Submitted by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-05-05T12:20:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RevisaoTaxonomicaComplexo.pdf: 5608023 bytes, checksum: 439260289b47c13064e39391d0d51ad5 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-05-05T12:22:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RevisaoTaxonomicaComplexo.pdf: 5608023 bytes, checksum: 439260289b47c13064e39391d0d51ad5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-05T12:22:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RevisaoTaxonomicaComplexo.pdf: 5608023 bytes, checksum: 439260289b47c13064e39391d0d51ad5 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O gênero Micrurus é composto por serpentes venenosas de distribuição Neotropical com diversificados padrões de coloração apostemática sendo conhecidas popularmente como cobras corais verdadeiras. Abrangendo aproximadamente 80 táxons, Micrurus está organizado em quatro grupos de espécies diferenciáveis com base no padrão de color, comprimento da cauda e morfologia do hemipênis: (1) grupo monadal tricolor, hemipênis e longo fortemente bifurcado; (2) grupo bicolor, com hemipênis longo e fortemente bifurcado; (3) grupo com coloração em tríades e hemipênis moderadamente alongado (4) grupo com padrão em tríades, com hemipênis curto e bilobado, podendo ser capitado ou não capitado. Inserido no quarto grupo, Micrurus spixii atualmente constitui um complexo contendo quatro subespécies nominais: M. s. spixii presente do norte ao sul da Amazônia central; M. s. martiusi ocorrendo na Amazônia Oriental, Brasil; M. s. obscurus ocorrendo em regiões de floresta a leste dos Andes (noroeste da Bolívia, norte do Peru, leste do Equador e sudeste da Colômbia) e noroeste do Amazonas, no Brasil; e M. s. princeps com populações restritas ao nordeste da Bolívia. Por apresentar caracteres merísticos e morfométricos densamente sobrepostos junto às semelhanças no padrão de coloração e o forte melanismo presente em diversos espécimes, a identificação destas subespécies é imprecisa, tornando questionável a validade das mesmas desde suas primeiras revisões. Neste trabalho, revisamos a taxonomia do complexo explorando caracteres externos (coloração, variação merística e morfométrica) e internos (morfologia hemipeniana e craniana), definido, assim os limites de cada táxon ao longo da distribuição geográfica. A presente dissertação foi organizada em duas seções: 1) Introdução geral onde são apresentadas informações taxonômicas e sistemáticas acerca de Micrurus, com atenção direcionada ao complexo Micrurus spixii; 2) o manuscrito intitulado “Revisão taxonômica das espécies do complexo Micrurus spixii (serpentes, elapidae)”, cujo objetivo foi revisar a taxonomia do complexo, explorando a morfologia interna e externa incluindo novos caracteres e assim delimitando precisamente os limites de cada táxon de acordo com a distribuição geográfica.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-05-04T17:15:51Z No. of bitstreams: 1 TES_HENRIQUE_VIEIRA_FIGUEIRO_COMPLETO.pdf: 4680551 bytes, checksum: 8695b78fe6812f4690586975941c4c31 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-04T17:15:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_HENRIQUE_VIEIRA_FIGUEIRO_COMPLETO.pdf: 4680551 bytes, checksum: 8695b78fe6812f4690586975941c4c31 (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / In the past 10 years, high throughput sequencing has revolutionized evolutionary biology. With the technical advances that emerged with the genome sequencing of model species, it is now possible to apply these techniques to taxonomic groups without any previously available genetic resources. Complete genome sequencing and reduced representation methods have enabled us to explore deeper evolutionary questions, such as detecting ancient hybridization and signatures of selection on a genomic scale. Among the groups that could benefit from these methods is the Panthera genus. The group is composed by five species (P. onca, P. tigris, P. leo, P. pardus and P. uncia), all of which are large felids that exert important ecological role as apex predators in their habitats. Their low densities, alarming rates of habitat loss and chronic conflict with humans, all of them are threatened with extinction in the wild and thus important targets for conservation. One of the species in this group, the jaguar (P. onca), is the only member of the genus currently present in the Neotropical region, and the focus of our study. The jaguar has a color pattern similar to that of the leopard, but a much more robust constitution, with massive jaws and shorter limbs. The present study aims to characterize for the first time the jaguar genome, and to perform comparative analyses with the genomes from all other Panthera species. In addition, we seek to perform population genomic analyses with Brazilian jaguar populations and search for signatures of divergent selection in different regions. We have sequenced four genomic libraries, with an estimated coverage depth of 84x. The complete genome sequence allowed the annotation of 25,441 genes and the description of other genomic features (e.g. ncRNA, microsatellites, numts). Additionally, we have sequenced the genome of a leopard at low coverage, with an estimated depth of 25x. With the addition of these two genomes, we were able obtain a genomic data set containing all five Panthera species, which was used to perform phylogenetic discordance analyses and to detect signatures of selection using a dataset encompassing 13,143 orthologous genes. We were able to demonstrate the presence of hybridization events during the speciation process of the species, as well as signatures of selection in genes potentially involved in important characteristics of these iconic animals. Among them, the jaguar?s robust build, the social behavior of lions, cold environment adaptations in the snow leopard and the tiger?s stripes. Using an exome capture approach, we performed a population genomics study targeting jaguar populations from different Brazilian biomes. In addition to assessments of genetic diversity and population structure, we detected signals of local adaptation using multiple methods. Among the obtained results is the presence of genes under selection that are related to energetic metabolism in the Amazon, body development in the Pantanal and immunity in the Atlantic Forest. Additionally, we observed several pigmentation-related genes under selection in different biomes. Those genes affect not only pigmentation, but also have pleiotropic effects in development and immunity routes. Overall, these results help to understand