CAVALCANTE, Marcelo Casimiro. Visitantes florais e polinização da castanha-do-brasil (Bertholletia excelsa h. & b.) em cultivo na amazônia central. 2008. 77 f . : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Zootecnia, Fortaleza-CE, 2008 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-04T14:35:55Z No. of bitstreams: 1 2008_dis_mccavalcante.pdf: 4677248 bytes, checksum: 4340f234a96bd5d1a31f3324c2e71f87 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-04T14:36:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_dis_mccavalcante.pdf: 4677248 bytes, checksum: 4340f234a96bd5d1a31f3324c2e71f87 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-04T14:36:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_dis_mccavalcante.pdf: 4677248 bytes, checksum: 4340f234a96bd5d1a31f3324c2e71f87 (MD5) Previous issue date: 2010 / The research was carried out in Aruanã farm, county of Itacoatiara, in the state of Amazonas, Brazil, in an area of 3,600 ha cultivated Brazil nut tree (Bertholletia excelsa). Data were collected from October to December 2007, to investigate floral visitors and the pollination of grafted Brazil nut trees cultivated in Central Amazon Forest, aiming to maximize the crop productivity. Floral biology and pollination requirements of this crop were assessed as well as richness, diversity and abundance of floral visitors in relation to the flowering phase of the trees (5, 25 and 50%); foraging behavior of bees visiting the flowers, initial fruit set and number of seeds set per fruit in hand and bagging pollination experiments (open pollination, restricted pollination, hand cross-pollination, hand self-pollination and hand geitonogamy). Results showed that 19 bee species, belonging to three Families, visited the flowers all-day long collecting nectar and pollen. Richness, diversity and abundance varied according to the blooming stages, showing increments to the former two and decrease in bee abundance per tree as blooming progressed. The most abundant and frequent species in the area during the whole blooming period were Xylocopa frontalis (63%) and Eulaema mocsaryi (12%). Natural pollination levels found showed to be lower than the crop’s potential observed by hand pollination. The Brazil nut tree allows geitonogamy (3.85%) in initial fruit set, but its level is significantly lower (p>0,01) than that of hand cross-pollination (19.33%), which needs biotic pollinators, in this case large-sized bees, to accomplish successful pollination. The number of viable seeds varied significantly (p>0.05) among treatments showing that open pollination and hand cross-pollination produced similar results between them, but greater than geitonogamy. The forging behavior of E. mocsaryi and X. frontalis led to the conclusion that they are the main pollinators of ertholletia excelsa under cultivation in that area. Richness, diversity and abundance of flora visitors and potential pollinators can be related to the surrounding forest which provides adequate environment to keep pollinators in periods of the year when the crop is not blooming / A pesquisa foi realizada na Fazenda Agropecuária Aruanã, município de Itacoatiara, Estado do Amazonas, numa área de 3600 ha de cultivo de castanheira-dobrasil (Bertholletia excelsa). Os dados foram coletados de outubro a dezembro de 2007, investigando os visitantes florais e a polinização da castanheira-do-brasil enxertada em cultivo na Amazônia Central, visando maximizar a produtividade da cultura. Foram estudados a biologia floral e os requerimentos de polinização da espécie em cultivo; a riqueza, diversidade e abundância dos visitantes florais em função do período de florescimento da cultura (5, 25 e 50%); o comportamento de forrageio das abelhas visitantes florais, bem como o vingamento inicial e número de sementes por fruto nos diferentes testes de polinização (polinização aberta, restrita, manual cruzada, geitonogamia manual e autopolinização manual). Os resultados mostraram que 19 espécies de abelhas, de três famílias, coletaram néctar e pólen durante todo o dia. A riqueza, diversidade e abundância de visitantes florais variaram em função do estágio de florescimento da cultura, havendo crescimento das duas primeiras com o aumento do florescimento, e queda em abundância por árvore. As espécies de abelhas mais abundantes e freqüentes na área de estudo, durante todo o período da florada, foram Xylocopa frontalis (63%) e a Eulaema mocsaryi (12%). Os níveis de polinização natural da cultura encontraram-se abaixo do seu potencial de vingamento quando comparados com a polinização induzida manualmente. A castanheira permite pequeno percentual de geitonogamia (3,85%) para o vingamento inicial, porém este é significativamente menor (p>0,01) que a polinização cruzada manual (19,33%), a qual necessita de polinizadores bióticos. O número de sementes viáveis diferiu significativamente (p>0,05) entre os tratamentos, onde a polinização natural e polinização cruzada manual foram semelhantes entre si e superiores à geitonogamia. Conclui-se que, em função do comportamento de forrageio, as espécies E. mocsaryi e X. frontalis podem ser considerados os principais polinizadores de Bertholletia excelsa sob cultivo. A riqueza, diversidade e abundância de visitantes florais e polinizadores potenciais podem estar relacionadas à floresta do entorno que promove ambiente propício para manutenção dos mesmos no período de não florescimento da cultura

Orientador: Mario Roberto Marostica Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-14T08:09:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Poeta_PaulaTelles.pdf: 385218 bytes, checksum: 2bf4aaf0b22dbeace1a8f8016c3145ef (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O objetivo do presente trabalho foi avaliar a qualidade nutricional da castanha do Brasil, enfatizando sua qualidade protéica e aminoacídica, sua composição em ácidos graxos e as alterações na composição corpórea de ratos Wistar decorrentes de sua ingestão em diferentes proporções na forma de torta desengordurada. Assim o estudo se iniciou com o recebimento das amêndoas da castanha do Brasil, provenientes da indústria Juta e CastanhaÒ, localizada na cidade de São Paulo. Em seguida procedeu-se à sua prensagem, utilizando a prensa ERT -60-II da Scott TechÒ, empresa localizada no município de Vinhedo ¿ SP. A composição centesimal das fontes protéicas utilizadas no estudo, torta desengordurada de castanha do Brasil e caseína, (utilizada como proteína padrão) foi determinada. A partir desses dados, foram confeccionadas as dietas dos animais, com 12% de proteína, com base na dieta AIN-93G para roedores. As dietas continham diferentes teores de torta e caseína como fontes de proteína, resultando em quatro dietas diferentes, sendo elas: G1: 100% caseína; G2: 35% torta/ 65%caseína; G3: 25%torta/ 75%caseína; G4: 12.5%torta/ 87.5% caseína. O ensaio biológico contou com 32 animais, divididos em quatro grupos de oito animais cada, mantidos em gaiolas separadas, sob ciclo claro/escuro de 12 horas, com temperatura e umidade controladas, durante o período de 28 dias. O consumo de dieta e o ganho de peso foram monitorados. Nos últimos sete dias do período experimental, os animais foram mantidos em gaiolas metabólicas coletando-se