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Caracterização de Leptospira spp. quanto à presença e conservação dos genes da família lig: importantes alvos para utilização em vacina e testes de diagnóstico / Characterization of Leptospira spp. regarding the presence and conservation of genes belonging to the lig family: important targets for vaccines and diagnostic tests

Cerqueira, Gustavo Maia de 31 March 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_gustavo_cerqueira.pdf: 757400 bytes, checksum: 75fc7b471af1fa029ccf13d06c0042eb (MD5) Previous issue date: 2006-03-31 / Pathogenic Leptospira species contain one or more genes of the lig family, which code for Lig-family proteins. Lig proteins ( Leptospiral immunoglobulin-like proteins ) are considered important virulence factors, and they may be involved in tissue penetration and adhesion to host cells. Lig proteins have been implicated as the main factors involved in pathogenesis of Leptospira spp. Three genes, ligA, ligB and ligC are known, which code for proteins with the same name. The increasing interest in the characterization of the genes code for Lig proteins is due to their strong immunoprotective and diagnosis potential. Thus, it was necessary to evaluate the degree of conservation among Lig genes and proteins in order to predict their usefulness as antigens for the induction of a broad range protection. Four of the pathogenic species of Leptospira had the lig genes sequenced in this study, comprising L. interrogans, L. noguchii, L. weilli and L. borgpetersenii. Among the LigB proteins sequenced so far, LigB from L. interrogans Copenhageni FIOCRUZ L1-130 appears as the most conserved when compared to LigB from other species. The sequencing and comparative analysis of lig genes and proteins demonstrated a low identity among the different genomospecies of Leptospira spp. The alignment of lig genes sequences from all the genomospecies enabled us to design primers that allowed the amplification of a fragment from each gene. Such approach demonstrated that ligB gene is present in all the pathogenic species, while ligA gene is only found in L. interrogans and L. kirschneri and ligC gene is present in L. interrogans, L. kirschneri, L. weilli and some serovars of L. noguchii. The sequencing of the amplified fragment, derived from 33 serovars which comprise 6 genomospecies, and their comparative analysis together with the corresponding region from ligB sequences available in GenBank, enabled a phylogenetic analysis. It was possible to differentiate pathogenic species based on the DNA sequence of this ligB fragment. / Leptospiras patogênicas carregam um ou mais genes lig, os quais codificam para proteínas da família Lig. As proteínas Lig ( Leptospiral immunoglobulin-like ) são importantes fatores de virulência, e acredita-se que estejam envolvidos na penetração do tecido e na adesão da Leptospira às células do tecido hospedeiro. Até o presente momento, as proteínas Lig são apontadas como um dos principais fatores envolvidos na patogênese de Leptospira spp. Três genes, ligA, ligB e ligC são conhecidos, os quais codificam para proteínas com o mesmo nome. O interesse pela caracterização dos genes que codificam para as proteínas Lig surgiu pelo fato destas apresentarem potencial imunoprotetor e como antígenos para testes de diagnóstico. Frente a esta constatação, fez-se necessário conhecer o grau de conservação destes genes para inferir se a utilização de uma destas proteínas como antígeno vacinal seria capaz de induzir uma imunidade de amplo espectro. Dentre as espécies patogênicas de Leptospira, 4 tiveram seus genes lig seqüenciados neste estudo, as quais compreendem L. interrogans, L. noguchii, L. weilli e L. borgpetersenii. Entre as proteínas Lig seqüenciadas até o momento, LigB oriunda de L. interrogans Copenhageni FIOCRUZ L1-130 aparece como a mais conservada quando comparada com LigB de outras espécies. Com o alinhamento da seqüência dos genes lig das diversas espécies, foi possível desenhar primers capazes de amplificar por PCR um fragmento interno de cada um dos três genes. Esta abordagem permitiu comprovar a presença do gene ligB em todas as espécies patogênicas, enquanto ligA aparece apenas em L. interrogans e L. kirschneri, e ligC é encontrado nas espécies L. interrogans, L. kirschneri, L. weilli e alguns sorovares de L. noguchii. O seqüenciamento do fragmento de ligB amplificado por PCR a partir do DNA de 33 sorovares de 6 espécies, e sua análise comparativa juntamente com o fragmento correspondente pertencente aos genes ligB depositados no GenBank, possibilitou uma análise filogenética onde verificou-se que é possível diferenciar as espécies pela seqüência deste fragmento.