the evolutionary processes that have shaped the adaptation of Panthera species, and particularly the jaguar, to the environments where they currently live. / Nos ?ltimos 10 anos, o sequenciamento gen?mico de alto desempenho revolucionou a biologia evolutiva. Com os avan?os gerados pelo sequenciamento do genoma completo de esp?cies modelo, agora ? poss?vel aplicar essas t?cnicas em animais com praticamente nenhum recurso gen?tico dispon?vel. O sequenciamento completo de genomas, bem como o uso de t?cnicas de representa??o reduzida, permitem explorar quest?es evolutivas complexas como, por exemplo, detec??o de hibrida??o e assinaturas de sele??o natural em uma escala gen?mica. Dentre os grupos taxon?micos que podem se beneficiar de tais t?cnicas est? o g?nero Panthera. O grupo ? composto por cinco esp?cies atuais (P. onca, P. tigris, P. leo, P. pardus e P. uncia), todas elas apresentando grande porte e atuando como predadores de topo nos ambientes que ocupam. Devido ?s baixas densidades, alarmante perda de habitat e constantes conflitos com humanos, o n?vel de amea?a em que essas esp?cies se encontram ? preocupante. Dentre as esp?cies do grupo, est? a on?a-pintada (P. onca), ?nica integrante do g?nero na regi?o Neotropical e o principal foco deste trabalho. Nesse sentido, o presente estudo busca caracterizar pela primeira vez o genoma da on?a-pintada, incluindo an?lises comparativas com as outras quatro esp?cies do g?nero. Al?m disso, o trabalho tem como objetivo avaliar as popula??es de on?a no Brasil e buscar assinaturas de sele??o divergente nos biomas que ela ocupa. Para o sequenciamento do genoma da esp?cie, foram utilizadas quatro bibliotecas gen?micas, com uma cobertura estimada de 84x. A sequ?ncia do genoma completo permitiu a anota??o de 25.441 genes e a descri??o de outros componentes do genoma (p.ex. ncRNA, microssat?lites, numts). Adicionalmente, foi sequenciado o genoma de um leopardo (P. pardus) com cobertura estimada de 25x. Com esses dois novos genomas, completou-se um conjunto abrangendo todas as cinco esp?cies do g?nero, permitindo a realiza??o de an?lises de discord?ncia filogen?tica para o grupo e detec??o de sele??o positiva utilizando um conjunto de 13.143 genes ort?logos. Foi poss?vel demonstrar eventos de hibrida??o durante o processo de especia??o das esp?cies do g?nero, bem como sinais de sele??o positiva em genes envolvidos em caracter?sticas que se destacam nos grandes fel?deos. Entre eles, fen?tipos potencialmente afetados por genes sob sele??o incluem o cr?nio e membros robustos da on?a-pintada, o comportamento social no le?o, adapta??o ao frio no leopardo das neves e a presen?a de listras no tigre. Com o uso de captura de exoma, que tem como objetivo o sequenciamento do conjunto de exons da esp?cie, foi poss?vel realizar uma nova avalia??o das caracter?sticas gen?ticas de popula??es de on?a-pintada, bem como a detec??o de assinaturas de adapta??o local. Entre os resultados obtidos est? a presen?a de genes sob sele??o relacionados com metabolismo energ?tico em popula??es da Amaz?nia, adapta??es relacionadas com desenvolvimento corporal no Pantanal e imunidade na Mata Atl?ntica. Adicionalmente, foram observados diversos genes de pigmenta??o com assinaturas de sele??o em diferentes biomas. Esses genes, al?m de afetarem a colora??o dos animais, possuem efeitos pleiotr?picos no desenvolvimento e imunidade da esp?cie. Esses resultados auxiliam no entendimento dos processos evolutivos que moldaram a adapta??o das esp?cies do g?nero, e em especial a on?a pintada, aos ambientes que elas ocupam atualmente.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-09T17:46:02Z No. of bitstreams: 1 DIS_CAMILA_CAMARGO_DE_SOUZA_COMPLETO.pdf: 3948791 bytes, checksum: c827f34181e47b84d2dc6c25fa596df9 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-09T17:46:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DIS_CAMILA_CAMARGO_DE_SOUZA_COMPLETO.pdf: 3948791 bytes, checksum: c827f34181e47b84d2dc6c25fa596df9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-09T17:46:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_CAMILA_CAMARGO_DE_SOUZA_COMPLETO.pdf: 3948791 bytes, checksum: c827f34181e47b84d2dc6c25fa596df9 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Gymnophiona M?ller, 1832?with 206 currently recognized species?is the least studied order within Amphibia. The phylogenetic relationships among its members have been historically unstable, with frequent taxonomic changes at the family level due to the recurrent presence of paraphyletic taxa. However, an increase of studies based on morphological and molecular data has built a scaffold of information about the evolutionary relationships among caecilians; even though, a phylogenetic classification of the order has remained a challenge. In 2011 a new taxonomy of Gymnophiona was proposed, where genera were arranged in nine families supposedly monophyletic. This taxonomy was not based on a phylogenetic analysis but on a consensus of the understanding of the evolutionary relationships of the group as inferred by previous studies. However, important conflicts exits among the results and type of analyses performed on these studies. Furthermore, only one study has included the known fossil taxon of Gymnophiona, which despite being fragmented is a valid source of evidence. Due to several and continuous efforts to generate data on caecilians, there is a wealth of hereditary characters available for phylogenetic studies. Thus, it has become crucial to perform a combined analysis of all these data (complete mitochondrial genomes, nuclear DNA sequences, phenotypic characters of extant and fossil taxa) to obtain a phylogenetic hypothesis that maximizes explanatory power. The objective of this study is to infer the evolutionary relationships of Gymnophiona based on a total evidence analysis using parsimony and dynamic homology to evaluate the current taxonomy of the group. Additionally, we also evaluate the effect of different types of alignment (tree versus similarity approaches), the influence of phenotypic characters on a dataset dominated by molecular characters, and the effect of coding indels as missing data. We compiled previously published phenotypic characters, DNA sequences available from GenBank of 47 nuclear and mitochondrial genes of all available taxa, and produced 42 new sequences. When comparing the results obtained from the tree-alignment analysis in POY with those of the similarity alignment in TNT, both recover Rhinatrematidae as sister of Ichthyophiidae + Teresomata. Within Rhinatrematidae, Epicrionops is paraphyletic in all analyses and the relationships within Ichthyophis