urina e fezes para a determinação dos índices de digestibilidade e valor biológico das dietas em estudo. Ao final do experimento, os animais foram sacrificados por decapitação, seu intestino limpo com soro fisiológico e devolvido à carcaça. As carcaças foram congeladas, fatiadas, liofilizadas e trituradas para posterior análise da composição corpórea. O índice químico utilizado para a avaliação da qualidade protéica foi o escore químico de aminoácidos indispensáveis. Para tal, foi realizada a determinação de aminoácidos nas amostras, através de High Performance Liquid Chromatography (HPLC) e derivatização com fenilisotiocianato (PITC). O escore químico revelou que a castanha do Brasil utilizada neste estudo é deficiente em lisina e treonina; entretanto esta amêndoa é muito rica em metionina+cisteína. Os índices nutricionais determinados foram o PER (quociente de eficência protéica), BN (balanço de nitrogênio), Da (digestibilidade aparente) e VBa (valor biológico aparente). Os resultados encontrados foram valores de PER variando entre 2.1 ± 0.03 e 2.7 ± 0.02; os valores de BN variaram de 1.2 ± 0.13 a 3.61 ± 0.04; a Da apresentou percentuais que variaram de 90.0 ± 0.78 a 95.1 ± 0.12 ; e os percentuais de VB encontrados variaram de 85.7 ± 3.42 a 92.2 ± 1.13. A análise da composição de ácidos graxos presentes no óleo extraído da castanha do Brasil foi realizado por meio de cromatografia gasosa e derivatização com trifluoreto de boro. O resultado revelou 45.3% de ácido graxo oléico e 27.4% de linoléico. A avaliação da composição corpórea variou entre os grupos alimentados com diferentes proporções das fontes de proteína. Redução de até 36.0% na composição de lipídios da carcaça foi observada no grupo G3 comparado com o grupo padrão; aumento dos conteúdos de proteína, cinza e umidade foram também detectados em todos os grupos alimentados com torta desengordurada de castanha do Brasil / Abstract: The objective of this work was the evaluation of the nutritional quality of the Brazil nut defatted cake. Emphases were done on the protein quality, fatty acid composition and the impact of different proportions of defatted cake on fed to Wistar rats. Nuts were received from ¿Juta e CastanhaÒ company¿, placed in São Paulo city, and were pressed using ERT-60-II press, to obtain the cake. The proximate percent composition of the protein sources used in this study (defatted cake and casein) were done. The feeds were formulated with 12% of protein. The casein of AIN rodent diet was partially replaced by defatted cake as follows: G1(100% casein); G2 (35% defatted cake/65% casein); G3 (25% defatted cake/75% casein); G4 (12.5 defatted cake/87.5% casein). For the biological assay, 32 animals were used. They were divided into 4 groups of 8 animals each housed separately with a regime of 12 h dark/light cicle, under controlled temperature and humidity during 28 days. Diet consumption and weight gain were registered. During last 7 days of experiment, the animals were housed in metabolic cages for urine and feces collection in order to determine digestibility and biological value of the studied protein diet. At the end of the experiment, the animals were sacrificed (decapitation), the intestines were removed for cleaning with physiological solution and returned to the respective carcass, which were frozen, sliced, freeze dried and triturated for further analysis. Chemical Score of indispensable amino acids was used in evaluating protein quality. Amino acids were determined using HPLC and derivatization with phenylisothiocyanante (PITC). The amino acid chemical score revealed that Brazil nut is deficient in lysine and threonine; however, the nut is very rich in methionine+cysteine. The nutritional indices used in this work were PER (Protein Efficiency ratio), NB (Nitrogen Balance), AD (Apparent digestibility) and ABV (Apparent Biological Value). The results were: PER>2.0; NB positive to all groups; AD > 90.0%; all ABV > 85.0%. The fatty acids composition of Brazil Nut was determined using gas chromatography and derivatization with boron trifluoride. The extracted oil had 45.3% oleic and 27.4% linoleic acids. The body composition varied among the groups fed different protein sources. Reduction of 36.0% of carcass lipid composition was achieved in G3 group compared to control group; increasing of protein, ash and moisture contents were also detected in all groups fed with defatted cake. For statistical analysis, SAS System, BC, 2001 software was used. ANOVA was applied and averages values were compared using Tukey test (p<5%) / Universidade Estadual de Campi / Nutrição Experimental e Aplicada à Tecnologia de Alimentos / Mestre em Alimentos e Nutrição

Orientador: Mario Roberto Marostica Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-14T20:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Berno_LucianeIsabel_M.pdf: 1103514 bytes, checksum: 7482258c3423d699ee03f85080189d7a (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar os efeitos do selênio oriundo da torta de castanha do Brasil sobre a concentração dos hormônios da tireóide, níveis de glutationa reduzida e alguns parâmetros bioquímicos de ratos Wistar decorrentes da ingestão de dietas com diferentes proporções de torta de castanha. Assim, o estudo se iniciou com o recebimento das amêndoas de castanha do Brasil, provenientes da indústria Juta e Castanha?, localizada na cidade de São Paulo. Em seguida procedeu-se à sua prensagem para desengorduramento parcial das castanhas ¿ o produto obtido desse processo foi denominado ¿torta desengordurada de castanha¿. Para dar continuidade ao trabalho, foi determinada a composição centesimal das fontes protéicas utilizadas no estudo, torta desengordurada de castanha do Brasil e caseína, utilizada como proteína padrão. A partir desses dados, foram confeccionadas as dietas dos animais com 12% de proteína. As dietas continham diferentes teores de torta e caseína como fontes de proteína, resultando em oito dietas diferentes, sendo elas: G1: 100% caseína com mix-mineral AIN 93G; G2: 100% caseína com mix-mineral AIN 93G elaborado com exclusão de Se; G3: 65% caseína, 35% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G elaborado com exclusão de Se; G4: 65% caseína, 35% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G; G5: 75% caseína, 25% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G elaborado com exclusão de Se; G6: 75% caseína, 25% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G; G7: 87,5% caseína, 12,5% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G elaborado com exclusão de Se; G8: 87,5% caseína, 12,5% torta de castanha do Brasil; com mix-mineral AIN 93G. O ensaio biológico contou com 64 animais, divididos em oito grupos de oito animais cada, acondicionados em gaiolas separadas, sob ciclo claro/escuro de 12 horas, com temperatura e umidade controladas, durante o período de 28 dias do ensaio biológico. O consumo de dieta e o ganho de peso foram monitorados. Ao final do experimento, os animais foram mortos por decapitação e o sangue foi coletado para realização das análises propostas. Os níveis dos hormônios da tireóide apresentaram-se, para todos os grupos, dentro dos parâmetros descritos na literatura como ideais para roedores. Os grupos