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Desenvolvimento de ferramentas para a manipulação genética e metodologias para a identificação de fatores de virulência de Leptospira spp / Development of tools for the genetic manipulation 4 and methodologies for the identification of virulence factors of Leptospira spp

Cerqueira, Gustavo Maia de 06 March 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_gustavo_cerqueira.pdf: 9683705 bytes, checksum: a1d0f93c3566774a1f0e953cc32fb912 (MD5) Previous issue date: 2009-03-06 / In this study, Himar1 was used to obtain a total of 929 transposon mutants, of which, 721 correspond to coding sequences (CDS) disrupted by the transposon in 551 different genes. Some mutants were evaluated regarding the effect of gene disruption to virulence in the hamster model, and two attenuated mutants containing the transposon into hypothetical genes were identified. Another study aimed to develop a new genetic tool to help in the study of specific genes. Thus, an inducible expression system for L. biflexa was developed. Such inducible expression system employed as reporter genes the green fluorescence protein (gfp) and the gene encoding for the flagelin B protein (flaB). Fluorescent L. biflexa (GFP) and motile leptospires (FlaB) were observed after induction by IPTG. Finally, another study was conducted to determine, by PCR amplification, the presence of the lig genes in different pathogenic species. ligB appeared to be ubiquitously distributed, while ligA and ligC were detected only in a reduced number of serovars. In addition, a 214 bp specific ligB fragment was used to constitute a new method for pathogenic Leptospira species classification. / Neste estudo, o Himar1 foi utilizado para a obtenção de um total de 929 mutantes, dos quais, 721 correspondem a seqüências codificadoras (CDS) interrompidas pelo transposon, cobrindo 551 genes diferentes. Alguns mutantes foram avaliados com relação aos efeitos da interrupção gênica sobre a virulência em modelo animal, e dois mutantes atenuados contendo o transposon em genes hipotéticos foram identificados. Outro estudo realizado buscou desenvolver uma nova ferramenta genética para auxiliar no estudo da função de genes específicos. Assim, foi desenvolvido um sistema de expressão induzível para L. biflexa. Este sistema de expressão empregou como repórter o gene da proteína verde fluorescente (gfp) e o gene da proteína flagelina B (flaB). L. biflexa fluorescente foi observada, assim como leptospiras que voltaram a ter mobilidade após a adição do agente indutor (IPTG). Finalmente, foi conduzido um estudo para a determinação da presença dos genes da família lig nas diversas espécies de leptospiras patogênicas, através da técnica de PCR. O gene ligB apareceu amplamente distribuído, enquanto que ligA e ligC foram detectados apenas em um reduzido número de sorovares. Além disso, a sequência de um fragmento específico de 214 pb do gene ligB pode ser usada para a constituição de um novo método para a classificação das espécies patogênicas de Leptospira
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Avaliação do perfil de metilação e expressão do gene CDH1 em Cebus apella como modelo experimental para câncer gástrico

ANTUNES, Symara Rodrigues 09 July 2012 (has links)
Submitted by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2012-12-12T14:17:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoPerfilMetilacao.pdf: 1830589 bytes, checksum: f88cbaf31829d2cb8cb979c72b380439 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2012-12-20T12:59:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoPerfilMetilacao.pdf: 1830589 bytes, checksum: f88cbaf31829d2cb8cb979c72b380439 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-20T12:59:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoPerfilMetilacao.pdf: 1830589 bytes, checksum: f88cbaf31829d2cb8cb979c72b380439 (MD5) Previous issue date: 2012 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O câncer gástrico continua sendo uma importante causa de morte dentre os tipos de câncer no Brasil e no mundo. A origem do câncer de estomago provém, assim como nos demais, de acúmulo de alterações genéticas. Portanto, se faz necessário saber quais alterações genéticas são importantes para desencadear a patogênese do câncer gástrico. O MNU, conhecido carcinógeno, quando ingerido de forma oral em doses determinadas desencadeia o desenvolvimento de adenocarcinoma gástrico do tipo intestinal, com aparecimento de estágios pré definidos característico deste tipo tumoral. Com base nestes conhecimentos, realizamos um experimento com 6 macacos da espécie Cebus apella induzidos à desenvolver câncer gástrico do tipo intestinal. Os animais ingeriam 16mg/kg de peso diariamente da droga, com desenvolvimento de lesões pré-neoplásicas em todos. Infelizmente, devido à toxicidade da droga, somente um animal sobreviveu ao tratamento e desenvolveu desenvolveu uma massa tumoral propriamente dita. Foram feitas avaliações periódicas dos animais, em dias pré-determinados (ao início, no 120º, 150º, 300º, 940º) com coletas de fragmentos da mucosa gástrica. Foram coletadas 20 amostras de tecido, distribuídas entre mucosa normal, gastrite, displasia, metaplasia e tumoral. Destas amostras extraímos DNA para as análises do gene CDH1. Não há na literatura sequencia deste gene para a espécie utilizada no estudo. Com este objetivo, utilizamos iniciadores construídos a partir de sequencias de CDH1 de Callithrix jacchus (espécie filogeneticamente) e seqüenciamos cerca de 342pb da região promotora de CDH1 de C. apella. As análises mostraram uma similaridade de 98% desta região com a dos humanos, com presença de vários sítios de ligação de fatores de transcrição (sp1, Ap2, NF-x, AREB6, Puf e CTF) além da presença do CAAT Box. Esta região ainda possui 30 sitios CpGs, o que indica que ela pode estar sofrendo regulação epigenética. Para se verificar como se encontrava o padrão de metilação desta região realizamos uma análise de MSP com iniciadores específicos e constatamos que houve predominância de alelos não metilados de CDH1 para todas as amostras pré neoplásicas e a amostra de adenocarcinoma encontra-se metilada. O que pode ser constatado com um ensaio de Imunohistoquímica, onde somente a amostra tumoral não expressava a proteína caderina. Desta maneira nossas análises sugerem que a metilação do gene CDH1 desempenha papel importante na tumorigênese gástrica em C. apella, e é um evento tardio, uma vez que não é observado nos outro tipos teciduais não tumorais E, partindo-se da similaridade entre as seqüências, podemos sugerir que o mesmo evento pode está ocorrendo em humanos. Esta metilação do promotor do CDH1 leva a um silenciamento deste gene o que desencadeia o estabelecimento de adenocarcinomas gástricos, fato apoiado pela literatura onde vários trabalhos apontaram que a hipermetilação do promotor da caderina está associada ao desenvolvimento do câncer gástrico. / The