are unsolved (a polytomy in the strict consensus). POY does not recovered Scolecomorphidae as the sister taxon of all other Teresomata but Typhlonectidae + Caeciliidae. Caecilia is paraphyletic with respect to Oscaecilia and Typhlonectes in relationship to Potamotyphlus. Scolecomorphidae is sister of Herpelidae + Chikilidae. The results of TNT recover a paraphyletic Herpelidae, with Herpele squalostoma sister of Chikilidae. Also, Siphonopidae is non-monophyletic. Indotyphlidae is non-monophyletic in both analyses and Idiocranium is consistently recovered as sister taxon of Dermophiidae. Dermophis is recovered as paraphyletic in the POY analysis, while both Dermophis and Gymnopis are paraphyletic in the TNT analysis. The strict consensus of the molecular dataset is highly congruous with that of the total evidence dataset; however, the former is better resolved (less polytomies), mainly within Indotyphlidae. The analysis of the phenotypic data alone resulted in a complete polytomy, illustrating the need of more research in this avenue. Coding indels as missing data did not cause important topological changes. The main conclusions derived from this study are: (i) the type of alignment of DNA sequences have an evident impact on the phylogenetic hypotheses of Gymnophiona; (ii) the apparent resolution on the evolutionary relationships of the extant supraspecific taxa of Gymnophiona and their monophyly presented in other studies are dependent on the exclusion of relevant evidence?taxa and characters?or the partial presentation of the optimal hypotheses; (iii) only a total evidence analysis allowed us to discover some of the potential cases of paraphyly or misidentification of vouchers; (iv) the phenotypic data currently used in the study of the evolutionary relationships of Gymnophiona contain important levels of non-congruent information and are not sufficient to place the fossil Eocaecilia micropodia within caecilians. This study reveals the need of detailed revision of the taxonomy and phylogeny of Gymnophiona. / Gymnophiona M?ller, 1832 ? a ordem menos estudada dentro de Amphibia, com 206 esp?cies conhecidas. As rela??es filogen?ticas do grupo permaneceram inst?veis por muito tempo, sofrendo com mudan?as no n?mero de fam?lias, devido ? constante presen?a de t?xons parafil?ticos. Uma crescente de estudos com produ??o de evid?ncias moleculares e morfol?gicas tem formado um arcabou?o de informa??es sobre as rela??es evolutivas do grupo. Mesmo assim, uma classifica??o filogen?tica de toda a ordem n?o representava uma tarefa f?cil. Em 2011, foi proposta uma classifica??o ao n?vel de fam?lia, onde os g?neros foram distribu?dos em nove fam?lias supostamente monofil?ticas. Essa proposta n?o foi baseada em uma an?lise filogen?tica, mas sim em um consenso do entendimento das rela??es filogen?ticas inferidas em estudos pr?vios, sendo muitos deles discordantes, tanto em tipos de an?lises, quanto em resultados. Apenas um estudo incluiu um t?xon f?ssil, que apesar de ser pouco representativo em quantidade, representa uma fonte v?lida de evid?ncia. Devido ao grande esfor?o para gerar dados e obter informa??es acerca dos Gymnophiona, existem in?meros caracteres heredit?rios dispon?veis. Dessa forma, percebe-se uma import?ncia em unir todos esses dados (genomas mitocondriais completos, sequ?ncias de genes nucleares, caracteres fenot?picos dos t?xons viventes e f?ssil) para compor uma nova proposta filogen?tica com o maior poder explicativo. Assim, o objetivo principal deste estudo foi inferir as rela??es evolutivas da ordem Gymnophiona em um contexto de evid?ncia total, sob an?lises de parcim?nia e homologia din?mica e avaliar a taxonomia atual de Gymnophiona com base na(s) ?rvore(s) mais parcimoniosa(s). Adicionalmente, avaliar o efeito de diferentes tipos de alinhamento, a influ?ncia de caracteres fenot?picos em um dataset dominado por dados gen?ticos e o efeito de codificar os indels como dados faltantes. Para isso foram compilados caracteres morfol?gicos de estudos pr?vios, sequ?ncias dispon?veis no GenBank, referentes a 47 genes (nucleares e mitocondriais) de todas as esp?cies dispon?veis, al?m da produ??o de 42 novas sequ?ncias. Comparando os resultados gerados a partir do alinhamento por ?rvore (POY) e do alinhamento por similaridade (TNT) encontramos Rhinatrematidae como grupo-irm?o de Ichthyophiidae + Teresomata. Dentro de Rhinatrematidae, Epicrionops foi recuperado parafil?tico em todas as an?lises e as rela??es dentro de Ichthyophiidae s?o uma politomia. A an?lise do POY n?o recupera Scolecomorphidae como t?xon-irm?o dos demais Teresomata, e sim Typhlonectidae + Caeciliidae. Caecilia ? parafil?tica a Oscaecilia, assim como Typhlonectes com rela??o a Potamotyphlus. Na an?lise via TNT, Herpelidae foi recuperada parafil?tica, com Herpele squalostoma agrupado com Chikilidae. Na an?lise do TNT, Siphonopidae n?o foi recuperada monofil?tica. A fam?lia Indotyphlidae foi n?o-monofil?tica em ambas as an?lises e Idiocranium foi recuperado como o t?xon-irm?o de Dermophiidae. Dermophis surge parafil?tico na an?lise do POY, enquanto que pelo TNT tanto Dermophis quanto Gymnopis surgen parafil?ticos. A topologia da ?rvore constru?da apenas com sequ?ncias de DNA, mostrou-se altamente semelhante ao consenso gerado pelo TNT, embora com alguns poucos clados melhor resolvidos, principalmente em Indotyphlidae. J? a an?lise unicamente morfol?gica restringiu-se a uma politomia total, o que pode ser justificado pela falta de caracteres morfol?gicos ?teis, e que tamb?m pode ser um reflexo da falta de conhecimento acerca deste tipo de evid?ncia. Quanto ? codifica??o de indels como quinto estado ou como dados faltantes, n?o foi observada vantagem sobre nenhum dos testes em rela??o ? topologia do consenso estrito. As principais conclus?es derivadas dos resultados obtidos s?o: (i) o tipo de alinhamento das sequ?ncias de DNA tem um impacto evidente nas hip?teses filogen?ticas; (ii) a aparente resolu??o da hist?ria evolutiva dos atuais t?xons supraespec?ficos de Gymnophiona e sua monofilia, apresentada em outros estudos, dependem da exclus?o de evid?ncia relevante das an?lises ou da apresenta??o parcial das hip?teses ?timas; (iii) s? a an?lise de evid?ncia total permitiu descobrir casos potenciais de parafilia ou identifica??o errada de terminais; (iv) os dados fenot?picos atualmente usados no estudo das rela??es evolutivas de Gymnophiona t?m altos n?veis de informa??o n?o congruente e n?o s?o suficentes para a inclus?o do t?xon f?ssil Eocaecilia micropodia dentro de Gymnophiona. O presente estudo revela a necessidade de uma revis?o detalhada da taxonomia e filogen?tica de Gymnophiona.

Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2018-04-17T13:17:04Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o_CAH_vfinal.pdf: 3985079 bytes, checksum: 6ad6a029bd9cffd5f9f47cd2432f0e7d (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-05-04T17:30:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Disserta??o_CAH_vfinal.pdf: 3985079 bytes, checksum: 6ad6a029bd9cffd5f9f47cd2432f0e7d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-04T17:35:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o_CAH_vfinal.pdf: 3985079 bytes, checksum: 6ad6a029bd9cffd5f9f47cd2432f0e7d (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Important studies have already been done regarding on paleoneurology of extinct animals due to the advancement of computed tomography techniques in recent years. This allowed more accurate studies and without the need to modify materials, especially non-mammaliaform cynodonts and basal mammals. However, these analyzes are limited by material preservation biases, often with absence of postcranium. Consequently, body mass estimations are required, which are necessary for calculations of quantitative analyzes regarding the evolution of the brain capacity of these animals. Considering this, in order to increase the data set about the evolution of the brain in Cynodontia, computed tomography of two skulls of the MCT/PUCRS (MCP 1600 PV Probelesodon kitchingi; MCP 3871 PV Massetognathus ochagaviae) were performed. We also calculated the specimens? encephalization quotients (EQ), with and without the olfactory bulbs, using two formulas of body mass estimation. When the necessary data were available in the literature, the EQs were calculated for other synapids for comparative purposes. In relation to the morphology of the endocranial casts, no differences were observed in relation to previous described for other eucinodonts, in which there is still no enlargement of the cerebral hemispheres, as well as a development of the cerebellar region. The EQs obtained for M. ochagaviae and P. kitchingi do not differ representatively from those previously calculated for other materials of the same genus. For the calculations with and without the olfactory bulbs the same was observed. However, when comparing the encephalization quotients obtained with the application of the four formulas, significant differences were observed between the results. Therefore, it is not possible to compare the EQs obtained with the different methods, and only one is required. / Importantes estudos j? foram realizados acerca da paleoneurologia de animais extintos gra?as ao avan?o das t?cnicas de tomografia computadorizada nos ?ltimos anos. Isso possibilitou estudos mais precisos e sem a necessidade de altera??o dos materiais, especialmente cinodontes n?o-mammaliaformes e mam?feros basais. Entretanto, estas an?lises s?o limitadas por vieses de preserva??o dos materiais, muitas vezes com aus?ncia de p?s-cr?nio. Consequentemente, s?o realizadas estimativas de massa corporal, necess?rias para os c?lculos de an?lises quantitativas da evolu??o da capacidade cerebral destes animais. Considerando isso, a fim de aumentar o conjunto de dados acerca da evolu??o do c?rebro em Cynodontia, foram realizadas tomografias computadorizadas de dois cr?nios do MCT/PUCRS (MCP 1600 PV Probelesodon kitchingi; MCP 3871 PV Massetognathus ochagaviae). Tamb?m foram calculados os quocientes de encefaliza??o (EQ) para os esp?cimes, com e sem os bulbos olfat?rios, aplicando-se quatro m?todos. Para as estimativas de massa corp?rea utilizou-se duas f?rmulas. Quando os dados necess?rios estavam dispon?veis na bibliografia, foram calculados os EQs para outros sinapsidos com fins comparativos. Em rela??o ? morfologia dos moldes endocranianos, n?o foram observadas diferen?as em rela??o ao descrito para outros eucinodontes, no qual ainda n?o h? um alargamento dos hemisf?rios cerebrais, assim como um desenvolvimento da regi?o cerebelar. Os EQs obtidos para M. ochagaviae e P. kitchingi n?o diferem de forma representativa dos previamente calculados para outros materiais de mesmos g?neros. O mesmo foi observado para os c?lculos com e sem os bulbos olfat?rios. Entretanto, ao analisar comparativamente os quocientes de encefaliza??o obtidos com a aplica??o das quatro f?rmulas, foram observadas diferen?as significativas entre os resultados. Portanto, n?o ? poss?vel a compara??o entre os EQs obtidos com os diferentes m?todos, sendo necess?ria a escolha de apenas um.

Submitted by Rose Suellen (rosesuellen@ufpa.br) on 2018-01-26T12:59:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_DeterminantesEstruturaComunidades.pdf: 4661730 bytes, checksum: a898759eb5ba6076e760cf3c89b0f1b6 (MD5) / Approved for entry into archive by Rose Suellen (rosesuellen@ufpa.br) on 2018-01-26T13:00:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_DeterminantesEstruturaComunidades.pdf: 4661730 bytes, checksum: a898759eb5ba6076e760cf3c89b0f1b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-26T13:00:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_DeterminantesEstruturaComunidades.pdf: 4661730 bytes, checksum: a898759eb5ba6076e760cf3c89b0f1b6 (MD5) Previous issue date: 2017-01-30 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os ecossistemas aquáticos são ambientes altamente complexos, pois os seus componentes bióticos e abióticos são dependentes da variação na estrutura física e das características limnológicas, que em geral, são fatores que atuam de forma específica em diferentes escalas espaciais e temporais. Assim, considerando essa complexidade dos habitats encontrados em ecossistemas lóticos amazônicos esta tese tem como objetivo geral avaliar quais são os fatores determinantes dos padrões de distribuição das comunidades de insetos aquáticos em riachos e suas relações com a variação ambiental desses ecossistemas e os efeitos da escala geográfica (variação espacial). Para responder a este objetivo a tese foi dividida em quatro capítulos. No primeiro através de uma análise cienciométrica foi realizada uma avaliação em escala mundial do uso de insetos da família Chironomidae (Diptera) em ecossistemas aquáticos e suas respostas como bioindicadores nesses ambientes. Encontramos que as principais questões apresentadas nos estudos foram relacionadas aos impactos antrópicos causados pelas atividades humanas sobre os ecossistemas aquáticos e as dificuldades taxonômicas sobre a utilização das espécies em biomonitoramentos. No segundo foram analisados os padrões de distribuição e diversidade de comunidades de Chironomidae, sob as predições da Teoria de Metacomunidades, para avaliar as relações das assembleias com a variação da escala espacial e do ambiente. Como principais resultados, encontramos que as assembleias são afetadas principalmente por componentes da estrutura física do habitat e parcialmente limitadas pela dispersão entre os riachos quando consideradas em larga escala na região hidrográfica. No terceiro capítulo, foi avaliada a composição de traços morfológicos e funcionais das comunidades de insetos aquáticos (Coleoptera, Diptera, Ephemeroptera, Hemiptera, Lepidoptera, Megaloptera, Odonata, Plecoptera, Trichoptera) e as suas respostas à variação na estrutura do habitat consideradas sob as premissas da Teoria de Habitat Templet. Assim, encontramos como resultados deste capítulo, relações entre a distribuição dos traços morfológicos e funcionais com as