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Avaliação da expressão dos genes TGFBR1 e TGFBR2 em amostras de carcinomas ductais invasivos

Paiva, Carlos Eduardo [UNESP] 28 February 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-28Bitstream added on 2014-06-13T18:56:52Z : No. of bitstreams: 1 paiva_ce_me_botfm.pdf: 1255697 bytes, checksum: 3b134e3a9a4224016105b510cbe1c230 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O câncer de mama (CM) ocupa o primeiro lugar em incidência e o segundo em mortalidade entre as mulheres no mundo. É considerada uma doença heterogênea com alterações em diversas vias de sinalização molecular. Os fatores prognósticos atuais são incapazes de predizer a evolução da totalidade dos pacientes, assim como os marcadores preditivos não conseguem evitar que grande parte das pacientes com CM sejam submetidas à tratamento desnecessário. A busca de outros marcadores tumorais, tanto prognósticos quanto preditivos tem sido alvo de inúmeras pesquisas, que buscam predizer a evolução clínica de um número maior de pacientes. Dois marcadores tumorais com possíveis implicações clínicas são o TGFB1 e o seu receptor TGFBR2. No entanto, o papel do TGFB1 na carcinogênese e na progressão do câncer de mama ainda não é totalmente conhecido. Desta forma, o objetivo deste estudo foi avaliar a expressão do TGFB1 e do TGFBR2 em tumores de mama e correlacionar com os dados clínicos e histopatológicos. Para tanto, foram analisadas 49 amostras de carcinomas ductais invasivos primários e sete amostras de mamas normais como controles pelas técnicas de RT-PCR quantitativa em tempo real (qRTPCR) e imunohistoquímica (IHQ). Os resultados mostraram que baixos níveis de expressão protéica de TGFB1 nas células tumorais estavam associados a menor sobrevida livre de doença. Os tumores apresentaram acentuada diminuição da expressão do transcrito TGFBR2 quando comparados ao controle normal. Além disso, foram observados baixos níveis dos transcritos TGFB1 e TGFBR2 nos tumores com fenótipos mais agressivos (alto índice proliferativo e estadio avançado). Esses dados sugerem que o TGFB1 atua como supressor tumoral em CMs e que a diminuição da expressão TGFB1 e TGFBR2 é um evento importante na carcinogênese mamária. A detecção dos níveis de expressão protéica... / Breast cancer (BC) is the leading female cancer in incidence and the second one in mortality worldwide. BC is considered a heterogeneous disease, that presents abnormalities in several molecular pathways. The known prognostic markers are not capable to predict the outcome of all the patients, as well as the predictive markers are not capable to avoid unnecessary treatments. It is necessary to search for other tumor markers, even prognostic and predictive, regarding the prediction of a higher number of patient’s outcome. Two tumor markers with possible clinical implications are TGFB1 and its receptor TGFBR2. However the role of TGFB1 in carcinogenesis and in the BC progression is not totally understood yet. In this way, the aim of this study was to analyze the expression of TGFB1 and TGFBR2 in breast tumors and to correlate it with clinical and histopathological data. For this, it were analyzed 49 ductal invasive carcinomas and 7 normal breast tissues as controls with quantitative real time PCR (qRT-PCR) and immunohistochemistry (IHC) technologies. The results showed that low expression levels of TGFB1 protein in tumor cells were associated with a lower disease-free survival. Tumors presented highly diminished TGFBR2 transcript expression when compared with normal controls. Moreover, low levels of TGFB1 and TGFBR2 transcripts were observed in tumors with aggressive phenotypes (high proliferation index and advanced stage). These results suggests that TGFB1 acts like a tumor supressor in BCs and that the TGFB1 and TGFBR2 lowering expression is an important event in mammary carcinogenesis. The detection of tumor TGFB1 protein expression levels can be helpful in clinical practice like a prognostic marker in mammary carcinomas.