gastric cancer remains a major cause of death among cancers in the world. In Brazil, are expected around 500 000 new cases in 2012/2013. The origin of stomach cancer, as in others, arises from the accumulation of genetic alterations. Therefore, it is necessary to know which genetic changes are important in triggering the pathogenesis of gastric cancer. We know that the intestinal type develops through well defined stages. The MNU - a known carcinogen - when ingested in oral form at dosages determined triggers development of this histological type of gastric cancer. Based on this knowledge, we conducted an experiment with six specime of Cebus paella, induced to develop intestinal type gastric cancer. The animals consumed 16mg/kg of body weight daily drugs. All pre-neoplasic lesions developed. Due to drug toxicity, only one survived the entire treatment and developed a tumor. Periodic evaluations were made of animals in pre-determined days (the beginning, days 120, 150, 300, 940) during which samples were made of the gastric mucosa. We collected 20 samples of tissue, distributed among normal mucosa, gastritis, dysplasia, metaplasia, and tumor. DNA extracted from these samples for further analyzes of the CDH1 gene. There is no sequence of this gene in the literature for the species under study. So the first step was to get this sequence. Using the initiators constructed from sequences of CDH1 Callithrix jacchus (species phylogenetically closer to C. apella) we get a sequence of 342pb. There is a similarity of 98% with humans, the presence of binding sites for transcription factors like (sp1, Ap2, NF-x, AREB6, Puf and CTF) and the presence of CAAT Box. The sequence has 30 CpG sites could suffer epigenetic regulation. We also performed MSP analysis with specific primers and found that the region analyzed, there was predominance of the unmethylated CDH1 alleles for all samples pre-neoplastic and adenocarcinoma sample is methylated. When we compared these data with immunohistochemistry revealed that only tumor sample did not express the protein cadherin. Our analyzes suggest that methylation of the CDH1 gene plays an important role in gastric tumorigenesis in C. apella. And, from the similarity between sequences, we suggest that the same occurs in humans. This cadherin promoter methylation leads to inactivation of the gene and establishment of gastric adenocarcinomas. The cadherin promoter hypermethylation has been reported in several articles associated with the development of gastric cancer.
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Avaliação do efeito antigenotóxico e anticitotóxico do bioproduto método CANOVA®

NASCIMENTO, Henrique Fonseca Sousa do 28 September 2012 (has links)
Submitted by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2013-01-24T12:43:45Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoEfeitoAntigenotoxicol.pdf: 986207 bytes, checksum: 5cb788fa976fca7b6c6ca781a3c1f029 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-01-24T14:58:46Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoEfeitoAntigenotoxicol.pdf: 986207 bytes, checksum: 5cb788fa976fca7b6c6ca781a3c1f029 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-24T14:58:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AvaliacaoEfeitoAntigenotoxicol.pdf: 986207 bytes, checksum: 5cb788fa976fca7b6c6ca781a3c1f029 (MD5) Previous issue date: 2012 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Método CANOVA® (CA) é um imunomodulador brasileiro de formulação homeopática. CA é indicado em condições clínicas nas quais o sistema imune se encontre comprometido. O N-Metil-N-Nitrosoureia (NMU) é um agente N-nitroso alquilante e carcinogênico utilizado como modelo experimental em roedores e macacos. O NMU também apresenta efeitos genotóxicos/mutagênicos analisáveis por testes clássicos de detecção de danos ao DNA e aberrações cromossômicas. Apesar de vários estudos terem demonstrado resultados promissores na utilização do medicamento CA, não existem trabalhos relatando possíveis efeitos antigenotóxicos deste medicamento, a despeito de seu potencial anticarcinogênico. Assim, o presente trabalho avaliou in vitro os efeitos antigenotóxicos e anticitotóxicos do medicamento CA em linfócitos humanos expostos ao NMU. Foram utilizadas amostras de linfócitos humanos que foram submetidos a diferentes concentrações de uma mistura contendo CA e NMU. A viabilidade das células expostas ao NMU foi avaliada pelo ensaio MTT, a genotoxicidade/antigenotoxicidade do CA foi avaliada pelo teste do cometa e a anticitotoxicidade do CA foi verificada pela quantificação de apoptose e necrose utilizando corantes fluorescentes (laranja de acridina/brometo de etídeo). No teste MTT verificamos que o NMU conseguiu diminuir a viabilidade dos linfócitos de forma significativa. No teste do cometa foi observado que CA diminui significativamente os danos ao DNA induzidos pelo NMU, caracterizando um claro efeito antigenotóxico do composto homeopático. CA também diminuiu de forma significativa a frequência de apoptose induzida pelo NMU em leitura realizada após 24 horas de tratamento. Concluímos que o CA apresentou um efeito antigenotóxico e anticitotóxico nas condições avaliadas no presente estudo, demonstrando, assim, um claro potencial citoprotetor. / The CANOVA® (CA) method is a Brazilian homeopathic immunomodulator. CA is indicated in clinical conditions where the immune system is impaired. N-Methyl-Nnitrosourea (NMU) is an N-nitroso carcinogenic alkylating agent used as an experimental model in rodents and monkeys. NMU also shows genotoxic/mutagenic effects that can be assessed by classical tests such as detection of DNA damage and chromosomal aberrations. Although several studies have shown promising results in the use of CA, there are no studies reporting possible antigenotoxic effects of this medicine, despite its anticancer potential. Therefore, the present study evaluated the in vitro antigenotoxic and anticytotoxic effects of CA in human lymphocytes exposed to NMU. Samples of human lymphocytes that were subjected to different concentrations of a mixture containing CA and NMU were used in the present study. The viability of cells exposed to NMU was evaluated by MTT assay, CA genotoxicity/antigenotoxicity was evaluated by the comet assay and CA anticytotoxicity was assessed by quantification of apoptosis and necrosis using fluorescent dyes (acridine orange/ethidium bromide). The MTT assay showed that NMU was able to decrease lymphocyte viability significantly. By using the comet assay it was observed that CA significantly reduces DNA damage induced by NMU, which sets a clear antigenotoxic effect of the homeopathic compound. CA also reduced significantly the frequency of NMU-induced apoptosis after 24 hours of treatment. We conclude that CA had an antigenotoxic and anticytotoxic effect in the conditions evaluated in this study, thereby demonstrating a clear cytoprotective potential.