variáveis da estrutura do habitat e a características limnológicas dos riachos. No quarto capítulo foram avaliados os efeitos da variação espacial e ambiental sobre a similaridade de composição das comunidades de insetos das ordens Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera em riachos de duas regiões hidrográficas distintas. Neste último capítulo, encontramos diferenças na composição das comunidades como resultado da distância geográfica e das características ambientais locais de cada região. Demonstramos como a estrutura do habitat dos riachos pode afetar as comunidades de insetos aquáticos em diferentes contextos de escala geográfica. Também, as características dos hábitats foram importantes para a seleção de atributos ecológicos e funcionais das comunidades de insetos aquáticos. Com isso, a partir dos resultados encontrados, concluímos que as variáveis que compõem a estrutura física dos riachos são fatores determinantes na estruturação das comunidades de insetos aquáticos em escalas geográficas em contextos regionais e locais específicos. Além disso, foi destacada a importância dos fatores locais (proporção da vegetação ripária/composição dos substratos/características limnológicas) em relação a composição de características morfológicas e funcionais das assembleias, enquanto que os fatores regionais (distância geográfica/limitação de dispersão) foram os componentes determinantes da similaridade da estrutura das comunidades. / Aquatic ecosystems are highly complex environments, mainly due to interactions between their abiotic and biotic components; they are dependent on variation in physical structure and limnological characteristics, which in general, are factors that specifically act on different spatial and temporal scales. Therefore, considering this complexity in structuring stream habitats, particularly in Amazonian lotic ecosystems, this doctoral thesis aims to evaluate which are the determining factors to structure aquatic insect communities and their distribution according to environmental variation and geographical distances. To meet this goal the thesis is divided into four chapters. In the first, a systematic revision was carried out with a global assessment about the use of insects (Chironomidae: Diptera) in monitoring aquatic ecosystems and their responses as bioindicators. We found that the main issues presented in the studies were related to anthropogenic impacts on aquatic ecosystems and the taxonomic difficulties on the use of species identification to biomonitoring. The second shows analysis of distribution patterns and diversity of Chironomidae communities, under predictions of Metacommunity models, to evaluate the relations of the assemblages with the spatial scale and the environment. The main results showed that the assemblages were mainly affected by components of the physical habitat structure and partly the communities were limited by dispersal among the streams when considered at large scale in the region studied. The third showed analysis of functional composition on the communities of aquatic insects (Coleoptera, Diptera, Ephemeroptera, Hemiptera, Lepidoptera, Megaloptera, Odonata, Plecoptera, Trichoptera) and their responses to variation in habitat structure considered under the assumptions of the Habitat Templet. Overall, we found relationships between the distribution of morphological and functional traits with the physical habitat variables. The fourth chapter evaluates the effect of spatial distance on the community similarity of Ephemeroptera, Trichoptera, Plecoptera communities in two regions of Eastern Amazon. In this final chapter, we find differences in the composition of communities expressed as species replacement because of the geographical distance and local environmental characteristics of each region. Finally, the studies developed in this thesis summarized how the structure of the habitat of streams can affect the aquatic insect communities and variation in the riparian structure and physical habitat, can cause variation in taxonomical composition and functional attributes. In summary, from these findings, we conclude that the physical habitat variables are determining factors in structuring aquatic insect communities. In addition, it is highlighted the importance of local factors (riparian vegetation structure/composition of substrates/limnological characteristics) as explanatory variables for taxonomical and functional composition. In addition, the regional factors (geographical distance / dispersal limitation) are essential components to affect similarity and structure of the communities.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-20T19:39:53Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Simone_Almeida_Dissertação_Final.pdf: 1285080 bytes, checksum: ae68783a7585bbb48bdaef2e7ffa3dde (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-20T19:40:23Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Simone_Almeida_Dissertação_Final.pdf: 1285080 bytes, checksum: ae68783a7585bbb48bdaef2e7ffa3dde (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-20T19:40:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Simone_Almeida_Dissertação_Final.pdf: 1285080 bytes, checksum: ae68783a7585bbb48bdaef2e7ffa3dde (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Em grande parte dos estudos sobre ocupação de nicho em comunidades ou populações a variabilidade individual não é levada em consideração. Entretanto as diferenças de habitat e disponibilidade de recurso também teriam influência nas variações individuais, em médio e longo prazo, causando efeitos relevantes na diversificação e especiação de espécies animais, uma vez que afetam a estabilidade da população. A especialização individual então seria uma forma de reduzir a competição intraespecífica em resposta à diversos fatores, como: variações ambientais, pressões ecológicas e polimorfismos de recursos. Indivíduos se tornam mais oportunistas quando a competição intraespecífica é alta e recursos preferidos são escassos. Esta mudança deve resultar em aumento da amplitude da dieta para os indivíduos, já que eles acrescentam presas não utilizadas anteriormente ao seu repertório. Como resultado, a amplitude de nicho da população como um todo deve aumentar são estruturalmente menos complexas do que as florestas naturais, porém seus efeitos variam de acordo com cada grupo ecológico, papel funcional e requisitos ecofisiológico. Ainda são poucos os estudos sobre estas alterações ambientais decorrentes desta monocultura sobre a fauna de florestas tropicais. No presente estudo, caracterizamos a dieta do roedor Hylaeamys megacephalus e avaliamos o grau de variação individual na dieta em função dos dois habitats inseridos no Bioma Amazônico. A dieta dos espécimes de H. megacephalus é composta por 18 itens alimentares, dos quais 12 são de origem animal e oito de origem vegetal, sendo apenas um item exclusivo de Floresta. Os itens “Fibra de dendê” (FOi% = 44%) e “Sementes inteiras” (FOi% = 40%) apresentarem maior frequência de ocorrência entre os indivíduos coletados em habitats de Plantio de palmeira de dendê, porém “Polpa do fruto do dendê” (IA% = 85.4%) foi o item mais importante na dieta. Os dados observados demonstram que os ambientes, tanto de Plantio como o de Floresta, afetam na especialização individual da população de Hylaeamys megacephalus. / In most studies on niche, occupation in individual