alimentados com as dietas que continham torta de castanha do Brasil apresentaram níveis de T3 significativamente maiores (1,19 a 1,41 nmol/L) que os encontrados nos grupos alimentados somente com caseína (1,04 e 1,07 nmol/L), o que revela que a torta de castanha do Brasil é um alimento que pode influenciar positivamente o metabolismo da tireóide. A análise da concentração sanguínea de glutationa reduzida revelou que, assim como a caseína (proteína padrão), a torta de castanha do Brasil apresenta características nutricionais que contribuem para a manutenção adequada dos níveis sanguíneos de glutationa (88,49 a 94,70 mg/dl). No entanto, outros fatores, que não só as diferentes concentrações de selênio consumidas pelos animais influenciaram os níveis de glutationa SH sanguínea encontrados. Os resultados dos parâmetros bioquímicos analisados, glicemia (79,05 a 139,76 mg/dl) e colesterol (34,73 a 87,42 mg/dl), levaram à conclusão de que torta de castanha do Brasil, não só influencia positivamente o metabolismo da tireóide, mas também o metabolismo dos glicídios e lipídeos. Para a análise estatística utilizou-se o software SAS INSTITUTE (1999). A análise de variância (ANOVA) foi calculada e as médias comparadas por meio do teste de Tukey, com 5% de significância / Abstact: The objective of this study was to evaluate the effects of selenium of the defatted cake from Brazil nuts on the concentrations of thyroid hormones, levels of reduced glutathione and some biochemical parameters of rats resulting from ingestion of diets with different proportions of defatted cake. The study began on receiving the Brazil nuts from Jute and Castanha® industry, located in São Paulo. Then the nuts were pressed partially eliminating the oil - the product of this process was called 'defatted cake' The centesimal composition of protein sources used in the study was determined: defatted cake of the Brazil nut and casein (the later used as protein reference), and diets were prepared with 12% of protein. The diets contained different levels of defatted cake and casein, resulting in eight different diets, which were: Diet 1: (Standard diet) AIN 93G diet (protein source: casein, mineral mix AIN 93); Diet 2: (Control diet) AIN 93G diet (protein source: casein, mineral mix AIN 93 without selenium); Diet 3: AIN 93 Diet (protein sources: 65% casein/35% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN 93 without selenium); Diet 4: AIN 93G diet (protein sources: 65% casein/35% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN 93); Diet 5: AIN 93 Diet (protein sources: 75% casein/25% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN 93 without selenium); Diet 6: AIN 93G diet (protein sources: 75% casein/25% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN-93); Diet 7: AIN 93 Diet (protein sources: 87,5% casein/12,5% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN 93 without selenium); Diet 8: AIN 93G diet (protein sources: 87,5% casein/12,5% Brazil nut defatted cake, mineral mix AIN-93). The assay had 64 animals, divided into eight groups with eight animals each, and packed in separate cages, on cycles light/dark of 12 hours, with controlled temperature and humidity during the 28 days of the assay. The consumption of diet and weight gain was monitored. At the end of the experiment, the animals were killed by decapitation and blood was collected to perform the analysis proposed. The levels of thyroid hormones showed an increase for all groups, remaining the value described in the literature as ideal for rodents. The groups fed the diets containing defatted cake of the Brazil nut showed higher levels of T3 than those found in the groups fed only casein, which shows that Brazil nut cake may positively influence the thyroid metabolism. The analysis of blood concentration of reduced glutathione revealed that the Brazil nut defatted cake presents nutritional characteristics that contribute to the maintenance of adequate blood levels of glutathione. However, other factors, independent of selenium concentrations consumed by the animals influenced the levels of blood glutathione. The biochemical parameters examined, glucose and cholesterol, lead to the conclusion that the Brazil nut defatted cake influence positively not only the thyroid metabolism, but also the metabolism of carbohydrates and lipids / Mestrado / Nutrição Experimental e Aplicada à Tecnologia de Alimentos / Mestre em Alimentos e Nutrição

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / A pesquisa foi realizada na Fazenda AgropecuÃria AruanÃ, municÃpio de Itacoatiara, Estado do Amazonas, numa Ãrea de 3600 ha de cultivo de castanheira-dobrasil (Bertholletia excelsa). Os dados foram coletados de outubro a dezembro de 2007, investigando os visitantes florais e a polinizaÃÃo da castanheira-do-brasil enxertada em cultivo na AmazÃnia Central, visando maximizar a produtividade da cultura. Foram estudados a biologia floral e os requerimentos de polinizaÃÃo da espÃcie em cultivo; a riqueza, diversidade e abundÃncia dos visitantes florais em funÃÃo do perÃodo de florescimento da cultura (5, 25 e 50%); o comportamento de forrageio das abelhas visitantes florais, bem como o vingamento inicial e nÃmero de sementes por fruto nos diferentes testes de polinizaÃÃo (polinizaÃÃo aberta, restrita, manual cruzada, geitonogamia manual e autopolinizaÃÃo manual). Os resultados mostraram que 19 espÃcies de abelhas, de trÃs famÃlias, coletaram nÃctar e pÃlen durante todo o dia. A riqueza, diversidade e abundÃncia de visitantes florais variaram em funÃÃo do estÃgio de florescimento da cultura, havendo crescimento das duas primeiras com o aumento do florescimento, e queda em abundÃncia por Ãrvore. As espÃcies de abelhas mais abundantes e freqÃentes na Ãrea de estudo, durante todo o perÃodo da florada, foram Xylocopa frontalis (63%) e a Eulaema mocsaryi (12%). Os nÃveis de polinizaÃÃo natural da cultura encontraram-se abaixo do seu potencial de vingamento quando comparados com a polinizaÃÃo induzida manualmente. A castanheira permite pequeno percentual de geitonogamia (3,85%) para o vingamento inicial, porÃm este à significativamente menor (p>0,01) que a polinizaÃÃo cruzada manual (19,33%), a qual necessita de polinizadores biÃticos. O nÃmero de sementes viÃveis diferiu significativamente (p>0,05) entre os tratamentos, onde a polinizaÃÃo natural e polinizaÃÃo cruzada manual foram semelhantes entre si e superiores à geitonogamia. Conclui-se que, em funÃÃo do comportamento de forrageio, as espÃcies E. mocsaryi e X. frontalis podem ser considerados os principais polinizadores de Bertholletia excelsa sob cultivo. A riqueza, diversidade e abundÃncia de visitantes florais e polinizadores potenciais podem estar relacionadas à floresta do entorno que promove ambiente propÃcio para manutenÃÃo dos mesmos no perÃodo de nÃo florescimento da cultura / The research was carried out in Aruanà farm, county of Itacoatiara, in the state of Amazonas, Brazil, in an area of 3,600 ha cultivated Brazil nut tree (Bertholletia excelsa). Data were collected from October to December 2007, to investigate floral visitors and the pollination of grafted Brazil nut trees cultivated in Central Amazon Forest, aiming to maximize the crop productivity. Floral biology and