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Investigação de efeitos mutagênicos em trabalhadores expostos à radiação ionizante no Brasil

CUNHA JUNIOR, Luiz Raimundo Campos da Silva e 18 December 2015 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-03-22T12:37:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_InvestigacoesEfeitosMutagenicos.pdf: 2501956 bytes, checksum: 54b361ed1a8093136d439ed076ffb6a1 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-03-24T16:11:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_InvestigacoesEfeitosMutagenicos.pdf: 2501956 bytes, checksum: 54b361ed1a8093136d439ed076ffb6a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T16:11:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_InvestigacoesEfeitosMutagenicos.pdf: 2501956 bytes, checksum: 54b361ed1a8093136d439ed076ffb6a1 (MD5) Previous issue date: 2015-12-18 / CNEN - Comissão Nacional de Energia Nuclear / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As radiações ionizantes (RI) estão presentes na maioria dos diagnósticos precoces de uma infinidade de doenças, muitos tipos de câncer estão inclusos, e têm a característica de um diagnóstico rápido e preciso e, muitas das vezes, mais barato. A utilização deste tipo de energia no entanto, requer de cuidados de proteção específicos, uma vez que as RI tem a característica de alterar o material genético, através de mutações. Os operadores da área da radiologia em hospitais são a classe de trabalhadores que está exposta de forma mais direta e, portanto, são alvos de investigações que podem auxiliar no entendimento da interação das RI com o material biológico, além de auxiliar a estes profissionais no requisito de proteção radiológica. Foram coletadas 75 amostras de indivíduos que trabalham em vários departamentos da radiologia em 5 hospitais de 4 Estados diferentes no Brasil (São Paulo, Minas Gerais, Rio Grande do Sul e Pará). Os critérios de seleção para a participação foram: ter ao menos 18 anos de idade e 2 anos de profissão, não ser etilista ou tabagista, não estar tomando medicamentos. Para análise citogenética, foram realizados os testes do cometa e Micronúcleo, assim como estudo de aberrações cromossômicas. Este estudo foi avaliado e aprovado por comitê de ética. Todos as amostras foram comparadas com indivíduos do mesmo gênero e idade que não tenham passado por qualquer tipo de exame radiológico nos últimos 6 meses.Quando comparados com o controle, os testes de MN e AC demonstraram uma totalidade de danos, usando o teste T, o banco de dados SPSS e bioestat. O teste do cometa mostrou um nível de danos maior se comparado aos controles (0,84 0,47). Foi estabelecida a média de idade e feita relação entre gênero e idade dos participantes, sendo os níveis de danos maiores para o gênero feminino em relação ao masculino. Individuos com idades acima dos 45 anos também demonstraram um nível de dano maior quando comparados com idades inferiores. Um fator a ser levado em consideração é de que a população de Porto alegre apresentar um nível de dano menor se comparado aos outros grupos, sendo muito provável este evento por conta da utilização de equipamentos DR de conversão direta. Os equipamentos de Belo Horizonte e Ribeirão Preto utilizam CR e os de Belém, convencionais. / Ionizing radiation (IR) are present in most of the early diagnosis of a multitude of diseases, many cancers are included, and have the characteristic of a quick and accurate diagnosis, and often cheaper. The use of this type of energy but requires specific care protection, since the IR has a characteristic of altering the genetic material through mutations. The radiology area operators in hospitals are the class of workers who are exposed more directly and thus are targets of investigations that may assist in understanding the interaction of IR with the biological material, in addition to assisting these professionals in requirement radiological protection. We collected 73 samples of individuals working in various radiology departments in five hospitals in four different states in Brazil (São Paulo, Minas Gerais, Rio Grande do Sul and Pará). The selection criteria for participation were: at least 18 years old and 2 years in the profession, not alcoholic or smoker, not taking drugs. For cytogenetic analysis were performed the comet test and micronucleus, and chromosome aberration study. This study was approved by ethics committee. All the samples were compared to individuals of the same age and gender who have not gone through any kind of radiological examination in the last 6 meses.Quando compared with the control, MN tests and AC showed a total damage, using the t test, the database and SPSS BioEstat. The comet assay showed a higher level of damage compared to controls (0.84 0,47). The average age was established and made relationship between gender and age of the participants, the more damage levels in females compared to males. Individuals aged over 45 years also showed a higher level of damage when compared with the age. A factor to be taken into consideration is that the population of Porto Alegre present a lower level of damage compared to other groups, and most likely this event due to the use of DR equipment Direct conversion. The Belo Horizonte and Ribeirão Preto equipment using CR and Belém, conventional.