variability to communities or populations is not taken into consideration. However, habitat differences and resource availability would also have influence on individual variations in medium and long term, causing significant effects on the diversification and speciation of animal species, since they affect the stability of the population. Individual specialization would then be a way to reduce the intraspecific competition in response to several factors, such as environmental variations, ecological pressures and resource polymorphisms. Individuals become more opportunistic when the intraspecific competition is high and preferred resources are scarce. This change should result in increased amplitude diet for individuals, since they add companies not previously used to his repertoire. As a result, the niche breadth of the population as a whole must increase are structurally less complex than natural forests, but their effects vary according to each ecological group, functional role and ecophysiological requirements. There are few studies on these environmental changes resulting from this monoculture on the tropical forest fauna. In the present study, we characterized the diet of rodent Hylaeamys megacephalus and evaluate the degree of individual variation in the function of the two diet inserted habitats in the Amazon biome. The diet of H. megacephalus specimens consists of 18 food items, 12 of which are animal-eight of plant origin, and only one unique item Forest. The items "palm fiber" (FOi% = 44%) and "whole seeds" (FOi% = 40%) have higher frequency of occurrence among individuals collected in palm plantation habitats, but "fruit squash palm "(IAi% = 85.4%) was the most important item in the diet. The observed data show that the environments, both plantation as forest affect the individual expertise of the population of Hylaeamys megacephalus.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-21T17:06:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tatyana Pinheiro Magalhães - Tese.pdf: 5237497 bytes, checksum: 68ed61dba72fa907bad3264fc1229dee (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-21T17:06:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tatyana Pinheiro Magalhães - Tese.pdf: 5237497 bytes, checksum: 68ed61dba72fa907bad3264fc1229dee (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-21T17:06:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tatyana Pinheiro Magalhães - Tese.pdf: 5237497 bytes, checksum: 68ed61dba72fa907bad3264fc1229dee (MD5) Previous issue date: 2015-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A maioria das espécies de primatas vive em grupo. Apesar das vantagens, esse tipo de organização social também pode aumentar a competição intragrupo por recursos. A prioridade no acesso a esses recursos está ligada a hierarquia de dominância. As posições hierárquicas e as relações sociais influenciam na qualidade de vida, por exemplo, alterando os sistemas reprodutivo e imunológico. Este trabalho caracteriza a hierarquia social do macaco-de-cheiro, Saimiri collinsi, em cativeiro e examina a influência de atributos intrínsecos na hierarquia. Descreve as redes de associações intragrupais e relaciona as associações com a hierarquia e comportamento reprodutivo. E descreve o cuidado com a prole (parental e aloparental) e testa a associação entre mães e alomães dentro e fora do período de cuidado com a prole. Os resultados mostraram que a estrutura de dominância de S. collinsi é do tipo hierarquia parcial e que ela sofre influência da idade e o tamanho corporal. As redes de associação são formadas com base nas classes sexuais e não são constituídas por idade, classe etária ou posição hierárquica. As associações parecem ter relação com o poder das fêmeas de resistência às investidas sexuais dos machos. E as alomães incluíram fêmeas com e sem filhotes e a associação entre mães e alomães não foi diferente dentro e fora do período de cuidado com os infantes. / Most primates live in groups. Despite the advantages, this type of social organization can also increase competition for resources intragroup. The priority access to these resources is linked to dominance hierarchy. The hierarchical positions and social relationships influence the quality of life, for example, changing the reproductive and immune systems. This study characterizes the social hierarchy of the squirrel monkeys, Saimiri collinsi in captivity and examines the influence of intrinsic attributes in the hierarchy. Describes the intragroup associations networks and the relations between associations and the hierarchy and reproductive behavior. Furthermore, describes the care with offspring (parental and alloparental care) and addresses the association between mothers and allomothers in and out of care with offspring period. The results showed that dominance structure of S. collinsi is a partial hierarchy and that it is influenced by the age and body size. The association networks are formed based on sex classes and are not made for age, age-classes, or rank. The associations appear to be related to female power resistance to males sex advances. Moreover, allomothers included females with and without offspring and the association between mothers and allomothers was no different inside and outside of care with infants period.

Submitted by Andreza Leão (andrezaflh@gmail.com) on 2018-08-31T17:32:01Z No. of bitstreams: 1 Tese_AcousticEcologyDolphins.pdf: 3257688 bytes, checksum: 4841865b7154c6248dc60c31219f8055 (MD5) / Approved for entry into archive by Celia Santana (celiasantana@ufpa.br) on 2018-12-12T18:02:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_AcousticEcologyDolphins.pdf: 3257688 bytes, checksum: 4841865b7154c6248dc60c31219f8055 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-12T18:02:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_AcousticEcologyDolphins.pdf: 3257688 bytes, checksum: 4841865b7154c6248dc60c31219f8055 (MD5) Previous issue date: 2018-03-09 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Sistemas sensoriais são vitais para que os animais obtenham informações sobre seus arredores. A informação pode ser adquirida por vias visuais, químicas, elétricas, táteis e acústicas. Estes sinais são usados em diferentes contextos ecológicos incluindo forrageamento, competição, defesa, interações sociais (e.g. corte), e também podem indicar uma condição, e estado emocional ou reprodutivo, ou a identidade do emissor do sinal. Para os mamíferos aquáticos o som é o meio de comunicação mais importante. A luz atenua rapidamente com a profundidade em ambientes aquáticos, limitando a comunicação visual. Todavia, a atenuação do som na água é baixa e ele viaja cerca de cinco vezes mais rápido na água do que no ar, o que o torna um meio de comunicação extremamente eficiente em baixo da água. Logo, o som é um aspecto fundamental da biologia dos cetáceos, já que estes animais dependem do som para comunicação, navegação e localização de presas. O gênero Sotalia compreende duas espécies que vivem em hábitats contratantes. O botocinza (Sotalia guianensis) que habita águas costeiras da Nicarágua ao sul do Brasil, e o tucuxi (Sotalia fluviatilis) restrito aos principais tributários da Bacia Amazônica. Enquanto que golfinhos do gênero Inia – popularmente conhecidos como botos-vermelhos – são encontrados exclusivamente nas Bacias dos rios Amazonas, Orinoco e Tocantins. Com ambos os seus