pollination requirements of this crop were assessed as well as richness, diversity and abundance of floral visitors in relation to the flowering phase of the trees (5, 25 and 50%); foraging behavior of bees visiting the flowers, initial fruit set and number of seeds set per fruit in hand and bagging pollination experiments (open pollination, restricted pollination, hand cross-pollination, hand self-pollination and hand geitonogamy). Results showed that 19 bee species, belonging to three Families, visited the flowers all-day long collecting nectar and pollen. Richness, diversity and abundance varied according to the blooming stages, showing increments to the former two and decrease in bee abundance per tree as blooming progressed. The most abundant and frequent species in the area during the whole blooming period were Xylocopa frontalis (63%) and Eulaema mocsaryi (12%). Natural pollination levels found showed to be lower than the cropâs potential observed by hand pollination. The Brazil nut tree allows geitonogamy (3.85%) in initial fruit set, but its level is significantly lower (p>0,01) than that of hand cross-pollination (19.33%), which needs biotic pollinators, in this case large-sized bees, to accomplish successful pollination. The number of viable seeds varied significantly (p>0.05) among treatments showing that open pollination and hand cross-pollination produced similar results between them, but greater than geitonogamy. The forging behavior of E. mocsaryi and X. frontalis led to the conclusion that they are the main pollinators of ertholletia excelsa under cultivation in that area. Richness, diversity and abundance of flora visitors and potential pollinators can be related to the surrounding forest which provides adequate environment to keep pollinators in periods of the year when the crop is not blooming

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-18T11:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sujii_PatriciaSanae_M.pdf: 17345942 bytes, checksum: f238cb8a37114affa63e3106ca0b1db9 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Matas de terra-firme da Amazônia são formações florestais extensas e podem ser encontradas compondo grandes florestas contínuas. Existem diversos estudos a respeito da estrutura genética populacional de espécies presentes nessas florestas, mas são poucos os trabalhos que buscam compreender a estruturação genética ao longo da Amazônia. A castanheira-do-brasil é uma espécie monotípica, Bertholletia excelsa, endêmica de matas de terra-firme e distribuída ao longo de quase toda extensão da Amazônia. Este trabalho teve como objetivo avaliar a estruturação genética de populações de Bertholletia excelsa ao longo da Amazônia e verificar se a estruturação é influenciada pela distância que as separa. Foi coletado material de 379 indivíduos, pertencentes a nove subpopulações distribuídas em cinco estados brasileiros. Foram desenvolvidos sete marcadores microssatélites que foram somados a outros quatro anteriormente publicados, para genotipagem das amostras. Análises populacionais intra e interpopulacionais foram realizadas para avaliar a diversidade genética e sua estruturação. As estimativas de distância genética encontradas foram correlacionadas com diferentes fatores para encontrar possíveis causas para estruturação. O número de alelos encontrado em cada subpopulação foi baixo. Os alelos presentes em diferentes subpopulações e suas frequências apresentaram grande variação, em especial quando comparadas subpopulações mais distantes. Foi observado FIS negativo para cinco das subpopulações e não significativamente diferente de zero para as quatro demais, indicando excesso de heterozigotos. A estruturação em micro-escala, quando presente, foi pequena. Os valores encontrados para estimativas de estrutura em macro-escala foram bastante variáveis, sendo observada diferenciação genética muito baixa ('teta' = 0,02) a muito alta ('teta' = 0,244). A estrutura genética encontrada pode ser analisada considerando três escalas: (i) intrapopulacional; (ii) entre subpopulações separadas por distâncias moderadas (<500km); e (iii) entre subpopulações separadas por grandes distâncias. Em todas as escalas, foi encontrada correlação significativa entre a estruturação genética e a distância que separa os pares de indivíduos ou subpopulações, indicando ser esse um fator importante para estruturação, mas com influência também de outros fatores, principalmente em escalas geográficas maiores / Abstract: Amazonian upland forests are wide formations and can compose large continuous forests. There are several studies about population genetic structure of species in this kind of forest, but there are few studies that aim to understand the genetic structure along the Amazon. Brazil-nut tree is a monotypic species, Bertholletia excelsa, endemic to upland forests and distributed along almost the entire expanse of the Amazon. This study aimed to evaluate genetic structure of Bertholletia excelsa populations over Amazon and verify if the structuring is influenced by distance between them. Material from 379 individuals was collected in nine subpopulations distributed in five states. Seven microsatellites markers were developed to the species and were used with four others, previously published, to samples genotyping. Analyses within and among populations were performed to evaluate genetic diversity and population structure. Genetic distance estimates were correlated to different potential factors to find possible causes to genetic structure. A few alleles were found in each subpopulation and considerable variation was observed in alleles found in each subpopulation and in their allele frequencies, especially when compared very distant subpopulations. Heterozygote excess was observed in five subpopulations while in the other four subpopulations non-significantly different from zero estimates of FIS were found. Fine-scale structure, when present, was small. Estimates to inter population genetic structure varied from low ('teta' = 0,02) to higt ('teta' = 0,244) values. B. excelsa genetic structure can be analysed considering three different scales: (i) within population; (ii) among moderately distant populations (<500km); and among very distant subpopulations. At all scales, significant correlations were found between genetic structure and geographic distance between pairs of individuals or populations. It may indicate that distance is an important factor to this population's genetic structure, but probably there are other factors acting together, especially at great geographical scales / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Indivíduos obesos apresentam níveis elevados de estresse oxidativo quando comparados com controles de peso eutrófico. Isto pode ser atribuído a uma série de fatores, com destaque para a ingestão reduzida de substâncias antioxidantes. Outro aspecto a ser considerado é a presença de polimorfismos em genes que codificam para enzimas antioxidantes, como é o caso do Pro198Leu no gene da enzima glutationa peroxidase 1 (GPx 1). Portanto, este trabalho teve como objetivos estudar as relações entre obesidade, marcadores de estresse oxidativo e o polimorfismo Pro198Leu no gene da GPx1, além de verificar as respostas