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Efeitos da temperatura e do mate (Ilex paraguariensis) sobre o processo de carcinogênese de esôfago em ratos wistar machos /

Silva, Juliana Ferreira da. January 2008 (has links)
Orientador: Luís Fernando Barbisan / Banca: Daniel Araki Ribeiro / Banca: Lígia Souza Lima Silveira da Mota / Resumo: O consumo de mate em altas temperaturas tem sido considerado um fator de risco para o desenvolvimento do carcinoma epidermóide de esôfago (CE) na América do Sul. Desta forma, os efeitos da ingestão de mate sobre danos de DNA e a carcinogênese de esôfago, induzidos pela dietilnitrosamina (DEN) e injúria térmica, foram avaliados em ratos Wistar machos. Na fase de iniciação, os animais foram iniciados com injeções i.p. da DEN (8 x 80 mg/Kg p.c.) e submetidos a injúria térmica (água a 65°C, lmIlrato, instilado no interior do esôfago) e receberam, concomitantemente, mate (2.0% p/v, grupo teste) ou chá-verde (2.0% p/v, grupo controle positivo) como única fonte de líquidos por oito semanas. Nenhum tratamento adicional foi introduzido durante a fase de pós-iniciação (nona a vigésima semana do experimento). Amostras de sangue periférico foram coletadas quatro horas após a última administração da DEN para o teste do cometa na oitava semana e amostras de esôfago e fígado foram coletadas na oitava e vigésima semanas do experimento. Na oitava semana, a ingestão de mate e chá-verde por si não foi genotóxica e reduziu de forma significativa os níveis de danos no DNA de leucócitos de sangue periférico nos animais tratados com a DEN. Além disso, uma redução significativa nos níveis de proliferação celular no epitélio do esôfago e no parênquima hepático e no número de lesões hepáticas pré-neoplásicas foram também observadas nos grupos iniciados e que receberam mate ou chá-verde. Na vigésima semana, uma menor incidência de neoplasias de esôfago e fígado foi observada nos grupos que receberam previamente mate e chá-verde quando comparado ao grupo iniciado pela DEN e submetido à injúria térmica. Os resultados do presente estudo indicam que a ingestão de mate se mostrou benéfica contra danos no DNA e a carcinogênese de esôfago e fígado induzidos pela DEN. / Abstract: Drinking hot mate has been associated with risk for esophageal squamous cell carcinoma m South America. Thus, the modifying effects of mate tea intake on DNA damage and esophageal carcinogenesis induced by diethylnitrosamine (DEN) plus thermal injury were evaluated in male Wistar rats. In the initiation phase, rats were treated with DEN injections (8 x 80 mg/Kg b.w.) plus thermal injury (water 65°C, lml/rat, instilled into the esophagus) and concomitantly received mate tea (2.0% w/v, test group) or green tea (2.0% w/v, positive control group) as the sole source of drinking fluid for 8 weeks. Any additional treatment was introduced at post-initiation until week 20. Peripheral blood was collected 4 hr after the last DEN application for comet assay at week 8 and samples from esophagus and liver were collected at weeks 8 and 20. At week 8, mate or green tea intake itselfwere non-genotoxic and significantly decreased DNA damage levels in peripheral blood leucocytes from DEN-treated animaIs. Also, a significant reduction of cell proliferation rates in both esophageal epithelium and liver parenchyma and on the number of putative preneoplastic liver lesions were observed in initiated and mate or green tea-treated animaIs at week 8. A significant lower incidence of esophageal and liver neoplasms and tumor multiplicity was observed in the groups previously treated with mate or green tea when compared to the DEN initiated/thermal injury group at week 20. These data indicate that mate tea presented protective effects against DNA damage and esophageal and liver carcinogenesis induced by DEN. / Mestre
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Elaboração de um modelo experimental de carcinogênese pulmonar em ratos wistar