estados de conservação como dados deficientes há grande demanda de informações quanto a sua biologia. Como fator-chave da biologia dos cetáceos a acústica pode nos prover uma riqueza de informações e ser usada como ferramenta para adquirir dados quanto ao uso de hábitat, números populacionais e comportamento. Entretanto, para fazê-lo, primeiro é necessário conhecer o repertório vocal das espécies em detalhe de forma que possamos diferenciá-las usando métodos acústicos. Portanto apresentamos aqui a primeira análise englobando toda a distribuição de golfinhos do gênero Sotalia e padrões geográficos e de diversidade de seus assobios. Além disso, apresentamos a primeira descrição do repertório vocal e de Inia araguaiensis focando na diversidade de repertório e em sua estrutura. O repertório de assobios de ambas as espécies de Sotalia é altamente estruturado, com populações da espécie fluvial apresentando um repertório menos diverso do que as populações da espécie costeira. Esta estruturação se dá provavelmente devido a áreas de vida pequenas e ao baixo fluxo gênico entre populações. As diferenças na riqueza entre o repertório destas espécies parecem estar relacionadas a uma combinação de fatores socio-ecológicos e evolutivos. Também apresentamos a primeira descrição do comportamento acústico do boto-o Araguaia (Inia araguaiaensis) e mostramos que eles possuem um repertório rico composto por assobios e principalmente chamados pulsados. Assobios foram produzidos raramente, um tipo específico de chamado, chamados curtos com dois componentes, foram o tipo de sinal mais comum durante nosso estudo. Estes chamados são similares em estrutura a aqueles produzidos por orcas (Orcinus orca) e baleias-piloto (Globicephala sp.). Devido ao contexto no qual estes sinais foram produzidos, nós hipotetizamos que eles podem funcionar para a comunicação ente mãe e filhote. Sotalia e Inia podem ser distintos acusticamente baseados em seus sons sociais, já que o primeiro tem um repertório baseado em assobios e o último em chamados pulsados. A baixa emissão de assobios por Inia faz com que a chance de identificação errônea seja baixa. Logo, sons 14 de ambos os gêneros podem ser usados para distingui-los durante monitoramentos acústicos passivos e podem servir como ferramentas para determinar a presença destas espécies em estudos de distribuição, uso de hábitat e abundância. / Sensory systems are vital for animals to obtain information about their surroundings. Information can be gathered via visual, chemical, electrical, tactile and acoustic cues. These cues are used in several ecological contexts including foraging, competition, defense, social interactions (e.g. courtship behavior), and to indicate a condition, emotional or reproductive state or identity of the signal emitter. For aquatic mammals, sound is the most important mechanism of communication. Light attenuates rapidly with depth in aquatic environments limiting visual communication. In contrast, sound has low attenuation in water and it travels about five times faster in water than in air, making a very efficient way to communicate underwater. Therefore, sound is a fundamental aspect of cetacean biology, as these animals rely on acoustic signals for communication, navigation and location of prey. The genus Sotalia consist of two species that inhabit contrasting habitats. The Guiana dolphin (Sotalia guianensis) inhabits the coastal waters from Nicaragua to Southern Brazil, and the tucuxi (Sotalia fluviatilis) is confined to the main tributaries of the Amazon Basin. Meanwhile, river dolphins of the genus Inia - commonly known as botos - are found exclusively in the Amazon, Orinoco, and Tocantins River Basins. With their conservation status of both genera as data deficient there is great demand for information on their biology. As a key factor on cetacean biology acoustics can provide us with a richness of information and used as a tool to acquire data on habitat use, population numbers and behavior. However, in order to do so, first one needs to know the species vocal repertoire in detail and be able to differentiate those using acoustic methods. Thus, here we present the first distributionwide analysis of the vocal repertoire of Sotalia dolphins and diversity and geographical patterns of their whistles. In addition, we present the first description of the vocal repertoire of Inia araguaiaensis focusing on repertoire diversity and structure. The whistle repertoire of both Sotalia species is highly structured, with populations of the riverine species showing a less diverse whistle repertoire than the populations of the coastal species. The highly structured repertoire is likely due to the small home ranges and low gene flow among populations. Differences in the richness of the acoustic repertoire between both species, may be due to a combination of socioecological and evolutionary factors. We also provide the first description of the Araguaian boto (Inia araguaiensis) acoustic behavior and showed that they have a rich acoustic repertoire consisting of whistles and primarily pulsed calls. While whistles were produced rarely, a specific type of call, the short two-component calls were the most common signal emitted during the study. These calls were similar in acoustic structure to those produced by orcas (Orcinus orca) and pilot whales (Globicephala sp.). Because of the context at which these signals were produced, we hypothesize that they possibly play a role in mother-calf communication. Sotalia and Inia can be acoustically distinguished based on their social sounds, as the former has a repertoire based on whistles and the latter based on pulsative calls. With the low emission rate of whistles by Inia, so chances of misidentification are low. Thus, sounds of both genera can be used to distinguish them from one another during passive acoustic monitoring and serve as proxies for species presence in studies of distribution, habitat use, and abundance.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-12-17T18:46:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_entrega.pdf: 2781108 bytes, checksum: 29e6c7c64b36f27d0dd17d83ffc1c7d5 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-12-17T18:47:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_entrega.pdf: 2781108 bytes, checksum: 29e6c7c64b36f27d0dd17d83ffc1c7d5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-17T18:47:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_entrega.pdf: 2781108 bytes, checksum: 29e6c7c64b36f27d0dd17d83ffc1c7d5 (MD5) Previous issue date: 2018 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Kentropyx calcarata foi descrito por Spix, 1825 e tem distribuição na Amazônia central e oriental, abrangendo a Venezuela, Guiana, Suriname, Guiana Francesa, Brasil e Bolívia; e no Brasil em áreas de manguezal na costa nordeste, na Serra de Baturité (um brejo de altitude na área de Caatinga) e em parte da Floresta Atlântica. Estudos anteriores com K. calcarata mostraram possíveis variações dentro da espécie, as quais necessitam ser melhor investigadas. Neste estudo foram analisadas amostras abrangendo toda a área de ocorrência na Amazônia brasileira, incluindo pontos de simpatria com K. altamazonica, tendo em vista que uma das observações quanto à variação morfológica levantou a hipótese de ser resultante da simpatria entre as duas espécies, com objetivo de avaliar as possíveis variações ocorrentes