destes parâmetros à ingestão de castanhas-do-brasil como fonte de selênio (Se). Participaram do estudo 37 mulheres em idade reprodutiva, que não apresentavam diabetes mellitus, doenças da tireóide; não ingeriam suplementos de minerais e vitaminas, medicamentos para redução de peso ou hipolipemiantes, e não eram tabagistas. Foram utilizados os seguintes marcadores bioquímicos: concentrações de Se plasmático, eritrocitário e nas unhas; atividade eritrocitária total da GPx; concentrações urinárias de 8-isoprostanos; concentrações plasmática de TBARS; avaliação de danos em DNA; perfil lipídico sérico; além da determinação dos genótipos relativos àquele polimorfismo. Cada unidade de castanha forneceu, em média, 290 &#181;g do mineral. Na fase pré-suplementação, 100% das pacientes estavam deficientes em Se. As concentrações eritrocitárias (60,5±22,6 x 205,9±42,0 &#181;g/L; p=0.000) e plasmáticas (55,7±13,3 x 132,5±34,9 &#181;g/L; p=0.000) deste mineral aumentaram significativamente na fase pós-suplementação. O mesmo perfil foi observado para a atividade eritrocitária total de GPx (36,6±17,1 x 53,6±20,4 U/gHb; p=0.000) e para as concentrações plasmáticas de TBARS (5,0±3,7 x 7,6±3,3 &#181;mol/L; p=0.000). As concentrações urinárias de 8-isoprostanos não apresentaram alterações significativas após a ingestão das castanhas (25,1±14,2 x 21,8±15,6 ng/mmol creat.). E o mesmo ocorreu com os níveis de danos em DNA (77,3±21,6 x 72,2±28,1 &#181;m). Com relação ao perfil lipídico sérico, não foram observadas mudanças significativas nas concentrações de colesterol total (171,0±28,8 x 175,5±26,6 mg/dL), LDL-c (114,0±29,6 x 109,3±22,8 mg/dL), VLDL-c (19,6±9,4 x 21,7±8,3 mg/dL) e triacilgliceróis (110,3±87,9 x 108,6±41,5 mg/dL). Entretanto, as concentrações de HDL-c apresentaram elevação significativa após o consumo das castanhas (37,6±13,6 x 44,5±13,4 mg/dL; p<0.00001). Este aumento também promoveu uma redução significativa nos valores dos índices de Castelli I (5,0±1,8 x 4,2±1,1; p<0.0002) e II (3,4±1,7 x 2,7±1,0; p<0.0004), preditores do risco cardiovascular. A frequência dos genótipos foi de 48,7% para Pro/Pro, 37,8% para Pro/Leu e 13,5% para Leu/Leu. Não foram verificadas diferenças estatisticamente significativas nos níveis de Se e na atividade da GPx entre os genótipos, nas duas fases. Entretanto, houve correlação positiva entre as concentrações eritrocitárias de Se e a atividade da GPx em ambas as fases apenas para o grupo Pro/Pro. Os resultados obtidos no ensaio do cometa foram significativamente diferentes entre os genótipos e revelaram que participantes Pro/Pro apresentaram redução na quantidade de danos em DNA após a ingestão das castanhas, o que não ocorreu naquelas Pro/Leu e Leu/Leu agrupadas. Além disso, aquelas Leu/Leu apresentaram valores de danos significativamente maiores em relação às Pro/Pro. As alterações observadas nos níveis de TBARS e lipídeos séricos não foram relacionadas aos genótipos. Também não foram verificadas alterações nas concentrações urinárias de 8-isoprostanos entre os diferentes genótipos. Estes dados sugerem um efeito benéfico do consumo de castanha-do-brasil como fonte de Se e também de ácidos graxos mono e poliinsaturados. Demonstrou-se também a influência do polimorfismo Pro198Leu no gene que codifica para a GPx1 sobre as concentrações sanguíneas de Se e a atividade eritrocitária total da GPx. Pode-se concluir que há uma interação entre este polimorfismo e o status de Se, bem como dos níveis antioxidantes. / Obese subjects present high oxidative stress levels when compared to those with normal weight. This characteristic can be attributed to several factors, mainly the low intake of antioxidant compounds. Another aspect to be taken into account is the presence of polimorphisms in genes of antioxidant enzymes, such as the Pro198Leu in the glutathione peroxidase 1 (GPx1) gene. The objectives of this work were to study the relations among obesity, oxidative stress markers, and the GPx1 Pro198Leu polymorphism, and to verify the responses of these parameters to the intake of Brazil nuts as a selenium (Se) source. Thirty seven women in reproductive age have participated in the study. They did not present diabetes mellitus, thyroid diseases, intake of vitamins and minerals supplements, medicines for weight loss or for cholesterol levels management, and smoking habit. The following biochemical markers were determined: plasma, erythrocyte and nails Se concentrations; total erythrocyte GPx activity, urine 8-isoprostanes concentration; plasma TBARS concentration; DNA damage; serum lipid profile; and genotyping of the polymorphism. Each unit of Brazil nut was estimated to provide &#8776; 290 &#181;g of Se. In the pre-supplementation phase, 100% of the subjects presented Se deficiency. The erythrocyte (60.5±22.6 x 205.9±42.0 &#181;g/L; p=0.000) and plasma (55.7±13.3 x 132.5±34.9 &#181g/L; p=0.000) concentrations of this mineral had presented a significant raise in the post-supplementation phase. The same profile was observed for the GPx activity (36.6±17.1 x 53.6±20.4 U/gHb; p=0.000) and for the plasma TBARS (5.0±3.7 x 7.6±3.3 &#181;mol/L; p=0.000) concentrations. There were no significant changes in the urinary 8-isoprostanes (25.1±14.2 x 21.8±15.6 ng/mmol creat.) concentration. The same pattern was observed in relation to the DNA damage levels (77.3±21.6 x 72.2±28.1 &#181;m). Regarding the serum lipid profile, it was not found significant changes in the total cholesterol (171.0±28.8 x 175.5±26.6 mg/dL) concentrations, LDL-c (114.0±29.6 x 109.3±22.8 mg/dL), VLDL-c (19.6±9.4 x 21.7±8.3 mg/dL) and triglycerides (110.3±87.9 x 108.6±41.5 mg/dL). However, there was a significant increase in the HDL-c (37.6±13.6 x 44.5±13.4 mg/dL; p<0.00001) concentrations after the Brazil nuts intake. This increase also had promoted a significant reduction in the Castelli I (5.0±1.8 x 4.2±1.1; p<0.0002) and II (3.4±1.7 x 2.7±1.0; p<0.0004) indexes, which are predictors of cardiovascular risk. The genotype frequency was 48.7% for Pro/Pro, 37.8% for Pro/Leu, and 13.5% for Leu/Leu. Se levels and GPx activity were not significantly different between the genotypes, in both pre and post-supplementation phases. However, there was a positive correlation between Se erythrocyte concentrations and GPx activity in both phases only in the Pro/Pro group. The results from the comet assay were significantly different between the genotypes and showed that subjects who were Pro/Pro presented a reduction in the levels of DNA damage after the Brazil nuts intake, which did not happen in those Pro/Leu and Leu/Leu grouped. Moreover, the Leu/Leu group showed higher damage levels when compared to that Pro/Pro. The changes in the plasma TBARS levels and in the serum lipid profile were unrelated to the genotypes. The urinary 8-isoprostanes concentrations also did not present any change regarding the genotypes. The data suggest a beneficial effect of the Brazil nut intake as a source of Se and possibly of mono and polyunsaturated fatty acid. The influence of the GPx1 Pro198Leu polymorphism on the blood Se concentration and GPx activity could be demonstrated. It could be concluded that there is an interaction between that polymorphism and the Se status, as well as the antioxidant levels.