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AVALIAÇÃO DA TRANSLOCAÇÃO T(14;18) MBR EM INDIVÍDUOS EXPOSTOS A BAIXAS DOSES DE RADIAÇÃO DE 137CsCl EM GOIÂNIA, GOIÁS, BRASIL

Nunes, Hugo Freire 11 February 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hugo Freire Nunes.pdf: 9223555 bytes, checksum: 727e689aec4609cbe403ed62b05a1443 (MD5) Previous issue date: 2011-02-11 / Healthy radio-exposed individuals, who received low levels of Cesium-137 radiation, during the accident that happened in Goiania, in 1987 and their familiars were tested for the detection of t(14;18) rearranged B cells in peripheral blood, using a high sensitive real-time quantitative PCR method. Also were tested a control group comprised of healthy non exposed age matched men. The chromosomal translocation t(14;18)(q32;q21) is characteristic of Follicular Lymphoma and it is a frequent abnormality in other types of non-Hodgkin lymphoma. This translocation leads to constitutive activation of the BCL2 oncogene by the enhancers of the immunoglobulin heavy chain loco. T(14;18) translocation constitute the genetic hallmark and early initiating event of Follicular Lymphoma. In healthy individuals, the same translocation may also be found in a small fraction of peripheral blood lymphocytes and positive cells might serve as an indicator for environmental exposure to carcinogens and possibly correlate with the cumulative risk of developing t(14;18)-positive non-Hodgkin lymphoma. Eight healthy radio-exposed, five relatives including three children, and four not exposed healthy men were tested for the detection of this translocation. Only one unexposed individual from the control group was positive for the chromosomal translocation, healthy radio-exposed individuals presented lower levels of cells bearing the BCL-2/JH rearrangement when compared to the levels of the patients with Follicular Lymphoma before treatment, however, test more cells would be required to confirm the total absence of circulating cells bearing the rearrangement BCL2/JH. / Indivíduos radioexpostos saudáveis que receberam acidentalmente baixas doses de radiação ionizante de Césio -137 no acidente ocorrido em Goiânia em 1987 e familiares, foram testados neste trabalho para a presença de células B em sangue periférico apresentando a translocação t(14;18) MBR. Da mesma maneira foram testados voluntários sem histórico de exposição à radiação ionizante, componentes de um grupo controle. Foi utilizado um método de PCR quantitativo em tempo real muito sensível. A translocação cromossômica t(14;18)(q31; q21) é característica de Linfomas Foliculares e é uma anormalidade freqüente em outros Linfomas não Hodgkin. Esta translocação acarreta em uma ativação constitutiva do oncogene BCL2 por uma região do gene de imunoglobulina de cadeia pesada. A ocorrência da translocação é considerada um evento marcante e inicial para o desenvolvimento de Linfoma Folicular. Em indivíduos saudáveis a mesma translocação pode ser encontrada em pequenas frações dentre os linfócitos de sangue periférico. As células translocadas são importantes referências para exposição ambiental à carcinógenos e possivelmente podem ser correlacionadas ao risco acumulativo de desenvolvimento de Linfoma não Hodgkin t(14;18) positivo. Oito radio expostos, cinco familiares e quatro voluntários não expostos foram testados para a detecção desta translocação cromossômica. Não foram encontras células t(14;18) MBR nos radioexpostos e familiares. Apenas um indivíduo não exposto pertencente ao grupo controle apresentou o rearranjo BCL2/JH, assim foi possível determinar com o estudo que os radioexpostos e familiares não apresentam freqüência da célula B t(14;18) similares das encontradas em média no sangue periférico de indivíduos com Linfoma Folicular antes do tratamento segundo outros estudos, entretanto apenas testando maiores quantidades de DNA de cada indivíduo será possível determinar abstenção total de células portando o rearranjo BCL2/JH
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Detecção de Papilomavírus Humano (HPV) em Adultos Jovens com idades entre 18 a 25 anos do Município de Leopoldo de Bulhões-GO

Roncato, Gerusa Cristhiny da Paixão 14 April 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GERUSA CRISTHINY DA PAIXAO RONCATO.pdf: 1739734 bytes, checksum: e31f127c33ebfe10748de3fa7c77d454 (MD5) Previous issue date: 2011-04-14 / Genital infection by human papillomavirus (HPV) is considered the sexually transmitted disease most prevalent among the population. The man has represented an important role as virus reservoir and transmitter. Most HPV-infected men are asymptomatic. The HPV infection prevalence in young males is poorly understood and few studies are available. This study aim was to evaluate the HPV prevalence in a group of young adults, ages 18 and 25, male, living in the City of Leopoldo de Bulhões-GO. For viral genome detection, was used the polymerase chain reaction (PCR) technique with primers PGMY09/11 Line Blot. Descriptive statistics and their frequencies was performed for the variables related to socio-demographic and behavioral features in the group of asymptomatic men for HPV infection. To investigate the possible associations between related factors and the infection, univariate analysis was performed by chi-square test with Yates correction. The study involved a population of 57 asymptomatic men aged between 18 and 25 years old living in the city of Leopoldo de Bulhões-GO, selected at the Jose Francisco Vargas Health Center. Among the study group behavioral characteristics, 43.9% of subjects were single and 56.1% were married. The individual s age who initiated sexual activity was approximately 15 years old. All subjects were informed about the study and signed a free and clear consent form. The HPV infection prevalence in the study group was 31.6%. HPV infection was significantly associated with marital status and partner s number, in other words, infection was more prevalent among unmarried individuals (56%) who did not have a steady partner (57.1%). As for condom use and early sexual activity, HPV infection was not significantly associated. Our results demonstrate that a man behavioral factor represents a significant risk for HPV infection association / A infecção genital pelo papilomavírus humano (HPV) é considerada a doença sexualmente transmissível de maior prevalência na população mundial. O homem tem apresentado um importante papel como reservatório e o transmissor desse vírus. A maioria dos homens infectados pelo HPV são assintomáticos. A prevalência da infecção pelo HPV em jovens