dentro da espécie. Também foram analisadas amostras da Floresta Atlântica, onde as populações da região central (ao sul do Rio São Francisco) apresentam diferenças no padrão de coloração. Todos os espécimes, tanto da Amazônia quanto da Floresta Atlântica, foram analisados quanto à morfologia externa, hemipeniana e padrão de coloração. Os espécimes ao sul do rio São Francisco foram considerados como uma espécie distinta, devido apresentarem caracteres não condizentes com a espécie K. calcarata, para a qual o nome K. vittata Schinz, 1822 está disponível, sendo aqui indicada a necessidade da revalidação da espécie. Em Kentropyx calcarata as populações da Amazônia e ao Norte da Floresta Atlântica apresentam hemipênis e padrão de coloração semelhantes. Foi observada a presença de variação nos caracteres merísticos, sendo a distância geográfica um dos fatores que pode contribuir com parte desta variação. As populações de K. calcarata com K. altamazonica apresentam variações tanto nos caracteres merísticos quanto morfométricos, possivelmente causadas por uma série de fatores ambientais, como por exemplo a competição por nichos ecológicos, confirmando a hipótese levantada em estudos anteriores. / Kentropyx calcarata was described by Spix, 1825 and has distribution in the central and eastern Amazon, covering Venezuela, Guyana, Suriname, French Guiana, Brazil and Bolivia; and in Brazil in mangrove areas on the northeast coast, Serra de Baturité (an altitude brejo in the Caatinga area) and part of the Atlantic Forest. Previous studies with K. calcarata showed possible variations within the species, which need to be better investigated. In this study, samples covering the entire area of occurrence in the Brazilian Amazon were analyzed, including points of sympathy with K. altamazonica, considering that one of the observations regarding the morphological variation raised the hypothesis of being the result of sympatry between the two species, with objective to evaluate the possible variations within the species. Samples were also analyzed from the Atlantic Forest, where the populations of the central region (south of the São Francisco River) show differences in the staining pattern. All specimens from both the Amazon and the Atlantic Forest were analyzed for external morphology, hemipenian and staining pattern. The specimens to the south of the São Francisco River were considered as a distinct species, due to the fact that they did not correspond to the species K. calcarata, for which the name K. vittata Schinz, 1822 is available, indicating the need for revalidation of the species . In Kentropyx calcarata the populations of the Amazon and to the North of the Atlantic Forest have similar hemipenis and coloring pattern. The presence of variation in the meristic characters was observed, being the geographic distance one of the factors that can contribute with part of this variation. The populations of K. calcarata and K. altamazonica show variations in both meristic and morphometric characters, possibly caused by a number of environmental factors, such as competition for ecological niches, confirming the hypothesis raised in previous studies. / IDEFLOR-BIO - Instituto de Desenvolvimento Florestal e da Biodiversidade do Estado do Pará / UEPA - Universidade do Estado do Pará

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-08-24T11:38:29Z No. of bitstreams: 1 473896 - Texto Completo.pdf: 771321 bytes, checksum: d452d3e95a8a6af596754e6365695a32 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-24T11:38:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 473896 - Texto Completo.pdf: 771321 bytes, checksum: d452d3e95a8a6af596754e6365695a32 (MD5) Previous issue date: 2013-08-30 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study investigated the activity budget, diet composition and the frequency of intergroup encounters and howling sessions of three social groups of brown howler monkeys (Alouatta guariba clamitans) to evaluate the occurrence of within- and between-group feeding competition and test predictions of socioecological models applied to folivorous primates. The groups inhabited a 10-ha forest fragment near the southern limit of the distribution of the taxon. The availability of preferred food resources (ripe fruit and young leaves) of 15 arboreal species belonging to the diet of brown howlers was monitored monthly prior to the collection of behavioral data. The behavior was recorded by the instantaneous scan (activity budget and diet composition) and the all occurrences (intergroup encounters, agonistic behaviors and howling sessions) sampling methods during 4 to 5 days per month (February to July 2012) per group. A total of 17,184 behavioral records were collected in 910 hours of observation. Resting was the most common activity (50-54%), followed by feeding (21-23%) and moving (17-21%). The diet was composed mainly of leaves (48-54%) and fruit (39- 45%). There were 52 intergroup encounters, 3 intragroup and 13 intergroup agonistic interactions and 245 howling sessions. Therefore, in accordance to previous studies, the brown howler monkeys were involved in low levels of both within- and between-group resource competition. However, the availability of new leaves and ripe fruit were good predictors of the rate of intergroup encounters and howling sessions by some groups, allowing to suggest that howler monkeys appear to reduce the frequency of encounters with conspecifics by using howling as a behavioral mechanism for maintaining intergroup spacing and obtaining access to sources of preferred foods. / O presente estudo investigou o or?amento de atividades, a composi??o da dieta e a frequ?ncia de encontros e as sess?es de ronco em tr?s grupos de bugios-ruivos (Alouatta guariba clamitans) vivendo em um fragmento florestal de 10 ha, pr?ximo ao limite sul da distribui??o do t?xon, a fim de avaliar a ocorr?ncia de competi??o alimentar intra- e intergrupo e testar predi??es de modelos socioecol?gicos para primatas fol?voros. A disponibilidade dos recursos preferidos fruto maduro e folha nova de 15 esp?cies arb?reas conhecidas da dieta do t?xon foi monitorada mensalmente pelo m?todo de Fournier, antes do per?odo de coleta de dados comportamentais pelo m?todo de varredura instant?nea (or?amento de atividades e composi??o da dieta) e todas as ocorr?ncias (encontros intergrupo, comportamentos agon?sticos e sess?es de ronco), durante 4 a 5 dias por m?s (fevereiro a julho de 2012) por grupo. Foram obtidos 17.184 registros comportamentais em 910 horas de observa??o. O descanso foi o comportamento mais comum (50-54%), seguido pela alimenta??o (21-23%) e locomo??o (17-21%). A dieta foi composta principalmente por folhas (48-54%) e frutos (39-45%). Foram registrados 52 encontros intergrupo, 3 intera??es agon?sticas intragrupo e 13 intergrupo e 245 sess?es de ronco. Em geral, houve uma baixa frequ?ncia de intera??es agon?sticas intra- e intergrupo entre os grupos estudados sugerindo um baixo n?vel de competi??o por recursos, o que corrobora estudos anteriores. Por?m, a disponibilidade de folhas novas e frutos maduros foram bons preditores das taxas de encontro intergrupo e de sess?es de ronco em alguns grupos, o que permite sugerir que os bugios parecem reduzir o enfretamento direto com conspec?ficos usando o ronco como mecanismo comportamental para manter o espa?amento e o acesso a fontes de alimentos preferidos.