Conciliar desenvolvimento local com a conservação da maior floresta tropical do mundo é um desafio emergente. Uma das estratégias que tem sido estimuladas em prol desse objetivo é a promoção de cadeias comerciais de produtos florestais não madeireiros. A castanha-do-brasil (Bertholletia excelsa Bonpl.) é uma das espécies mais importantes do contexto amazônico, considerada uma espécie chave para a contribuição com a conservação da floresta e dos meios de vida associados à ela. O presente estudo teve por objetivo investigar se o extrativismo de base comunitária e tradicional da castanha em Almeirim - município situado na região da calha norte paraense - representa de fato uma atividade chave para garantir a conservação da floresta aliada ao desenvolvimento local. Para isso, foram definidas questões norteadoras a serem focadas no desenvolvimento da pesquisa: (I) A organização social das comunidades extrativistas, bem como o desenvolvimento e amadurecimento de instituições coletivas atuantes no gerenciamento da produção e comercialização da castanha promovem melhorias nas diferentes dimensões dos meios de vida comunitários?; (II) Existe sustentabilidade ecológica na produção de castanha oriunda dos castanhais de Almeirim? O que a dinâmica populacional dos castanhais explorados de Almeirim pode nos dizer sobre o futuro das populações de castanheiras na Amazônia? Foi verificado que de fato diferentes níveis de organização social dos sistemas socio-ecológicos aonde se constituem as atividades extrativas da castanha em Almeirim contribuem de modo distinto e significativo para a manutenção e melhoria dos capitais humano, social, físico, financeiro e natural dos meios de vida das comunidades da região de estudo. Também verificou-se que a coleta de sementes de castanha-do-brasil, realizada há pelo menos um século na região, não representa uma ameaça à manutenção das populações de Bertholletia excelsa, uma vez que essa parece atingir alto nível de estabilidade e resistência à remoção de suas sementes. Pode-se considerar, portanto, que o extrativismo de castanha-do-brasil no município de Almerim é uma estratégia de alta relevância para a manutenção sociocultural das comunidades estudadas, bem como melhoria de seus meios de vida e que não provoca prejuízos a dinâmica das populações de castanheiras. / Harmonizing local development with the world largest rain forest conservation is an emerging challenge. One of the strategies that has been stimulated for this goal is the promotion of non-timber forest products commercial chains. Brazil Nut is one of the most important product in this Amazon context, considered a cornerstone specie for the contribution of the forest and the local living ways associated. This study aimed to investigate if Brazil Nut\'s extractivist communities and traditional way of extractivism in Almeirim - municipality located north channel of Amazon river in Pará state - represent in fact a key activity to guarantee forest conservation allied to the local development. In this regard, directional questions have been defined to be focus in the development of research: (I) Does social organization of the extractive communities, as well as the development and maturing of collective institutions that act in the production and commercialization management of Brazil Nut, promote better conditions of the different community livelihoods? (II) Is there ecological sustainability of the Brazil Nut\'s extraction in the Almeirim\'s Brazil Nut\'s stands? What does population dynamics of the explored Brazil Nut\'s stands in Almeirim can tell us about the future of Brazil Nut\'s stands in Amazonia? It has been verificated that the different levels of social organization in the social ecological systems where the Brazil Nut\'s extraction activities in Almeirim contributes distinctly and significantly to the maintenance and upgrade of human, social, physical, financial and natural community assets of livelihoods in the study area. It was also verified that Brazil nut seed collection, which has been carried out for at least a century in the region, does not represent a threat to the maintenance of the populations of Bertholletia excelsa, since the specie seems to reach a high level of stability and resistance to seed removal. It can be considered, therefore, that Brazil nut extractivism in the municipality of Almeirim is a highly relevant strategy for the socio-cultural maintenance of the communities studied, as well as the improvement of their livelihoods and that does not cause damages to the dynamics of Brazil nut populations.