do sexo masculino é pouco conhecida e apenas alguns estudos encontram-se disponíveis. O objetivo deste trabalho foi avaliar a prevalência do HPV em um grupo de adultos jovens, com idades entre 18 e 25 anos, do sexo masculino, residentes no Município de Leopoldo de Bulhões-GO. Para a detecção do genoma viral utilizou a reação em cadeia da polimerase (PCR), utilizando a técnica com primers PGMY09/11. A estatística descritiva com suas respectivas freqüências foi realizada para as variáveis relativas às características sócio-demográficas, comportamentais no grupo de homens assintomáticos para infecção pelo HPV. Para investigar as possíveis associações entre os fatores relacionados e a infecção realizou-se análise univariada, pelo teste do qui-quadrado com correção de Yates, selecionados no Centro de Saúde José Franscisco Vargas. Dentre as características comportamentais do grupo estudado 43,9% dos indivíduos eram solteiros e 56,1% eram casados. A idade de início da atividade sexual foi de aproximadamente 15 anos. Todos os indivíduos foram informados sobre o estudo e assinaram o termo de consentimento livre e esclarecido. A prevalência da infecção pelo HPV no grupo estudado foi de 31,6%. A infecção pelo HPV esteve significativamente associada ao estado civil e ao número de parceiras, ou seja, a infecção foi mais prevalente nos indivíduos solteiros (56%) e que não apresentaram parceira fixa (57,1%). Quanto ao uso do preservativo e o início da atividade sexual a infecção pelo HPV não esteve significativamente associada. Nossos resultados demonstraram que fatores comportamentais do homem representam uma associação com risco significativo para a infecção pelo HPV
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ANÁLISE MOLECULAR DO GENE DO RECEPTOR DE ANDRÓGENOS EM HOMENS COM SUSPEITA DE INFERTILIDADE

Melo, Caroline Oliveira Araujo 11 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caroline Oliveira Araujo Melo.pdf: 9819543 bytes, checksum: 9c73c3b07e3a86d2b7a6f185fa67e197 (MD5) Previous issue date: 2010-01-11 / The androgen is a generic term usually applied to describe a group of sex steroid hormones. Androgens are produced primarily by a male's testes. However, some small amounts are also produced by the ovaries in females and by the adrenal gland, in both sexes. Androgens are responsible for the male sex differentiation during embryogenesis at the 6th or 7th week of gestation , triggering the development of the testes and penis in male fetuses and is directed by the testicular determining factor, the gene SRY (sex determining region on Y chromosome), located on the short arm of chromosome Y. The differentiation of male external genitalia in penis, scrotum and penile urethra occurs between the 9th and 13th weeks of pregnancy and requires adequate concentration of testosterone and converting this to another more potent androgen dihydrotestosterone (DHT), through the action of 5α reductase in target tissues. The actions of testosterone and DHT require the presence of functional androgen receptors, which, after the connection with these hormones, activate the transcription of specific genes in target tissues. The AR gene is a protein coding gene located at Xq11.2-q12. It spans over 90 kb and codes for a protein that functions as a steroid-hormone activated transcription factor. The AR, like other members of the nuclear receptor superfamily, has three major functional domains: the AR is characterized by a modular structure consisting of four functional domains: an N-terminal domain (NTD), a DNA-binding domain (DBD), a hinge region, and a ligand (androgen-) binding domain (LBD). Mutations in the AR gene cause the X-linked Androgen Insensitivity Syndrome (AIS) characterized by androgen unresponsiveness, which affects the proper male sexual development both at embryogenesis and puberty. As a genetic disorder, AIS presents a problem and a burden to the affected people and their families and a major medical challenge for the health providers. This impaired response to androgen results from the incapacity or reduced capacity of the androgen receptor (AR) to transactivate androgen-responsive genes in target cells, and leads to abnormal differentiation and development of male internal and external genitalia, and thus leading to male pseudohermaphroditism. / Andrógeno é um termo genérico geralmente utilizado para descrever um grupo de hormônios esteroides sexuais. Os andrógenos são produzidos no homem primariamente pelos testículos. No entanto, algumas pequenas quantidades são também produzidas pelos ovários nas mulheres e pelas glândulas adrenais, em ambos os sexos. Os andrógenos são responsáveis pela diferenciação sexual masculina durante a embriogênese na 6ª ou 7ª semana de gestação, desencadeando o desenvolvimento dos testículos e pênis em fetos masculinos e é dirigido pelo fator determinante testicular, o gene SRY (região determinante do sexo no cromossomo Y), localizado no braço curto do cromossomo Y. A diferenciação da genitália externa masculina em pênis, escroto e uretra peniana ocorre entre a 9ª e 13ª semana de gravidez e requer concentração adequada de testosterona e a conversão para um outro andrógeno mais potente, a dihidrotestosterona (DHT), através da ação da 5 α- redutase em tecidos alvos. As ações da testosterona e DHT requerem a presença dos receptores androgênicos funcionais. O gene AR é uma proteína codificada para o gene localizado no Xq11.2-q12. Ele abrange mais de 90 kb e codifica pra a proteína que funciona como um hormônio esteroide que ativa o fator de transcrição. O AR, como outros membros da superfamília de receptores nucleares, tem três domínios principais: o AR é caracterizado por uma estrutura modular consistindo de quatro domínios funcionais: o domínio N-terminal (NTD), um domínio de ligação ao DNA (DBD), a região de dobradiça, e um domínio de ligação ao ligante (LBD). Mutações no gene AR causam a Síndrome de Insensibilidade aos Andrógens ligada ao cromossomo X (AIS) caracterizada pela insensibilidade androgênica, que afeta o desenvolvimento sexual adequado tanto na embriogênese quanto na puberdade. Como uma desordem genética, o AIS apresenta um problema e um fardo para as pessoas afetadas e suas famílias e um grande desafio médico para os provedores de saúde. Essa resposta prejudicada aos andrógenos resulta na incapacidade ou redução da capacidade do receptor de andrógeno (AR) de transativar os genes responsivos aos andrógenos em células alvo, e leva à diferenciação e desenvolvimento anormais da genitália masculina interna e externa, e assim, levando ao pseudohermafroditismo masculino.