Silva, Baldomero Antonio Kato da January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, 2006. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-10-23T13:11:53Z No. of bitstreams: 1 2006_Baldomero Antonio Kato da Silva.pdf: 920008 bytes, checksum: c034b65e76f09dcd009ef75070f6de70 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-07-07T19:06:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Baldomero Antonio Kato da Silva.pdf: 920008 bytes, checksum: c034b65e76f09dcd009ef75070f6de70 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-07-07T19:06:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Baldomero Antonio Kato da Silva.pdf: 920008 bytes, checksum: c034b65e76f09dcd009ef75070f6de70 (MD5) Previous issue date: 2006 / O objetivo deste estudo foi elaborar um modelo experimental de carcinogênese pulmonar em ratos wistar. Para tanto, foi realizada injeção intra-pulmonar da diluição em álcool 70% de Benzo[a]pireno (B[a]P), um hidrocarboneto aromático policíclico amplamente conhecido por seu poder de indução tumoral. Após realização de estudo para verificação do grau de proliferação celular induzido pelo B[a]P, cuja confirmação pôde ser obtida através da análise histológica dos pontos de regiões organizadoras nucleolares argirofílicas (AgNOR) 03 semanas após a injeção (10mg/kg = 1,84±0,13; 20mg/kg = 2,48±0,28), foram formados três grupos experimentais com 08 animais cada: Grupo Controle (álcool 70%); Grupo B[a]P 10 mg/kg; e Grupo B[a]P 20mg/kg, submetidos a eutanásia 08, 10, 12 e 14 semanas após o procedimento experimental. As secções pulmonares foram coradas por hematoxilina e eosina (HE) e submetidas a análise morfométrica para descrição das alterações teciduais. Em todos os grupos observou-se a presença de alterações inflamatórias difusas, porém na análise do tecido pulmonar dos grupos experimentais, observou-se alterações hiperplásicas (hiperplasia de BALT), e em um dos animais do grupo experimental 20mg/kg (12 semanas) notou-se a presença de pleomorfismo celular epitelial traqueal, sugerindo a formação de adenocarcinoma in situ. Concluiu-se neste estudo que a injeção intra-pulmonar de B[a]P é um método de fácil realização e pode constituir um modelo adequado quando utilizadas doses e períodos maiores de observação. As principais alterações secundárias à injeção intra-pulmonar de B[a]P em ratos Wistar foram: proliferação celular, alterações inflamatórias de diversos graus e hiperplasias nodulares linfóides. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this study was to elaborate an experimental model of pulmonary carcinogenesis in Wistar rats. So it was carried through an intra-pulmonary injection of the Benzo[a]pyrene (B[a]P) dilution in alcohol 70%, a polycyclic aromatic hydrocarbon widely known by its power of tumoral induction. After daily study accomplishment to verify the induced degree of cellular proliferation by the B[a]P, which confirmation was gotten through the histological analysis of the Argyrophilic Nucleolar Organizer Regions (AgNOR) points 03 weeks later the injection (10mg/kg = 1,84±0,13; 20mg/kg = 2,48±0,28), three experimental groups had been formed with 08 animals each: Control Group (Alcohol 70%); B[a]P Group 10 mg/kg; e B[a]P Group 20mg/kg, submitted to euthanasia 08, 10, 12 and 14 weeks after the experimental procedure. The pulmonary sections had been colored by hematoxilin-eosin (HE) and submitted to the morphometrical analysis to describe the tissue alterations. The presence of diffuse inflammatory alterations was observed in all groups, however, at the analysis of the pulmonary tissue of the experimental groups, it had been observed hyperplasic alterations (BALT hyperplasia), and in one of the animals of the experimental group 20mg/kg (12 weeks), it was noticed the presence of cellular epithelial tracheal pleomorphism, suggesting the adenocarcinoma formation in situ. It had been concluded in this study that the intra-pulmonary injection of B[a]P is an easy realization method, and can be an adequate model when major doses and observation periods will used. The main secondary alterations to the intra-pulmonary injection of B[a]P in Wistar rats were: cellular proliferation, inflammatory alterations of several degrees and nodular lymphoid hyperplasias.