Submitted by Nadiele Pacheco (nadielep@gmail.com) on 2018-10-31T21:27:11Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) / Rejected by PPGCIFA Ciências Florestais e Ambientais (ppgcifa@ufam.edu.br), reason: Retificar o Departamento para FCA ( Faculdade de Ciências Agrárias) on 2018-12-01T02:29:57Z (GMT) / Submitted by Nadiele Pacheco (nadielep@gmail.com) on 2018-12-01T02:32:48Z No. of bitstreams: 3 Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by PPGCIFA Ciências Florestais e Ambientais (ppgcifa@ufam.edu.br) on 2018-12-01T02:36:32Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Rejected by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: O campo "Áreas de conhecimento de acordo com tabela do CNPq" deve ser preenchido com texto da Tabela e não com números. Dúvidas? ddbc@ufam.edu.br on 2018-12-03T12:47:37Z (GMT) / Submitted by Nadiele Pacheco (nadielep@gmail.com) on 2018-12-03T13:17:54Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) / Approved for entry into archive by PPGCIFA Ciências Florestais e Ambientais (ppgcifa@ufam.edu.br) on 2018-12-03T14:41:27Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-12-03T14:54:03Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Nadiele_FINAL.pdf: 2852381 bytes, checksum: 135bd00a8e4219d8895560af7517c1db (MD5) carta_encaminhamento.tif: 485261 bytes, checksum: 7f5b58ea9cfeede6a19ee02a9116c6ac (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-03T14:54:03Z (GMT). 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It also sought to identify the existence of a taxonomic pattern associated with focal Brazil nuts trees, selected according to classes of fruit production, whose information is important for decision making in the application of public policies to favor the conservation and management of these Brazil nuts florests and to improve the quality of life of the agro-extractivists. The research was conducted in the main Brazil nut production regions of the State of Amazonas: Piagaçu Purus Sustainable Development Reserve (Anori city), Jutica Property (Tefé city), Jatuarana Community (Manicoré city), Sítio Gostoso (Amaturá city), Mufuá Community (Lábrea city), Extractive Reserve of Rio Unini (Barcelos city). The floristic diferences were analyzed through cluster analysis and non-metric multidimensional scaling (nMDS) and the taxonomic pattern through indival indicator species, which allows the identification of species or associations of these representative of fruit production classes. The multivariate variance analysis, based on permutations (Permanova), was used to analyze the significant differences among Brazil nuts florests, at 5% probability, using floristic dissimilarity analysis called Adonis. In this context, all individuals with DBH≥ 10 cm, neighboring the selected Brazil nuts trees, were marked and identified in 15 circular plots of 15 meters radius in each Brazil nuts florests. The plots were installed around Brazil nuts trees selected from the fruit production class (5 high, 5 medium and 5 low productivity). As a result, 3039 individuals were recorded in the six Brazil nuts florests, and the Jatuarana locality was the one with the highest number of individuals (577) represented in 133 species. The species Trymatococcus amazonicus (Pama) stood out among the five most abundant species in four of the six Brazil nuts florests: Jatuarana, Mufuá, Sítio Gostoso and Uixi. The Brazil nuts florests with the highest floristic similarity were Sítio Gostoso and Mufuá. However, in the context of the production classes there was no pattern of grouping of plots of the same class, as evidenced by nMDS. As far as local (alpha) diversity is concerned, the forest environments studied have great floristic diversity, since they presented a Shannon-Weaver index between 3.65 and 4.19; these values of diversity were not statistically significant (Kruskal Wallis test) among the localities. However, in the case of floristic diferences, significant diferences were observed among the six localities, according to (remains / andonis p-value = 0.001). The analysis of a taxonomic pattern associated to the production classes showed interesting results in each Brazil nut florests, especially Unini, where a clear pattern was not obtained, with only one (01) species meeting the selection criteria; this may be the reflection of the lower alpha diversity observed at this site and the arrangement, which should be investigated in future works. Goupia glabra is a species that has been associated to areas of medium and high productivity in the Brazil nut florests Jutica, Sítio Gostoso and Uixi, which deserves additional studies in order to investigate its ecological association with the Brazil nuts trees of these different localities. / Bertholletia excelsa, conhecida popularmente como castanheira, é uma espécie florestal que produz um fruto chamado ouriço, o qual é coletado por populações tradicionais que comercializam suas amêndoas, castanha-do-brasil, como alternativa na composição da renda familiar. Este estudo avaliou a diversidade vegetal associada a castanheiras nativas no Amazonas, por meio da comparação das diferenças florísticas entre e dentro de seis castanhais. Buscou também identificar a existência de um padrão taxonômico associado às castanheiras focais, selecionadas segundo classes de produção de frutos, cujas informações são importantes para tomadas de decisões na aplicação de políticas públicas a favorecer a conservação e manejo desses castanhais e para melhoria da qualidade de vida dos agroextrativistas. A pesquisa foi conduzida nas principais regiões produtoras de castanha-do-brasil do Estado do Amazonas: Reserva de Desenvolvimento Sustentável Piagaçu Purus (Anori), Propriedade do Jutica (Tefé), Comunidade Jatuarana (Manicoré), Sítio Gostoso (Amaturá), Comunidade Mufuá (Lábrea), Reserva Extrativista do Rio Unini (Barcelos). As diferenças florísticas foram analisadas por meio da análise cluster e Escalonamento Multidimensional Não Métrico – nMDS e o padrão taxonômico por meio do método espécies indicadoras-IndVal, que permite identificar espécies ou associações destas representativas das classes de produção de frutos. Empregou-se a análise de variância multivariada, baseada em permutações (Permanova), para analisar as diferenças significativas entre os castanhais, a 5% de probabilidade, usando análise de dissimilaridade florística chamada Adonis. Neste contexto, todos os indivíduos com DAP≥ 10 cm, vizinhos às castanheiras selecionadas, foram marcados e identificados em 15 parcelas circulares de 15 metros de raio em cada castanhal. As parcelas foram instaladas ao redor de castanheiras selecionadas a partir da classe de produção de frutos (5 de alta, 5 de média e 5 de baixa produtividade). Como resultados, foram registrados 3039 indivíduos nos seis castanhais, sendo que a localidade Jatuarana foi a que apresentou o maior número de indivíduos (577) representados em 133 espécies. A espécie Trymatococcus amazonicus (Pama) se destacou entre as cinco primeiras espécies mais abundantes em quatro dos seis castanhais: Jatuarana, Mufuá, Sítio Gostoso e Uixi. Os castanhais com maior similaridade florística foram Sítio Gostoso e Mufuá. Porém, no contexto das classes de produção não se observou um padrão de agrupamento das parcelas de mesma classe, conforme evidenciado pelo nMDS. No que compete à diversidade local (alfa), os ambientes florestais estudados possuem grande diversidade florística, pois apresentaram índice de Shannon-Weaver entre de 3,65 a 4,19; estes valores de diversidade não foram estatisticamente significativos (teste Kruskal Wallis) entre as localidades. Entretanto, em se tratando das diferenças florísticas, observou-se diferenças significativas entre as seis localidades, segundo (permanova/adonis p-valor = 0,001). As análises buscando um padrão taxonômico associado às classes de produção, revelou resultados interessantes em cada castanhal, destacando-se o Unini, localidade onde não se obteve um padrão mais evidente, com apenas uma (01) espécie atendendo aos critérios de seleção; isto pode ser o reflexo da menor diversidade alfa observada neste local e pelo arranjo composicional, que deve ser investigado em trabalhos futuros. Goupia glabra é uma espécie que apareceu associada a áreas de média e alta produtividade nos castanhais Jutica, Sítio Gostoso e Uixi, a qual merece estudos adicionais a fim de se investigar sua associação ecológica com as castanheiras destas diferentes localidades.