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ANÁLISE DO PERFIL GENÔMICO DA PERDA AUDITIVA SENSORIONEURAL NÃO SINDRÔMICA

Machado, Luciana Alves Antonio 23 September 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LUCIANA ALVES ANTONIO MACHADO.pdf: 708554 bytes, checksum: ee6ad7a8ea7c2a08efc5ed340a9ce84c (MD5) Previous issue date: 2011-09-23 / Hearing loss is the most common sensory deficit in humans, which causes a negative impact in the structure of language and oral communication skills. One out of every thousand children are born deaf or become deaf to varying degrees before language is acquired, thus developing a pre-lingual deafness. Knowing the molecular genetic basis of the auditory system would provide early intervention, development of new therapies, genetic counseling and more productive social integration of individuals with hearing loss. Genomic studies would produce important information to support the development of technical, technological, and scientific tools that would help the regional community to provide better health care to the deaf . Moreover, genomic studies would ensure a molecular epidemiological analysis that portrays the reality of better health disorders in the population of Goiás. The current study was designed to identify chromosome regions containing genomic imbalances potentially associated with the nonsyndromic sensorineural hearing loss using molecular cytogenetics. Peripheral blood samples were obtained from 31 patients from the Clinical School of Speech Pathology, Pontifical Catholic University of Goiás, with sensorioneural hearing loss of unknown etiology, with or without family history and without a concurrent syndrome. All subjects were submitted to audiological evaluation, followed by short-term cultures of peripheral blood T lymphocytes in order to obtain metaphase chromosomes for karyotyping. Chromosomal imbalances was assessed by CGH. In the studied group, 45.2% were male and 54.8% female, mean age was 19.5 years, while 54.8% reported family history of deafness, 9% reported lack of familial history, and 3.2% could not say. All participants had sensorioneural hearing loss varying from mild to severe degrees, of which 87.1% exhibited prelingual hearing loss and 12.9% post-lingual. The multifactorial nature of hearing loss was certainly evident. However, chromosomal imbalances played an important role in the genesis and development of the disorder. Thus, a better understanding of the roles of genetic factors in the mechanisms related to the processes of cell differentiation, contributes to better understand the genesis of health problems, especially in the field of hearing loss.1 Referencial Teórico / A perda auditiva é o déficit sensorial mais comum em humanos e gera alterações na estruturação da linguagem e na capacidade de comunicação oral. Uma em cada mil crianças nasce surda ou se tornará surda em diferentes graus antes que a linguagem seja adquirida, período pré lingual. O conhecimento dos fundamentos genéticos moleculares do sistema auditivo proporcionará intervenções precoces, desenvolvimento de novas terapias, facilitação do aconselhamento genético e maior integração do indivíduo, com perda auditiva, na sociedade. Estudos genômicos poderão solidificar a geração e desenvolvimento do conhecimento técnico científico e tecnológico na comunidade científica regional, além de garantir uma análise epidemiológico molecular que retrate melhor a realidade dos agravos da saúde na população em Goiás. O presente estudo teve como objetivo identificar regiões cromossômicas contendo imbalanços genômicos, potencialmente associados nas perdas auditivas sensorioneurais não sindrômicas utilizando abordagens de citogenética molecular. Para a participação na pesquisa, amostras de sangue periférico foram obtidas de 31 pacientes da Clínica Escola de Fonoaudiologia da Pontifícia Universidade Católica de Goiás, com perda auditiva sensorioneural sem etiologia definida, com ou sem antecedentes familiares e sem características sindrômicas. Todos os indivíduos foram submetidos à avaliação audiológica, seguidos de culturas de linfócitos T do sangue periférico em curto prazo, conforme os protocolos para a obtenção de cromossomos metafásicos para a avaliação cariotípica. A investigação dos imbalanços cromossômicos foi realizada por CGH, utilizando o kit comercial para hibridação genômica comparativa, seguindo as recomendações do fabricante. Do grupo amostral, 45,2% (14/31) eram do sexo masculino e 54,8% (17/31) do feminino, com idade média de 19,5 anos, sendo que 54,8% citaram antecedentes familiares, 41,9% afirmaram não haver antecedentes e 3,2% não souberam informar. Todos os participantes apresentavam Perda Auditiva sensorioneural variando o grau de leve a profundo, dos quais 87,1% dos indivíduos referiram perda auditiva pré lingual e 12,9% pós lingual. A natureza multifatorial da perda auditiva é certamente uma situação muito evidente. Contudo, os imbalanços cromossômicos assumem um papel importante na gênese e desenvolvimento da doença. Deste modo, o melhor entendimento dos papéis dos fatores genéticos nos mecanismos relacionados com os processos de diferenciação celular, vem contribuir no melhor entendimento da gênese dos agravos à saúde, em especial, na perda auditiva.
