DI). Esse estudo tem o objetivo de identificar a contribuição de diferentes técnicas de citogenética clássica e molecular para o diagnóstico genético de pacientes com CC e DI e outras possíveis malformações congênitas. Avaliamos a aplicação de um fluxograma de diagnóstico uilizando as técnicas de cariótipo, MLPA (do inglês, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) e CMA (do inglês Chromosomal Microarrays). Foram selecionados 20 pacientes portadores de diferentes cardiopatias e deficiências intelectuais e suas amostras foram submetidas ao fluxograma diagnóstico proposto. A partir da aplicação do fluxograma foi possível identificar alterações patogênicas ou possivelmente patogênicas em 75% dos casos, confirmando a eficiência dos exames propostos para diagnóstico de CCs e DIs. A identificação de 45% dos pacientes como portadores da Síndrome de deleção 22q11.2 ressalta a importância da triagem dessa alteração submicroscópica em portadores de CCs e DIs. Foram identificados ainda genes-candidatos a explicar a associação entre CC e DI. O estudo apresentado ressalta a importância da diversificação das técnicas de diagnóstico genético para maximização da capacidade diagnóstica, especialmente a partir da inclusão de técnicas de citogenética molecular. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Chromosomal abnormalities are frequently related to the etiology of congenital malformations, especially in cases involving congenital heart defects (CHD) and intellectual disability (ID). This study aims to identify the contribution of different cytogenetic techniques in the diagnosis of patients with intellectual disabilities and congenital heart defects (CHD). We propose the application of a flow chart composed of classical and molecular techniques (karyotype, MLPA and microarray) to identify the contribution of each specific technique in routine diagnosis. Samples from 20 patients with different heart defects and intellectual disabilities were prossessed according to the flowchart. Pathogenic or potentially pathogenic changes were identified in 75% of the cases, thereby confirming the efficiency of the proposed tests for the diagnosis of CHDs and IDs. The identification of 45% of the patients with the 22q11.2 deletion syndrome emphasizes the importance of screening this alteration in patients with CHDs. We also suggest candidate genes to explain the association between CHDs and IDs. The present study emphasizes the importance of diverse genetic diagnostic techniques to maximise diagnostic capacity, particularly the inclusion of molecular cytogenetic techniques.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, 2015. / Submitted by Patrícia Nunes da Silva (patricia@bce.unb.br) on 2015-11-17T20:13:44Z No. of bitstreams: 1 2015_MariaTeresaAlvesdaSilvaRosa_Parcial.pdf: 1419262 bytes, checksum: 0e082b1100e235970a60a2ab3ab92784 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-11-19T10:56:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_MariaTeresaAlvesdaSilvaRosa_Parcial.pdf: 1419262 bytes, checksum: 0e082b1100e235970a60a2ab3ab92784 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-19T10:56:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_MariaTeresaAlvesdaSilvaRosa_Parcial.pdf: 1419262 bytes, checksum: 0e082b1100e235970a60a2ab3ab92784 (MD5) / A deficiência intelectual/atraso de desenvolvimento neuropsicomotor é caracterizada por comprometimento da função cognitiva e déficit em duas ou mais funções adaptativas e afeta cerca de 3% da população mundial, sendo um problema importante de saúde pública. Há várias causas para a deficiência intelectual e as causas genéticas contribuem com uma porcentagem significativa desses casos. A habilidade da análise cromossômica por microarray (CMA) em detectar alterações submicroscópicas tem revolucionado o diagnóstico clínico dos pacientes com deficiência intelectual, distúrbio de comportamento e malformações congênitas. O reconhecimento das variações do número de cópias (coy number variations- CNVs) nesses indivíduos permite um melhor acompanhamento, aconselhamento genético e intervenção terapêutica em alguns casos. O objetivo desse estudo foi descrever as características fenotípicas de pacientes com deficiência intelectual e dismorfias, que apresentam alterações submicroscópicas. Dos 50 pacientes analisados, 36% tiveram CNVs identificados. Desses pacientes,22% tiveram CNVs patogênicos relacionados com o quadro clínico apresentado e 12% tiveram CNVs de significado incerto (variants of unknown significance - VOUS). Em um paciente os CNVs foram herdados de pais fenotipicamente normais e consideradas possivelmente benignas. Dentre as características fenotípicas apresentadas por esses pacientes, as alterações em mãos e membros são as mais prevalentes, encontradas 20% dos pacientes, seguida pelas alterações oftalmológicas observadas 14%. Esse estudo reforça a importância da realização da análise cromossômica por microarray como método diagnóstico em pacientes com deficiência intelectual e dismorfias, contribuindo com a descrição de alterações cromossômicas raras ou não previamente descritas na literatura. ___________________________________________________________________________ ABSTRACT / Intellectual disability/developmental delay is characterized by significantly impaired cognitive functioning and deficit in two or more adaptive behaviors. It affects about 3% of the world´s population and is a major public health problem. There are many causes of intellectual disability and genetic causes contribute to a significant percentage of cases. The ability of chromosome microarray analysis (CMA) to detect submicroscopic genetic abnormalities has revolutionized the clinical diagnostic approaches to individuals with intellectual disability, neurobehavioral phenotypes and congenital malformations. The identification of copy number variations in these patients may allow a better follow-up, genetic counseling and therapeutic interventions in some cases. The aim of this study was to describe the phenotypic characteristics of patients with intellectual disability and dysmorphisms carrying submicroscopic chromosome abnormalities. In our 50 patient cohort, 36% had non-polymorphic CNVs. Among the patients, 22% had pathogenic CNVs related to the phenotype and 12% had variants of unknown significance (VOUS). In one patient CNVs were inherited from healthy parents and were considered to be benign. Among clinical signs present by these patients, hands and feet malformations are the most prevalent, found 20%, followed by ophthalmological abnormalities in 14%. This study reinforces the importance of performing chromosome microarray analysis as a diagnostic tool for patients with intellectual disability and dysmorphisms, contributing to the description of rare and novel chromosome abnormalities.