In the first part of the thesis, protein-ligand interactions were investigated using the chaperone LcrH, from Yersinia as target protein. The structure of a peptide encompassing the amphipathic domain (residue 278-300) of the protein YopD from Yersinia was determined by NMR in 40% TFE. The structure of YopD278-300 is a well defined α-helix with a β-turn at the C-terminus of the helix capping the structure. This turn is crucial for the structure as peptides lacking the residues involved in the turn are unstructured. NMR relaxation indicates that the peptide is not monomeric. This is supported by intermolecular NOEs found from residue Phe280 to Ile288 and Val292 indicative of a multimeric structure with the helical structures oriented in an antiparallel manner with hydrophobic residues forming the oligomer. The interaction with the chaperone LcrH was confirmed by 1H relaxation experiments and induced chemical shift changes in the peptide Protein-ligand interactions were investigated further in the second paper using a different approach. A wide range of substances were used in screening for affinity against the chaperones PapD and FimC from uropathogenic Escherichia coli using 1H relaxation NMR experiments, surface plasmon resonance and 19F NMR. Fluorine NMR proved to be advantageous as compared to proton NMR as it is straight forward to identify binding ligands due to the well resolved 19F NMR spectra. Several compounds were found to interact with PapD and FimC through induced line-broadening and chemical shift changes for the ligands. Data corroborate well with surface plasmon resonance and proton NMR experiments. However, our results indicate the substances used in this study to have poor specificity for PapD and FimC as the induced chemical shift is minor and hardly no competitive binding is observed. Paper III and IV is an investigation of the structural features of the allergenic 2S albumin Ber e 1 from Brazil nut. Ber e 1 is a 2S albumin previously identified as the major allergen of Brazil nut. Recent studies have demonstrated that endogenous Brazil nut lipids are required for an immune response to occur in vivo. The structure was obtained from 3D heteronuclear NMR experiments followed by simulated annealing using the software ARIA. Interestingly, the common fold of the 2S albumin family, described as a right-handed super helix with the core composed of a helix bundle, is not found in Ber e 1. Instead the C-terminal region is participating in the formation of the core between helix 3, 4 and 5. The dynamic properties of Ber e 1 were investigated using 15N relaxation experiments and data was analyzed using the model-free approach. The analysis showed that a few residues in the loop between helix 2 and 3 experience decreased mobility, compared to the rest of the loop. This is consistent with NOE data as long range NOEs were found from the loop to the core region of the protein. The anchoring of this loop is a unique feature of Ber e 1, as it is not found in any other structures of 2S albumins. Chemical shift mapping of Ber e 1 upon the addition of lipid extract from Brazil nut identified 4 regions in the protein where chemical shift perturbations were detected. Interestingly, all four structural clusters align along a cleft in the structure formed by helix 1-3 on one side and helix 4-5 on the other. This cleft is big enough to encompass a lipid molecule. It is therefore tempting to speculate whether this cleft is the lipid binding epitope in Ber e 1.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-03-13T16:38:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Soares Silva - 2017.pdf: 3492036 bytes, checksum: dc2e1dccbf2920f944a35cd9546e6852 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-20T12:16:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Soares Silva - 2017.pdf: 3492036 bytes, checksum: dc2e1dccbf2920f944a35cd9546e6852 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T12:16:54Z (GMT). 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The determinations were performed in triplicate and the results were analyzed by the Statistica software and the mathematical models were generated, tested and validated. In order to obtain a better acceptance of the beverage, in both most accepted extracts in the sensorial analysis a fixed amount of 10,00% (w/v) sugar was added and the amount of preservatives for the reduction of residual taste, reduced. After the definition of the best mixture formulation, determined by global acceptance and purchase intention parameters, the water-soluble extract with the best grade was reprocessed in large scale and stored during 28 days, under 4 degrees refrigeration, evaluating the rheological profile and keeping up with the evolution of physicochemical, microbiological and sensorial analysis parameters. The formulation of water-soluble extract composed by 69.17% (w/w) of water, 9.17% (w/w) of Brazil nut and 21.67% of 10,00% (w/v) sucrose Baru almond was the favorite in the global acceptance test. The mathematical models obtained by the simplex centroid planning achieved better adjustments with the special cubic model proving to be highly predictive. The water-soluble extract presented non-newtonian pseudoplastic fluid behavior. The microbiological determinations did not demonstrate contamination of the beverage over the refrigerated storage time, indicating adequate hygienic handling during the processing and its good biological stability. / Com o objetivo de elaborar a melhor combinação entre amêndoas da Castanha-do-Brasil (Bertholletia excelsa) e Baru (Dipteryx alata Vogel) para o desenvolvimento de um extrato hidrossolúvel misto, com estabilidade físico-química, física e biológica, realizou-se um delineamento de misturas do tipo simplex-centroide, sendo uma mistura ternária entre as amêndoas e Água. O extrato hidrossolúvel a base de Castanha- do-Brasil e Baru obtido foi envasado em garrafas de vidro de 220 mL e pasteurizado em tacho encamisado de aço inoxidável, sendo posteriormente resfriados e estocados a 4 °C até o momento da realização das determinações físico-químicas, físicas, microbiológicas e sensoriais. Tais determinações foram realizadas em triplicata e os resultados analisados geraram modelos matemáticos que puderam ser testados e validados. Com o intuito de obter uma melhor aceitação da bebida, nos dois extratos hidrossolúveis mais aceitos nas análises sensoriais, foram adicionados uma quantidade fixa de açúcar de 10,00% p/v, expressos em sacarose, e reduzidos a quantidade de conservantes para a diminuição do sabor residual. Após estabelecida a melhor formulação da mistura, determinada através da aceitação global e intenção de compra, o extrato hidrossolúvel com a melhor nota foi novamente processado e armazenado durante 28 dias, sob refrigeração a 4° C, para acompanhamento da estabilidade através de parâmetros físico-químicos, microbiológicos, sensoriais e perfil reológico. A formulação de extrato hidrossolúvel composta por 69,17% (p/p) de água, 9,17% (p/p) de Castanha-do-Brasil e 21,67% (p/p) de Baru, adicionado de 10,00% (p/v) de açúcar, expressos em sacarose, foi a preferida no teste de aceitação global. Os modelos matemáticos obtidos pelo planejamento simplex-centroide apresentaram bons ajustes aos dados experimentais. O extrato hidrossolúvel apresentou comportamento de fluido não-newtoniano pseudoplástico. As determinações microbiológicas não demonstraram contaminação da bebida ao longo do tempo de armazenamento refrigerado, indicando manipulação higiênica adequada durante os processamentos e sua boa estabilidade biológica.