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ANÁLISE GENÉTICA DOS VESTÍGIOS DE CRIMES SEXUAIS

Piza, Patrícia Bonilha de Toledo 31 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PATRICIA BONILHA DE TOLEDO PIZA.pdf: 970259 bytes, checksum: e296c4994d48ecfafd048f3cc57617e4 (MD5) Previous issue date: 2012-08-31 / In Brazil sexual violence is a crime. Rape and vulnerable rape are heinous crimes. It is estimated that only 10% of rapes are recorded and the SENASP point 42.946 police incidents in 2010. Most victims are women aged below 14 years. The absence of expert evidence difficult the sentencing of the offender. In victim, exams corpus delicti of carnal knowledge and research of semen when positive do not identify the perpetrator and negativity is not a factor of no sexual assault. Genetic analysis by PCR-STR and Y identifies the presence of male DNA and the genetic profile of the perpetrator. This paper aims to analyze samples for traces of sex crimes to obtain molecular profiles of Y-STR. We selected 19 cases of sex crimes with no suspect, totaling 20 female victims aged 11 months to 81 years, which resulted in 48 samples questioned, of which 44 were subjected to differential extraction and 4 to organic extraction, totaling 92 products extraction (44 SF, 44 NSF and 4 Organic). The DNA quantitation by real-time PCR detected the presence of male DNA in 62% of the samples. Of these, 21 samples were selected and standardized to a concentration of Y-DNA 0.1 ng to 1.25 ng / PCR reaction for Y-STR. Amplification was performed for 17 joint multiplex Y-STR markers and electrophoresis capillary was preceded in genetic analyzer and the results were analyzed by programs. Of the 21 samples amplified, 12 had results for Y-STR and their haplotype been classified as full (Y-STR 17), minimum (11 Y-STR) and incomplete (absence of one or more of the Y-STR minimum haplotype) resulting 10 minimal haplotypes and complete and 02 incomplete. After comparing the minimum haplotypes and complete intra case and between their criminal cases, it was evident that the sexual assaults were committed in each case, by a single assailant, not featuring serial crimes. It is easy to recognize the importance that the Y-STR haplotype analysis assumes the sexual crimes as expert evidence, especially when it becomes the only genetic information of the offender being questioned samples obtained. The results presented in this study demonstrate the importance of being analyzed the largest number of polymorphic markers Y-STR haplotype to compose an informative, giving preference to multiplex sets that amplify multiple loci simultaneously, including polymorphic markers with products up to 200 base pairs. / No Brasil a violência sexual é crime. O estupro e o estupro de vulnerável são crimes hediondos. Estima-se que apenas 10% dos estupros são registrados e dados da SENASP apontam 42.946 ocorrências policiais em 2010. A maioria das vítimas é do sexo feminino com idade abaixo de 14 anos. A ausência de prova pericial dificulta a condenação do agressor. Na vítima, os exames de corpo de delito de conjunção carnal e pesquisa de sêmen quando positivos não identificam o agressor e a negatividade não é fator de inexistência de agressão sexual. A análise genética, através da PCR e Y-STR permite identificar a presença de DNA masculino e o perfil genético do agressor. Este trabalho objetiva analisar amostras de vestígios de crimes sexuais para a obtenção de perfis moleculares de Y-STR. Foram selecionados 19 casos de crimes sexuais com ausência de suspeito, totalizando 20 vítimas do sexo feminino com idade entre 11 meses a 81 anos, que resultaram em 48 amostras questionadas, das quais 44 foram submetidas à extração diferencial e 4 à extração orgânica, totalizando 92 produtos de extração (44 FE, 44 FNE e 4 Orgânica). A quantificação de DNA pela PCR em tempo real detectou a presença de DNA masculino em 62% das amostras extraídas. Destas, 21 amostras foram selecionadas e normalizadas a uma concentração de Y-DNA entre 0,1 ng a 1,25 ng/reação de PCR para Y-STR. A amplificação foi realizada com conjunto multiplex para 17 marcadores Y-STR e a eletroforese capilar foi procedida em analisador genético; os resultados foram analisados por programas específicos. Das 21 amostras amplificadas, 12 apresentaram resultados para Y-STR e seus haplótipos foram classificados como completo (17 Y-STR), mínimo (11 Y-STR) e incompleto (ausência de 1 ou mais Y-STR do haplótipo mínimo), resultando em 10 haplótipos mínimos e completos e 02 incompletos. Após confrontar os haplótipos mínimos e completos intra caso e entre os respectivos casos criminais, ficou evidenciado que as agressões sexuais foram cometidas, em cada caso, por um único agressor, não caracterizando crimes em série. É de facil reconhecimento a importância que o haplótipo de Y-STR assume nas análises de crimes sexuais como prova pericial, principalmente quando este se torna a única informação genética do agressor a ser obtida de amostras questionadas. Os resultados apresentados neste estudo demonstraram a importância de serem analisados o maior número de marcadores polimórficos Y-STR para compor um haplótipo informativo, dando-se preferência a conjuntos multiplex que amplificam simultaneamente vários loci, incluindo marcadores polimórficos com produtos de até 200 pares de bases.

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