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Bioensaios de Abarema cochliocarpa (Gomes) Barneby & Grimes (Leguminosae)

JESUS, Renata Patrícia Freitas Soares de 31 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T16:25:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1197_1.pdf: 5646654 bytes, checksum: 42118b4d08177ee05a417ae1e2343fad (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana in vitro , e in vivo o nível de toxicidade aguda, cicatrizante, antiinflamatória, analgésica e antitumoral do extrato etanólico de Abarema cochliocarpa (EEAc) (Gomes) Barneby & Grimes. A ação antimicrobiana do extrato foi realizada por método de difusão em meio sólido, através da técnica de poços e de disco, obtendo-se a Concentração Inibitória Mínima (CIM) sobre os principais representantes presentes na cavidade oral e da pele. A toxicidade aguda foi estabelecida através do cálculo da Dose letal (DL50) nas vias intraperitoneal (i.p.) e oral (v.o.) em camundongos (Mus musculus). A avaliação cicatrizante foi observada em feridas excisionais no dorso de ratos albinos Wistar (Rattus novergicus), tratados com creme dermatológico com EEAc nas doses de 51,5 e 103 mg/kg comparado a outros dois grupos: placebo e dexpantenol a 5% (controle-positivo). Os animais foram sacrificados no 3º, 7º e 14º dia de tratamento. A atividade antiinflamatória foi verificada através do modelo de edema de pata induzido por carragenina (0,1% p/v) em ratos Wistar. Os grupos padrão e controle receberam indometacina (10 mg/kg-i.p.) e solução salina (0,9%-i.p.), respectivamente. Foi estudado também o efeito antinociceptivo do EEAc e de suas frações através dos modelos de contorções abdominais, teste da formalina, da placa quente e de imersão de cauda. A ação antinociceptiva do extrato também foi testada com o naloxone nos testes da placa quente e de imersão de cauda. Para a avaliação da atividade antineoplásica foram utilizadas as linhagens de Sarcoma 180 e Carcinoma de Ehrlich. Os resultados do estudo microbiológico demonstraram que o extrato possui atividade antimicrobiana sobre todos os microorganismos orais testados. Os testes toxicológicos evidenciaram toxicidade por i.p. (DL50 = 257, 49 mg/kg) e atóxica para via oral. Através da análise histológica da pele do dorso dos animais, o creme dermatológico contribuiu na redução do infiltrado inflamatório de células polimorfonucleares, e com o aumento da fibroplasia entre o 3º e o 7º dia de tratamento, quando comparado ao placebo e ao dexpantenol a 5%. Os estudos mostraram que o EEAc possui atividade antinociceptiva periférica e no Sistema Nervoso Central (SNC). O EEAc apresentou ação antiinflamatória significativa no modelo de edema de pata induzido por carragenina. Os resultados demonstraram que o extrato e suas frações de saponinas e de taninos foram capazes de inibir o crescimento de tumores carcinomatosos e sarcomatosos. A avaliação histológica demonstrou que a administração do EEAc provocou discretas alterações no tecido pulmonar quando comparados com os animais dos grupos controle e padrão. O screening fitoquímico do EEAc apresentou testes positivos para saponinas, flavonóides e taninos. Conclui-se que o A. cochliocarpa apresenta atividade antimicrobiana, antiinflamatória e cicatrizante, analgésica e antitumoral sendo possivelmente uma expectativa para o desenvolvimento de produto fitoterápico para utilização humana
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Mutações do gene N-ras em pacientes com mieloma multiplo

Shitara, Edson Shusaku 26 February 2002 (has links)
Orientador : Fernando F. Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-01T12:39:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Shitara_EdsonShusaku_M.pdf: 13377377 bytes, checksum: 8ddc98862559481b7bfb0bb363d2deb2 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo:O mieloma múltiplo (MM) é uma doença neoplásica maligna que se desenvolve em células linfocitárias de linhagem B, em sua fase mais evoluída, chamada de plasmocitária. Ele é caracterizado pela tríade formada por infiltração plasmocitária de medula óssea (MO), produção de imunoglobulinas (Igs) monoclonais e lesões osteolíticas. O MM não tem ainda bem esclarecida sua patogênese e etiologia. Fatores diversos são relacionados para justificar a carcinogênese nesta patologia. Mutações no gene N-ras estão presentes em aproximadamente 20 a 30 % dos pacientes com esta doença ao diagnóstico, além de acometimento maior quando de atividade do MM. Neste trabalho, investigamos mutações no proto-oncogene N-ras em 44 pacientes com diagnóstico de MM. A metodologia utilizada foi a de amplificação do fragmento do gene N-ras através de PCR e determinação da seqüência por meio de seqüenciamento automatizado. Em nossa investigação não encontramos nenhuma mutação do gene em qüestão. Concluímos que a ausência de mutações no gene N-ras indica, aparentemente, que seu papel não é fundamental na etiopatogenia desta população brasileira avaliada. Este resultado pode sugerir também uma peculiaridade quanto ao uso da terapia gênica que aborde N-ras nestes pacientes / Abstract: Various authors met gene ras mutation in MM patients, mainly at N- and K-ras. The incidence is variable, but a median result is 30-40% at presentation, and until 70% in cases of relapse. The aim of this study was the determination of the frequency of mutation of the hot-spots codons 12,13 and 61 N-ras proto-oncogene. We studied the bone marrow DNAfrom 44 patients with multiple myeloma. We used DNA sequencing methodology for identification of mutations at N-ras gene. The positive-control was a patient with mutation at codons 12 and 13 of N-ras gene from a previous investigation in our laboratory. We didn't find oncogenic mutational alterations. The result suggests that the mutations of N-ras gene are not fundamental importance for pathogenesis of multiple myeloma in the Brazilian population avalied. / Mestrado / Patologia Clinica / Mestre em Ciências Médicas
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Ação genotoxica da estreptozotocina em culturas celulares de mamiferos

Capucci, Maria Silvia 08 April 1994 (has links)
Orientadores: Maria Edwiges Hoffmann, A.T. Natarajan / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T08:34:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Capucci_MariaSilvia_D.pdf: 6708542 bytes, checksum: f660b3940bd707763d76d06e2b170801 (MD5) Previous issue date: 1994 / Doutorado / Doutor em Genetica
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Estudo da participação do sistema imunologico durante o periodo pre-tumoral na carcinogeneses pancreatica experimental

Garcia, Irandaia Ubirajara 19 July 2018 (has links)
Orientador: Maria Juana Escribano / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T11:55:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Garcia_IrandaiaUbirajara_D.pdf: 9327229 bytes, checksum: 1adb737cb20a365e67d01b2e765f4679 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: A carcinogênese experimental em hamster, induzida por nitrosaminas, é um processo multifásico dando origem a adenocarcinomas na fase terminal, semelhante à doença humana. A resposta humoral e celular neste modelo, levou aos seguintes resultados: Quando os tecidos são tratados com antissoro específico aos linfócitos "T" de hamster, observamos uma migração de células "T" através do tecido exócrino em paralelo a neo-vascularização intensa (angiogênese). Esta migração foi observada precocemente, antes que pudesse constatar lesões nas análises por histologia convencional. Parece que as células em possível cooperação com outras células imunocompetentes, foram capazes de atacar ou destruir as acinares sem alterações morfológicas evidentes, ao lado de canais hiperplásicos correspondentes às lesões pré-neoplásicas. Entretanto, não foi observado linfócitos "T" em contacto direto com os canais em hiperplasia epitelial. Ao longo da carcinogênese observamos um aumento progressivo da síntese de imunoglobulinas circulantes. Esta foi medida pelo método semi-quantitativo "dot-blot", utilizando antissoro anti-lgG total de hamster. O método da imunoperoxidase indireta nos cortes histológicos, mostrou a presença de auto-anticorpos dirigidos provavelmente contra neoantígenos , que surgiram em consequência das lesões induzidas. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Experimental carcinogenesis in hamster, induced by nitrosamines, is a multiphasic processus ultimatly leading to adenocarcinomas closely ressembling the human illness.A follow-up of hUl11oral and cellular immuncrcsponscs in this modcl allowcd thc following results: When tissues were processed with an antiserum specifc for hamster T-lymphocytes, we observed a migration of T-cells througth the exocrine tissue concomitant with abundant neovascularitation (angiogenis). Migration occurred far before lesiolls could be Iloticed by conventional histology. Apparently, these cells, in possible cooperatin with other immunocompetent cells, were able to attack or destroy acini with no signifíant morphological alterations as well as hyperplasic ducts which are preneoplasic lesions. T-Iynphocytes in neoplasic ducts were, on the contraty, not observed. Along the carcinogenesis there also was an increase in immunoglobuline synthesis in blood-circulation This was evaluated by semiquantitative nitrocellulose immuno "dot blot" using anti-whole Ig antiserum. Indirect immunoperoxidase in the tissue sections showed presence of autoantibodies directed against neoantigens appearing as a consequence of theinduced lesions. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Doutor em Imunologia
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Padronização de modelo de carcinogênese mamária induzido quimicamente por DMBA em camundongos / Standardization of a mammary carcinogenesis chemically model induced by DMBA in mice

Avanzo, Gabriela Uliana 09 February 2009 (has links)
O câncer de mama permanece como o segundo tipo de câncer mais freqüente no mundo e o primeiro entre as mulheres (INCA, 2007). Porém, os mecanismos envolvidos no processo de gênese dos tumores mamários mesmo sendo intensamente estudados nos últimos 30 anos, ainda não são bem definidos. Vários estudos apontam que a susceptibilidade em função da genética é uma causa relevante ao surgimento do tumor, porém não a principal. Outros fatores tais quais o ambiente e dieta tendem a ser mais significantes nesse processo. Para a indução dos tumores em animais, a maioria dos modelos utiliza carcinógenos pertencentes à família dos hidrocarbonetos aromáticos policíclicos, dentre eles o DMBA (7,12-dimetil bezantraceno). O DMBA foi utilizado neste estudo com o objetivo de induzir tumor mamário, estabelecendo-se assim um modelo para estudos futuros, quantificando e classificando as lesões nas diferentes concentrações do carcinógeno, avaliando também a proliferação celular através do método de imunohistoquímica PCNA nos diferentes tumores encontrados. Neste estudo, em todos os grupos houve o desenvolvimento de tumores mamários, sendo estes mais freqüentes nos grupos de 3, 6 e 9 mg. O tipo de tumor mais freqüente foi o Adenocarcinoma A, seguido de Adenoacantoma e Adenocarcinoma Misto em menor freqüência. Sendo assim, concluiu-se através deste trabalho que o DMBA produz um modelo de carcinogênese mamária em camundongos. / The breast cancer remains the second most common cancer type in the world and first among women (INCA, 2008). However, the mechanisms involved in the origin even being intensively studied in the past 30 years, are still not well defined. Several studies suggest that genetic susceptibility is a relevant issue to the tumor development, however others factors can favor tumor growing. Among such factors the environment and diet are considered more significant. For mice tumor induction, most significant carcinogens used belonging to the polycyclic aromatic hydrocarbons family, where DMBA (7,12-dimethyl bezantraceno) take place. The DMBA was used in this study in order to induce mammary tumors, establishing the real conditions for future studies in our mice colony, classifying and quantifying the lesions. Cell proliferation was also evaluated though the immunohistochemistry against PCNA in different tumors classified. In this study, all concentration resulted in breast tumor development, which was more frequently observed in groups of 3, 6 and 9 mg. The most common type tumor regarded was Adenocarcinoma A, followed by Adenoacantoma and Mixed A/B in lower frequency. In conclusion, DMBA was able to produces a model of mammary carcinogenesis in mice.
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Avaliação do perfil genômico dos genes da família HOX em tumores a partir de dados de bancos públicos / Genomic profile evaluation of HOX genes family in cancer using public databases

Plaça, Jessica Rodrigues 11 October 2017 (has links)
A família de genes HOX compreende um conjunto de fatores de transcrição altamente conservados evolutivamente. Em mamíferos, os genes HOX se subdividem em 4 clusters: HOXA, HOXB, HOXC e HOXD, atuando no desenvolvimento embrionário com a regulação de processos biológicos como proliferação, diferenciação, migração, angiogênese e apoptose que são reativados durante a carcinogênese. Estudos recentes apontam que os genes HOX podem exercer papel relevante na formação de diversos tumores sólidos, todavia ainda não foi possível caracterizar sistematicamente a expressão dos genes HOX em tumores bem como determinar seus alvos em tumores. Desta forma, o objetivo geral deste trabalho consistiu na caracterização in silico do modelo de atuação genes HOX na carcinogênese. Para cumprir este objetivo foi identificado o perfil diferencial dos genes HOX entre amostras normais e tumorais. Alvos de genes HOX foram identificados e, quando diferencialmente expressos, foram associados com os genes HOX, independentemente dos índices de metilação e CNA. Por fim, as associações finais entre os genes HOX e seus alvos foram enriquecidas com os bancos de dados KEGG e GO. Identificou-se diferentes assinaturas de expressão de genes HOX em diferentes tumores, associadas com o eixo ântero-posterior do corpo humano, bem como os folhetos embrionários originários aos tecidos tumorais, compatível com o padrão de expressão no desenvolvimento embrionário. Um número considerável de genes HOX atuam preferencialmente via enhancers na regulação de seus alvos. Como exemplo, os genes HOXB7 e HOXC11, que funcionam como moduladores anti tumorais. Finalmente, o estudo mostra que diante do número crescente de dados genômicos públicos, é possível viabilizar projetos de grande valor científico. / The HOX gene family comprises a set of evolutionarily highly conserved transcription factors. In mammals, HOX genes are subdivided into four clusters: HOXA, HOXB, HOXC and HOXD, acting on the embryonic development with regulation of biological processes such as proliferation, differentiation, migration, angiogenesis and apoptosis that are reactivated during carcinogenesis. Recent studies indicate that HOX genes may play a relevant role in the formation of several solid tumors, but it has not been possible to systematically characterize the expression of HOX genes in tumors as well as to determine their targets in tumors. Thus, the general aim of this project was to characterize the in vivo model of HOX genes in carcinogenesis. To accomplish this goal the differential profile of HOX genes was identified between normal and tumor samples. HOX gene targets were identified and, when differentially expressed, were associated with HOX genes regardless of methylation and CNA indices. Finally, the final associations between the HOX genes and their targets were enriched with the KEGG and GO databases. Different signatures of HOX gene expression were identified in different tumors, associated with the anteroposterior axis of the human body, as well as the embryonic leaflets originating from the tumor tissues, compatible with the expression pattern in the embryonic development. A considerable number of HOX genes preferentially act via enhancers in the regulation of their targets. As an example, the HOXB7 and HOXC11 genes, which function as pro-tumor modulators. Finally, the study shows that in view of the growing number of public genomic data, it is possible to make feasible projects of great scientific value.
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Avaliação da expressão proteica de PTEN, MDM2, P53 e AR em lesões proliferativas da próstata canina /

Rivera Calderón, Luis Gabriel. January 2014 (has links)
Orientador: Renée Laufer Amorim / Banca: Antonio Carlos Alessi / Banca: Kellen de Sousa Oliveira / Resumo: A próstata canina pode desenvolver espontaneamente lesões proliferativas, associadas com a idade, inflamação e os hormônios, tais como: a hiperplasia prostática benigna (HPB), a atrofia inflamatória proliferativa (PIA) e o carcinoma prostático (CaP). Consequentemente, o cão pode ser usado para o estudo do processo carcinogênico da próstata no homem. Alterações na expressão gênica, proteica e na função do PTEN e TP53 foram detectadas nas lesões pré-neoplásicas e neoplásicas da próstata humana. A super-expressão da oncoproteína MDM2 e a perda de marcação nuclear do receptor andrógeno (AR) foram correlacionados com progressão tumoral e ineficiência ao tratamento anti-andrógeno do CaP no homem. Neste contexto, o objetivo deste estudo foi avaliar a expressão proteica de PTEN, MDM2, p53 e AR para determinar seu papel no processo carcinogênico da próstata canina e validar os resultados obtidos pelo grupo de pesquisa com a técnica de hibridação genômica comparativa (CHG) nesses genes. Com isso, foi construído um microarranjo de tecido (TMA), com 74 amostras da glândula prostática canina, divididas em 18 HPB, 22 PIA, 19 CaP e 15 próstatas de tecido normal. A técnica de imuno-histoquímica para os anticorpos PTEN, MDM2, p53, e AR, foi realizada pelo método de peroxidase e DAB. O PTEN, p53 e AR apresentaram perda de marcação nuclear nos carcinomas prostáticos quando comparados com o tecido prostático normal. Na oncoproteína MDM2, o tecido normal obteve marcação nuclear e citoplasmática discreta enquanto no CaP, mais de 85% das amostras apresentaram super-expressão citoplasmática/nuclear. A perda de marcação nuclear do PTEN, p53 e AR, e o ganho da expressão de MDM2 também foi relatado no CaP do homem, sugerindo que existem semelhanças nas alterações moleculares da rede PTEN/MDM2/p53 e AR em ambas as espécies no processo de carcinogênese prostática. Por conseguinte, a espécie cão é um ... / Abstract: The canine prostate may spontaneously develop prostatic proliferative lesions, associated with aging, inflammation and hormones, such as: benign prostatic hyperplasia (BPH), proliferative inflammatory atrophy (PIA) and prostatic carcinoma (PCa). Consequently, the dog can be used for the study of carcinogenesis process in the prostate of men. Changes in PTEN and TP53 gene and protein expression and function were detected in preneoplasic and neoplasic lesion of human prostate. MDM2 oncoprotein overexpression and loss of nuclear staining of androgen receptor (AR) were correlated with tumor progression and inefficiency antiandrogen treatment of PCa in men. In this context, the aim of this study was to evaluate PTEN, MDM2, p53 and AR protein expression to determine their role in carcinogenic process of the canine prostate. We built a tissue microarray (TMA), with 74 samples of canine prostate, divided into 18 BPH, PIA 22, 19 PCa and 15 prostates of normal tissue. The immunohistochemistry was carried for PTEN, MDM2, p53, and AR antibodies with peroxidase method and DAB. The PTEN, p53 and AR showed loss of nuclear staining in canine prostate carcinoma compared with normal prostate tissue. MDM2 oncoprotein, in normal tissue was discrete cytoplasmic and we observed nuclear staining in CaP, while more than 85% of the samples showed cytoplasmic/nuclear overexpression. The loss of nuclear staining of PTEN, p53 and AR, and the gain of MDM2 expression was also reported in human PCa, suggesting that there are similarities in the molecular alterations of PTEN/MDM2/p53 network and AR in both species in the process prostate carcinogenesis. Therefore, the dog is a potential model for the study of molecular signaling pathways as PTEN/MDM2/p53 and AR involved in human PCa / Mestre

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